1UQYA

Xylanase xyn10b mutant (e262s) from cellvibrio mixtus in complex with xylopentaose
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
347
structure length
347
Chain Sequence
GLKSAYKDNFLIGAALNATIASGADERLNTLIAKEFNSITPENCMKWGVLRDAQGQWNWKDADAFVAFGTKHNLHMVGHTLVWHSQIHDEVFKNADGSYISKAALQKKMEEHITTLAGRYKGKLAAWDVVNEAVGDDLKMRDSHWYKIMGDDFIYNAFTLANEVDPKAHLMYNDYNIERTGKREATVEMIERLQKRGMPIHGLGIQGHLGIDTPPIAEIEKSIIAFAKLGLRVHFTSLDVDVLPSVWELPVAEVSTRFEYKPERDPYTKGLPQEMQDKLAKRYEDLFKLFIKHSDKIDRATFWGVSDDASWLNGFPIPGRTNYPLLFDRKLQPKDAYFRLLDLKRLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Cellvibrio mixtus
publication title The Mechanisms by which Family 10 Glycoside Hydrolases Bind Decorated Substrates
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOXYLANASE
total genus 142
structure length 347
sequence length 347
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uqyA00
3MO4A 3UCQA 2DQXA 4B16A 3BAWA 4AXNA 1OGBA 4RE2A 3WDPP 2W66A 3MSGA 2WKGA 3AISA 1KXQA 1BYDA 1GOMA 2O92A 3AS0A 1OWQA 2GJXB 1JI2A 1I1WA 1GCYA 4IUGA 2ZX7A 1N82A 1HL8A 3HU7A 3D5HA 2XVNA 3WDQA 2XGBA 1W1VA 3CPUA 2DSUA 2WB5A 4WLCA 1BAGA 3M7SA 2E8YA 4E8CA 2DH3A 2J75A 3U5UA 4WK9A 5EFFA 3DHPA 1OIFA 1GW1A 1UYQA 2E9MA 2D20A 4Z2GA 2X1IA 3ZO9A 1NP2A 3OIHA 2UY2A 4HU0A 1Q6EA 2WCGA 2WLZA 2VO5A 2XFFA 3A4WA 3UG3A 4PMYA 2WMKA 3W0KA 1FP8A 4AD3A 4BS0A 1QI4A 4NRSA 3TTQA 4OBSA 2J79A 2CBUA 1GQKA 1Y7VA 3TONA 3VDBA 2OWCA 4PCSA 2EO7A 1E4MM 4JAWA 3G6MA 4CU8A 3RDKA 3L4VA 4Z2HA 3LPPA 3MMDA 1RH9A 4CVWA 5C70A 3L4WA 2J62A 1C93A 1NOWA 3K8MA 1J0KA 3AHVA 1UH4A 2JIWA 5A6SA 3BLKA 1JDCA 1E1EA 3VM5A 4BQ3A 2J4GA 4D6JA 1UG6A 1D7FA 4HOZA 5CSUA 1EGZA 1O6IA 1V0LA 3AIUA 3PTKA 3POHA 3EDJA 4EKJA 2ZX9A 2WC4A 1K9FA 4YHGA 3AMLA 3RILA 1E5NA 3B9EA 6TAAA 2O9PA 4C7FA 2ZUSA 4FF5A 4FLQA 2YBUA 4HMDA 3EMZA 3NDYA 1VF8A 4UFMA 5GNXA 3AQUA 1XD1A 2GJRA 2Y8KA 2WCAA 2VCCA 3EYPA 