3S0CA

Transaldolase wt of thermoplasma acidophilum
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
MKIFLDTANIDEIRTGVNWGIVDGVTTNPTLISKEAVNGKKYGDIIREILKIVDGPVSVEVVSTKYEGMVEEARKIHGLGDNAVVKIPMTEDGLRAIKTLSSEHINTNCTLVFNPIQALLAAKAGVTYVSPFVGRLDDIGEDGMQIIDMIRTIFNNYIIKTQILVASIRNPIHVLRSAVIGADVVTVPFNVLKSLMKHPKTDEGLAKFLEDWKKVSPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Thermoplasma acidophilum
publication title Twisted Schiff base intermediates and substrate locale revise transaldolase mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable transaldolase
total genus 81
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2011-05-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3s0cA00
4O17A 4QITA 2QCFA 3GDTA 3M1ZA 4MYXA 4PEKA 1G4EA 5FESA 3N2MA 3E96A 1X1OA 4UMCA 3W07A 4A2RA 1FDYA 3OHIA 2DZPA 4JDBA 3GIYA 3S5NA 1C9DA 4O57A 1CI1A 3CC1A 3NQAA 3G18A 4UUIA 5FF0A 2FQIA 3BLFA 5HULA 3SI9A 3M6YA 3I65A 3FYOA 3VNDA 2I9EA 3MP4A 1XXXA 2D73A 1GVOA 1SFLA 3A5VA 1B3OA 5FF3A 4POCA 2DZUA 4S1FA 1I2OA 3L65A 4NJGA 4UTWC 3B0PA 3TX9A 5DXXA 4WZHA 3KFTA 4XTIA 1OFDA 3N73A 2XN2A 5K4ZA 1XM3A 5F4XA 4ADUA 2A85A 1P5BA 4LVDA 3HQ1A 1TJRA 1YLVA 4O0KA 4AWTA 3ABRA 3NL6A 4E2DA 4AVFA 4O15A 3W70A 1Z44A 2QCLA 3W84A 3TFCA 4WOZA 4MJMA 4NJHA 1AW2A 1KTNA 3UWUA 3W7LA 1QO2A 3S9YA 1OJXA 1EX5A 3UPWA 5AYZA 1P1XA 1YDNA 3GAYA 1GVFA 2QUTA 3HPZA 4N02A 3FFSA 1IF2A 2V0TA 1FDJA 1TPDA 2X30A 4HNNA 4UTHA 3U2OA 4W9TA 1GTEA 3F03K 4MOZA 1LYXA 1OYCA 3NQ2A 2V5BA 3NL5A 4O54A 5BOOA 1YXCA 4JTHA 2QCEA 4MIMA 3IIXA 2V30A 3NOEA 5KZEA 3RFAA 1LM1A 4BI6A 2ZRZA 5BW6A 1SW0A 3NQVA 3TXVA 2Z1BA 1O94A 1W1ZA 1HL2A 3TFXA 4AF0A 5D04C 3I7RA 3TQVA 1SO3A 3HGJA 1MEIA 5CZJA 3LB0A 2NWRA 3UXAA 5LNUA 4WUIA 4TMBA 3ABQA 1JUKA 4WY0A 3VE7A 4K8HA 4O50A 1Z41A 2AGKA 1S3HA 1SZNA 3W86A 4IQLA 3C8FA 4O10A 3LXCA 2ABAA 1MEHA 3LRLA 1W5MA 3W22A 1QDSA 4N9EA 2TYSA 5GVJA 4MUZA 2FB3A 3V75A 1K03A 3G0UA 5LGXA 3W87A 4FXSA 2FB2A 4HIBA 2GVLA 1W31A 3DHDA 2V2DA 2HTMA 4PL2A 3SR7A 1Z42A 4JIPA 1OFPA 4FX6M 3BLEA 4E0CA 1W3IA 