4F8XA

Penicillium canescens endo-1,4-beta-xylanase xyle
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
DIDLNKLAQRRGKHWFGTAADIPGTAETTDAAYLKVLKQNFGEITPANAMKFMYTETEQNVFNFTEGEQFLEVAERFGSKVRCHNLVWASQVSDFVTSKTWTAKELTAVMKNHIFKTVQHFGRRCYSWDVVNEALNGDGTFSSSVWYDTIGEEYFYLAFKYAQEALAQIGANDVKLYYNDYGIENPGTKSTAVLQLVSNLRKRGIRIDGVGLESHFIVGETPSLADQLATKQAYIKANLDVAVTELDVRFSTVPYYTAAAQKQQAEDYYVSVASCMNAGPRCIGVVVWDFDDAYSWVPSAFAGQGGACLFNNTLEAKPAYYAVADALEGKPCSVC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Penicillium canescens
molecule keywords Endo-1,4-beta-xylanase
total genus 139
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2012-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4f8xA00
1VBRA 1WE5A 3CHEA 5IHSA 5A3HA 3BCFA 5HNNA 2J7CA 1EDTA 1GOMA 3DYOA 4HA3A 1JL8A 1ECEA 4JZ5A 2ZWZA 1PJ9A 1XH1A 4OBRA 2WYSA 2GDUA 4C7DA 4PTWA 4PMZA 3VDAA 3WF0A 1QNOA 2J4GA 1B30A 3MUAA 2NT1A 1TUXA 1EIBA 5A8PA 1HKKA 3B8SA 3VD7A 2WC3A 1BYCA 1EHAA 2V38A 4OKDA 1PX3A 2XIBA 1NARA 1R85A 2A3CA 2W5FA 1OIMA 4CD7A 2WVUA 3RM9A 1XCWA 3CLWA 1KXVA 3WF3A 5ABGA 1H3GA 3EMQA 5GNYA 1LWJA 3WEMA 1QVBA 2XVLA 4PMYA 3IK2A 2VC9A 4JKMA 1V0LA 3GNRA 4AD2A 1VEPA 2XYLA 3AS2A 4CCCA 5FCZA 2EO7A 2YBUA 4AZHA 3VMOA 2BV9A 3ARTA 5I23A 3TTQA 2ZWYA 1ZBKA 4B3KA 1BAGA 2E40A 5CJ5A 1W1VA 1V3LA 2XVNA 1E1FA 3II1A 4J3UA 1JFXA 7A3HA 2CBIA 3UCQA 1E0VA 1KR0A 5IHRA 3OBAA 3WSUA 2VJXA 1ZJAA 1J0KA 4EK7A 2XGBA 3B9EA 5A94A 4N0RA 1BVZA 4PN2A 4JFVA 5CPSA 2J75A 1ZU8A 2GVYA 4JFTA 3VOCA 4J3VA 2JALA 1MW1A 1GJUA 4A4AA 1ISXA 2B31A 3VVGA 3ZJ7A 3CZ8A 4UCFA 1J01A 5E09A 4UR9A 3VILA 4CVWA 1EHNA 1CECA 5LA2A 1EDQA 2ZUWA 2WHKA 4UOJA 4WKHA 3CHCA 5I0DA 3ARZA 1UR9A 4AW7A 2Z1KA 2Y8VA 4GI9A 1WZAA 3IJ7A 1J10A 1V6VA 3WUEA 1FH8A 1WCGA 2G3MA 4ZEPA 1VJSA 4ATWA 1JDAA 1UD8A 3O9NA 1G1YA 1E55A 2VZUA 3ZQ9A 2CHOA 5GPRA 5A8QA 2BHYA 1JNDA 3AHTA 