2EJ1A 3L4UA 3N1AA 5FD0A 4C7GA 2ZUTA 2GJXA 1L8NA 1WZAA 2OSXA 1XSJA 4QP0A 3T2QA 3WH5A 1V6VA 4PYSA 1LWHA 4UTFA 4PBGA 2VCAA 2WC3A 4HMCA 1Q6FA 4AD5A 4XZWA 2CEQA 2V5DA 2DT3A 2VRKA 3M6DA 1UWUA 1E43A 4XX6A 5BXRA 1HJQA 2PF0A 1RP9A 2IXUA 1UWRA 1C91A 4J3XA 3WH6A 4MB3A 4CCDA 1F4HA 2E4TA 4W88A 3CUGA 4UOQA 2WHJA 1FH8A 1OBAA 1TCMA 4HPHA 3WUFA 1WDSA 2XUCA 4WKFA 4D6CA 3ZJ8A 2VQUA 3FW6A 4BCEA 4AEEA 3NCOA 5FOOA 1BVZA 3AJ7A 4JHZA 1QHZA 5A3HA 4CN1A 4TVDA 3WSUA 3OA5A 2EBNA 1J0ZA 1X6LA 3AIVA 2WAGA 2ZUNA 2TAAA 1NOFA 3OBAA 2YL6A 1UD2A 2VVNA 1KCKA 4W5UA 2BXZA 5C71A 5BXPA 1IV8A 1UD8A 2DIJA 2AOSA 1FHDA 3FXYA 2PWEA 3BH4A 3L4YA 4QCEA 4PTMA 1WDRA 4A3HA 1YHTA 4AD4A 4TXEA 2ESCA 1HJXA 5LYRA 4IISA 4AIEA 3AYSA 1EDQA 1OT1A 5IFPA 3CHFA 4IPLA 3VD3A 5D9PA 1BTCA 3F5JA 2VNCA 1HKKA 1UWSA 3W24A 2VJXA 2CKSA 3RJXA 1CWYA 1DWIM 1G9HA 2VZTA 1EDTA 1QOXA 1JNEA 3SURA 5E09A 1CGTA 5HBFA 1VIWA 1B30A 1GVIA 5A8NA 1U30A 4KMQA 2D0GA 1AQ0A 3LPOA 2W61A 3EDKA 2WZEA 3WF1A 3VIHA 3L4XA 3A4XA 2XGIA 4OUEA 1H0IA 4U2ZA 4CCEA 3BAKA 1CGUA 2QMJA 5IXEA 5D4YA 5A2AA 3NUKA 3AI0A 3W6LA 3LPGA 5A6BD 2GSJA 1HKMA 3VIGA 3VMPA 3ARUA 3WDIA 1R7AA 1U2YA 3T09A 1MFVA 4KGJA 3WQ6A 2Q8XA 1PAMA 5CG0A 1XCXA 4J3TA 3W53A 4PRWA 1XD0A 3VX1A 3SUSA 3VIOA 2Z1KA 3ZM8A 5EFDA 1VJZA 2Y24A 2YDRA 4K68A 2PWFA 1QW9A 5BCAA 1NARA 1UKSA 1WDPA 7TAAA 3IANA 4GZEA 1XSIA 3VMNA 5CJ5A 4P7LA 1UWQA 1RD6A 4LYRA 3WEMA 3F4VA 1KCLA 1UZ1A 5FCZA 2V3GA 5ABFB 3LPFA 3VX0A 3WDRA 1X1NA 4CD7A 3U7VA 2C8NA 1SFSA 2EPKX 2WWDA 2G3MA 3GNPA 3VIIA 3RJYA 1NWUA 5ABEA 4AW7A 3WUGA 1EQCA 1XCWA 3PZNA 3GXIA 5E6YA 1DWJM 3GXFA 3ARRA 1P6WA 5M03A 2DDXA 4PN2A 2EPLX 3VO0A 2CCRA 4U2YA 1CGXA 3CZJA 3RMEA 1VBUA 4BF7A 1E3ZA 1W3LA 4ATWA 2CYGA 1XSKA 1V08A 3L4ZA 4KRTA 4UQAA 3VILA 1GJUA 3BMWA 2OSWA 1E3XA 5CSYA 1JYWA 1ISVA 4XV0A 4AZGA 4W7VA 4OJYA 1QI3A 3UG4A 2WVVB 3WN6A 4WF7A 1M04A 4U31A 2VCBA 3DC0A 2WZHA 1ZJAA 1US3A 3ALFA 3G6LA 