5CPTA

Disproportionating enzyme 1 from arabidopsis - beta cyclodextrin soak
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
517
structure length
514
Chain Sequence
SVGEDFPSEYEQWLPVPDPESRRRAGVLLHPTSFRGPHGIGDLGEEAFRFIDWLHSTGCSVWQVLPLVPPDEGGSPYAGQDANCGNTLLISLDELVKDGLLIKDELPQPIDADSVNYQTANKLKSPLITKAAKRLIDGNGELKSKLLDFRNDPSISCWLEDAAYFAAIDNTLNAYSWFEWPEPLKNRHLSALEAIYESQKEFIDLFIAKQFLFQRQWQKVREYARRQGVDIMGDMPIYVGYHSADVWANKKHFLLNKKGFPLLVSGVPPSETGQLWGSPLYDWKAMESDQYSWWVNRIRRAQDLYDECRIDHFRGFAGFWAVPSEAKVAMVGRWKVGPGKSLFDAISKGVGKIKIIAEDLGVITKDVVELRKSIGAPGMAVLQFAFGGGADNPHLPHNHEVNQVVYSGTHDNDTIRGWWDTLDQEEKSKAMKYLSIAGEDDISWSVIQAAFSSTAQTAIIPMQDILGLGSSARMNTPATEVGNWGWRIPSSTSFDNLETESDRLRDLLSLYGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords 4-alpha-glucanotransferase DPE1, chloroplastic/amyloplastic
publication title Structural Dissection of the Maltodextrin Disproportionation Cycle of the Arabidopsis Plastidial Disproportionating Enzyme 1 (DPE1).
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 182
structure length 514
sequence length 517
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.1.25: 4-alpha-glucanotransferase.
pdb deposition date 2015-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02446 Glyco_hydro_77 4-alpha-glucanotransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5cptA01
4W8BA 1DWAM 4BA0A 2EQDA 4AD1A 8CGTA 1E72M 4JZ5A 3WMCA 1KCKA 1EGZA 2JIWA 3RMEA 5CXPA 1VEMA 3BAYA 1EQPA 1QI3A 2ZIDA 1BYBA 1BYCA 2W63A 1YQ2A 1ESWA 1DEDA 4PMUA 1NQ6A 2YLAA 4JL2A 1WDQA 3CZJA 3AZRA 1E70M 3OLGA 4TVCA 5I78A 1QW9A 5GQBA 5CG0A 2X05A 3BMWA 4MPKA 5KEZA 2O9PA 3NDYA 3N1AA 5AC5A 2DH3A 3G6LA 3MV01 5CGMA 1JYXA 3NCOA 1GVIA 4U3CA 3CZKA 1CDGA 5FL0A 4H8HA 2WPGA 4J7RA 3M07A 3VX0A 3VD9A 4H8VA 2UY4A 1HKIA 1CPUA 4QLLA 3A4WA 4AEFA 3CZ8A 4QCFA 1XHGA 2ZUNA 1E56A 3FN9A 5ABHA 2C0HA 1W3LA 1PIFA 5A6AA 2X2YA 1R8LA 4U2YA 4P8XA 3W53A 4PCSA 3L4XA 2XTKA 3SCVA 3ZSTA 1H11A 3IK2A 3F4VA 