2OCZA

The structure of a putative 3-dehydroquinate dehydratase from streptococcus pyogenes.
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
224
structure length
218
Chain Sequence
AMRIVAPVMPRHFDEAQAIDISKYEDVNLIEWRADFLPKDEIVAVAPAIFEKFAGKEIIFTLRTVQEGGNITLSSQEYVDIIKEINAIYNPDYIDFEYFTHKSVFQEMLDFPNLILSYHNFEETPENLMEAFSEMTKLAPRVVKIAVMPQSEQDVLDLMNYTRGFKTLNPEQEFATISMGKLGRLSRFAGDVIGSSWTYVSLGQVTLNDMKRIIEVLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structure of a Putative 3-Dehydroquinate Dehydratase from Streptococcus pyogenes.
rcsb
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
molecule tags Lyase
source organism Streptococcus pyogenes serotype m1
total genus 73
structure length 218
sequence length 224
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2006-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2oczA00
2VFIA 3IVUA 2XFWA 3IIVA 2RFGA 3FYOA 1XKYA 4PODA 3CPRA 1DKWA 1YTDA 3NGJA 1QNVA 1NF7A 4M6QA 3STGA 4WQ6A 3L66A 4OU1A 5I3GA 3DI1A 4OBTA 4O8RA 1T8XA 3R89A 4BI5A 1GVOA 1HUVA 4EF8A 3OHIA 3IRDA 4JTKA 2WSYA 1SPQA 4LVBA 4K38A 3ATZA 2NXIA 3LX9A 3PAJA 2OZ0A 5D30A 2A2IA 3NNTA 2NLIA 5SWUA 3P81A 4JTSA 4AWTA 5BMXA 2DORA 1K7EA 2A7NA 3GZ3A 3BW2A 4OV9A 2RHGA 4QQ3A 1UBSA 3EXRA 3NAVA 3G8EA 5D2VA 1AW5A 1EB3A 3P60A 3TQ0A 3W2KA 2VFGA 1ADOA 3W2NA 3EKZA 5G5IA 1VR6A 1OFDA 4CCEA 1YPIA 3JR2A 1XC4A 1KFCA 3HGRA 3L2IA 1LBMA 1XBYA 4JX6A 3LLDA 3VKJA 4HSNA 3EEGA 4H4IA 3L5AA 4OV4A 3TJXA 2H3DA 4TX9A 3G1AA 4N2YA 4IMFA 3QPYA 4AHQA 1NF0A 3A9IA 1UB3A 1XL9A 2A4AA 4YLWA 3P67A 3C0JA 1QO2A 2RKXA 3TAKA 3W07A 2E6YA 3L0KA 2FQIA 1VLWA 4POCA 1ZENA 4OGZA 1Q6OA 4RX0A 1RV8A 1MEWA 2ZRWA 1AW2A 3HG5A 2C19A 2VC6A 2UV8G 2ZZ3A 1Z44A 3IGUA 1TB3A 4XBKA 4XQ6A 3CHVA 1RQHA 3TC7A 4X3ZA 3FKRA 3PVFA 3KVLA 5BNKA 1RPXA 4GUJA 3OVQA 2WPBA 1KFJA 5CZSA 4ZL1A 4EOUA 3S5NA 5D05A 1OVDA 4DO6A 3MBFA 3NPUA 1LOQA 4JX4A 2JGQA 3GNDA 4N9CA 4A2SA 4K8EA 4QJ1A 1R2TA 3P8IA 3G8RA 1X8FA 3B04A 1XI3A 2XN2A 4GWEA 2TPSA 2QCDB 4Q4KA 3GAKA 1VS1A 1LTDA 3MUXA 1W3TA 2O7SA 4WUIA 1YXDA 2Q3RA 4RXFA 4S1FA 2VEIA 2WOQA 