3G1FA 4IPIA 1F2JA 3KAOA 4YCOA 3S1VA 4CCCA 4RK8A 1PV8A 1RZMA 1WAUA 3HG3A 1SSDA 4H4IA 2GVGA 2X1RA 1EPXA 1VRDA 4MFEA 4JTIA 5FF7A 1QPNA 3NQEA 4KWVA 3G1DA 3OVRA 3S42A 4ZQOA 5T26A 1A5CA 1YTDA 1QMLA 3S5ZA 3PG9A 3R8RA 2FFCA 3W74A 3RMJA 4O0ZA 4TIMA 3T7VA 1WDWA 1ZAJA 2V2CA 5C54A 4EF9A 1G6CA 4ZMGA 4LS1A 1ML1A 3P61A 1IXNA 4IXHA 2ZYFA 4L4LA 3MWAA 2EAWA 2ZRUA 3MHFA 2QCNA 3EXSA 1ZCOA 3ATZA 2A7RA 1LRTA 4TO8A 2R94A 3S1UA 2RDUA 4G1KA 5AC6A 1W5QA 5AOUA 1VLIA 1LORA 5FF4A 1LRQA 4NJIA 3HBLA 4NNBA 3IV3A 4EF8A 1WXJA 1ADOA 1W8SA 5G4WA 1XUUA 1WBHA 2VEKA 3H54A 2F84A 5HWJA 2JGYA 3FA5A 3TAKA 2YZRA 1P0NA 3LBCA 1DBTA 2A4AA 1B4KA 1GJPA 3CWNA 4ML9A 4UTKA 1KA9F 3HO8A 3PR2A 5I3IA 2A5HA 3GNDA 3E9AA 3AO0A 4BI5A 4FIQA 3PSVA 2BTMA 2NV1A 5CPMA 5F2LA 4YMZA 1JCJA 4N9CA 2ZFAA 3O6DA 3EX1A 4XBKA 3S5YA 3G0SA 1H61A 1EP2A 1EP3A 2DZWA 1SO4A 5G4EA 1N7KA 3C3NA 1H50A 1RD5A 2ZA3A 2WNQA 3W1NA 1FUYA 2ZZ1A 4LOCA 5DCEA 3IVTA 3GYEA 4O4VA 5D37A 4ADSA 4HSOA 4OGZA 1VQTA 4R53A 4RXFA 1GVQA 3VCRA 3C2RA 4Y90A 3HG4A 3PBVA 2RKXA 4K38A 5BRBA 4KFNA 4Z0JA 4K8EA 1G4TA 3DFSA 4JYDA 3EWWA 2O7SA 3N9RA 1SR9A 2V9DA 3Q37A 3S8HA 1KLZA 4Z1BA 2JK2A 3R13A 2UV8G 3TK7A 5F4WA 1I8JA 4JS3A 4GWEA 5DBUA 2GQAA 4HSNA 5G1YA 4BR1A 1IGSA 3P60A 1K8ZA 1BTMA 1LLWA 2PCQA 1V7YA 3EWZA 3M44A 2WV8A 3NL3A 4N6EA 1L9WA 3TSDA 3TQ0A 4GUFA 1MZHA 4MZYA 4N9DA 3CEUA 3KVKA 1J5TA 3TIMA 1Q6LA 1O5XA 3DFPA 1KM4A 3W1XA 3PUOA 4X3ZA 4Y8FA 1PVNA 3GDLA 2W79A 3NVTA 4NZFA 2CLOA 1SFJA 4EVZA 3F4NA 4JICA 1MXSA 2Y70A 1NAL1 4MZ1A 1YYAA 3BGJA 2ZZ6A 4UR8A 4IX2A 3W7NA 3FYPA 2F7FA 2E5BA 4UTIA 3W2MA 4XQ6A 3DZ1A 3GX9A 1TSIA 3BG5A 5U7SA 1JRBA 4M7SA 1TQJA 3PUDA 4I7VA 2QJIA 3QMSA 1HG3A 4O11A 4RR4A 1F5ZA 2IQTA 3HG2A 1T99A 1X6UA 1BWLA 4M5PA 2VELA 4WQ6A 2C15A 5AHNA 3FKRA 4HPXA 1TO3A 1VYPX 1Q6OA 2E6FA 3W7HA 4CNPA 4M6VA 4Q32A 2Y89A 2ATSA 2ISWA 1GT8A 3NL2A 1K8XA 1H7XA 1PCKA 1Z48A 1F73A 2A7NA 1HO4A 2J9XA 5D03A 3WJWA 3Q58A 3UZJA 2AAMA 5D30A 3NPUA 3S5OA 3GNNA 3LHWA 5D05A 1F05A 3HPXA 3T40A 3M7WA 3LXAA 3QRHA 3MP3A 2J9YA 4FNQA 2YCEA 2C1HA 3TW6A 4UTWA 3B0VC 