3ZR4A

Structural evidence for ammonia tunneling across the (beta-alpha)8 barrel of the imidazole glycerol phosphate synthase bienzyme complex
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
253
structure length
242
Chain Sequence
MLAKRIIACLDVKDGRVVGDPVELGKFYSEIGIDELVFLDITASVEKRKTMLELVEKVAEQIDIPFTVGGGIHDFETASELILRGADKVSINTAAVENPSLITQIAQTFGSQAVVVAIDAKRVDGEFMVFTYSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEILLTSIDRDGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIASGGAGKMEHFLEAFLAGADAALAASVFHFREIDVRELKEYLKKHGVNVRLEGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Thermotoga maritima
publication title Catalysis Uncoupling in a Glutamine Amidotransferase Bienzyme by Unblocking the Glutaminase Active Site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords IMIDAZOLE GLYCEROL PHOSPHATE SYNTHASE SUBUNIT HISF
total genus 80
structure length 242
sequence length 253
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 4.3.2.10: Imidazole glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2011-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3zr4A00
1F6KA 1U83A 1CW2A 4DO6A 3GNDA 1O94A 3WFAA 4HT3A 4XBKA 3HO8A 3SGUA 3PG9A 2BWGA 3O63A 5C2XA 3LTPA 3BGGA 4JY8A 1OYBA 1F05A 2CLKA 3QM3A 3LHZA 1K7FA 2PE4A 3LCLA 5T26A 3W85A 4NNCA 3BW2A 3TH6A 3CC1A 4JXCA 2B7QA 3C52A 1TPDA 4O19A 4UTWC 5U4NA 3S1VA 3DGRA 3TIMA 4UIOA 1D3HA 4PODA 3ATYA 4H6KA 3I7SA 3NQGA 3VE7A 2QCGA 4O0KA 4DBDA 4WY0B 1KFCA 1KFKA 1QO5A 3BV4A 4IJBA 3TW6A 3GAYA 2ZRUA 1VYSX 1TSIA 2TPSA 5KITA 5DCDA 4KFOA 4Z08A 4O57A 1W5QA 1A50A 4GE8A 4H4IA 1VHNA 3H54A 3IIOA 4O10A 4ALDA 2X1RA 3QPYA 1OK6A 4XKYB 1XBVA 1GT8A 4BFAA 2FFCA 5HINA 5LNUA 2VEMA 3STGA 2WSQA 1RVGA 5HJLA 1QNVA 3U6WA 3QF0A 3DBPA 5K4XA 3NQAA 1JUKA 1TQJA 5KZDA 3IGUA 3IVSA 3PSWA 2DORA 4DF2A 1H1YA 2QCCA 3HBLA 4C1KA 3UWUA 4IMFA 4JTSA 4JYFA 2BSLA 3W86A 1LBLA 2YW4A 2J9XA 4MIMA 3R89A 1WV2A 3DHFA 1PHWA 4HSOA 3MP5A 4LUIA 3FYOA 3LHUA 1G4EA 2HS6A 2E6FA 1OABA 1GWJA 3L5LA 2ZRZA 3NL2A 5HQEA 1O95A 1WOBA 1W0MA 4JIPA 3UY7A 1H60A 1LORA 1UB3A 2J24A 2D73A 1OX6A 4RXFA 3IIXA 1W37A 4O4WA 2ZZ7A 5G5IA 1Z44A 