1HF6A

Endoglucanase cel5a from bacillus agaradhaerens in the orthorhombic crystal form in complex with cellotriose
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus agaradhaerens
publication title Direct Experimental Observation of the Hydrogen-Bonding Network of a Glycosidase Along its Reaction Coordinate Revealed by Atomic Resolution Analyses of Endoglucanase Cel5A
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE B
total genus 119
structure length 300
sequence length 300
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2000-11-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1hf6A00
1W3KA 3MUAA 3RILA 4UQDA 5GPRA 1QI0A 4J7RA 3WUFA 2VT0A 3SCUA 1KGXA 1CWYA 1E72M 3BSGA 3DECA 3EMZA 1PAMA 3RO8A 2UY4A 4PMNA 5A2AA 3CGTA 2VZSA 4Y7EA 1JI2A 3BC9A 3PZGA 1HVXA 4W86A 4FLOA 1PPIA 3WDHA 4CUCA 3CHDA 1JZ5A 4JFVA 2BY2A 1DTUA 1LWJA 1XH2A 4CVWA 3CZEA 4PSPA 2XVNA 1GOOA 2YOCA 1H0IA 3AICA 4WKFA 4U3AA 3CZGA 3S6TA 3AISA 1IV8A 3U57A 5DT5A 5M17A 3VGEA 1Q6FA 4AYSA 2OSWA 5ABHA 3KWXA 1XV8A 4AZ6A 4M29A 4N0RA 1BG4A 1LWHA 3RDKA 1JIBA 1UD2A 3T09A 3WFLA 1E1EA 1QBBA 1JZ6A 2OWWA 1EQPA 1PBGA 3WKZA 1B30A 3K4AA 2FH6A 3N1AA 4D6EA 1WZKA 4MJ2A 3N04A 1UOKA 3PTMA 3K46A 3MANA 1JGIA 2A3HA 1JZ3A 3CZKA 4DM2A 4JKMA 3WDJA 1ODUA 2YJQA 1EO5A 1EGZA 2WVUA 4AW7A 3WFZA 2VZUA 5EB8A 4OUEA 5HPCA 3K1DA 3T08A 2E4TA 1UKOA 1C93A 4XX6A 3WD0A 2X0HA 2DPEA 1C8XA 1LF1A 2UWFA 1TVPA 2CNCA 2Z1KA 1RP8A 1FHLA 2CESA 4TVDA 4L4PA 7A3HA 3F5KA 4UOQA 4CD4A 5HXMA 1D2KA 2DIJA 2YDSA 2DT1A 4LYPA 3WQVA 3VX0A 1ODZA 2XIIA 1QI2A 3VD7A 3NJ3A 2WLYA 3EDJA 4P7NA 2DSWA 2F8QA 3KL3A 1LL6A 3CUJA 1ISYA 1FFRA 3A6OA 1IZKA 4RE2A 1E73M 5TD4A 3MO4A 3WF2A 5CXPA 2VOTA 4ML4A 3ZJKA 1BVZA 4TX8A 2W4XA 5HOSA 4MB1A 2VO5A 2WKGA 3WNMA 1GOQA 2BHZA 1HP4A 3AYSA 4WK9A 3L2LA 5C70A 2D20A 3L4UA 1SMDA 3RMEA 1SR0A 