1I1X | Genus

Total Genus 120

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	120
sequence length	302
structure length	302
Chain Sequence	EAAQSVDQLIKARGKVYFGVATDQNRLTTGKNAAIIQANFGQVTPENSMKWDATEPSQGNFNFAGADYLVNWAQQNGKLIRGHTLVWHSQLPSWVSSITDKNTLTNVMKNHITTLMTRYKGKIRAWDVVNEAFNEDGSLRQTVFLNVIGEDYIPIAFQTARAADPNAKLYINDYNLDSASYPKTQAIVNRVKKWRAAGVPIDGIGSQTHLSAGQGASVLQALPLLASAGTPEVAITELDVAGASSTDYVNVVNACLNVSSCVGITVWGVADPDSWRASTTPLLFDGNFNPKPAYNAIVQNLQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
publication title	Thermostable xylanase from Thermoascus aurantiacus at ultrahigh resolution (0.89 A) at 100 K and atomic resolution (1.11 A) at 293 K refined anisotropically to small-molecule accuracy. pubmed doi rcsb
molecule keywords	ENDO-1,4-BETA-XYLANASE
total genus	120
structure length	302
sequence length	302
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	2001-02-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1i1xA00

1FH8A 4HOWA 3LMYA 3A3HA 3JUGA 2WC4A 1UD6A 3A4WA 5A2AA 1UR1A 2W5FA 1GHSA 5CPQA 1X6LA 4IPNB 3AS1A 1GPFA 3QR3A 4J3SA 5GNZA 2HISA 3UETA 3EMZA 1FHLA 1JFHA 3VX1A 3AHXA 4M1RA 5A8QA 2GJRA 1EO7A 1BG9A 5CZKA 4AWEA 4FLQA 3VIIA 4BS0A 2D24A 4K68A 2YLLA 3LPFA 1LL4A 3SCOA 4YHEA 1C7TA 4DWSB 3ZM8A 1HJVA 1GOIA 1CGVA 4RL3A 1ECEA 2YA2A 3EBVA 1U2YA 3S6TA 4KGJA 1XD0A 3AFBA 5I77A 2D3NA 1ESWA 1W1YA 3BC9A 2WVVA 1WNOA 3WENA 3ZR6A 3RCNA 3MU7A 1VRXA 1J18A 2JIWA 1GVIA 3ARUA 3F4VA 1BTCA 3IK2A 4PMQA 5FIPA 1QHZA 1GOQA 1V3HA 1E3ZA 5F7UA 4E8DA 1KQZA 2WMGA 3AZRA 5M5DA 2WM0A 2AMGA 3TTOA 1VJSA 1QW9A 4BF7A 3VIPA 1V0NA 1VJZA 1WDQA 3VDHA 4EK7A 1GHRA 1NP0A 1TVPA 1V3JA 1WB0A 1ODZA 1IV8A 2GDVA 2WNWA 2ZUMA 2NT0A 1C8XA 4D1IA 3CTTA 1B3VA 1VF8A 3TONA 3DHPA 3W4RA 1G9HA 2DT3A 1M03A 4RE3A 1UG6A 1G01A 2WBGA 3N17A 1DHKA 4TX6A 4Z2IA 3AJ7A 3CZGA 4MDOA 5I79A 3SCNA 2YBUA 1QVBA 5AYIA 3D3AA 3SURA 5AYBA 4CCEA 3DHUA 3OGRA 3ARQA 2NSXA 2A3AA 1DWFM 3BLKA 2XTKA 4H04A 4PBGA 4PTXA 3AMCA 5A69A 3VO0A 2OWCA 1H49A 1O6IA 1XYFA 1FA2A 4XUYA 1WP6A 1WPCA 2BFGA 3U57A 4PSRA 3T0DA 2DH3A 3UCQA 3OB8A 1W9VA 1J0ZA 1LWJA 3NSXA 1HKJA 