3BW4A

Crystal structures and site-directed mutagenesis study of nitroalkane oxidase from streptomyces ansochromogenes
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
350
structure length
347
Chain Sequence
SALTDLFPLPIVQAPMAGGVSVPQLAAAVCEAGGLGFLAAGYKTADGMYQEIKRLRGLTGRPFGVNVFMPQPELGAVEVYAHQLAGEAAWYETELGDPDGGRDDGYDAKLAVLLDDPVPVVSFHFGVPDREVIARLRRAGTLTLVTATTPEEARAVEAAGADAVIAQGVEAGGHQGTHRDSSEDDGAGIGLLSLLAQVREAVDIPVVAAGGIMRGGQIAAVLAAGADAAQLGTAFLATDESGAPGPHKRALTDPLFARTRLTRAFTGRPARSLVNRFLREHGPYAPAAYPDVHHLTSPLRKAAAKAGDAQGMALYAGQGHRMARELPAGRLVEVLAAELAEARTALS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Streptomyces ansochromogenes
publication title Crystal structures and site-directed mutagenesis study of nitroalkane oxidase from Streptomyces ansochromogenes
rcsb
molecule keywords 2-nitropropane dioxygenase
total genus 128
structure length 347
sequence length 350
ec nomenclature ec 1.7.3.1: Nitroalkane oxidase.
pdb deposition date 2008-01-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03060 NMO Nitronate monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3bw4A00
5DLCA 1WQ5A 4LVFA 5KZMA 3N9RA 3LXBA 4JX4A 2C14A 4Z1BA 4XTIA 1KLYA 3NDOA 2NXHA 1QPRA 1QNVA 3NXFA 2A7NA 1TV7A 1A5AA 2JKPA 3IRDA 2YFOA 3DGRA 3NG3A 2ZRXA 3O8AA 3NAVA 3ABSA 2YSWA 3W23A 1G67A 3PUDA 2VENA 1R30A 2J24A 4NX0A 2BLEA 2ZZ4A 2WSRA 1TV5A 4M5PA 3G18A 1H51A 2W0UA 4LVGA 4GUFA 3H54A 4RR4A 1QR7A 4TIMA 3HGSA 4J9JA 1Z42A 2B0MA 2ZZ5A 3L5MA 3UWVA 2NX1A 2CLEA 4LOCA 3I65A 4XUGA 5F2IA 4AH7A 4GC4A 1JCYA 3HB9A 2PRMA 3P62A 3M5XA 3R13A 3EX3A 1O5XA 5LKYA 4Z1AA 2VOMA 2YXGA 1ALDA 3JS3A 2VFFA 1QPNA 1H63A 1A5BA 2LLEA 4DO5A 4LUJA 1LDCA 3VFLA 5L9FA 1RZMA 1KBIA 1YPFA 2QUUA 3MI6A 1VCVA 4M19A 2J9XA 2VEPA 1G4SA 3LM7A 1W0MA 1SZNA 2NX3A 4JY9A 2QF7A 1GTEA 2FDSA 4K6AA 3PG9A 4NZJA 4O18A 3SGUA 2RDUA 5LGZA 5AB3A 3U6WA 4LT9A 1SUXA 3BG5A 4HNNA 2WNZA 4RZ6A 4DQWA 2Q3RA 3W7JA 1XDMA 3NPWA 3LCHA 4IGHA 1WXJA 3OVQA 3G1DA 3TKFA 5D30A 3STGA 2J88A 3TMQA 5DELA 4NQ1A 4ZMGA 1Q3NA 3ATZA 3O6DA 2HS8A 5LNRA 1TSIA 2A4AA 2I9EA 4P61A 2PRLA 4O19A 1KTBA 2J9ZA 4IPIA 2CWNA 5LZLA 3LLDA 3L65A 