4W8BA

Crystal structure of xeg5b, a gh5 xyloglucan-specific beta-1,4-glucanase from ruminal metagenomic library, in complex with xxlg
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
386
structure length
386
Chain Sequence
KDAQAIAKDMYPGWNLGNTLEATGSGLDAETSWQPTLTTQQIIDAVKAAGFKSVRIPCSWDIHSDSNGEIDAQWMARVKQVVNYCINDGIYVVLNDHWDNGWIEVLGFSKSSSSYQAVDEATITSKITRLKDLWTQIANEFKDYDEHLLFAGLNEPFQEYSLFSGHHEELTPILCRYNQAFVEAVRATGGNNAQRTLVVQGPSTNINSSVNYMTADKLPETAGRLMVEVHYYDPGQFCGTFDASGDNAFYFWGAANHSTDHNATYGEEAYMLSQFGLLKTAYTSLGYPVIIGEYAALQRTISGDQNKHNASVKYFYQCVNEYATNNGIIAFAWDTNDTNGLNSEGGSSTIIDRANSAVVGNNAMEGVKAGVAAGKWPFLEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Uncultured bacterium
publication title Structural Basis for Xyloglucan Specificity and alpha-d-Xylp(1 6)-d-Glcp Recognition at the -1 Subsite within the GH5 Family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Exo-xyloglucanase
total genus 157
structure length 386
sequence length 386
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w8bA00
3ZSSA 4AC1X 1E6NA 1V3IA 5A6LA 5JBEA 2ZX9A 3FAWA 1XV8A 5D9NA 1M01A 3L4XA 5AYBA 2E9LA 4FMVA 1H11A 1WO2A 4PMRA 2WVTA 5DF0A 4ML4A 3RPMA 3CBWA 2JE8A 5E09A 1MYRA 4AZBA 4D6HA 1X1NA 4W7VA 2BY2A 3K46A 2VR5A 5I23A 3UEQA 3NJ3A 1AQMA 3PZUA 1ZBKA 2BY0A 2GJRA 2NSXA 1CLVA 5JUVA 4JHOA 1KWKA 1ODUA 1Q6FA 3OLIA 2XVGA 2WMJA 4AXNA 5I24A 4IUGA 2X0YA 2WZHA 1V6XA 3CHDA 1B31A 1TMQA 2GDVA 2ZUVA 1UR9A 3CZ8A 2GUYA 1V08A 2DPEA 4CVUA 4U2YA 1D2KA 3GH4A 3RM4A 4MB5A 4QAWA 1UH4A 1UR2A 3GNOA 3AISA 3UG4A 4HA1A 1E40A 4D6FA 5AC4A 2FHFA 2X09A 1H5VA 1JXKA 3NUKA 5HNNA 3QHMA 3DECA 3WF3A 3WELA 4PCSA 3VD4A 3MUIA 2J75A 3N11A 3AHTA 3VIMA 5D9PA 1NARA 1I1WA 3PTMA 1J0ZA 2OYMA 4XX6A 1FP8A 1TR1A 1DTUA 3OGVA 2WLZA 1MQQA 3VMOA 2J47A 4N0RA 1W1VA 3ARWA 1JF5A 3DYOA 5HPCA 1CXLA 1MQPA 1HNYA 3U7BA 4ACZB 4D1IA 4HP5A 2YIHA 4FLOA 4TX6A 4JFVA 4H8UA 2J8GA 5EFDA 1DHKA 