3PZIA

Structure of the hyperthermostable endo-1,4-beta-d-mannanase from thermotoga petrophila rku-1 in complex with beta-d-glucose
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
357
structure length
357
Chain Sequence
FRFIGSNNYYMHYKSNRMIDSVLESARDMGIKVLRIWGFLDGESYCRDKNTYMHPEPGVFGVPEGISNAQNGFERLDYTIAKAKELGIKLIIVLVNNWDDFGGMNQYVRWFGGTHHDDFYRDERIKEEYKKYVSFLINHVNVYTGVPYREEPTIMAWELANELRCETDKSGNTLVEWVKEMSSYIKSLDPNHLVAVGDEGFFSNYEGFKPYGGEAEWAYNGWSGVDWKKLLSIETVDFGTFHLYPSHWGVSPENYAQWGAKWIEDHIKIAKEIGKPVVLEEYGIPKSAPVNRTAIYRLWNDLVYDLGGDGAMFWMLAGIGEGSDRDERGYYPDYDGFRIVNDDSPEAELIREYAKLF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural characterization of a novel hyperthermostable endo-1,4-beta-D-mannanase from Thermotoga petrophila RKU-1
rcsb
molecule keywords Mannan endo-1,4-beta-mannosidase. Glycosyl Hydrolase family
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga petrophila
total genus 154
structure length 357
sequence length 357
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2010-12-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3pziA00
3GXDA 5BRPA 2CKSA 4QCFA 4QP0A 1NM9A 4AZHA 2G3JA 2WVUA 1E6SM 4C7FA 3PZTA 1FOBA 4Z2GA 2J75A 1W32A 1HL9A 4JFWA 3AS1A 5C71A 3W29A 2W5FA 1UA7A 3CMJA 3UERA 3AICA 4PMDA 1WDQA 1TA3A 3AMCA 2X0YA 3PZVA 1BPLB 3L4WA 2BFGA 5D9PA 5IFTA 2BXYA 2FH8A 5DT5A 3VVGA 1JZ5A 1F4HA 4DWSB 4RE4A 5FIPA 2CESA 1KR0A 1UR8A 5DEZA 4MPKA 1BYAA 3CZJA 1EO7A 1QBAA 2WVVA 1M53A 4UOQA 2VX5A 4M56A 5E6YA 2WHLA 4W5ZA 3UESA 1CNVA 3U5YA 4AIOA 1DWGM 5CGMA 3VMPA 1JZ2A 1JF6A 3K8MA 3N12A 3NSNA 5BCAA 2CYGA 4PMUA 4UFMA 1EGZA 1JZ7A 1JG9A 3PZGA 2WC7A 4J3WA 1E1EA 2XVPA 3WD4A 1PIGA 1H09A 1OINA 3EMQA 5GNZA 4NSBA 3AXHA 3AIUA 1UD8A 2FH6A 2J79A 3CUGA 1HP5A 1E5JA 4MADA 3WNNA 1B1YA 1BYDA 1W9PA 4D6HA 3RILA 2QF8A 1CPUA 1GW1A 3PBGA 5I5RA 3CMGA 2VZOA 1KQYA 3I3EA 4CD4A 2EPLX 3VD9A 2IUZA 1PX3A 3WF2A 2EEXA 1I1XA 1CXFA 3FAXA 