4GUGA 2WOQA 4BWLA 1R46A 5AC7A 4CCDA 1EPXA 5CGQA 3W1MA 3WK1A 3U2OA 1OFPA 1S5TA 4HSOA 3LI1A 4QNWA 1FDJA 4UR8A 3IVUA 3T44A 4EF8A 4M6VA 4H6KA 4PTNA 4O1DA 4MYAA 1LRTA 2EAWA 1S5WA 1XC4A 3W7LA 3RK8A 4MFDA 5E1QA 2Y7GA 2FPTA 2NV2A 1R2SA 3DHFA 3NPUA 1LBLA 4L4LA 3L5AA 3N34A 3W6YA 3FOKA 1V7YA 2V0TA 2BXVA 3W7OA 4R33A 1RQHA 3S1XA 3EKLA 4UFJA 2W6RA 2J27A 3W70A 1K8YA 4M6QA 2YW4A 3GDLA 3ELFA 2RDTA 3W7IA 5FI8A 1GJPA 3KXQA 3UQNA 3S5OA 2VFIA 4AWTA 5D2YA 3QC3A 3LCGA 1EP1A 2VFGA 3C56A 3EX1A 3ABRA 3C61A 3LTPA 4S2CA 1VCFA 3OBKA 3WJYA 3SECA 4ZQCA 1JCLA 3W1AA 4BI6A 1FDYA 3QH2A 4O57A 1DBTA 4CQ9A 1MZHA 2QCDA 3DKJA 8TIMA 3S8HA 1KW1A 2PURA 2YDAA 1RV8A 2PRHA 4Y9AA 4CLMA 1H61A 3LV5A 5FF0A 5I3IA 4QSHA 3SW6A 5K9CA 4X2RA 3B8DA 1XBYA 1EA0A 3NQDA 1SQ7A 5HUOA 1A5SA 2HMCA 4JDBA 4UUIA 2OT1A 3L0KA 4EOUA 1PIIA 3EX4A 5LNUA 3AO0A 5D04C 2YYUA 5IM51 4NJHA 3W75A 3B03A 2P0OA 4EIVA 3ZR4A 1AMKA 2WPBA 2DP3A 3LI0A 3LDVA 2C3ZA 3G22A 3TE9A 1ADOA 2NXIA 2VELA 4KFPA 2WJZA 4UNLA 3T78A 1T8XA 2QAFA 2VFEA 1GVOA 2CLHA 2VFDA 1IIGA 3G1SA 3HIJA 3HG2A 4R34A 4N9CA 1PVNA 4HNUA 4N02A 2Z6JA 6TIMA 1UUOA 3PUEA 3L21A 2ZCGA 5EBUA 4K7YA 4FIRA 1TPH1 2FTPA 4LV4A 4OBTA 2ZFAA 3PR2A 3LGEA 3BK0A 1FXPA 3GVGA 3P81A 2ZQ0A 3QMRA 1L6WA 4MY8A 1W56A 5EKYA 1F74A 1ME8A 4UFLA 5H2ZA 1QWGA 3W2NA 2AGKA 4JN6A 4GUHA 3M5VA 3SFKA 3N14A 1KBJA 3CTLA 2JBMA 2DORA 3IVTA 5CSRA 2QDGA 1B4KA 1PHWA 3E12A 2A7PA 2NX9A 2H8XA 5K3VA 1KFJA 3MBDA 3RLVA 4AHQA 3PVFA 5F4WA 2JK2A 4UTIA 4GBUA 3DU0A 3W1UA 1SFJA 1G4TA 1I8JA 5G2IA 3PBYA 4DO6A 5K9XA 2GVGA 5LSMA 2HS6A 1JR1A 2PCQA 3KRUA 3R12A 1HTIA 1L6SA 2H90A 4JTLA 4O1AA 1FBAA 1WBJA 4HHPA 2FFCA 4XKYB 2CU0A 2E5CA 1EP2A 1Q6RA 4O17A 2OJPA 3W7QA 4E2DA 4MPQA 2OCZA 2ZZ3A 3QPZA 4UMCA 2GJNA 1W5NA 2H8ZA 3USBA 1HO4A 2BWGA 1T0OA 2X30A 1TPB1 1LM1A 4O15A 4YXGA 3UWUA 2ZRUA 1OHLA 3NPXA 1IXQA 2BTMA 2ZZ6A 1W8SA 3SJ3A 3G1YA 3KVLA 1EUAA 4MFEA 2A7RA 1DKWA 3T55A 3N73A 2EPHA 3W7HA 2CLFA 3A23A 4ORIA 4JXCA 1MEWA 4YL2A 2JGQA 3CHVA 4JTJA 1KFLA 3GLCA 3S0CA 3LTSA 1WOAA 3O1NA 5I3HA 1EUNA 3EWXA 5CPMA 1XUZA 1PS9A 4QIUA 1CX9A 2EF9A 4XWUA 3VE9A 1KFBA 3E49A 2W79A 3NQCA 5D2WA 1E51A 1P0NA 2DZUA 3TXVA 3GDKA 5LGXA 4AHOA 