1O60A 4UTTC 1H7XA 3L21A 3QW4B 1PVNA 2QJGA 3UZJA 4Z1CA 1E51A 4I7UA 3QMSA 2C6QA 2YX0A 3W84A 1WA3A 1Q45A 4X9SA 5T26A 4JTUA 1GQNA 4JYEA 4BFAA 1EA0A 4R34A 2CLKA 5HULA 1QDSA 4RZ6A 2BSLA 4Q32A 1ZFJA 4YCPA 4AB4A 3O05A 2W0UA 1WYIA 2C18A 3A22A 4N9EA 1KM0A 4MJMA 4E0CA 5FI8A 2GQ9A 3ABSA 4NX5A 3HMJG 1TMHA 3LLFA 5EA9A 5A8GA 3LCWA 1S5VA 2OJPA 3HGOA 3QMRA 3TR2A 2RH9A 2RDTA 1PCKA 1TIMA 1WQ5A 3QW3A 4UTTA 3TSBA 4GRSA 4GUFA 4HNUA 3S0CA 1VYRA 3IVTA 2WKJA 2G97A 1ZNNA 4CNOA 3MHFA 2NUWA 2V2CA 3LXCA 3KRZA 5D03A 2IQTA 4O52A 3LHTA 3QQ0A 4LU0A 2QCDA 4LWWA 2CLMA 3FKKA 1OYCA 4MZYA 3GDMA 1YYAA 5DBTA 3NQAA 4GFSA 3R13A 1SR9A 4MIMA 2C1HA 3MP3A 1RD5A 2PRMA 1I2PA 1R46A 2Y63A 5FEPA 2E09A 4HKPA 3G0SA 2QCLA 3VE9A 3IIPA 4AAJA 4E38A 1K8XA 1N55A 2NV2A 1HO1A 3PG8A 4KWWA 3W6YA 3W7EA 3TSDA 2WJZA 1DOSA 2QCEA 5LNVA 2NWSA 3UY8A 3FEMA 2VOMA 5KZEA 2VFEA 7TIMA 5E1QA 3SR7A 4UFLA 1VHNA 1H60A 4N9DA 1P0KA 3TCEA 3RK8A 3DBPA 3TUUA 3M43A 5AYZA 1R2SA 1PIIA 3W1XA 1MEHA 1LRNA 4JGDA 3UWQA 5AC6A 3SFKA 1V5XA 4UMBA 1IIHA 3HGSA 4O50A 4FXRA 5BRBA 5K7JA 3PC0A 1AK5A 2WV8A 4FHAA 1TQXA 4BK9A 4OT7A 1OJXA 2CZ5A 3V1PA 1TQJA 3WK1A 1D9EA 3S1WA 1IXOA 3HO8A 3O63A 3I7QA 3NQ7A 3MI3A 3O16A 3L65A 4UNKA 3C2VA 1G4SA 1A5CA 3BG3A 3TJLA 5IBXC 4KFPA 3KX6A 3N2MA 3NQ2A 3GVGA 4O14A 4UTHA 3W1RA 3TMQA 4JY8A 4DQWA 1AL7A 2I9EA 3M9YA 3M41A 3MW7A 3G0UA 2QKFA 3VI2A 4DF2A 1WBHA 3RLUA 5C6MA 2TYSA 5C5YA 4NUWA 4LT9A 1L6YA 3HJZA 4XUGA 3GDRA 4QIUA 4MJZA 3W7CA 2QCHA 3DU0A 2A7RA 4GC4A 4WXYA 3CEPA 2C3ZA 4O1CA 5IBXA 5G2WA 3M1ZA 1F73A 1ZY9A 4LV9A 1SUXA 3B0VC 1LOLA 3HPZA 1QPNA 1QR7A 1YDVA 1YXYA 1W54A 2GJNA 3LCLA 2Y7FA 1B4EA 4DO5A 3EWUA 2FDSA 4CQ9A 2HS8A 4N4QA 3P84A 1EP1A 1QWGA 1SQ7A 2WSRA 2ZTKA 4JTIA 1JUKA 1OFOA 2DU2A 2AGKA 2WSQA 5AHFA 1ZAJA 1LROA 1OFRA 3N3MA 4H6KA 1PS9A 3ZWTA 1UASA 3KXQA 3PY2A 1B3OA 2V5LA 3UWVA 2GQ8A 3P74A 4E2BA 3NA8A 4O4WA 4LVFA 1DBTA 1ALDA 3QZEA 3W7NA 5DXXA 1FWNA 3WJZA 4DF0A 4C1LA 1PHWA 1Z42A 3UWYA 5G4EA 4FNSA 1JCMP 1KTNA 2QDGA 1VC4A 4WX2A 3L68A 4RR4A 3G1DA 3IGSA 4UFHA 5AB3A 3PBVA 3B06A 1G69A 4RJEA 3W1UA 2AQWA 5D33A 1EWEA 5LNWA 3PF3A 