3W83 | Genus

Total Genus 108

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	108
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-6-097 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus	108
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-03-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w83A02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w83A01

3CWNA 4A3UA 3DZ1A 5F4SA 3PC0A 1SFLA 3B06A 1UASA 2Z0IA 3BW3A 3WK1A 4O54A 2YSWA 4NXKA 3I6RA 2QCDB 4MYXA 4RJEA 1I4NA 4NQ1A 1C29A 2JGQA 4POCA 2R14A 2WNNA 3GVGA 3QEZA 4JEQA 1TPH1 1S5VA 5BMWA 3W72A 3O16A 4Y9AA 1GQNA 2JK2A 2ISWA 5CZJA 4BWLA 1YADA 2OJPA 1KFEA 4KFOA 1QPRA 1FCBA 3HG4A 3ATYA 1OYCA 1LOLA 3M5VA 3RF9A 2GOUA 3C3NA 3KAOA 3UWQA 1SW7A 3CWOX 1A5SA 4NX0A 1P1XA 1TJPA 1XBVA 4JYDA 4I9AA 4TU1A 2YFOA 4JICA 4YWIA 1Z41A 3LV5A 3LRMA 4HSOA 2ZRVA 1L6SA 2FPYA 5EA9A 4O8RA 5BRBA 4ADSA 1YDVA 3LHTA 4HNVA 5FESA 4UR7A 1ZJIA 1EX5A 1PHQA 1Q3NA 3B05A 1SO6A 1GZGA 2DU2A 4UCGA 3RK8A 3HOJA 1JCJA 3KRZA 3KVLA 4Z08A 2WSQA 3HF3A 3R8RA 4UC5A 5FEPA 5LGZA 3F1QA 4O1BA 3P8IA 4QNEA 4Y8FA 1KBJA 4OV4A 2ZTJA 3EKZA 4X3ZA 3I68A 3WJZA 3C6CA 4LS1A 1DL3A 3KHJA 2O7SA 3IGUA 1TPWA 4O1AA 3P74A 3W3OA 4BI7A 1VC4A 2WSRA 2CLLA 1OX5A 4ZQCA 1H7RA 3O05A 1M7OA 5HR7A 3CM4A 1QR7A 4O28A 3W86A 1WYIA 4FO4A 4GUJA 3ANYA 4XTIA 1FY6A 3TX9A 1VH7A 3UY7A 4FNTA 2OCZA 2H90A 4I7UA 5E0KA 4K36A 4YLWA 5LZLA 2RH9A 4WX2A 2XN2A 1S5TA 3M43A 2A7PA 4JIPA 3Q58A 4RKAA 4RZ6A 1XUUA 3W6YA 3SY5A 1LLZA 1AW5A 2Q3RA 3G1SA 4Z0SA 3NL6A 1K02A 2YDAA 1YLVA 1K8XA 1B3OA 4UTLA 4UTWA 5H2ZA 3G0XA 3IIPA 3EX3A 4IXHA 1R47A 1VHCA 3S0CA 3EXTA 3P8JA 3GLCA 4DQWA 3EWBX 1PCWA 3EWXA 4IQLA 1WQ5A 5AOUA 2PC4A 1AL7A 3DKJA 3ZS4A 2GQ8A 1KFJA 3STGA 2NXIA 1R2RA 2E6YA 4QJ1A 3TSDA 1I45A 4UTKA 3E9AA 5F2MA 1B4EA 4K37A 5FEXA 4AHOA 3TV8A 2TMDA 3UWZA 5D38A 4ZL1A 5MHBA 4E2BA 1GVFA 3PB0A 3GNNA 2CLIA 3LB0A 1OHLA 1PVNA 1OABA 1NFBA 1Y0EA 3B04A 4O50A 4JX4A 4NZJA 1TPVA 3PF3A 3W7JA 3S1VA 