2VRKA 5GNXA 4DM2A 3QGVA 3N12A 3WDJA 3AHXA 4BF7A 4MNLA 4HU8A 1CGYA 3S2CA 1WDSA 1BYAA 2BS9A 4B9ZA 2J7EA 4RE2A 3WF2A 1BG9A 1DP0A 4DWSB 3ZJ6A 1Q6DA 5CSYA 3QOMA 2WLZA 4GI8A 2O9TA 2WZHA 4W88A 5I5RA 2AAAA 4UFMA 2BY3A 1NP0A 2VX6A 5A2CA 4V27A 3QHNA 3K8KA 3NCOA 4QLLA 4MNMA 3VIPA 4E2OA 3F5KA 4ACZA 1QHZA 2OLHA 1V3KA 2VZOA 4D6HA 1FHLA 2DGAA 1RP8A 3VM7A 1CEOA 3GXMA 2XM2A 3T0DA 5A8NA 4E8CA 3PZIA 4CGTA 1UKPA 4OJYA 5I79A 2X05A 1JIBA 2BY1A 4ACYA 2D3NA 4P8UA 2UWFA 4AC1X 4GXPA 2E8YA 1A47A 3N17A 4AWEA 1UWTA 1K9EA 3FXYA 3WQ4A 4DWSD 1U30A 1KQYA 3WL0A 1E15A 3WY1A 2G8ZA 1QI4A 1BYDA 3VX0A 2EEXA 3HJEA 3GNPA 2DPEA 2UY2A 4GINA 3PZ9A 1JI2A 2VUYA 3MMUA 5FD0A 1HL9A 1PAMA 1IT0A 3CHDA 5HPCA 3ZR6A 3PTMA 1W3HA 2IXUA 2RGMA 4QCFA 3T2QA 3BAXA 1CWYA 3VGEA 2F2HA 5JIWA 1R7OA 2ZX9A 4P8XA 3VNZA 4MAVA 4U3CA 4WIWA 1E4LA 1H0IA 4UFIA 5A8MA 2O9RA 1JAKA 2ZXAA 1M03A 4M82A 1K9FA 2OSYA 4QLKA 4M24A 5KZ6A 3VIKA 4CVUA 1KCKA 2JEPA 1TR1A 2WKLA 3ZT5A 3BMVA 2WLYA 2WSKA 5AYIA 1MYRA 4GO8A 1HKIA 5D9PA 3CO4A 1U33A 1GHSA 2Y8KA 3UEQA 3NIYA 4BCEA 1E9LA 2O9PA 4A3YA 1G9HA 4Z2IA 3T0AA 3UR7A 2G41A 1ISVA 1DWAM 3KEHA 5DT5A 1QI0A 1OB0A 5A8OA 4AZGA 1UH3A 3HMCA 1FHDA 2J78A 1KBBA 3MANA 1C8YA 2J8GA 2GJRA 4OBSA 1W1YA 2Q8XA 3W24A 3MSDA 4TX6A 1Q6EA 1ZL1A 3BMWA 2XPKA 1OGSA 3CZGA 4UQCA 1KWGA 3AS0A 4OOZA 1EOKA 4GZIA 2QV4A 2D20A 1J11A 1E40A 1KB3A 4QDMA 1W9BM 5DF0A 5JUVA 2BY2A 1UA7A 1AQ0A 1H09A 4TUFA 2WSPA 2QMJA 2HVMA 3ZM8A 3AHYA 3WNLA 4JCMA 4Z2LA 3OGSA 2WMGA 2BXZA 1LL4A 2EPOA 3VIJA 4KGLA 1DTUA 2VRQA 4WSJA 1HIZA 1BFNA 3VNYA 2Y24A 4KWUA 1JG9A 2J79A 1DWIM 3UG4A 2PC8A 4AD0A 2YBTA 2WVSA 1BHGA 2DSUA 3RJYA 4YHEA 1GOOA 4FF5A 3ZR5A 3SUTA 4D1IA 1YHTA 2XTKA 1V0NA 3MMWA 4M1RA 1CYGA 2DEPA 3OB8A 2WCAA 5HBFA 4BQ4A 4BA0A 4PCTA 1J12A 2VX5A 4AD1A 1K9DA 3D5HA 2VT0A 1TMQA 3AICA 1WDRA 2J7DA 4H04A 4OUEA 2ZX6A 2O9OA 2FHCA 1E0XA 3K8LA 1C92A 