2HVMA

Hevamine a at 1.8 angstrom resolution
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
GGIAIYWGQNGNEGTLTQTCSTRKYSYVNIAFLNKFGNGQTPQINLAGHCNPAAGGCTIVSNGIRSCQIQGIKVMLSLGGGIGSYTLASQADAKNVADYLWNNFLGGKSSSRPLGDAVLDGIDFDIEHGSTLYWDDLARYLSAYSKQGKKVYLTAAPQCPFPDRYLGTALNTGLFDYVWVQFYNNPPCQYSSGNINNIINSWNRWTTSINAGKIFLGLPAAPEAAGSGYVPPDVLISRILPEIKKSPKYGGVMLWSKFYDDKNGYSSSILDSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The 1.8 A resolution structure of hevamine, a plant chitinase/lysozyme, and analysis of the conserved sequence and structure motifs of glycosyl hydrolase family 18.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEVAMINE
molecule tags Hydrolase
total genus 96
structure length 273
sequence length 273
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 1996-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2hvmA00
3TONA 4PRWA 1BPLB 1QNQA 3WY1A 3WD0A 3BAIA 3VU2A 3CHFA 4U5KA 2FDMA 3RJYA 1DWGM 3VKKA 4AZCB 1E40A 2WKLA 5I2UA 4WKFA 5EBAA 3MV11 2YJQA 1US2A 1MQPA 1EHAA 4D6FA 1NARA 3SCNA 2D0GA 4CD4A 3PZTA 1JNEA 3RM9A 1R8LA 3OIHA 3L4VA 2J8GA 2ZUTA 1UR8A 4MB4A 3N1AA 3M7SA 1GUVA 4KRTA 3WQ6A 2WK2A 4DM1A 1WZKA 2YLLA 1GOWA 2JF6A 3WH6A 3VGFA 1V6UA 4C7GA 2CESA 2XSAA 3ZJKA 4B9YA 1V3MA 3WH8A 4UQBA 5LA1A 3KEHA 1D3CA 1E0XA 3EBVA 4AD5A 2ZUWA 1JDCA 2OWXA 3DYPA 2ZX9A 3CHEA 3VD4A 3A6OA 3AHTA 1KGXA 3T0DA 1KB3A 1B3WA 4HTYA 3MU7A 2OSWA 3VDHA 2WHKA 4PCTA 4B15A 1QVBA 3VX1A 3K46A 3WNMA 4BA0A 1KR0A 3U5UA 5A69A 2PC8A 4FF5A 1E0WA 4LYPA 2ZXAA 2ZUVA 2J47A 1V0KA 3AIEA 1NP2A 3EDJA 1WZAA 2WMKA 5C71A 1J0HA 1WB0A 3PTQA 4CVUA 5HPCA 1B9ZA 1E6PA 5AYBA 2QHAA 3CTTA 4W88A 5DO8A 3SUVA 1W3LA 2VVSA 4HMEA 4UFHA 1B0IA 1JZ3A 4A3HA 4W84A 1VFFA 2DGAA 4JL2A 3RM4A 1ZS2A 1WO2A 1D7FA 4NRSA 2WCGA 4GQQA 5JBFA 1HT6A 2VVNA 2J75A 2OSYA 4LYQA 3WUEA 1AQMA 1W9VA 2YBUA 5DFAA 4EE9A 5A1AA 2PWDA 3DHUA 3PZUA 4PMNA 