4JS3A

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with 057
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
TGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with 057
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
total genus 135
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2013-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4js3A00
1OFRA 4ML9A 4K37A 2EF9A 3RMJA 3KRUA 6ALDA 1PIIA 3NDOA 3W22A 4NJKA 3U8GA 5L9FA 3B06A 4LWWA 3P84A 1Q3NA 1TV8A 2WQPA 4UIOA 4QISA 3TFXA 3W1QA 4ADSA 1TPWA 4IQLA 4LVFA 3OA3A 4PEKA 2RHGA 1ZAIA 4Y96A 2RKXA 1QOQA 1N8FA 1H62A 3GVGA 3L5LA 3W7RA 3PWAA 1HUVA 3FKKA 4UTUA 2J9XA 3W83A 2GQ8A 1YADA 4MUZA 3NG3A 1WV2A 3SJ3A 3P7YA 1L6WA 3GKAA 4JTSA 1GZGA 3NR0A 4UFLA 3UWVA 3W74A 3QFEA 1WX0A 3RNDA 5C55A 3CTLA 3UXDA 2H3BA 4FO4A 3CEUA 3W1LA 4IUOA 3TJXA 3E96A 1O4UA 1K7FA 1F7BA 2DP3A 1SZFA 1TJPA 3QEZA 1IIHA 4PODA 2NX3A 4BF9A 2JK2A 2Y89A 1S5VA 1LLWA 4O1BA 4JICA 4GBUA 3I65A 5D33A 4CQAA 2CLKA 1W54A 3GNDA 1RR2A 3N2XA 3OVPA 4XKYA 3FLUA 1H7OA 1ME9A 1KM5A 5LZLA 4UC5A 1GT8A 5HULA 4NJHA 3NQAA 3Q2DA 3S8HA 4NT0A 1G69A 4OHQA 2FLIA 3IIVA 1LZOA 3L0GA 2BX7A 2JKPA 4ZQPA 2Z6JA 3LDVA 4S2CA 4O1DA 1GVSA 2G97A 4A3UA 3PG8A 1NF0A 4FXSA 2DZUA 4WY0A 2ZZ2A 5HMSA 3K30A 2V8ZA 1ZNNA 4AHOA 4J9JA 2ZRWA 4RZ5A 5KZDA 1IIGA 2G95A 2C6QA 4N4PA 5A8GA 2VEIA 1AK5A 1W5NA 4RLIA 3P67A 5A5WA 2HMCA 1LCOA 3PB2A 4P61A 1KM0A 5HWNA 5GVJA 4UMCA 1VS1A 1T0OA 3PBWA 4KFPA 4OE7A 4TO8A 4UFKA 5DBTA 5FEWA 3LHWA 4UNKA 2CZDA 4Z08A 1UB3A 3NYZA 4A29A 4RZ4A 2Z0IA 1JUEA 2QCMA 4NJIA 2FPTA 4IMFA 1K02A 1H50A 3S1VA 3TKFA 3EKLA 5DY2A 3TNOA 3NAVA 4CNPA 3MHUA 4FNSA 2E09A 4JYFA 1H7PA 3CQ0A 4GC4A 4MY1A 3CHVA 5ABTA 3S1UA 4N9BA 2ZTKA 4IX0A 4UR7A 3ABRA 5DN1A 5H2ZA 2I1OA 1OK4A 1MEWA 2JBMA 3QYQA 