3HPZA

Crystal structure of mycobacterium tuberculosis leua complexed with bromopyruvate
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
626
structure length
571
Chain Sequence
TIVKPAGPPRVGQPSWNPQRASSMPVNRYRPFAEEVEPIRLRNRTWPDRVIDRAPLWCAVDLRDGNQALIDPMSPARKRRMFDLLVRMGYKEIEVGFPSASQTDFDFVREIIEQGAIPDDVTIQVLTQCRPELIERTFQACSGAPRAIVHFYNSTSILQRRVVFRANRAEVQAIATDGARKCVEQAAKYPGTQWRFEYSPESYTGTELEYAKQVCDAVGEVIAPTPERPIIFNLPATVEMTTPNVYADSIEWMSRNLANRESVILSLHPHNDRGTAVAAAELGFAAGADRIEGCLFGNGERTGNVCLVTLGLNLFSRGVDPQIDFSNIDEIRRTVEYCNQLPVHERHPYGGDLVYTAFSGSHQDAINKGLDAMKLDADAADCDVDDMLWQVPYLPIDPRDVGRTYEAVIGGVAYIMKTDHGLSLPRRLQIEFSQVIQKEVSPKEMWDAFAEEYLAPVRPLERIRQHVDAADDDGGTTSITATVKINGVETEISGSGNGPLAAFVHALADVGFDVAVLDYYEHAMSAGDDAQAAAYVEASVTISKTVWGVGIAPSITTASLRAVVSAVNRAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Probing the active site of M. tuberculosis LeuA
rcsb
molecule keywords 2-isopropylmalate synthase
total genus 190
structure length 571
sequence length 626
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.3.13: 2-isopropylmalate synthase.
pdb deposition date 2009-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
A PF08502 LeuA_dimer LeuA allosteric (dimerisation) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3hpzA01
3.30.160.270 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Double Stranded RNA Binding Domain Double Stranded RNA Binding Domain 3hpzA02
1GTEA 3LRLA 1WYIA 5D33A 2RDWA 3MHGA 4JD4A 4WJEA 1GG1A 1Z44A 1OFOA 3A9IA 3G1FA 1VH7A 4M5PA 4RXFA 5FEZA 1P5BA 4LV4A 2VOMA 1KLZA 3HJZA 2QDHA 1X7FA 3NM3A 3QQ1A 1HO4A 3W1XA 3D0CA 2ISWA 3ABOA 5MHBA 4JTKA 2VELA 4ADUA 3CQ0A 5IBXA 4NXSA 2G95A 4QNWA 4HSOA 3CEUA 3S1VA 3ELFA 4MUZA 1G4PA 3IIPA 3VFLA 1TPEA 3NQEA 4JTJA 