3TXZA 3EXRA 4NXKA 4K39A 4UFHA 3VI2A 2WO5A 5KZDA 2CLMA 3NVTA 5E93A 1AW1A 4MYXA 3OA3A 3QPYA 2VXNA 3V1PA 4OWGA 1XXXA 1NSJA 5HWMA 3WJSA 4O13A 3O07A 2ABBA 5J5DA 4UFKA 1KM2A 4LY8A 5AHMA 2V2DA 3I7QA 3NQGA 1RD5A 3N19B 3DENA 4YWIA 1EWEA 4JY8A 3W71A 2A21A 1O94A 4FB7A 3DBPA 5AHEA 5BRBA 5DBTA 1F76A 5D03A 5DY2A 3MP3A 3C4UA 3NGJA 5GVJA 1ZHAA 5EMUA 4O10A 3QW4B 3W7GA 2QJGA 4QNEA 3W83A 1DJQA 1SW3A 3PS7A 3MUXA 2Q8ZA 1MEHA 1I2QA 2R94A 1T99A 1H7WA 1GTHA 4WD0A 1FQ0A 3LHVA 1F7BA 1LBMA 1ME9A 4HKPA 2FLIA 1J2WA 2Y7EA 3M7WA 3CC1A 3BG9A 3BARA 3EWYA 4K38A 2E5BA 4U4MA 5C5YA 3QW3A 3HG4A 3TR2A 2Z0IA 3E96A 3G1FA 1MXSA 1GVRA 3S5ZA 1O4UA 2FIQA 4UTTC 5J5RA 5DCBA 3GYEA 3TJXA 1VZWA 5I3FA 3W7CA 1WYIA 2NWRA 4CCCA 3SGZA 1R47A 1U83A 3TSMA 2A0NA 4FNQA 2EGZA 4NNBA 5F1UA 1LORA 2XN1A 4O53A 1YTDA 4AVFA 3G0UA 3TSBA 4ONVA 3TC6A 1YXDA 3PBWA 1TMHA 3W1XA 1JCJA 3DAQA 4FNUA 3W07A 3MJYA 1Z48A 1EB3A 4IMCA 1PL9A 2DJXA 3P7YA 3QFEA 2GPTA 3GXTA 2VFHA 3NZRA 5FEPA 3O06A 4RZ5A 3UYCA 3TIMA 1VYPX 3FYPA 2Z6IA 4IXXA 1LLWA 1OX4A 1YADA 1QPOA 3IVSA 1KM4A 4JYDA 5G2HA 3OVPA 1G69A 3ZWTA 1W5MA 3GXPA 1KM5A 3E0IA 4O50A 4UIOA 3MYOA 4TU1A 4O11A 2A1YA 3GR7A 5HJLA 4K8HA 1KFCA 2BX7A 5HINA 4A29A 4C1LA 4ML9A 4I7UA 4A2SA 5F2GA 4JTSA 1FDZA 1YTKA 3QSTA 3LHTA 3MI2A 3QQ0A 4NJGA 1M6JA 2QAPA 4RK8A 3CWOX 1ME7A 1H62A 2YX0A 4NXSA 1TCDA 3RNDA 1XBZA 3DHDA 4CNPA 1YXYA 1EEPA 1P4CA 1SPQA 1GG1A 2DZPA 4LRSA 3ZS4A 4KFOA 1VLWA 4IX0A 3W22A 4ZQNA 3SSJA 3NQMA 1XFBA 1H5YA 4UTWA 1D3GA 3Q37A 1FWSA 5LNWA 2F84A 1UJPA 4JGDA 4FXRA 3FJ6A 2ATMA 2QCHA 1G7UA 2QCGA 3BGJA 5C2XA 3TAOA 1XBXA 1L2UA 2Y85A 2ALDA 3NM1A 4DBEA 3B06A 1HL2A 1TJRA 4WXYA 4JTGA 2CLLA 4OV4A 1JULA 1VS1A 1VCGA 2BSLA 4NNCA 1FWRA 1ONRA 5LHEA 4O1CA 4RX0A 1X1ZA 1G7VA 5D02A 5KMYA 1O60A 3JRKA 3MMTA 3I6RA 1M5WA 4O4WA 4IOTA 2FQIA 3W7PA 4RXFA 3TW7A 2Y62A 2B4GA 3GR8A 4UTUA 4AF0A 5HULA 3T40A 4H3DA 3KVJA 3B05A 3LERA 4WOZA 2HSAA 1Y0EA 5FF4A 2VEMA 1JVNA 1ZNNA 4TMBA 5EY5A 4PCFA 1Z41A 4UTTA 5KITA 3KX6A 2O7QA 3MP4A 4K37A 3WK3A 1ZAJA 1FX6A 3HQ1A 3LCIA 4AWUA 2NLIA 1HG3A 4EF9A 1FWTA 4O0ZA 3E9AA 1Q45A 3ANYA 4M7TA 4FNPA 1VRDA 3M1ZA 3IIZA 2Y7DA 1I45A 4I7VA 5DXXA 1GVSA 3HO8A 