2E6DA

Crystal structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with fumarate
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase complexed with substrates and products: atomic resolution insights into mechanisms of dihydroorotate oxidation and fumarate reduction
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 105
structure length 312
sequence length 312
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2006-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 2e6dA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2e6dA01
3Q58A 4XZ9A 3EWWA 4WJEA 1SZGA 2GQ8A 4CQ8A 1TV8A 2ZA2A 3TXZA 3W1NA 1EP3A 4CQAA 3S9YA 3QEZA 4C1LA 3M9YA 3W2JA 2ISSA 4YCOA 3EEGA 1OYAA 1HO1A 3TK7A 4DQWA 2ZCGA 2V8ZA 2ZTJA 5EA9A 2HSAA 4AXKA 4I7UA 3C0JA 3MUXA 1F7BA 4OE7A 1H60A 2R8WA 4AWUA 1AMKA 2DZTA 2OCZA 2Y88A 5HUOA 3ZR4A 2R91A 2Y7EA 1PV8A 4N9EA 4PFMA 3E12A 4IPIA 4UR8A 3D0CA 3LERA 3BG9A 3KRZA 1GVSA 3GLCA 3TR2A 1A5CA 1O5KA 3W1PA 2Q3RA 4PCFA 4Z0SA 2QUTA 3WK2A 1FWWA 3PUEA 4MY9A 5EBUA 1GTHA 3MBFA 3T7VA 2Z6IA 3UD6A 3F1QA 1T96A 3ATZA 4DF2A 3TUUA 1IXOA 3G24A 5FF4A 5FEPA 4JDYA 4Y6GA 4BFAA 3DAQA 2BWGA 3LHTA 3QZEA 1K3UA 2VELA 2ZZ1A 4K8EA 2B0MA 5I3GA 3B4UA 3CIXA 3M6YA 2CLFA 1G6CA 2KZHA 3IGXA 5HNRA 2WNNA 3UPBA 3NQAA 4ZQNA 3UWYA 1SUXA 4LUJA 2BXVA 2B7NA 2B7QA 2YW4A 4IJBA 5U4NA 4O53A 1O4UA 4CCDA 4E0CA 1R46A 3W72A 3NYZA 4GBUA 5LZLA 2ZZ4A 3L67A 3QM3A 1Z44A 4UFIA 1OX4A 3TIMA 1WDWA 2VFHA 3S6DA 2QCFA 1ALDA 1XBVA 4MY8A 1SZEA 4JX5A 1VZWA 2J9YA 4AHOA 4ML9A 3L0NA 1FCBA 4MUZA 1DOSA 4CQ9A 1LBFA 1TJRA 1PVNA 3DFOA 2WSQA 5HJLA 1N7KA 4DBEA 4A2RA 4LVBA 3W87A 1KM5A 2G5WA 2YGYA 1TRIA 3DI1A 2ZA1A 2GUUA 1SO5A 4FB7A 3YPIA 2H90A 1X1ZA 3P8IA 3N34A 3RLVA 3W1MA 1JUEA 4ORIA 4BWLA 2V5BA 1KM0A 1H62A 1ME8A 3QPZA 5CG7A 1QOQA 4CCCA 1FX6A 4MYXA 4L4LA 