1OBAA 3FAWA 3RJXA 1EO7A 4PMUA 4D1IA 2W4XA 1CIUA 2XM1A 1WAWA 1JAKA 5EB8A 1GHRA 4AIOA 1U2YA 1TA3B 2BY0A 2FH6A 1I1XA 3GNPA 3UERA 1TE1A 3WNOA 1E6ZA 1KBKA 2YDQA 1MQQA 3BAJA 4PMRA 3MSGA 1NOUA 4EAMA 3AISA 4X0VA 2G3JA 5GNZA 3MUZ1 1JDDA 1QI5A 2WVTA 1R86A 3ZJ8A 4ATLA 3ZMRA 2B31A 1E15A 4S3JA 1XYFA 3PZ9A 1JYVA 1XYZA 1E71M 1CGUA 4HPHA 4L4PA 2CYGA 4AW7A 4GQRA 1DP0A 1JXKA 4J3UA 2WYSA 3IJ9A 3AXIA 4UFJA 2V3GA 2GSJA 2WANA 4GXPA 1KXTA 4Q7NA 5M5DA 1E55A 1EO5A 2EJ1A 3LMYA 1XRVA 2W66A 3HU7A 4YHGA 2J77A 2YDRA 1XSKA 2GFTA 1QI3A 1LG1A 1TR1A 1K9TA 2WMIA 3PZOA 1CPUA 3L2MA 1FP9A 1E6SM 4N42A 2XSBA 4LPCA 5JBEA 2BY2A 5FIPA 4CCCA 3UR8A 5E0CA 2J4GA 4D6GA 3A4WA 7TAAA 1UKTA 3GXIA 2G3IA 1Q4NX 4KH2A 5E9AA 3DYMA 2EPOA 1E6RA 4J3TA 3PZGA 3S2CA 5HDRA 1C93A 3IAQA 2D2OA 1WCGA 3LPGA 1UKQA 4P7NA 4JCMA 3GNOA 3K4DA 2CPUA 2X05A 1YQ2A 3OB8A 4GO9A 4UOQA 2XTKA 3WDRA 1EDTA 1UD4A 3WQWA 5AC5A 2Z1KA 3W27A 3CUHA 4AD1A 4CU6A 1GOOA 3WH5A 1UKPA 5A2AA 3UG3A 3WD2A 4D6CA 1BG4A 4HZ6A 1Q6FA 3WBAA 2FGLA 3AXXA 3EMCA 1GPFA 4QLKA 3FW6A 3HMCA 2ZUNA 2Q8XA 1HJWA 3AS1A 3T2PA 1E9LA 4H8UA 2CHNA 2DPEA 5HBFA 1DEDA 2OLHA 5IFPA 4UZSA 2FHCA 2AMGA 2E40A 3OLEA 4ZEPA 4PMYA 2EPKX 3NCOA 1VJZA 5CXPA 2ZX6A 4UQEA 1S46A 3CUFA 1TFVA 2HVMA 3WFZA 2GVYA 2WAGA 1H3GA 3N18A 3WUFA 1JFHA 1C90A 3IJ8A 1GW1A 3ZT5A 4W7WA 1B90A 1UUQA 4W7VA 3SCOA 3ZJ7A 3WUGA 1BVNP 4FLSA 4E4PA 1XH0A 1VJSA 3ARYA 3VOCA 4P8WA 3BCDA 1VEOA 4XX6A 4V27A 2W67A 2X8RA 5A2CA 4Z2JA 1C8QA 4D6EA 4R27A 5ABFA 5DEZA 4HMCA 4FLRA 3GDBA 2FHBA 2DIJA 1KWGA 2D22A 4PUEA 1ITCA 3WL0A 1V03A 2V3FA 3CZKA 1JI2A 1JDAA 3WSUA 1X6NA 2WCAA 1AQ0A 1RH9A 1C91A 3AHXA 4IUGA 4CD8A 1QBBA 2XGBA 4UCFA 5FKYA 1D2KA 1ZL1A 5A8MA 5A6JA 3RIKA 3VM7A 1BFNA 3VTRA 2DT2A 3GBDA 5DT7A 2G8ZA 1BVZA 3WF0A 3VD9A 2J25A 3W24A 1ESWA 1E4IA 1WE5A 1E0VA 2DT1A 1DWJM 1EOKA 1NOWA 1V08A 1GONA 4M82A 5E6YA 4W89A 5HPOA 1SMAA 4PN2A 4UOJA 3GXDA 1X6LA 3VINA 