2C0AA 4A2RA 2DJXA 2OT0A 4AB4A 1ZAHA 3P84A 2A1YA 4HKPA 3LERA 3B03A 3QPZA 3OIXA 2V82A 3EX4A 4MYAA 3BPWA 3OVPA 4Z1CA 4BFAA 1VR6A 3ZWTA 1JQVA 2H3DA 4LVAA 1JVNA 1KM3A 1ME8A 4LUJA 3AO0A 3LLDA 3EEGA 2ZRYA 1SO5A 3MHUA 3CLMA 2DZUA 2EPHA 4RXGA 3TMLA 4DO5A 4HPXA 4AWSA 2WNQA 4PL2A 1XC4A 4E38A 1W3NA 4O17A 1K3UA 4M6QA 3N9RA 3OVRA 1OFPA 2AAMA 2Z2UA 4AHQA 3QPYA 1GG1A 4IX2A 3NM3A 4ALDA 5G2WA 4YCOA 1BTMA 4IPIA 2C6QA 1KV8A 3QH2A 2J9XA 4LOCA 1IGSA 3SZ8A 3LCIA 4UXDA 2Y7EA 5K7JA 4LU0A 3LM7A 2ZA1A 1TTPA 1V5XA 1OF8A 2ZDRA 1JR1A 4OV9A 1SQ7A 2ZRWA 3PUDA 1C8VA 1JJKA 1FXPA 1GYNA 1OG0A 3M5ZA 4IXXA 3THQA 3G1VA 1PV8A 3L9CA 3NDOA 5G2HA 3NQFA 2YGYA 5G2IA 5F2GA 4Y96A 5K4ZA 4LRTA 3BK0A 3C0JA 4E0CA 2F7FA 4FB7A 3W1RA 3TW6A 2Y85A 1KM2A 4PCFA 4LTSA 3W1XA 4FNPA 5J5RA 2BLEA 2QCHA 1SO4A 3PBUA 3PR2A 5AYXA 3TA6A 3I65A 4JN6A 2BZNA 2HS8A 1SSGA 3S5NA 1TMHA 2ZZ4A 3C61A 2WOQA 1YYAA 2TRSA 3TQKA 4WOQA 4LWWA 3W7MA 5D05A 3BVJA 3QMRA 3HPXA 2CZEA 3WJSA 3C2VA 5D33A 1Q6OA 3UXAA 1KM5A 4AEOA 2NX1A 3F4WA 2WO5A 3KVKA 3T55A 5D30A 4NX5A 2VFIA 3UZ5A 1NF0A 3KXQA 5DXXA 3HGRA 4UFIA 2ATMA 2ZZ2A 1KFKA 2R94A 2A0NA 1FCUA 4DBEA 3FJLA 3QQ0A 4DF0A 2QDHA 2CZFA 1F6KA 1DVJA 4Z1DA 3W1LA 4A29A 3W1QA 3DXIA 3E12A 1OK4A 4QSHA 3UXDA 3BG5A 3NQEA 1LM1A 1BEUA 4IGHA 3HGJA 2C13A 2OX1A 3G8EA 3PWAA 3FEMA 1EEPA 2G95A 1G4SA 3L5MA 3O6YX 1VYRA 3EX2A 4R33A 3KFTA 2JBMA 3G1XA 1TPC1 3GX9A 4XQ6A 5DCBA 3GYEA 5C6MA 3L2IA 3LCXA 2YW4A 1IXNA 4JDYA 4TMCA 2YFNA 2RDTA 3LI1A 1H62A 2J27A 1DQWA 3GXNA 3G8RA 4Q33A 5IBXC 4PH6A 1VLWA 5LKYA 3N19B 4O4WA 3CHVA 1TPUA 2VEMA 3LHVA 4ADTA 2Y62A 3OG3A 3DI1A 3MP5A 5KTLA 4JTUA 1VCFA 3TIMA 5D2VA 5C2XA 1FWRA 1N55A 4WD0A 3W2NA 5CZSA 4GJ1A 3KOFA 5A8GA 4Z0JA 2VFEA 1BKSA 1MXSA 2QF7A 2ZRXA 3L67A 1ZY9A 3W7LA 2C18A 3UYCA 4HNTA 3C56A 2EF9A 5AHFA 2FPVA 3V1PA 4C1LA 2FQIA 3C2FA 1H7PA 3EWWA 2BXVA 4RX0A 4CQ8A 4EF8A 3LTSA 3BARA 1J5TA 3FOKA 3S42A 4N6EA 4FX7A 1OFDA 1OVDA 3GAKA 3M5YA 1H51A 2V8ZA 4PL1A 1VLIA 1WV2A 2P10A 3H55A 