1H60A 5SWUA 5K7JA 2A4AA 2FPYA 3LCXA 1GTEA 3HG2A 1ADOA 1VZWA 2WSQA 3MHGA 1PV8A 4IJBA 3W73A 4FIQA 5BMWA 4WXZA 1UBSA 1UUOA 5DCDA 3SY5A 3DENA 1W37A 3G1HA 2NUYA 1Q6RA 5CGQA 4CQ9A 1FDZA 4DBDA 1MZHA 1XBYA 1K03A 1OABA 3TMLA 1LDCA 4JDYA 5D38A 3USBA 3VCRA 4NVTA 4JY9A 4O11A 2A2IA 1L6YA 3W1NA 4BFAA 3IVTA 1KM2A 4MZ1A 1EP1A 2RFGA 4YL2A 2TMDA 1VHCA 4U4MA 1F2JA 1QAPA 1W31A 2V30A 2YYUA 5AC8A 2Y70A 5K4ZA 3P5ZA 1VLWA 2XN1A 3O63A 4IX2A 3MP5A 3SECA 3LCHA 1JR1A 2B4GA 1SFJA 1EWEA 3NEVA 1W3NA 3FFSA 1K3UA 1W8SA 3P80A 5AN7A 1YTEA 4HPXA 4U28A 1JCJA 2DJLA 1GWJA 4N6EA 1SO5A 1YPIA 3DFSA 1A53A 3TMQA 1J5TA 1NSJA 5AHFA 4LOCA 3TC6A 3THAA 3W7IA 1JULA 1SPQA 4UFMA 3QMTA 1YLVA 2W6RA 4XUGA 3IVSA 3W7JA 1ZHAA 3QPYA 5LNWA 4UUIA 4O4WA 5C6MA 1FX6A 4MJMA 1ZJIA 3A23A 1K7EA 4DQWA 1I8JA 1TRIA 4GRSA 1OYAA 3UZ5A 4QSHA 4DF1A 3LRLA 2ZYFA 5IM51 3LTPA 3CIXA 4JNMA 2GVGA 1JCXA 1VCVA 3DBPA 3RLUA 4O52A 3LXBA 4DPPA 3UWZA 3NQCA 4N2YA 5K9DA 1TPH1 2FB3A 5F2GA 1UJPA 5LSMA 4FF7A 2QCFA 2Q3RA 4EOUA 2A85A 1C29A 3G22A 1K8ZA 1LRNA 3P81A 5CKSA 5D05A 4JGDA 3PBYA 3W7PA 1JUBA 3C8FA 1DQWA 1XCFA 4ZQRA 4K38A 1KFEA 3NL2A 2QJHA 5K2ZA 2NXIA 4BI5A 4AXKA 4H4IA 1K8YA 2ZRVA 3S42A 1LOLA 4LT9A 5D2WA 1OHLA 1XXXA 2ZRYA 5AHIA 3T7VA 1JRBA 1W5MA 2PURA 3TJLA 5DBUA 4DEFA 3U2OA 2PE4A 4FNUA 4TMCA 2QAPA 4DF0A 4Y90A 4JR5A 4A2SA 3NZRA 1GQNA 3EXRA 4HIBA 4WOQA 1JCMP 3EWZA 4XWUA 4K39A 1OFEA 4H6KA 4BWLA 1PL9A 2ZRZA 2ZRUA 1XI3A 5EL1A 5FEZA 4WX2A 4YCPA 2C18A 3RLVA 2C1HA 2I14A 4WY0F 1GG0A 3IRDA 3QPZA 1HO4A 1GYLA 4K7YA 4K36A 3VE9A 2GQ9A 1LYXA 1LORA 4X3ZA 3IIPA 5CPOA 4E38A 5KSWA 1HTIA 4RJEA 4C1KA 1GJPA 5FF7A 4BR1A 1ZAHA 2QDGA 3A5FA 3FEMA 2BLEA 1NEYA 2WPBA 3LXCA 4Y6GA 4EWND 3UWWA 2BWGA 2C16A 3ABSA 4O0ZA 5FF4A 1YXDA 2XFWA 4CNOA 3MI2A 3HG5A 1SO4A 4RXGA 2NV1A 2ZZ1A 3G1FA 