2DH2A 2XG9A 1OD8A 1UQYA 3WDIA 3ARUA 2W92A 1W9UA 5FOOA 3NDZA 5CGMA 5EB8A 4WSKA 3FW6A 1GJWA 4LYRA 4UFJA 3AXIA 5C70A 4UOQA 2VR4A 1GQJA 2DSVA 6TAAA 1LG2A 4UZSA 3WNKA 3M7SA 4H2CA 5TD4A 3VIFA 4YPJA 2JF7A 5BRPA 4PMVA 1KCLA 2WANA 1CNVA 2V3EA 3PTKA 1C7SA 3CBWA 4C7GA 4M56A 1CXLA 1E6RA 1NOUA 2PWDA 2YOCA 1UKQA 2EPNA 5BROA 3RMEA 1OGGA 1CLVA 1E6SM 3ARPA 2YL9A 2J25A 2VI0A 3VDHA 2WWCA 2J47A 1JNEA 1Q6GA 1VFUA 2YL6A 4JHOA 1E6QM 1GW1A 5HOSA 1W9PA 2E9BA 1C8QA 2CEQA 4DWSC 2V3FA 1MWOA 1MW2A 3GXDA 3POHA 3W6LA 1E43A 4AIOA 3VTRA 2JE8A 1EH9A 1W91A 5ABHA 1CGUA 2CHNA 3MV11 3WEZA 5I77A 4W8BA 4W5ZA 1V03A 3CUGA 4ML4A 2UY5A 1AVAA 3RPMA 3KL3A 2J7BA 2VMFA 3RDKA 1J0ZA 1FFQA 5AY7A 1QI2A 1V0MA 2A3AA 1LL6A 2WBKA 4PBGA 4WJXA 2XSBA 3K46A 1QI3A 2BXYA 4JL1A 1PBGA 1E5JA 2VO5A 1DWHM 4M8UA 5D9MA 3B9AA 3MUZ1 4V2XA 4MNKA 3DHPA 3EDJA 1QNPA 3AHVA 1HJQA 4BQ5A 1K9TA 2BY0A 1MXGA 4PSPA 1UD4A 1XSJA 3POCA 1ODZA 5A6AA 1Y7VA 1UWSA 1W9DM 2V3DA 4JFSA 4AD3A 3ZSSA 1GHRA 1PZ3A 1CDGA 1GQKA 5AC5A 2OYLA 1UD2A 1VAHA 1XGZA 4X9YA 3WDRA 2PBOA 4URIA 1XC6A 3W82A 1NWTA 2EPMX 1J0YA 2IUZA 1TE1A 1HKMA 1JF6A 3PZUA 1W32A 2F8QA 3JUGA 1SFSA 2WPGA 4ZE5A 2W62A 4D72A 1EA9C 1MW3A 4CU7A 3FAWA 4UQEA 3VD9A 4B15A 3AIVA 2OWCA 3SUVA 4W7WA 2CKSA 2JEQA 1AQHA 1OINA 3ZT7A 4HOZA 2JF6A 1W3KA 2Y4SA 1RPKA 2YKKA 3G6LA 3TOPA 3MMDA 2ZUTA 3WUFA 3UG3A 1G0CA 5DEZA 4PTMA 4W84A 5M5DA 1CXEA 2FGZA 1E73M 3GBDA 4U2YA 5E6YA 3SCVA 1KR1A 4A3HA 3LPGA 1HJUA 2WMJA 2XFRA 3QHMA 1OWQA 2ZUUA 4J3WA 5CXPA 4F8XA 1LWHA 2CBJA 4B9YA 2DIEA 3CGTA 1MFUA 2OWXA 3CZLA 1GONA 1C8XA 2YA2A 5CZKA 4F79A 4JHZA 1CGTA 1E6PA 3E1F1 1A3HA 2ZX8A 4KRTA 2ZUNA 2ZX7A 3VUPA 1G01A 2X1IA 1OGBA 1JXJA 4GQRA 4TOQA 1KXTA 2VX7A 4MJ4A 3CUHA 2BHUA 4FLRA 1W9VA 3W37A 1UWIA 3AI0A 4CKQA 1HJVA 4J3XA 2AMGA 1TVPA 4FLQA 4D6DA 1PEZA 2JFEX 2NSXA 4MNJA 3I3BA 1UA3A 2CETA 4RE4A 3RM4A 3AXXA 4IPLA 2WZEA 4IUGA 