3QMTA 1TPVA 1VCVA 4K7VA 3NM1A 2OT1A 1FCQA 4LW7A 1XFBA 1GVRA 3W7MA 3STEA 1JQVA 2CZDA 3A23A 4MYXA 1KM4A 3WJXA 4UC5A 4UTWC 2ZRYA 1CW2A 4LNYA 1OFAA 1LDCA 3HPSA 3W1LA 3LHWA 2ATMA 5DBUA 5LGZA 6TIMA 3ABOA 3O6YX 3O6CA 3A5FA 3BVJA 2ISSA 4Z1DA 3A21A 1S5WA 3W1PA 3L9CA 1SZEA 3CT7A 3TSMA 4K36A 2QCNA 4LC8A 1I2NA 3IIXA 5LSMA 1GT8A 3MHUA 4M6VA 2YW4A 1H7RA 2ZA2A 1TTIA 3NQDA 2C15A 4K6AA 3UYCA 1QCWA 2ZDRA 5DCBA 4NXSA 2PE4A 1H63A 2ABAA 3GYEA 3FFSA 3OVPA 4IOTA 1H61A 2ALDA 3CQ0A 5DN1A 5FF3A 2GOUA 4FX8A 5L9FA 1OYBA 3BG5A 2QCMA 3BO9A 1L6SA 3GR8A 4CQAA 3EB2A 1BWKA 1FDYA 3B8DA 5I3FA 4AXKA 1W1ZA 1H50A 3JS3A 1KM3A 3LDVA 1WOBA 4ZVJA 2V5BA 3SSJA 4JIPA 1I2RA 4DPQA 3GDLA 3HGJA 4G1KA 3QFEA 3GXPA 1TJPA 4NNAA 5FF0A 4NNBA 1KA9F 3OEXA 5BMWA 3M0ZA 2OCZA 1XBZA 3W76A 3PBUA 5KTLA 4FNQA 1NEYA 2V2DA 3E0IA 4ZQPA 5E93A 3W7RA 3EX1A 3S6DA 1QPOA 3PS7A 5FEWA 4IQLA 3GDTA 1R30A 2VEMA 3W72A 2QUUA 3KVMA 1BEUA 1YTEA 1EPXA 5FEXA 4TO8A 2A21A 2ZZ4A 3M47A 1IXNA 3DENA 4O11A 4ZMGA 1ZAHA 2DZWA 1NSJA 2Z2UA 1JRBA 3QEZA 3WK3A 3QQ1A 2ZYFA 5HR7A 1QPRA 2V2HA 2J27A 3EWXA 4O53A 3W23A 1KFBA 3O15A 4LRSA 4UFIA 4GUIA 3W2JA 2E6DA 2J9XA 4RLIA 3NQMA 3M44A 5BW6A 4IWWA 3VFLA 3W2UA 3G24A 3WJYA 3LI1A 3SW6A 3PSVA 1MXSA 3KVKA 4QAIA 5I3KA 4TIMA 3U2OA 3L67A 1CI1A 2Y62A 3LERA 1GVFA 3P61A 5ABTA 1FY6A 2Y88A 3LV5A 4O0ZA 5HMSA 4LS1A 4N9BA 5HR6A 1OFPA 3R2GA 2ZRXA 3S5OA 1G67A 1SSGA 1WXJA 1XDLA 2H8XA 4Y96A 3UNDA 2LLEA 3UPBA 1TPWA 3PUOA 4ZQOA 5HINA 1DORA 3H53A 1JVNA 1K8ZA 2P0OA 1W5OA 2H8ZA 3W1AA 5FEZA 4NVTA 2G5WA 4RXGA 1X7FA 2Q3OA 3EWWA 3O06A 4PL1A 3Q94A 1MSSA 3I7SA 3TFCA 3C8FA 4O18A 3NR0A 4Z1BA 2X30A 4UMAA 4AWUA 4O17A 3OBKA 4WOQA 2ZRVA 5D04C 3C4UA 1O94A 1QAPA 1KV8A 3PR2A 1TV5A 2H3BA 1EX5A 1S3HA 2DZVA 4A2RA 1R2RA 1HTIA 3NYZA 4FNUA 1Q6QA 2EHHA 1A53A 1Z41A 2YYUA 1TPC1 3SJ3A 3O6DA 4ADTA 1T0OA 3LB0A 4JTEA 1VLIA 3SI9A 3MMTA 3DFQA 4UR8A 4JDBA 2AAMA 1YDNA 2X1TA 3THQA 3MWAA 2D73A 2J9YA 2E6FA 3C2FA 3ABRA 1TTQA 1K7XA 2JK2A 4PL2A 4UTJA 2YR1A 3TV8A 1TJRA 5F1VA 2ZRUA 5C54A 2Y70A 4FEZA 4A21A 3LHUA 1QMLA 3NL3A 4LS0A 5AHIA 4LUIA 3GKFA 2BLEA 3MP5A 3HQ1A 