3APGA 3VGEA 3NUKA 1J0ZA 1XD0A 2J7FA 4B3KA 3EYPA 3B9EA 1B31A 1HX0A 4FLOA 2CBVA 2PWFA 5HXMA 2FH8A 1UD3A 1KQZA 1FP8A 5I79A 2CBUA 4IPLA 2XIIA 3U7BA 4AZBA 2GJXA 2WXDM 1JIBA 5A6LA 4TXEA 3W29A 5A6MA 1JD9A 3HJEA 5BRPA 1OWQA 2GUYA 3WELA 3BAYA 1PX3A 2EPNA 4H04A 5AY7A 3WEZA 1GZJA 3WDJA 3CPUA 1HNYA 1JL8A 5GNYA 4AYSA 2WC3A 1AVAA 4QLJA 3ZT6A 4P7OA 5CG0A 2PBGA 1L0PA 2VRQA 3VIPA 2WBKA 1KXVA 1OSEA 4AEFA 2VNCA 3AIUA 2Y2WA 3AS3A 1KQYA 4J3WA 1U30A 3NYDA 3ZO9A 1HL9A 4RL3A 1GNXA 3EDEA 1A47A 4MTVA 1LL4A 4JKMA 1V02A 4X0NA 1PAMA 4PMVA 3F4VA 1W9XA 4LX4A 3ALGA 9CGTA 1M03A 1JI1A 2VX6A 1UOKA 1ODZA 4HP5A 3THCA 3PHAA 3PZMA 4GPNA 3AHYA 4PMZA 3L4ZA 3OLGA 3AI0A 3BLPX 5CZKA 5BWFA 3FAXA 2WMHA 1VFMA 2DT3A 2F8QA 1JZ2A 3A4XA 1WDRA 3WNLA 2QMKA 1JNDA 2EO7A 2UY4A 6TAAA 2BY3A 3B8SA 3WH9A 1W9BM 1XHGA 3AZTA 2OYKA 2JE8A 1QNRA 4EKJA 1UH3A 1V3IA 4JAWA 2BHZA 2VCBA 1CNVA 2XVNA 3SEPA 2YKKA 4UZUA 1FH7A 3ARTA 1VBUA 4UQ9A 3T09A 1E73M 1ZJBA 3WMBA 4GINA 5BCAA 2QLYA 4P8UA 1CLVA 1J0IA 4KGJA 1KWKA 2CXGA 2BHYA 2G4FA 3UG5A 3RDKA 3TP4A 3WNPA 4JCLA 3S6TA 4PYSA 2XG9A 4Y7EA 2O9OA 8CGTA 1BYDA 2Y5EA 1PX4A 1SMDA 5JIWA 3BGAA 2PF0A 1KGUA 2NW0A 2DSKA 4HA4A 1V02E 2GDUA 3SCQA 1BGAA 2WWCA 3WNNA 3VIJA 1LLOA 2WM0A 4EK7A 3RMEA 3AS0A 1HJSA 1O6IA 5CGTA 3VD7A 4Q22A 1NH6A 1QNPA 3N04A 3SUTA 4F9JA 1GVIA 1TVPA 3T0BA 3N11A 4R5EA 3SCPA 4GO8A 2V5DA 3DHPA 3OA5A 3MV01 1HKJA 1RD6A 4F8XA 4F9DA 3WQ8A 3G6LA 1V0LA 4OUEA 3SCWA 2QF8A 4P7LA 1F4HA 5FOOA 1E3ZA 1ISVA 4GI8A 3W4RA 5EFFA 3DYOA 4ACZA 4IPNB 2WMFA 1H09A 1VEMA 1E6XM 3IAPA 3VMPA 1V0MA 5GPRA 2A3HA 2WB5A 2XYLA 4OJYA 2VL4A 4WK9A 1OGGA 3CZJA 4XV0A 5A8OA 2VMFA 3WD3A 3TTYA 1ZJAA 2IUZA 1HKIA 1EH9A 1HKMA 4MJ4A 2DSUA 5I0DA 1OD0A 1E56A 4LXFA 4QAWA 2YBTA 3ZOAA 4TVDA 2QMJA 3F5LA 2V3DA 1J9YA 1M53A 4WLCA 2IXVA 3WF3A 1CBGA 2YL6A 1XV8A 1H5VA 2W63A 3NDYA 3K4AA 4J28A 1NWTA 1QOXA 2E8ZA 1KGWA 4PMQA 2XVKA 4MDOA 3WDPP 2YIHA 1B3XA 