2V5BA

The monomerization of triosephosphate isomerase from trypanosoma cruzi
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
242
structure length
236
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKCLLVPLIETLNAATFDHDVQCVVAPTFLHIPMTKARLTNPKFQIAAQNAGNADALASLKDYGISWVVLGHSERRLYYGETNEIVAEKVAQAAAGFHVIVCVGETNEEREAGRTAAVVLTQLAAVAQKLSKEAWSRVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEVHELLRRWVRSKLGTDIAAQLRILYGGSVTAKNARTLYQMRDINGFLVGGASLKPEFVEIIEATK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Monomerization of Triosephosphate Isomerase from Trypanosoma Cruzi.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
molecule tags Isomerase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 84
structure length 236
sequence length 242
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2008-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2v5bA00
3O6CA 2X2GA 3K30A 1MSSA 1GWJA 1H7OA 2FB2A 4RR4A 1JJKA 3MI6A 4UFHA 2I9EA 4JTKA 2WQPA 2C15A 4FEZA 4NJHA 4AEOA 3DFNA 5HMSA 1DV7A 4K7VA 1WA3A 5D02A 4UTWA 4WXYA 3NQEA 3QSRA 1AMKA 3IIOA 2VELA 5HUOA 2YXGA 3ATYA 5F1UA 2NXIA 4R33A 1HO4A 3KVJA 3W7MA 1SW3A 3BPWA 1QOQA 2Q8LA 1FDJA 5T26A 2P0OA 3W7CA 1OX6A 2GVLA 4FXSA 3B0VC 3DHFA 2BSLA 2Z6IA 3Q94A 1H1ZA 1K7FA 3DFQA 2ZFAA 3NQGA 3TA6A 2A4AA 3FYOA 1LCOA 2J24A 3C2OA 4LY8A 3CEUA 3U2OA 3KRSA 4KWVA 4X3ZA 4YLWA 2EAWA 3LCWA 1KM0A 4ZL1A 3EX2A 5AC8A 4H3DA 4UFLA 3VI2A 2VKZG 5HWNA 3W7EA 5TQLA 2YW4A 1FCVA 5DELA 1GTEA 1JRCA 3L5MA 5DCDA 1VZWA 2NXHA 3W7JA 1Z42A 3W73A 2J6XA 3IVTA 1LORA 4JIPA 3SW6A 3GYEA 4HNTA 1TJPA 4YWIA 3GR7A 5J5RA 3HG4A 4MYXA 3W75A 4A2SA 1L9WA 4GFSA 3FS2A 4JNMA 2YYTA 1M7OA 1VH7A 3H54A 4Y6GA 1O60A 2P1FA 4UFJA 2H3DA 3GDRA 2E5DA 1TTQA 2VOMA 1G4TA 2ZZ3A 5F4XA 1XI3A 1WBHA 4AH7A 2V5BA 1TTPA 1ZENA 1QPQA 1B3OA 3UYCA 1B9BA 1XBZA 3QFEA 4PCFA 4BFAA 4H6KA 2Y62A 1FCUA 5BRBA 1WYIA 2V8ZA 1HFBA 2GJNA 3GKAA 5AOUA 3WJZA 4UTIA 1OFRA 4DF0A 3EKZA 4DO6A 4E0CA 1HTIA 4JYDA 2A7RA 2F84A 5EBUA 1GVQA 3RNDA 2J9ZA 1KM2A 1TV8A 4RLIA 5C55A 1XDLA 5CPMA 4NQ1A 4ONVA 2RDWA 5K7JA 3F4WA 4O4WA 