1UZ4A 1GUVA 3KL0A 3ARTA 2WMFA 4QLKA 1SR0A 1J11A 2AOSA 4FLRA 4TVUA 1PAMA 4U5KA 5BXTA 3W6MA 4JHZA 4JFUA 1EIBA 4P7QA 1C90A 5DO8A 1FP9A 4LYRA 1WDRA 1OGGA 2IXVA 1E6RA 1TFVA 1W3HA 2QV4A 1AMYA 2JEQA 4A4AA 1QI3A 1MQQA 1W9BM 1PZ2A 2BXZA 2W67A 4W93A 1GJUA 2O92A 2CITA 4UFHA 2XYLA 2J62A 2VZOA 1W3JA 4R27A 4AZGA 1HN1A 5CGMA 4MDPA 3U7VA 2CCRA 3UEQA 3CIVA 3N13A 4UQDA 4V28A 4BA0A 3VGGA 3VDBA 2E8ZA 1H0GA 2BVDA 4WIWA 3VD3A 4C7GA 1HKIA 3VKKA 5CLTA 1H09A 1PX4A 1JYWA 1NWUA 2CESA 5FKYA 1CEOA 4HMCA 2DSVA 3F5LA 1NOFA 1J0KA 1KGXA 4MADA 3N18A 3AYSA 3MKKA 1A47A 3VIJA 1ZB5A 2BHYA 2DT2A 2J78A 3UG3A 3D5HA 4AD1A 4NSBA 3TP4A 2Y2WA 4TTGA 1OB0A 1UR2A 1BYDA 3VUPA 4JKKA 2A3BA 3VIKA 5I5RA 4YPJA 1ZL1A 1B31A 2WCSA 5DT5A 4JFSA 2W66A 2OYKA 5EBAA 4AIEA 5I6SA 4QLLA 5E09A 3AIWA 2X0YA 1VFUA 5BWFA 3ZOAA 3PZGA 1SFSA 3ARRA 1KQYA 1DWJM 2PBGA 1JZ3A 2AAAA 4D6CA 3SCTA 4JCMA 4IISA 2CEQA 4B16A 3BGAA 3MANA 1E6ZA 3OIHA 4AC1X 2EXOA 2EBNA 3B8SA 2WWCA 1GOKA 2PWEA 3SCUA 3WNOA 4CN1A 2WZHA 4D71A 1V6VA 1QNQA 4ZEPA 3AHTA 3K8LA 1FHDA 1JZ2A 3FXYA 1KBBA 5IDIA 1MW1A 3O2LA 4PMRA 1PJ9A 4CCCA 3KZSA 8CGTA 2JF6A 3EDKA 1UR4A 1ZJBA 3BSGA 4BZYA 4UFJA 3OLGA 1TG7A 2O9OA 1XC6A 2ZXQA 1KXHA 3VGBA 3ZIZA 5BRPA 1B9ZA 1ISYA 2UWFA 4GI8A 1LWHA 5CPSA 3TA9A 3O6AA 5A8MA 1C8QA 4GI9A 4UFLA 3WQ4A 1AQHA 4DM1A 2J77A 3NUKA 1BYBA 2WHMA 1FP8A 3NSNA 1V3IA 1VBRA 3PBGA 2X09A 3WUGA 2XPKA 1H3GA 2E8YA 3GM8A 2BVYA 1E1EA 3WQ6A 3MSDA 3WN6A 1UKTA 4QFUA 2TAAA 2CERA 5A6KA 2F61A 3BAXA 3BLPX 4CD4A 3KE0A 1KCKA 2VCAA 3WUEA 4PMYA 3PZOA 4ACZA 3L4ZA 3WD3A 3ZMRA 2BY1A 3WY1A 3WBEA 2G4FA 3VDAA 1EDQA 3CUIA 2DT0A 5LYRA 2J47A 2VZTA 4ATLA 6A3HA 2G3JA 4CD8A 3WEZA 2WLZA 2ZX9A 2WYSA 4HOZA 2GJPA 1US3A 3TTYA 5GPRA 3GXMA 1J9YA 2ZUNA 1OD0A 3PHAA 2GJXA 1UH3A 1XSKA 2VI0A 2QPSA 4FLOA 3W37A 4HZ8A 4WJXA 3GH7A 1XV8A 1FOBA 6TAAA 1IT0A 1QI5A 4AEEA 5GNYA 4OOZA 3T08A 1GONA 5I0DA 4YHGA 3OG2A 3L4UA 1DP0A 1LG1A 2J8GA 2DIJA 1CYGA 3RIKA 2VRQA 3L4VA 1OCQA 1LLOA 4UR9A 3VM7A 3FW6A 2BVTA 5A6AA 4U3AA 2YDRA 4AIOA 3WUBA 2G3MA 3AZSA 4NI3A 1F4HA 1ZBCA 1CENA 1JYXA 1EGZA 3CZEA 1B0IA 3FNDA 3AZTA 1K9EA 4ACZB 3GH4A 5JBFA 1GQIA 