4C7FA 1VF8A 5A3HA 2WLYA 1E72M 1LL7A 1CGTA 4ATDA 1ISZA 3L4WA 1PIGA 2PB1A 3VIFA 2RGLA 1LF1A 2UY5A 1UZ4A 3MMUA 1HJQA 5D9OA 1J12A 1VENA 4V2XA 1B3ZA 1M7XA 1XCWA 3OZPA 2VZUA 3MSDA 2BVTA 3A4AA 3AICA 3MUIA 3W28A 3FXYA 3GH7A 5I3DA 4AZIA 3L4YA 4PSRA 2VZTA 4DWSD 3VVGA 3BCFA 1G9HA 3GH5A 2BVDA 3ZR6A 3ZR5A 3N15A 1EOMA 2JIWA 3FY1A 1JF5A 3AIBA 1KFWA 2D1ZA 2MANA 2YL8A 4MNKA 1VBRA 4AEEA 3EDKA 3SUSA 1Q6EA 2JFEX 3AHZA 4IM4A 3ARVA 2PWHA 1FHDA 4Z2LA 5BXRA 2EXOA 3WQ4A 2ZIDA 5IDIA 4F79A 3O9NA 4W86A 2D24A 5CGMA 4P7RA 4PTVA 2UY3A 3PZNA 1BYAA 2D23A 1GVYA 1OB0A 2OWCA 1C3FA 2CETA 1LL6A 1OGSA 1EIBA 4OIFA 1LWHA 3UR7A 4A3YA 3ZQ9A 3VDAA 2WMIB 3POCA 1UQYA 4PTWA 4NI3A 1K9EA 1V3LA 3CZEA 2X2YA 1EGZA 2GJPA 3ZSSA 5AC4A 2JEQA 1FFQA 4U2ZA 4CCDA 3M46A 2ZX8A 3ZJ6A 1V3HA 1JAEA 1SYTA 2WNWA 4BQ4A 2UWFA 3I3BA 3L2LA 2GK1A 4JFSA 4J3VA 3O2LA 1EQCA 4W8BA 1ZBCA 3CGTA 4MAVA 1WDQA 3OLIA 2CKRA 3A47A 4D72A 4BQ5A 4PMDA 4FK9A 2VCAA 7CGTA 3W53A 1GJUA 3EDDA 3WNKA 5D4YA 3VM5A 5I24A 3B9DA 4CN1A 5A95A 3KWXA 2AAAA 1E43A 2HISA 4OBRA 2NT0A 5GQBA 1JFXA 1B3YA 3ARUA 3MMWA 4PBGA 3VGHA 1GQKA 1NOFA 2W61A 2ZOXA 3BAKA 2O92A 4QFUA 1VIWA 3CZ8A 2ZICA 3SCRA 4JFWA 4JFVA 3B9AA 8A3HA 3WUBA 4CUCA 1E70M 5JBDA 5IHRA 4MNJA 1GJWA 1K6AA 5A94A 5DMYA 2BNJA 1IV8A 4CD6A 4NF7A 3MMDA 4AD2A 2VR5A 2VT0A 4MAZA 1CLXA 1DWAM 1E1EA 3FHQA 2PI6A 1WKYA 1W9UA 1Y7VA 2A3BA 2EPLX 2VO5A 2VZOA 2CIPA 2QPUA 3A3HA 1DHKA 5CPTA 3N13A 1OIFA 2XFFA 5ABFB 3D5HA 4M80A 3SCTA 2WC4A 4Z2KA 1JYWA 3GXMA 1UH2A 7A3HA 4QP0A 1H2JA 2BS9A 5BRQA 2W91A 3OLDA 3SUWA 5ABHA 4UNIA 4DUXA 1K9FA 4CCEA 1HIZA 1UD8A 5CLWA 5CPQA 1I75A 4J3SA 1XH1A 4FMVA 3BSHA 1UWTA 3TOPA 1UR2A 2OSXA 1V0NA 1W9PA 2X1IA 2E9BA 1ITXA 3L4UA 1HL8A 4JL1A 5AYIA 1J0KA 1UG6A 4B9ZA 4JIEA 1WDPA 4MNLA 5HNNA 4BF7A 4DUVA 1MXGA 2WBGA 4Z2GA 1H49A 4WKAA 2W62A 3ARSA 1ISYA 4UOZA 3AOFA 4U31A 1V6WA 4PTXA 1N82A 3NSXA 2G3MA 3VGGA 2J7DA 3K1DA 3VIMA 