1UP0A

Structure of the endoglucanase cel6 from mycobacterium tuberculosis in complex with cellobiose at 1.75 angstrom
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
293
structure length
292
Chain Sequence
ANPLAGKPFYVDPASAAVAARNANPPNAELTSVANTPQSYWLDQAFPPATVGGTVARYTGAAQAAGAMPVLTLYGIPHRDCGSYASGGFATGTDYRGWIDAVASGLGSSPATIIVEPDALAMADCLSPDQRQERFDLVRYAVDTLTRDPAAAVYVDAGHSRWLSAEAMAARLNDVGVGRARGFSLNVSNFYTTDEEIGYGEAISGLTNGSHYVIDTSRNGAGPAPDAPLNWCNPSGRALGAPPTTATAGAHADAYLWIKRPGESDGTCGRGEPQAGRFVSQYAIDLAHNAGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Mycobacterium Tuberculosis Strains Possess Functional Cellulases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PUTATIVE CELLULASE CEL6
total genus 113
structure length 292
sequence length 293
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01341 Glyco_hydro_6 Glycosyl hydrolases family 6
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.40 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel 1, 4-beta cellobiohydrolase 1up0A00
4AVOA 1HGYA 1TMLA 1OCBA 4B4HA 1QK0A 4AVNA 1UP0A 3RU8X 2BVWA 1GZ1A 4AU0A 1OC6A 1QK2A 3VOFA 4I5UA 1UP3A 2BOGX 3A64A 4A05A 3VOGA 3ABXA 3VOHA 3VOJA 1OC7A 3RPTA 1OC5A 1DYSA 3VOIA 2BODX 4AX7A 1HGWA 1UP2A 2BOFX 2BOEX 1CB2A 1OCNA 1UOZA 4B4FA 3A9BA 1BVWA 1QJWA 4AX6A 4I5RA 1OCJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2AL1A 3N6HA 1P0BA 4HA3A 4QAWA 3W7DA 5HMDA 2DT0A 3WLSA 4PTVA 4DQWA 2UWFA 2EJ1A 1AODA 2FFIA 1Q63A 1H1YA 4IPLA 5T91A 5FSDC 2BHYA 2WYSA 4C65A 4QE4A 1LM1A 3NQBA 3NXFA 3W1PA 3WDHA 3O0KA 4RPQA 5SWUA 4MFEA 1JL8A 3VVGA 5CJMA 1JD7A 3SN0A 1D2KA 1THFD 1EXPA 5IOBA 1TYGA 1LYXA 4MTVA 4HK6A 1RQBA 3P14A 1QW9A 3L21A 4DELA 3TSBA 3TNOA 2AQWA 4IIHA 2VCBA 1DIDA 1AD4A 3ANYA 3W2UA 2W3ZA 5KMYA 2GDVA 3VNLA 1EJVC 1H50A 4D2JA 4PSPA 1TQJA 2C91A 3WF0A 2ZUVA 3GTXA 1K6AA 4P8VA 3TSDA 1R3YA 4CQCA 2ACSA 5DCBA 3IJ8A 2CZDA 3DEQA 3G0UA 4ZSTA 4A3YA 2VURA 2XH2A 3F4WA 2HS8A 3SQMA 3VZYA 5T9BG 3G18A 3WUGA 3LD5A 2VOTA 3E2QA 3MMDA 5EL1A 3W37A 3LXCA 1XYBA 3NGJA 5H6HA 4AIBA 6XIMA 4MVAA 4P61A 1E3XA 1UOZA 1YTKA 3ES7A 1ZTVA 4GQQA 1FOBA 2ATMA 3V1PA 1YX1A 