2NUYA

2-keto-3-deoxygluconate aldolase from sulfolobus acidocaldarius in complex with pyruvate
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
288
structure length
288
Chain Sequence
MEIISPIITPFDKQGKVNVDALKTHAKNLLEKGIDAIFVNGTTGLGPALSKDEKRQNLNALYDVTHKLIFQVGSLNLNDVMELVKFSNEMDILGVSSHSPYYFPRLPEKFLAKYYEEIARISSHSLYIYNYPAATGYDIPPSILKSLPVKGIKDTNQDLAHSLEYKLNLPGVKVYNGSNTLIYYSLLSLDGVVASFTNFIPEVIVKQRDLIKQGKLDDALRLQELINRLADILRKYGSISAIYVLVNEFQGYDVGYPRPPIFPLTDEEALSLKREIEPLKRKIQELVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural exploration of the catalytic capacity of Sulfolobus KDG aldolases
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-keto-3-deoxygluconate/2-keto-3-deoxy-6-phospho gluconate a
molecule tags Lyase
source organism Sulfolobus acidocaldarius dsm 639
total genus 115
structure length 288
sequence length 288
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.55: 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate/2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate
pdb deposition date 2006-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2nuyA00
1SW7A 1N55A 4MLJA 3P82A 5LGXA 4UTTA 3Q94A 4LVDA 2VEMA 1TPEA 2O7QA 4HNTA 4BK9A 2X1SA 4LRSA 1H60A 4A2SA 3O6CA 3OIXA 3IVUA 3T4CA 3LB0A 3UY8A 1D9EA 1XDMA 3BLFA 4NZFA 4O57A 3OVPA 3C3NA 1QMLA 3G22A 2DU2A 2YR1A 3INPA 3LHZA 1SO5A 1ONRA 3NL2A 2BTMA 3T7VA 1TRDA 4DBEA 3BK0A 2XFWA 4O11A 1G69A 3W2UA 3S6DA 2ISSA 1WAUA 3NXFA 3PSVA 1FCVA 3C6CA 4N4PA 1WYIA 1TPB1 5G1TA 3M6YA 4LU0A 4K37A 1ALDA 3B4UA 3QM3A 2JKEA 3DKLA 4JY9A 4AHQA 2BWGA 3MJYA 4LC8A 4DEFA 4KFPA 1K02A 1XC4A 3DBPA 3EWXA 1HUVA 4LTSA 2JGQA 3W7NA 3QEZA 5K4XA 4IMEA 3CHVA 4R33A 4TMBA 4QSHA 3CT7A 3CEPA 2AGKA 3GR8A 1GZGA 3QFEA 4JIPA 3UXAA 3WJSA 3H53A 3TDFA 3HOJA 4IPJA 4XBSA 5DXXA 5F2IA 3L0NA 4WOQA 1JCLA 5FF4A 5E93A 1LOLA 4RR4A 1DVJA 4YLWA 5SWUA 4UTLA 5K9XA 3IIVA 3MI3A 3NZ1A 5KZMA 3M41A 5C55A 3LHVA 1OG0A 3DXIA 4N9CA 5D33A 5D30A 4BI6A 5AYYA 2OT1A 2NZLA 3L66A 1FWNA 4E2BA 1VS1A 2Y70A 3OVRA 3QZEA 4MYXA 4ONVA 1S5VA 4OBTA 3CWNA 3W7MA 2NWRA 3UZJA 3W1XA 2VEKA 2A85A 2B0MA 2PRHA 1P0NA 4JTJA 3R2GA 3EXTA 