1SR9A

Crystal structure of leua from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
626
structure length
573
Chain Sequence
TIVKPAGPPRVGQPSWNPQRASSMPVNRYRPFAEEVEPIRLRNRTWPDRVIDRAPLWCAVDLRDGNQALIDPMSPARKRRMFDLLVRMGYKEIEVGFPSASQTDFDFVREIIEQGAIPDDVTIQVLTQCRPELIERTFQACSGAPRAIVHFYNSTSILQRRVVFRANRAEVQAIATDGARKCVEQAAKYPGTQWRFEYSPESYTGTELEYAKQVCDAVGEVIAPTPERPIIFNLPATVEMTTPNVYADSIEWMSRNLANRESVILSLHPHNDRGTAVAAAELGFAAGADRIEGCLFGNGERTGNVCLVTLGLNLFSRGVDPQIDFSNIDEIRRTVEYCNQLPVHERHPYGGDLVYTAFSGSHQDAINKGLDAMKLDADAADCDVDDMLWQVPYLPIDPRDVGRTYEAVIKGGVAYIMKTDHGLSLPRRLQIEFSQVIQKIEVSPKEMWDAFAEEYLAPVRPLERIRQHVDAADDDGGTTSITATVKINGVETEISGSGNGPLAAFVHALADVGFDVAVLDYYEHAMSAGDDAQAAAYVEASVTISKTVWGVGIAPSITTASLRAVVSAVNRAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Crystal structure of LeuA from Mycobacterium tuberculosis, a key enzyme in leucine biosynthesis
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-isopropylmalate synthase
total genus 181
structure length 573
sequence length 626
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.3.13: 2-isopropylmalate synthase.
pdb deposition date 2004-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
A PF08502 LeuA_dimer LeuA allosteric (dimerisation) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1sr9A01
3.30.160.270 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Double Stranded RNA Binding Domain Double Stranded RNA Binding Domain 1sr9A02
2VEIA 1K7FA 3PF3A 3EB2A 4P2VA 1VJIA 3QC3A 4E2BA 4UFJA 1TO3A 4UTLA 1FY6A 3W7OA 1XC4A 5U4NA 1SZEA 1SZFA 1W0MA 4TIMA 1B4EA 1QMLA 3OBKA 1VHNA 5G2WA 4K39A 4JGDA 3PR2A 4GUHA 1EUNA 1YPIA 1C9DA 4O54A 3IIVA 1OABA 4EVZA 4XTDA 1KFBA 1I4NA 1RZMA 3WK3A 4PTNA 1A53A 3PB0A 5HR7A 1Z44A 3L5LA 2NV1A 4WZHA 