3UGVA 1NARA 4OFCA 4OGZA 3GHSA 2ZE0A 1GOOA 2X05A 1SR0A 3WF2A 2VRQA 1UP3A 1GKPA 3GLCA 3VOGA 1SJAA 1FWAC 5A69A 3VIKA 4PMNA 1UD4A 1JXJA 2WNWA 2AMXA 4ERGA 4J7RA 1EDGA 3SCSA 4BQ2A 4J3UA 1VPQA 1XCXA 2PDUA 4D9PA 5BYWA 3EOSA 1YDOA 3BAXA 4C1KA 4C6CA 3W6MA 3GZAA 1CX9A 4S23A 1ZY9A 1NWUA 1U2YA 1E6NA 2BX7A 2F9RA 3LHUA 4Y9AA 3O8AA 3RX3A 2QAPA 2EKGA 3ITGA 5C9RA 4YWSA 2OGYA 1EJXC 2A3HA 2VZTA 1OC5A 4AEEA 2PTYA 3CZ8A 4XTDA 4RV8A 4DWSB 2ISSA 1V08A 3NM3A 2W9MA 3MCOA 4QJ4B 1WKFA 2J7HA 1QOQA 2CWNA 2YZRA 2QLYA 3NQEA 1UA3A 2YYTA 3AZRA 2PP1A 1DJWA 4TV6A 4C7FA 4GIYA 4GZJA 3T42A 4E6MA 1XD1A 3BCFA 5JBEA 4ATWA 3PTKA 1TELA 5TD4A 2A3LA 2V5DA 3WIJA 1S5NA 1LQAA 4XD6A 1XINA 3V5FA 3EPMA 3FK4A 2BG5A 4JQAA 4PMUA 3L23A 3OVGA 2YZ5A 3ERPA 3SCNA 1Q6RA 1TJ0A 3W1TA 4KETA 3AMGA 3SR7A 1U83A 4L6HA 3OW1A 5F2IA 2J8FA 5F4SA 1RSCA 5M3WA 4I5XA 2EKCA 3GIPA 3W27A 4A8NA 1ODUA 2V30A 4JTUA 1JUKA 4LUYA 3SM0A 4O0QA 1EIXA 4ZMGA 3JU2A 2IW0A 3P7YA 1XYCA 3MANA 4P5UA 2CETA 1OM0A 4DF2A 5AC6A 4G1NA 4WOQA 2ZZ4A 1PCKA 1AZ2A 3W2NA 1Q66A 3C8NA 2HVNA 9XIAA 4E4UA 1ISYA 2C1GA 1WUFA 1SW7A 3UR7A 3GUGA 1JZ6A 1ICSA 1OK4A 3M5YA 4KGLA 3GVQA 1K9EA 3S2LA 4ZZ9A 3AMKA 4A3RA 3CAKA 1BRLA 1FWIC 2HS6A 3BW3A 3G1SA 1K8YA 3TLQA 3NZGA 2YBVA 4HD5A 5FF0A 1P7TA 1QI2A 3AC0A 5CJ5A 3RR4A 1LG2A 3RCMA 4HSNA 2W66A 5CC6A 5AYXA 4E2OA 3R2GA 1VLIA 2ZXAA 3EWBX 1R9ZA 2EHHA 1GNXA 2NV1A 1UC5A 5LIKX 5MF5A 4CNNA 1M53A 4E2VA 2OPJA 1UH4A 1E73M 2VZOA 3QQ1A 4Q4SA 2VEPA 3ITXA 2X7VA 3DENA 4EWJA 3VGHA 5I79A 1OWQA 1RPKA 3KUMA 2X1IA 1G5AA 1S1PA 3FXYA 4O0KA 3OZMA 8A3HA 4N9BA 4HN4A 2OR2A 2Z2UA 3VXGA 1IEXA 4CGTA 3H2AA 3RR1A 1MZRA 4K36A 3OLDA 3P84A 1S3TC 2HQAA 3SADA 3AUOA 4M24A 5CAHA 3SCUA 3LCIA 1U1HA 3OA3A 4R34A 5FF7A 3LOTA 4KCTA 4POCA 1RQEA 3CHVA 5IDIA 3WNNA 5KTLA 2X42A 3A13A 3KRZA 2YL6A 4TMBA 1KLZA 4TMCA 2J9XA 2QS8A 3LBCA 1MUMA 2BY0A 4H6QA 1XYFA 2Q09A 5GQBA 2CLOA 4K68A 4TX9A 4QROA 3MSYA 2DJXA 4D6FA 4O13A 2NT1A 3GNOA 3HF3A 1KM4A 1ITQA 4MJZA 2OQYA 5I0DA 3WF3A 1XLKA 4L6OA 1S2CA 5CC5A 4Z1AA 5FL0A 4E2DA 1UZHA 5JU6A 1QNPA 2NVAA 1GOMA 2VMFA 2ABAA 1RBOB 3SY8A 1EP2A 2HBVA 4NAEA 1HJWA 4XAZA 1E6RA 3K8MA 2F2KA 2QMJA 2QDDA 1UWUA 