3BW4A 1KM6A 1GOXA 2VEIA 3B4UA 4A2SA 1G67A 3KHJA 1H7OA 1B4EA 3P7YA 5F2MA 1PHQA 4O54A 3GR8A 3IIPA 4FNSA 4AB4A 2BZNA 3KFTA 3GXTA 2WOQA 4LV9A 4AAJA 1YXCA 3EX2A 2WNNA 1ZENA 5SWUA 5K9XA 3GKFA 3HG4A 1TREA 4JTGA 2ZTKA 1ME8A 2C16A 2PRLA 1Z41A 2WNZA 5D2YA 1LOLA 3S0CA 1GVQA 2Q3RA 3LHTA 3R8RA 2VFEA 3DENA 3WJWA 2DZUA 1NVMA 1LCOA 2QCDB 4DBEA 1SZNA 2QCEA 1MSSA 2G5WA 3LTSA 4QNEA 4UFIA 3I7RA 3KRSA 3LI1A 3DFSA 4RJEA 4UFLA 4JIQA 3CWOX 1JCLA 7TIMA 2ZRVA 3TAKA 3UZJA 2WPBA 5IBXA 4UFMA 3DZ1A 3IRDA 3GIYA 3MWAA 4X2RA 5J5RA 3EWBX 4GUHA 3O8AA 4UC5A 1OYCA 3O07A 2QAFA 1D3GA 4ZZ9A 2HMCA 2B7NA 1HTIA 4DF1A 1YTKA 3NA8A 1EP2A 5LZLA 3W2JA 1KBIA 3TDFA 1L2UA 3B06A 4Y96A 3TSDA 5TIMA 2P10A 1OFAA 4FEZA 5LNVA 5AC8A 5ABTA 3P74A 3QPZA 5FF0A 1T8XA 4WD0A 4DXVA 3NL6A 3A9IA 3W7CA 4N9CA 5CSRA 2A5HA 4Y6GA 1SFLA 1AL8A 2GQAA 5G2HA 5G4WA 3LCGA 4GUGA 3KX6A 3FOKA 5K4ZA 1ZCOA 2BLEA 3KVJA 1LP6A 5BW6A 2Q3OA 1W54A 4JDYA 2CZFA 4CQAA 3M43A 3LDVA 3V1PA 1FCBA 1XL9A 4OV9A 1KLYA 1HG3A 5L6UA 3FJ6A 5EA9A 2C13A 4MOZA 3USBA 1FWTA 3GXNA 1RQBA 5IM51 1RZMA 3LHVA 4N4PA 3PULA 3E9AA 3LXBA 2WKJA 1ZAIA 4TMCA 5DXYA 3B04A 1NSJA 3O16A 1C29A 3GDKA 1YDOA 3M5VA 3W7LA 2HTMA 3ABQA 3UWVA 4Z1DA 3G24A 3LGEA 2R94A 5H2ZA 4MUZA 3S5OA 1HO4A 4Z1AA 4IX2A 3G1XA 3PWAA 3BK0A 3SW6A 2BXVA 3S5YA 1BTMA 2WV8A 1KFEA 4JY9A 5LHEA 4NUWA 1H1ZA 4L4LA 4FIQA 3TSBA 1KTNA 3HG5A 1TPWA 4JICA 4B5NA 1YXYA 3DFQA 3TV8A 5F1VA 3L67A 1IXNA 3W1PA 2E5DA 2TRSA 4XKYA 4X3ZA 3W1AA 1KW1A 3GDLA 4AEOA 3MUXA 1JVNA 1FXQA 1F6PA 3BLFA 1NF7A 5I3IA 1G7UA 4DF0A 3LM7A 2RHGA 4HHPA 1GJPA 3MHFA 2W6RA 3MI3A 1OVDA 4UMAA 1VCVA 4GRSA 3W2UA 3UZ5A 3E12A 2E1DA 3NQ8A 3PBWA 2X1UA 2CZDA 5G2WA 3WK0A 1LROA 4JTKA 4PL2A 3KRUA 2V8ZA 1VH7A 5D09A 3UQNA 1SO5A 3C8FA 2Y7FA 1OX4B 4LW7A 1RD5A 1F7BA 1PCKA 4MKNA 1LLZA 4I7WA 3QH2A 1FDYA 4GWEA 1H61A 2EHHA 4MLRA 3KAOA 4UTTA 3VCRA 3HB9A 4TX9A 1X1OA 2GQ8A 1R47A 3G8EA 3JS3A 1N8FA 4QSHA 1UUOA 4YL2A 4PA8A 1VYRA 1EWEA 3IIZA 3W7MA 3LCIA 4ZQMA 4AWSA 3UD6A 3DKLA 4UMBA 1OHLA 3M5ZA 3LCFA 4JEQA 5D37A 5H91A 4LUJA 3W1MA 1CI1A 1TTQA 4MZYA 1ME7A 3CHVA 4UTUA 3DH7A 2JK2A 3KXQA 3MI2A 3RU6A 1OFPA 4RX0A 2OT0A 1Q3NA 2EF9A 3EXSA 4GUFA 4MVAA 