1ZNNA

Structure of the synthase subunit of plp synthase
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
254
structure length
245
Chain Sequence
KGGVIMDVVNAEQAKIAEAAGAVAVMALEGGVARMADPTVIEEVMNAVSIPVMAKVRIGHYVEARVLEALGVDYIDESEVLTPADEEFHIDKRQFTVPFVCGCRDLGEAARRIAEGASMLRTKGEPGTGNIVEAVRHMRKVNAQIRKVVNMSEDELVAEAKQLGAPVEVLREIKRLGRLPVVNFAAGGVTTPADAALMMHLGADGVFVGSGIFKSENPEKYARAIVEATTHYEDYELIAHLSKGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Biosynthetic protein
publication title A New Arrangement of (beta/alpha)8 Barrels in the Synthase Subunit of PLP Synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PLP SYNTHASE
total genus 89
structure length 245
sequence length 254
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 4.3.3.6: Pyridoxal 5'-phosphate synthase (glutamine hydrolyzing).
pdb deposition date 2005-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01680 SOR_SNZ SOR/SNZ family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1znnA00
1Q3NA 3SR7A 1KFCA 3IIVA 4FNPA 4PL1A 5LNWA 1L9WA 3LTYA 2DZPA 5KMYA 1ZALA 1OFDA 3TQ0A 3EX1A 1S5VA 2NWSA 3R2GA 4MFEA 4O52A 3L5AA 3UPBA 2R8WA 5EMUA 4FF7A 2YGYA 4YMZA 3FA5A 3W7LA 3GDLA 1SSDA 3E12A 3PB0A 3PSVA 4HPJA 1TPUA 2RHGA 1PHQA 3G1VA 5BMWA 2RDUA 4N4QA 3QMRA 2Y89A 1EP1A 1VYPX 4XTDA 4EWND 3TC6A 4PC8A 2C18A 1VZWA 1TPC1 2ISSA 3RLUA 1SW3A 4BI7A 3HG2A 4JXCA 4FEZA 3TR2A 3NQ2A 1KW1A 4HT3A 3LB0A 4Y9AA 4Q33A 4O11A 3L9CA 1TSIA 2EKCA 4FNRA 3CWOX 2EF9A 4DXVA 3O1NA 4I9AA 3O15A 4K6AA 4UNLA 1ALDA 3CHVA 4ONVA 4A2RA 3W73A 3IGUA 3NA8A 3QEZA 3BLFA 3TDFA 3TV8A 1VLWA 1QO2A 1WXJA 2A7NA 1SW0A 2CWNA 1MZHA 3QQ1A 1OHLA 1B9BA 3MYPA 4JN6A 4ALDA 3OIXA 3E9AA 2G97A 3P60A 3NQCA 1XBVA 3G1AA 4K36A 1G7VA 3L0NA 2OT1A 2W6RA 3C2VA 3G1XA 3NQ8A 1G4TA 4FIQA 3GKAA 3S1XA 1TJPA 3W9ZA 2X16A 3G8EA 1IIGA 4UFMA 2ISWA 2VENA 3TIMA 2C15A 1ZAHA 1YPFA 1U5JA 3U8GA 2EGZA 1NF0A 2LLEA 3LHZA 