4C7DA 1UD4A 1CENA 3GBEA 3GH7A 1EXPA 5D9PA 1UA7A 4H7VA 5HPCA 4B15A 4OBRA 5C71A 1OD0A 4Z2IA 1QI4A 2DGAA 1MXDA 2PBOA 4NF7A 5E0FA 1BQCA 1ITCA 4HA4A 4U5IA 4W5ZA 2W91A 5CPTA 4H41A 1N82A 1QHZA 5A95A 4YHEA 1BG9A 1UD2A 2DIEA 3NYDA 4WSJA 4XB3A 2CEQA 2W4XA 3W26A 1W2VA 1W32A 3VM7A 3VIGA 4LX4A 3O9NA 1E55A 3BXWA 1ZBVA 4HOWA 4BZYA 3U7BA 3UG5A 2BY1A 3WQ4A 1LLOA 1HXJA 3U5UA 3VGEA 1Q6EA 2VVSA 4CVWA 3WMBA 2CHOA 3S2CA 1G1YA 5I2UA 4TTGA 1JFHA 4JCLA 1DWJM 2WC4A 1E5JA 4AY1A 1CECA 5FOOA 5FD0A 2IUZA 3WEZA 4IM4A 3GBDA 4MAZA 2EEXA 1W9XA 3PN8A 5D9NA 1B3ZA 1LF1A 3WSUA 3CTTA 1C90A 2BHUA 4J28A 4DM1A 4U2ZA 3RILA 2VC9A 3K8KA 1WNOA 5A6SA 2VT0A 4PMDA 4U33A 3OLEA 2D3NA 3A6OA 1CGXA 3ARYA 2XVLA 2OLHA 1W3HA 2YA0A 3TTOA 3ARQA 2ZUTA 3VM5A 5I23A 1WO2A 2VZOA 4GIAA 3WH7A 2D20A 3RM4A 3CUHA 2DPEA 2CIPA 3AIUA 1NOUA 4UNIA 2VZSA 1XGZA 1E6QM 1TR1A 3RDKA 4AZBA 3MUY1 1IZKA 2JF7A 3B8SA 4TX6A 2XPKA 1E4NA 5I5RA 3VOCA 3POHA 3AIRA 3T08A 3VIJA 3U57A 1GNXA 1XSKA 1KWKA 1HKKA 2CNCA 2Y2WA 3L4UA 3VGHA 5BXTA 1W9VA 1CXHA 1GOMA 1E0VA 1ZL1A 1JD7A 3BH4A 4GI8A 3IANA 4Y7EA 1KXQA 3T0DA 1XRVA 5IFPA 2J7EA 1QNQA 4X0VA 4OOUA 2WXDM 4E8CA 1V6UA 1J01A 4UFHA 1J12A 4W89A 3UG4A 3WQWA 5M17A 3N15A 4DWSC 4ML4A 1WZKA 1UWSA 3L4YA 1V0MA 3OGVA 4JIEA 3QHOA 3POCA 2VZVA 4BS0A 1MW1A 1FH8A 4A4AA 2V3FA 4GZIA 2VQUA 3ZT6A 1UHVA 1U2YA 3F5KA 1CXFA 5DMYA 4NZCA 5A6JA 3VPLA 3W0KA 2J79A 1HKMA 1H09A 1ZJBA 1FH9A 3VIKA 1LL6A 2Y8VA 5A6MA 1R7OA 2J75A 5A8MA 4D1JA 4JL1A 3AYSA 2GJPA 2XYLA 2JF6A 1KR1A 1SFSA 4M82A 2WVUA 4UR9A 3AHYA 4AZCB 4MB1A 4P7QA 3WDQA 1GOWA 5I24A 2GVYA 4HMDA 4F79A 2GSJA 2OYKA 1KQZA 3M6DA 3UEQA 3SUUA 3W6LA 1GQJA 2YJQA 4HOXA 1JYVA 2HVMA 4TOQA 3I3DA 4CCEA 1VENA 2J47A 4CVUA 3BSGA 2VCAA 4CN6A 1CGUA 1TVNA 2J25A 2DQXA 1UR8A 1FHDA 3MU7A 1C3FA 3EDJA 3VGGA 4PUEA 3N13A 1FA2A 1XV8A 4UFLA 2FHFA 1EO7A 1JIBA 3WFLA 1ECEA 4OIFA 5IHSA 1J0IA 1JI2A 4M81A 2EPLX 2ZE0A 3OBAA 3DYOA 2DT0A 4UQDA 1HJVA 3SCPA 2QMKA 1CYGA 1GOKA 4U5KA 5A2BA 3N9KA 3AMGA 5HBFA 2ZUUA 5A6BA 2GK1B 