4UXDA 1DOSA 3L5AA 4K8HA 3G0SA 2JKPA 3IGSA 4UUIA 3USBA 4RK8A 4N9BA 4CNPA 2GJLA 3A5FA 3P84A 4MIMA 3DHDA 2V2CA 3P61A 3E0IA 1HO1A 5LSMA 2HMCA 4IXXA 1EP3A 3FJ6A 3DZ1A 4POCA 1IF2A 3NQ7A 5D04C 2BTMA 3LCXA 4ADUA 2Z0IA 1X1OA 4H4IA 4NT0A 3LRMA 5AHFA 1VCGA 3I7SA 4BWLC 1TPVA 3C3NA 1JCJA 4UTJA 4LC8A 3BG5A 3IIPA 1QNVA 3TJXA 5TBOA 3T55A 2JGQA 4HPXA 2CFFA 2V2DA 5K4XA 4BI5A 1LYXA 4DBEA 5G2WA 4QNEA 1SZGA 5HWMA 3O06A 1QO5A 1PVNA 4AWSA 3ABQA 3EEGA 1H60A 2V2HA 1N55A 1ALDA 2B7PA 2NUYA 4UCGA 1UUMA 3NZRA 2FLIA 4O53A 2CW6A 2ZBTA 5TIMA 2PRMA 1YXDA 4O10A 2WNZA 2VFIA 3ZS4A 2YFNA 3N73A 1Q3NA 4U4MA 1J2WA 3PG8A 3P60A 4MFEA 5AN7A 3B03A 1EUAA 1TPH1 3UZ5A 3UY7A 3IV3A 3G3MA 1YDNA 1W31A 4OBTA 4HHPA 2ISVA 2ZRUA 1W5QA 1YDOA 3W2JA 4Q4KA 1YPIA 3GK0A 2E6YA 3NL2A 4JX6A 3G8RA 1LOLA 2H8XA 3B05A 3LCLA 4HIBA 4MYAA 5AHLA 1DBTA 1WQ5A 2TYSA 3G1YA 4Y9AA 1FWTA 1N8FA 1H50A 1EWDA 4G1KA 4MZYA 4O1BA 3KX6A 1NF0A 4JX5A 4N2YA 4XTIA 2H3BA 5HNRA 1MEWA 2BLEA 2DJLA 4PFMA 5U7SA 3GVGA 3Q37A 2AQWA 4O54A 4JGDA 1Q6RA 4WY0B 1SSDA 4LVAA 3QJAA 4IUOA 4Y90A 4AMAA 2R14A 4EF8A 3ELFA 1CX9A 2GVGA 2WPBA 3L9CA 3W1QA 4MLJA 4Z08A 5LHFA 3CWOX 1AW1A 3MBFA 2Y7GA 3PVFA 5I3FA 1LOSA 3B8DA 3LBCA 4TR9A 5FEPA 5K9XA 3GDKA 2QKFA 3VFLA 4NX0A 5BMWA 4R34A 2TPSA 1R2SA 1OF6A 1DORA 1SR9A 3NQ2A 3W7LA 4ICNA 3EKLA 4ORIA 1LRQA 1OK4A 2J9YA 2C16A 5FEXA 3G8EA 3NL3A 4GXMA 2DZVA 3A22A 1DJQA 1R2RA 1H51A 5U4NA 4JYFA 4LW7A 2QUUA 5AFDA 1UUOA 5LNSA 5D05A 3NQMA 1WX0A 3NPUA 1H7NA 4ZQRA 3UD6A 4TO8A 1WBJA 5CPNA 6ALDA 4LOCA 1LP6A 2B0MA 4BR1A 2WSYA 4HSOA 3STFA 2JKAA 3VNDA 3N14A 4FF7A 1DVJA 3B0UX 1TJRA 2C1HA 4KKXA 4O18A 2ZRZA 1IGSA 4WY0A 4AF0B 4PC8A 1OF8A 2NXGA 1G7UA 3DENA 1PS9A 4LUIA 2P10A 2CU0A 1DKWA 1O4UA 4RZ6A 4JD4A 2VENA 1AW5A 1KW1A 2Y61A 4JXCA 2FTPA 3B04A 4Z0SA 2RKXA 3M5XA 3ABRA 4BWLA 5DBTA 1AW2A 5LGZA 3BGJA 4NJIA 3S8HA 1U83A 3SR7A 5F1VA 3PWAA 2NV2A 2NX3A 1KFEA 2DJXA 3NPXA 1RVGA 1WDWA 2ZRYA 2C3ZA 1VHNA 1NFBA 3UWUA 1GYNA 1XCFA 5G1TA 4XQ6A 5I3GA 3PBWA 3OEXA 1QWGA 1GTHA 2E68A 3TROA 3GNDA 4FNRA 2W6RA 3CM4A 3HG5A 6TIMA 3B06A 1THFD 4OT7A 4XZ9A 1RV8A 2QJIA 4K7YA 4RKAA 