1DBTA 1JUBA 2ZQ0A 4UNKA 1AW1A 3G24A 3BGJA 3TROA 1OFQA 1RQHA 4Q32A 5EYWA 3M1ZA 3PUOA 1O95A 5DBUA 2ABAA 3RLVA 4DPQA 1H61A 1F6PA 3W1NA 5K4XA 1W5QA 2I9EA 5G2IA 1XBYA 2B7QA 3TMQA 4UTKA 4XBSA 4M6VA 1YXYA 2E68A 1DOSA 2OX1A 2HMCA 4AF0A 4LUIA 2TMDA 2DJLA 1IXPA 4I7WA 3LERA 1OX4A 5L6UA 4CNNA 4MKNA 3C2EA 1LRNA 3BG5A 3MBFA 3W7JA 1LP6A 3MP5A 4K7YA 5I3FA 5IBXC 1EEPA 2B0MA 4AVFA 1R2RA 2CW6A 3NQ7A 3WJZA 3QQ0A 3RF9A 3QPYA 4MOZA 3B04A 3ABSA 1XL9A 1LDCA 3W7MA 4M6PA 3TCEA 4LTSA 1RR2A 3OVPA 1AK5A 3R89A 3FS2A 4TO8A 3EKLA 5TQLA 3LCGA 1GVOA 2VFIA 4YXGA 1DVJA 5LNVA 4JTHA 4HSNA 5EY5A 4KKXA 3OG3A 5TBOA 1ZNNA 3TKFA 1W31A 1A5BA 2VFHA 3LHUA 1TTQA 3W1TA 1K7XA 2Y7DA 3GR7A 3LTPA 2CLEA 1W5PA 3QYQA 3S6DA 3VI2A 1ZJIA 1X6UA 2XN2A 2JGQA 4LNYA 3ZR4A 1F7BA 1Y0EA 3N9SA 1W5MA 1A50A 3MP3A 3TMLA 1FUYA 4UTHA 3N19B 2OMAA 3C61A 5DCDA 3EXSA 1M5WA 2DJXA 4MFDA 4DQWA 4P61A 1I2OA 1PCKA 2GVJA 3A9IA 3M6YA 3I65A 1I2RA 3THQA 4FX7A 4UTJA 1J2WA 1SFLA 2VELA 2QJIA 3IGXA 3MHUA 3LLFA 3UYCA 2YYUA 4YCOA 3NQAA 2JBMA 3GXTA 3P8JA 3W1QA 2WNZA 1RPXA 4HNNA 1P1XA 5LGZA 3TQVA 1GYNA 4HHPA 4KWWA 4IMFA 5F2IA 3G3DA 1KM4A 4XUGA 3B03A 3N73A 4WXYA 2FJKA 1EUNA 3NXFA 1HTIA 1YTEA 3NNTA 2PRLA 3SY5A 1TREA 1KFKA 3W1UA 1Z42A 1SZGA 4JTKA 1DL3A 2HSAA 3MI3A 4WD0A 3FKRA 2QUTA 2CLLA 1XXXA 1FWSA 3LLDA 5D05A 1GTHA 3W7QA 4EIVA 5AB3A 4H3DA 5CSRA 4S1FA 1XUZA 2CZDA 3PG9A 3UZ5A 2CLIA 1TCDA 1TRIA 4AHQA 3WK1A 5DCBA 5K2ZA 1I2NA 4L4LA 4NX5A 5AYYA 2DORA 3LRLA 1F73A 2YSWA 4ICNA 4LOCA 3C2RA 2G96A 4PCFA 3Q37A 5U7SA 1H51A 3HF3A 1LM1A 5AHNA 4RZ5A 4O18A 1H50A 2XN1A 4C1KA 1JCYA 5EKYA 3W3OA 4H6KA 3B06A 1BWLA 4Z1CA 6ALDA 2PE4A 3W84A 1NSJA 4RKAA 4PH6A 3LV6A 1M6JA 3T40A 1H7XA 4NJJA 3UY8A 3DKJA 3NQVA 3PULA 1XDMA 3LXBA 5H91A 4DBEA 3HGSA 2ALDA 1IXNA 2A2IA 1QCWA 4GBUA 2J9XA 4TX9A 5G2WA 3TUUA 4JTIA 2CU0A 1F76A 4UIOA 4OHQA 1OFBA 4O15A 4RV8A 4A2SA 3CB8A 2Z1BA 1EX5A 1KFBA 5BRBA 1KFEA 1ME8A 1OJXA 4LRSA 4RLIA 3LCLA 