3NG3A 3SZ8A 3S8HA 3W7QA 3DH7A 5EKYA 3BPWA 1I2NA 1K7FA 3OEXA 4GXMA 4R53A 1PHQA 4GUFA 3GKFA 5A8GA 2C3ZA 3OG3A 3TJLA 3IGSA 1KW1A 4DO5A 1DORA 3TROA 3LXCA 3N14A 3FJLA 2TRSA 3ABQA 2A0NA 2CZ5A 4M5PA 4A22A 4NJGA 3TCEA 2VENA 3FIGA 3FFSA 4NU7A 1OFAA 4X22A 1XCFA 3WJWA 4A3UA 1QCWA 2O7SA 3O06A 4FF7A 3BK0A 5D05A 1VHCA 3PBYA 1RR2A 3KX6A 3INPA 4DO4A 2X1RA 3A5FA 3CIWA 3QSRA 4OQVA 4KWWA 3GX9A 3DFSA 3TA6A 2F7FA 3NL3A 2IQTA 4JNMA 4I9AA 1VR6A 1LRTA 1MEHA 3WJSA 1RQHA 4XKYA 4A29A 5CPOA 1GQNA 3LTPA 3M16A 3NDOA 4N02A 4O0KA 4UTIA 2OT1A 4UTHA 3FOKA 5KZEA 3JR2A 3EX2A 4WX2A 3ANYA 3MI2A 1OX6A 3Q94A 3W7LA 1RQEA 1TPH1 1EA0A 3P67A 1GT8A 1TPC1 4ALDA 3HO8A 4XQ6A 1B9BA 3PM6A 2W6RA 3THQA 1HG3A 2Z0IA 1KFKA 4IUOA 1TJPA 4AHQA 5FF3A 4IXXA 3NPUA 3LLFA 5DBTA 1AW1A 1OJXA 3PAJA 3O07A 5LSMA 1HFBA 5K7JA 1QAPA 3NAVA 4TMBA 1VC4A 4RV8A 2JKAA 1KBIA 1GTEA 3ZS4A 1TTPA 1F76A 2I1OA 3GB6A 3C2FA 4NZJA 1W37A 3DZ1A 5F4XA 2OZ0A 4DF1A 1WX0A 3VKJA 2A5HA 4EF8A 3O8AA 1TCDA 3I7RA 1UCWA 3E49A 3SFKA 2JBMA 2Q3OA 1XBXA 4LVDA 5H2ZA 1SFLA 2AQWA 3L5LA 1G7VA 3QH2A 5CZTA 4QQ3A 3HIJA 4Z1AA 1HTIA 4RKAA 4LC8A 2NXIA 5AFDA 1DJQA 4RR4A 4MPQA 4UIOA 4UFHA 5HULA 3DGRA 3NQ8A 1T8XA 1L6WA 4RX0A 1ZENA 4UR7A 1FDJA 3W7OA 5F2MA 3GIYA 4N6EA 3PB0A 4XWUA 5DXXA 1ONRA 4BF9A 3DKLA 3IIZA 4BI6A 1B4KA 3P61A 3P8JA 4FEZA 4U28A 2E6YA 4TU1A 3DFQA 3U6WA 2Y7FA 4FIRA 5F1VA 1VLIA 3T78A 2C13A 1KM2A 4LV9A 1OHLA 5D2VA 1H51A 2QDHA 2J27A 4QISA 4MY1A 5BW6A 1I8JA 4LWWA 4O1BA 2NUWA 2LLEA 4K36A 1RPXA 3JRKA 4GJ1A 5E93A 1WA3A 4FIQA 1CI1A 1A50A 1IXNA 1W5MA 2D73A 3P5ZA 2YFOA 5HUPA 3BO9A 2YYUA 1WAUA 1EUNA 3O05A 1XFBA 1AW5A 2YXGA 4PA8A 4LY8A 1O5XA 2HMCA 2BLEA 1TPUA 1JR1A 4HSOA 2RFGA 3FYPA 1S5VA 2ZQ0A 3NL2A 1QNVA 2QJGA 3GZ3A 1BTMA 1LLWA 1WBJA 4HPXA 4HNNA 3C2OA 3I68A 3O16A 3R8RA 1EIXA 1B4EA 3BG3A 5CZJA 3W2KA 1L6SA 4TX9A 