3KRUA 5C5YA 4Q32A 1LORA 1IIGA 4HIBA 2JKPA 3QW3A 3BG3A 3DU0A 1JCNA 3M7WA 3PG8A 3STCA 1QPOA 3LHZA 2ZCGA 4K8HA 3C2OA 5FI8A 1H60A 1PL9A 3KVMA 4IMGA 4QQ3A 2CLEA 3PULA 2Y7FA 5AHNA 4JD4A 3G1FA 1CI1A 2VENA 3CQ0A 1XCFA 1ADOA 4LVBA 3W2JA 2V30A 3CT7A 1QWGA 2QCEA 3C52A 3QC3A 5C54A 1OF6A 4XBSA 3UNDA 4JYEA 2V0TA 3IIOA 3O07A 5I3KA 4TX9A 2Y70A 1LOSA 1OFRA 1DKWA 5HJLA 3W7IA 4FX8A 4NUWA 1W0MA 5HMSA 4ZZ9A 1KFLA 3USBA 2YXGA 1WXJA 2QJGA 2QCLA 2ZA2A 2QKFA 1W1ZA 5LNSA 5AB3A 1FWTA 1GTEA 3LGEA 1EIXA 2ABAA 1QCWA 1H50A 1XL9A 1OYBA 3LBMA 5AC6A 5LSMA 2X1RA 5G4EA 2X1UA 5LNUA 2Z1BA 3RU6A 1FDZA 3W22A 4PFMA 1W37A 1EP1A 2V81A 3HQ1A 1JCXA 2EGZA 2WNZA 1FWNA 4O1DA 2R91A 3LX9A 3M44A 7TIMA 5CZ0A 3KVJA 3EXRA 5EBUA 3GZ3A 4CCEA 1OYAA 2A4AA 4ZQRA 5DBTA 3PBWA 1TO3A 3FKKA 4UFLA 4MY1A 3W1PA 3L0GA 3ZWSA 5DELA 1EPXA 4H4IA 4JDBA 4PTNA 4DBDA 1VRDA 1C9DA 4A21A 4BF9A 3ZR4A 1VHNA 2DZPA 1HFBA 3STEA 3BGJA 3O63A 4O0ZA 4NVTA 5L9FA 1TIMA 3PB2A 3H54A 4JTTA 2YX0A 2E5BA 2EKCA 3MYPA 4O13A 3TH6A 1TTQA 1UBSA 5TBOA 5I3IA 3IIZA 4Z1AA 1K7FA 3MW7A 1VYSX 1W5PA 8TIMA 3W71A 2GVJA 2WQPA 1GPWA 2YW3A 3EWYA 3UWWA 4UFJA 3NAVA 4OHQA 1YXCA 3G0SA 4HHPA 3LLFA 4UR8A 1JQXA 1DJQA 2YZRA 4FIRA 5D09A 1M6JA 3MI2A 1XXXA 2HTMA 1QNVA 4O0KA 4PA8A 1ME7A 1SW0A 4RZ5A 3P82A 5LNRA 3ABRA 2NWRA 3W2MA 4NZFA 5D32A 1FWWA 1WOAA 4GUFA 3G1DA 1FCQA 2FTPA 1T0OA 3MP3A 4DELA 3NQDA 4MKNA 5KZMA 3CIXA 3QJAA 4LS2A 5H91A 4E2DA 5AFDA 4WY0F 4M7SA 3PBYA 3TSBA 2H6RA 1YDOA 2GVGA 2Q8ZA 3DHDA 1QAPA 2DZTA 3M5XA 1JRCA 1RD5A 2E68A 1M7PA 1X1OA 3N34A 1O4UA 4HPJA 3GKFA 1OX6A 3A9IA 3W7CA 3UWYA 3U6WA 1RVGA 2HMCA 3F03K 3GAYA 5FF0A 4U4MA 1RV8A 3Q2DA 1F76A 4WXYA 5LNWA 4XUGA 3HGSA 3W1NA 1G7UA 1O5XA 5AHEA 3DENA 3W2LA 2XFWA 1YPFA 2I1OA 4K39A 2OZ0A 3FLUA 5FF7A 2A6LA 2CFFA 5D37A 3NQ8A 2Y89A 4PC8A 3T44A 1G67A 4QIUA 1JCLA 3BG9A 3T7VA 3EWUA 2VFHA 1UCWA 5DY3A 1KTCA 3TQVA 2ZRUA 1KV5A 4N2YA 1TYGA 3UWVA 1VQTA 4N6FA 3NQVA 4NJJA 5FF4A 3FYOA 4RZ4A 2C15A 4IMCA 4S2BA 3IEBA 2E5DA 