3TX9A 2A7PA 5F4SA 1B57A 3C2EA 4DPQA 4GRSA 3A24A 2QDHA 3LERA 3GR8A 1I2OA 2CLOA 1GVQA 1VGAA 5G2IA 4OU1A 3QF0A 2C13A 2CLHA 4K8HA 3RK8A 1HG3A 3LCFA 1TRDA 1LBLA 4UFLA 1CW2A 3LV5A 2Y88A 2TRSA 4FX8A 2A6LA 1Q6RA 3L68A 3NGJA 1XL9A 4K6AA 1JR1A 3E12A 3GAKA 2YFOA 1GYLA 3PS7A 4AEOA 3MHFA 3RLVA 3TNOA 2E6FA 4M5PA 4IXXA 1SO6A 1VC4A 1KV8A 1WAUA 3GK0A 1LOLA 3T4CA 3TQKA 3CEPA 1KTNA 5K9XA 2PRLA 1VYPX 3F1QA 1RPXA 4IX2A 4TO8A 2C1HA 4FXRA 5F2IA 4GXMA 4EF8A 1TPFA 3CWNA 4IUOA 2A2IA 5FF7A 4HNVA 3DFPA 1AL8A 1LLZA 1TQJA 1VLWA 1QFEA 4O15A 2QCFA 4CCCA 3W2NA 2Z0IA 4ICNA 5LHEA 3PUDA 1YLVA 1TPH1 3I65A 2DZSA 1TV7A 5D09A 1DV7A 4TR9A 5D2XA 3MW7A 3QJAA 1XBVA 3BK0A 1KFEA 4M6QA 3LX9A 4WX2A 2EAWA 3ABRA 3FYPA 4UFMA 4MOZA 4HPJA 3TUUA 3OG3A 3TFCA 1OYBA 1F76A 2NUXA 2DJXA 4ML9A 3QQ0A 4CNNA 2X1UA 3RNDA 4YL2A 4WUIA 3GKAA 5AHEA 5DXYA 3NZ1A 1SQ7A 1MSSA 3CWOX 1G7UA 4O14A 1YPFA 4K8EA 2XN0A 5TBOA 5F2LA 1H5YA 4ORIA 4ZQOA 3G8RA 3PSVA 1K8XA 1DL3A 3LHWA 3W23A 3PB2A 2QAPA 2JKAA 4AHOA 1V5XA 1JCJA 1ME8A 4GNJA 5IM51 1UUMA 4M7TA 2BZNA 3M41A 1SZNA 1EEPA 5D32A 1U5JA 1MO0A 4UC5A 2GVGA 3W1UA 1CI1A 2CLMA 5D37A 1FWTA 2E1DA 3S8HA 2JKEA 3BG5A 3W7KA 3QSRA 1FXPA 2R94A 1IF2A 1ZFJA 4Y8FA 4DO6A 4A21A 2PCQA 4JX5A 3LCXA 4QIUA 5AHIA 4UMAA 3THAA 3W7NA 2ZRVA 3W70A 1PCWA 2V8ZA 3DFQA 5I3IA 1W8SA 2VOMA 2Y70A 4DPPA 4WOZA 1KTCA 1LDCA 3MYOA 2VC6A 3KAOA 1JUEA 3BLIA 3LOTA 3QPZA 5FF2A 2B7NA 4LU0A 3CEUA 1QPQA 5MHBA 4JX4A 2PRHA 2YCEA 1I45A 1FDJA 2QCCA 1CX9A 2VEMA 1W31A 3MHUA 4JTFA 4ADSA 1MZHA 4EOUA 1ICPA 2Y63A 3AJXA 2BX7A 5F2GA 3W2JA 5J5DA 3B4UA 1ZAHA 3OVQA 4X3ZA 4O1AA 3C52A 1SU5A 2H8XA 1JCLA 2ZZ2A 3IIZA 2V81A 1P0NA 2IQTA 4CQ9A 1VHCA 3BARA 4XUGA 3QW3A 1GYNA 2ISVA 7TIMA 1GPWA 3GXPA 4OE7A 5ABTA 1G7VA 3I7QA 3N2XA 3P82A 3UYCA 2OMAA 3HBLA 1NSJA 4LW7A 2WNZA 5HWJA 