3B04A 3OBKA 4O57A 2NX3A 2B7PA 1ZHAA 4DXVA 3UPWA 4RZ4A 1H7PA 4NNCA 2H3DA 1OYBA 2V5LA 3S42A 4JY8A 5ABTA 5IBXA 1QOPA 5DLCA 4IMFA 1R2TA 3NQVA 1B57A 4HSNA 4O19A 3HGOA 4FNPA 1S5TA 3F4WA 5CSSA 3Q37A 4UMCA 3UZ5A 2NV1A 5TIMA 2VEPA 3LBCA 2DJXA 2PCQA 2CLEA 3U8GA 3GR8A 3W1XA 2QCNA 1FCQA 3C8FA 3PC0A 4RZ6A 2NWRA 2CZDA 4AVFA 4N4PA 5CZ0A 1A5SA 1X1OA 2VC6A 1WYIA 2A2IA 1JCXA 2RDUA 2FQIA 2ZZ2A 1ADOA 3QJAA 2QCGA 2DZPA 2JGQA 3TC6A 4E38A 4Z08A 2NLIA 2ZRXA 3O6DA 3W71A 4LRSA 3VCRA 4AF0B 3GYEA 1GVFA 3UWVA 4FXSA 1W5OA 4KFNA 4LS0A 4JX6A 3TW7A 1ICPA 5F2LA 3C2VA 1ZFJA 1O60A 3L0GA 1EWDA 4AMAA 2W0UA 4JTLA 2YSWA 3C2EA 3USBA 2CLHA 2JKPA 3CQ0A 3TSMA 4JD4A 3W7CA 4LOCA 1ME7A 1N8FA 4PH6A 3EXRA 2ZRYA 2NV2A 3KFTA 2OJPA 3UWQA 4LNYA 3TFCA 3W1UA 4ZQMA 2H6RA 3CHVA 2A7NA 2RH9A 1SPQA 3VI2A 5LNVA 3QSTA 3R2GA 3MHGA 4ADTA 4AF0A 5A5WA 3W1RA 4N9BA 3EX1A 2ZZ6A 1HUVA 3NGJA 5FI8A 3STGA 3R13A 4UNKA 2A85A 4AWSA 1OVDA 5D32A 3W9ZA 3A22A 3LLDA 1YYAA 4LV4A 1KV5A 3B03A 2CLKA 4UTWA 1TMHA 1YXYA 2JKEA 2WOQA 3GDRA 4JTSA 4ONVA 5TBOA 1P0NA 1Z48A 4WD0A 2EHHA 5J5DA 1P1XA 1KLYA 2WKJA 4IGHA 4UXDA 4QIUA 5C5YA 1K8YA 3G8RA 2BSLA 3BGGA 5EPDA 4Z1DA 3HGJA 3TW6A 1TO3A 1W5QA 3CWOX 4ZZ9A 2ATMA 2DZSA 3WJXA 1DV7A 3W84A 1DL3A 1W5NA 1W3TA 3PB2A 2DU2A 2EPHA 2PRLA 1TIMA 1OK6A 3U2OA 3S1UA 2WV8A 4BWLC 4U4MA 1JCLA 4MZ1A 3STFA 3L9CA 2QJHA 1OX5A 2ZZ5A 3OVQA 1PS9A 3HBLA 1YPIA 1TQJA 2CLIA 3B8DA 4OGZA 1ZAIA 4NX5A 1QPNA 3O63A 1GYNA 1UJPA 1LP6A 1K02A 3LRMA 1SO6A 4OWGA 3TQVA 5HINA 2ZYFA 2DZUA 1NEYA 5DELA 2G95A 4ZVJA 1I2QA 4LVAA 3NPVA 4RXFA 1ZJIA 2GQAA 3RMJA 1IIGA 4DPPA 4PL1A 4L4MA 2DZWA 1MO0A 1H7XA 4BI7A 3CWNA 1EP2A 3W7JA 3GXTA 4FHAA 1QMLA 4HT3A 1VQTA 3A23A 2E5DA 4IXHA 3QYQA 3ABRA 1H5YA 1R47A 1FXPA 4NNBA 3NOEA 4UC5A 2QF7A 3W7DA 2QCDB 1LDCA 2DZVA 3A24A 1VRDA 3NQDA 4JR5A 4RJEA 4O12A 3RK8A 2FPVA 