3LBMA 4RZ6A 4BI7A 4ZVJA 1ZY9A 3IGXA 3FS2A 1PCKA 4WD0A 4KWVA 4KFNA 5F4SA 3GK0A 4AWSA 1RQHA 3M43A 4CCCA 3KHJA 3W72A 3S9YA 2YYTA 2AGKA 4JXCA 1FCBA 1TPEA 3BLFA 4O10A 1DVJA 3G24A 5CPNA 1VLIA 3KOFA 4R7JA 2CZEA 4X22A 4NQ1A 3AJXA 4HNVA 1FCQA 4JYEA 1QOPA 3IGUA 4IMEA 1J2WA 3LERA 1PS9A 4Z0JA 2YGYA 2A6LA 3LLFA 4RK8A 1OK6A 1XDLA 5EKYA 1P0NA 1OX5A 2CW6A 3GLCA 5LGXA 5BOOA 2B7QA 1YPFA 1VCFA 1TYGA 3BLIA 3NQ2A 4UTWC 5F1UA 3LX9A 1B3OA 2G96A 2E6AA 3STFA 4MIMA 1RZMA 1FDYA 5K3VA 4AH7A 2VFHA 2OX1A 3WJSA 2ZCGA 5DCBA 5J5RA 3L68A 4JTEA 3HB9A 5KZEA 3ABQA 1I4NA 3BG9A 4GNJA 3UPWA 3UWUA 4O13A 3MO7A 3RK8A 2X1UA 1OFBA 1S5TA 2CLEA 2QUUA 4LTSA 1BWLA 1RPXA 2A7NA 1Q6QA 1VQTA 1FBAA 1G4SA 4GFSA 4EVZA 3DFTA 3MJYA 2ZZ4A 2VFIA 3C2RA 1OX6A 4UTHA 2W79A 1BKSA 1WQ5A 5HUOA 1HG3A 3EWUA 4CCDA 2C15A 2GJLA 4OV4A 5E93A 1IXNA 1QDSA 1YDVA 3W1AA 3DFQA 3MWAA 4PL1A 3G1AA 3CIWA 1AW2A 5F2MA 1JQVA 2JGQA 4O28A 3C6CA 2VFDA 1TREA 2J27A 3A9IA 4Q4KA 1WOAA 1KBIA 2C0AA 3NVTA 2ZZ7A 3IGSA 3EEGA 4IPJA 1JCYA 3SZ8A 3C52A 3DGRA 3WJXA 2D73A 4O19A 3LCLA 3W2JA 3W2MA 2R91A 2DU2A 3MUXA 1KLYA 3M41A 3SFKA 1OFAA 1IXQA 3C4UA 3G18A 8TIMA 3KXQA 5K9CA 3O06A 1TTPA 4EIVA 1L9WA 4UFIA 4CNNA 1M5WA 1DQXA 4JTIA 4NNBA 1EPXA 2Y62A 4JDBA 2ISWA 3PB0A 1G6CA 3NM1A 3QRHA 1OX4B 5CPLA 5LNUA 5D2VA 1FCVA 1Z48A 2E5CA 3G0XA 1HO1A 2HTMA 4WQ6A 3I7QA 5CZJA 3GR8A 3KFTA 3Q37A 4O14A 3STEA 4QM1A 3HGSA 1H51A 3YPIA 2H90A 2Z1BA 1ICSA 2DJXA 3O16A 1SQ7A 2QEZA 1VC4A 3KAOA 1EWDA 4M6QA 1W5QA 2RDTA 2A7PA 2DZXA 5F1VA 2JKAA 1JCLA 4ORMA 4AWUA 2CWNA 4Z1AA 3O6YX 3G1YA 4O15A 5D2YA 2GUUA 4XQ6A 1PVNA 2V2CA 3FJLA 4DO6A 3CC1A 1ZAJA 3EXSA 3DFPA 1L6SA 3R13A 4UTLA 3PG9A 3EXTA 3PS7A 2V81A 3KVJA 3DI0A 4IMCA 4JX6A 4ZQCA 3SIZA 5CPMA 3P62A 1VGAA 2QCCA 3OVRA 2NLIA 3VI2A 3M5ZA 1TMHA 3B05A 2PRMA 4IXXA 