4AVOA 1JDDA 1X96A 1SO4A 2DEPA 2VC6A 4O19A 2XN2A 2BSLA 4MADA 4OUIA 1VPXA 5D9MA 2PFHA 4A05A 2QUTA 4P7LA 2C6QA 2OX4A 2ZUNA 1CYGA 2QIWA 4NXKA 3W88A 2OB3A 2POTA 4NAEB 2OOFA 3P8JA 1YDNA 2GL5A 4EP8C 1QPQA 3UG8A 3MT1A 2OWCA 2ZOXA 3O7UA 2H3DA 4KWOA 3RHGA 2G3NA 3W86A 4JICA 3CIVA 7CGTA 2GGIA 2V67A 5BWFA 2UY5A 4QG6A 1FHVA 5HINA 1XPGA 2JALA 1H1NA 1CEOA 3GYEA 1PAMA 2PCEA 1I4NA 4PSRA 3EX1A 4HZ7A 4NNBA 1J6PA 1OVDA 1ZALA 1JF5A 1UH3A 4TOQA 3ARQA 3BQ6A 3CIWA 4P7QA 4DO5A 3W76A 3QMSA 4ZFMA 4IMGA 3IUIA 3QQ0A 2PAJA 5AVNA 3NVTA 3TQ0A 3UF9A 4DO4A 1TTIA 1XH2A 4W87A 3O06A 5JH2A 4NY2A 1JCXA 2QULA 4F66A 4DJDC 4YYFA 4DJDA 3L67A 4GWEA 5LNUA 4LB3A 3VK5A 1XYMA 4D1JA 2WHLA 3W6LA 2XZ9A 1TV2A 4EF8A 1UIOA 3O2LA 3FHQA 4M6PA 8TIMA 4D6HA 3ZVIA 4JEQA 2XPKA 4PMOA 2B7QA 4ZTXA 4O1CA 4U33A 1IEQA 1W9DM 2OWXA 3KBMA 1BTMA 2UBPC 7REQA 4YJ5A 4ACYA 2WMGA 1HQTA 4Q8QA 2VCAA 4JFWA 3CPRA 4PMQA 1DHPA 3CT2A 3Q37A 1A47A 2V38A 1WKEA 3W23A 2ZUUA 3UR8A 3ABXA 4XD5A 2INFA 1QVBA 3WL1A 5ABFA 4INFA 1XDLA 3DKJA 3R0DA 2PB1A 4LANA 3NM1A 3ICJA 4GINA 3DFPA 3UJEA 4ICCX 3EB3A 2ZC1A 4CUCA 1HT6A 1V6WA 3FYPA 4EK7A 1TMQA 1JQXA 4AU0A 1E56A 3F1QA 1IR1A 5D4YA 5C55A 2D1ZA 3RF9A 3NQFA 1Z89A 2YYUA 5K2ZA 2C13A 4G5DA 2HPIA 2X2GA 3S6OA 1EOKA 4ADSA 4L4PA 5LKYA 3CV6A 4L4LA 1KGXA 2XFRA 1I2RA 4W7VA 3B05A 3H7RA 3ABOA 1ESWA 1QBAA 4K1WA 4WDTA 3VIPA 4EOUA 4PODA 4KWSA 1J79A 1EA0A 1ENUA 3H2FA 2QCEA 3HM7A 3DXIA 1AH4A 1ITUA 3POCA 4JX4A 4XSLA 2D2JA 4L5ZA 4JIRA 4DNMA 4X9YA 2CBUA 2WK2A 2VD8A 4HNLA 2J66A 1XCWA 3WH7A 2WC3A 1HKJA 3NNTA 4JN7A 1E1CB 4QE5A 1LBFA 1V0NA 1P0EA 3R0UA 4IUGA 1LWHA 4O16A 5G4HC 2E4TA 3QJAA 2Z28A 5C9ZA 2J9ZA 1LL7A 5B80A 4IQDA 1PPIA 1KBIA 1AK5A 2YXGA 1JR1A 1EWDA 1KFKA 1XCFA 1XBXA 3UZZA 3THUA 4W89A 4F9JA 4IIFA 1WOBA 2O9OA 1IZJA 3URBA 1ADOA 4AAJA 1H4PA 3MC5A 1BKHA 3LHWA 1V51A 1WBJA 3BSGA 3LBOA 3N2BA 4UZSA 4C1LA 3PZQA 1A53A 4Z1DA 1EO7A 3CAQA 2ZKMX 3WFAA 3F5KA 3IJIA 3W75A 1R3TA 3ZS4A 4HPHA 1QHPA 5BWAA 4ZVJA 5GNYA 3WQVA 1OQFA 4TTUA 4H8UA 4C1NA 5GJNA 4MOZA 3AJ7A 1DL3A 5LNVA 3TDFA 5D2VA 3S2MA 2WVUA 3EZ4A 4AF0B 1UMYA 1UR3M 4REQA 3S2JA 1AG1O 4OHQA 1CXKA 1V0KA 1V3LA 3PZIA 4PMXA 1NQ6A 5LA1A 3WBAA 