3W37A 1QHOA 2WLYA 2BHZA 1IZKA 5GQBA 2F2HA 3WFZA 3ZMRA 1B3ZA 2J47A 3BSGA 4W89A 1GQIA 2YOCA 3TTYA 1LG1A 4UR9A 1ISXA 2D22A 4NSBA 1V3MA 3A6OA 1C8QA 2OYMA 4AIUA 2JF7A 3WNMA 4JZ5A 1HT6A 2BVYA 1ZBKA 3UG5A 2FDMA 3K8LA 4CN4A 4E4PA 4AZIA 3HJEA 2XYLA 1PJ9A 1HKJA 2XHYA 4U3AA 3A4AA 5JBDA 3N04A 5DFAA 1W3KA 4GKLA 3VUPA 3QR3A 3MUY1 2G3NA 3AS2A 4OBRA 1GNXA 2W91A 4F9DA 2GJPA 5E70A 1MFUA 3VD9A 4W8LA 2JEQA 3N17A 4OKDA 4EK7A 3SCQA 1UHVA 2E8ZA 2J77A 3TA9A 1TG7A 4W7UA 1MXGA 1TVPA 5E0CA 1W3HA 5A8MA 3W6MA 1VBRA 1B9ZA 1DP0A 5FL0A 2GVYA 4D6EA 1J18A 1KWKA 1YQ2A 3WD4A 5ABFA 4PTXA 3FAWA 2W92A 3GNOA 4ZENA 1KXTA 1SR0A 1HX0A 5E6ZA 3BSHA 1CLVA 2CKRA 3DHUA 1UOKA 1WP6A 1LL4A 3WD0A 4D6HA 3IK2A 1SMAA 5CLWA 1VEPA 2WSKA 3APGA 4J3UA 3RIKA 2W62A 4GZIA 4BQ5A 8A3HA 1GJWA 3PHAA 3AIEA 2CERA 2WBGA 3QHOA 2NW0A 3BAJA 2WVVA 1E55A 2DSVA 1CDGA 1W32A 4CCCA 4JFSA 2RGMA 1JG9A 4MNKA 5A8PA 5FIPA 5A6MA 4F79A 3BGAA 1MWOA 2E3ZA 3ARXA 1HJUA 1CIUA 1PX4A 1GOIA 4B15A 1KGXA 1CNVA 4JKMA 3CMGA 3O9NA 3O6AA 2VMFA 3MKKA 4P8VA 1HL9A 3WD3A 3VIFA 2J25A 5BYWA 1WZMA 2JE8A 4LQ1A 1FHLA 3WDHA 1QPKA 1UR8A 4ZEPA 4AWEA 3MMUA 4OOZA 1GOOA 5ECUA 2YL5A 1CYGA 5IFTA 2ZWZA 1HJWA 1TFVA 5FL1A 5JBFA 2J7EA 4CVUA 3S6TA 1GOQA 1UQZA 3AYRA 2V5CA 3U57A 3VD5A 1FFRA 4GQQA 1ODUA 5CGTA 1GOKA 2XSAA 2OYLA 4D1JA 3WNOA 5LA1A 1C8YA 2VX6A 1CPUA 4Z2KA 5DMYA 3K4AA 1LLOA 4LX4A 1B0IA 3PZ9A 1KFWA 2DSZA 3FHQA 5E0FA 1OM0A 3OZPA 1JAKA 5CPQA 4ZXOA 2VURA 2DGAA 1M7XA 1QVBA 2A3EA 2V3FA 3JUGA 7A3HA 2XVPA 2Y2WA 1JXKA 1H0GA 4WIWA 2ZXQA 2F8QA 6A3HA 4F9JA 2BY1A 2X2YA 4MB4A 2WK2A 2OYKA 2OWWA 3EMQA 4CU7A 2CBIA 1R7OA 3GH4A 5CPTA 1UQYA 3CUIA 4XB3A 3AXIA 3B8SA 3I3BA 9CGTA 1CLXA 1WDQA 2D1ZA 2YJQA 2D23A 4R5EA 2BHYA 3WNPA 2WMFA 1GQLA 3AMCA 1B3VA 1UA7A 4D72A 4FLOA 4JCLA 1FH7A 4WKAA 2J7DA 4NZCA 1QI2A 4AZ7A 1HN1A 3OLIA 1J9YA 5JIPA 3QHNA 4D6GA 3W29A 1XHGA 3CZLA 4NI3A 4MDOA 4NRRA 4CUCA 2VQTA 2A3BA 2YIHA 3D3AA 