1I2PA 4FX8A 3G1HA 3GR7A 1LTDA 2ZRVA 3HOJA 3HB9A 3G3DA 4LVFA 3S1WA 1D9EA 5HR7A 4Y8FA 4TMCA 4M7TA 3QMSA 4N9CA 5HQEA 2V2CA 1IGSA 1KM4A 2QAFA 4WY0B 5HWMA 3W1LA 5LHEA 1QPQA 4JTHA 2DJLA 1RVGA 3FYOA 5D02A 1VCGA 2HS8A 3NZ1A 3PUOA 4O13A 5DCDA 4EF9A 1BWLA 4UMAA 1SZFA 1ZAJA 2TMDA 3W7NA 3NPWA 4K7VA 3VNDA 1L6YA 5CPNA 5G1YA 4HHPA 4LUIA 3ZFHA 3OA3A 1K8XA 3LDVA 3N9SA 4H4IA 2EAWA 1TPEA 3EXTA 5FF0A 3S5NA 2GOUA 4NJHA 1F74A 4JTTA 4A2SA 5AHNA 1ZNNA 4CNPA 3WJZA 3HJZA 2QCHA 4ADUA 4BK9A 5DCBA 3G18A 1THFD 3IIVA 2C0AA 4HPJA 1TPFA 4GUIA 3B05A 1LBMA 1Q45A 4K37A 5AYXA 2QDGA 1YLVA 1YDVA 2C18A 4X9SA 2GVJA 1LRQA 2ZZ7A 3W1TA 4KKXA 1GVOA 2NX1A 2QCLA 4JICA 4FNTA 2EKCA 3EWUA 4WOZA 2X1SA 4MFDA 4AB4A 3N2XA 2QCMA 3HQ1A 1TV5A 3QW3A 4IMDA 1TB3A 5G2HA 2VFEA 2E1DA 3EWZA 3KHJA 2WPBA 4N9DA 5AHFA 4M6QA 3LRKA 3DFNA 4UTJA 2QUVA 1UUMA 3TSBA 1XI3A 3S0CA 4LC6A 1W3IA 3G1DA 2A7PA 1XBYA 4O8RA 4CNNA 1OFBA 1KTCA 2PRHA 3B06A 4UFKA 5L9FA 2B7OA 4QSHA 1XXXA 2QCCA 1I2RA 1MXSA 5E0KA 4WXZA 2PE4A 3IIOA 3L65A 5LNRA 3W74A 2E6FA 4JYFA 1XL9A 2AGKA 4PL2A 2P1FA 4H6KA 5CSRA 3NO5A 3B0VC 4AWTA 2Q8LA 3C52A 3NNTA 3THAA 3W75A 4GUGA 5CGQA 3SIZA 2QJIA 2ZRZA 3O6YX 3SGZA 2YW3A 3P62A 3QW4B 1WOAA 5DXYA 5LNWA 2V81A 1T99A 3R12A 2GVGA 4GC4A 4Q33A 5HWJA 3ZWTA 4DPQA 4NUWA 5C2XA 3MP3A 1KM6A 3S5YA 1QDSA 1GVQA 5BNKA 3M5ZA 5LNUA 2VEMA 5U7SA 2J88A 2V82A 2X2GA 4UTKA 1W0MA 3OVRA 3P84A 1Z42A 2C1HA 2XN2A 3TDFA 3GDTA 1Q6LA 4ZMGA 4FNRA 3UZJA 4XUGA 4C1KA 4GNJA 1R2RA 2FB2A 4O54A 4UUIA 3DXIA 3MJYA 3HMJG 1Q6OA 4Q4KA 2YCEA 3DKJA 3S5OA 4E2DA 5MHBA 3W2MA 2ZFAA 1FCUA 3DFTA 3UNDA 2A6LA 3H53A 5KITA 4XBSA 4J9JA 4JIQA 2QEZA 1OFOA 1O94A 1GOXA 4NVTA 2X16A 3BW4A 5EL1A 3E96A 4LW7A 1M5WA 1MZHA 1H7NA 3G22A 3GNDA 5IBXC 1NF7A 4I7VA 2A6NA 4HNUA 1JULA 1JCMP 4DBDA 5DY2A 1GZGA 1A5BA 3T40A 4JTFA 1FDYA 1P0KA 4OHQA 1F6PA 