3HGJA 4O14A 5FEZA 3NZ1A 4MY8A 1GTEA 1SSGA 4ADSA 4C1LA 1FBAA 3BARA 2J27A 3KOFA 1PCWA 3C8FA 3IVTA 2E6DA 1FCVA 4ZVJA 2V82A 2YFNA 3LHYA 5F4SA 3RK8A 3NPWA 1O4UA 2V81A 2ZRXA 3ZFHA 1KFJA 1LOQA 1ME7A 3UQNA 5K4ZA 3JR2A 1QAPA 4N2YA 3OVRA 4U28A 1W3IA 1SFJA 3MP4A 3C0JA 4ADTA 2TYSA 1DQWA 3DU0A 3TNOA 4IMCA 3HBLA 2QCHA 3EWXA 3GK0A 1R47A 3CPRA 3NG3A 4IX0A 1KBIA 1H1YA 4UMAA 1JULA 1CW2A 2J88A 4KWVA 1IXQA 4O53A 5G1TA 3FEMA 3P67A 3SFKA 4MZYA 3S5ZA 3W1PA 3M5YA 2ZZ5A 4ZQPA 4QNWA 2YW3A 1K8YA 4NNCA 1TPEA 4JDBA 1IXOA 5D37A 2XN0A 2W0UA 3QZEA 4GXMA 3G1DA 4WOQA 4ZQOA 3GDKA 5BOOA 4I7VA 3A23A 5CPMA 4CCEA 1MEIA 1FXQA 4LUJA 1W56A 4EF9A 1N7KA 4POCA 1JJKA 1KLZA 1EA0A 3P62A 2ZFAA 4GJ1A 3FJLA 3LRKA 2YXGA 3BLEA 3G18A 5HQEA 5D04C 1MEWA 3M5ZA 4Z1BA 4A22A 3M43A 5D02A 4HSOA 1FCUA 2RDTA 4O0ZA 4UTTC 3DXIA 1R2TA 3VE7A 3KAOA 3VKJA 2ISVA 1H7NA 3LBCA 1TV7A 3F03K 3NM3A 2GQ8A 1UASA 1EP2A 1WBJA 5DLCA 5IBXA 5HJLA 1F05A 3UXAA 3EWWA 2WSRA 5K9XA 3W74A 4N6EA 2ZZ7A 1TPH1 5F1UA 4E2BA 1GVSA 1OX4B 2FPVA 3EX6A 1YDNA 2CLKA 3DH7A 1WV2A 2GJNA 3CWNA 1D3HA 2PCQA 4CQ8A 1WOBA 5AC7A 1FQ0A 1LLZA 3E49A 5AHMA 1WBHA 1YDVA 3HMJG 2BTMA 3I7QA 4R7JA 1B3OA 3W87A 3CC1A 5LZLA 5FEPA 5A5WA 3O6CA 3NL3A 2VEKA 5D2TA 3QPZA 1MEHA 4JTUA 4S2BA 4E2DA 2ZZ3A 5D03A 3TJLA 1CX9A 4UFHA 3H54A 3M7WA 4M5PA 4PL2A 4JICA 4X22A 4XKYA 5E93A 5E1QA 4A21A 4DELA 2WSQA 3EX4A 3PWAA 2G95A 5F2MA 4JTSA 1ICPA 1LRQA 3EX3A 5G4WA 1BKSA 3M16A 3T7VA 1G4SA 1H7RA 3VCRA 1LTDA 1T8XA 2VFEA 2V9DA 1QMLA 3PS7A 3SECA 3HOJA 3LI1A 1IIHA 4H4IA 1JCXA 2PURA 4W9TA 4CLMA 1K02A 1TO3A 5D2VA 3QM3A 2FB3A 4WZHA 3T4CA 1LBMA 4OQVA 3HGOA 3V1PA 3KVKA 4FIRA 1YDOA 3OEXA 5D33A 1TB3A 2QCLA 2EAWA 5LHEA 1FDZA 3P81A 1DJQA 5AHLA 1TMHA 3NQGA 1CI1A 4OBTA 3DI0A 2QCCA 3DHFA 1XM3A 2DU2A 2R91A 2RDWA 1OX5A 4CCCA 3W7PA 3HG4A 5CZSA 3LHTA 3D0CA 3UWYA 2P1FA 1GT8A 2DP3A 3BW4A 3KRUA 1YXCA 4S2CA 2ZA2A 2NXHA 4QISA 1VRDA 4HN4A 3H55A 3STCA 4WUIA 1X1ZA 