3W22 | Genus

Total Genus 107

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	107
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-3-125 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus	107
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2012-11-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w22A02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w22A01

2O7QA 3EX1A 1YDNA 1VR6A 3G1AA 1VQTA 4JTJA 2WV8A 4NU7A 4UTKA 3W07A 2QJIA 2HS8A 4WY0F 1BWLA 3OVRA 1HFBA 2OMAA 3LOTA 1U5JA 3L0KA 1FDZA 3FYOA 1B57A 5D33A 4M7SA 4POCA 5H2ZA 1X1ZA 4FIQA 4FIRA 4NJKA 1EUAA 1C9DA 2G96A 1JCMP 1A5AA 1GTEA 3ABOA 1SUXA 4A3UA 3NOEA 3W1NA 3MHUA 1TJRA 3EXRA 4AEOA 2X16A 3TR2A 2V0TA 1JR1A 3F4WA 5LGZA 5J5RA 3HB9A 1VC4A 2JBMA 4OT7A 3VE9A 2QCCA 2DZPA 2J27A 4JDBA 2OT0A 4MZ1A 4ADUA 4L4MA 4O14A 3RNDA 1FBAA 3LLFA 1VHNA 1OVDA 1WXJA 4RLIA 3W1AA 2VELA 3K30A 4M6PA 1LORA 1MO0A 2Y7DA 3MUXA 1AMKA 2CU0A 1J2WA 1GT8A 1FCBA 4JY9A 3LHYA 1M7PA 4TIMA 1XDLA 4KKXA 1JVNA 4X9SA 2R8WA 3CLMA 3IIZA 3QW3A 4UFJA 3SZ8A 1WX0A 3OVQA 3ABSA 5DXXA 2GVGA 1W3IA 3HPSA 2Z2UA 4M7TA 1OK6A 1J5TA 3LCGA 5CGQA 1H7XA 3BO9A 1M7OA 1LROA 4Z08A 4BFAA 4Z0SA 3W23A 1S3HA 1Q6OA 3CT7A 1QPNA 3IRDA 1ZHAA 2WSYA 5EKYA 5D04C 3STCA 2ATMA 2WSQA 4RV8A 3TC7A 2VFFA 4IJBA 4U4MA 4NNCA 2FDSA 2Y6ZA 1G7UA 4LY8A 3W85A 1K02A 2CZ5A 2X1SA 2AQWA 1N8FA 6ALDA 2FPTA 1D3GA 4XKYB 3EKZA 1LRNA 5HUOA 2GQ8A 2Y85A 4JICA 2RKXA 3QSTA 4BF9A 4H3DA 4TO8A 5CSSA 4YL2A 1R2SA 1SFJA 4OGZA 1T8XA 4X22A 5FEZA 3T44A 1V5XA 1TV8A 1FCUA 4XBKA 2NV2A 2QCNA 3P5YA 4FX7A 5E1QA 4N02A 1PS9A 1EWEA 3BGJA 5D2XA 5TIMA 1ONRA 4UC5A 3LHWA 5LNUA 4Q32A 2NX1A 4PTNA 1BKSA 4HKPA 3G1SA 5KSWA 3MBFA 1EEPA 4MJMA 3L5LA 4CQAA 3L67A 4Y6GA 2C1HA 4R53A 3KHJA 4TMBA 4HNTA 5CPMA 1TYGA 4LS2A 3NL2A 3W6YA 1TSIA 2HS6A 3MO7A 4MLJA 2AAMA 2NXHA 3TV8A 3W1RA 3KVLA 3RLUA 3DU0A 1FWWA 2RDTA 4IWWA 4O1AA 2PRMA 5AYYA 4UTUA 2TSYA 2ZBTA 1Z44A 4HIBA 4Y96A 1RV8A 4AB4A 1YYAA 1S5VA 2A7NA 