1OGSA 4HU8A 1H3GA 1XSIA 2BY3A 3WD0A 3GH7A 3GNOA 5DO8A 3ZSSA 3OGSA 2UY4A 1B2YA 3PN8A 3BAWA 4MNJA 1VEMA 3ZMRA 5A8MA 5A2AA 1D3CA 3WELA 3MMDA 4D72A 4W5UA 1V3HA 2VR4A 3LPOA 2V5CA 4PMOA 1V3IA 3AMKA 3ARUA 1G9HA 2WMIA 4PMVA 4WJXA 3GXIA 1PBGA 4A3YA 4MNKA 4EAMA 1PIFA 4D1JA 1H11A 1WO2A 5HXMA 3S6TA 1S46A 1GZJA 4W89A 1C7TA 1V3JA 2NT1A 1HJXA 1GORA 5E70A 3WNPA 4JL1A 5I23A 1DWAM 3ZT7A 1QVBA 2YDRA 1UWSA 5CLWA 3POCA 1RP9A 1EHNA 4MDPA 3ZJKA 5JBDA 2XM2A 1GOOA 2XM1A 3WDIA 1EIBA 1KWGA 4AEEA 1P6WA 4YHGA 3UR7A 4HMCA 2WZEA 1BLIA 4HZ7A 2ZXBA 2WMHA 4UFKA 3AXXA 2VQUA 3DECA 1YHTA 3B9AA 1CYGA 2D3LA 2VX6A 3WL1A 1J11A 2YBTA 3IJ9A 1LF1A 1NOUA 1LL6A 3ARQA 1VJZA 3F5JA 1FH9A 2WZHA 5ABHA 3K4DA 2J7GA 3PZOA 1JI1A 3J7HA 4AZ6A 4HZ8A 4Z2HA 2J7DA 2BY1A 3IAPA 1B3XA 4UQBA 3L4TA 1JL8A 3W53A 3NYDA 5KZ6A 2WBKA 1J0JA 3CHEA 4PN2A 2QV4A 1JZ3A 1R85A 3UG5A 1JIBA 4D6JA 1QI5A 2JF6A 4Q22A 1E55A 5A6JA 3ZT6A 4PCSA 3VGHA 3CHDA 1ZBCA 5CJ5A 1PX4A 1ISZA 3F4VA 4CN6A 3FW6A 3GNRA 1GVIA 2ZOXA 4XX6A 3DYPA 2WPGA 3L4XA 1GJWA 3OGRA 2WB5A 2GK1B 2D20A 3L2LA 1MFVA 3N1AA 4J3SA 1BGGA 1UOKA 3DC0A 2VMFA 1CBGA 4MB3A 2Y24A 1J10A 4D6EA 4W86A 4Q7NA 3BCFA 5A8QA 5CSUA 4X0VA 1QW9A 1BHGA 2IXVA 2O92A 2D24A 5A8OA 3MUAA 3ZIZA 1H1NA 1C92A 1H0IA 2DQXA 1PAMA 1HIZA 2GJPA 3AFBA 4M24A 5I79A 1HKKA 1X6LA 4W84A 3CZEA 1W1TA 1QW8A 2W4XA 5A94A 2PWHA 3OLGA 3DHUA 5D9OA 4H41A 3W82A 2VVNA 3NSXA 3E1F1 3K46A 3FAWA 4F9DA 3VM5A 1J01A 2J78A 1G0CA 1FFRA 3DYMA 2D22A 1E72M 4IUGA 3VD7A 4HTYA 3T09A 1BG9A 4TOQA 1FA2A 2CBIA 2EPMX 2OWWA 4UOZA 1CENA 4AWEA 3NCOA 5HOSA 1VFMA 5AC4A 5I78A 3QHNA 5AC5A 1VEPA 2A3HA 2GVYA 3GDBA 5IHSA 4EE9A 4CU8A 3AZSA 1OIFA 5A8PA 1LWJA 3RDKA 3WUGA 4AIEA 1NOWA 1UWQA 2WKLA 1E6XM 4CD8A 2J7HA 3MV01 2XYLA 1W9UA 1MQQA 4PEEA 2J7EA 3AZRA 1CGXA 3K4AA 5LA1A 3OBAA 3QGVA 4C7DA 4FLOA 3MMUA 3OLIA 1XHGA 2VX4A 1AQHA 1ISYA 1K9EA 2WW5A 4MB4A 1HVXA 3QHOA 2DSKA 1E0WA 1CGYA 2VCBA 3BXWA 3WDJA 2Q8XA 3CUIA 3WF1A 1RP8A 5I2UA 