2CEQA

Beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus in complex with glucoimidazole
Total Genus 203
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
203
sequence length
489
structure length
489
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITRGNEKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Sulfolobus solfataricus
publication title Structural, Kinetic, and Thermodynamic Analysis of Glucoimidazole-Derived Glycosidase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GALACTOSIDASE
total genus 203
structure length 489
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2006-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2ceqA00
4AZCA 1GOKA 3B8SA 2WLYA 3N18A 4QLKA 3WQ8A 3UESA 1I1WA 3OZPA 3TTSA 1FH8A 2O9TA 2QMKA 2AOSA 4OKDA 4W5UA 1XGZA 2J62A 1VFFA 3AI0A 1HJQA 4HMDA 4J3VA 6TAAA 1JD9A 4DWSC 3OB8A 4TVDA 3BH4A 4W87A 4DUVA 1JZ5A 2CYGA 1GONA 2UY4A 3BAWA 1E55A 1XYFA 3W53A 3VD7A 3LPFA 1CXKA 1Q6GA 1XD1A 3N1AA 2DT2A 5CPSA 4WSJA 1GCYA 1JXKA 2QLYA 3WF2A 1FFRA 1BVNP 1CTNA 4JHOA 1V0LA 3AOFA 2Y4SA 1DWJM 1SR0A 1VEMA 4A3HA 1C8QA 1W3KA 3PBGA 1E3ZA 2D0HA 4KMQA 3BLPX 2BFGA 3TOPA 4KGJA 1GZJA 2JF6A 3BAYA 2ZX9A 2QF8A 4GO8A 3K4DA 5A6AA 2VOTA 1XCXA 1KBBA 4DM2A 3ALFA 1VIWA 2FDMA 4TUFA 3DECA 2X05A 1GOIA 2CESA 1LLOA 1CGYA 3IANA 2OSYA 2CIPA 3TTQA 1M04A 3VINA 3WNNA 2QPSA 4EE9A 5A6BA 1XCWA 1V0MA 4OOUA 2WNWA 3VD4A 5KZ6A 3SCQA 5HOSA 2CXGA 1H41A 3UG4A 1VENA 2YJQA 2J79A 5HPOA 3N15A 3ARYA 1OB0A 1WE5A 5AC5A 4UOJA 4WSKA 5HPCA 5CPQA 1G5AA 2VO5A 3PHAA 3CPUA 4FLSA 1XSJA 2ZX5A 1KGXA 3BXWA 3MUY1 4CVUA 4F79A 2JFEX 1OGBA 5CGTA 2CHOA 4W89A 2NSXA 3WSUA 1J0IA 3BCDA 1UD4A 4UNIA 1UKQA 5DEZA 2A3HA 3WFLA 1QHPA 4UFMA 1KWGA 5BRPA 3L4WA 5C71A 1E9LA 2VR4A 1CYGA 4H8UA 5KEZA 4X0NA 2J75A 2WMFA 2YDSA 4U33A 1CXFA 2CETA 3A47A 4P8UA 3VIJA 3AQUA 1E5NA 1UWTA 2QMJA 1HNYA 2XWDA 7A3HA 4CD6A 4Z2JA 1OT1A 3PZTA 3IJ9A 1G9HA 1ITXA 2C8NA 2WC4A 2E40A 2WPGA 4U2ZA 4ML4A 1UH3A 2VR5A 4U3AA 3L4XA 3LPGA 1E5JA 5DT7A 2XGBA 1JZ3A 4DM1A 3RMEA 2FHBA 1OGSA 3PTKA 2HVMA 1H1NA 1KGWA 