3W84A 4FNQA 4GWEA 3DH7A 2BXVA 2C14A 3G0SA 2WJZA 4M7TA 4ONVA 3TUUA 5HQEA 2XN0A 2YR1A 3C2OA 3E12A 1KFLA 1B4KA 4PL2A 3LTSA 1N7KA 3PUOA 4FNRA 4PA8A 3W9ZA 1XM3A 1KFKA 3DFNA 3LB0A 4FEZA 4AF0B 5G1TA 1SZGA 3PAJA 4FXRA 3PBVA 3T55A 2JGYA 1O60A 3UPBA 3PC0A 4ALDA 3A22A 3HG4A 4M5PA 2A21A 2WKJA 1TV5A 2TSYA 3G3MA 3MP3A 3QSRA 2FDSA 2VC6A 4PTNA 3E49A 3TDFA 1T8XA 3TSDA 1DOSA 1TPB1 1IGSA 2GJNA 2QR6A 5F4WA 1F6KA 2PRLA 2ATMA 3NM3A 2ZA2A 1WBJA 3M44A 3CU2A 1J4EA 3I6RA 5C2XA 4DO4A 4S2BA 3SW6A 1T99A 3W7OA 4JX4A 2J88A 5U4NA 4FX7A 3IIOA 3WK3A 4DXVA 3W85A 4NX5A 1TB3A 1HL2A 3P5YA 1QWGA 3L9CA 5U7SA 3P60A 1EB3A 5AFDA 1YDNA 4IMDA 3W2KA 3FKRA 2NUWA 3T4CA 3NXFA 4XTIA 3GXNA 4UTTA 1F76A 1SZNA 3VFLA 2ATSA 5H91A 3PVFA 5HR6A 2NX9A 3C56A 5DCEA 2J24A 3T78A 3GAYA 4JTJA 3W71A 3O07A 4XZ9A 2PCQA 3EB2A 5LNRA 1OFDA 3D0CA 1KTNA 2G5WA 4Y9AA 1SW3A 4P2VA 3W2UA 1FXQA 2ZA1A 4D2JA 3TH6A 5D09A 1JRCA 1TPC1 3L21A 2QCGA 2Q8LA 3FIGA 5G2HA 4Q32A 4OBTA 3U6WA 3A5VA 1GTHA 3FYPA 1EA0A 5I3GA 2VFFA 1H7WA 3W1XA 3H55A 3HGOA 3P74A 3PULA 3Q58A 2NXHA 3QJAA 3CT7A 4I7WA 1GVFA 1OFQA 5AYZA 2O7SA 1KA9F 2H8XA 4B5NA 3W1TA 3DHDA 1G4EA 4O18A 1JQXA 2QUTA 1DHPA 3TQVA 3SGZA 3TK7A 4KFOA 3R5EA 5D02A 3ELFA 3W7DA 4LV9A 2Z6IA 5CZSA 4ADTA 2Z2UA 4JTLA 4PH6A 3OBKA 5HUPA 1R47A 3MI6A 4JS3A 3NQ7A 1EUAA 5DY3A 5G2IA 3FJ6A 3QQ0A 1X7FA 5EMUA 1QMLA 3LI1A 4W9TA 1X1OA 1DJQA 4MY9A 2C19A 3W6YA 4UTKA 1CW2A 4L4LA 4UR8A 1FWSA 2NWSA 4BWLC 1B57A 1G4PA 2CLHA 3L2IA 4JTFA 2NZLA 4MZYA 1G7UA 4RCXA 1TSIA 4FX6M 2ZDRA 1OF8A 3GDTA 2V5BA 3GXTA 1RV8A 1XBVA 4BI6A 3R89A 3EX1A 1OG0A 5T26A 1TPVA 4E2DA 1GYNA 3NZ1A 6TIMA 3W23A 1B4EA 3GB6A 5AHNA 1SO6A 3SI9A 1WDWA 3MI3A 5LNVA 4LUJA 3W07A 4A2RA 3L5MA 3HJZA 2GQAA 4HNUA 2A6NA 4UCGA 1SSDA 2WSRA 1EX5A 1W3IA 4HNNA 3OEXA 3M7WA 3G1XA 3QW3A 5I3FA 