1XLAA 1KLYA 3WBEA 1HJXA 1GQNA 1H63A 4KWUA 1KBJA 3MUZ1 3XINA 1ZS2A 3MTWA 1XLJA 3VX0A 2ZX9A 2AKMA 1J5TA 4PMZA 4BK9A 1UD3A 3L4WA 3C0LA 2E1WA 3ARWA 3DFNA 4XZNX 1IV8A 5BU6A 4QBXA 4F3HA 2A21A 1PKYA 3ZO9A 1XRFA 1B4KA 1E9IA 1HP4A 3KRSA 2G3MA 4PRTA 3BARA 4OECA 3M46A 4Q8NA 4P7RA 4GIRA 2G95A 5DN1A 1CB2A 5D37A 2GJRA 4A22A 3PBYA 2XFFA 1ZCCA 4NZCA 4Z2GA 2GSJA 4YTTA 4WIWA 4F4RA 4Y9NA 3VNZA 1JCLA 1ZJIA 4FXRA 3G1RA 1XLIA 4JIHA 1BHGA 3QF0A 3RGTA 4KRTA 1ZUAX 1JZ4A 3ZOAA 2OEMA 3UWEA 1OYCA 2BXYA 2GYIA 4U28A 4EANA 4QEHA 4F2TA 4X3ZA 1B57A 3WNKA 3R8RA 5C7VA 1M7JA 3W07A 1E0VA 2HDJA 3FSTA 3UWZA 1E9YB 4AIUA 1B3YA 3B9DA 1XIIA 5CKSA 4UB9A 2XZ7A 3UXKA 3U3HA 3TIMA 1QNVA 5LIWX 1XXXA 2PLMA 2XINA 4AXNA 4MM1A 4JBRA 3UFYA 4A8RA 3LY0A 1FHUA 5LSMA 1BQGA 1L0PA 4DWSD 3INPA 4RE3A 2ZZ7A 1ZENA 2OMAA 5CC3A 5F2LA 2E1DA 2GQ9A 3IAQA 4O11A 3WLKX 4YCPA 1E9LA 4IJRA 1NOFA 3QVQA 3CEUA 4PMYA 5G2IA 4GVHA 4HOWA 3CZEA 5JIPA 3RJYA 3PJUA 1UP2A 1R3QA 3ARPA 1GOIA 4QE1A 3GH4A 2J74A 1K4GA 3FCPA 3ZFHA 1GOKA 3TU9A 1I60A 1GZGA 2VENA 1PHQA 4HJWA 5A94A 4ZXOA 1ZBKA 3W7OA 1I9CB 1ZQ5A 5ECUA 4JD4A 3CB3A 1PTGA 4O53A 3N04A 2WANA 3WJWA 5EMUA 4ZB5A 3R89A 3PUEA 5HR7A 4QP0A 1OADA 5F1VA 4JAWA 3BLDA 1RAKA 1Q6QA 3MW7A 1EO5A 4LEFA 4QNWA 2OEJA 3WY1A 3QZ6A 1VYSX 1ZL1A 2XM2A 4HZ8A 3S1VA 1BD0A 1KXVA 5IDZA 1BYBA 5BXTA 2YL9A 3CQHA 2EF9A 3OU8A 3Q67A 1NWSA 2CZVA 1AJ2A 5CGQA 1Y5XA 5DANA 1HL8A 3E0FA 4JY8A 2WZIA 3RK8A 3AIEA 4JCLA 9CGTA 4E38A 1FXQA 3LNMA 4H41A 3EAUA 4KIRA 3GNXA 4EPBC 2Z6IA 4Q6XA 2PEVA 1WNOA 2VEKA 2WOQA 2ONEA 2P0IA 2PURA 2A3BA 3CUXA 1Q65A 1XM3A 3UJ2A 2Y61A 4N0RA 2ALRA 4J5NA 3AWOA 3NZ1A 2A85A 5A2CA 1WAUA 2BY3A 1MEIA 3AIUA 3QR3A 3SQLA 3SQSA 1IYXA 1OD0A 2E9MA 3VNYA 3WEZA 5HWJA 4B3LA 4PBGA 1J6OA 2QCGA 4AD3A 4BI7A 3ZWTA 3PAJA 3UXLA 3T4CA 2P0OA 3S5SA 2ZIDA 5TBOA 2XN0A 3CGTA 2PDIA 2F61A 2QF8A 5AZ1A 3LCFA 1YBQB 2CYGA 2PWFA 3PWIA 1DIOA 1UW9A 1RHCA 1UUQA 3MB9A 3GXFA 3AHVA 4NP7A 4WY0A 1QCWA 1FDYA 2TMDA 3O3RA 3FEQA 3T8LA 3GQYA 4MUPA 1GCYA 1UG6A 1LT7A 2GGHA 4DO7A 1ZNNA 3M0VA 3WD0A 3L66A 1BLIA 2BHUA 2FTPA 1DHKA 3C2VA 1GHRA 2ZZ2A 3BAJA 4Y9PA 3WLTA 5HOSA 3FFSA 1D9EA 4Z2LA 2TSYA 3BC9A 3D3AA 3BOFA 