3FA5A 4ZMGA 1LOLA 2AGKA 1O5KA 3SSJA 4WY0F 3G1HA 1FCUA 4DF0A 5D2WA 2F84A 3JR2A 3O15A 5HULA 1K7XA 1OYAA 4WOZA 2CZDA 3W7QA 5LNWA 4BR1A 1GG0A 1NFBA 1OABA 2DJLA 4XKYB 3HGRA 4GUJA 3W7NA 4E38A 3EWYA 4O15A 1NSJA 4K7VA 1FQ0A 4LS2A 4LU0A 3UXAA 1FDZA 3UWZA 4JX6A 4MFDA 5G1TA 3PBYA 3DXIA 4MYXA 4DO5A 3HQ1A 2WO5A 1WDWA 4K8EA 3NQDA 1N7KA 3WK0A 3NQGA 4FHAA 5T26A 2B7NA 5IBXC 1EA0A 2QJGA 2RDTA 5D04C 3T40A 1TB3A 3BW2A 4G1KA 1WOBA 3INPA 3LBCA 3A22A 3MW7A 5CKSA 2V5BA 2J6XA 3L2IA 4ZQPA 4R53A 3QM3A 2NWRA 2A5HA 3KVLA 3KRUA 1PS9A 3E12A 3MHUA 3O63A 4JTHA 3BVJA 5J5DA 3LHZA 1NVMA 3B0PA 3GIYA 1UUMA 2GPTA 3W88A 3CIWA 2CLLA 2DZWA 3DHFA 3FYOA 3HF3A 4Y8FA 5TIMA 4UFKA 1Z48A 2QCHA 2C1HA 3S5NA 2ZZ7A 1XFBA 2C18A 3O8AA 3MHFA 1OX4B 1TPH1 3QC3A 1K7FA 2AAMA 4FNUA 1YPFA 1LRNA 3PSVA 4N4PA 3KX6A 2EGZA 3GXPA 5AHLA 3ABQA 3KAOA 2Y6ZA 3G1DA 3G24A 4ALDA 1W3NA 5AOUA 4CNPA 1N8FA 1K3UA 2YX0A 3Q2DA 4JTUA 2H8ZA 2QCLA 3EXRA 1H5YA 2E1DA 3TSMA 3MI3A 1RQHA 1JVNA 3GNDA 5AYXA 3GKFA 4DELA 2VC6A 1SFLA 2ATSA 3K30A 1VCFA 2OT1A 3UZJA 3S5ZA 3G18A 4RZ6A 1IXPA 1HL2A 1RV8A 1W54A 5LNSA 4AHOA 3TC7A 3NAVA 4NZJA 4WXZA 1H63A 3UYCA 2C15A 2PRLA 2A6LA 1FWNA 5U7SA 1CW2A 1AMKA 1JCLA 1XXXA 3C0JA 3PB2A 5AYYA 4MY9A 1KM3A 1O5XA 4AHPA 4N9BA 2VEMA 4NNAA 3TFXA 4FF7A 3TIMA 1W5MA 2YGYA 4J9JA 2GVGA 5C54A 2J9ZA 3MP5A 5D2TA 3QH2A 3C2OA 3LRMA 5BMXA 2ZZ6A 4GJ1A 4ORIA 5F4SA 1N55A 3IIXA 2DZXA 2RH9A 2ZYFA 4X22A 1THFD 1ZALA 3MBFA 3GKAA 1KBIA 4QQ3A 4W9TA 4UFJA 3THAA 1BWLA 2EF9A 3OA3A 4QAIA 5DCDA 4WXYA 4O0KA 2IQTA 5D32A 5LNVA 4UTTA 3DFTA 3W7EA 2QR6A 2G96A 5F2IA 4ZQCA 2Y7DA 3S1XA 2I14A 3IIZA 2BX7A 1KM5A 1XDLA 1OHLA 4BFAA 3NQMA 4OWGA 5DY3A 3UWVA 1KFBA 2R8WA 2ATMA 1TTIA 3EWUA 2FPTA 2Q3OA 3HG3A 3S5OA 3B06A 3UY8A 3W1QA 4AXKA 1MEIA 1G69A 3NDOA 4AF0B 1JR1A 4DO4A 2VFDA 