3HJZA

The structure of an aldolase from prochlorococcus marinus
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
GMKSILEQLSSMTVVVADTGDLDSIKKFQPRDATTNPSLILAAAKNPDYVKLIDKAIESSENTLPNGFSEIELIKETVDQVSVFFGKEILKIISGRVSTEVDARLSFDTEATVKKARKLINLYKNFGIEKERILIKIAATWEGIKAAEILEKEGIKCNLTLLFNFCQAVTCANANITLISPFVGRILDWHKAKTGKTSFIGAEDPGVISVTQIYKYFKEKGFKTEVMGASFRNLDEIKELAGCDLLTIAPKFLEELKREKGVLIRKLDASTKINNSIDYKFEEKDFRLSMLEDQMASEKLSEGITGFSKAIEELEELLIERLSEMKNHKLISA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Transaldolase B
publication title Phage auxiliary metabolic genes and the redirection of cyanobacterial host carbon metabolism.
pubmed doi rcsb
source organism Prochlorococcus marinus str. mit 9312
total genus 131
structure length 333
sequence length 333
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2009-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3hjzA00
1OYAA 4BWLC 3PB0A 5KINA 3QC3A 4X2RA 1GYNA 3N73A 3ABQA 2VFDA 4BK9A 3G8EA 1W5QA 3WJYA 2W79A 4UXDA 1M5WA 1F6KA 3MHGA 3QMTA 3E12A 2I1OA 3EX2A 4KKXA 3QJAA 4MYAA 1CW2A 3CC1A 4TX9A 1LBFA 1PHWA 2V5BA 1KM5A 5LSMA 1A5SA 4UTWC 4XBKA 2VFHA 5EMUA 2WNQA 1IIGA 1EP3A 3THAA 2C3ZA 3PB2A 4HHPA 1OFDA 1Q6QA 4ICNA 1TTQA 1MEHA 2YPIA 3LCLA 2QEZA 3EX4A 4NQ1A 4C1KA 4RZ5A 3UNDA 3HJZA 3ELFA 1SZNA 3IVUA 4XKYA 3SZ8A 2FPVA 2B7QA 2ZQ0A 1X8FA 3W86A 4K38A 3GNNA 3MYPA 5LZLA 2J9ZA 3O1NA 3RFAA 2OT0A 1KFLA 3TX9A 3C0JA 2JKPA 2H6RA 1K8YA 3GAYA 1WQ5A 3PS7A 2DZUA 2VXNA 5C5YA 3CWNA 3PBWA 4K8HA 5LKYA 3B4UA 1TV5A 2HTMA 3P84A 1KTCA 1QOQA 2EAWA 1ZY9A 2CW6A 1LLWA 1TYGA 3HBLA 3QPZA 3FYOA 4XTDA 3U6WA 3MJYA 3UZJA 1NFBA 4DEFA 3H55A 2FQIA 1OFEA 4GUJA 4KFNA 1Y0EA 2X1SA 1H63A 4E2DA 5AHFA 1GVFA 2VFEA 1WOAA 3GAKA 3STFA 2EGZA 3TMQA 5TIMA 2JK2A 5DXYA 4Z1DA 1W5NA 5D30A 3FEMA 1O60A 2RDWA 1TMHA 1JCYA 1QPQA 3C2VA 3N9RA 4OBTA 3C2RA 4N02A 2R8WA 3QQ0A 1IXNA 4JDBA 1YTEA 4NXSA 