2H8XA 5D2YA 2G95A 4ZQCA 1QPOA 5L9FA 4UTTC 5FEXA 2O7SA 1K03A 3GZ3A 1I2RA 4FEZA 3UWVA 3DKJA 4ZMGA 1MEWA 3P60A 3L21A 4JD4A 3GXTA 4RXGA 5IM51 4AHOA 5F2LA 4M6VA 2ZZ2A 1VCGA 3S5ZA 1RPXA 4G1KA 1WA3A 3TW6A 1TJPA 3EX6A 4MVAA 2QCGA 2QCMA 4LU0A 1KBJA 3A9IA 3W1PA 2QUUA 3W7QA 1J4EA 3QPZA 4E38A 3BLFA 5LNVA 4IMDA 3DFNA 5K9DA 3CC1A 1NAL1 3CB8A 1TREA 4ZQRA 4NT0A 4JGDA 3OA3A 3TAOA 4IXXA 2QUTA 1K8XA 4QNEA 3SIZA 1K8ZA 1UUOA 4O0ZA 1VRDA 3WJWA 5DCDA 5HR6A 2C15A 4JTHA 5F2MA 4LVAA 1DV7A 4GC4A 3S5YA 4UMCA 3HO8A 3TC6A 1FDYA 4LC6A 5F1VA 1GZGA 2X30A 4WOZA 2JKAA 3PSVA 4DF0A 4LW7A 3PUEA 5I3IA 3E9AA 3G3MA 4K8HA 2A6NA 2B7NA 1TTPA 1QO2A 1QOQA 2Y7GA 4A2RA 3QQ0A 4IUOA 2PE4A 4IOTA 1W8SA 3MHGA 1IGSA 5E0KA 5C6MA 5I3GA 1N7KA 3JS3A 3B0UX 1H61A 2CZEA 2QDHA 2YFOA 4MIMA 4UIOA 2P0OA 1X8FA 4NXKA 4CQ8A 4NNAA 4AHQA 4K8EA 1I2OA 3P62A 4IPJA 1G4TA 3STGA 1I2NA 1OFBA 1G7VA 2ZQ0A 3GKFA 5DN1A 2J88A 4LRTA 4W9TA 1IXNA 3DFPA 1TQXA 3HG2A 5F2IA 3O6DA 1YTEA 1HO1A 3TAKA 4ALDA 3DFTA 3HIJA 3F03K 4ML9A 4Q4KA 1R2RA 4KFOA 3TSMA 4K38A 5CPNA 4XQ6A 1Y0EA 4LUJA 4NX0A 3TX9A 1GYLA 4K39A 3NA8A 4MUZA 2DZVA 3LCLA 4HPXA 1BWKA 4N9CA 3MI3A 3C2EA 3GX9A 4NJJA 3W1QA 1FUYA 3TUUA 2CLMA 1SQ7A 1X6UA 1XBXA 2JGYA 2V82A 1O95A 2E5CA 2PC4A 2TRSA 4IMEA 4N6EA 3PBYA 1IIHA 4ZVJA 3QQ1A 3TE9A 3G1XA 2ZDRA 4E0CA 4RR4A 3NQMA 3LHUA 3PBVA 3HPXA 4AMAA 2YSWA 3UZ5A 4QNWA 1R46A 3R2GA 4O16A 2DP3A 3G1DA 4CCCA 2X1UA 5LSMA 1OYBA 5FF3A 1F74A 1PIIA 5HNRA 5CZ0A 1LBFA 3W7IA 3CWOX 4PFMA 2DZSA 2ZRVA 4UR7A 5H91A 5SWUA 3V75A 3M41A 4Z0JA 1UBSA 2Q3RA 1GOXA 5FESA 3W2UA 1OG0A 1LDCA 1XC4A 4GNJA 4MY9A 4YMZA 3EWUA 2ZRZA 3NQGA 3FS2A 4Z1AA 1DQWA 2V30A 5A8GA 2QJGA 4NXSA 1HL2A 5AYZA 1AL8A 3IGSA 3GDLA 2E5BA 4X3ZA 4TU1A 5TQLA 3ZS4A 2NUWA 4ICNA 3BG9A 3DFOA 3W86A 3R89A 1GQNA 1WOBA 1GYNA 4LUIA 4P2VA 2IQTA 2VC6A 5AHLA 1SSDA 4C1KA 2FPYA 3SSJA 1JCNA 5BMXA 3HG4A 1HUVA 3Q94A 1TRDA 1FX6A 3JR2A 3KVMA 4O28A 4JIQA 6TIMA 4YCOA 5AOUA 5GVJA 4RZ5A 3OG3A 1PCWA 1TPH1 3W2MA 3LTSA 2Q8ZA 