4P61A

Chicken triosephosphate isomerase with loop6 mutations, v167p and w168e.
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
246
structure length
243
Chain Sequence
PRKFFVGGNWKMNGDKKSLGELIHTLNGAKLSADTEVVCGAPSIYLDFARQKLDAKIGVAAQNCYKVPKGAFTGEISPAMIKDIGAAWVILGHSERRHVFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKAIADNVKDWSKVVLAYEPPEAIGTATPQQAQEVHEKLRGWLKSHVSDAVAQSTRIIYGGSVTGGNCKELASQHDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Gallus gallus
publication title Enzyme architecture: the effect of replacement and deletion mutations of loop 6 on catalysis by triosephosphate isomerase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
total genus 89
structure length 243
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4p61A00
1KLYA 4JY9A 3NQVA 3WJSA 4O14A 1ZFJA 4MFEA 1THFD 4FNRA 3W7KA 1KBIA 1LOSA 3C52A 3MMTA 3I65A 1Z48A 3A5FA 2H8XA 3BK0A 5FEXA 3O07A 3QM3A 1XKYA 3HGRA 2W79A 3LRLA 2CZEA 2QCFA 5AC7A 4NVTA 3EWYA 5CZ0A 1DQXA 3W76A 5HUPA 1W5NA 1SZFA 1LDCA 5CPNA 3C61A 4MY8A 3LBMA 3F03K 4FNTA 3KVLA 1FBAA 3L0KA 4NXKA 3RLVA 2CLHA 1SU5A 4ZQCA 4O17A 4LVGA 1LLWA 1JUBA 2ZZ5A 3DFNA 3G1DA 5DY2A 2EGZA 3NM3A 4KFNA 4ADTA 4AAJA 1H1ZA 3DGRA 1TPFA 5I3JA 1GTEA 4AWSA 1YPIA 3BW3A 4K6AA 2V81A 2GQ9A 4N9BA 3RMJA 1F6KA 3C8FA 1BWLA 3G1XA 5AB3A 1F73A 4P61A 4WX2A 1EUAA 2CZ5A 4M6VA 1O60A 5DLCA 4Z1AA 3IRDA 3NQCA 5E0KA 2QKFA 3TJXA 3W88A 1G67A 1P0KA 3PB0A 3IV3A 4J9JA 4EVZA 4LC8A 3LCLA 1TIMA 1QMLA 3VFLA 3CU2A 4AVFA 4MVAA 1PE1A 3DKJA 1TV8A 4HNVA 3BO9A 3THAA 3KHJA 3RF9A 2G97A 4UFKA 3NL5A 4FHAA 2YFOA 3JR2A 1EP2A 5FI8A 3G3DA 4XKYA 1A50A 3QH2A 4GXMA 4IOTA 3W7HA 1UCWA 5CZSA 4KFOA 4ZQMA 2QCEA 5CKSA 1HUVA 4JIQA 4LRSA 5AHFA 5AC8A 2E6AA 1G7VA 2BWGA 1DL3A 2RKXA 3W6YA 4LVDA 1O95A 3RK8A 3W7QA 4OWGA 1WXJA 1NF0A 2A7NA 3TXZA 3W1NA 3W70A 3CHVA 4RK8A 2A21A 4E38A 1D9EA 2C16A 4N4QA 2YGYA 4EF8A 4GJ1A 1GTHA 1L9WA 3DKLA 2JBMA 3PVFA 4XKYB 5DXYA 4H6KA 3NG3A 4UNLA 2V8ZA 1Q45A 3SGZA 2DORA 2CLEA 1I2PA 3TAKA 4UR7A 2B7QA 3L2IA 1X1OA 3T55A 2E6FA 3NQ2A 3NPVA 1VGAA 1D3GA 