4PFMA 3TQ0A 4CCCA 4JX4A 3CM4A 2TMDA 3S5NA 3FYPA 3QMRA 4QJ1A 4ZQOA 2GUUA 2R8WA 2CFFA 1ZY9A 1DL3A 3N2XA 1L6WA 2QCDA 5LGZA 4Y8FA 1FWWA 1F2JA 2V5BA 2YDAA 2J6XA 1YDVA 2HSAA 3SI9A 2V0TA 3EXRA 4GNJA 2QJHA 1ZAJA 5FF7A 2X1TA 2P0OA 4UR8A 4BK9A 3R12A 4DO4A 4ZQNA 4E0CA 4YLWA 3P8IA 3S42A 1TV8A 4CQ8A 1EA0A 3HF3A 1SR9A 1TTPA 5CZ0A 1OG0A 1YPIA 3EWWA 4NZJA 4PC8A 3TK7A 2EKCA 4HNVA 4O0ZA 1LM1A 3M5XA 4UTTC 2QJGA 3W7QA 5G4EA 5AHFA 3PAJA 1OFQA 3QJAA 4M5PA 4FNPA 5K2ZA 4ADTA 3TQVA 4JYEA 1X6UA 4HNTA 4O4VA 2R14A 3F4NA 1JRBA 3PBVA 1FCVA 3R5EA 4JTIA 3W72A 2VFGA 3QW3A 5E1QA 4U4MA 5FF4A 5I3GA 1I2PA 4MZ8A 3IGXA 3T44A 1JCMP 3MJYA 4TO8A 3QFEA 1TPFA 2V82A 3DFTA 3B05A 4Z1BA 3R13A 3THQA 4RZ5A 4ZL1A 3PS7A 3OA3A 3GDTA 4UTWA 3W7HA 3QC3A 4AVFA 4Z0JA 3D0CA 2A1YA 1KTBA 5FESA 2ZRWA 3H53A 1VC4A 4LVGA 3GKAA 5DBUA 3M44A 3GX9A 4I7UA 5CGQA 5DY3A 1KV5A 1PL9A 1SFJA 3EKZA 4JTUA 4WZHA 4UNLA 4IMDA 2A85A 3U8GA 4UXDA 1A5BA 4XTDA 1SZGA 2C0AA 3OG3A 4AXKA 3BPWA 1KFJA 1X7FA 1KV8A 3MHGA 4JYDA 1XC4A 4MLJA 2RDTA 5EYWA 1K7XA 3TXVA 1FDZA 4FX6M 3RLUA 2YPIA 4QISA 5F2GA 4NJKA 3CU2A 2BTMA 4LU0A 3HGSA 2WJZA 4N6EA 1K8XA 2FDSA 1AW1A 4UCGA 3T40A 2G96A 3Q37A 3MW7A 2F7FA 2QCHA 3A24A 3NQDA 4NX0A 1G7VA 4KWVA 4FXRA 1IXQA 3GK0A 4TU1A 3BG9A 1JCJA 3VNDA 3WK2A 2NX9A 1GQNA 3E02A 1SZEA 5AOUA 1A53A 2QKFA 4OQVA 3NQMA 2QJIA 3MYPA 4WXZA 4Z1CA 1J2WA 2ZCGA 4CNOA 3KVLA 4JN6A 4EOUA 5D2XA 5DBTA 3W3OA 1JUEA 2ISVA 3NQ7A 3O6CA 4BWLA 4POCA 1JR1A 3M47A 5AN7A 3RNDA 2TYSA 1TYGA 2NUYA 3WJZA 3DU0A 2ZZ5A 3I7QA 1OX4A 2ZA2A 3FKKA 1L6YA 5D38A 3TJLA 3FFSA 2NX3A 1SUXA 2Y89A 3W76A 2AAMA 1DORA 3G18A 2C1HA 5CPNA 4GUIA 3N19B 4N02A 3NL3A 5BOOA 1TRIA 3CEPA 3E0IA 3GNNA 3PSVA 2A21A 1I2QA 3ABSA 3W87A 3BGJA 3N73A 5KINA 1G4SA 2CLLA 1LRNA 1XFBA 1KFLA 3VFLA 3W7DA 2CW6A 4UTHA 1W5OA 3NL5A 3C6CA 5FF3A 2DZXA 3W7KA 3G1YA 3IVUA 1QOPA 1LBFA 3A5VA 3G1HA 3PUOA 5D04C 4AHQA 4LRSA 4LVFA 1F5ZA 3U2OA 1SW7A 1M7PA 2J9ZA 1W3IA 2NV1A 1J4EA 2FB3A 2FPYA 3QYQA 3TC6A 1JCNA 3NPXA 2EPHA 3KRZA 2X1SA 2OT1A 4FO4A 3IV3A 1GYNA 2R91A 1OX5A 5U7SA 3W88A 3OEXA 3LB0A 1MO0A 5D2VA 3TNOA 2ABAA 1YXDA 4BWLC 1LOQA 3W75A 3DAQA 1QOQA 1P4CA 4FNTA 3N14A 1TJRA 1MXSA 3BG3A 