4UTHA 2PRHA 3OVQA 5G5IA 3NQ8A 4LC8A 1HTIA 4BR1A 2HMCA 4OHQA 1KM3A 4NJGA 3ZWTA 5D2YA 3WK0A 3O6DA 1KTNA 3DFTA 2VELA 2QUTA 2QCFA 4WOZA 2A1YA 4JX4A 2NLIA 2TMDA 1D3GA 1G4PA 1ML1A 4N4QA 4O12A 2BTMA 2QJGA 1XKYA 1LZOA 1ICQA 4JIPA 1YYAA 4LRSA 3EX1A 1ZALA 3TIMA 3W07A 1EPXA 1ADOA 5AC8A 1W3IA 3S1VA 1G4TA 3EX3A 3I7RA 1Q6LA 2HS6A 4RK8A 4KWVA 3T78A 4ZMGA 1KFBA 1RQEA 1SSDA 4JYEA 4CQ8A 1GWJA 2WNZA 3TSMA 3HGSA 3W1LA 3NOEA 4MY9A 3UWVA 4XZ9A 3WJXA 5L9FA 3GYEA 3TV8A 5I3HA 1PS9A 1AW1A 3TAKA 1R46A 4N4PA 3BLFA 2V9DA 3IVSA 3C52A 4A22A 3W2JA 1LRQA 2CLEA 1W5OA 5AYYA 1QFEA 3QH2A 3NZRA 2DJXA 1CI1A 4NJHA 3RLVA 4A3UA 3B0VC 1S3HA 4MJMA 4UTJA 1GG0A 2GQAA 4OV4A 2Y88A 1W5MA 5G2IA 1UUOA 4RXGA 3MI2A 4MY1A 2TRSA 1A5BA 4LS1A 5DBTA 4BI5A 1A50A 1OHLA 3BLIA 4O1CA 4UNKA 3R89A 2H90A 5HUOA 3O63A 5EL1A 1ZFJA 3LTSA 4Y9AA 5FEWA 1I2RA 3QEZA 3MHFA 4BF9A 3PBYA 1YXYA 1RR2A 2E5CA 5FESA 2VEKA 3EXTA 4GNJA 2YYUA 4I7VA 1TQJA 2JGYA 4PC8A 4QISA 5I3JA 4DO6A 1VCVA 3L9CA 1EB3A 3G0XA 3DU0A 3NQAA 3L5MA 1FXQA 4LC6A 3I6RA 3DENA 2DZSA 5AHNA 1FCBA 1LDCA 2F7FA 4O1BA 1GOXA 2BX7A 4UFHA 1D3HA 1W3NA 1R2RA 3LXBA 3R12A 2ABBA 2CLHA 4EOUA 2YYTA 3EKZA 3W7CA 2C6QA 4FEZA 3RNDA 2PRLA 3R5EA 2PRMA 4N9DA 2ZZ2A 1NVMA 3HO8A 3W7IA 3IIPA 5D02A 3UWZA 4BWLA 4N6FA 2V5LA 5K4XA 3QYQA 1BKSA 3NQEA 4DF1A 3O15A 4Y6GA 4WY0B 3HGRA 4IXXA 3DGRA 3W88A 2BXVA 4DO4A 1SO5A 1H7RA 3MI3A 3BARA 2W0UA 1OX4A 3QW4B 5SWUA 1TIMA 1VYRA 2QDGA 3P74A 3O6CA 4O50A 4O16A 5CPNA 3TW7A 4LW7A 3KRZA 2ISVA 3PR2A 3LGEA 5AYZA 3P5YA 4TMBA 4UTWA 4AHOA 2Y7FA 1LLZA 4JNMA 3TJXA 1RV8A 3DZ1A 2Y61A 4R7JA 3QM3A 1J2WA 4JXCA 1QPRA 3JS3A 1H7PA 4K6AA 2NXHA 1NF7A 2CZEA 3HPXA 3ANYA 4WX2A 1XI3A 2B0MA 2P1FA 4N2YA 3P5ZA 2VFGA 2EHHA 1O94A 3IVTA 3NQ6A 4GUGA 4JD4A 3A5VA 4IGHA 4WUIA 3N14A 3STCA 1G4EA 3FS2A 4AMAA 1FDYA 2QAPA 3M5XA 2GQ8A 3JR2A 3GKAA 3HPZA 3VE7A 4NVTA 4LS2A 3DH7A 2CWNA 3LHZA 3E9AA 4H3DA 3VI2A 2QDHA 4P61A 