3BAKA 1UZ4A 3CUHA 2ZWYA 1HJQA 3WD3A 1OWQA 2VT0A 4HOZA 1BTCA 4OUEA 2JEQA 3BAYA 3AIRA 5ABFA 4KGLA 1V08A 3MV11 5E0FA 3AOFA 3WUEA 1CIUA 3WD1A 3M6DA 1TVPA 4P7NA 3EDKA 3KL5A 3KL0A 3HN3A 1HNYA 5BXPA 4LYPA 2E8ZA 4UQAA 3RPMA 4P8XA 2D0FA 5FCZA 1J0IA 2UWFA 2WMFA 3VIMA 2QHAA 2YKKA 1EDQA 3SCOA 4PBGA 4U31A 2CITA 4JFVA 2VX7A 4Y7EA 2J7BA 1KBKA 5BROA 3AHXA 1FHDA 3W28A 3VM7A 1D7FA 2XFFA 1ZS2A 1UQZA 4PMRA 1J18A 1DWIM 3PTMA 4WKAA 4P7OA 1LG2A 1JAKA 2YA2A 5I77A 3VGDA 1J9YA 1H41A 3N13A 1HT6A 1GQKA 1CWYA 1WCGA 4FK9A 4TX6A 3RMEA 4D6CA 1JF5A 3WDPP 2ZUUA 2F2HA 3WH6A 5E9AA 1OT1A 1UWTA 1FH8A 1MW2A 2OLHA 3CZLA 1RPKA 3F5LA 3AROA 2DT0A 4E2OA 3ZJ6A 4D6DA 4GO9A 4BQ3A 1CXLA 1DWHM 2EQDA 2PC8A 1LLOA 3VIFA 4N42A 4FLSA 3A4WA 1M03A 3G6MA 1M01A 3WY1A 4U5IA 3AS0A 5DT7A 3AIWA 4PYSA 3SCSA 3WN6A 1VF8A 4UOJA 3ZQ9A 1B31A 4MJ2A 5JIPA 1NH6A 1G1YA 4AZCB 3WFLA 1KCKA 4P7LA 2O9TA 4R5EA 3OZOA 3L2MA 1BF2A 3OG2A 2CCRA 3SIMA 1NWSA 4IM4A 1B90A 4DWSD 2VCAA 1NWRA 2Z1KA 3T08A 3IK2A 9CGTA 2WMJA 3W38A 5IFPA 4H04A 3PZQA 3B9EA 4NZCA 3BCDA 3VO0A 3AJ7A 3FHQA 2V3FA 2J25A 4AD1A 4AD3A 4XZWA 4KGJA 4U3AA 1W3KA 4Z2JA 1UKQA 1DEDA 1E15A 3THCA 4ZXOA 4AZGA 3VDHA 3GZAA 4ATWA 4MDOA 4D6FA 3W25A 3THDA 1V6UA 1R87A 3UG4A 4GI9A 5M03A 5LA0A 2XFRA 8A3HA 5BXSA 1G01A 5CGTA 3CZGA 1BFNA 1UH4A 3UEQA 2JIEA 3MS8A 3WH7A 5CPTA 1JDAA 2GJXB 2BV9A 1O7AA 2D0HA 4FMVA 5A3HA 3WQ5A 2Z1SA 3GTNA 2XPKA 2BS9A 2J7CA 3VKKA 1D2KA 1E70M 3RJXA 3CH9A 1ISWA 3VDBA 3EMZA 2WC3A 2E8YA 5EMYA 3W27A 3WH9A 3AHYA 3KZSA 3ZR5A 1ITCA 1UKTA 1JFHA 1OB0A 1QNPA 1G94A 3MUZ1 6A3HA 3WF0A 4N0RA 4D6GA 3PTQA 3JUGA 1V0MA 3WQWA 2WCGA 4PSPA 1HJVA 4CD6A 1LL7A 1PEZA 2XGBA 3WNLA 5E6ZA 4ZE4A 3SCVA 5IXEA 2GFTA 4RL3A 3IJ8A 4TTGA 1MVYA 2WC4A 2X2YA 4UFLA 3A3HA 1UD6A 2UY3A 1W3JA 1GQJA 3VIGA 3W4RA 2FHFA 2ZX6A 4QFUA 4BQ2A 4DUWA 2ZXAA 2OSYA 1GCYA 1KXVA 5BYWA 3VIHA 1V02E 2NW0A 2CIPA 2G3NA 1EDGA 2XIIA 2CXGA 3SCPA 1XGZA 3AHTA 5A6KA 2ESCA 5HPOA 4HMDA 3QR3A 3VIPA 