5KITA 2Y88A 2VFHA 3FYPA 2ZTJA 1W3TA 2EKCA 3QW3A 3IIPA 3KX6A 2QCCA 1EA0A 4JTHA 3FS2A 2YZRA 1H7WA 3E9AA 4ZQOA 3UWWA 1J2WA 3CWNA 3NQ6A 4DEFA 5AOUA 1HL2A 1HFBA 4O4VA 2QJIA 5HUOA 4WXYA 1TRIA 1SO4A 2ATMA 2X1TA 1KM0A 4JDYA 3MJYA 3T44A 4ML9A 1TTJA 2XN0A 3TDFA 3LV5A 3GDRA 3PS7A 1X6UA 4O28A 4B5NA 3TQ0A 1WX0A 4DO6A 3TQKA 1AW1A 1OF6A 2DJLA 4ZMGA 3NL6A 2NX1A 2VFGA 4Y9AA 1IXOA 1ZNNA 2OX1A 1JCLA 4S1FA 3TC6A 3OHIA 1ME8A 2OJPA 5F2GA 2V5LA 3S9YA 2JGQA 4OT7A 2Y89A 1SZGA 1V5XA 3UD6A 4X22A 4D2JA 4IQLA 3BLEA 4ALDA 2FPTA 3A24A 4OGZA 2CW6A 4ORIA 3MI6A 3CPRA 3LHYA 3O8AA 5K7JA 5AC6A 2NWRA 1VHNA 3N14A 1NAL1 3C2VA 3M5YA 1KFKA 2VFDA 5EYWA 4AF0A 2QF7A 3TFCA 3PUOA 1F05A 3LGEA 3SZ8A 4FXSA 4LS2A 4HIBA 1R46A 3EX4A 3P80A 4JEQA 1F76A 2QAFA 3MP5A 3NL3A 5LNUA 1ZY9A 2GOUA 1I8JA 1QPRA 1W5MA 3WJWA 1FWNA 2QCLA 1OFBA 3HIJA 3H54A 4NZJA 4BK9A 5L9FA 2J24A 3ZS4A 4FNSA 3GVGA 4AF0B 3LCFA 4QIUA 1K7FA 5K4ZA 2GUUA 1KFLA 1GJPA 4AHPA 2CFFA 2GVGA 3LTYA 4JTUA 3M5VA 1NF7A 3W7MA 1TRDA 4ZL1A 4A2SA 5D2VA 5HNRA 1Q6QA 4BR1A 3GDMA 3TMQA 3F4WA 2LLEA 4TU1A 1RV8A 1K03A 3DH7A 5D04C 4N9CA 1KTNA 1XBYA 3IGXA 3W87A 2ZZ4A 4Q33A 3DAQA 3WJYA 1YXDA 1R2TA 1LBMA 4XQ6A 5K2ZA 2A7PA 2WO5A 1T96A 3DHFA 5DCDA 3SGUA 1W1ZA 4RCXA 3GAKA 4CNPA 1N8FA 5HJLA 3W1MA 4GUJA 1EIXA 1GG0A 4K8HA 3M43A 2BXVA 4LY8A 2WJZA 1I2OA 3LM7A 4PODA 3S6DA 3R2GA 4AB4A 3W86A 4JIPA 3AJXA 3HOJA 4UXDA 5C6MA 1CX9A 1H7RA 1H5YA 3S5YA 3MHFA 3B4UA 4EOUA 1H62A 1KV5A 4Z1CA 4GE8A 2B0MA 1W31A 4POCA 3DHDA 5TBOA 3S5OA 2OT1A 4NNCA 1WQ5A 3LLFA 3LCWA 3QEZA 1B57A 3WK1A 4G1KA 3G22A 4HN4A 3IVSA 3C2EA 4M6PA 4NJGA 3USBA 1OVDA 2VEMA 4A22A 3VE7A 3BVJA 4EWND 3W7NA 1FDJA 3G1FA 1GOXA 4AMAA 1VR6A 2E77A 3T4CA 3LB0A 1YLVA 5U7SA 3GZ3A 2XFWA 1AL7A 1VCGA 2RH9A 2I1OA 4A21A 2NX3A 2QJGA 3T78A 3W23A 3DBPA 1DBTA 4NQ1A 3L0NA 4MIMA 3YPIA 1KM1A 5I3HA 4OHQA 2RDWA 1VZWA 3TCEA 3QSTA 2NXGA 4MFDA 2C19A 4JTLA 3MBDA 4XBKA 3NZ1A 4LRTA 2E6DA 3EXSA 3EKZA 2OMAA 4CQAA 4MLRA 2AGKA 3FKRA 3NQ8A 1L6YA 1FQ0A 3OG3A 3FJ6A 3LHVA 3V1PA 3THQA 2ZQ0A 1M5WA 4MYXA 3A22A 1GT8A 5K4XA 1KTBA 3KFTA 1MEWA 