3NR0A 3MI6A 1HL2A 5FI8A 1DQWA 1OYCA 4LNYA 3VCRA 1KM0A 4IMEA 4RLIA 3W7LA 4AWUA 3IIOA 1EIXA 1T0OA 4CQ9A 3QMSA 2NX1A 1RPXA 1FWSA 4IMDA 3L5LA 2Z6JA 4RCXA 1DJQA 3GR7A 1QAPA 3P62A 5C54A 1FCQA 5EKYA 1KFEA 2Y85A 3HGJA 3ZWSA 2ISWA 3W7OA 2QCEA 1WOBA 4GXMA 3S1WA 1EA0A 1GT8A 3G1SA 5TQLA 4PTNA 1KBJA 3CB8A 4MFEA 4O53A 3HG3A 4DPPA 3LCGA 3O6YX 4JIQA 3BV4A 2O7QA 3BGJA 1YLVA 2JKAA 2B7PA 1VC4A 4X3ZA 1MEWA 3M5VA 1XUUA 2ZZ1A 1GZGA 3G18A 3PULA 1VCGA 3T44A 3M1ZA 3LLDA 3ZS4A 2CZFA 1TO3A 4ONVA 1LBMA 3LCHA 4WOQA 2B4GA 1MSSA 3LX9A 2GPTA 5HINA 1JVNA 4UFMA 2QCDB 2FJKA 5AC6A 1RQBA 3NO5A 5HMSA 3W72A 1IGSA 1PHQA 3EWUA 1AMKA 1FUYA 4UNLA 1W31A 1ICSA 4NZFA 1SZEA 4RJEA 3UWYA 3EXSA 1OFQA 3Q37A 3M16A 3PUDA 5U4NA 4HN4A 1GG1A 2FLIA 2G5WA 2C13A 3M6YA 3I7SA 1ICPA 3A23A 2WV8A 1THFD 3DAQA 1KV5A 3R8RA 2A6LA 1RQHA 5DY2A 1WX0A 2VEMA 5EA9A 4FHAA 4M6QA 4N6EA 1O5XA 1OF6A 3W22A 1K7EA 3LRLA 3NL2A 3F1QA 3G1VA 1GVSA 4DBEA 3LV6A 4PODA 3PBVA 5T26A 5KMYA 3G3MA 1G6CA 3C6CA 1H60A 3LB0A 3NQDA 4R34A 4ML9A 5AHLA 3DKLA 1T8XA 2PURA 3W1NA 3GLCA 3MO7A 3O8AA 3GXTA 4UTLA 1H62A 3DFOA 1TB3A 5E1QA 2XN0A 4NJIA 2Q3OA 2W6RA 4LVBA 4CLMA 3W7PA 2AQWA 5HQEA 5LNUA 3KAOA 3LV5A 2H3DA 5CSSA 5LNVA 3O05A 4CNOA 3W3OA 2QF7A 3P67A 2ZTJA 2NXGA 4JYDA 1UASA 4Z1AA 4LUIA 1FWRA 2VKZG 4UTMA 3OEXA 3HMJG 2WJZA 1RD5A 4NX5A 1YTKA 4PA8A 5D38A 4FXRA 5D32A 1M7PA 5IM51 5K9DA 4UMAA 1LRTA 3TNOA 4MPQA 4MUZA 2ZRVA 3S5OA 5FF4A 3L68A 4JY9A 3W73A 2CU0A 4IWWA 3IGUA 2Q3RA 1GVQA 4NZJA 4BI7A 3G1AA 1YPIA 4K39A 3L66A 1XBZA 3BPWA 3L0NA 3TJLA 3CIWA 3UWWA 4GUIA 4LVGA 3E96A 2J24A 3MBDA 4O4WA 1B3OA 4DBDA 3HG5A 3O06A 2DZWA 4A2SA 4QNEA 2AAMA 2NZLA 1X7FA 5D2VA 4K8EA 3L67A 4TO8A 4JTTA 1F5ZA 1YPFA 2Y62A 2QCHA 3OIXA 2J27A 2CLMA 4Q4KA 1LP6A 4JEQA 2NXIA 4ORMA 1I2NA 2G96A 5CPMA 4ALDA 1A5CA 3A9IA 5CG7A 4XKYB 5HNRA 3SFKA 1SW0A 1K02A 3T55A 4AXKA 4OV9A 3QSRA 1OYBA 3LRKA 3LHYA 1F05A 1AW2A 5DLCA 5DN1A 1H7WA 3UPBA 2NV1A 1LRNA 3B03A 3PSWA 1U5JA 3A21A 2Q8ZA 1TV7A 2A85A 3NPWA 4IUOA 1AL8A 3GB6A 2JBMA 2WSYA 1N7KA 3I7QA 3GVGA 3RF9A 2B7NA 4XTIA 5K9CA 4MFDA 4MY8A 5G2HA 3WJWA 2I14A 2BSLA 1SR9A 1TPUA 1PL9A 1S5WA 5AFDA 1PV8A 4UUIA 1SSGA 4CQAA 2ZDRA 3NXFA 1JRBA 2XFWA 1TV8A 5CZ0A 1J5TA 5FEXA 1FDJA 1FWNA 1TPB1 3GK0A 1G67A 5MHBA 3ATYA 3UXDA 3W2MA 1R47A 4XBSA 4EIVA 1Z42A 2ZCGA 1Z41A 4YWIA 2CFFA 4JTKA 4AWTA 4JN6A 3P8IA 4LS0A 3W1PA 1WBJA 2E6AA 3W70A 1F2JA 4AHQA 3GXPA 1DVJA 4LOCA 4YLWA 3FJLA 5A8GA 1JR1A 1SUXA 2Z2UA 4ZQNA 3W6YA 4CNPA 3PWAA 2ZTKA 3VE9A 4AWSA 1DQXA 2FPYA 4A21A 3BW2A 5F2GA 5KZEA 3G0SA 1K03A 1JULA 2ZZ3A 3LOTA 1DOSA 5C6MA 3KX6A 1B9BA 3WK2A 4AB4A 1QPOA 1K3UA 2Y7DA 3ABSA 3NM1A 4QM1A 4X22A 2XN1A 1IIHA 1AW5A 4UCGA 1M6JA 2PC4A 5KITA 3MUXA 4JTIA 2OCZA 3C8FA 4O0KA 2XN2A 3TU9A 3NQ2A 4D2JA 1S5TA 2ZA2A 3P8JA 5LNSA 4J9JA 2NV2A 4UFKA 3DI1A 4UR7A 2CLKA 1VRDA 4WQ6A 4OGZA 3TCEA 4LV9A 3D0CA 5EY5A 4ZQRA 1QNVA 4R33A 5C2XA 3TH6A 4KFPA 1LROA 3QQ1A 4HIBA 2X2GA 1FCVA 4GFSA 1X1OA 4AF0B 1QOPA 4AH7A 1UUMA 2CZDA 1I45A 5DELA 3CHVA 3LCXA 2X1TA 1ZAIA 1NAL1 4GE8A 2UV8G 1KTBA 1O95A 3PSVA 4IXHA 4O13A 5LNRA 1XDLA 4UC5A 2EPHA 2IQTA 2QCMA 3C2OA 5AN7A 1XBVA 1SPQA 5AHEA 3O07A 1ZJIA 5F1UA 5U7SA 3DFQA 4HNNA 3NQCA 1X6UA 5BRBA 3QPYA 1NF0A 2QKFA 2Y7GA 2E09A 1VGAA 3NL5A 3TSBA 1TCDA 1TPC1 1H7XA 3GDLA 3NVTA 4NJKA 3LBCA 1MXSA 1LM1A 3PF3A 1GTHA 2QAFA 3BLEA 1SW3A 4OE7A 3CT7A 5FEZA 3PVFA 3W71A 1KLZA 3NNTA 1QCWA 1C8VA 3NDOA 4HKPA 2O7SA 3HOJA 1OABA 1VYPX 4ZQOA 1UBSA 1IXPA 1WAUA 3R2GA 3CLMA 3L2IA 1ZHAA 1LCOA 1GTEA 1YDNA 4QAIA 5BOOA 1DORA 5KZDA 4WXZA 2YR1A 2WPBA 3YPIA 2DZVA 4Z1BA 1Q3NA 4UMBA 5BNKA 1JCNA 3LTPA 2YX0A 5K3VA 1X1ZA 1HO4A 1XFBA 3ZFHA 4YXGA 1K7FA 4ADTA 4ZZ9A 1MEIA 1EWEA 2R94A 1JUBA 5D2WA 3W9ZA 5DCDA 2ZFAA 3LHVA 2JGQA 3STGA 4ZQCA 3LRMA 3W1AA 4AAJA 3H54A 1VLIA 3DBPA 1A5AA 1TPWA 2F84A 2FPTA 2ALDA 3C2EA 2NUWA 2WQPA 2RKXA 2J88A 