4B5NA 4XZ9A 3B4UA 4YLWA 1QPQA 2FPVA 2Y7FA 2ZA3A 1HUVA 4O52A 2NUWA 3C2VA 5DCEA 4AAJA 4N4QA 2H3BA 2A85A 4FX7A 3TSDA 3I7RA 1K7FA 4QQ3A 4Y96A 2XN0A 2WQPA 4XQ6A 4JS3A 2CLOA 1XDLA 3HPSA 4LS0A 3TU9A 3C3NA 3GZ3A 3EB2A 1TJPA 3NL3A 2F7FA 3W9ZA 1OF6A 4H4IA 4NJIA 4NUWA 4Q33A 1EX5A 2C13A 2YYTA 4YCPA 5A5WA 4NJJA 3A5FA 3QMTA 4HSNA 1VHCA 3NNTA 2RKXA 3CT7A 1KM3A 3LCLA 5F2LA 4LS1A 4IUOA 1TPDA 3W2UA 2AQWA 1DVJA 2DZVA 1SZGA 4WZHA 5CZSA 3T4CA 3TMLA 4CNOA 1K02A 1UASA 2P10A 3QEZA 3W72A 1QFEA 2ATSA 6ALDA 1OYAA 5HQEA 3OHIA 5D09A 3M6YA 3UPBA 5FEZA 4A2RA 1OFOA 1ZALA 2ZRVA 3LHYA 3STFA 4U28A 3G1AA 1KV8A 1H60A 1JQVA 3GK0A 3OIXA 1KM1A 3M0ZA 3DI1A 3N9SA 4FNRA 4N4PA 3M5ZA 3P80A 2EKCA 1I2RA 1HFBA 3PUOA 1TTPA 4BF9A 1XBVA 3W7DA 4UMBA 3RMJA 1OF8A 5K9DA 3FJLA 2OZ0A 1XCFA 3ZWSA 1FUYA 2GJLA 3SR7A 3P67A 1H7NA 4GFSA 4PH6A 3TFCA 4ZQPA 4OT7A 2E68A 2G95A 2ZBTA 4N6FA 4PFMA 3TJLA 3C2EA 4FXSA 3LCWA 4MJMA 3VCRA 4GUJA 5AHNA 3LCXA 1LOLA 4N9DA 2WSYA 4XBKA 3HPZA 3O6YX 1VJIA 1WA3A 3OG3A 4MLJA 4PL2A 1UB3A 3SY5A 3CWNA 2E6FA 5A8GA 3ATYA 3P5YA 3BW3A 1X6UA 4DF0A 2I1OA 1D9EA 4LWWA 3WJWA 1JCNA 2Y89A 2I14A 2DZSA 3O15A 5AYXA 4ZZ9A 1O5KA 1B3OA 1VLIA 2QJIA 3AJXA 3NQEA 3DFNA 3CIXA 4DPQA 2ZDRA 4JIQA 4O16A 3L0GA 2QEZA 3GB6A 4IMEA 5H91A 4LC8A 1Q6OA 2OMAA 3OVRA 2NUYA 4NVTA 1LRNA 3STEA 1IXPA 2CFFA 4RKAA 3LBCA 3QZEA 1W3TA 5EA9A 2NZLA 1WAUA 3S1WA 3G1HA 1QCWA 2R14A 3F4WA 1BEUA 4JX5A 3NQ6A 3GXNA 2EHHA 5AOUA 3F4NA 3VNDA 4UFIA 3MBFA 3LRKA 3PBUA 3PBVA 2WNQA 4JDYA 3EWBX 4N9BA 5D2TA 3IIPA 3JR2A 2G96A 1K3UA 5D05A 5HWNA 4LNYA 1PCWA 5LNSA 1KM0A 1OFAA 2ISVA 3TA6A 1D3HA 3NQ7A 3PAJA 3M41A 3M5YA 3T7VA 3IIOA 3THQA 4WXZA 1JUBA 5K7JA 5DY3A 2AAMA 2JKAA 4UTHA 4Y8FA 4FNTA 4UTMA 3O16A 3BW4A 5HR7A 4GNJA 4IMFA 4DEFA 5F1VA 1TB3A 2DJLA 3ABOA 3FFSA 2QCNA 5F4XA 2GVLA 4TX9A 1SW0A 3WJZA 3HJZA 3CQ0A 1JRBA 5L6UA 4MUZA 2NXGA 1GYNA 1OFDA 3WJXA 3GDMA 1B4EA 5T26A 1NFBA 3W3OA 5DCDA 3W1PA 3W2MA 5LNVA 2TSYA 1C29A 3NYZA 1W37A 3HOJA 5KTLA 5MHBA 4O12A 4JX6A 4GE8A 4IQLA 4DBDA 4IJBA 4Z1CA 4KKXA 3UZ5A 1TV8A 3LHWA 1JCXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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