5ABEA 3EDJA 1VIWA 1E6PA 2ZUTA 1E4NA 1QNOA 3HN3A 4F66A 1BF2A 1U33A 2ZICA 4MAVA 3VIHA 3A4XA 1KBKA 4WSJA 4TUFA 2QF8A 1M53A 4OIFA 3WNMA 2X0HA 2J8FA 2VL4A 3N11A 3WEMA 4AEFA 5A2CA 2GJXB 1HT6A 2J7DA 3PZUA 2GK1A 2WK2A 4PUEA 2VTFA 1AQMA 4GO8A 1H11A 1CWYA 3OLDA 1JI1A 3VD9A 1BG4A 1J10A 2CPUA 3ARXA 1AVAA 3VIFA 3ARVA 5HOSA 4NZCA 2YA0A 1M7XA 2JIEA 4B15A 2WC7A 1U30A 1BYCA 2C0HA 3EDDA 1K6AA 1UQYA 3LPGA 5ABFA 1PBGA 1E3XA 2J7BA 1MQRA 2ZE0A 2EJ1A 3N12A 2W61A 2XSBA 4JL1A 2VUYA 4TX8A 4GQRA 4D6FA 2YL8A 1QNSA 3CZKA 2ZUVA 4HA1A 3BAIA 1UR0A 1B3YA 2VT0A 3SUTA 4HZ7A 2RGLA 1MQPA 3AIBA 2E3ZA 3AMDA 2XFRA 5D9OA 1CNVA 3AIVA 4WKFA 1XCXA 1WE5A 3ARZA 3W28A 3WDQA 3A4AA 2WCGA 1QW8A 2WPGA 4L4OA 3BAKA 1UKOA 1ZBVA 1TE1A 4PSPA 3SUVA 5IFTA 2Z1SA 1LF1A 4JFWA 3ZJKA 3MUY1 5I2UA 3FAWA 1EXPA 1SMAA 2DPEA 5D9NA 3T2OA 1JDAA 5A8PA 4D6HA 2GK1B 5BYWA 1GOMA 4LYQA 1DEDA 1CTNA 2ZUSA 2J7EA 4UQCA 5ABHA 3BCFA 2CIPA 5CGTA 2RGMA 1VEMA 2OSXA 3VGDA 1V6XA 3SIMA 4JFTA 1VEOA 2HVMA 3AOFA 5ABFB 1NWTA 1IZJA 3A6OA 4H8UA 1HJQA 2PF0A 3WD4A 5HPCA 4U2ZA 1C93A 1KGUA 2VOTA 1TVNA 5CPTA 6CGTA 3WD0A 1V02A 2XVLA 3CUHA 1C91A 3WNPA 3VIGA 4HU0A 4UQEA 4B9ZA 3AHYA 1UH2A 1HVXA 4J3VA 3ZO9A 3QHNA 3WNLA 5CQ1A 4UOQA 4L4PA 1Q4NX 2DQXA 1R7AA 4HZ6A 2OSWA 1GNXA 4F9DA 1W2PA 2EPNA 2A3CA 5AC5A 1ISVA 4CGTA 4C7DA 2XVPA 2DSZA 1CGYA 1Q6DA 2PWHA 1ZBWA 3WMCA 3ZQ9A 1UHVA 1WKYA 4P7LA 3W27A 1EHAA 3I3DA 1JG9A 2WHJA 5CXPA 3WH8A 4KWUA 5A94A 1XHGA 1CLVA 2VX5A 4B3LA 1W9UA 3NDZA 2ZUUA 1UD8A 2WVTA 2F2HA 4DWSD 2D1ZA 4PCSA 4H2CA 1E55A 4IPLA 1XRVA 1CGTA 1OINA 4CVWA 1V02E 3I3BA 3AIRA 1V03A 1E0VA 1G94A 5JIWA 1E70M 1RD6A 2FHFA 5DF0A 3QHMA 3L4XA 4W5ZA 4N0RA 1CPUA 4UFKA 5FOOA 1OSEA 2VQUA 3OBAA 5D4YA 4AMCA 3BH4A 4KH2A 2O9PA 3WMSA 3S2CA 3VDCA 1JF5A 4UZUA 4PMVA 4U33A 1TZ7A 2WVVB 1B3ZA 4GO9A 4HPHA 1CBGA 3WH5A 1WCGA 1J0JA 1V0KA 5C71A 3B9AA 3G6MA 1W1PA 4J27A 1WZKA 3MUZ1 2XVNA 1I1WA 3U7BA 5E70A 1UQZA 5M03A 2WZIA 2BY0A 3G6LA 1JZ6A 3RDKA 4H8VA 3CZLA 3BXWA 4M81A 2Z1KA 1WDPA 2BHUA 1VENA 2J7GA 4W85A 3RM9A 3VNZA 1US2A 3AHVA 1OT2A 3HMCA 5AY7A 3RJYA 2X1IA 1BFNA 3WF0A 5DFAA 2PWDA 2XM1A 2D3LA 4CU8A 4AIUA 3FAXA 