2R14A 1C9DA 2FB3A 5H2ZA 1W56A 4JICA 1TPH1 3TROA 1LOQA 3LLFA 3DFNA 1H7NA 3T7VA 1SFJA 3E49A 3KXQA 5BMWA 2Z6IA 4UFLA 3P60A 3SW6A 3TKFA 5FF0A 1OK4A 2V82A 3EB2A 4O10A 4ORIA 3B04A 1KFKA 3F4NA 1FXPA 1KM2A 2B7OA 5DCEA 1IXOA 4K36A 1EP1A 3GDMA 3OA3A 3SSJA 3W7MA 5G2WA 1XM3A 3FIGA 2J9XA 3L21A 3TE9A 3LDVA 5F1VA 4KFOA 5CPLA 3MP3A 3WFAA 1G7VA 1ME9A 2A7PA 2KZHA 1N8FA 4WXYA 1KM6A 1B4EA 2ZRXA 3P61A 3GDKA 3TFXA 4DXVA 4G1KA 3LBMA 3TK7A 3KVJA 1ZNNA 3HG2A 3TC7A 2G97A 1DJNA 4GWEA 3M44A 1T96A 5AHMA 4XQ6A 3HG4A 3VKJA 2GJNA 4N9EA 5KTLA 3EKLA 1CX9A 5F2MA 3L0KA 4Z08A 1P1XA 4O17A 3GNDA 2YGYA 3K30A 4RX0A 2DJLA 4S2CA 3H53A 2ZZ4A 1LORA 3MMTA 4Y8FA 1TJPA 5LGXA 2ZZ5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4W7W A;  2VHL A;  5KIN A;  4JBR A;  1S2A A;  4MPK A;  1CEC A;  2VFD A;  4BK9 A;  2FGB A;  3G8E A;  4OIF A;  2VC9 A;  1W5Q A;  3WJY A;  5HNN A;  5M2F X;  4R88 A;  3ARS A;  4F2U A;  3AMD A;  1M5W A;  2NLY A;  1F6K A;  4TTG A;  3RO6 A;  3LMY A;  2I1O A;  3QJA A;  3UPM A;  3CC1 A;  3WH7 A;  1HVX A;  1XLD A;  2V5B A;  3T6C A;  4UTW C;  3RCN A;  3UA3 A;  1JZ7 A;  1ZBV A;  4DX3 A;  4GO9 A;  1IR2 A;  4J3Z A;  3E5B A;  2DEP A;  1TCM A;  1OFD A;  4NYU A;  3WF0 A;  2WZT A;  1MEH A;  4O1F A;  4C1K A;  4YTU A;  4C6J A;  3UND A;  4LJ3 A;  2F6X A;  3HJZ A;  3ELF A;  1SZN A;  2YL9 A;  1YDY A;  4A3H A;  3SZ8 A;  1WCG A;  1S1P A;  2B7Q A;  2VGG A;  2WHL A;  2PU1 A;  1KFL A;  3C0J A;  3WNK A;  2JKP A;  4IFK A;  2ZDS A;  3PZI A;  3ZJ8 A;  2VXN A;  3VX1 A;  5C5Y A;  5IOB A;  1UZH A;  3TOP A;  3KOW A;  4ZXO A;  3SN1 A;  3CWN A;  1YE4 A;  3A13 A;  2J7E A;  3CH0 A;  3S6O A;  1KTC A;  1QOQ A;  5D9O A;  1TEL A;  2DT3 A;  3BDK A;  4XTD A;  4RPP A;  1W1B 1;  3UZJ A;  1XQL A;  3RX4 A;  2OPJ A;  5H1W A;  4DWS B;  1W91 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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