3NVTA 3QMRA 3LHVA 4TMCA 1EPXA 4O10A 5CZJA 3LXCA 1L6SA 2A5HA 4JNMA 2ZA3A 1R2TA 3FJ6A 2RDTA 1P5BA 3L65A 3USBA 3LCWA 5LNRA 3NR0A 1B9BA 5EL1A 1SW7A 1TPEA 3TR2A 4ADTA 1H51A 5LNWA 4X9SA 3PG9A 2QJHA 1NF0A 1A50A 1VYRA 3THQA 3EX2A 5D02A 4LV4A 4O4WA 1FCQA 3DZ1A 4KFPA 1BEUA 3NL2A 4OQVA 4AH7A 1YDOA 5CPMA 3RLUA 5LGZA 4MZYA 3MMTA 2CWNA 3H55A 2TYSA 4UTWA 2QCGA 4RCXA 5FEPA 1D3HA 3TC6A 4FNRA 3M9YA 4LY8A 1QR7A 1DKWA 5AB3A 1IXOA 3S5NA 5A8GA 2GQAA 3UNDA 5BRBA 3LHUA 1O60A 1OFPA 5AC7A 5IBXA 2HTMA 4RK8A 4FNQA 1OFOA 1GG1A 1DJQA 2RH9A 2YZRA 3UWVA 5AYYA 2CLIA 3PSWA 2A1YA 2ZDRA 3HG4A 3OIXA 4QISA 1X1OA 2E6DA 3HIJA 3STCA 1H7NA 2VFEA 1SO4A 1GVOA 2VFHA 5D30A 3ABSA 2E6YA 3IVUA 4EWND 2C3ZA 4RZ5A 3S1WA 5C54A 1KFJA 1THFD 1Q6LA 3F03K 2OT1A 2CZEA 3GYEA 4O19A 3NO5A 4GUFA 4IMFA 5DCEA 1FCBA 3ATZA 3M6YA 4O1CA 3NQCA 3BGJA 5D2WA 3WJZA 3W76A 4JTEA 4FF7A 4EF9A 2O7SA 2FDSA 3QPYA 1ONRA 3LCGA 1D3GA 1OF6A 2E6AA 3NQ8A 4FIRA 1JULA 1XKYA 1KA9F 2V9DA 5FF4A 3W88A 1V7YA 4DF0A 1XBYA 2WO5A 3BVJA 3A5FA 2AAMA 1W54A 4Y90A 4WXZA 1YYAA 1OFEA 1I8JA 4JS3A 4U28A 4LVDA 5K9CA 4O53A 2TMDA 4UFIA 3SJ3A 4LNYA 2H3BA 3VKJA 3NG3A 4QJ1A 1AW2A 3W1PA 4FHAA 1GTEA 1PVNA 4OWGA 4UNLA 4RZ4A 3LI0A 5BMXA 1SUXA 2DJLA 3O6DA 3TAOA 3L67A 1DQXA 3DFSA 3P62A 3VE7A 5EBUA 3DFOA 5DELA 2VEPA 2C0AA 3SZ8A 1K03A 3G1AA 3MUXA 2P10A 4IGHA 4LUIA 5E93A 3FLUA 3HB9A 1X6UA 2C6QA 4NU7A 3EX4A 3FKKA 4MFDA 5FESA 1T8XA 2FIQA 4NUWA 4UMCA 1H61A 1OK4A 3LCLA 3PULA 3LTPA 3LDVA 3M1ZA 1H7OA 1PV8A 5F2MA 4TMBA 5CPOA 3TSMA 2Z6IA 2Y85A 2VXNA 4FNSA 1OFDA 5LNSA 5DY2A 1XUUA 3G0UA 2CFFA 4MY9A 1TRIA 3PBVA 4MYXA 1NFBA 2V2CA 5DCBA 2Q8ZA 5FF3A 1GT8A 3F4NA 3PBUA 1SSDA 4J9JA 3LXBA 1HFBA 3SW6A 3LLFA 4E2DA 4MPQA 5I3HA 4JR5A 2JGQA 5F4XA 3O06A 1WBJA 4JIQA 3HPZA 2A7NA 1GQNA 4GFSA 1O5KA 1W5PA 3O07A 4B5NA 