4OUEA 5A8NA 3WD2A 2WXDM 4M24A 4WSKA 2XWDA 4BQ3A 4UNIA 1JF6A 2CYGA 3GBEA 5FL1A 3WF2A 2ESCA 3QOMA 3WFZA 4JL2A 1H4PA 4PEEA 3RMEA 3RM8A 2V5CA 2BY3A 3W81A 4W5UA 5C70A 5D8WA 2J7FA 3II1A 4QP0A 5EMYA 1HKKA 4JCLA 4CU7A 5DEZA 3BCDA 4HA4A 4TVDA 3SCQA 4Y7EA 5LA1A 2CXGA 4PMUA 4AD5A 2ZUWA 3WEOA 2WVUA 3OGSA 3PTKA 2DH2A 3OZPA 1M01A 1XD1A 4AD3A 1KXTA 1V0LA 2VRKA 1BYAA 1QOXA 3B9DA 4W84A 4IM4A 1HJSA 1CZ1A 4HP5A 2FHCA 2J7HA 2WB5A 3RO8A 3VGHA 1QBBA 1UR8A 4QDMA 1VFMA 2UY4A 5A95A 3OGVA 2DIEA 4AZ7A 1D2KA 4TTUA 1O7AA 1K9FA 3VGEA 2VVNA 3OZOA 3E1F1 4OBSA 1P6WA 1CXFA 4EE9A 3DECA 1UD4A 1BPLB 3IJ9A 1W91A 4PYSA 1HJUA 1OM0A 3O9NA 4MJ2A 4MNLA 1CGUA 4NRRA 1E4MM 4MPKA 3PZMA 4AZ5A 4DUXA 4F79A 2ZX6A 2J74A 3RPMA 4GZIA 4YN5A 3CGTA 5EB8A 1H5VA 2Y4SA 5JIPA 1UA7A 2WVSA 4JZ5A 1WO2A 4AXNA 1JNEA 1UH4A 4Z2KA 1E15A 1JZ4A 1Q6CA 3PTQA 4A3HA 1W3LA 4UOJA 4S3JA 4P8WA 3AISA 2XVGA 3J7HA 3T2QA 2FH6A 2PWFA 2VCBA 3U5UA 2GDUA 5HNNA 4WKAA 5A6MA 4OKDA 3K1DA 3MS8A 1H41A 1B2YA 2VURA 4H8HA 1BHGA 1H0IA 3SCWA 5BXSA 1YHTA 4BCEA 4ATWA 4AD0A 3ECQA 1UWQA 4ML4A 4P8UA 5E0CA 3K8KA 1CXHA 4UQ9A 1E5NA 4M8UA 2XHYA 1C92A 1MFVA 1W2VA 5A3HA 1UZ1A 3CMGA 1MWOA 1XGZA 1E43A 2A3HA 2GFTA 1EOMA 4LYPA 1EDGA 3WKZA 4W87A 1GJWA 2YKKA 4TVCA 4GKLA 4N42A 4UTFA 7A3HA 2V3GA 3IAQA 1J12A 3PZ9A 1DWAM 1QI4A 3QGVA 5IHSA 1EDTA 3W29A 2G3IA 1UWSA 4DWSC 1OGBA 4PTVA 3BMWA 5A2BA 1WZMA 3GNPA 1Z32X 4P8VA 1TA3A 3W53A 3WDIA 1JDCA 3WSUA 4ZXOA 3K4AA 4AZCA 2A3EA 2JFEX 4AW7A 3IANA 3K46A 4XZWA 2W62A 4NF7A 1RH9A 3W6LA 3CBWA 4FLSA 3VD4A 1MW3A 1GOOA 4CD7A 4AD4A 1HNYA 3CUJA 4Z2JA 3N1AA 4CCDA 2YIHA 1SMDA 1ODUA 4DUVA 1G1YA 2B31A 3T0BA 4CN4A 3WUFA 5E0FA 5E6ZA 3GXFA 5IHRA 1HP4A 3VMNA 2E9BA 1OD8A 1CXIA 3ZT6A 1GQKA 4UQAA 4GXPA 3WELA 3MV11 1HF6A 4P7OA 2IXUA 4LX4A 4J3WA 2PI6A 4Z2LA 3EDFA 3CZJA 2GVYA 1QHOA 3CLWA 5A1AA 3WF1A 1KB3A 1WDSA 3FHAA 1BVNP 1RP8A 2FGLA 2VR5A 1G5AA 1CXKA 3PZTA 2VR4A 4AZIA 2ZXAA 1E6SM 1HP5A 1KR0A 1TA3B 4WF7A 5A6BA 4B9YA 3WDPP 2DSWA 1V08A 5A8OA 2BS9A 2YLAA 3WDJA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1I1XA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations