2HISA

Cellulomonas fimi xylanase/cellulase double mutant e127a/h205n with covalent cellobiose
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNAAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSNLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Cellulomonas fimi
publication title Insights into transition state stabilization of the beta-1,4-glycosidase Cex by covalent intermediate accumulation in active site mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELLULOMONAS FIMI FAMILY 10 BETA-1,4-GLYCANASE
total genus 118
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 1998-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2hisA00
2O92A 2RGMA 1J0ZA 3MS8A 1ZBKA 2VMFA 3WEMA 5E0CA 4PUDA 1R87A 1W9PA 2XFYA 3SUVA 5IHRA 2VZSA 4W84A 1TA3B 4XV0A 3QOMA 4ZE5A 1KWKA 4PBGA 2WKLA 1CDGA 4J28A 4H7VA 2XGBA 2FHFA 5LYRA 5BRPA 1B3YA 5A6BA 1UR0A 1O7AA 2BY2A 5E9AA 1E6SM 2WAGA 3RIKA 1NOUA 3VIIA 1XGZA 2BFGA 2WZEA 4DM1A 3UCQA 2CBIA 1CGWA 3GXDA 2PWFA 4B3KA 1B31A 1E0XA 1JDCA 3KWXA 2J7EA 1EHAA 1TVPA 1X1NA 4KRUA 4HMEA 2CPUA 4P7OA 1XCXA 2V3FA 5E70A 1K9FA 2W91A 3VIMA 1KGUA 4X9YA 4C7GA 2QLYA 4J3XA 1L0PA 4QLLA 4RE4A 1LQ0A 2DEPA 2GJXA 4V2XA 4B16A 4GPNA 4CCDA 1MVYA 3VX1A 2J62A 2Y24A 1QNPA 1VFMA 4BF7A 5BXRA 3WQVA 1UQYA 3UERA 4D72A 2V3EA 3W53A 3F5KA 3APGA 4D6FA 4AD3A 4Z2LA 1JXJA 1J0KA 1BAGA 4DWSC 4JCLA 4JFSA 3AHTA 3RPMA 3T0DA 4E8CA 3VDBA 3UR8A 4QP0A 1HF6A 1KXVA 2XGIA 2WMIB 2EPLX 4UOZA 2D1ZA 3SUWA 3CBWA 1PPIA 1XRVA 1NP2A 3MSGA 1JNEA 2FHCA 4AD2A 1WZMA 3BAKA 5FL1A 1PEZA 4AD1A 2CEQA 4W5UA 4UQDA 4ZXLA 2PWHA 3SCWA 1E4MM 1BLIA 4J7RA 4OUEA 4QFUA 1J01A 1KBBA 4TUFA 2UWFA 3M7SA 3MUY1 4PCTA 3AMCA 3CMGA 3N15A 1UWRA 2CKSA 2XG9A 5CLTA 3AMLA 5M3WA 4URIA 3AS0A 1WDQA 3AXHA 5M17A 1WZAA 3RMEA 2EBNA 1DEDA 1XH2A 3VIOA 1ISWA 2ZUMA 3VD9A 1JD9A 1GVYA 3EDDA 1JYNA 4C7FA 1ITXA 2Q8XA 3UETA 1OM0A 4HPGA 4Q7NA 4L4OA 3AJ7A 3TTOA 2WCGA 5ABFA 1SR0A 3DYMA 4GI6A 1PZ2A 3N11A 3QGVA 2YDRA 1HVXA 4AEFA 4ZE4A 4DWSA 2CESA 4UFIA 1H3GA 5HPOA 3CHCA 2IXUA 2WPGA 3I3DA 1W2PA 3KL0A 1VBRA 1QI2A 3BMWA 1B0IA 1BSIA 1E5JA 3WN6A 4LPCA 3MV11 3VGBA 2VZVA 3KE0A 1ISZA 1UR4A 1V0KA 3CHFA 1CIUA 1QHZA 3VGDA 3EDEA 1FP8A 3HN3A 1ESWA 3L4WA 2JFEX 5JBFA 1Q6FA 3TTYA 1Q6CA 3J7HA 5FKYA 3CTTA 1GOOA 1W3JA 4E8DA 3VINA 4LYRA 1DTUA 2EXOA 2J78A 4WIWA 1HJXA 2CYGA 3BMVA 1NOFA 5I2UA 3FY1A 1G5AA 1HVQA 3PBGA 2PI6A 2VVSA 2WB5A 3PHAA 3HMCA 1XCWA 2C8NA 3B9AA 3W82A 3NUKA 3ZQ9A 2D22A 1FFQA 4HMCA 1WZLA 3K8KA 4TTGA 1FH9A 4DM2A 2VR5A 1IZJA 3PN8A 4X0VA 2UY4A 3AIRA 1UHVA 3MO4A 2PF0A 2DH2A 4MADA 1JDAA 1E1EA 3AS3A 3AMGA 3ZOAA 1QNQA 2V3DA 4HOWA 1UH3A 2A3HA 3ARYA 1H0GA 3F5JA 2QPSA 4S3KA 3UG5A 4D6IA 1MW3A 3GZAA 3PTMA 2ZWZA 2WWDA 1E55A 3HU7A 2WHMA 5A6AA 4U3CA 1FHLA 4M80A 3SUTA 4M1RA 5M03A 3QHNA 1B3WA 1JI1A 3GDBA 4QDMA 4CD4A 5DT7A 4CN4A 4FK9A 2EEXA 1G0CA 1W2VA 2WCSA 2OYLA 1DWHM 3VO0A 3WNKA 1CZ1A 1V3JA 1J0IA 1QW9A 4W88A 2VX7A 4R27A 2FH6A 4WSKA 2CHNA 4TOQA 3W38A 1CXHA 2A3BA 4P7LA 3MMDA 4P8UA 1VB9A 1KBKA 1W91A 3NSNA 5HNNA 1UWQA 3AFBA 3QHMA 4AZCA 4D1IA 2XVNA 4D71A 1LL4A 3SCQA 1RP9A 3DHPA 4FLRA 3AICA 1E4IA 3BH4A 1VRXA 4GI9A 3TA9A 3CPUA 5FOOA 2WW5A 9CGTA 3CHDA 2EQDA 2IXVA 1E3ZA 2VQTA 4MAVA 3UR7A 1CECA 1CGXA 2WVUA 5FD0A 4PTWA 5D9MA 1W9UA 5CZKA 3W37A 4UQAA 3W28A 4OKDA 5A1AA 4J3UA 1MFVA 4KGJA 4B15A 2ZWYA 3L4ZA 4PYSA 4UFHA 2XHYA 6CGTA 2PC8A 4AZ7A 1ZJAA 1UR2A 1W1TA 5D9OA 5A94A 1VIWA 4AD5A 3D5HA 3W26A 3BAIA 1TUXA 3EMZA 4JKLA 2D3LA 2W61A 2FDMA 2ZXAA 2YDQA 2BVTA 5A6JA 1MFUA 4D1JA 1H0IA 4YPJA 3FXYA 3WF4A 2UY5A 1JFHA 4P8WA 4W7WA 5A2BA 4NZCA 3AXIA 1GQIA 3W29A 2A3EA 4ZEPA 3WIJA 2YA1A 1JDDA 1CXEA 2OYKA 3VIPA 4F8XA 2WVVB 1CGVA 1HJUA 1GJUA 5GNXA 3MMWA 1OGGA 4LQ1A 4Q22A 1B90A 2ZX6A 1V0MA 1A3HA 2ZX8A 3OGSA 5FCZA 1OCQA 1KQYA 4HTYA 4Z2KA 1GOWA 4P7RA 2YBTA 2WHLA 1EDTA 1LJYA 1UG6A 3MSDA 3WH8A 4JFUA 4OJYA 3VM5A 3VM7A 2J7FA 1QI4A 3PZ9A 1ODUA 2G3JA 3FHAA 4W93A 3T2OA 3DYOA 1P6WA 2J75A 3SCVA 4D6DA 5ABHA 1E4LA 3F4VA 2JEPA 1DWAM 1ITCA 5CGMA 2F61A 4HMDA 5A6SA 2OSYA 4F66A 1C91A 1QPKA 1E56A 4UCFA 3WBAA 1UD6A 1TMQA 4OOZA 1NARA 4HP5A 3AMKA 2GFTA 4ML4A 4YHGA 3ZR6A 1FP9A 2OWXA 2DSUA 4J3TA 1TCMA 3L4VA 3WNLA 1FA2A 2J79A 2XWEA 3L2MA 1AQ0A 2AAAA 4H41A 2BVYA 1B3VA 1CNVA 4D6HA 3W27A 1M53A 4JFTA 2XVKA 1WP6A 1W9BM 3SURA 4PMNA 4HOZA 1KXQA 4Z2JA 1HKKA 3ARWA 5C71A 1MQRA 3PZMA 2E3ZA 4DUVA 2VO5A 1R7AA 3ZSTA 1QNSA 2DSWA 7CGTA 4W8AA 4QCFA 3ARSA 4H8HA 1MWOA 1C92A 1E43A 1G1YA 3W6MA 3WELA 1K6AA 4R5EA 3O6AA 1JZ7A 2D20A 4QCEA 4U31A 5E6YA 1HX0A 1GOIA 2BNJA 4GKLA 5I23A 2XVGA 1WDPA 4UQCA 2JE8A 3SCTA 1CYGA 4CD8A 4J3WA 1E72M 1E6NA 1B2YA 3PZUA 1BG4A 3L4XA 2XFRA 3U57A 3VDCA 5ABEA 1Z32X 4IISA 4FMVA 4HZ7A 2VL4A 1NP0A 1GVIA 3AI0A 1LLOA 4PTVA 3K1DA 1QI3A 1QBBA 1BF2A 1JZ4A 3VNYA 2DSKA 2J7HA 2XVPA 3PZTA 1C7SA 4MB4A 3RCNA 3VU2A 1UKOA 1JFXA 4P7NA 2DH3A 2CNCA 3NSMA 4UZSA 4OIFA 1R86A 3CIVA 3WDQA 1E0VA 1W1PA 1VEPA 2CBVA 3ZJ8A 4AMCA 4MJ2A 1J0YA 4W5ZA 1OBAA 2ZUNA 5AC5A 3N1AA 3VMOA 3VIKA 3IJ7A 2YDSA 1CEOA 3WL0A 4JL1A 2QF8A 5I5RA 2XWDA 3VD7A 1KR0A 4BQ2A 2CERA 4OOUA 1BFNA 3RM9A 5I78A 5A6LA 2V5DA 2VI0A 1NQ6A 2WXDM 1V6UA 3VGGA 2BXYA 2NW0A 1JAKA 3JUGA 1KR1A 3N13A 4ATLA 4CU6A 4CUCA 4WK9A 2YIHA 4MPKA 3A47A 4W87A 1JD7A 1XHGA 2XFFA 2C7FA 4KMQA 1JXKA 4GXPA 4AISA 2W4XA 1Q4NX 3SCSA 5I6SA 2E9MA 1GORA 1VFOA 4QAWA 1JYWA 4J27A 4UQEA 4PTMA 3VGEA 2JF6A 1FOBA 1UD5A 2NT0A 3GXFA 3CZLA 3AZRA 1EGZA 2DT1A 4GZJA 1QOXA 3AS1A 3IANA 3OLGA 1E6PA 1TA3A 2VX5A 4MJ4A 1W9DM 1E4NA 2TAAA 2PWDA 2RGLA 5I79A 3GTNA 3DC0A 3RO8A 5C70A 2DT0A 4UFJA 1KXTA 4BS0A 2QHAA 2DSVA 4TXEA 3LPOA 2VRQA 3WF2A 3BAJA 3U5UA 1MYRA 1UD3A 3GYCA 1K9TA 3UG4A 4Y7EA 3NDYA 5I77A 2VURA 3OB8A 4A3HA 1HKMA 1X6LA 1WO2A 2DT3A 2ZXQA 4KGLA 4W7VA 5A8NA 1EO5A 1UWIA 4M29A 2XPKA 2D3NA 3VD5A 4GO9A 4M82A 1J12A 5A2AA 1UH4A 1PX3A 1VF8A 3CUGA 2VUYA 1MW0A 2V5CA 1WZKA 1HP4A 3AHVA 1V08A 4EAMA 2BV9A 2GSJA 1AVAA 1RP8A 5A8QA 1R85A 1E1FA 1WB0A 5I0DA 4ATDA 1MW1A 4ACZB 4GQRA 3ZT6A 5F7UA 1UA7A 1UWSA 5M5DA 1MQPA 1OSEA 3N9KA 5DFAA 1J11A 2VX6A 2D24A 4CGTA 4OZOA 5A3HA 1D2KA 2Z1SA 3SCNA 3G6MA 5DO8A 1Q6DA 2ZX7A 7TAAA 1IZKA 4WKAA 2JIEA 2HISA 4LYPA 3WH5A 4M81A 4H8UA 3CH9A 4PMRA 5A95A 4U33A 1H5VA 2UY3A 2WSPA 3M46A 2X0HA 3AIVA 1XSIA 2WMIA 4JAWA 4PMZA 4MNLA 2A3AA 4PUEA 3VUPA 1DWIM 1N82A 4PMDA 4WF7A 3VD4A 1ZB5A 2YL8A 2F2HA 3EYPA 3NSXA 4CCEA 4BCEA 2V3GA 3WDPP 1QI0A 2J7DA 3HJEA 1V03A 1W1VA 1JZ8A 4HOXA 2WMJA 1W9VA 2OSWA 4C7DA 4UZUA 3NIYA 1HNYA 3AIQA 4IUGA 5CJ5A 3I3BA 2X05A 4B3LA 3SCUA 3CUIA 2WLZA 1HJWA 1V02A 1X6NA 3EDFA 3GNPA 1C8QA 3WF0A 3OZPA 3SCOA 2WLYA 5A8PA 4F79A 3WDJA 1XYFA 2GVYA 1PJ9A 1VENA 2ZX9A 2WSKA 1OB0A 3ALGA 3A3HA 4MDOA 3GM8A 1JGIA 1JZ6A 2XM1A 1UR8A 1W32A 3N17A 1M7XA 1J0HA 1OT1A 2EPKX 1EQPA 3SUUA 3L2LA 5CSUA 1ZS2A 3WNNA 1CXLA 1G94A 4L4PA 1B1YA 1TFVA 2XTKA 3CO4A 1KB3A 4CU8A 1CGTA 3WD0A 1GW1A 3VIGA 1BGAA 1V6VA 5JIWA 3T08A 1GOKA 1AQHA 5CPSA 2GJRA 2PB1A 2EPNA 1NWRA 3LPFA 4LYQA 3VGHA 5I24A 2ZXDA 3BGAA 1HP5A 5I3DA 4B9YA 4PTXA 3WQ8A 2J8GA 4D6CA 1C8XA 5BRQA 3AXXA 5LA0A 1HIZA 3WDRA 1XYZA 2BY0A 2ZUVA 3CZ8A 1E5NA 4AIUA 4W89A 2DSZA 4XZWA 2VJXA 3O2LA 2OYMA 3MU7A 1CGYA 3ZR5A 1H2JA 4JZ5A 4MDPA 5HXMA 2Z1KA 3NYDA 1V6YA 2VVNA 3EDKA 1ISXA 1JG9A 3U7VA 4XUYA 1E6ZA 4WSJA 4AZ6A 4V27A 3PZVA 1EOKA 3ARZA 3UG3A 2D0HA 4H04A 2JF7A 4GINA 4U2YA 1QW8A 1NWUA 3CZJA 3CLWA 3MKKA 1WKYA 5AYBA 3WENA 2DIEA 3FAWA 1GJWA 3CZKA 1D7FA 3AMDA 4PN2A 3POCA 1UD4A 4PMVA 5GNZA 2GDUA 3AZSA 1HL9A 5EFFA 3BXWA 4HU0A 4JHZA 3AS2A 4YN5A 4AZIA 1C3FA 2WMHA 4LX4A 1ISYA 1H41A 3CZGA 3DYPA 3NJ3A 4CU7A 1BG9A 2WZIA 2PWEA 4P8VA 3T2QA 3VTRA 1UH2A 4M56A 4AIEA 3LPPA 4MB3A 1DWFM 3L4TA 2WHJA 4UOQA 3VGFA 4XX6A 2WVTA 2CKRA 4UOJA 3W81A 4B9ZA 1UKPA 3WH9A 1GNXA 6TAAA 4MNMA 3VOCA 2WNWA 3OGVA 3B9EA 4ZENA 2VC9A 2Y8VA 4UQBA 2WM0A 1UKQA 4AXNA 2YL5A 2AMGA 4CN1A 3W25A 3ZSSA 1BYBA 5JBEA 3SCRA 3ARXA 5IHSA 3EMQA 2VZTA 1US3A 3VDAA 1V0LA 2CETA 1CXKA 1K9DA 1V6XA 2VT0A 2WMKA 1EDQA 1LF1A 5E6ZA 1OD8A 1Q6GA 5KZ6A 1C7TA 1KGXA 2NT1A 3BAWA 5D4YA 2E8YA 4QLJA 1M03A 2XSBA 3IAPA 3WH6A 2C0HA 1JI2A 2QPUA 2VNCA 3GNRA 4M24A 1XV8A 1NOWA 2YL9A 3RILA 1VAHA 2BY3A 3AYRA 2PBOA 4K68A 5JIPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2O92 A;  2RGM A;  1J0Z A;  3MS8 A;  1ZBK A;  2VMF A;  3WEM A;  5E0C A;  4PUD A;  1R87 A;  1W9P A;  2XFY A;  3SUV A;  5IHR A;  2VZS A;  4W84 A;  1TA3 B;  4XV0 A;  3QOM A;  4ZE5 A;  1KWK A;  4PBG A;  2WKL A;  1CDG A;  4J28 A;  4H7V A;  2XGB A;  2FHF A;  5LYR A;  5BRP A;  1B3Y A;  5A6B A;  1UR0 A;  1O7A A;  2BY2 A;  5E9A A;  1E6S M;  2WAG A;  3RIK A;  1NOU A;  3VII A;  1XGZ A;  2BFG A;  2WZE A;  4DM1 A;  3UCQ A;  2CBI A;  1CGW A;  3GXD A;  2PWF A;  4B3K A;  1B31 A;  1E0X A;  1JDC A;  3KWX A;  2J7E A;  1EHA A;  1TVP A;  1X1N A;  4KRU A;  4HME A;  2CPU A;  4P7O A;  1XCX A;  2V3F A;  5E70 A;  1K9F A;  2W91 A;  3VIM A;  1KGU A;  4X9Y A;  4C7G A;  2QLY A;  4J3X A;  1L0P A;  4QLL A;  4RE4 A;  1LQ0 A;  2DEP A;  2GJX A;  4V2X A;  4B16 A;  4GPN A;  4CCD A;  1MVY A;  3VX1 A;  2J62 A;  2Y24 A;  1QNP A;  1VFM A;  4BF7 A;  5BXR A;  3WQV A;  1UQY A;  3UER A;  4D72 A;  2V3E A;  3W53 A;  3F5K A;  3APG A;  4D6F A;  4AD3 A;  4Z2L A;  1JXJ A;  1J0K A;  1BAG A;  4DWS C;  4JCL A;  4JFS A;  3AHT A;  3RPM A;  3T0D A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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