1KFWA 1XH0A 1OCQA 1U30A 1GONA 3WD2A 3OLDA 1E6SM 4NSBA 3WDJA 2OSYA 3PTKA 3W82A 3A47A 1B2YA 1W9BM 3EDEA 1M53A 1KXHA 4PTVA 4WSKA 4CCCA 1V02A 2FGZA 2WLYA 4KWUA 1E3XA 3ARVA 1MQQA 4H04A 1XSIA 1X6NA 2DDXA 1XH2A 2O9RA 1TZ7A 2XGBA 3WD4A 1UR9A 4ZE5A 3NSXA 3OB8A 1TMQA 4LPCA 6TAAA 1R86A 3NSNA 2ZUMA 1GUVA 2CHNA 1QNOA 2O9TA 3O6AA 1GOIA 2F8QA 5I77A 9CGTA 4UZSA 3AHXA 1PX3A 4N42A 1CEOA 1UKOA 4P8WA 4PYSA 4LYQA 3ZM8A 3VKKA 4A3HA 1UKPA 1OM0A 3MSDA 3AI0A 4CU7A 3CZEA 4D6HA 2EPOA 1PPIA 4C7GA 1B0IA 3ZJ6A 5BCAA 3TTYA 4UQCA 1UH2A 2RGLA 1LWHA 2DT3A 1DP0A 1CGWA 3CIVA 4R27A 4BF7A 2VQTA 4CGTA 1EHNA 4C7FA 2YIHA 1UD6A 1WDSA 3KWXA 4M1RA 3W6MA 3O2LA 4EK7A 1U33A 5DFAA 4XUYA 2AAAA 3AS1A 5C8BB 2BVTA 4ZFMA 1TFVA 1QOXA 1V3MA 4AZIA 1C91A 1BPLB 1XD0A 1E9LA 4P7RA 5D8WA 1EDGA 1XC6A 1ITXA 1GOOA 1EHAA 3GXFA 3VDAA 1TG7A 4UFIA 2WZEA 3PZQA 2OYLA 3OLIA 2B31A 4GZJA 3W29A 1IZJA 4V27A 3CZGA 1WDPA 3CZLA 1ISYA 2DT1A 2F2HA 3DHPA 5EBAA 1K9TA 1E4IA 4YN5A 3EDDA 2IXUA 2XM2A 3WKZA 1US3A 1Y7VA 4MNMA 1RPKA 5A8NA 2Z1KA 4V28A 2YL8A 2J7CA 5A6BD 2J7FA 5FL1A 4P8UA 4WJXA 2GK1A 5BXPA 2WAGA 4M29A 2OWWA 2BVYA 1M03A 2DH2A 4TVDA 5D8ZA 5E0CA 2XSAA 1G94A 2EPNA 1H3GA 2PC8A 4Z2JA 4D6EA 4WKAA 3ZSSA 2BS9A 2D23A 2GUYA 3VINA 2G3JA 4UOJA 2BNJA 2UWFA 1UQZA 4CU6A 2WWCA 4BQ5A 1MW3A 2CCRA 5ABGA 2PWFA 2Q8XA 2E9LA 4JHZA 4EANA 2A3EA 1GQLA 2CKRA 2G4FA 2WCAA 2J7DA 3A3HA 3WUGA 2WYSA 2YL6A 3VNYA 4CD7A 4GQRA 2ZWZA 5E09A 1GQIA 2XVNA 3OIHA 4W85A 3CPUA 4PMYA 4W7UA 4QLJA 2QLYA 1E15A 1CLXA 1UH4A 1BSIA 5KZ6A 3CUIA 1QPKA 1CLVA 3II1A 1JD9A 1BG4A 4ZXOA 3J7HA 1E0WA 2WMKA 2WM0A 3AQUA 1FP9A 1HX0A 1LG1A 4PSRA 1UR0A 3K4AA 5I3DA 1VJZA 1JXKA 4FLQA 4ZXLA 1CIUA 1QVBA 2G3IA 3AIEA 4XX6A 4LGXA 4IPNB 2YA2A 4MB4A 1MXGA 2C7FA 1V3IA 3BSHA 5A6LA 1KGUA 4KMQA 3OZOA 1WZAA 1J0KA 1AQHA 4Q22A 2VRJA 3TA9A 1E43A 3UETA 1E4MM 5JBEA 5LA1A 1WP6A 2J4GA 1JF6A 4QFUA 2X0HA 2AOSA 2PWEA 2OSWA 1RH9A 2ZXDA 3WQ8A 1UOKA 1ZJAA 4J3UA 1NOFA 5C70A 1ZS2A 2ZICA 8A3HA 1VFOA 3W38A 4PTWA 1HJQA 3VGBA 1JAKA 