4TX9A 3IIVA 1NF0A 2Q3RA 2ZZ4A 4O1CA 1DV7A 1OX4A 3MBFA 4LC6A 1F74A 5KITA 2E6DA 3NPXA 4BK9A 2DORA 3KHJA 4GJ1A 5D2VA 3DU0A 3LXBA 3VE9A 1KM6A 3LGEA 3EX2A 3DXIA 1FCVA 5HUPA 3HMJG 5LHEA 3ZR4A 2NUWA 3WFAA 3RLVA 2QJHA 1KFLA 3GR7A 4O52A 5BMWA 3NM3A 2X16A 2ZA2A 1XBYA 4O13A 4XZ9A 1XFBA 4AH7A 1D3GA 3LCIA 3PBUA 3W7KA 2FIQA 2CLLA 5EMUA 1GG0A 5HWMA 1EEPA 4AF0B 1H7WA 1TTQA 4DF0A 1RQEA 5LNWA 3LX9A 1OYBA 5F4SA 1TCDA 1SO6A 4AWUA 4FX7A 4OBTA 1KTBA 1VHCA 3STFA 2ZRXA 3UYCA 1C8VA 3PUEA 2PRLA 4AHOA 3KOFA 1PE1A 3QF0A 3TA6A 1A5AA 1TV7A 3TCEA 2EPHA 1L6WA 3DFNA 1AK5A 2RHGA 3JR2A 4LV9A 5IBXC 5SWUA 4JX6A 3QSTA 1GQNA 3ATYA 2PE4A 3IVUA 2VFHA 1QPOA 2QDGA 5F1UA 2J88A 2ZZ2A 4WX2A 5FI8A 3CLMA 4RKAA 4LRTA 4JTLA 3WK0A 3C6CA 4TR9A 1OFOA 2CLHA 3T78A 2OZ0A 3DFOA 1SZEA 4YLWA 4LU0A 3U8GA 1PCWA 4FNTA 2H8XA 3STGA 2WPBA 3PSWA 3PF3A 3TH6A 4BF9A 5LSMA 2CLEA 2OCZA 3HB9A 1XCFA 4AAJA 4H6KA 1HO1A 4RX0A 4N4PA 3P82A 3L66A 1WOBA 3RLUA 4JTKA 2QCMA 2GJNA 3UWQA 4UFKA 1QR7A 1ZALA 3CM4A 3TSMA 4LWWA 3C2FA 3MP5A 2WNNA 5I3HA 4YL2A 4FB7A 3GDMA 5D32A 4RXGA 1Y0EA 1ICPA 3EXRA 3WK3A 3PAJA 4QSHA 3QYQA 4UFLA 3LRKA 4I9AA 4XUGA 3LTSA 3L5MA 1XDMA 3GDRA 4JTTA 1GVRA 2A6NA 3UWWA 2GOUA 1WYIA 3AJXA 2X1TA 1UJPA 3CWOX 3W83A 1H7NA 1FCUA 3W7PA 2HSAA 1LROA 1LBLA 2FJKA 3I7QA 4N6FA 1VHNA 4CCEA 1OG0A 3S1XA 4YWIA 3NR0A 3TC6A 3PBWA 5DCBA 2YFOA 4PTNA 3QZEA 3LRMA 1M7PA 3OIXA 3GDKA 3PY2A 1JQVA 3HGSA 1GVSA 3HIJA 5L6UA 1B4EA 3O63A 3IRDA 2OT0A 4U28A 3BW4A 1OF8A 4OE7A 3W85A 3THAA 1ZHAA 2W6RA 5EY5A 1S5WA 1TMHA 5EBUA 4X2RA 4YCPA 1OX5A 3EX6A 3TXZA 1F76A 5CGQA 2VFGA 3N14A 4GUJA 1SW7A 5DBTA 4UTLA 3LOTA 1TPEA 3KX6A 1KFEA 5EYWA 4IMCA 5CSRA 1FWNA 5I3KA 2GUUA 3DGRA 2Y85A 1I2NA 3M47A 4MZ8A 3CU2A 4JTSA 3W1TA 2E5DA 4U4MA 4IJBA 1FBAA 1IXOA 2FDSA 3C2EA 4M19A 4ONVA 4ZZ9A 2A1YA 2G96A 3P81A 2ISSA 4EWND 1GZGA 1ALDA 1EWEA 3WJYA 1MEWA 4PODA 1I2QA 2YSWA 4IGHA 3LBMA 2NXHA 1G67A 3S0CA 3NQGA 2ZRVA 3E49A 1NFBA 4KKXA 3W7JA 4HN4A 3NQDA 4CNOA 3G3DA 1XUZA 3CIXA 4UTJA 1ME7A 1R46A 4O1BA 4NU7A 3TROA 5EKYA 4GNJA 1OX6A 1W54A 5K4XA 4UTUA 