3W1XA 3CEPA 3NQDA 3QSRA 3TSMA 1SPQA 2ZRUA 1AW5A 4UFLA 4IMCA 3TW6A 1XCFA 4WOQA 4I9AA 2VFEA 1EP1A 1I4NA 3Q2DA 3S1UA 3W7GA 1H60A 5CGQA 1SFJA 1HO4A 1UASA 1JCMP 4FIRA 3P5ZA 1SW7A 3PF3A 3TA6A 4UFJA 1IIHA 2CU0A 5D2WA 5H2ZA 4IMFA 3STEA 2B7PA 2A0NA 2Z6JA 1VJIA 3CT7A 3PY2A 2Z1BA 1E51A 3KAOA 1XDLA 3ANYA 4O8RA 4LT9A 4X3ZA 2NUYA 2RDUA 4ADUA 4LTSA 3L9CA 3O6YX 3W2UA 4DF1A 3LV6A 1I2QA 4BI5A 3GR8A 4XTIA 4KWVA 3GDKA 3MW7A 4NJJA 4ICNA 2E5BA 2EHHA 1PS9A 4C1KA 3CQ0A 2BTMA 3BG3A 4JN6A 1H7OA 1X8FA 2BSLA 4JS3A 3LERA 2ZZ6A 2QCGA 3B8DA 1AL8A 2G95A 3NPUA 5CZTA 4FX7A 6TIMA 1R30A 4CLMA 2XN2A 4RKAA 1WBJA 3H53A 3C56A 1AG1O 8TIMA 3WJZA 2YCEA 2FDSA 4IJBA 4O52A 3W83A 1VS1A 3TAOA 2C0AA 3LXAA 1GVOA 1DORA 1WV2A 2Y62A 1OK6A 3M5XA 4U4MA 5F1VA 4QAIA 1WYIA 3NA8A 3NDOA 4FB7A 1UUOA 3HG2A 3P8JA 4N9EA 1LRQA 1J5TA 3Q94A 1VLWA 1XXXA 1F5ZA 4I7WA 1F2JA 4FNUA 1JCJA 3OIXA 5IBXC 5BOOA 1W8SA 3W7OA 1OHLA 3CEUA 4ZQPA 1LZOA 2AQWA 3UPBA 2QUVA 4PA8A 1W5OA 2CLKA 3A9IA 1R47A 1VYSX 2QCDA 4K38A 1TSIA 1F7BA 3ABRA 4P2VA 4RJEA 5CSSA 1H1YA 5K3VA 4E2BA 2NLIA 3TV8A 4NZFA 4N9DA 5C2XA 3F1QA 3EKLA 1OYBA 1QR7A 1WDWA 3FJLA 4FNPA 2JKEA 3MI3A 3OVPA 4X9SA 3OA3A 2A7RA 3SECA 3TH6A 1OFDA 1RVGA 1O4UA 2W0UA 4K36A 1QPNA 3P5YA 2ZRVA 2QCDB 3R89A 3N34A 3PUEA 3PM6A 1WAUA 3FYOA 4YCPA 1ONRA 3SJ3A 4ADSA 1MEIA 4QITA 4MUZA 4UUIA 2YFNA 2EF9A 3N9RA 1AK5A 1YDVA 4BWLA 2PE4A 4MKNA 3W22A 3RNDA 1HO1A 3B0PA 3S42A 1OYAA 1VHCA 4MY1A 4NJHA 3I7QA 3QQ1A 2HTMA 2QR6A 3W7JA 4AHOA 4QSHA 4PFMA 1W3NA 3FKKA 3QPZA 2ZA1A 3DI1A 4PEKA 3W7CA 1ZJIA 4O15A 3RLUA 5C54A 3GKFA 2E09A 1TB3A 4HNTA 4NJKA 2Y6ZA 4R53A 3ABSA 1X1ZA 1OFRA 1GG1A 4GUFA 3EX1A 1DKWA 4OV4A 2YYUA 1UUMA 5KZDA 2V2CA 3QRHA 1Q3NA 2ABAA 1LYXA 2OZ0A 3E02A 3CC1A 5D30A 2WSRA 5HQEA 4NNAA 1A53A 1OX4B 3LX9A 4NUWA 3W1TA 2NZLA 2AAMA 3MHGA 2Y7FA 5G2IA 1FCUA 2Y7GA 2ZYFA 3VKJA 4JX4A 5CPLA 3IIVA 3PBWA 1TJRA 5AYZA 5F1UA 4XZ9A 2Z0IA 5LNRA 3G1HA 1QOQA 3N73A 2VEKA 4MZ8A 1M7OA 3RU6A 3LHTA 4UTWC 1KFBA 2IQTA 3OEXA 4XWUA 3VNDA 3DFOA 3QFEA 2NXIA 5LHEA 3ABQA 3LRMA 2ZA3A 3G1AA 3UNDA 3E96A 4ZQNA 4WUIA 2VXNA 