2Y63A 3PBWA 1W54A 3SY5A 3GR7A 4GUGA 2DZTA 2A4AA 3WK1A 1YTDA 3GK0A 4MLRA 4A2SA 2H3BA 1KA9F 3HPZA 1W1ZA 4GUFA 4WZHA 1LLZA 1P4CA 2QKFA 4O18A 4CNNA 4BK9A 3PG9A 3EX4A 3TIMA 3FEMA 2E6DA 2RFGA 1LRTA 3UWZA 3FYPA 3QRHA 4ONVA 5D09A 4JY8A 4UTWA 1MSSA 1EA0A 1M6JA 3S42A 1NSJA 3M43A 3A23A 4LNYA 3GAKA 3W2KA 1VYRA 2J6XA 1I8JA 1XBZA 2YCEA 2VFDA 5KZDA 4AAJA 3GB6A 1UASA 1AK5A 1D9EA 3LCWA 2J9ZA 4JDYA 3VFLA 3GDMA 3UWYA 3Q37A 4RZ4A 4LVFA 2V2DA 1GVRA 3HOJA 5HWNA 3ATYA 4UFLA 1H7PA 3TH6A 3KRSA 2DORA 2YXGA 1OF6A 5LGXA 4O19A 1EP1A 3WJXA 2B7OA 5C5YA 3PF3A 1F05A 5AC7A 1R30A 1RR2A 3NZ1A 2FLIA 2WNZA 3H54A 1OFDA 3O63A 1YLVA 2GQAA 4HNVA 2VEKA 4RX0A 3INPA 5FI8A 1AW5A 4KWWA 3BPWA 4OE7A 3G24A 4HSNA 4AHPA 4TR9A 3NQDA 4UXDA 3GIYA 3SI9A 4JS3A 3UPBA 2X1RA 1SO3A 3EXSA 4Z1DA 1LYXA 2VEMA 3LCHA 4A22A 3W2NA 3S1UA 5LNSA 1KFKA 3NAVA 4RZ6A 3O1NA 1OYAA 3BVJA 1VYPX 2P1FA 3NQAA 4QQ3A 2EGZA 4LT9A 1DL3A 5D2TA 4P61A 2E68A 1UCWA 4QM1A 2HMCA 1RQHA 3TQKA 3GNNA 3PS7A 4JTEA 4JTTA 2BSLA 3BK0A 1DQXA 1Z41A 3QH2A 4FX8A 5EMUA 3UD6A 3EX3A 3LBMA 2CLFA 2CLIA 2VOMA 4N9DA 1KFEA 2Z6JA 3I68A 4S2BA 3IIXA 5EBUA 3W7NA 3LI1A 2NUYA 1YDOA 3EXTA 1WBJA 5FF2A 1GVQA 3NZRA 4UCGA 3W1MA 2V5BA 1SPQA 1Z42A 3E02A 3FJLA 3MHFA 3DBPA 3CEPA 2YDAA 3W1TA 2TPSA 5G2HA 1X7FA 3G0SA 4MY1A 1HG3A 2WNNA 2JGQA 1KM0A 2PRLA 1KTCA 4LVGA 3E49A 1G67A 1G4SA 4M6QA 5C54A 1XBYA 3NPVA 4MY8A 3M0ZA 3QC3A 4WXZA 2QCLA 1H60A 3LHZA 1H62A 2XFWA 1CW2A 3Q2DA 2ZRWA 3KRUA 3LI0A 3GXNA 1PV8A 4FNPA 1VZWA 4JTLA 3G1FA 4XTIA 3DENA 5G4EA 3EWZA 4NZFA 3MI6A 2D73A 3TCEA 3EWXA 5F4XA 1JUKA 2ZFAA 3H53A 3M44A 3M47A 4GBUA 4M19A 4AXKA 5CG7A 3G8EA 1RZMA 3TNOA 5BOOA 1O60A 4O54A 5U7SA 1SZGA 4GWEA 2G5WA 1WQ5A 1EWDA 3A5FA 4KFNA 4MYAA 4U28A 1MEHA 3STFA 3C52A 4OQVA 3W74A 2C19A 3L5AA 5D32A 1GG0A 3N2XA 1DOSA 3N3MA 2W79A 3LXBA 1F76A 5D02A 2DJXA 1I4NA 3N9SA 5HINA 1WDWA 4UFIA 1C29A 4CNOA 2NX3A 1YPFA 2I14A 4B5NA 1GVOA 1KFLA 2UV8G 3GKAA 1FWNA 4LWWA 1T99A 1UUMA 1TQJA 1VCFA 2CLHA 4N2YA 