3EDFA 3VIMA 3SCUA 2WMFA 5EFDA 5E9AA 1E71M 3VMPA 1DWJM 1UG6A 1V6YA 2DSKA 3AIQA 1KWKA 4XUYA 3GDBA 2PF0A 2X09A 1D7FA 1VEOA 3WH8A 3WMCA 1E56A 1H1NA 3N11A 1JAEA 3B9DA 3VX1A 1KQZA 1B31A 5FL1A 3WMSA 3K1DA 1H5VA 1BQCA 3M07A 4DUWA 3MSGA 3I3EA 4D6FA 3MU7A 4IPNB 3WL1A 3WH7A 5FKYA 2ZUSA 2WHMA 1E4MM 3OIHA 4AZBA 1LF1A 3W28A 3HN3A 2ZUVA 3BAKA 2X0HA 3CZKA 3VDBA 2DSZA 1JXKA 3PBGA 1DEDA 3L4WA 1RD6A 1K6AA 3L4XA 4F66A 3VGHA 2EBNA 1Q6CA 1ZJBA 1XCXA 2VQTA 2YLLA 1UZ1A 2GSJA 2UY3A 1EXPA 3UR8A 2XWDA 1J0IA 5JBFA 4QLJA 2WZIA 2VZVA 1RP9A 2BVDA 3NSXA 4H8UA 4MPKA 2CBVA 2W91A 5M3WA 3AHZA 1HVQA 5ECUA 3BH4A 1FOBA 2GFTA 1UR4A 4XV0A 4AEEA 4WKAA 1UOKA 3MUIA 1CENA 3CTTA 4AZ6A 3M46A 4PMUA 1JZ3A 4XZBA 1NP2A 5BRQA 4IISA 1E5NA 3WNMA 3CH9A 3PZTA 4E4PA 4BQ3A 1V3IA 4W8LA 3NUKA 1MXDA 4HZ7A 1UWQA 4AEFA 5I24A 1R87A 1HXJA 2XUCA 4QFUA 1JD9A 1VRXA 2CIPA 4HA1A 1JF5A 2XFFA 1OBAA 5JBEA 2DT3A 3WIJA 1CZ1A 2GUYA 1CXIA 3WF1A 1WZLA 1R8LA 2D24A 1OSEA 4E8DA 1UD5A 1PX4A 3RCNA 4JFWA 1NWUA 1V6WA 1UUQA 1MFVA 2D0FA 3WDPP 1B3VA 2O92A 1J0HA 4LPCA 2EJ1A 4W93A 2GJXA 4NRSA 4J28A 1UH4A 3PZOA 2HISA 4UFLA 3HU7A 3THDA 3WH6A 1TFVA 2VX4A 3OLEA 3VIGA 3WH9A 1ZB5A 4DUXA 3GH4A 2QF8A 1UR8A 3DYMA 3PN8A 4ZENA 1X6LA 2X0YA 4P7RA 4YHGA 4F9JA 1I1XA 1ITCA 3WELA 2E4TA 2NT0A 4MTVA 5D8ZA 1C93A 4U33A 4Q22A 3WD3A 1V02E 5BXPA 4X0NA 3VD4A 6A3HA 3AIUA 3GBEA 4KRUA 3AJ7A 3G6MA 4PMXA 4B3LA 3A4XA 4EE9A 3T2PA 3W29A 4MB3A 1C3FA 1LLOA 4C7FA 3ARVA 3A6OA 3FN9A 3L4YA 3WQ5A 1E3ZA 2BHZA 8A3HA 2ZX5A 4Z2JA 4JKKA 1HP4A 2DT1A 2VVNA 1QW8A 4FK9A 2NW0A 4RE3A 3WDHA 3W6MA 4HU0A 4OZOA 1V3MA 5A6SA 2C0HA 4ACZB 4HOWA 3SCQA 1L8NA 2WNWA 4U5IA 2VR5A 4FLSA 3GH7A 4K68A 1J0JA 5C71A 3IANA 1E6NA 1M53A 1JZ2A 1IZKA 5AYBA 1M7XA 4AIUA 4ZXLA 3EMZA 2VCBA 2PBGA 3KL0A 3NYDA 3IAQA 2GK1A 3VM5A 2YIHA 1W3LA 1CGXA 3AMLA 4M29A 1CXHA 3AS1A 2F61A 4HZ6A 2WM0A 3CMGA 2XM1A 4W7VA 