1GJWA 2FGLA 1GNXA 3PZIA 5JBFA 1EIBA 1V3MA 2J47A 1V02E 4M29A 3SUWA 3CGTA 2RGMA 5JBDA 2XM1A 1OM0A 1TG7A 4J7RA 1R8LA 1QNPA 3JUGA 1JZ7A 3WH5A 1J10A 4FLQA 4CGTA 5D9PA 3F5LA 3OG2A 1QNOA 4FLOA 4KRTA 4HU8A 3SCUA 3U5YA 1S46A 4UR9A 4M8UA 1OIFA 1CGUA 5CGMA 1YHTA 4QCEA 4U31A 3PZQA 3EYPA 1E0XA 2XIBA 3A3HA 5AYIA 3UR8A 3A4WA 1B3YA 1NWRA 2XVPA 1UWUA 3SCSA 4AZBA 2TAAA 1WDRA 4W8AA 1NM9A 4AC1X 3VOCA 2JEQA 2BY1A 3OLIA 2F2HA 1ECEA 3NIYA 2DH2A 3CUGA 4PMVA 3GDBA 5GPRA 1SFSA 3NSNA 3TA9A 5DT5A 1WKYA 1ZU8A 3FHQA 2Y24A 2FGZA 4PMDA 3WH8A 4JIEA 1H5VA 2G8ZA 3WMBA 5BXTA 2OSXA 5IHRA 2ESCA 3AS2A 3L2MA 4ZEPA 2VCCA 3AYSA 3ZJKA 4AD0A 2WZHA 1E40A 1E4MM 2ZXQA 2WMIA 3VDCA 2GJRA 4Z2KA 5LA2A 2DT1A 4AXNA 3K4AA 4UFHA 1CXEA 2NT0A 5BYWA 1OWQA 2JIEA 2VQTA 4LX4A 4CUCA 1UR2A 1UKTA 2GFTA 3IJ7A 4UQAA 2D24A 2EEXA 3D3AA 3NUKA 4L4PA 2DDXA 2VZVA 3SUTA 3U7BA 4AYSA 4AIUA 2XSAA 2ZXBA 4PMNA 1PIGA 3FW6A 4PTMA 3VM7A 1ISVA 3N12A 4D72A 1Q6CA 3BC9A 4MNMA 2VX4A 4ACZB 1E71M 3AXIA 1MVYA 2Y8VA 4HZ8A 3WDHA 1EDTA 3W24A 3NDZA 4V27A 5A8QA 2VCBA 2WVSA 4E2OA 1PIFA 4K68A 3M46A 1C7TA 4UFJA 4PTWA 1M7XA 1MW2A 3NSMA 1TA3B 4U5IA 1XYZA 4W88A 1E0WA 4XB3A 3WUBA 2G3JA 4M56A 2WVVB 4TTUA 4XV0A 4YHGA 4QFUA 5CJ5A 2W92A 3FNDA 3NCOA 1C91A 2JEPA 2B31A 1QI4A 3K8LA 5D4YA 1X6LA 3E1F1 4J27A 4UFKA 3KEHA 4H04A 1C90A 2VX6A 3A4AA 4GXPA 3S6TA 1UKPA 1CNVA 4RE4A 2VVSA 3T0AA 1QNSA 1E3XA 4GZJA 1UD8A 3OBAA 4JFUA 3M07A 4JCMA 1JZ8A 3I3EA 1WP6A 2VZUA 1BF2A 3BAXA 5EBAA 2QV4A 3VGHA 3AIWA 3FAXA 3WEOA 4MDPA 5M03A 2YL9A 1GORA 4YHEA 3VDAA 3NYDA 4PMRA 1B31A 3ZO9A 4AISA 3VD3A 1TMQA 5JIWA 3T2QA 3HMCA 1EGZA 2OYLA 3AMLA 4MB4A 2YOCA 4EK7A 3GH5A 4BQ5A 3GNRA 4PRWA 1VFUA 1HX0A 2DSKA 3L4UA 5D9OA 5I79A 3CUHA 3EDJA 5E6YA 3AIVA 3AYRA 4PUDA 1QBAA 4GKLA 3WNLA 1E6SM 3DYPA 3T09A 3U7VA 2ZICA 2J8FA 3AROA 3ARWA 1E15A 1UD2A 1JIBA 1JDDA 4D6HA 1ZBWA 1WDQA 1ISXA 1LL4A 2V3FA 4OBRA 1E4LA 4JKKA 3DC0A 4GINA 3SUVA 2ZWYA 3W0KA 3U57A 4MB3A 2GJPA 1CEOA 2CITA 2D3LA 4RE2A 2W4XA 2VX7A 4MB1A 2WVTA 3PZVA 1LJYA 1V3KA 4YN5A 3J7HA 2JE8A 1FA2A 1WDPA 3MUAA 2CEQA 3WBAA 3WQ6A 1E6RA 