2EAWA 3NPWA 1MO0A 4UC5A 2H90A 4ZVJA 3W73A 4WD0A 3LLDA 3MWAA 3NQFA 5H91A 3SR7A 1TO3A 5DXXA 4MY9A 5FF4A 4LS1A 3FFSA 4E2DA 1IIGA 2C15A 3F4NA 1KM6A 1OF8A 4LVFA 1H63A 4AXKA 3S5NA 1TREA 3G3MA 3GNNA 5E93A 2YX0A 3BLFA 5FEPA 2V82A 5D03A 3H55A 3HB9A 4UNKA 3W1AA 1TPB1 3K30A 3UWQA 2Q3OA 3SI9A 5ABTA 2ZRYA 1FCQA 2NV2A 1FUYA 4LC6A 2QJHA 4A2RA 1JR1A 4R33A 1BEUA 3M5ZA 3PSWA 1PHWA 4N6EA 5D05A 2DP3A 1LOQA 2RHGA 5LHFA 5FEWA 1KBJA 1QNVA 5D37A 1R2SA 2FPYA 5G5IA 2WNZA 5EMUA 2WNNA 4IUOA 4IGHA 2EPHA 1F6PA 1YXYA 4JICA 5T26A 5LSMA 1S3HA 4PCFA 4JTGA 2YW3A 3DU0A 5G4WA 1G4PA 3P74A 4FXRA 2G96A 4HT3A 3W7IA 4S2BA 3TSDA 2F84A 4YMZA 1YDOA 3W1QA 1SO5A 1VCFA 3GKAA 3TIMA 1RR2A 4RR4A 1KTCA 2YW4A 2VFFA 4MJZA 4UMBA 1G4TA 5HWNA 3LRKA 4ORMA 5CPOA 3TQVA 3ATYA 3KXQA 2Y70A 1XM3A 3ATZA 2P1FA 3A23A 1EB3A 4LNYA 4UFHA 3HJZA 1UBSA 4JTJA 5C55A 1KFJA 4I7VA 4RX0A 2Y63A 1ML1A 3W74A 5I3GA 4BI7A 2QUTA 5F4SA 1EEPA 4O57A 1TPWA 3L5AA 4O0KA 3NQMA 2GQAA 4HPXA 2FQIA 4QJ1A 1LP6A 1DV7A 3HGSA 4FX6M 1TPEA 1EX5A 3UYCA 1OK4A 3LCGA 3QF0A 3W1LA 4HKPA 1I2NA 1DVJA 2YSWA 5EA9A 4Z0JA 1A5SA 4Q32A 4U28A 1UJPA 4DBEA 2B7NA 5HWMA 5I3IA 1YTKA 3UWYA 4GBUA 5D2XA 5CZJA 1B4KA 1A5CA 2TYSA 4JDBA 2R94A 4GC4A 1XI3A 3DZ1A 3Q37A 5AHLA 3V75A 3WFAA 2E5CA 1BKSA 4JTSA 4IXHA 4LW7A 2O7QA 4DPQA 5EY5A 1VPXA 2E68A 5KZEA 3KRSA 3KOFA 1GYLA 2P10A 4QISA 3A5VA 2FFCA 3E12A 3CM4A 2HS8A 1TCDA 3QYQA 5AHIA 3OVQA 4NXSA 2OT0A 3IGUA 4WXZA 5FF2A 4QNWA 1C8VA 1W54A 5D32A 1ZALA 2ZRXA 1YXCA 5A5WA 2WPBA 4UTTC 4Z0SA 4HSOA 4IX2A 3BW4A 5HMSA 1XBXA 3GK0A 4OBTA 1SSGA 4IWWA 1FCVA 3S0CA 1JJKA 4DO4A 4CCDA 1Q6LA 2CZDA 3LXCA 3R8RA 3B03A 2ISWA 1O94A 3R12A 3R5EA 1ZHAA 3BW2A 1OFOA 3N3MA 4Y6GA 1SUXA 3W2MA 4O54A 3W85A 2VOMA 1H51A 3SFKA 3EX3A 1ZAJA 1WA3A 4TO8A 2P0OA 4UTUA 3PSVA 5D2YA 3GR7A 4O1DA 4JY8A 2GQ8A 4JTEA 3L21A 1C9DA 5AHEA 1A5BA 2PC4A 1TTIA 3TMLA 5SWUA 3MP4A 3QMRA 5KSWA 3I6RA 1FWRA 3W2JA 3M47A 3GXTA 3ABOA 5F2MA 1S5TA 3UXDA 1MXSA 2DZVA 4NJIA 1TMHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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