3W2KA 4JXCA 2Y7GA 2ZRUA 4GUGA 1OG0A 4NVTA 2H8ZA 1LRNA 2VFDA 5AHLA 4NZFA 3CQ0A 4UTKA 2ZRZA 1LRQA 3W73A 1UB3A 3PM6A 1EB3A 1OX6A 1AMKA 2JKPA 3BW3A 3H53A 2JBMA 3L0GA 1TV5A 1P1XA 2GQ9A 3AO0A 1PCKA 3W7MA 1OVDA 1H60A 4JTIA 4NX5A 3NXFA 3IIPA 3G18A 1F05A 3HG2A 3K30A 1ALDA 4JYEA 1OFQA 1ZAJA 1BTMA 1RQHA 1Q6OA 4FNTA 2JGYA 4JTTA 5G2HA 3QRHA 2VENA 4N2YA 5CG7A 4H6KA 5I3KA 5DBTA 1VQTA 4H3DA 3LCIA 1O94A 3KRUA 2ZZ1A 3PY2A 1W37A 5KZEA 3TXVA 3NM1A 2ZZ7A 4DF2A 2ZZ5A 3M5XA 2QUUA 3ZR4A 3R89A 4JTUA 3P84A 1TJRA 4O4VA 2YR1A 2CLFA 1YTKA 2V5BA 3M16A 1R2SA 2A7RA 3E49A 4N6EA 3MBFA 4LT9A 4NQ1A 5DY3A 5G5IA 3EKLA 4AWSA 1TPDA 3ABOA 2QCMA 3W9ZA 3C3NA 1RQBA 4PEKA 2CW6A 1Q3NA 1H50A 4HNTA 5D2TA 1TTJA 4UUIA 1B3OA 4ZL1A 1JQVA 5BMWA 4O1DA 2E5DA 5CZ0A 5I3JA 1F7BA 3NA8A 4S2BA 2CZDA 1R2RA 2Q3RA 4O1BA 4CCEA 1TTPA 1PS9A 4CNPA 3C2RA 2EKCA 4Y6GA 1KFLA 3PWAA 5AHFA 1YTDA 1FDYA 2V5LA 3P5YA 3MP4A 3BPWA 3QM3A 5EA9A 2FPVA 2FQIA 2P0OA 4D2JA 1LBMA 4JTLA 4PL2A 2WPBA 1O4UA 4OV9A 3S5YA 3W7EA 3FJLA 3QYQA 2X1SA 2NLIA 1EWEA 1PHWA 4TU1A 3HF3A 3GDKA 3LM7A 1PE1A 3EKZA 4K7VA 5EYWA 3B05A 3ELFA 1UCWA 5D33A 5LHFA 3F4WA 4NNBA 4DO4A 1T99A 1OYAA 2DZWA 4RLIA 2GUUA 3ZFHA 1JCMP 2ZQ0A 1M5WA 3MI3A 2Z6JA 4JYFA 2BXVA 5DCDA 4JICA 2BWGA 4O11A 4BI7A 3W72A 1TQXA 1H1YA 4Y9AA 3B03A 3R8RA 1G6CA 5KZDA 3W71A 3FA5A 3B0PA 1F2JA 2J9ZA 5LNUA 3C61A 3CU2A 3BG3A 5EY5A 1WA3A 4ZMGA 4QM1A 1UASA 1NVMA 2C18A 1IGSA 3G8EA 5FEXA 3U8GA 3L0NA 4JEQA 3LB0A 3NQAA 5F4WA 3WFAA 3TQ0A 4KKXA 4AXKA 3CPRA 3EXSA 3TKFA 4HIBA 2F7FA 3A21A 2ZZ3A 3DKJA 1YXYA 5KTLA 3A5VA 3P60A 3L9CA 1WOAA 3W2MA 4A3UA 2CLEA 3QSTA 1GTHA 3LHZA 4RX0A 1YXDA 2GPTA 2P1FA 1JRCA 4HPXA 3FIGA 2A4AA 5HULA 4OGZA 3R2GA 3NPXA 1XBXA 1QOQA 3W2UA 4BF9A 2VFGA 1OX5A 1EA0A 2VKZG 3GDMA 3TC7A 4ZQCA 5BNKA 3W1AA 4BR1A 3HPSA 