3GDRA 4K7VA 1KM2A 2ZZ5A 5FF7A 2QDGA 4O11A 4FXRA 1K7FA 4JYEA 5MHBA 2Y62A 4HHPA 4NQ1A 3QMSA 3MI2A 2J9XA 2GJNA 4ORMA 3PR2A 4J9JA 3LHTA 4UFHA 2YGYA 1IIGA 2VEIA 3P67A 1T0OA 4DPQA 3THAA 3T40A 4QJ1A 5DY2A 2C14A 3MBDA 5AC8A 2E1DA 4RKAA 4UTIA 1VH7A 1SU5A 3TK7A 2ZA3A 4X2RA 2A1YA 3NPXA 3BW2A 5D03A 2Z6IA 3QPYA 3W7KA 4MZ8A 4DO4A 1CX9A 2XN2A 1GTHA 3U8GA 1OX5A 4O0KA 4YWIA 3HG5A 3UWWA 5EL1A 1RQBA 2EPHA 3SGZA 3W7OA 3A22A 2HSAA 1XUUA 4S2CA 3I65A 3T55A 2GJLA 1O5KA 3VKJA 2AGKA 4N4PA 4BR1A 2J9YA 1OFQA 3M5ZA 5AHNA 1P1XA 3NDOA 1SZFA 2GQ9A 4QAIA 3W7LA 5F4SA 1EB3A 1OYCA 3F4NA 3ANYA 4O4VA 3T4CA 5KZEA 3NYZA 1SR9A 1VHCA 1TRIA 1VGAA 4RJEA 2WJZA 2FIQA 4L4LA 1Q45A 2F84A 5K7JA 2C6QA 2NWRA 4FNSA 3S1VA 1M5WA 2OT1A 1FWSA 4AWSA 2DU2A 1I2QA 1U83A 2A0NA 5J5DA 2CZFA 3YPIA 3VE7A 3QFEA 1QMLA 4RK8A 2XN1A 3QEZA 4FNUA 1OFOA 3EWYA 3L5MA 1F6KA 2NXGA 4DQWA 1GVSA 4FHAA 4JX6A 2QEZA 3QW4B 4FXSA 1VLWA 2QCFA 3UY7A 1BTMA 4K6AA 3DH7A 3ZWSA 5U4NA 3EWWA 1JQXA 3FOKA 3P8IA 3IVSA 1OFAA 3LV6A 3LDVA 3MW7A 4DO6A 1I2PA 1JRCA 5IBXC 2ZA1A 4AVFA 4O12A 2BXVA 2VFEA 3NEVA 2X1TA 4GUHA 3SFKA 4XTDA 3U6WA 1NF0A 3HG3A 3MWAA 4DPPA 5AHEA 2V2HA 1B4KA 1F7BA 5BMWA 3FKRA 1VS1A 4HN4A 3CPRA 2W0UA 2C3ZA 4FO4A 1L9WA 4I9AA 1IXQA 2H6RA 3M1ZA 1H7OA 3IVUA 3W72A 3LLDA 5C2XA 1PHQA 3RMJA 4EF9A 5E93A 2XN0A 3G8RA 3LTYA 1DVJA 3OEXA 1ICSA 1SZEA 5I3JA 2QR6A 1L2UA 5F4WA 5AYXA 3IV3A 1ME7A 1LM1A 3FA5A 3NVTA 5DXYA 3GR8A 3GNDA 4O1DA 4M5PA 3PY2A 1XFBA 5G5IA 3G1HA 1QCWA 2I9EA 2ISVA 2ZRXA 2QAFA 1ME9A 3GXPA 3KRZA 2NLIA 3LBCA 4I7UA 1MEIA 5HWMA 3DHFA 4XBSA 1D3HA 1O4UA 5EA9A 1ZAHA 5FEWA 1ALDA 5D38A 1VCVA 1TTIA 5HMSA 2R91A 3BV4A 1JULA 1FWTA 3NXFA 5D2WA 2CLEA 1SW3A 2YX0A 3NNTA 2KZHA 3S1XA 5C55A 4UUIA 3TXVA 1LZOA 2GVLA 2CLOA 4TX9A 3R8RA 4GUJA 1SFLA 5DBTA 2Y89A 1V7YA 1H51A 1W31A 2NV1A 3W7MA 4QSHA 4WXYA 2DZWA 3FLUA 3W70A 3CIXA 1IXPA 1HTIA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3W22A

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