3VILA 4U3AA 1CBGA 1JGIA 1QHPA 3WF1A 1L0PA 1PAMA 5LA0A 1J0ZA 3DECA 1UWIA 2D1ZA 3AXHA 3VD3A 1W2PA 4B9YA 3W27A 2CBJA 3SUTA 1B30A 2NT1A 4GXPA 5DT7A 2A3CA 2CETA 2VX5A 1BLIA 4NRSA 2CYGA 3DC0A 1DWFM 2O92A 5CJ5A 1BYAA 2GJRA 1H49A 4XZWA 4GINA 1SYTA 5M5DA 3N12A 4J3XA 2BFGA 3WDPP 2VZTA 3T2PA 3WF3A 5A8PA 3VVGA 1JFXA 2FDMA 4QLKA 3IJ8A 4Z2HA 4CCDA 3SCWA 1J9YA 3SUVA 1NWUA 2EPMX 5GPRA 3FAXA 2VL4A 3I3BA 4ACYA 4DUXA 5HPOA 4S3KA 1NP2A 1RP8A 1FH7A 3VNZA 1VEOA 1B90A 5BROA 4NRRA 3OZPA 2DEPA 1WB0A 1Q6CA 3EBVA 2D24A 3QGVA 3K8LA 5IFTA 5CQ1A 2QPUA 1AQMA 3ZQ9A 1JZ6A 4PSPA 5ECUA 3WY1A 2ZXQA 1OT2A 3SCUA 1ZBCA 2YDSA 1QW8A 3B9EA 2X1IA 2FH8A 1E4LA 4HU8A 3WQ6A 4CN4A 2D22A 3BCFA 4M8UA 3NIYA 2ZUSA 3AJ7A 3TOPA 2E40A 4W93A 1BAGA 3PZGA 1W1PA 2VRKA 2VMFA 4JHOA 2FHCA 3WNNA 3SCRA 3ZR6A 5EMYA 3WQ5A 5D9MA 3IAQA 3W4RA 1VEPA 1MYRA 1JZ5A 2J7BA 1J0HA 4CU8A 3ARWA 4URIA 3AMLA 3CHEA 1QI2A 3ZT7A 4AZ6A 3CMGA 3F5LA 5A69A 2WHJA 3HJEA 3RO8A 2WBGA 4PRWA 2E8YA 1UQYA 2JIEA 1R87A 4B9ZA 3CGTA 3APGA 3WH9A 2EPKX 1KB3A 2WHLA 1B3XA 2YL9A 2V3GA 1BF2A 4J27A 2OWXA 4B3LA 3VD4A 2WVVB 1W1VA 4Z2KA 1NOWA 3UESA 2NW0A 1UWTA 1GHSA 1C93A 4ZE4A 1NWRA 1UKTA 1TCMA 1V3KA 2WC7A 5BRQA 1UWQA 4QAWA 3SCOA 3ARSA 2CPUA 1OIFA 1BHGA 1L8NA 4ATWA 3MV11 4XZBA 4F9DA 3AIBA 4UCFA 1JNDA 3A4XA 1O6IA 3WL1A 2JEPA 3WNOA 1KBKA 1KXTA 3SEPA 1E1FA 4AXNA 1TVPA 5A8OA 2YLLA 2ZX9A 2EJ1A 2ZX5A 4UFJA 4CD5A 3N18A 1GQKA 2VNCA 3PZUA 3W37A 2G3NA 3EYPA 2PF0A 1E6NA 1AMYA 3ARXA 2D0FA 1PIGA 5HXMA 1JYNA 2WMFA 5ABFA 1GJUA 2XVGA 3MANA 1E0XA 3OGRA 3BGAA 4MJ2A 4PEEA 3RCNA 1PJ9A 3T2OA 2GJXB 3SCTA 2OSXA 1JZ2A 2D2OA 4F66A 2CXGA 4HU0A 1V0KA 2EO7A 5CGTA 1V6WA 4LYPA 2W62A 4KRTA 2OYMA 2WZIA 4IUGA 3KEHA 1VFMA 4AD3A 1CGVA 1UA3A 3MMDA 4HZ8A 2XVKA 4D71A 1KR0A 1RP9A 1UWRA 5CPSA 3RIKA 4MAVA 1P6WA 2FH6A 3MKKA 2E9MA 4PMNA 4OKDA 3SCSA 1WKYA 2PB1A 3FXYA 4CD6A 3WBEA 2WCGA 4IPLA 3KZSA 4R5EA 4M80A 1VRXA 1W91A 1EOKA 4DUWA 4D6FA 5IHRA 3AISA 1W9DM 1SMDA 3PZMA 4PMXA 2O9OA 2DSVA 3MSGA 4RE4A 4ATDA 1OSEA 