1NOUA 1B3WA 5I78A 2BY0A 2IXVA 1CLVA 4AD5A 4CD7A 5LA0A 1ODUA 3VTRA 1CIUA 4PUEA 1SYTA 4WK9A 1V03A 2OYKA 3APGA 4TXEA 4MTVA 4ACYA 2V5DA 4DWSD 2Q8XA 3TTOA 1ZL1A 1U33A 2EPNA 2DH3A 2AAAA 4CN6A 5ABGA 3TONA 1VAHA 1LG1A 3WL1A 4AW7A 5DF0A 3VNYA 3CO4A 1V02A 5A6JA 4JFVA 3EMQA 5ABEA 1UWRA 5JUVA 1OGGA 4HA1A 1EQPA 3ZJ6A 5I5RA 3CZ8A 1HF6A 1A47A 1F4AA 3FXYA 3ZSTA 4P8XA 1V3JA 3AHXA 1NOFA 3AHZA 2E3ZA 4IPLA 1UR0A 1BLIA 1UG6A 4IPNB 4U3CA 4WKHA 1UD3A 2F8QA 1AMYA 4MPKA 2WZIA 2CNCA 4H7VA 4QAWA 1UH2A 4DWSB 1GJUA 2W5FA 2XIIA 1EQCA 2ZX7A 1D2KA 5EB8A 4B3LA 2BHUA 2WHLA 3RM9A 2RGLA 4JL2A 4QP0A 1E43A 3VU2A 3THCA 4J28A 1UZ4A 2DSZA 3W27A 3CBWA 1C93A 4AEEA 5DMYA 1EH9A 3FAWA 1UOKA 3VDBA 2WK2A 2XM2A 1JYNA 1NARA 1C8XA 2J7DA 4TTGA 3MMDA 2VURA 1R87A 1N82A 1XSKA 1R7AA 4BZYA 1RP9A 2YL6A 3RPMA 1JYVA 2J7HA 4TX6A 1HP4A 4EANA 3G6MA 2OSWA 4UQEA 2X8RA 3CUJA 1JZ4A 2G3NA 3GXFA 2EXOA 1FH7A 1MQPA 1YQ2A 2DEPA 2PC8A 4YPJA 1CXLA 5BXRA 1MWOA 2ZUSA 1I1XA 2EPLX 4OUEA 3CMGA 1EDGA 2XJ7A 4UCFA 1XH2A 3ARSA 3O6AA 5E0FA 4UOQA 3AMDA 1JYXA 2OWXA 3VIKA 3CUIA 3MV01 4BF7A 4BS0A 2V3GA 4MNJA 4J3XA 3SCOA 1VFOA 4W5ZA 5FIPA 3EMZA 4HP5A 5IFTA 2ZUTA 5M5DA 4HA3A 1J0KA 4F66A 1LL7A 3SURA 2CBUA 2FH8A 2VRJA 2VT0A 2DT3A 1ZBVA 4Y7EA 1JAKA 8A3HA 4JFWA 1ZJAA 3PZMA 1MYRA 4ACZA 2EPOA 1W32A 2AMGA 3BLKA 2EBNA 3ZQ9A 2BV9A 6CGTA 1V3IA 2DQXA 2O9OA 2WSPA 4WKAA 3VMOA 4AD1A 3WMCA 2WAGA 2DSVA 1LQ0A 1MXGA 2BVYA 1KR1A 4EAMA 3WEMA 4WJXA 1KGUA 1TA3A 2DPEA 1MFVA 2YLLA 4IM4A 3SCVA 3AJ7A 4D1JA 1BGGA 4S3KA 3PZOA 1TUXA 2WVVA 1QI3A 2J7BA 3ARXA 4PMYA 4PMXA 4J3WA 3L4VA 1VRXA 4P7LA 1MFUA 2D23A 1HVQA 1WPCA 5A94A 2DT0A 4CU8A 2GJXB 2W63A 5E0CA 1H11A 4Z2IA 1E6PA 2JF7A 3GTNA 5HNNA 1JZ2A 4UQDA 3WD3A 2ZUMA 4W8LA 5CQ1A 4HPGA 1JAEA 3GM8A 1QBBA 4H8HA 1GUVA 1G0CA 1V0NA 5IDIA 4JCLA 4AD2A 1J0ZA 2G41A 1GHSA 3WL0A 4ZXLA 1JFXA 1XHGA 3OIHA 3QGVA 2E9LA 1BFNA 4PMQA 5BCAA 2CCRA 4R27A 5GNZA 3CHEA 2YIHA 5FL1A 1KXVA 3BAJA 3B9AA 3WF3A 4Z2HA 1MQRA 1SMDA 5ABFB 1FOBA 1DTUA 4F8XA 3T0DA 3FHAA 3AIEA 1PX3A 2ZUVA 3L2LA 3WH9A 1SMAA 1HJUA 1G01A 3CHCA 2W61A 1O7AA 1NWSA 