4H04A 2UWFA 2VVSA 4D6DA 2A3HA 2VZVA 5A8OA 1JZ3A 3AMGA 5AY7A 2XVLA 4W86A 3KL0A 1NQ6A 3W4RA 3OB8A 2WMJA 4PUEA 3VDAA 1E56A 1TA3B 4TX8A 1M01A 3AIQA 4M56A 4GINA 3W28A 3ARWA 3ARTA 3CUHA 1G1YA 1TVNA 1W9UA 1KXHA 3THCA 2QHAA 3IAQA 3WQ5A 2PI6A 2XTKA 1H5VA 3FAXA 3F5KA 1UR1A 2CXGA 5I0DA 1V3KA 4MJ4A 2WMIB 1E6NA 4M1RA 1NWRA 7CGTA 3VIPA 2D24A 3GBDA 1ZBCA 1MW2A 2E9BA 2VL4A 4TTUA 4TVCA 3WBEA 2VZUA 1ZJBA 1EHAA 1VFUA 2CNCA 1W2VA 2BV9A 5GNZA 3F5LA 1NH6A 4AY1A 1Z32X 1J12A 1UD3A 4P8WA 3QOKA 4RL3A 2G41A 3U5YA 1UR4A 3AOFA 3BCDA 3PZOA 3ALGA 4J27A 3NSMA 1MVYA 3WNLA 2C0HA 1QNQA 1FFQA 2IXVA 1OD0A 4L4PA 2ZXBA 1JZ8A 5I6SA 3VNYA 1W1PA 4U33A 2PBOA 2Y4SA 1PEZA 2JFEX 2X05A 4U5IA 4W93A 3CO4A 4UFJA 3ZJKA 1KR0A 2EPNA 4WJXA 3VIKA 4PTVA 5I2UA 4J7RA 3MV01 2VRQA 3VGEA 5BWFA 2G3IA 3ZJ7A 5LA2A 3II1A 1MXDA 1XYZA 1Q6GA 3OG2A 3BAYA 1G5AA 2WM0A 1ISZA 4U5KA 2WW5A 4FK9A 4D1IA 3WMCA 1UWTA 1JI1A 3UESA 1HVQA 2J7BA 3OGRA 3GTNA 3AZRA 2O9RA 1PZ3A 2XG9A 1FA2A 1FOBA 2ZUMA 2VX7A 3MSDA 3SCTA 3SUUA 5EB8A 1R85A 5E9AA 4UFKA 4W87A 3L2LA 1B1YA 2BY2A 3IJ8A 1EA9C 2VRJA 1TA3A 4ATDA 3POCA 4GIAA 3IJ9A 1OGSA 3E1F1 1CENA 2ZOXA 1G94A 5JUVA 1KXVA 2WYSA 3CGTA 1KQYA 4HMEA 1BGGA 1XV8A 1CXIA 2XWDA 1WZLA 2WMIA 3AIBA 4TOQA 1PX3A 4TX6A 4V28A 4KGLA 1JYXA 1Q4NX 4BZYA 1NWSA 1H4PA 2WXDM 1HP5A 4CD5A 3AROA 4Q22A 2FHBA 4FLRA 1JZ6A 4PMDA 2EXOA 1KBKA 1LQ0A 1E70M 5BROA 1V3IA 2ZX8A 3EBVA 3AHXA 4PUDA 2VT0A 3VM7A 2FH6A 1HP4A 3AHZA 1OGGA 3VGDA 1QBAA 1OSEA 3VGFA 3WF0A 1W9XA 4UZSA 3SCRA 3BCFA 2VR5A 1C92A 2Y8VA 2QV4A 4AMCA 1EDGA 4UOJA 3DECA 4W8AA 1VEOA 4JFUA 1CGWA 4B9YA 3OZOA 4P7NA 1UWIA 3TOPA 3VOCA 4AZHA 1CXHA 4ATLA 1DHKA 3BAIA 1KWGA 1B3XA 2QLYA 5BXTA 5I3DA 2J8FA 4CD6A 3VMOA 1EXPA 1UD5A 3I3EA 4B3KA 2EPMX 1K9EA 3SUVA 4ZE5A 2EQDA 3AXXA 3O2LA 2RGLA 1H11A 2WVSA 3WMSA 1W2PA 1CBGA 3WDJA 3A3HA 3N12A 3VKKA 1V02E 3VDCA 1UKTA 4R27A 1JD9A 3TTOA 1JYVA 2V38A 1B90A 2WBKA 3ZJ6A 