1LOQA 2CLEA 4CCEA 2WNNA 1GEQA 1GVOA 4RX0A 3STEA 4JTLA 5KZDA 1JQXA 1QOQA 1TTPA 2NX9A 2WQPA 3W1AA 1RQBA 3C61A 1HUVA 3S1UA 4LWWA 3BGGA 3LB0A 3G1YA 2Y63A 4OGZA 3FKRA 3W71A 1H61A 5C5YA 1NF0A 1LZOA 2E5BA 1GVQA 1PCKA 4UTTC 3O6YX 2JGYA 3GZ3A 1C8VA 4N6EA 4ZZ9A 4MKNA 1L9WA 3B8DA 3CT7A 4N2YA 4O12A 2QJHA 2GQ8A 4YWIA 5E1QA 5G2IA 1FY6A 2CLHA 4JN6A 2E6AA 2LLEA 1ZAIA 3DENA 4TO8A 3PR2A 5A5WA 3TQKA 5G5IA 2OZ0A 4OBTA 4U4MA 5AYZA 1VCVA 3NXFA 2NV1A 3EXSA 1AW2A 1XI3A 3PVFA 3TU9A 3CWOX 3AO0A 1BEUA 1VLWA 1DJNA 3FJ6A 1DOSA 3UD6A 4O1BA 4JY9A 1OYCA 3EX2A 5D03A 4HNNA 3W75A 4NJKA 3B03A 1EX5A 2GOUA 2ZQ0A 1EIXA 3QF0A 1TYGA 3A24A 4O17A 4CCDA 1WQ5A 3TAOA 3TR2A 1DKWA 2GJNA 5CZTA 3PSWA 4IMDA 5KSWA 2V2DA 3DH7A 5DXYA 1VJIA 4N9DA 1E51A 3P8IA 4RV8A 1W8SA 4YCPA 3NQCA 4LRSA 4WUIA 5LKYA 3C52A 3TJXA 3W9ZA 1YLVA 1YADA 3IV3A 3CIXA 1SR9A 3RLUA 1EEPA 1YTKA 3TX9A 3BG5A 1XL9A 2A21A 2ZA2A 4YL2A 2V2HA 1M7OA 1KM1A 1OF8A 3S6DA 4K37A 3T7VA 3KOFA 4JNMA 1AL7A 2KZHA 4NU7A 3TFCA 3HIJA 5DCEA 5EL1A 2G97A 3OVRA 4TMCA 2B0MA 1H7WA 1Q6LA 2AQWA 2JKPA 1FBAA 3M41A 1YDVA 2NUXA 1MZHA 4O0ZA 1F6KA 3SR7A 3QEZA 3TSBA 3EKLA 1R2TA 1WXJA 3EXTA 1BTMA 1KFCA 1GT8A 4HHPA 3R12A 4IWWA 5DBTA 1A5BA 1TPUA 4ADSA 1T0OA 1OFPA 3F03K 5L9FA 3I7QA 3JRKA 3T4CA 1ADOA 1S3HA 4CQ9A 4UFMA 3TQ0A 2FLIA 3WFAA 4R33A 1TJRA 1P1XA 2QF7A 1RVGA 1QWGA 4XKYA 3NO5A 2X2GA 2E77A 4UFLA 4OU1A 3BW3A 4GXMA 1JJKA 3NGJA 3GR7A 4ORMA 3M7WA 3O1NA 1DQWA 1GVRA 4JX4A 2XFWA 3NZRA 3IGUA 1SQ7A 4XTIA 4A22A 3R5EA 1YTEA 4KFNA 2DJXA 3W2MA 1RZMA 4LW7A 3GDTA 1TPB1 4XTDA 4XZ9A 2PRHA 1TJPA 1WA3A 1FCQA 5K4XA 2VFFA 4DBDA 4O28A 4IJBA 1QR7A 2Y61A 4ZQNA 2GJLA 2CW6A 3NQAA 3HPXA 4M6VA 1P0NA 3LLFA 3RNDA 4UFIA 3N34A 1ME7A 3F4NA 3LM7A 3Q58A 2QCMA 4HNVA 4N6FA 4JDYA 1JCXA 4PL1A 3MBDA 5KITA 3W1NA 1O4UA 1GJPA 