5JUVA 3KE0A 3T2OA 2J7EA 4UQCA 3AXHA 4AZGA 2NT1A 2YOCA 4QDMA 4OBSA 3W0KA 1BYCA 3WF2A 1V6XA 2GJXB 1CXEA 4ZE4A 3WN6A 4E8CA 1LQ0A 4AD4A 2J79A 4PMXA 3VO0A 1CDGA 1MW1A 2VQTA 3LPOA 3VX0A 2VX4A 4W87A 1LJYA 1GHSA 3E1F1 4QCFA 4V28A 3N12A 1NWRA 2VC9A 3PZVA 3J7HA 2XIBA 2VJXA 3RO8A 3I3EA 4E2OA 5E70A 3VD5A 2E3ZA 1HN1A 1TMQA 1E5JA 4TTGA 5FL0A 3VDBA 3AMGA 2J7HA 3AZRA 4NSBA 4B16A 5CSUA 1VEPA 4W8LA 1XD1A 2OYLA 4JZ5A 2WVVA 3PZIA 3M07A 4TTUA 4Z2HA 2DDXA 3KL5A 2ZXDA 1J01A 4B3LA 1E5NA 3AYSA 3OZOA 1PIFA 2WMGA 4GZIA 4ZE5A 1GOIA 5I23A 3T0AA 1UR9A 4TVCA 3WKZA 4TVUA 5M03A 1UQZA 4P8VA 3IANA 4YN5A 1Z32X 3LPPA 1BQCA 2J7BA 1H11A 1UR0A 2BV9A 4D6HA 1BGGA 2WZEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3TON A;  4PRW A;  1BPL B;  1QNQ A;  3WY1 A;  3WD0 A;  3BAI A;  3VU2 A;  3CHF A;  4U5K A;  2FDM A;  3RJY A;  1DWG M;  3VKK A;  4AZC B;  1E40 A;  2WKL A;  5I2U A;  4WKF A;  5EBA A;  3MV1 1;  2YJQ A;  1US2 A;  1MQP A;  1EHA A;  4D6F A;  1NAR A;  3SCN A;  2D0G A;  4CD4 A;  3PZT A;  1JNE A;  3RM9 A;  1R8L A;  3OIH A;  3L4V A;  2J8G A;  2ZUT A;  1UR8 A;  4MB4 A;  3N1A A;  3M7S A;  1GUV A;  4KRT A;  3WQ6 A;  2WK2 A;  4DM1 A;  1WZK A;  2YLL A;  1GOW A;  2JF6 A;  3WH6 A;  3VGF A;  1V6U A;  4C7G A;  2CES A;  2XSA A;  3ZJK A;  4B9Y A;  1V3M A;  3WH8 A;  4UQB A;  5LA1 A;  3KEH A;  1D3C A;  1E0X A;  3EBV A;  4AD5 A;  2ZUW A;  1JDC A;  2OWX A;  3DYP A;  2ZX9 A;  3CHE A;  3VD4 A;  3A6O A;  3AHT A;  1KGX A;  3T0D A;  1KB3 A;  1B3W A;  4HTY A;  3MU7 A;  2OSW A;  3VDH A;  2WHK A;  4PCT A;  4B15 A;  1QVB A;  3VX1 A;  3K46 A;  3WNM A;  4BA0 A;  1KR0 A;  3U5U A;  5A69 A;  2PC8 A;  4FF5 A;  1E0W A;  4LYP A;  2ZXA A;  2ZUV A;  2J47 A;  1V0K A;  3AIE A;  1NP2 A;  3EDJ A;  1WZA A;  2WMK A;  5C71 A;  1J0H A;  1WB0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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