5KITA 3E12A 5E0KA 2ZBTA 2RKXA 3ABQA 3GX9A 4K8HA 1B9BA 1MEIA 1PS9A 4O4VA 3C2EA 3S5ZA 1MZHA 2H3DA 3IIOA 2EGZA 3TJXA 1NF7A 5BOOA 1H5YA 1OX5A 5D2XA 1OJXA 3W72A 3HB9A 1W56A 2VELA 5BMXA 1K8YA 5KZDA 3IGXA 3CQ0A 3C61A 4IXHA 1LOQA 3CTLA 1GYLA 3UQNA 4I7VA 2FDSA 4O1AA 4BF9A 1W3NA 3WJXA 3MO7A 1W5PA 1EX5A 1OFQA 5AHLA 3M47A 2D73A 1I4NA 1XBYA 3IIZA 3KVMA 3DGRA 3LXCA 3W1LA 3C8FA 3W2KA 4CLMA 1I2OA 1WV2A 1W3IA 4ZL1A 4JNMA 4PCFA 1JUKA 5AFDA 5EMUA 2VFDA 5E1QA 3PG8A 4IOTA 3NQEA 5G5IA 5D2VA 3L21A 3TQ0A 3RF9A 2WOQA 3GXTA 3D0CA 4NZJA 4HNNA 4L4LA 1DJQA 2ALDA 3N2XA 3NL6A 2V2HA 2GVGA 4QJ1A 3DFPA 1H63A 3CPRA 4X22A 3I6RA 3EXRA 1G7UA 3VE7A 3QMTA 1JCNA 4EWND 4XKYA 1LCOA 2WSQA 3NQMA 4AVFA 4Z1CA 3OVQA 3P84A 3W1AA 1BWKA 2G95A 2R94A 1HG3A 1ML1A 3VFLA 2DZTA 2GVJA 1EA0A 4O10A 4JN6A 3K30A 3R12A 1Q6RA 5LNVA 3CIWA 3EWUA 4E0CA 4N9BA 6TIMA 1FX6A 1QDSA 4CCCA 1UUOA 5K3VA 3C2RA 1ICSA 5FEXA 4E2DA 3M5ZA 2QCFA 4MFEA 1ME9A 1JCMP 4M7TA 3PUEA 2AQWA 1IXOA 3W83A 1RQHA 3NA8A 3S5OA 4K6AA 1YXYA 1QAPA 1EWEA 1OFAA 3I65A 5F2LA 1FXQA 2C13A 3WJZA 4IX2A 6ALDA 5IBXA 2NV2A 2Y7DA 4ZQRA 4NJHA 3VKJA 3MYPA 5D38A 4AMAA 3ABRA 1SW0A 2QCCA 4QAIA 5LNSA 2QCGA 2ZCGA 4K8EA 3NQDA 3NG3A 3ZS4A 3WK2A 3LERA 1LTDA 2C19A 1R2RA 4KFOA 4O19A 5F1VA 2V9DA 1XCFA 4I9AA 5U4NA 5AN7A 3LTPA 4O16A 4UNLA 1VR6A 4O1DA 1F76A 1PCWA 2CWNA 5K7JA 1E51A 2C0AA 3Q2DA 3PBYA 1EUNA 4BI5A 2B7NA 2OMAA 4LV9A 3FJLA 3SR7A 2RDTA 2G96A 3SI9A 3P60A 4MY1A 1VGAA 4N9EA 5HJLA 4YMZA 5K4ZA 4IMGA 3LTYA 4R34A 3L68A 5FESA 4UFJA 4O12A 4I7UA 4UFKA 1FCUA 2PRLA 3LHUA 3BPWA 3E9AA 1OX4B 3KXQA 2OX1A 3TAKA 1G4TA 4HNVA 4JIQA 2ZZ5A 4JTFA 3LXBA 5FEPA 4LRTA 4LT9A 1VHCA 2O7SA 5HNRA 5F2GA 3QSTA 3O8AA 3FEMA 3OHIA 4DO6A 1KM4A 3T78A 2GJLA 4CNPA 2QCHA 1W8SA 3N9SA 3R8RA 1QWGA 3GDKA 1B4EA 3PY2A 3RLVA 1KM1A 2J6XA 3W71A 2EAWA 3M5VA 4IGHA 5F4WA 3B05A 4N6FA 4IUOA 2XN1A 3NPVA 4GWEA 4A21A 2C6QA 4HNUA 2JKPA 3C2FA 3LCIA 4OU1A 3KVKA 3DZ1A 1YADA 4A29A 2ZA3A 2X1RA 3TCEA 3TU9A 1EUAA 4LNYA 2TYSA 3SJ3A 3NL5A 4O28A 3LLDA 3FYPA 1MSSA 4UUIA 5C2XA 4JTHA 4UFIA 4UTHA 3G1FA 2WQPA 2ZRWA 3B04A 3M5YA 1TQXA 2ZRXA 3H55A 1H7XA 1PV8A 3KVJA 2Z6IA 4DPPA 5HQEA 3PBVA 2FFCA 1OF8A 4RXGA 