3BLPX 1G01A 1HKIA 4PSRA 3BGAA 1V0MA 4UZUA 2JIWA 3BAWA 1FOBA 1U2YA 4B9ZA 1OD0A 1V02A 1QNOA 1QI4A 2VL4A 2XPKA 4B3LA 5IHSA 5DMYA 3MV11 3W4RA 3GH4A 1KCKA 1W1TA 2CERA 1XH0A 4W93A 4BS0A 4MDPA 1CXFA 3AHTA 4HZ7A 1P6WA 2WCGA 2DT0A 8A3HA 4W7UA 5HBFA 2VCAA 2NT1A 2ZX8A 5BXTA 1M04A 4MNMA 1B3YA 5LA0A 5I0DA 4JL1A 1MW1A 1UWIA 4UQAA 1QVBA 4OBRA 4AC1X 1XSJA 3FHQA 2GVYA 1C92A 2YL6A 2PWGA 3LPGA 2WHKA 1MQPA 1MW0A 1E6ZA 3KEHA 1W2PA 3GYCA 4C7DA 1JFXA 3EDEA 3F5LA 4GIAA 2XWDA 1QNPA 2FHBA 3LPOA 4JHOA 2CBUA 2PWHA 2TAAA 3BH4A 3M46A 4YN5A 2G3MA 1VAHA 1D7FA 1HIZA 3L4WA 1Q6EA 3ARXA 1JXJA 1PZ2A 1EHNA 3NDYA 1YHTA 2UY3A 4XB3A 4P8UA 4HMDA 3W26A 4YPJA 1EOKA 5F7UA 2AMGA 1HP5A 3AHXA 1L8NA 2EXOA 3DHUA 2NSXA 2WC7A 4U3CA 4CVUA 4WKHA 1UH3A 2JFEX 3FY1A 4OIFA 3VGGA 1N82A 4PTXA 5A6SA 1V6YA 3WH9A 4W88A 2VC9A 4PCTA 2FHCA 2V5DA 4ATWA 1B1YA 1S46A 4FF5A 4U31A 1JNDA 3BMVA 4CN4A 2Y8KA 3U7VA 2RGLA 5I23A 2VMFA 1KCLA 5I77A 3VIGA 2WWDA 3NUKA 2YBTA 3CMJA 1GORA 1E15A 4WIWA 1K9TA 4AD0A 2XVPA 4FLRA 3N18A 5I3DA 4Z2JA 1J0KA 4W5UA 4E8DA 1E4NA 1BTCA 3ARRA 2PI6A 4BQ4A 5CPQA 3WH6A 5HDRA 5EFDA 1UD3A 4HOXA 3KL0A 3UG4A 2BXYA 4UFMA 1H11A 1GOKA 4CD6A 1J12A 2J7CA 3ARQA 2VX5A 4AZCB 4GI6A 1EQCA 3TP4A 3VIKA 3QR3A 3AXIA 3BCFA 3BSHA 1F4AA 2Q8XA 3WUGA 2BHUA 3F4VA 2ZX5A 3VVGA 4PMOA 1VJSA 5AC5A 1XYZA 3RJYA 2OWXA 3T2PA 4M24A 4DUXA 3BLKA 5BXPA 2WMJA 4FK9A 5I79A 2ZUWA 4F8XA 5D9NA 4ATDA 1H09A 3AJ7A 4H04A 4AD4A 1GONA 2WB5A 1UD6A 1F4HA 1UKSA 4FLQA 1UKPA 3M7SA 4UNIA 3N12A 5D4YA 2J79A 2ZXQA 5D9MA 2GUYA 4URIA 4S3KA 2VI0A 3WF4A 4QCEA 2BVDA 3II1A 1WKYA 1XH1A 2XFYA 1UWUA 4J28A 2XM1A 1C90A 4W8AA 1CGWA 4PMVA 1W32A 4GPNA 1NWTA 2A3BA 3M07A 1GOWA 1UWSA 2GJRA 1JFHA 5I24A 4Q7NA 4PYSA 1JYXA 1B3WA 1ISWA 1J0IA 2A3CA 4JCMA 2W62A 3ARPA 4UFJA 2QV4A 3ZJ7A 4H8UA 4M56A 3WD4A 2GSJA 4AZGA 2BXZA 3EDFA 5A6MA 4B16A 3MMUA 1CECA 1VBUA 