2GJN | Genus

Total Genus 110

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	110
sequence length	324
structure length	324
Chain Sequence	VFRTRFTETFGVEHPIMQGGMQWVGRAEMAAAVANAGGLATLSALTQPSPEALAAEIARCRELTDRPFGVNLTLLPTQKPVPYAEYRAAIIEAGIRVVETAGNDPGEHIAEFRRHGVKVIHKCTAVRHALKAERLGVDAVSIDGFECAGHPGEDDIPGLVLLPAAANRLRVPIIASGGFADGRGLVAALALGADAINMGTRFLATRECPIHPAVKAAIRAADERSTDLIMRSLRNTARVARNAISQEVLAIEARGGAGYADIAALVSGQRGRQVYQQGDTDLGIWSAGMVQGLIDDEPACAELLRDIVEQARQLVRQRLEGMLA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal Structure of 2-Nitropropane Dioxygenase Complexed with FMN and Substrate: identification of the catalytic base pubmed doi rcsb
molecule keywords	hypothetical protein PA1024
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas aeruginosa pao1
total genus	110
structure length	324
sequence length	324
ec nomenclature	ec 1.6.5.11: NADH dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2006-03-31

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF03060	NMO	Nitronate monooxygenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2gjnA00

3EWXA 4M6PA 5DBUA 5HJLA 1TQXA 2X16A 2CLMA 3IVTA 1EA0A 2Q3RA 1GOXA 1TPH1 3P81A 1NAL1 4K38A 2QUTA 1PHQA 1GQNA 2RH9A 1XBYA 1TMHA 5G2HA 3LCIA 1EWEA 5C2XA 3WJWA 5CG7A 3PVFA 1KLYA 1TRDA 4Q33A 2G5WA 4H4IA 1YXCA 3M41A 4Y96A 3EX1A 1IIGA 3BV4A 3LXAA 1JCXA 2A85A 4M5PA 5I3FA 1TV5A 3GKFA 5F4SA 2ZZ1A 4UR7A 3UWVA 2PURA 3TIMA 3SJ3A 2Q3OA 1A50A 5AYZA 2NUWA 2Y61A 2ZRVA 1OYBA 4ZL1A 4JR5A 3ABQA 1GYNA 3KOFA 4RX0A 1RQEA 5C5YA 1WAUA 3MHGA 3NQFA 1KM0A 4N9EA 4LU0A 3B0PA 3LHUA 1SZGA 3JRKA 3QC3A 4LTSA 3TW6A 2Z1BA 1O4UA 1VCGA 4UFLA 1TPFA 2DZUA 3U2OA 1WA3A 3UWYA 4RXFA 3CIWA 5LHFA 1CW2A 3N34A 3JS3A 5E0KA 4YMZA 5EA9A 5F1VA 5BW6A 1JVNA 2VFDA 3W23A 5G4EA 1UJPA 2GPTA 4KKXA 3IGSA 1OJXA 3QW3A 3HGRA 3LOTA 2WQPA 3VNDA 4QISA 3LX9A 2GJNA 3NQGA 3NAVA 5AYYA 5K7JA 3EX2A 1TPWA 1LBMA 4X2RA 5I3JA 3H54A 5H91A 8TIMA 4GBUA 3IEBA 1JCMP 1XM3A 2CFFA 1TPDA 4O14A 4HPJA 2B7QA 1KFKA 1EWDA 2FDSA 3MI2A 3G8EA 1ICSA 3TDFA 1LRNA 2H6RA 2VEPA 4AMAA 3LTPA 1GZGA 2CZ5A 3THQA 5I3IA 2A4AA 1B4KA 3EXRA 4MYAA 3HF3A 4A2SA 3NQAA 4JDYA 2O7QA 1LDCA 2NWRA 5I3KA 4UTJA 1VHCA 3GLCA 4X9SA 4GRSA 2P0OA 2Y85A 4Z1AA 1TCDA 4NJKA 3W7IA 3NPWA 1GVSA 1YADA 3G1FA 1S3HA 4N6FA 4OV9A 4NZJA 1VS1A 3O8AA 2PRLA 3UZJA 4LUIA 3W1TA 4QAIA 1XBVA 4E2DA 3W7OA 3LRMA 5KZEA 2NXHA 3GKAA 4MZ1A 1W5NA 1JRCA 2RDTA 3LHZA 4LUJA 4LVAA 1TIMA 1XBZA 1FUYA 3LXCA 4QQ3A 4MLJA 4HNUA 4HNNA 2D73A 3M9YA 3NQCA 1YTKA 4A3UA 3IIOA 2WSQA 1QAPA 1XUZA 2DU2A 1ICPA 1ICQA 3KVJA 2V30A 3TE9A 4ZQNA 3PBWA 1W3TA 5J5RA 3R13A 4JYDA 2P10A 4PTNA 1AW2A 3UY7A 3U8GA 1THFD 3MYOA 3TJXA 3BGGA 4EVZA 3BW4A 2QCMA 3UWUA 3B8DA 2NWSA 4E38A 1VYPX 3W2KA 4Z1BA 1WYIA 1SQ7A 5DXXA 3S42A 1TYGA 4FHAA 4A22A 3NL5A 2ZZ3A 4OBTA 1P5BA 1GTHA 3FJLA 3LHWA 4IQLA 3CEUA 1D9EA 3P8JA 4LRTA 4BR1A 1G4TA 4LVBA 1UUOA 4CNOA 2NUYA 4W9TA 2ISVA 3ZR4A 2WPBA 4NZFA 5GVJA 2CZEA 1ONRA 3C52A 4HSNA 3TH6A 4ONVA 1N55A 4O1AA 3E12A 4LRSA 4DBDA 3WFAA 3K30A 4PA8A 4M19A 4TX9A 1A5CA 1W56A 4N9BA 1OX5A 1FCUA 4LS2A 2VENA 1IXPA 2FB2A 4UTIA 3NQDA 3NM3A 3KX6A 5G2IA 4M7SA 1LBLA 4UFHA 2CLLA 5DBTA 1RZMA 2Z2UA 3CWOX 5LGZA 4WY0A 5AC8A 3G0XA 4GUJA 2BTMA 3P8IA 5FEXA 1TTQA 3OG3A 5D2WA 5LNSA 2VFGA 2DJLA 1SW3A 2A6NA 3FOKA 2RDUA 1X1OA 5HR6A 2CU0A 3W7KA 2YW3A 5FF0A 3Q58A 2ATMA 3M6YA 3IIPA 1VYRA 3MI6A 4JX6A 3HG4A 4XKYB 3W1XA 5I3GA 2Y70A 4CCCA 3CB8A 1H1ZA 2GJLA 3TMQA 4AWUA 3DI1A 3N2MA 4FB7A 3W72A 1YDOA 4TO8A 1HL2A 4DF0A 3WJYA 4CNNA 1H62A 3C2EA 4NJIA 2ZZ2A 4AHQA 3CPRA 1OK4A 1H63A 5K3VA 1MEHA 3OA3A 1N7KA 3FFSA 5CPNA 1KW1A 4RLIA 1EPXA 1OFQA 3TMLA 5AFDA 4PL1A 1CX9A 3TU9A 1JULA 2GVGA 4JICA 1ZAHA 3LHVA 3S8HA 3R12A 3D0CA 5KZDA 4DQWA 1XI3A 4IMFA 4UXDA 1HUVA 3O63A 3O06A 3SZ8A 3P74A 3S5OA 1BKSA 3KVMA 5FEWA 5CZ0A 1UASA 1I2RA 2LLEA 2NX1A 4JTFA 3SW6A 2Y62A 2WJZA 4S2CA 3G1YA 5AN7A 1WX0A 1W5MA 2ISSA 1XDLA 2E68A 1R47A 2AQWA 4X22A 2OCZA 4GNJA 2I1OA 3TW7A 1EB3A 2R94A 3L9CA 3QH2A 1OFPA 2A2IA 2VXNA 1YTDA 3RU6A 4KWVA 3QMRA 5D38A 3STGA 4AHOA 3L0GA 5CPOA 3GR7A 1FDJA 3L5AA 2EKCA 1H7OA 2E09A 3EX6A 1KFBA 4PH6A 2NUXA 3QPYA 3CLMA 4ZQRA 3NPXA 3W85A 3NQVA 1ZHAA 1DOSA 1OFAA 5G5IA 2QDHA 3BLIA 3IIZA 1T8XA 1TJPA 3ELFA 4YXGA 1OFBA 1DV7A 1HTIA 2E6YA 3W73A 3BGJA 4ZQMA 2ZYFA 1TRIA 1M5WA 2ZDRA 1F05A 3PAJA 3I6RA 4R53A 3P80A 1XFBA 1LBFA 2CW6A 3GZ3A 3VKJA 4XTIA 1VC4A 5E1QA 4IXXA 5AHNA 3QJAA 4MPQA 3W83A 1GVQA 2HS8A 1WOAA 3HG3A 2YXGA 2OZ0A 4AAJA 2A5HA 3F03K 3DKLA 2J6XA 1DL3A 5DN1A 4E2BA 2E6AA 3MHUA 3LDVA 4QM1A 3GVGA 1OYAA 4YL2A 5K4ZA 2A7RA 1F74A 4UMCA 4GUIA 5C54A 2ZBTA 3UQNA 2WSYA 4DO6A 5CPMA 4NNBA 4WX2A 1QNVA 2V2HA 3N3MA 3E0IA 2TRSA 1QOPA 2ISWA 3QMTA 2DZWA 3L2IA 3UPBA 3V1PA 2QJGA 3LTSA 3DU0A 2YGYA 4UC5A 2RHGA 5AHEA 3PB0A 3GXNA 2C3ZA 4IJBA 4K8HA 3IVSA 1R46A 3NPUA 3LHYA 2NXGA 3NL2A 2VEIA 2VEKA 2JK2A 4NXKA 4RK8A 1YPIA 4TMBA 3U6WA 4WXZA 5HQEA 1XUUA 2DZVA 5DY2A 1U5JA 1H7WA 1S5TA 3PS7A 4IPJA 1QCWA 3E02A 1SFLA 4RZ4A 4PEKA 4Y9AA 1TPVA 3T40A 1L6YA 1F6KA 3PG8A 1VQTA 2ZCGA 3TUUA 2VELA 3ZWSA 4FO4A 3T44A 2JGYA 2FIQA 1LLZA 4CCEA 4H3DA 4WQ6A 3N14A 3A23A 1LCOA 3QW4B 1KFJA 4AVFA 5CSSA 2QCNA 4O54A 1SZNA 4RR4A 1L2UA 1G67A 4UNKA 1TTJA 1ME7A 1IXNA 3W7CA 4MY1A 1LYXA 3QSRA 1GG0A 3MP3A 4JEQA 3S5ZA 1KFLA 4UFJA 5KITA 4ZQOA 5H2ZA 3S5YA 2F84A 5KZMA 3S6DA 3TC7A 2G96A 4KWWA 4O10A 5AHIA 4Z1CA 3DI0A 2RDWA 4XTDA 4Y8FA 3IIVA 1Q45A 3QM3A 4DO5A 2ZRWA 3S1WA 1ZENA 3GIYA 4HNTA 3A24A 3HG2A 4I7UA 1L6WA 4BWLA 1I2NA 1UCWA 4I9AA 3OVQA 3TXZA 3NVTA 1W31A 5C6MA 3TV8A 4WD0A 2FTPA 4UNLA 1WDWA 3MP5A 3GAYA 5G4WA 3PB2A 1RR2A 4JTGA 5TQLA 2W6RA 5F2GA 4GUGA 1D3GA 5LKYA 3HO8A 1OFDA 1Z42A 3C2OA 1RPXA 3NQMA 5BMWA 3NYZA 4S1FA 2Z0IA 4NU7A 3C56A 4RXGA 1LOLA 3B04A 2PRHA 3OEXA 3OIXA 5LNUA 2WNZA 4JTLA 3O6CA 1RVGA 3LBMA 1A5BA 1F2JA 4UFKA 3BPWA 5AB3A 3IIXA 3OVRA 3TAKA 1GJPA 3C61A 2H8ZA 1W0MA 4XKYA 5CGQA 3W1NA 1WBJA 1OFRA 3R2GA 4NJHA 3DENA 4CQAA 2QCGA 3G1DA 3RLVA 1YLVA 3C2RA 2Y63A 3IGXA 3C3NA 4UR8A 3YPIA 3UXAA 3UYCA 1W1ZA 1KM5A 3CWNA 1Y0EA 2J9ZA 2DZPA 1G4PA 3PBYA 4AWTA 4IOTA 4LT9A 3NQEA 5BRBA 4FF7A 4O12A 4MJZA 1AW5A 1KV8A 1DHPA 4WXYA 3B05A 4HN4A 2QJIA 4O4VA 2TPSA 4BWLC 3DHFA 5KTLA 3OVPA 1LM1A 4A2RA 4MKNA 3GXPA 1T0OA 3DFSA 4FNTA 1JRBA 1KA9F 1H7NA 1CI1A 1AK5A 2GQ9A 3PUOA 4FIRA 2VOMA 2OX1A 1I2PA 1Q3NA 2Y89A 2RFGA 4XBKA 4NQ1A 2PRMA 2YFNA 1F76A 3T55A 4IXHA 4R34A 1PE1A 3UXDA 3P62A 5G2WA 2ZQ0A 4MJMA 1PHWA 1YYAA 3LRKA 4M6QA 3FEMA 3O16A 1RQBA 4DO4A 1EUNA 2VFIA 4G1KA 5J5DA 2H3DA 3UWZA 3EEGA 1TTIA 1LRQA 4MY9A 4R33A 3STFA 3G1HA 5EL1A 2X1TA 4N2YA 3PWAA 4ORMA 1QPNA 2NZLA 4K37A 3NZRA 3RF9A 1XCFA 4ZQCA 1YPFA 3E96A 4MOZA 1WV2A 3TNOA 4ZVJA 4U28A 1Q6OA 4HHPA 3DH7A 3N73A 2ZA3A 2CLFA 3MI3A 2BXVA 5D05A 2YX0A 3N2XA 4O1CA 1Z41A 3LGEA 2YYTA 1DKWA 4GUHA 1GVRA 2QCDB 2Q8ZA 3SIZA 3BW2A 3CQ0A 4AEOA 2UV8G 3H53A 3PR2A 1G69A 2YW4A 1YTEA 4WOZA 2R14A 3IV3A 3KAOA 4JXCA 4JYEA 3W2LA 4FNSA 5L9FA 3B06A 2B0MA 4OHQA 4JIQA 4AHPA 4FXRA 1GTEA 3EWYA 4OGZA 3MO7A 5D02A 3W07A 3FJ6A 3NL6A 3UD6A 1PCKA 1Q6RA 3W1RA 5CKSA 4UFIA 3O6DA 5K9DA 5F4WA 3Q2DA 3LRLA 1C8VA 2JBMA 3W1UA 1FWTA 2V5LA 3LB0A 4ICNA 5CSRA 4IMGA 3QSTA 1J2WA 1W54A 4AH7A 3TFXA 2EAWA 1ZFJA 3A5VA 1GVOA 3LLFA 5DY3A 4YWIA 1WQ5A 1AL8A 3P60A 5G1YA 3L0NA 3PY2A 2EGZA 1M7PA 3GDRA 4NJJA 1R30A 3Q37A 2A1YA 4JY8A 3F4NA 3LCGA 2CWNA 3M47A 3I7QA 4MZ8A 1QO2A 3CTLA 1NFBA 4M7TA 4O0ZA 5SWUA 1OABA 1XBXA 5HULA 2GVJA 2IQTA 1ZCOA 4YLWA 3W76A 1QMLA 1K03A 4LS1A 3SR7A 3NGJA 4O15A 4UTLA 2RKXA 1SR9A 4ADUA 2C19A 3TKFA 1JCJA 2V8ZA 1TREA 3GR8A 3W7NA 1LP6A 3W6YA 3MWAA 5EKYA 3HQ1A 3S1XA 5G1TA 2ZRZA 3F1QA 3LXBA 4I7VA 2C13A 2I14A 3MBDA 4JTTA 3HG5A 1ME9A 4XZ9A 3P5YA 3W1QA 3W7DA 2GQAA 4O1DA 4DPQA 2FPTA 4DF2A 1SW7A 4ORIA 1J5TA 1OF6A 1MO0A 2WKJA 3GB6A 2CLHA 2JKPA 3G1XA 3A9IA 3RFAA 5D09A 4NNCA 1I4NA 4BF9A 1H7RA 1OX4B 1UB3A 2DZXA 3L65A 4WUIA 3DXIA 1X8FA 4L4LA 1DBTA 5DELA 2YSWA 4K39A 3O05A 5I3HA 3TXVA 3TK7A 4FIQA 1OG0A 2C6QA 1VPXA 1OX6A 3M5ZA 3R89A 3SGUA 2FPVA 3W75A 3S9YA 1WOBA 5D37A 4LV9A 5LSMA 3C6CA 1DQWA 2GVLA 3NNTA 1B57A 1F6PA 1SO3A 3W22A 4IMCA 1V7YA 3EKLA 4O28A 3TX9A 4MYXA 2B7NA 1FY6A 1S5VA 1KFEA 1OFEA 1PL9A 4K6AA 3W7JA 3TJLA 1PV8A 3LCWA 5D03A 2WV8A 2KZHA 3IVUA 4LOCA 3H55A 2QAPA 3PSWA 3GX9A 1WXJA 1L9WA 3B03A 3EX4A 1G4EA 4ADSA 3LHTA 3SY5A 4Z0JA 4FNPA 4I7WA 4O13A 2OT1A 3TR2A 3KXQA 5EYWA 3LI1A 2C15A 3INPA 3QZEA 4WZHA 2C16A 4L4MA 2XFWA 3O15A 3TCEA 1FDZA 4LVDA 1MXSA 2JKAA 3NQ7A 3TSBA 3W7HA 2V5BA 3BLEA 3RNDA 3UNDA 1SUXA 4JDBA 1K02A 3LTYA 1YDVA 5LZLA 2ZA1A 1XL9A 2OJPA 1TO3A 3LI0A 3RLUA 4JY9A 4N9CA 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4MFEA 1KBIA 1KFCA 3GK0A 4Y6GA 3UZ5A 1PVNA 4EWND 2FPYA 1D3HA 3CEPA 4Z1DA 3NM1A 1B3OA 1FCQA 2ZZ5A 3G8RA 4UTWA 3ABRA 2VC6A 5HINA 1L6SA 2HS6A 2J88A 2QCDA 5A8GA 4JTKA 3S5NA 1O95A 3W3OA 1KLZA 4CNPA 3ATZA 1PS9A 2Z6JA 1XKYA 3KHJA 5HMSA 1ZAJA 4UTTA 3LCLA 5IM51 2NV2A 1FCBA 4CQ9A 2TYSA 4AB4A 4XQ6A 3Q94A 4HNVA 4GWEA 3RMJA 1TTPA 4RCXA 1W5PA 3PSVA 3NA8A 2VFHA 3TAOA 4LW7A 1SO6A 3EWZA 3SFKA 1K7FA 5TIMA 1KTNA 2PC4A 5DCEA 1W8SA 4FX7A 3KRUA 1BTMA 4N4QA 4U4MA 3FYOA 2WOQA 4QIUA 4BI5A 5T26A 5ABTA 3M43A 4N9DA 1IIHA 3MMTA 2YDAA 2HSAA 1EP3A 3BK0A 4JS3A 5KINA 1I2OA 1OHLA 2F7FA 3HIJA 4C1KA 1H51A 4IX0A 5K9CA 1HO4A 1IXOA 1LORA 2WSRA 1TPB1 1ZAIA 4GJ1A 4O53A 4XWUA 3E49A 4PC8A 3HB9A 1SW0A 3GXTA 2H3BA 4KFPA 1NF7A 4O0KA 1X6UA 5F2IA 2YFOA 3TQKA 3HPZA 1GPWA 2B7OA 3PULA 2XN0A 3T4CA 3LV5A 3EWWA 1H5YA 1FWWA 3PF3A 2QCLA 2B4GA 1U83A 1LOSA 4O18A 5TBOA 2W0UA 2BSLA 2CLKA 1HG3A 3ZS4A 3HGSA 1KM1A 3ABOA 4LC6A 3NQ6A 4OWGA 1KTBA 3SGZA 5LGXA 3W2JA 3P82A 1NSJA 1OVDA 1VZWA 2WNNA 2ZTJA 5AYXA 1IXQA 2E5DA 4N02A 3EXTA 2R8WA 4UTWC 4GE8A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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