3MHUA 4HN4A 3HPZA 1VLWA 1BWLA 4QITA 4R53A 3QMTA 1W54A 3O1NA 2YPIA 3M16A 2YFOA 4ZQPA 1QPRA 3HPSA 3F4NA 3SECA 3WJSA 1FXQA 1YTKA 3HG3A 1L6SA 4GUGA 3W2UA 2VC6A 2QDHA 2PRLA 1SUXA 3LCHA 5AYYA 1H1YA 3LV5A 1QR7A 2X1UA 4PA8A 2X30A 4JTIA 1TREA 3S1UA 3I65A 3BVJA 1H7PA 1M5WA 3JS3A 3QEZA 3G24A 3W70A 1AL8A 5F2GA 4EF9A 3BLFA 5K3VA 1G4EA 3W84A 4AF0A 4NU7A 1ME9A 4PH6A 3F03K 3MHFA 2HTMA 3L65A 4M19A 3OVRA 2ZZ1A 2JK2A 1H7RA 5AYXA 3TW6A 3T4CA 4LT9A 1QFEA 3W83A 3GAYA 4TMCA 3HOJA 4FXRA 4GUJA 2QAPA 2QUVA 3O8AA 1GVSA 3IGXA 2BWGA 1OFAA 5CZ0A 2AAMA 5DN1A 1YLVA 1SZEA 1JVNA 1VJIA 2H8ZA 1K7XA 2TMDA 4JTFA 4LRTA 3L66A 4M7SA 2R8WA 3NQAA 1GT8A 1V7YA 1KBJA 4LVDA 4M6VA 3O6YX 1FBAA 3DFPA 4O0KA 4YXGA 1KBIA 2XFWA 3SGZA 3TCEA 4QISA 1OFDA 2J9XA 5F4WA 4QAIA 3NM1A 1SZNA 3G1XA 2CLOA 3LTPA 1NEYA 2Y88A 2QJGA 4DEFA 4HSNA 2QDGA 1TV7A 3IEBA 1PL9A 3ZWTA 2W79A 1OK6A 2G5WA 5FF0A 1LLZA 2D73A 5KZMA 1YTDA 2CLFA 3RF9A 4ZQOA 2Y70A 3E12A 3HMJG 4GUFA 4EWND 3KVMA 3MP4A 3GDTA 4UTHA 4MJZA 3HQ1A 3NM3A 3GXNA 2WSRA 2DP3A 5EMUA 3M0ZA 1LDCA 3U8GA 4ADTA 3HO8A 1JQXA 1SW7A 4Z1BA 4HKPA 5G1YA 2ZYFA 4N02A 1OX4B 3M41A 5D2VA 3BK0A 1FUYA 3M7WA 1C9DA 4UTLA 5D38A 3LDVA 1TTJA 5KMYA 3B4UA 5DCBA 2CLLA 1TO3A 4NNBA 2E6DA 2BXVA 3N2MA 4OWGA 1KM1A 3S5NA 5I3JA 4MLRA 4HNUA 5SWUA 1OFPA 4O52A 3LTSA 1IXQA 3CPRA 3INPA 4DO4A 1KFLA 3O63A 3MYOA 2C19A 4YL2A 3IVUA 3BG3A 4UNKA 4XKYA 4UMAA 2ZZ2A 3B0PA 2ZA1A 3TC6A 3PBYA 4MKNA 1RPXA 3TU9A 3KRZA 5LGXA 1W56A 2WNQA 4K6AA 3QQ1A 1PHQA 5DY2A 2UV8G 2QUTA 1FDYA 3W1XA 4AVFA 5FESA 3M5VA 3W85A 4ALDA 4UMBA 3TKFA 2WKJA 1K02A 4O11A 1EPXA 4ZZ9A 2RHGA 3W1UA 3PSWA 3W1PA 4WXZA 3CLMA 3QMSA 1FCQA 2CZFA 4JEQA 1TPWA 1A50A 2JKEA 4RV8A 4OQVA 1KLYA 1OX4A 1ZCOA 3EB2A 3NOEA 3Q58A 4GWEA 4FX7A 3LCFA 3LHTA 4O13A 4IX0A 3W22A 4GJ1A 4JTLA 3HBLA 2C13A 5IM51 1LBMA 1QPNA 3TX9A 2FPTA 3LXBA 4IQLA 3NPWA 1J5TA 2YDAA 3TMQA 3KRUA 5FEZA 3FKKA 5BW6A 1EWEA 1SZFA 5D2YA 4AHOA 1YPFA 3LI0A 4PODA 1H63A 3GX9A 1FCBA 4PTNA 3STCA 2CLMA 1U5JA 3KXQA 5AC6A 3M43A 3N9RA 4I7VA 4QIUA 3NL5A 1FDZA 3G0UA 1ZFJA 1NF7A 2ATMA 3MYPA 3W72A 1LZOA 2F7FA 3P62A 5DCEA 3MP5A 4CLMA 