1D2KA 1KFWA 3RILA 2XJ7A 2PI6A 3EDKA 1UR2A 3WQVA 1BSIA 3W27A 6CGTA 1Z32X 3DYPA 4MB5A 3O2LA 3QHOA 1X1NA 2J77A 3J7HA 3RM8A 4B16A 2OSXA 3T0BA 3MS8A 3TTYA 1QPKA 2X8RA 3MV01 4AZIA 4PMNA 3AMDA 4W89A 3AZSA 4P8VA 2A3BA 4GKLA 3N1AA 2WAGA 1UKTA 1B2YA 3BLKA 4UQAA 3TA9A 3QR3A 3ZT6A 2VZTA 5E0FA 1E72M 5A6BA 1XYFA 1ISWA 4UZUA 3WEOA 1B9ZA 3OZPA 4XX6A 2XFYA 1BYBA 3M6DA 2GDVA 1HJWA 1J18A 1GPFA 4AISA 3TTOA 2JIWA 3F5JA 4Y7EA 5I2UA 4PRWA 2JIEA 3A4AA 3SCTA 2FHBA 1EO7A 2YDRA 1KXQA 2RGLA 1IV8A 3W0KA 1WNOA 2ZOXA 5C8BB 4AY1A 2W67A 4UFHA 3SCRA 2XVPA 1ZBWA 4D71A 1QOXA 4FMVA 3OZOA 4X0VA 1HVXA 2J7GA 3VIIA 5I78A 1TA3A 4V28A 1EO5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1VBR A;  1WE5 A;  3CHE A;  5IHS A;  5A3H A;  3BCF A;  5HNN A;  2J7C A;  1EDT A;  1GOM A;  3DYO A;  4HA3 A;  1JL8 A;  1ECE A;  4JZ5 A;  2ZWZ A;  1PJ9 A;  1XH1 A;  4OBR A;  2WYS A;  2GDU A;  4C7D A;  4PTW A;  4PMZ A;  3VDA A;  3WF0 A;  1QNO A;  2J4G A;  1B30 A;  3MUA A;  2NT1 A;  1TUX A;  1EIB A;  5A8P A;  1HKK A;  3B8S A;  3VD7 A;  2WC3 A;  1BYC A;  1EHA A;  2V38 A;  4OKD A;  1PX3 A;  2XIB A;  1NAR A;  1R85 A;  2A3C A;  2W5F A;  1OIM A;  4CD7 A;  2WVU A;  3RM9 A;  1XCW A;  3CLW A;  1KXV A;  3WF3 A;  5ABG A;  1H3G A;  3EMQ A;  5GNY A;  1LWJ A;  3WEM A;  1QVB A;  2XVL A;  4PMY A;  3IK2 A;  2VC9 A;  4JKM A;  1V0L A;  3GNR A;  4AD2 A;  1VEP A;  2XYL A;  3AS2 A;  4CCC A;  5FCZ A;  2EO7 A;  2YBU A;  4AZH A;  3VMO A;  2BV9 A;  3ART A;  5I23 A;  3TTQ A;  2ZWY A;  1ZBK A;  4B3K A;  1BAG A;  2E40 A;  5CJ5 A;  1W1V A;  1V3L A;  2XVN A;  1E1F A;  3II1 A;  4J3U A;  1JFX A;  7A3H A;  2CBI A;  3UCQ A;  1E0V A;  1KR0 A;  5IHR A;  3OBA A;  3WSU A;  2VJX A;  1ZJA A;  1J0K A;  4EK7 A;  2XGB A;  3B9E A;  5A94 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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