1DBTA 2J9ZA 3DU0A 4AHQA 1O5KA 2AQWA 3W7EA 1SUXA 4ADUA 3HGRA 4MLJA 2V82A 3KVMA 2CLIA 4EF9A 3NQDA 1DORA 1VPXA 3FA5A 5EY5A 5G4WA 1MSSA 4QNEA 1X1ZA 1QO5A 3PBUA 5F4XA 2FPVA 4LRSA 2YSWA 3N9RA 3W3OA 3QF0A 2FFCA 3OVQA 2YFNA 2CU0A 4L4MA 1LM1A 1FXPA 3TV8A 4ZQOA 3UQNA 1W0MA 1ZCOA 2GVJA 1ICQA 2ZTJA 3S5YA 1IXOA 2BSLA 1R30A 2PC4A 3ATYA 3E9AA 5AB3A 2E1DA 5F2LA 3TW7A 3M5YA 2QF7A 4JTHA 3NQ8A 2J6XA 3HPZA 3Q94A 1GG1A 1TTQA 3TCEA 1BEUA 5AHLA 3GDMA 3BGGA 3BG5A 5AYYA 3FYOA 5CSSA 4ZL1A 3BV4A 3C0JA 4X9SA 3GXPA 2OJPA 3DXIA 3LCIA 3TAKA 4K8HA 1IXPA 4ICNA 4IWWA 4YMZA 1YXCA 1AMKA 4ZQMA 4M7SA 3B0VC 2DZTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3OOD A;  3DG6 A;  2FHC A;  2Z1S A;  1WKF A;  4HP5 A;  4H19 A;  4UQC A;  1GVY A;  3GDB A;  3MS8 A;  2ZUT A;  2BOD X;  3E74 A;  3IJ9 A;  1EDT A;  4QIS A;  1UD3 A;  3EDE A;  5FSE C;  5HNU A;  1EJS C;  3KRB A;  3O9N A;  2QLY A;  1N8F A;  1CLX A;  2OGJ A;  4W8L A;  2PB1 A;  3CV1 A;  4UTU A;  3PFM A;  2GQ8 A;  4ZXL A;  3SJ3 A;  3P7Y A;  4EX4 A;  3B8S A;  2BHU A;  3N9K A;  3CBW A;  1FA2 A;  4UOQ A;  3NGF A;  5C55 A;  3CTL A;  3RRA A;  3W1L A;  3BZG A;  2YJQ A;  2NVD A;  3TJX A;  1O4U A;  3QEZ A;  2CCR A;  4AZC B;  1MNZ A;  4Z2G A;  3QHM A;  1JAK A;  1US2 A;  4HMN A;  3W29 A;  1QPK A;  4O1B A;  2EPL X;  3FK4 A;  4UWM A;  1XIE A;  4JIC A;  1KGX A;  5D33 A;  1KQY A;  1V77 A;  3WQO A;  2IXV A;  3CUI A;  2FZN A;  1RR2 A;  1JZ5 A;  2P88 A;  3OVP A;  2IMR A;  4XKY A;  3FLU A;  4QLJ A;  2R82 A;  1KM5 A;  2VZO A;  5LZL A;  2QDE A;  4UC5 A;  1GT8 A;  2HDJ A;  2PU1 A;  3NQA A;  4NT0 A;  3EA2 A;  1XQL A;  3W6M A;  5ABH A;  3IIV A;  1LZO A;  2BX7 A;  2JKP A;  3LDV A;  2XH0 A;  1F61 A;  2GSE A;  2G97 A;  3PG8 A; 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