1R8LA 2J62A 4OBSA 2WAGA 2VNCA 3HMCA 4NRSA 4GZEA 2YIHA 1TA3B 4ZFMA 3UG3A 2ZUVA 3W27A 2WMGA 3VDCA 2J47A 4QAWA 3B8SA 4F79A 3ZJ8A 1JAEA 3AMDA 1HVQA 1ECEA 1GJUA 3AZSA 5JUVA 4CN6A 2XG9A 3QGVA 3VOCA 3MU7A 5A8PA 3OLEA 3WF3A 3CHEA 2WZEA 4P8XA 1KWGA 3WEZA 4PMQA 3GZAA 1BHGA 5I2UA 2EPOA 4PN2A 3MKKA 2C8NA 3WIJA 1E5NA 2WHJA 5BRQA 5A3HA 4V2XA 3BXWA 1CXIA 2QHAA 2VQTA 4OJYA 2J7GA 1OIMA 3WDIA 2VVSA 1KXQA 1Y7VA 4CD8A 4TVUA 3BAXA 2YL5A 2E9MA 1HJWA 1QHOA 5DFAA 4UZSA 2JE8A 1AQHA 1OSEA 1E4MM 1PZ3A 4LYRA 4DUVA 1B0IA 1XD0A 3MSDA 2VCBA 2XVGA 3N17A 4Z2LA 1CGVA 3I3BA 4ACZB 1BYAA 3VMOA 3AIUA 3GH5A 1BFNA 4TX6A 4U2ZA 3HN3A 2EBNA 2OSXA 5ECUA 1BSIA 1CXEA 1E4LA 2V3FA 1QW8A 1I1XA 1JF6A 2ZXAA 1W9VA 1PEZA 2YLAA 1JG9A 2UY2A 2X09A 4WF7A 5FL0A 4D72A 4HP5A 1C8QA 4FLSA 2X05A 4JL2A 4M80A 2D0FA 3PZOA 2YKKA 4MAVA 1KQYA 4KRTA 1IZJA 3W81A 1TZ7A 3SCTA 2ESCA 2V38A 4MADA 1MQQA 1O6IA 1GZJA 1GQLA 4NF7A 4RL3A 4PTWA 2D23A 1Q6DA 2X2YA 4CU7A 2CEQA 4CU6A 9CGTA 5AY7A 2X8RA 1JDAA 1X6LA 3TTQA 1W1PA 2J77A 1ESWA 3GXMA 1G9HA 2ZUTA 1G1YA 2WM0A 5HNNA 4DWSD 5CPTA 4AWEA 4X0VA 1E6NA 4CN1A 3L4TA 1VIWA 2X1IA 3W25A 5EBAA 2JF7A 3TTYA 2BV9A 1US2A 3VDBA 3QOMA 1H2JA 4P8VA 1E0VA 4AZCA 1CGYA 4F9JA 4RE3A 2QF8A 1E1FA 2O92A 2D2OA 1XYFA 3PTQA 3OZPA 1ZU8A 4OOUA 4DWSB 2ZICA 1VFMA 1H5VA 1SFSA 3THDA 2EPMX 3BCDA 4D6CA 1WZMA 2DGAA 2ZUSA 1HJSA 1E70M 1EDQA 3O6AA 3UEQA 4UTFA 3UERA 3QOKA 5CSUA 5E6ZA 1E6XM 1JI1A 3VGFA 3AIEA 4U5IA 1BYCA 1UHVA 4B9YA 3NSXA 2WHMA 1UKTA 1GVIA 4ZEPA 3L4VA 1V6WA 3IJ8A 4AIEA 5BROA 3AS3A 5A8QA 3VD4A 3GNOA 3TA9A 2GFTA 3GM8A 1WDRA 2CYGA 3CO4A 4PMZA 4PRWA 4JZ5A 5A6LA 1NQ6A 1GQJA 3T0BA 5E0CA 3WUEA 1HKJA 4PCSA 3WF0A 1R87A 1V0LA 1FP9A 1G94A 4ATLA 4GINA 1AQMA 4QLKA 3VIFA 3DC0A 3OA5A 5AC4A 1RPKA 3WN6A 3TTOA 4GQRA 2V3DA 3F5JA 3SCVA 3WQ6A 4KH2A 1BQCA 4OKDA 1A3HA 3BAKA 1E0XA 1LJYA 2ZUNA 2WHLA 1AQ0A 