3SFKA 2Y88A 5AHFA 2P10A 3EKZA 3A24A 5DN1A 2DJLA 1PCKA 3DFQA 4AF0B 1NF0A 2JBMA 1XBVA 1ME7A 1GTHA 1TO3A 1JVNA 3N3MA 5LGZA 1GG1A 2DZWA 1DKWA 3VE9A 1OFEA 4RJEA 2CLLA 1K7FA 4HHPA 1JULA 1NFBA 4RK8A 4XTIA 5FF2A 4POCA 3B06A 4ZZ9A 1H7NA 4DQWA 4FNPA 1TPDA 3W7PA 3EX3A 3KAOA 4EIVA 4XWUA 2H8XA 1ZAJA 2A0NA 4HPXA 1CW2A 2FPVA 4AHPA 1QO2A 4NXSA 2VFFA 5BNKA 1OF6A 1DL3A 2Y7GA 1EP1A 3MP3A 2ZRUA 2QCMA 3Q58A 3G1HA 1WDWA 3BW2A 4LS2A 1LOSA 3UXDA 4HIBA 2WSRA 2YGYA 4DELA 3STCA 5CPMA 3ZWSA 4TIMA 3TX9A 5CPLA 3EXSA 1FCBA 1KTCA 4NXKA 4RXFA 4ZQNA 3SW6A 4OV9A 5G4EA 3HF3A 5AHEA 5KMYA 2H6RA 3MUXA 3EX4A 1TREA 4TX9A 1WBHA 3UWZA 5HUPA 5C5YA 4JICA 1DBTA 1XUUA 3HGJA 2YX0A 5EYWA 4OGZA 3O1NA 1ICQA 3BW4A 4N9DA 5D02A 3F4NA 1D3GA 2A2IA 4TU1A 1X1OA 2VENA 3MBFA 3GLCA 2NUXA 3IVSA 3B0VC 2V82A 3IVTA 3EWYA 4EOUA 1RQBA 3U8GA 1C9DA 2QJGA 2LLEA 3I68A 3F4WA 4WUIA 3BVJA 1VLIA 4FNQA 3M43A 2XN0A 3UNDA 2NX1A 4AWTA 2QJHA 5F1UA 2V8ZA 2QEZA 1X1ZA 3CC1A 1NVMA 1TJPA 4B5NA 3EX6A 4JD4A 4JTGA 4RZ4A 1TPWA 3W70A 3PB0A 2VXNA 2C18A 4ML9A 3LCHA 3MP4A 4WX2A 1I2QA 1GYNA 1O94A 2WSYA 4ORIA 3W2JA 2Q3OA 4D2JA 4OV4A 3LI1A 1ADOA 1A5AA 1KFCA 2WV8A 1LYXA 3NQ8A 5F2MA 3L65A 1GTEA 3UPBA 1ZY9A 5KINA 4HPJA 1W3TA 1K7XA 4N2YA 5CPOA 2E6AA 2YW4A 3U6WA 1G7VA 5CPNA 1JCYA 2TSYA 2E5CA 1TV7A 3ZR4A 4WZHA 3WK1A 5K9CA 3SGZA 4KKXA 3W2NA 1M7OA 3EWWA 1O5KA 1SUXA 4Z1DA 1VZWA 1SU5A 4M6QA 1F73A 3L0KA 5K9DA 1R47A 3RNDA 2F7FA 3W76A 3ABSA 3NQFA 1SZFA 3GAKA 4C1LA 4Y96A 1VYSX 2QDGA 4TR9A 5LZLA 5HWJA 2A21A 1RV8A 3P5ZA 4AEOA 3CWOX 3LGEA 1CX9A 4MIMA 5H91A 1KBJA 3FJ6A 4O18A 2ZYFA 3O06A 1F74A 2E5BA 5C54A 4MZYA 3W7HA 1OX4A 3KRZA 1UJPA 4R53A 4MJMA 3NM3A 3EX2A 1GOXA 1FWWA 5FF7A 3SECA 1H7OA 1PVNA 2ZQ0A 2WNNA 4WY0F 3PUDA 2A4AA 1GT8A 3S1XA 4LVGA 1OK4A 4QM1A 4UTIA 2AAMA 3MMTA 5CZSA 5D2TA 3LLFA 3FLUA 1JUBA 1SFJA 2WJZA 4OT7A 2GOUA 3N34A 3IEBA 2GQ8A 2GUUA 4K36A 5L9FA 4ADSA 4ALDA 1QOPA 4PC8A 4GJ1A 4M7SA 1OYBA 4GUGA 2V5BA 1XDLA 3HG5A 3RU6A 2Y6ZA 2VOMA 5J5DA 3F1QA 3SY5A 3EB2A 1F6PA 5EL1A 1JUEA 2QUTA 2E6FA 1G67A 3W7QA 2FPTA 1SZEA 4FIQA 3UWVA 3GAYA 4UMCA 2YDAA 4DF0A 1IGSA 2DZUA 2J9XA 1GVOA 3VCRA 3E49A 5D04C 1GPWA 2I1OA 1LM1A 2CLMA 3LCFA 