5D32A 1LROA 4Y96A 4IJBA 4N02A 2ABBA 2DZWA 5D2YA 3P80A 4MUZA 2GQAA 2O7QA 3TAOA 1FDJA 3QW3A 3QW4B 5BMXA 3TQKA 1B57A 1LBFA 1F74A 1HO4A 4O16A 3TU9A 5KTLA 1FY6A 2D73A 1PL9A 4DF2A 4GUIA 3LTSA 1S5TA 3MJYA 1GOXA 3W83A 3DHDA 4AXKA 3MUXA 4LV9A 2R94A 3EXTA 5HNRA 3TA6A 4UMCA 4FX8A 4LU0A 1UUOA 4K39A 3G3MA 3OBKA 3T44A 2P10A 1H5YA 3GXPA 2ZZ4A 3EWYA 3CM4A 1B4EA 3EXRA 1GWJA 1EB3A 2QJGA 4BFAA 1NVMA 1VR6A 1WX0A 4O1AA 1Z44A 1GVRA 2J24A 1GEQA 3FKKA 2GVGA 3B0VC 1JRBA 1AG1O 4JDYA 3MBDA 1QPRA 1H62A 3W7NA 3GYEA 5BNKA 1VYSX 3WK3A 2Z6IA 4LT9A 1A5CA 1QDSA 2ZA3A 4BK9A 1KA9F 3W2UA 3NAVA 4PFMA 3L5MA 2NUWA 4YLWA 4MYXA 3QSTA 3L21A 3SSJA 2BZNA 1B4KA 2Q3RA 4EOUA 3G1HA 4FX6M 3UWZA 1A5AA 3C6CA 4PA8A 5E0KA 1WQ5A 3A5FA 4TMBA 1TPWA 5HWMA 3MI6A 4N9BA 4GC4A 3TFCA 3HPXA 1FWTA 2FB2A 4ORMA 1I4NA 1ME9A 1FXPA 1SQ7A 1O60A 3FJ6A 4BI5A 5D2XA 3O16A 3S42A 2A85A 1LBLA 2JKEA 1TJRA 3SIZA 1RVGA 2CZ5A 4MZ1A 2B7OA 2FQIA 4LVDA 3S1UA 4JYDA 5KZMA 3UD6A 1TV8A 1LRTA 1XBXA 2Y88A 1YTDA 3G22A 4B5NA 5I3GA 3NQFA 4MY9A 1KTNA 4WQ6A 1QOPA 1DQXA 3PY2A 2YFOA 3W7OA 2GUUA 1XC4A 4IMDA 1DHPA 3BV4A 5LHFA 4WY0A 1H60A 2DZSA 1OFPA 1Q6OA 4UFIA 3KVJA 4IQLA 4MY1A 3IV3A 2WOQA 3B4UA 2BLEA 3HIJA 2X30A 5LNRA 4NXSA 3DFTA 4UTTA 3KFTA 1O94A 2GVLA 4IGHA 4PEKA 1TQJA 3B0UX 3F1QA 2E5BA 2ZRYA 3O05A 5FI8A 4O12A 1G69A 2DZVA 1W1ZA 3S8HA 3IVSA 5D30A 3L5LA 1DORA 1SO3A 2C13A 3L2IA 3KXQA 1TQXA 2I1OA 3LDVA 3DGRA 2VEIA 3STGA 2NUXA 3CEPA 7TIMA 1H7WA 4MZ8A 1HFBA 1EUAA 3JS3A 3KHJA 1RD5A 3Q2DA 3ATYA 4WY0F 5MHBA 3GDTA 5CPNA 4AAJA 4YWIA 5KSWA 4YCPA 2V5BA 3TW6A 5DCEA 3GNNA 3TFXA 1I2QA 4ZZ9A 3NPXA 3W2KA 4ZQNA 2YR1A 4XQ6A 1N8FA 5CG7A 1KM2A 1PV8A 3LHVA 1KTCA 2V5LA 1ICQA 2FLIA 2H8ZA 1VHNA 2NXGA 3OA3A 5SWUA 5HINA 4JTTA 3FOKA 4YL2A 2ZA1A 2VFDA 2X1UA 4XKYB 4NZFA 1TRDA 3C56A 4DO6A 4O1DA 1TTPA 4O54A 4MVAA 5AOUA 2E5DA 2Y7FA 4QIUA 1SO5A 5FEWA 3CEUA 3GLCA 3JRKA 1G67A 1M7PA 2QF7A 3USBA 3NL6A 1S5WA 2FDSA 3CTLA 3MO7A 