1LYXA 2A0NA 3A23A 3E9AA 1Z42A 2ZRYA 3HPSA 4OE7A 1W5NA 5BNKA 1F5ZA 3O6DA 1J2WA 1XBVA 4GUHA 1K8ZA 3VCRA 2Y89A 1SSDA 2H3DA 1OX4A 5K2ZA 5I3FA 4TU1A 4UCGA 3W72A 3KXQA 3DFSA 1TPWA 4IXXA 2C13A 3OVQA 4FIRA 4H3DA 1TV7A 3I65A 4QM1A 2WSYA 1S5TA 4Y90A 3MI2A 4NX5A 3QJAA 3EWXA 4IMGA 1JCMP 1L6YA 1VYSX 3VNDA 1K8YA 3UWWA 5I3KA 1GVFA 1B4EA 3DFOA 4PCFA 1ME9A 5G1YA 3W86A 1GOXA 1TSIA 1DVJA 4ZQMA 3TCEA 1W3TA 3PUOA 4PH6A 5AHFA 3KVMA 3THQA 4D2JA 1L6WA 2A7PA 4M7TA 2CLKA 1M7PA 4O14A 1HFBA 4MYAA 1F73A 2TRSA 3LHVA 5K9DA 5AHMA 5E93A 5CPLA 3QSRA 3TA6A 3P62A 1TREA 1QFEA 1OFDA 3FOKA 1LLWA 3FIGA 2Z6IA 1SW7A 1EP1A 3I68A 2GUUA 2ISSA 5AHIA 3HG4A 3HG5A 1HO1A 1OFBA 4CNOA 2BWGA 2JGQA 3TMLA 4MJZA 4LV9A 2NWSA 3BGJA 2ZZ1A 1CI1A 4MLRA 2H90A 5D37A 1L2UA 3W1TA 3CWNA 5EY5A 5AC7A 4JX5A 3LCWA 3TQVA 1I8JA 5HWMA 4IMCA 2VXNA 3IGSA 2NXHA 4JTSA 4EVZA 3TK7A 3W87A 1EP2A 4FNSA 5D38A 2CZ5A 1F76A 4A21A 1LRQA 2QCNA 4K7YA 3W1UA 1FDYA 1XDMA 1G7UA 4RKAA 3W6YA 1AW5A 3IGXA 4IUOA 2X1RA 5F1VA 2B7QA 2V81A 2FPVA 1KFKA 2X1SA 4LVBA 5D02A 3NNTA 1OYBA 4JGDA 1IF2A 2OT0A 2W6RA 1O94A 2PC4A 1X8FA 1B4KA 3HGJA 1H7NA 4IPJA 2BLEA 3PWAA 4ML9A 4HNUA 1B57A 5LGXA 2C16A 5D30A 4QJ1A 3MI6A 4AF0A 4MVAA 3M16A 3NYZA 4UNLA 5FF3A 3Q37A 1KFLA 2DZVA 2GVJA 3LV5A 1LBLA 5D2VA 4RZ4A 3E0IA 3W7HA 1YXDA 3ZR4A 4AMAA 1H7OA 2QCCA 2E6DA 2JK2A 3P82A 3B0UX 3G8RA 2QAFA 4PA8A 2OCZA 4NJGA 4UTWA 5FF2A 4L4MA 1PV8A 1YDOA 1PE1A 4BF9A 3OEXA 3M47A 3PF3A 3C3NA 3UZ5A 4CQAA 5BOOA 4GRSA 2YDAA 4FXSA 1VQTA 5DN1A 3NQ6A 3CTLA 4LUJA 4Q32A 5H91A 4RCXA 4H6KA 4I7WA 3S1WA 4A3UA 5FF0A 4KWVA 4Z1CA 4EIVA 2VEKA 1VPXA 3L65A 3T44A 4AEOA 5C2XA 2WV8A 3GAYA 4ZQRA 1H7PA 4MOZA 3W7RA 2NLIA 4XBSA 5HWNA 3CB8A 3WJYA 2CLOA 2ZTKA 3IVSA 4X9SA 2YZRA 3HGOA 2VEIA 1F05A 4PODA 3LCGA 2WKJA 2J9XA 2P0OA 3PUDA 2V8ZA 