1GPFA 1QHZA 1V0LA 1H5VA 1RH9A 2QPSA 3BAJA 1ODZA 3EBVA 4AYSA 4F79A 1IT0A 5A69A 4DUXA 1JDCA 3I3DA 3ARVA 2ZUMA 1JZ6A 4Z2KA 1C3FA 2OYMA 2WHJA 2GDUA 1MW3A 3MU7A 4UTFA 4OOUA 1EQPA 2HVMA 4EK7A 3WL0A 2DSWA 5D9MA 3S2CA 1F4AA 5E0CA 4L4PA 1HJWA 4L4OA 4ACYA 7A3HA 2GJRA 3RCNA 4M80A 1E4IA 4M29A 3VD4A 2J62A 1ESWA 2X05A 1V3MA 2WHMA 4W8BA 2BXZA 3AS3A 3GM8A 5FL1A 2RGLA 1G5AA 3CUFA 2PWDA 2G8ZA 5AY7A 5A95A 1X6NA 2WVSA 3L4ZA 2VTFA 3TOPA 3AHZA 1ZL1A 4AXNA 4TX8A 1E6QM 2VNCA 4V28A 3KWXA 4LYQA 3ARSA 2ZX8A 3PZ9A 2JIWA 4P7RA 1GOQA 1UWIA 1TZ7A 1CXHA 1NWTA 2WK2A 3NUKA 2BHUA 4GPNA 5HBFA 1FHLA 3AXIA 3O6AA 2YLAA 1EHAA 3WIJA 2PBOA 4AD4A 1M04A 4F66A 4E8DA 1CXIA 2JFEX 2J47A 4P7QA 3MUY1 1JD7A 2WLYA 1V6YA 4WK9A 5LYRA 1HP4A 4A4AA 1MWOA 4CD5A 1UH3A 5DMYA 4A3HA 2WM0A 2G41A 3BSGA 1VBRA 2A3BA 4JCMA 1QI4A 1GHRA 3K8KA 1E4NA 3OZPA 4FF5A 1VEOA 3U57A 4PRWA 5I24A 3WQVA 1AMYA 2YL5A 2CETA 1ITXA 3MO4A 3ZR6A 1C7SA 2YA0A 4W8AA 2WCAA 3BAXA 4TTUA 5AYBA 1W9XA 4HZ6A 3ALFA 1UHVA 4J3UA 3WF3A 1E73M 4H8UA 3WKZA 2XWDA 1OGGA 3EDEA 3FY1A 4WF7A 2YIHA 1EQCA 1KQZA 3EYPA 4E4PA 1VFFA 1MXGA 5JIWA 1XYZA 3RO8A 4CU6A 3OA5A 4C7GA 4KWUA 3SCQA 5CSYA 3W6MA 2X1IA 3BSHA 3NSMA 4LPCA 1CTNA 3AS2A 2XWEA 1JI2A 1OD8A 4GZIA 1TA3B 1HL8A 1WDRA 2JEPA 5A1AA 3WDHA 1UH2A 1XSJA 3OGVA 4QLJA 4HOWA 1GHSA 6CGTA 3PZIA 2DEPA 1TMQA 3EMCA 1CZ1A 1PPIA 3SUWA 3IAQA 3AZTA 3WNOA 3QOMA 5DF0A 2CHNA 3WH5A 2MANA 2Y8VA 1BGAA 2WVVB 1W3HA 4PMZA 1ISXA 1Y7VA 4WSKA 1VBUA 2D23A 2VL4A 4F9JA 3DHPA 4W8LA 1AVAA 2BVDA 4CD7A 4AMCA 2BVTA 2DSUA 2V5DA 3ARXA 1XD1A 3ZJ7A 3ARWA 2WHKA 2XVNA 5GNXA 1UG6A 1W3LA 4P8VA 5JUVA 1JYNA 2XIBA 2DSZA 2BNJA 3VX1A 2JALA 2VRKA 4B3LA 4CVUA 3ZSTA 1KCLA 1CDGA 4M1RA 1TFVA 2ZIDA 4WIWA 4GO8A 1MQRA 4MB5A 2J7FA 2WLZA 1QNQA 4YN5A 1UD2A 1XH2A 2B31A 4JZ5A 2YBUA 1K9DA 3WNMA 3K8LA 1R86A 5HPCA 4KH2A 2E9MA 2CKRA 3AIEA 1V02A 3CZ8A 3WNKA 3BH4A 4OOZA 2VZUA 2OYLA 4AC1X 4WKHA 5KEZA 4WKFA 4JFUA 5A6BD 4R27A 3PTKA 4H8HA 