4PMRA 4PCTA 1JL8A 3GXMA 2JF6A 1QBBA 3MUIA 3PZTA 2PWHA 3CBWA 1UH3A 1BSIA 3VNZA 1CTNA 1K9TA 4OIFA 3T08A 3W27A 1I1XA 2BVTA 1EHNA 4H41A 1JZ7A 2D0HA 2QMKA 1E4LA 5A6LA 3T0AA 1TUXA 3W81A 4ACZB 1BLIA 3RM4A 3AMDA 3WMBA 3SCVA 1DWFM 3QGVA 4C7DA 3VVGA 1BHGA 4GZJA 4GI9A 3UR7A 1EQPA 3CHCA 3CUJA 4L4OA 3MUZ1 4UOZA 2O9OA 3N9KA 1V02A 1EOKA 3AZSA 1E40A 4UQBA 1EOMA 2FH8A 5EMYA 4PMUA 1VAHA 4E2OA 4BA0A 1ZU8A 2X0YA 4B3LA 3SCPA 2IUZA 3ARSA 4EAMA 4GQRA 4HP5A 2OSYA 1RP8A 4CGTA 3EDDA 4W84A 3BC9A 4JIEA 4QAWA 1OCQA 1ZBWA 1E0XA 4B9ZA 3CHEA 2BXYA 4X9YA 1J01A 3GXDA 3OLEA 1JD7A 3PZMA 3WELA 4LYQA 3UEQA 4DUWA 3M46A 1V6UA 1E6ZA 3WH8A 1MYRA 3THDA 4YN5A 3FHAA 4P8XA 4QLLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3MO4 A;  3UCQ A;  2DQX A;  4B16 A;  3BAW A;  4AXN A;  1OGB A;  4RE2 A;  3WDP P;  2W66 A;  3MSG A;  2WKG A;  3AIS A;  1KXQ A;  1BYD A;  1GOM A;  2O92 A;  3AS0 A;  1OWQ A;  2GJX B;  1JI2 A;  1I1W A;  1GCY A;  4IUG A;  2ZX7 A;  1N82 A;  1HL8 A;  3HU7 A;  3D5H A;  2XVN A;  3WDQ A;  2XGB A;  1W1V A;  3CPU A;  2DSU A;  2WB5 A;  4WLC A;  1BAG A;  3M7S A;  2E8Y A;  4E8C A;  2DH3 A;  2J75 A;  3U5U A;  4WK9 A;  5EFF A;  3DHP A;  1OIF A;  1GW1 A;  1UYQ A;  2E9M A;  2D20 A;  4Z2G A;  2X1I A;  3ZO9 A;  1NP2 A;  3OIH A;  2UY2 A;  4HU0 A;  1Q6E A;  2WCG A;  2WLZ A;  2VO5 A;  2XFF A;  3A4W A;  3UG3 A;  4PMY A;  2WMK A;  3W0K A;  1FP8 A;  4AD3 A;  4BS0 A;  1QI4 A;  4NRS A;  3TTQ A;  4OBS A;  2J79 A;  2CBU A;  1GQK A;  1Y7V A;  3TON A;  3VDB A;  2OWC A;  4PCS A;  2EO7 A;  1E4M M;  4JAW A;  3G6M A;  4CU8 A;  3RDK A;  3L4V A;  4Z2H A;  3LPP A;  3MMD A;  1RH9 A;  4CVW A;  5C70 A;  3L4W A;  2J62 A;  1C93 A;  1NOW A;  3K8M A;  1J0K A;  3AHV A;  1UH4 A;  2JIW A;  5A6S A;  3BLK A;  1JDC A;  1E1E A;  3VM5 A;  4BQ3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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