5D2XA 5CG7A 4LW7A 4O10A 5E1QA 3P81A 1R30A 3TXZA 4AF0B 3W84A 1YDNA 3W7KA 3B0VC 2E5CA 1HUVA 3GIYA 1H1YA 5E93A 1KFBA 3E02A 3W70A 1VCVA 4CQ9A 1LTDA 1QOPA 3N73A 1KTBA 1QO5A 4GWEA 3W7DA 1ICSA 4RLIA 3NM1A 1XKYA 3WFAA 3VNDA 4DF2A 3QRHA 2ATSA 3G3MA 3LXBA 5CZTA 1LP6A 1U5JA 2QCNA 4K38A 3M1ZA 2V2HA 1ZFJA 5AN7A 1TSIA 4FXSA 5D03A 1Q6LA 5KSWA 3PY2A 4Y90A 2NV1A 4JTIA 2G5WA 4RR4A 2DP3A 2Z6IA 4NNCA 2ZZ7A 1Z42A 3LV6A 5CGQA 2W6RA 5TIMA 1HO4A 2QEZA 2ZZ6A 3B4UA 3LI0A 2YYTA 2Y88A 1OX4B 4BI5A 2ZA3A 4R53A 2AQWA 3N9SA 1SU5A 2I14A 3LCWA 5SWUA 3QMSA 2VEPA 4NU7A 2D73A 4PODA 3GR8A 4O1CA 4AHPA 3W7PA 2H8XA 3PUOA 2GVLA 5HUPA 5K9XA 2ABBA 3BGGA 4FEZA 4GE8A 1XUZA 2QCGA 3GKAA 1DV7A 1TQXA 5KZEA 5IM51 3TDFA 4JTFA 3ABSA 4DXVA 5KMYA 5HUOA 4AMAA 5AHMA 3L65A 2X2GA 5TQLA 2IQTA 3A22A 1OFBA 4NNAA 3SECA 3L5LA 4KFPA 1K03A 4WUIA 4DO6A 4N4PA 4Q4KA 2DZWA 2GUUA 4N9CA 1ZAJA 3QM3A 4M19A 1L6WA 5U4NA 2FJKA 2PRHA 3DFQA 2VFDA 4H3DA 4IMFA 3W1MA 4OT7A 4MZYA 4ONVA 4RCXA 1WBJA 4XBKA 4Y6GA 2A2IA 5ABTA 4MZ8A 1HTIA 1D9EA 1QOQA 5HINA 4WZHA 1G4TA 4JS3A 2BTMA 1KM6A 1D3HA 4FF7A 2ZFAA 4UTTA 4ZQNA 2GPTA 2Z6JA 3SJ3A 4LV9A 3W75A 3EXSA 4FNUA 3SW6A 1F2JA 1GYLA 2OMAA 4UTIA 4AH7A 3JRKA 3BLFA 1G4EA 1TPEA 3OVQA 3P7YA 1IXPA 4LVFA 3STFA 1H1ZA 3TCEA 4UNKA 1H61A 5AYYA 1RQEA 1FBAA 1X1ZA 1P0NA 2UV8G 2W79A 3D0CA 1JCMP 3IIVA 1ALDA 4H6KA 2WJZA 4GRSA 1PHWA 4HN4A 2NUYA 4NXSA 4U28A 1W5QA 2QCFA 4IWWA 5T26A 3BLEA 1GVSA 3CB8A 3S8HA 3QQ1A 3UD6A 1J2WA 3S1WA 3MP4A 5I3GA 4UTHA 4GUHA 5BNKA 4X2RA 4JYFA 2DZXA 3W7HA 2C1HA 2FB2A 4R7JA 2NX9A 3HPZA 2H3BA 3PS7A 4K6AA 2QCCA 1GTHA 4LC6A 1PE1A 3MYOA 2F84A 5I3FA 4UMBA 1U83A 1O5KA 4JTGA 4O18A 3RLUA 3TC6A 4BWLC 2TYSA 3NGJA 1T8XA 3PSWA 5HQEA 2P1FA 4MFDA 2PRMA 3UPBA 1VYPX 1MEHA 2GJLA 3P60A 3N2MA 5CSRA 1K8ZA 3C4UA 3UQNA 2J6XA 3DFNA 3KX6A 4MUZA 1I2RA 1ZHAA 1XBZA 1IXQA 5AHLA 3A24A 4RV8A 1W3TA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3W83A

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