1EA9C 1EH9A 3SCUA 1NOFA 1GONA 4V27A 4S3KA 1TCMA 1SYTA 1WDSA 4CCCA 3CPUA 1GQIA 4B15A 2J74A 1E1FA 5CPQA 3AMGA 3VPLA 1E6PA 4U5KA 1FH7A 1GUVA 1K9FA 2ZX5A 2BY2A 1N82A 2CHOA 3N11A 4PUEA 4CCDA 4PSRA 2VOTA 1KFWA 3EDDA 1W1YA 3RM9A 4PUDA 4PMYA 2DIJA 4CN1A 3VGGA 1SFSA 2PI6A 2D0GA 2VZTA 4Z2IA 3L4VA 2V3EA 1HKIA 1E6RA 3TP4A 1JFXA 2WMGA 1UD3A 3NDZA 1WNOA 2DIEA 4NI3A 4WLCA 1US2A 1E43A 4FLRA 4F8XA 2WWCA 3AI0A 3CHCA 3AYRA 4OJYA 2QLYA 4AD0A 2J77A 1B0IA 4M8UA 3ZOAA 3CUJA 5M3WA 4JIEA 2EXOA 3QOKA 3RJYA 2ZXQA 1E40A 1XH1A 1CECA 1LQ0A 2CBUA 1EXPA 1VFOA 1HJUA 5AYIA 2ZICA 5ABGA 2W92A 2E4TA 3AMDA 2DPEA 2FHCA 1UKPA 2E9BA 1JD9A 1KXTA 3MSGA 3CIVA 4U2YA 5BXTA 1ECEA 1NP0A 3KL3A 2EBNA 2W67A 4LX4A 4BF7A 2VZVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3GXD A;  5BRP A;  2CKS A;  4QCF A;  4QP0 A;  1NM9 A;  4AZH A;  2G3J A;  2WVU A;  1E6S M;  4C7F A;  3PZT A;  1FOB A;  4Z2G A;  2J75 A;  1W32 A;  1HL9 A;  4JFW A;  3AS1 A;  5C71 A;  3W29 A;  2W5F A;  1UA7 A;  3CMJ A;  3UER A;  3AIC A;  4PMD A;  1WDQ A;  1TA3 A;  3AMC A;  2X0Y A;  3PZV A;  1BPL B;  3L4W A;  2BFG A;  5D9P A;  5IFT A;  2BXY A;  2FH8 A;  5DT5 A;  3VVG A;  1JZ5 A;  1F4H A;  4DWS B;  4RE4 A;  5FIP A;  2CES A;  1KR0 A;  1UR8 A;  5DEZ A;  4MPK A;  1BYA A;  3CZJ A;  1EO7 A;  1QBA A;  2WVV A;  1M53 A;  4UOQ A;  2VX5 A;  4M56 A;  5E6Y A;  2WHL A;  4W5Z A;  3UES A;  1CNV A;  3U5Y A;  4AIO A;  1DWG M;  5CGM A;  3VMP A;  1JZ2 A;  1JF6 A;  3K8M A;  3N12 A;  3NSN A;  5BCA A;  2CYG A;  4PMU A;  4UFM A;  1EGZ A;  1JZ7 A;  1JG9 A;  3PZG A;  2WC7 A;  4J3W A;  1E1E A;  2XVP A;  3WD4 A;  1PIG A;  1H09 A;  1OIN A;  3EMQ A;  5GNZ A;  4NSB A;  3AXH A;  3AIU A;  1UD8 A;  2FH6 A;  2J79 A;  3CUG A;  1HP5 A;  1E5J A;  4MAD A;  3WNN A;  1B1Y A;  1BYD A;  1W9P A;  4D6H A;  3RIL A;  2QF8 A;  1CPU A;  1GW1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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