5A94A 1UKTA 2DIJA 1KB3A 1JZ8A 3WNNA 5BXSA 1JYXA 2XVLA 2XIBA 2V3FA 1XSIA 3D3AA 1MQRA 4PSRA 4M56A 1GORA 5HDRA 4H8VA 4AD4A 4A3HA 5A6BD 3WNMA 1Q4NX 2VMFA 1E0XA 2XGBA 5GNYA 3O2LA 4D1JA 3KL3A 3WDHA 1BG9A 4PMQA 2ZWYA 2VCCA 3ARYA 4Z2LA 1H4PA 3AS3A 5ECUA 1GOOA 4D71A 3VMNA 4P8WA 1V3KA 3AMLA 3SCNA 3K8LA 4AZGA 2J4GA 1UD2A 2WAGA 2YDQA 3WH5A 1XRVA 2WBGA 5CZKA 5EFFA 1N82A 4PTXA 1UR8A 1WZAA 1VB9A 4D6GA 2C7FA 3RDKA 2UY4A 3WNPA 3WNOA 1KBKA 1VFUA 1H09A 1GOWA 4M8UA 1ZBCA 1OSEA 2FGZA 3BMVA 3AFBA 2FHCA 1V3LA 4HMEA 1TA3A 5FKYA 1MFVA 3OIHA 2VRKA 1K9TA 1U2YA 4D6JA 2ZE0A 3VVGA 3TP4A 2XPKA 5FL0A 5A8NA 1TG7A 2XWDA 2OWXA 3HU7A 5DEZA 2Y8VA 4F79A 1DWIM 5IHSA 3RM8A 1EOKA 2JFEX 4W5UA 1HJWA 4MDOA 2CERA 1LF1A 4DUXA 4KGLA 2V3GA 4C7GA 5EBAA 1EHNA 3M46A 4HOWA 4W8BA 1E72M 3CUGA 3CH9A 1RP8A 2WC3A 5M03A 3WH7A 1V6WA 1W3KA 1LWHA 1E9LA 3WF0A 3GDBA 5LA0A 3GXIA 1W32A 4W7WA 2F2HA 2CKSA 5LA1A 2WZIA 4AWEA 5FD0A 4M1RA 5A2AA 3VU2A 1XYZA 4PMVA 1J0JA 3AHYA 4D6EA 4WLCA 4M81A 4YHEA 3TTQA 2D0FA 1J12A 1UD6A 3EMZA 2DT0A 1MW2A 2EPKX 3BLKA 2VQTA 2CPUA 4FK9A 3SEPA 2EPLX 3WL0A 4WSKA 2BVYA 3WQ8A 3AMDA 4GO9A 4D6IA 1J01A 1J18A 3WBAA 2V3DA 3LPGA 2VX6A 1CYGA 1QBAA 3K8MA 4EE9A 1W3LA 3KL5A 4DUWA 1JF6A 1TVPA 3BLPX 3GH7A 4CD7A 1VFFA 2ZUUA 3L4WA 4EK7A 5ABFB 3VIJA 2ZX5A 3WD3A 1LL6A 4GPNA 2NT0A 1VIWA 2YDRA 3M7SA 1ISZA 1V0KA 1FH8A 3SUUA 4PTMA 4PTVA 3AIWA 1J0IA 5CGMA 1WZKA 4AZIA 2CETA 3W82A 4PYSA 1QBBA 3KWXA 4FLRA 4ZXLA 2VC9A 1JZ7A 2WWCA 2RGLA 5BRPA 4V2XA 2XUCA 3T2PA 1ZJBA 3VGDA 4WK9A 1UH3A 5FIPA 1GQJA 4Q7NA 3WDRA 3GXFA 2CYGA 3ZM8A 1X6NA 4URIA 1KXVA 2GDUA 4UFHA 5E0FA 3BSHA 1IV8A 2VZTA 4P7OA 4XUYA 3CZKA 2WKGA 5TD4A 5CQ1A 2QV4A 1GHSA 2WVVA 3NIYA 3VDCA 3AIQA 4W88A 1A3HA 1PEZA 1PZ3A 1WB0A 2VOTA 2ZUWA 1DEDA 3IJ9A 4MNMA 3PN8A 1B9ZA 2J74A 1SFSA 5A6AA 4OOZA 1ODZA 3W27A 5I78A 1CXEA 1WP6A 1E5NA 2PWEA 2XM1A 5I3DA 3WDJA 2ESCA 4MB1A 4Z2KA 3CHFA 5A6KA 1CIUA 4NI3A 1OT1A 2CBVA 1QHPA 2XIIA 