1LOQA 4JDBA 1SSGA 5AB3A 2PC4A 1ML1A 2FB3A 1TV7A 3N3MA 3P5YA 5G4WA 2VFIA 2FJKA 3TKFA 5K9DA 3MI3A 2NXGA 3OVPA 2WNZA 1W8SA 2WNQA 4WY0F 4JTJA 1ZCOA 4O50A 3FLUA 3W3OA 3HPSA 3PY2A 4TIMA 3QMTA 2E09A 1DBTA 4PODA 1AL7A 3HG3A 3GXPA 1XDMA 3TFXA 4QJ1A 4NT0A 3S5ZA 1KFCA 3ATYA 1H1YA 2AAMA 3W7KA 2ZRWA 3DU0A 1F2JA 1I45A 4RZ5A 4S2CA 4UNLA 1K7XA 1VS1A 2ZDRA 3NQEA 4YLWA 3PR2A 1S3HA 2XFWA 4IPJA 4FNQA 3TX9A 2CFFA 1KFLA 3F03K 4JTUA 5F1UA 1ICSA 3WFAA 3FKRA 2GJLA 3L21A 3QQ1A 1K8ZA 2DZXA 1TPB1 1YTEA 4JTKA 2CWNA 4EOUA 2Z6JA 2ISVA 4K39A 1XM3A 3NA8A 1H7OA 2ALDA 3QC3A 3DHFA 1NAL1 2Q8ZA 3UXAA 3NL5A 3TJXA 3MMTA 4JTEA 3GNNA 3LXBA 3LHYA 1BEUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3Q58 A;  4XZ9 A;  2VHL A;  4QLL A;  1JF6 A;  4CQ8 A;  2QPS A;  4D6C A;  3WLS A;  3WH9 A;  3F4D A;  1A49 A;  1ADD A;  2WM1 A;  1XIJ A;  3A64 A;  3TYA A;  4TX8 A;  3OGV A;  5BRQ A;  1WZA A;  3WKZ A;  2ZTJ A;  4Q8P A;  4BF5 A;  4TV6 A;  3C0J A;  4OE7 A;  1H60 A;  2R8W A;  2V5D A;  1AMK A;  2Y88 A;  4HOW A;  1MDR A;  1BXB A;  2Z7G A;  1UOZ A;  3FSU A;  2J8T A;  1XQL A;  2ZX7 A;  3BG9 A;  4ZTX A;  1GVS A;  1GHR A;  3PZV A;  5J04 A;  1XIS A;  4LAL A;  3FHQ A;  2DT1 A;  3P0W A;  4PCF A;  2CKS A;  4BQ2 A;  3PUE A;  4H8H A;  5EBU A;  3Q45 A;  3UD6 A;  1ELS A;  1KB3 A;  3ATZ A;  3E5B A;  1ECE A;  3CTT A;  3UG3 A;  3SRF A;  4C6B A;  4ZE4 A;  4HZ7 A;  3LPP A;  1MNZ A;  5M03 A;  5JIW A;  2ZZ1 A;  3CH0 A;  1G94 A;  5I3G A;  3H8A A;  4W8A A;  3VNZ A;  2WNN A;  5JUV A;  4ACZ A;  2QDD A;  4DBS A;  3NQA A;  4GXW A;  1R87 A;  4PBE A;  4G7F A;  1JG9 A;  3WML A;  2YW4 A;  3NYZ A;  1VFO A;  4IT1 A;  3WD0 A;  2ZZ4 A;  3DUG A;  1B2Y A;  4CNS A;  3U5Y A;  4D1I A;  4HU4 A;  2CXE A;  2AMG A;  4GHR A;  1NH6 A;  4EPK A; 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