3PZIA 1E6ZA 1M7XA 6A3HA 4N0RA 1FOBA 1E3ZA 7CGTA 3W24A 4FLRA 3GYCA 2A3BA 2WMHA 1ISZA 1HL8A 2QPSA 4AMCA 4FMVA 3VGFA 4AISA 5TD4A 1MFVA 3WUEA 5BWFA 1HN1A 4OUEA 2WVVA 1F4HA 5EB8A 2VCCA 1US2A 4Z2GA 4W88A 1UG6A 2ESCA 4H2CA 4EKJA 2A3AA 1E1EA 4QCEA 4J3SA 4ZENA 1EIBA 1E6RA 1PX4A 2W66A 3GNPA 3WN6A 3GXMA 2G41A 5EFFA 1DHKA 4P7LA 4LQ1A 3ZIZA 4AEEA 4PMVA 4FLOA 2ZUVA 2WSKA 3VMNA 3WMSA 3WENA 4BCEA 2WC3A 3QHNA 2E0PA 4KRUA 4DWSD 1UZ4A 1M01A 3ZMRA 2W67A 3ARPA 3L4VA 2C8NA 4PUDA 1W3JA 4HP5A 4L4OA 4XV0A 1OIMA 4V2XA 3WL0A 3AZSA 1OD8A 2VCBA 2RGMA 1CXIA 4JFSA 3CHCA 3N04A 3AS3A 2W61A 1PZ3A 2VI0A 1TE1A 5BXRA 2GJXA 4W5UA 2WB5A 3AFBA 1OGSA 2ZX7A 3WUFA 1W9UA 1BTCA 1R7AA 3GH4A 1PBGA 3WNMA 4GKLA 1V0NA 1XD1A 2PI6A 4P8VA 2EBNA 1E5NA 1Q6GA 1I75A 4TUFA 1J18A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4W8B A;  1DWA M;  4BA0 A;  2EQD A;  4AD1 A;  8CGT A;  1E72 M;  4JZ5 A;  3WMC A;  1KCK A;  1EGZ A;  2JIW A;  3RME A;  5CXP A;  1VEM A;  3BAY A;  1EQP A;  1QI3 A;  2ZID A;  1BYB A;  1BYC A;  2W63 A;  1YQ2 A;  1ESW A;  1DED A;  4PMU A;  1NQ6 A;  2YLA A;  4JL2 A;  1WDQ A;  3CZJ A;  3AZR A;  1E70 M;  3OLG A;  4TVC A;  5I78 A;  1QW9 A;  5GQB A;  5CG0 A;  2X05 A;  3BMW A;  4MPK A;  5KEZ A;  2O9P A;  3NDY A;  3N1A A;  5AC5 A;  2DH3 A;  3G6L A;  3MV0 1;  5CGM A;  1JYX A;  3NCO A;  1GVI A;  4U3C A;  3CZK A;  1CDG A;  5FL0 A;  4H8H A;  2WPG A;  4J7R A;  3M07 A;  3VX0 A;  3VD9 A;  4H8V A;  2UY4 A;  1HKI A;  1CPU A;  4QLL A;  3A4W A;  4AEF A;  3CZ8 A;  4QCF A;  1XHG A;  2ZUN A;  1E56 A;  3FN9 A;  5ABH A;  2C0H A;  1W3L A;  1PIF A;  5A6A A;  2X2Y A;  1R8L A;  4U2Y A;  4P8X A;  3W53 A;  4PCS A;  3L4X A;  2XTK A;  3SCV A;  3ZST A;  1H11 A;  3IK2 A;  3F4V A;  4C7D A;  1UD4 A;  1CEN A;  3GBE A;  3GH7 A;  1EXP A;  5D9P A;  1UA7 A;  4H7V A;  5HPC A;  4B15 A;  4OBR A;  5C71 A;  1OD0 A;  4Z2I A;  1QI4 A;  2DGA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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