4AF0A 5CZ0A 3P67A 5U7SA 2Y61A 3ATYA 3T44A 4DO4A 3NQAA 3V75A 3HPZA 3QC3A 4FX8A 2E1DA 1ZENA 1TQJA 3LOTA 1P4CA 2KZHA 4LS0A 4FX6M 1YTDA 4YWIA 5EKYA 3DHFA 3HMJG 4GUFA 3M5XA 1LDCA 1I45A 3SSJA 1OFOA 3FA5A 4IWWA 1W0MA 1RZMA 2RDWA 4JXCA 2NXHA 4FHAA 4MUZA 1FWSA 1R2TA 3IIXA 2ATMA 1KTBA 2C3ZA 3W7DA 1H7PA 4JY8A 2YSWA 2E6DA 4LS1A 4UTKA 3G0XA 4UFHA 1R2SA 3LRLA 3G0UA 2P0OA 4HT3A 3LHTA 2YW3A 4GNJA 2JKAA 3R89A 2CLOA 2NLIA 1OFRA 3HGOA 3G0SA 1ZALA 2TRSA 3QSRA 3TIMA 1DQXA 3O15A 1H61A 4JTUA 1YXCA 1LORA 2CZDA 3NPWA 3W2MA 1KTNA 1W54A 3M16A 4PEKA 3G3DA 1W5MA 3TJLA 3W1QA 3OA3A 3E96A 1KLZA 1G4EA 2DORA 1TPC1 1TSIA 2QCEA 2ZZ7A 4JX6A 1KFKA 4C1KA 5D32A 1S3HA 2A6LA 3IRDA 4BR1A 5K2ZA 3G18A 4JR5A 2TMDA 1I2PA 1GWJA 3C4UA 3CEUA 3E02A 3O05A 3W75A 2V5LA 2R8WA 4FXRA 3ZWTA 3P61A 1WA3A 1W1ZA 1B4KA 2EKCA 1F5ZA 3P80A 2C15A 4QITA 3THQA 1DORA 3A5VA 3BGGA 1AMKA 4MFDA 4ADTA 2QAPA 2YFNA 5FF3A 3TAOA 4JDYA 1TCDA 3PBUA 2YCEA 1LLZA 1L6WA 4JTIA 4XZ9A 3E0IA 3W84A 4NX5A 1LRTA 3W7CA 5IBXC 3ELFA 1XI3A 1ZCOA 2VFHA 3NO5A 4FO4A 2C1HA 3QPZA 4EVZA 2QJIA 3GDMA 2VEIA 3DFSA 2QDHA 4LC6A 3BO9A 3TH6A 3TSDA 2DZXA 4L4MA 3DI1A 3R5EA 3U2OA 2W6RA 3NQ6A 1MXSA 3A9IA 4PA8A 1PHWA 2H8ZA 4W9TA 4NU7A 4ZQPA 2BX7A 3V1PA 4DO5A 3W6YA 2ABAA 2OJPA 3PWAA 1SO4A 3KVLA 3O16A 2ISVA 4RCXA 5G2HA 3EKLA 2EHHA 5HULA 5I3IA 1QOQA 4AWUA 1QR7A 3BARA 4ZMGA 1PIIA 1WOAA 3QQ0A 2C16A 4JX4A 1K3UA 1LBFA 2X16A 5DY2A 4UTMA 5I3FA 3DU0A 4UTWC 1AW5A 3G1VA 5DY3A 2QKFA 2PRMA 3CIXA 4YXGA 1LROA 3W7GA 3C2OA 8TIMA 1F6KA 3LHWA 1K8XA 5LHFA 1T99A 2FQIA 3JS3A 3UZ5A 3N73A 4GRSA 1C8VA 1X6UA 4QNWA 5MHBA 1TIMA 3MHFA 1W5QA 1LP6A 1UCWA 3RK8A 4UTWA 3STGA 2ZZ6A 1EP2A 3VI2A 3IGUA 1N7KA 1KM6A 2BSLA 2ISWA 2NX9A 4MZ8A 5HR7A 3UWYA 3GNNA 3W7OA 1W5OA 3FFSA 4U28A 3NOEA 2E5DA 4FEZA 5AHNA 4OQVA 1YXDA 3TFCA 5D2YA 4QNEA 1IIGA 1O4UA 3P81A 4MJZA 5HMSA 3W74A 2NUWA 1LRQA 3O6YX 4LWWA 2QUUA 3A23A 3MBDA 3TNOA 4YCPA 1XBXA 3LX9A 1YPIA 1J5TA 2Z2UA 1FWTA 1PL9A 1ZJIA 5EPDA 2FTPA 1M6JA 4QISA 1H1YA 3MWAA 2NV1A 1T0OA 3KRSA 2ABBA 1KLYA 3QMRA 2J27A 3NL3A 3LCGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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