2DH3A 2WMHA 4Q22A 1A47A 2WYSA 4P7RA 1TA3A 5BXRA 3GH7A 2XSAA 4N42A 4XZWA 4J27A 3VIJA 1WAWA 1FA2A 2Y4SA 2DSUA 4EKJA 1FH8A 2D1ZA 4MB5A 1M01A 3WH5A 4V28A 2WKLA 3L4YA 1QW9A 1WB0A 1BGGA 2BNJA 3N9KA 4CU8A 2BVYA 1V3IA 2CCRA 3AIQA 3BAJA 3EDDA 5ABFA 3S2CA 2QMKA 5GQBA 4JIEA 2WCAA 1HF6A 2YDRA 3JUGA 1V08A 3W6MA 2FH8A 1V6UA 5JIWA 2GJXB 2IXUA 4IISA 3FN9A 4P7OA 4X9YA 1O7AA 2WXDM 1US3A 1XD1A 1U33A 3BMWA 2C7FA 4QFUA 1K9DA 2J7BA 2GJPA 3CIVA 1J0ZA 4ACZA 5IFPA 3U5UA 1RH9A 3KE0A 3D3AA 4JKKA 1XCWA 3VIMA 5CGMA 4EK7A 2PF0A 3CUFA 1WO2A 2CBJA 1E6RA 3VO0A 2O9RA 1JD7A 4WKAA 3CTTA 4UOJA 4MAZA 1FP8A 2XWEA 3EBVA 4JFWA 4MTVA 1ZL1A 1MXGA 3WF1A 1E43A 1KXTA 3IK2A 1UYQA 3SCRA 3DHPA 3ZM8A 3GNPA 4AEFA 1HX0A 1SYTA 1EXPA 3ARTA 1ZJBA 3VNYA 3AS2A 1UQZA 1M53A 2WVVB 2GDUA 3TTSA 4ACYA 1JZ7A 1E3XA 4BCEA 1E9LA 1OB0A 2QMJA 2DT3A 3AOFA 1UQYA 4MNLA 2IXVA 2Y5EA 3ALFA 1UR9A 3ARVA 3WMCA 4AXNA 3WNNA 4D6IA 1ZBVA 1UR2A 3WELA 2XVLA 2DSKA 7CGTA 2XJ7A 1HKMA 4PMRA 3UR7A 1ISXA 2WWCA 2WC4A 2D3NA 4IPLA 1C3FA 1VFFA 4XV0A 2EJ1A 1CTNA 2E3ZA 3AMLA 2XM2A 2V3GA 4D6FA 5D8WA 2VZTA 2ZWZA 4M8UA 4B15A 3EMCA 3U5YA 1V6VA 4BQ5A 4W85A 4J3UA 4CCCA 4YHGA 3W82A 3VM7A 4DWSA 1XSKA 1TMQA 3UR8A 3FAWA 1R7OA 4AIUA 1CPUA 4AZIA 3VGHA 4EAMA 2Y8VA 4NZCA 1XCXA 3AS1A 3VDAA 1EA9C 1UR1A 2WVTA 3AMKA 3RM8A 1E56A 5IFTA 4TTGA 5A6KA 1JZ8A 4HMCA 1NP2A 1L0PA 1GNXA 5DEZA 5ABGA 5A95A 4ZXLA 2EO7A 5FIPA 3AHVA 4H2CA 3WL0A 2G4FA 2Z1SA 5D8ZA 1WDQA 2W91A 2ZWYA 5BXSA 1QOXA 1UH2A 3CMGA 2XSBA 3PTKA 4AD1A 3WD1A 2XGBA 4JAWA 1J10A 3DYPA 2XUCA 1JL8A 1W9XA 3A4AA 3RPMA 1LG2A 2PWDA 4R27A 3NCOA 1CIUA 4KGLA 3THCA 3AQUA 4UOZA 3WQ8A 3DYMA 5A2BA 3OGSA 5A6BD 5LYRA 2ZX7A 2ZUUA 4PMYA 1J0YA 1V3HA 1U30A 4W8LA 4D6DA 1DP0A 5A8MA 2BS9A 3IJ7A 1WPCA 3AS0A 1MWOA 6TAAA 4OZOA 1OCQA 3SCWA 4A4AA 1AMYA 1DWHM 1PX3A 1OGGA 4GZJA 5M03A 1M7XA 1VFOA 4C7FA 1QI3A 1IT0A 1W9DM 3AFBA 1HNYA 1TG7A 3I3EA 1UZ1A 2W5FA 2NW0A 4HA4A 2YL9A 1B9ZA 5DT7A 1V02E 4JHZA 1NOFA 3U7BA 3O2LA 1UZ4A 3BAYA 3OLGA 2VX6A 3ZOAA 5I6SA 5CJ5A 2CXGA 3FNDA 3MUIA 3TONA 4P7QA 2E0PA 1KXVA 4PUEA 2GDVA 3B9AA 3VUPA 3PBGA 1H49A 3W0KA 3ARYA 1E6QM 3MMDA 5I5RA 1DWGM 1QNQA 5KZ6A 2PWEA 4K68A 2W63A 3AIWA 3EMQA 2FHFA 1JAKA 3OGVA 3MV01 3AXXA 4BQ3A 1W91A 5IDIA 4W89A 1CXKA 2GJXA 1R86A 3POHA 1BAGA 1XSIA 1UA3A 3CUHA 1PIFA 4Z2GA 1DWIM 3CLWA 2WNWA 2W92A 1UD5A 3WD2A 1HJXA 1OIFA 1WZLA 2RGMA 4IUGA 3AIRA 2E8YA 1E40A 1JD9A 2GK1B 1EH9A 1MXDA 1OINA 4TOQA 5I78A 1VJZA 3HU7A 5CSYA 4UQCA 3ZT7A 3AMCA 1HN1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1W3K A;  3MUA A;  3RIL A;  4UQD A;  5GPR A;  1QI0 A;  4J7R A;  3WUF A;  2VT0 A;  3SCU A;  1KGX A;  1CWY A;  1E72 M;  3BSG A;  3DEC A;  3EMZ A;  1PAM A;  3RO8 A;  2UY4 A;  4PMN A;  5A2A A;  3CGT A;  2VZS A;  4Y7E A;  1JI2 A;  3BC9 A;  3PZG A;  1HVX A;  4W86 A;  4FLO A;  1PPI A;  3WDH A;  4CUC A;  3CHD A;  1JZ5 A;  4JFV A;  2BY2 A;  1DTU A;  1LWJ A;  1XH2 A;  4CVW A;  3CZE A;  4PSP A;  2XVN A;  1GOO A;  2YOC A;  1H0I A;  3AIC A;  4WKF A;  4U3A A;  3CZG A;  3S6T A;  3AIS A;  1IV8 A;  3U57 A;  5DT5 A;  5M17 A;  3VGE A;  1Q6F A;  4AYS A;  2OSW A;  5ABH A;  3KWX A;  1XV8 A;  4AZ6 A;  4M29 A;  4N0R A;  1BG4 A;  1LWH A;  3RDK A;  1JIB A;  1UD2 A;  3T09 A;  3WFL A;  1E1E A;  1QBB A;  1JZ6 A;  2OWW A;  1EQP A;  1PBG A;  3WKZ A;  1B30 A;  3K4A A;  2FH6 A;  3N1A A;  4D6E A;  1WZK A;  4MJ2 A;  3N04 A;  1UOK A;  3PTM A;  3K46 A;  3MAN A;  1JGI A;  2A3H A;  1JZ3 A;  3CZK A;  4DM2 A;  4JKM A;  3WDJ A;  1ODU A;  2YJQ A;  1EO5 A;  1EGZ A;  2WVU A;  4AW7 A;  3WFZ A;  2VZU A;  5EB8 A;  4OUE A;  5HPC A;  3K1D A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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