4D6CA 2WHKA 3VNZA 4TTUA 3CUHA 2XFYA 4WJXA 2CBIA 1SMAA 4D6DA 1QI0A 2VRQA 3WMBA 3OLGA 8A3HA 1E4IA 4UTFA 3RM9A 6CGTA 3WY1A 3VIFA 2ZOXA 1F4HA 4NRRA 4HA4A 2W66A 3MMUA 4EAMA 1HJUA 1NQ6A 1TFVA 1UQYA 3AIBA 3LPPA 3ZMRA 4AISA 3M6DA 1PBGA 4CUCA 2CIPA 1LLOA 4FLQA 4UQBA 1H41A 1Q6CA 1SYTA 4B16A 1K9DA 1LWJA 4MAVA 1JFXA 4WKAA 4K68A 1CENA 3AXXA 1EDGA 1CZ1A 1BVNP 2OSYA 3FXYA 3IJ8A 3ZR5A 4MNLA 3ARVA 1UD8A 1E73M 1C8YA 4F9DA 3UR8A 2DGAA 1V02A 1HJXA 1OGBA 3WH8A 2ZUMA 2WVSA 2Y2WA 2EEXA 4BQ3A 4W85A 2YL5A 1PIFA 1XGZA 1PPIA 5CPTA 2GFTA 1XYFA 4QLKA 1XH1A 2WZEA 1G0CA 1EQPA 3G6LA 7TAAA 3VGHA 1JG9A 3WDPP 2BHZA 4J3XA 1E3XA 1UR1A 1EIBA 3CZGA 5EB8A 3VUPA 4ACZA 2JEPA 4B9YA 2FGLA 4P7LA 3EBVA 1ISXA 1UOKA 5A6SA 3VOCA 4D72A 3AI0A 1CGUA 3ZJ8A 3FAXA 1E15A 3VX1A 1JIBA 3GNPA 3OB8A 2DH3A 3MMDA 4UZUA 3PTQA 2CNCA 3S2CA 3UCQA 5A3HA 3SCUA 1OGSA 4UFLA 2X1IA 2VNCA 1ZB5A 1B3WA 3O9NA 1V0NA 1QOXA 4WKFA 1E6SM 4Z2JA 1E6RA 3HMCA 1JFHA 4X9YA 3SCVA 3WEZA 4LXFA 2WK2A 1OCQA 3W6LA 4PMZA 1ZBWA 4OIFA 3GH5A 7A3HA 6A3HA 2QMJA 4GQQA 4MNKA 2EO7A 2XGIA 1IT0A 4HU0A 1AQHA 3BAIA 3WD0A 3QR3A 1HKKA 3BSGA 1B3ZA 1VFOA 2ZICA 2EXOA 1P6WA 2ZX7A 3MV11 3N12A 3LPOA 4CVWA 4GI6A 5IXEA 2GVYA 3WUFA 2PWDA 3W38A 2W61A 1GQKA 3MUZ1 1JGIA 2CESA 2ZUSA 4HMCA 2D20A 3VIPA 3W6MA 1OINA 2G3JA 3AMKA 3RMEA 5FCZA 1UKSA 2OSXA 1WZMA 4YHGA 5ABEA 1RP9A 4HU8A 4R5EA 3THCA 5C70A 1E6ZA 1BAGA 1GQIA 1X6LA 5AYIA 5C8BB 4PBGA 4MDPA 1UWSA 1KWGA 4W93A 1EO7A 4W8LA 4KWUA 4WIWA 2YDSA 1KGWA 5A2BA 1WDSA 1ESWA 3AROA 1HX0A 3AHVA 4HA3A 4DWSA 5F7UA 1E43A 1KR1A 1OD8A 2Y4SA 3MSGA 4RE4A 1NWUA 3WEMA 3SCWA 3SCQA 1CXFA 1OD0A 1KCLA 5JIPA 1E55A 1HKMA 2WWDA 4PUEA 2V5CA 5D4YA 3GBEA 2GJXB 1G9HA 2D24A 2WSKA 1AVAA 2QLYA 5HBFA 5D9MA 3AYSA 2O92A 1U33A 4JCMA 1QHZA 1BFNA 2D3LA 2QF8A 2IUZA 5GQBA 1E4MM 1JAKA 2VCAA 4PRWA 3CMJA 4UFJA 2MANA 2G41A 1NWSA 1FOBA 1CGYA 2W91A 4ZFMA 3W0KA 3WFZA 1EGZA 1KQZA 4TVUA 4RE3A 1CBGA 1IZKA 3CHCA 1OIFA 3F5JA 