1TPH1 3G0XA 3BW3A 5DY3A 1SU5A 3A21A 3A9IA 1K3UA 3BG9A 4LVBA 3M5YA 4LS2A 5AHFA 3W1LA 3W9ZA 5FEWA 2B0MA 3DKLA 3OBKA 2C18A 3L21A 1TV8A 4K36A 1LRNA 3FEMA 1R47A 3EWUA 1OFRA 3W7CA 2EHHA 3FLUA 3TSBA 2DP3A 4UFJA 5HNRA 4A22A 1S5TA 1WV2A 3MBDA 1O60A 1GWJA 3R89A 1JCMP 3BO9A 1TPFA 3G1HA 1YDOA 4UCGA 4A21A 3NM1A 4LUJA 3O6YX 4O28A 2Q8ZA 3EWXA 3P62A 5HMSA 2CZEA 4FHAA 3NDOA 4O18A 2NUXA 3U6WA 1TTPA 1DKWA 3NZRA 4ZQPA 4GBUA 3N9SA 4B5NA 3CQ0A 5DELA 4WXZA 3BPWA 2C14A 1H5YA 3B05A 1VS1A 2R8WA 2Q3OA 1M5WA 1SZGA 3LHYA 2QAPA 3FKKA 1VCFA 1N55A 2NXGA 1CX9A 1H62A 3MYOA 3INPA 2DZSA 3F1QA 1OK6A 3QPZA 4BFAA 2A0NA 1C29A 2Y7FA 3I6RA 4R34A 3V1PA 2Y88A 1O95A 2DZTA 3L9CA 1GEQA 2WJZA 2P10A 3S1WA 2JKPA 3W2KA 4IMEA 3QC3A 3USBA 2G5WA 4OV9A 1DQWA 3NZ1A 1JCYA 1ME8A 3NQMA 2NV2A 3SFKA 5D33A 2YW3A 3FOKA 1KFKA 2B7OA 1VZWA 4DPQA 3TUUA 4MFDA 2GJLA 3THQA 3E12A 3QMRA 3DHFA 1T96A 3E02A 3FJLA 3P8IA 2H3BA 1K7XA 4CLMA 1TTJA 3UY8A 4OT7A 5AB3A 1GOXA 1VYSX 2VKZG 3NXFA 2ZRWA 4LV4A 1ICQA 1UBSA 1L6YA 1HFBA 1JUEA 2QJGA 5HUOA 2CLFA 1OX4B 1QPRA 5DY2A 4GUGA 2CZFA 3IGUA 4FXRA 2J27A 2E1DA 5K3VA 3IGSA 3W7OA 1GG1A 4C1KA 5CZTA 1NF7A 4NXKA 1O4UA 4OQVA 4ORIA 1B57A 4QNEA 3MI6A 4IMFA 4FEZA 3WK1A 3TU9A 5K9XA 4LW7A 1Q45A 3SW6A 3Q94A 4MY8A 3STCA 3TNOA 3UPBA 3GAKA 4PH6A 4AEOA 1FWTA 2DJXA 1R2TA 2NX9A 3STEA 2Y63A 4BWLC 1QCWA 1U5JA 4RCXA 5F2MA 1H1YA 3BVJA 1YPIA 1AG1O 1WBJA 3W75A 2HMCA 4ORMA 2G95A 4QIUA 4NX5A 5AHIA 1G7UA 4K39A 1KM0A 2X1SA 2A7PA 2RDTA 3M16A 1HUVA 1PHQA 3B03A 4DBEA 2X2GA 4FNPA 3L2IA 1G4SA 1AL8A 4JIQA 2QUVA 3MJYA 1MO0A 3LCGA 3M5VA 3MHGA 3W7RA 3ZFHA 3M5XA 4Z08A 3ANYA 3CT7A 3TR2A 4NQ1A 3M9YA 2A2IA 5KZMA 1DHPA 3M0ZA 2Z2UA 3A24A 1QOPA 5CSSA 2E6YA 2E5CA 3TV8A 4XTDA 3C61A 2J24A 3QSRA 4DELA 3O06A 2ZQ0A 3PB0A 4HT3A 1DQXA 3HF3A 1X1ZA 2BSLA 4I7WA 5FEPA 3W1RA 5IBXA 1H7OA 5AHEA 3QPYA 5AC7A 1OFQA 1QOQA 4M7TA 3HPSA 4FO4A 1ME9A 3TMLA 2Y6ZA 4LY8A 1EWDA 1OFEA 1M6JA 4A3UA 4RLIA 1H7PA 4Z1DA 3VI2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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