1T0OA 2QJIA 2ABBA 3QH2A 2GOUA 4U4MA 2ZRXA 4RJEA 4Q33A 4AB4A 1B4KA 3P80A 3NQGA 4K36A 4FNUA 4GJ1A 4QQ3A 3S1XA 3E02A 1IXQA 1GOXA 3C0JA 4XQ6A 4IOTA 4I7UA 4QNEA 1FWWA 4Y96A 3LLDA 2HS8A 1G4EA 3W1MA 4ALDA 1H7RA 5D04C 4DBEA 4A29A 2X30A 1ME9A 3JS3A 2PRMA 5T26A 4LVAA 4UTTA 3W7RA 1SR9A 4Z1BA 1H7XA 5L9FA 1PIIA 1VCFA 3FFSA 1KM3A 3W1TA 2Y6ZA 3M47A 3QZEA 3UXDA 3W85A 1DORA 2ZZ6A 3SY5A 3NQ6A 1FCUA 4AHPA 4MFEA 5AN7A 4MKNA 4DBDA 1ICQA 2X1RA 1JUBA 2QCNA 5E1QA 2YFNA 3TJXA 3MP5A 1JUKA 3Q94A 4OBTA 1A5CA 3B06A 4MLRA 1MXSA 2Y7DA 3TMQA 2GVLA 2WOQA 3STGA 3TSDA 4YWIA 3V75A 1TB3A 5AYZA 3DI0A 5HMSA 1OFRA 4JN6A 2BSLA 2ZA1A 4UIOA 4ZVJA 1HTIA 3NNTA 3TDFA 2I9EA 4UFKA 3EWUA 1FWRA 1OX4B 2QEZA 3LI1A 1JCNA 3W87A 3KVMA 3LCHA 5AHMA 2ZZ4A 4L4MA 4NNCA 4WXYA 1JRBA 1KBJA 4MVAA 2QKFA 2B0MA 2PC4A 4BK9A 3UWWA 4FO4A 2UV8G 4FIQA 2NX3A 4P61A 2DORA 4GC4A 3MP3A 4JTSA 5H2ZA 1EUAA 5HQEA 1D9EA 4XBKA 1LLWA 3JR2A 2V2HA 1L6YA 2W6RA 1LBFA 4WOQA 3P5ZA 3HJZA 1FCVA 4UR8A 3CLMA 4YXGA 3LGEA 1DVJA 4KFNA 2WQPA 1LORA 4POCA 3I68A 4NNAA 4HNNA 1IXNA 1TV8A 2TPSA 3QW4B 3HOJA 4JY9A 4JTKA 5G4WA 4ZQMA 3A22A 3L0KA 2B4GA 5HUPA 2PURA 4DEFA 2Y61A 1TIMA 4QSHA 4RXGA 1N55A 4IXHA 3NM3A 3G1FA 4DELA 1WYIA 4LV9A 4UTHA 1LYXA 1C29A 1QO2A 2ABAA 4GUJA 4KWWA 4I9AA 3NYZA 4O13A 3M44A 1SFLA 3W7QA 5AC6A 1WQ5A 2FPTA 2WV8A 3CIWA 4LUJA 3S9YA 5I3FA 1N7KA 1E51A 3P8JA 3TK7A 3TW6A 1T96A 3N9SA 3IGSA 4NXSA 2B7OA 4E38A 3FYOA 1R46A 5K9DA 3CT7A 1ZJIA 3TA6A 4O16A 4FXSA 4GUIA 3SIZA 1R47A 3RU6A 3DHFA 4R33A 2NUWA 2RFGA 4ZZ9A 1KLZA 5SWUA 2Y7FA 3SI9A 1W3TA 3GB6A 2OZ0A 4XWUA 5D03A 3CC1A 4CCDA 3W83A 2Q8LA 3LTYA 1HO4A 1FWNA 1TSIA 4KWVA 3KXQA 3HG3A 1ML1A 4FX7A 1FUYA 5AFDA 3G3MA 3NPVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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