4FB7A 3SIZA 2GQAA 2WQPA 3W1TA 5D32A 2Y7GA 3OVRA 2J6XA 1SZFA 4UFKA 1X6UA 3UWWA 1KTCA 5F4XA 5AN7A 3TNOA 1EUNA 1IIGA 1SO6A 1G4EA 3NOEA 1VYSX 3CLMA 2NX9A 4MVAA 1A5AA 4NJHA 3W7LA 4HHPA 3AO0A 3EX2A 3NM3A 3A5VA 3NO5A 2Q8ZA 3G1HA 4MZ8A 4IPIA 4XWUA 5AHMA 4HIBA 1F74A 5TIMA 1DJQA 4WY0B 1GTHA 3ATYA 3AJXA 1DQXA 2ZZ1A 3GLCA 3T44A 4CLMA 3A24A 1KBIA 1H7PA 3W87A 3HBLA 1GG0A 4JNMA 1LBLA 2TMDA 3W22A 4N02A 2P1FA 4NNCA 2YGYA 3E96A 5F1UA 4MFDA 4UCGA 1C9DA 4DPPA 1EEPA 3UQNA 5K9CA 4M7SA 2CLOA 3CB8A 3EWBX 4IJBA 2CLHA 3PB2A 3WK0A 4CNPA 2NZLA 4GBUA 1GTEA 1VZWA 1X1ZA 3EX4A 5C55A 3FA5A 1WOAA 3LTYA 4DXVA 3CIXA 4JN6A 1H7OA 3G1SA 1GYNA 2Y61A 4RKAA 1G4PA 1PV8A 3LI0A 3TK7A 3TQKA 4JYDA 3F4WA 2E5DA 3S1UA 4QM1A 2JKPA 4WY0A 2H6RA 1K03A 4JTFA 4IMCA 5LNRA 3LRLA 4GNJA 3NQEA 3GKAA 4JY9A 1EWDA 3VE7A 4R53A 3MBDA 3DHFA 1I2OA 1NFBA 1VGAA 3G3MA 4DBEA 3USBA 3LRMA 4B5NA 3S42A 3NPXA 2C13A 3LBMA 3U8GA 1GEQA 3GIYA 3KOFA 3Q58A 2VXNA 3BLIA 5HNRA 4A22A 2O7QA 1HL2A 3W7GA 5IM51 3W7OA 1X1OA 3BGGA 3IIZA 4UIOA 2VKZG 2CU0A 3N73A 1P1XA 5EBUA 3PSWA 5J5RA 3NQFA 3MYOA 1TO3A 4EF9A 4OHQA 3IEBA 3BGJA 3DFPA 4MY8A 4Y90A 1RR2A 3N9SA 4XBSA 1TPEA 4LVDA 2V9DA 3I7RA 1KM1A 1GJPA 2TSYA 3SZ8A 2QJIA 3NL6A 4AWSA 1VPXA 4NXKA 5A5WA 3W85A 3LGEA 3QPZA 5DCDA 4TMBA 2NXHA 5CKSA 1G7VA 4BF9A 5KZDA 4I7VA 4HNTA 4PA8A 2A5HA 1HFBA 4MY1A 2VFHA 4ONVA 5FESA 1ICQA 4L4MA 3O1NA 1MZHA 3GNNA 5DCEA 3OG3A 1XM3A 1TYGA 3TIMA 3LXBA 3QH2A 3GK0A 4YCOA 3P80A 2EPHA 1F7BA 2VENA 3E49A 4RZ5A 1W31A 2HSAA 3NQ8A 1FCUA 1LLWA 2GVLA 3EXSA 4U4MA 2DJLA 2ZZ6A 3C3NA 1FWWA 5D37A 4Z0SA 4FIRA 5CPNA 3HIJA 3VCRA 4ZQMA 1AMKA 4JTGA 5DY3A 3G1FA 1QPQA 4O1BA 1JQXA 1W8SA 2ZCGA 3L0NA 1SW3A 2R94A 1WAUA 3HG3A 2C14A 3OA3A 1TRIA 3EWZA 5KSWA 2GVJA 3PULA 4UNLA 3W7IA 3NQVA 1LORA 4R7JA 5HWJA 3C2EA 1SFLA 4UFJA 1O95A 1AL8A 4FX7A 4JTTA 4A3UA 4Y9AA 2RDUA 2FIQA 4EWND 1QFEA 3PUDA 1KM5A 2R8WA 3NEVA 3C2RA 5LGXA 3UZ5A 3DXIA 3N9RA 2WNNA 4LVGA 3TH6A 1OFBA 3K30A 1TTPA 3B0UX 3UXDA 3TMLA 3KFTA 4QNWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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