4OIFA 1MW0A 5CLTA 2CBJA 3AMCA 3W28A 1GOQA 4JAWA 1JFHA 3SCPA 2W91A 3GXMA 2OLHA 2XVLA 4E8DA 1DWFM 3L4YA 3VVGA 5A8OA 4ZFMA 1IT0A 1HJVA 3WNPA 4JFSA 2V5CA 1ZS2A 3CHDA 3WQ5A 3T0BA 1UWQA 3B9EA 3WD0A 4PBGA 3RIKA 4UZSA 1W3HA 4IISA 5D8WA 3L4ZA 5TD4A 2PWDA 2VJXA 2VRQA 2WZEA 4HA4A 3CZEA 1QOXA 2XWEA 2EPMX 2D22A 1CPUA 2XYLA 1LL6A 1H0IA 3AXHA 3GYCA 3MU7A 3W26A 1HL8A 2J78A 3WMSA 1QVBA 4P8VA 1K9TA 3RJXA 5LYRA 1GQIA 1HIZA 3ZR5A 4NI3A 9CGTA 1WO2A 1D3CA 5F7UA 3CZLA 1DWHM 2X09A 4N0RA 1WZAA 2WMGA 4RL3A 2VNCA 1OCQA 5E09A 3WFZA 1J9YA 1V6VA 4DUXA 5A8PA 2IUZA 4D6CA 2CBVA 3WEZA 4B9ZA 3AHYA 3VO0A 2W66A 1QI2A 1HVXA 2J4GA 2ZIDA 1QW8A 3VMPA 3ARTA 4BQ4A 3MKKA 3ZT7A 3KE0A 1E4NA 5IFPA 1GQJA 3VIGA 3ARZA 1DWIM 2XGIA 4NSBA 2UY5A 1HKJA 4ATLA 2PWEA 3GH4A 3WNKA 5A8NA 3AMGA 2A3AA 2ZXDA 1PBGA 1BAGA 2ZOXA 3WF1A 2BXYA 1W9DM 4PEEA 3VMNA 1WB0A 3ECQA 2E0PA 1M53A 2X1IA 3WNOA 1KBKA 1B90A 1U30A 4TVUA 1MXDA 2XTKA 1UR4A 3CIVA 3WD1A 2EQDA 3AFBA 3WDJA 4FLRA 2E8YA 2WMJA 1JL8A 4DWSA 4QLJA 4W7UA 1NWUA 1DWAM 5GNYA 1E72M 2WLZA 3ARUA 5AY7A 4AZ7A 2FHCA 3ALGA 5A6SA 3WN6A 3RM4A 4MNLA 3AS0A 2C7FA 4MDOA 1CXHA 4NF7A 2WC7A 4U2YA 3S2CA 3EDKA 4HMEA 1FP8A 3WUEA 4J3TA 2X0HA 3W4RA 4AZHA 3N13A 2WWCA 3FY1A 4KGLA 3CUFA 3WBEA 3AZSA 1IV8A 1J0JA 3AS3A 4XUYA 4MAZA 3BAIA 1TVPA 3LPOA 4WLCA 3QHOA 5AYBA 2YKKA 2D0FA 5C70A 1H3GA 2WM0A 2XHYA 1L0PA 4D6GA 2EJ1A 4MB5A 3WQ4A 2Z1SA 3IK2A 3WQWA 2J7CA 2J7GA 2UY3A 2VTFA 2GDUA 1H0GA 2C0HA 1TFVA 4HU0A 5D9NA 1WZKA 2WVUA 4V2XA 1FP9A 1U2YA 1J11A 1CGTA 2BVDA 3I3DA 2YBUA 3RCNA 1W9VA 1CDGA 3KWXA 4MJ4A 3ZR6A 4B3KA 3AXXA 1CECA 2XFYA 2PBOA 1J0HA 3VGDA 1ODZA 1CENA 1JYWA 3LMYA 5AC4A 2VI0A 3MSGA 3PZNA 3BAKA 4JHZA 3VKKA 3W37A 1GQLA 1H4PA 1IZJA 1E1FA 1G1YA 1NP2A 3OGSA 3K46A 4GI6A 2OWCA 3ZMRA 1V6XA 4ZENA 4PMOA 3U5UA 3QOMA 5I3DA 2J8GA 5A2AA 1X1NA 5ECUA 2YA0A 3AIQA 4P7NA 2EPKX 2D2OA 3BSGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4AZC A;  1GOK A;  3B8S A;  2WLY A;  3N18 A;  4QLK A;  3WQ8 A;  3UES A;  1I1W A;  3OZP A;  3TTS A;  1FH8 A;  2O9T A;  2QMK A;  2AOS A;  4OKD A;  4W5U A;  1XGZ A;  2J62 A;  1VFF A;  3AI0 A;  1HJQ A;  4HMD A;  4J3V A;  6TAA A;  1JD9 A;  4DWS C;  3OB8 A;  4TVD A;  3BH4 A;  4W87 A;  4DUV A;  1JZ5 A;  2CYG A;  1GON A;  2UY4 A;  3BAW A;  1E55 A;  1XYF A;  3W53 A;  3VD7 A;  3LPF A;  1CXK A;  1Q6G A;  1XD1 A;  3N1A A;  2DT2 A;  5CPS A;  4WSJ A;  1GCY A;  1JXK A;  2QLY A;  3WF2 A;  1FFR A;  1BVN P;  1CTN A;  4JHO A;  1V0L A;  3AOF A;  2Y4S A;  1DWJ M;  1SR0 A;  1VEM A;  4A3H A;  1C8Q A;  1W3K A;  3PBG A;  1E3Z A;  2D0H A;  4KMQ A;  3BLP X;  2BFG A;  3TOP A;  4KGJ A;  1GZJ A;  2JF6 A;  3BAY A;  2ZX9 A;  2QF8 A;  4GO8 A;  3K4D A;  5A6A A;  2VOT A;  1XCX A;  1KBB A;  4DM2 A;  3ALF A;  1VIW A;  2FDM A;  4TUF A;  3DEC A;  2X05 A;  1GOI A;  2CES A;  1LLO A;  1CGY A;  3IAN A;  2OSY A;  2CIP A;  3TTQ A;  1M04 A;  3VIN A;  3WNN A;  2QPS A;  4EE9 A;  5A6B A;  1XCW A;  1V0M A;  4OOU A;  2WNW A;  3VD4 A;  5KZ6 A;  3SCQ A;  5HOS A;  2CXG A;  1H41 A;  3UG4 A;  1VEN A;  2YJQ A;  2J79 A;  5HPO A;  3N15 A;  3ARY A;  1OB0 A;  1WE5 A;  5AC5 A;  4UOJ A;  4WSK A;  5HPC A;  5CPQ A;  1G5A A;  2VO5 A;  3PHA A;  3CPU A;  4FLS A;  1XSJ A;  2ZX5 A;  1KGX A;  3BXW A;  3MUY 1;  4CVU A;  4F79 A;  2JFE X;  1OGB A;  5CGT A;  2CHO A;  4W89 A;  2NSX A;  3WSU A;  1J0I A;  3BCD A;  1UD4 A;  4UNI A;  1UKQ A;  5DEZ A;  2A3H A;  3WFL A;  1QHP A;  4UFM A;  1KWG A;  5BRP A;  3L4W A;  5C71 A;  1E9L A;  2VR4 A;  1CYG A;  4H8U A;  5KEZ A;  4X0N A;  2J75 A;  2WMF A;  2YDS A;  4U33 A;  1CXF A;  2CET A;  3A47 A;  4P8U A;  3VIJ A;  3AQU A;  1E5N A;  1UWT A;  2QMJ A;  1HNY A;  2XWD A;  7A3H A;  4CD6 A;  4Z2J A;  1OT1 A;  3PZT A;  3IJ9 A;  1G9H A;  1ITX A;  2C8N A;  2WC4 A;  2E40 A;  2WPG A;  4U2Z A;  4ML4 A;  1UH3 A;  2VR5 A;  4U3A A;  3L4X A;  3LPG A;  1E5J A;  5DT7 A;  2XGB A;  1JZ3 A;  4DM1 A;  3RME A;  2FHB A;  1OGS A;  3PTK A;  2HVM A;  1H1N A;  1KGW A;  1GJW A;  2FGL A;  1GNX A;  3PZI A;  5JBF A;  1EIB A;  1V3M A;  2J47 A;  1V02 E; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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