1CTNA 1PX8A 3EMQA 3BAXA 1E70M 2E9BA 1JXJA 4JFUA 2WW5A 1M04A 2YBUA 3ZT7A 5ABFA 3APGA 3AHXA 5D8WA 1RH9A 4U2ZA 4UZSA 1EH9A 4GZJA 2VZUA 1CXKA 3OZPA 3SIMA 3CZLA 3A4XA 4UQDA 4C7DA 1XH0A 1FP9A 4S3KA 3AIEA 1UWUA 4CGTA 3FW6A 4OJYA 3TA9A 3VD5A 1CWYA 1BF2A 2O9TA 3NDYA 3DYPA 1CNVA 4GKLA 1BHGA 3VILA 1E6XM 1HL9A 8CGTA 1WE5A 2DH2A 1TUXA 3A6OA 1XSJA 4NF7A 3EDKA 5CGTA 1BGAA 1BSIA 1JYVA 4U5KA 2E9MA 1SMDA 4GZEA 2Y24A 1JAEA 3E1F1 1JYWA 1AMYA 1QW9A 1CECA 1Q6DA 1JDDA 2PWFA 3VD3A 1UWRA 2Q8XA 1IZJA 2PBGA 3IJ7A 3QOKA 4TX8A 1NOFA 3OA5A 1H1NA 1RPKA 1MW1A 1QNOA 1BQCA 1WPCA 1GOKA 3BGAA 3GNRA 1PIGA 1VRXA 1H49A 1LG1A 4AZCA 2JALA 4UNIA 4OZOA 5BROA 2EJ1A 2O9OA 1BYAA 2A3AA 2TAAA 4IM4A 4LYQA 2CITA 2XM2A 4TTGA 3CGTA 3M07A 5BCAA 3VX0A 3UETA 1QNQA 1E4LA 2YL6A 1RD6A 4MB3A 2OWWA 3WQWA 1L8NA 2EQDA 1NP2A 4P8UA 4QFUA 1YQ2A 2Z1SA 1KXQA 3WUEA 1OB0A 2C0HA 1ZJAA 3N1AA 4PN2A 4H2CA 3G6MA 2G3MA 1WCGA 1O6IA 2JF7A 3ARSA 1JNEA 4JAWA 3W4RA 4YN5A 3WIJA 4HPHA 4IISA 3NSXA 4DM1A 1GJWA 4DWSB 4TOQA 1VJSA 4PMXA 3VINA 1GZJA 4AD2A 3RJXA 3PZIA 2GJPA 4AW7A 1HP4A 5BRQA 1XSKA 3OBAA 2X8RA 2A3CA 2YOCA 1B0IA 3N9KA 4JKKA 1BPLB 1E6PA 2O9PA 4FF5A 1UR0A 2F8QA 3U57A 1NH6A 3ARRA 4F66A 2PWHA 1NM9A 2WPGA 1I75A 2DQXA 2EBNA 1C92A 2CHOA 3N17A 3UG5A 1HKIA 2DSWA 1LL7A 4CU8A 1FA2A 1W9VA 3OLEA 2BFGA 3T08A 4PUDA 4J3TA 1KGUA 2YL9A 1TE1A 1V6UA 4GI8A 1V03A 2BHYA 5CJ5A 1QNPA 2W62A 1CDGA 1V0LA 4X0VA 5GNZA 2VL4A 1UG6A 3T0AA 2J79A 4PMOA 1QVBA 5HXMA 4LYPA 3IK2A 3CUIA 1VF8A 3BMWA 1FHLA 1G94A 3AIRA 4JZ5A 4KRUA 1KXTA 2EPNA 3ECQA 3WH9A 1V6YA 1C3FA 4KH2A 1K6AA 3ZJ7A 1E71M 1UD4A 2VO5A 2YJQA 2AMGA 1GVIA 3AHZA 3N13A 1ZBVA 4GZIA 3HN3A 9CGTA 5A95A 3AOFA 3CHEA 3EDJA 5I0DA 4HTYA 3A47A 1UHVA 4M29A 1OWQA 2YA2A 5DMYA 4W7UA 3VDAA 2CBJA 3PBGA 4RE2A 1HT6A 1V02E 4BQ2A 1B90A 4V28A 3ALFA 3BC9A 3CO4A 1W1PA 1VEOA 2WLYA 5CPSA 1G1YA 1W1YA 1ZU8A 3QHNA 1DWHM 3OG2A 2WMIB 3MANA 1M53A 4AZ6A 3AQUA 4XV0A 3AZRA 4ATDA 