4JYDA 3CLMA 2W0UA 2Y85A 3W1MA 3U2OA 3W2LA 2Y88A 2E09A 2J88A 1GTHA 4WZHA 1YXYA 4UNKA 2Q8LA 2F7FA 2ZZ3A 3G0UA 3G0SA 2NZLA 3TXZA 4UTWC 1FWWA 3MJYA 1BWKA 1S5VA 2PURA 4K36A 3F1QA 3W73A 2QCFA 1SPQA 4XUGA 1GPWA 1OK6A 1WV2A 1W56A 3NPXA 3CM4A 5C6MA 3IIVA 3NQFA 4UIOA 2E5CA 4LT9A 3FKKA 5FEPA 3VE7A 5C55A 2ZRVA 4LVFA 3UWUA 1EWEA 3ATZA 4Z1BA 3DI1A 5I3IA 3DFPA 1KLYA 5HR7A 4NX0A 1L6SA 3BO9A 3C4UA 1UUOA 4PEKA 4KFPA 3LXAA 2DZPA 4FXRA 1HG3A 1KA9F 1ONRA 1RR2A 2P10A 2CU0A 4S2CA 3GNNA 5J5RA 4KKXA 4S2BA 1OVDA 1UCWA 5LHEA 1B3OA 1TPFA 4JTTA 1GYNA 5EBUA 3W84A 3G3DA 4JTEA 1P0KA 4E2BA 3KFTA 2XN2A 4MLJA 1ZAHA 2C6QA 1UBSA 1LLZA 2H8XA 2C3ZA 3CPRA 4LNYA 4JYEA 4OQVA 3ATYA 3TW7A 2J9YA 4FX7A 5F2LA 3CC1A 2RHGA 2GQAA 1ZNNA 4NT0A 1VHCA 4JIQA 3S5YA 1KM4A 3EKZA 1UJPA 3LI1A 1R2SA 3PG9A 4O4VA 2VENA 5CPOA 1G6CA 1QAPA 4AHQA 3TROA 3SZ8A 1QCWA 3NOEA 3P67A 3RMJA 2BSLA 3E49A 4WY0B 1XUZA 3LLDA 1I2RA 5CSSA 1KV5A 5KTLA 5AC8A 3S9YA 3UWYA 6ALDA 1VR6A 2EAWA 3L66A 4CNNA 4ADTA 3OIXA 3LHYA 4IPIA 2NV2A 4UR7A 1LTDA 3F4WA 1FWRA 2A7RA 4GNJA 3LXCA 3MWAA 1A5CA 3NL3A 1GYLA 1S5WA 3QPYA 3ZS4A 2BXVA 3S8HA 1PL9A 1TV8A 3A21A 3SW6A 2YFOA 1VC4A 1X1ZA 1QDSA 3QPZA 4I7UA 1Q6RA 1PCWA 1A5SA 2ABAA 1GVSA 3SGUA 1DQXA 4RXGA 4QISA 3O06A 2WSRA 4X3ZA 3W2NA 1IIHA 3DKLA 3W07A 3WJSA 2Y7GA 4C1LA 4CCCA 4AWUA 5G4EA 4I9AA 4NJJA 4AVFA 3PG8A 3LBMA 4MPQA 3M5YA 4Z0JA 3ANYA 1JCYA 4NNBA 4E2DA 3G3MA 3LHWA 1YXCA 1VGAA 1TQXA 3L68A 1ZHAA 4RJEA 3NR0A 2C14A 4RZ5A 5I3JA 2I9EA 5AB3A 4FNRA 1ZAJA 1TMHA 1HTIA 4UTIA 3G1VA 2NX3A 3H53A 5DY2A 3MYOA 1Z41A 3LTSA 1LM1A 3DKJA 3A5VA 3IRDA 3NM1A 4C1KA 1KTBA 5DCBA 3W7LA 4O50A 1D9EA 3LCFA 4UR8A 4BI7A 5U4NA 3LERA 1OX6A 1IXQA 2PCQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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