4GFSA 4UTTC 2NUYA 1F5ZA 4WY0B 1UR8A 3PZTA 3KRUA 1RXOB 3TROA 2FDSA 2I17A 1IHIA 3CYVA 1VFTA 1ISWA 2E3ZA 3IV3A 1JPKA 4G7EA 1VCFA 2H6RA 2WNZA 5FF4A 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4AVOA 1HGYA 1TMLA 1OCBA 4B4HA 1QK0A 4AVNA 1UP0A 3RU8X 2BVWA 1GZ1A 4AU0A 1OC6A 1QK2A 3VOFA 4I5UA 1UP3A 2BOGX 3A64A 4A05A 3VOGA 3ABXA 3VOHA 3VOJA 1OC7A 3RPTA 1OC5A 1DYSA 3VOIA 2BODX 4AX7A 1HGWA 1UP2A 2BOFX 2BOEX 1CB2A 1OCNA 1UOZA 4B4FA 3A9BA 1BVWA 1QJWA 4AX6A 4I5RA 1OCJA
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 1RCQ A;  3L9C A;  4IGN A;  2XVK A;  4NNA A;  2G41 A;  1S5T A;  1VGA A;  3RAO A;  4KFN A;  2WMI B;  3FLU A;  4O1F A;  3PFR A;  3ZYZ A;  5BMX A;  1L6F A;  3QPZ A;  4OBT A;  1E6S M;  2V6A A;  4ZOC A;  2CBJ A;  2YA1 A;  3HN3 A;  3QYS A;  5D9O A;  2PI6 A;  2BXZ A;  2TPS A;  2WLY A;  1VEN A;  3WX7 A;  1NY1 A;  4HA0 A;  2HE5 A;  3GG0 A;  4HNN A;  4S3K A;  3NEH A;  2HIS A;  1QOP A;  2G0W A;  2XHY A;  3UZX A;  3QRH A;  1A5M C;  1BWK A;  3TE9 A;  5ECV A;  1WDD A;  2W4X A;  3VII A;  1BXN A;  4JDY A;  3STP A;  5REQ A;  2V2H A;  3W1U A;  3ITO A;  4R7O A;  1VRD A;  3KHJ A;  1XIE A;  1KKO A;  3HGS A;  4H01 A;  5KZE A;  4OOZ A;  3KBJ A;  5CLT A;  2FVK A;  4ZCW A;  4HTY A;  1RK6 A;  4J3S A;  4AD1 A;  1UWS A;  4W93 A;  4BY3 A;  4N7Q A;  3M0X A;  5DMY A;  2W27 A;  5IHR A;  5I23 A;  1VKF A;  1N8W A;  3MS8 A;  3WK1 A;  4H7C A;  3N15 A;  2F6K A;  4L1G A;  4HJF A;  4IIB A;  4K7Y A;  1ITX A;  3B0P A;  4PCP A;  1Y0E A;  2A7R A;  4C6D A;  2O7S A;  2CLP A;  2P1F A;  1Y7V A;  3UR2 A;  4X22 A;  4WSK A;  2UY2 A;  1JI2 A; 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 4AVO A;  1HGY A;  1TML A;  1OCB A;  4B4H A;  1QK0 A;  4AVN A;  1UP0 A;  3RU8 X;  2BVW A;  1GZ1 A;  4AU0 A;  1OC6 A;  1QK2 A;  3VOF A;  4I5U A;  1UP3 A;  2BOG X;  3A64 A;  4A05 A;  3VOG A;  3ABX A;  3VOH A;  3VOJ A;  1OC7 A;  3RPT A;  1OC5 A;  1DYS A;  3VOI A;  2BOD X;  4AX7 A;  1HGW A;  1UP2 A;  2BOF X;  2BOE X;  1CB2 A;  1OCN A;  1UOZ A;  4B4F A;  3A9B A;  1BVW A;  1QJW A;  4AX6 A;  4I5R A;  1OCJ A; 
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