2VCBA 2ZUNA 1W9UA 2WSPA 4P7RA 2E4TA 3IAPA 4PTWA 3SURA 1E0VA 2PF0A 2OLHA 3N15A 2DSKA 2ZXQA 2D3NA 5A8OA 4U31A 4P8VA 2X05A 2DT1A 4AZCB 4B15A 3MU7A 2VRJA 4TXEA 5DO8A 2J7HA 4XZWA 2XTKA 3VIGA 2F61A 3MV01 3WL1A 1GCYA 4UQ9A 1EQCA 4HZ7A 1CXHA 5I5RA 1GUVA 3VGFA 2J7CA 1C7SA 3W26A 1US3A 3WUBA 2DT2A 1PJ9A 3ARPA 3B9DA 3L4ZA 5CXPA 4Y7EA 1DP0A 3VGEA 4CN4A 2PC8A 3L4VA 4UQAA 3PHAA 2FHBA 4EANA 1HVQA 1V0MA 1GOIA 3W25A 1VBUA 1CGVA 3THDA 4CCCA 1BYBA 4AMCA 2UY5A 2VR4A 3UG3A 2J78A 4HOXA 3T0DA 2Z1KA 3SCSA 1JZ3A 1FH9A 1GOQA 4PMDA 4E4PA 5FOOA 2WCSA 2QMKA 4UFIA 2BHUA 3WN6A 1W3JA 3UERA 3POHA 2BVTA 4PCTA 3K1DA 4W8AA 5IDIA 2QHAA 2GJXA 2J7FA 4JCLA 1NOUA 1J10A 1M7XA 3VKKA 1E4NA 3VMPA 5EMYA 4CD6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3ZSS A;  4AC1 X;  1E6N A;  1V3I A;  5A6L A;  5JBE A;  2ZX9 A;  3FAW A;  1XV8 A;  5D9N A;  1M01 A;  3L4X A;  5AYB A;  2E9L A;  4FMV A;  1H11 A;  1WO2 A;  4PMR A;  2WVT A;  5DF0 A;  4ML4 A;  3RPM A;  3CBW A;  2JE8 A;  5E09 A;  1MYR A;  4AZB A;  4D6H A;  1X1N A;  4W7V A;  2BY2 A;  3K46 A;  2VR5 A;  5I23 A;  3UEQ A;  3NJ3 A;  1AQM A;  3PZU A;  1ZBK A;  2BY0 A;  2GJR A;  2NSX A;  1CLV A;  5JUV A;  4JHO A;  1KWK A;  1ODU A;  1Q6F A;  3OLI A;  2XVG A;  2WMJ A;  4AXN A;  5I24 A;  4IUG A;  2X0Y A;  2WZH A;  1V6X A;  3CHD A;  1B31 A;  1TMQ A;  2GDV A;  2ZUV A;  1UR9 A;  3CZ8 A;  2GUY A;  1V08 A;  2DPE A;  4CVU A;  4U2Y A;  1D2K A;  3GH4 A;  3RM4 A;  4MB5 A;  4QAW A;  1UH4 A;  1UR2 A;  3GNO A;  3AIS A;  3UG4 A;  4HA1 A;  1E40 A;  4D6F A;  5AC4 A;  2FHF A;  2X09 A;  1H5V A;  1JXK A;  3NUK A;  5HNN A;  3QHM A;  3DEC A;  3WF3 A;  3WEL A;  4PCS A;  3VD4 A;  3MUI A;  2J75 A;  3N11 A;  3AHT A;  3VIM A;  5D9P A;  1NAR A;  1I1W A;  3PTM A;  1J0Z A;  2OYM A;  4XX6 A;  1FP8 A;  1TR1 A;  1DTU A;  3OGV A;  2WLZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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