4OE7A 5G5IA 2KZHA 5K9DA 2BWGA 5I3IA 4AWTA 1W3TA 3HB9A 1SO6A 4L4MA 5AFDA 4IWWA 1OYCA 3L67A 3Q94A 4HKPA 1OFAA 3W76A 3A21A 1VCVA 1UBSA 3S5YA 2HTMA 1BWKA 4IPIA 3LCFA 1ML1A 4Y90A 5AN7A 4UTIA 1C9DA 3M44A 1GG1A 2RH9A 1QNVA 2YW4A 1P0NA 2Z2UA 3G1FA 1LOSA 3LRMA 1Z41A 3W1LA 1FWWA 3PUDA 2QCDB 2V2HA 4OT7A 5BW6A 1GVQA 1UB3A 4DO5A 1X8FA 2OCZA 3PBWA 1JCNA 3BG3A 4O19A 2ZZ6A 4ZQMA 5HULA 1JCLA 1KM6A 3L0GA 3K30A 4MLRA 4QAIA 4O17A 3W86A 1QPOA 2VEPA 4WJEA 4IXXA 4K8HA 4CQAA 1J4EA 3W7KA 1MO0A 4UTWC 1RV8A 4MYAA 1QR7A 3N34A 3QC3A 3TE9A 1WOAA 2BSLA 5ABTA 4JTGA 1R2SA 3W07A 3BW2A 3G1YA 1TPFA 1TPVA 3NPUA 4NUWA 3W88A 3NL2A 3PC0A 3U6WA 2J6XA 3DENA 1A53A 2C1HA 1KM1A 1JR1A 3RU6A 4CCDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2V5D A;  3VFC A;  4WSJ A;  3IIV A;  2CKR A;  4QDM A;  4CEX C;  1KCX A;  4HTY A;  4PL1 A;  5A1A A;  2Y5S A;  5LNW A;  3B4Y A;  3LTY A;  2DZP A;  4GXP A;  1OFD A;  2J62 A;  1EJU C;  3EX1 A;  4IGM A;  3VMO A;  2HDJ A;  3R2G A;  2R8W A;  3AS2 A;  3MZN A;  4Q6X A;  1HKV A;  4YMZ A;  2OXN A;  3GDL A;  3E12 A;  2OB3 A;  2RDU A;  4JQA A;  3CL8 A;  3QMR A;  3H4G A;  2E8Z A;  1W9P A;  4BI7 A;  3HG2 A;  5H8U A;  1MW0 A;  4FEZ A;  2FKP A;  2W91 A;  4Y9A A;  2HV5 A;  3UR2 A;  1SGJ A;  4ATW A;  4MJ4 A;  1VB9 A;  1JYN A;  3L9C A;  4DJE A;  2DSK A;  1FFR A;  3MUC A;  4FNR A;  3PZO A;  2W67 A;  5DMM A;  4J3U A;  4EXA A;  1ZLP A;  4E8G A;  3M07 A;  1ALD A;  2JAL A;  4QG8 A;  4AEE A;  2J6V A;  4H7Z A;  4AC1 X;  1RAK A;  4A2R A;  2PBG A;  4IIC A;  4AZG A;  4ACY A;  1WZL A;  3EGJ A;  1DIK A;  1LWH A;  2BY0 A;  1NWU A;  3G1A A;  4WSK A;  5BYW A;  1G7V A;  2DH3 A;  2BGN E;  1U1U A;  2OT1 A;  3LY0 A;  3C2V A;  3G1X A;  4FIQ A;  2J7G A;  2X16 A;  1IIG A;  1XLD A;  4A8R A;  1SJA A;  2VQT A;  1YPF A;  4C6B A;  2EGZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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