2OX1A 2CU0A 4OV4A 4I7VA 3QW4B 4XTIA 2E6AA 3L2IA 1O5KA 1QCWA 2C6QA 3GDRA 5HR6A 3FJLA 3HMJG 3S1XA 4KWWA 2ZTJA 5L9FA 4IMCA 4QQ3A 3PBUA 2E5CA 3TMLA 1LLWA 3UWWA 4HSNA 2V30A 4O12A 3C0JA 5D03A 1TPEA 1TRDA 2V2DA 4JDBA 1VLWA 3M7WA 1DOSA 3NQFA 1R46A 3B8DA 5I3FA 4Q33A 4KFNA 3ZFHA 3W7OA 1WAUA 5LNSA 3P67A 3CIWA 3NYZA 3W1UA 3CWNA 2QCLA 2G95A 4O53A 2C14A 3HGOA 3EWYA 3CPRA 3H55A 1TPVA 2GVJA 1GVFA 1QFEA 2Y70A 3N9SA 3F1QA 3W1NA 1S5WA 1W5PA 3P5YA 2PRMA 4YXGA 1P0NA 2OZ0A 4EWND 2Y61A 4Y9AA 1TMHA 1XI3A 5LNRA 1XM3A 1IF2A 4MYAA 3NZRA 3FKRA 2IQTA 3JRKA 4JD4A 1KA9F 1A5CA 4MY9A 3FS2A 4Q32A 2OMAA 5E0KA 1U5JA 1YYAA 3GVGA 3O6DA 1I4NA 3CIXA 3W1TA 2JKAA 4UTMA 1SZFA 3AO0A 2QCMA 1M7OA 3NDOA 4DPQA 1T0OA 3TUUA 2CLIA 1WA3A 5F2LA 2WO5A 1EX5A 2FQIA 4JX5A 1V7YA 3QSTA 2NXGA 1UASA 5HWJA 2GVGA 1GYLA 1FCQA 4WJEA 1VR6A 1T99A 2A4AA 3GAKA 1BEUA 2OJPA 5D2WA 4E38A 1K7EA 3PUEA 6TIMA 2Z0IA 5CZSA 5CZJA 1VS1A 2A2IA 4A22A 2ZYFA 1F76A 2QUUA 5HUPA 5KMYA 4UTKA 4YMZA 3LLDA 2H3DA 2A7PA 1ONRA 5HULA 1FXPA 5J5DA 1X1ZA 3LXCA 3QMSA 4GC4A 3G0SA 5LKYA 3O1NA 3W9ZA 3PUDA 5AHLA 4IQLA 4K36A 3MI6A 3W71A 3P84A 3LRKA 5I3JA 4UR7A 3PVFA 2YX0A 3WK1A 1R2TA 4WY0F 1PE1A 5DN1A 3CTLA 3L5AA 3P80A 4AHOA 3E49A 5A5WA 5DLCA 1TV5A 5F4XA 1KTCA 2VXNA 2PCQA 3T78A 4UMCA 3Q94A 1UUMA 2FPVA 2NWRA 4N9BA 1EUAA 2I9EA 1IXOA 2NV2A 2Z1BA 4LNYA 4O15A 3F4WA 4RZ4A 2NUXA 3UWQA 2NXHA 4WY0A 5BNKA 1OFOA 4O1BA 1HFBA 4RLIA 3W23A 3W2MA 1FWSA 1MEWA 3M5YA 4RV8A 2ZRXA 4D2JA 1LTDA 4IXHA 1I2OA 5HMSA 3NM3A 4CCEA 1XBXA 2DJXA 5AHMA 3NGJA 4LS2A 2QDHA 3ANYA 1LDCA 3UXDA 3EWXA 3P62A 3C2OA 5HWMA 3LX9A 4IXXA 1SU5A 2YSWA 3TFXA 1DKWA 3UY8A 2AQWA 4TR9A 4OE7A 5DCEA 1WXJA 4JTEA 2ZBTA 1GTHA 3A5FA 3A21A 4WXYA 3L9CA 2JKEA 3B03A 2B4GA 1E51A 5C54A 4LS0A 3TQKA 1FY6A 2H8ZA 5EBUA 3W22A 4LC6A 2CZ5A 5F1UA 5GVJA 3QMTA 3CB8A 1FBAA 2Y6ZA 3F03K 2ZQ0A 4A3UA 3W74A 3KVMA 1TTIA 3G0UA 4TMBA 2EAWA 4LVBA 4M19A 3OHIA 1OFRA 3O06A 1AW5A 4M7TA 2Q8ZA 3BW3A 3EX1A 3MBFA 4IWWA 3NEVA 3ELFA 2VEKA 1H7XA 4S2BA 3C2EA 1TQXA 3OIXA 4ADUA 1DQWA 2WNQA 3TAOA 4NJHA 1UBSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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