2HSAA 1VPXA 5E0KA 3NPVA 2QCDB 1B4EA 1CI1A 1ADOA 3Q2DA 2ABBA 2ZRXA 4WY0F 3DAQA 3FIGA 3CEPA 4NVTA 4TMBA 5D03A 2QCLA 2OJPA 4IOTA 3ZWSA 3W23A 3OG3A 3TAOA 1KFBA 1ZJIA 4Q33A 2EF9A 4OV9A 4O14A 2NV1A 4GNJA 4O12A 2FIQA 1GZGA 1ICQA 2C0AA 3M44A 3W3OA 1TPEA 1W5MA 3QF0A 3LGEA 1KM4A 1FY6A 4TU1A 2A6LA 3DH7A 3G18A 1R46A 3W87A 2W0UA 4B5NA 2O7QA 2VFGA 3YPIA 1RQHA 1UASA 2Y7FA 4ML9A 5EYWA 3L0NA 4AWUA 1GJPA 2AGKA 3H55A 2WO5A 3RLVA 3TFXA 1TSIA 1ZNNA 2WNNA 4M6QA 2ZZ4A 3A24A 5LHEA 1SPQA 3LX9A 1VYRA 1XC4A 1HUVA 3V75A 3GNNA 1SO3A 2TSYA 4UIOA 5A5WA 4NJGA 5KITA 3LLDA 2C6QA 4Z1AA 3UWVA 5D2XA 5HR6A 3T78A 4WJEA 2OZ0A 4O17A 2OCZA 3EWZA 1ME8A 3FKRA 4KFPA 1YDVA 2V82A 3M6YA 1X6UA 2QCDA 4AHQA 4R7JA 3P5YA 1ICPA 2QCCA 4FNUA 5C54A 4Y8FA 3W1NA 3I6RA 3P8JA 1D3HA 3LV6A 5DXXA 8TIMA 3DXIA 1R47A 2OT0A 1KM6A 4DF1A 3I7RA 3MJYA 1JCXA 3SI9A 3LTYA 3P74A 3LXCA 1X1ZA 4UNLA 5E93A 4CNNA 1GOXA 4GRSA 3PBUA 1SO4A 5EKYA 2VEMA 1QPOA 3ABSA 1P0KA 1GG0A 4HT3A 5AHIA 1OG0A 7TIMA 3GXTA 4A22A 3DKLA 1D3GA 2FFCA 2QEZA 4RX0A 5CPOA 1TRDA 2X1TA 3DI0A 2XN2A 3CC1A 2PCQA 3FYPA 3P7YA 1SW0A 2A0NA 4CCEA 1IIGA 5AYZA 4X9SA 3CHVA 4O0ZA 2G95A 2NX9A 3QMRA 1G6CA 3N9SA 3H53A 1QDSA 3R13A 5H91A 1HL2A 5EL1A 5HUPA 5FF7A 1JQVA 2HS8A 3EX1A 2H6RA 1IXPA 3GAKA 3STEA 3THAA 5G4WA 3U6WA 1JUKA 2VFHA 3QC3A 5H2ZA 4NXSA 3ATZA 3AO0A 4S2CA 2BZNA 4WQ6A 4ORMA 3PBVA 1A5BA 3CIWA 1B4KA 3TC7A 3HIJA 2WJZA 5IBXC 1E51A 4NUWA 4XTDA 2GQ8A 4O15A 4FIRA 1BKSA 1P1XA 4CCDA 3EX4A 1OFBA 3TSMA 1DJNA 3EX3A 4IMEA 5C2XA 1NSJA 1W3NA 4ZVJA 2QCHA 1VYPX 3TQ0A 3W76A 3DI1A 4BI7A 1KV5A 4K8EA 3NQVA 3A21A 5AHNA 3BGGA 5KZDA 3FJLA 1OFQA 5BMXA 3RLUA 5HULA 1M7PA 1VCVA 3GKFA 4Z1CA 4LV9A 1T0OA 1LOQA 4FNTA 1EP2A 4HPJA 3UY8A 2A7NA 1L6WA 5CSSA 4MOZA 3GR8A 1TPUA 3IVSA 2WSQA 4MY1A 4ADSA 1S5TA 4X22A 3GZ3A 4O8RA 2QCFA 3O05A 4UR8A 5FI8A 3ZFHA 1VS1A 4K37A 4UMCA 4N4PA 5K4ZA 5F2IA 3BLEA 2QCMA 2C18A 3N19B 4GBUA 4MZ1A 2A2IA 3R5EA 3N3MA 4DQWA 2V81A 4JTGA 5LKYA 4A21A 2DZWA 1A5CA 3KHJA 4HNNA 3G1FA 4OHQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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