3W86 | Genus

Total Genus 104

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	104
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with SH-1-96 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus	104
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-03-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w86A02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w86A01

4ZQNA 3W7NA 5I3HA 2TSYA 4NNAA 4JN6A 4WUIA 1CX9A 2KZHA 3S9YA 1EP2A 3NYZA 4UC5A 3DFQA 4FX8A 4HN4A 4UTTA 3V75A 1DHPA 5LNSA 2QJIA 1LOQA 3W87A 4GE8A 3OIXA 4MIMA 4UTUA 3MBFA 4YL2A 3L5LA 4B5NA 3H55A 5C54A 3NM1A 3TJLA 1TRDA 4GWEA 2ZRVA 1VYSX 2V2HA 3EKLA 5F4SA 3GLCA 4BWLC 5DXYA 8TIMA 3P60A 2DZTA 1OG0A 3O8AA 2VEMA 4PFMA 2ZA2A 4RZ5A 1W8SA 2C0AA 3P8IA 1YLVA 2AQWA 3HB9A 4DF0A 2Y7FA 3IVSA 2CZFA 1H60A 2W6RA 1XBVA 4HNNA 4DBEA 2Y6ZA 3TQKA 4K36A 4LW7A 1T8XA 5HWJA 1Q3NA 4JTUA 4RZ4A 4OWGA 1VRDA 1OFDA 3G1FA 3L2IA 3UY7A 3SR7A 1O94A 4HKPA 1IIHA 3TSMA 3UWYA 4JTTA 3UWVA 4LUJA 2V2CA 2I1OA 1GG0A 1K7XA 3QW3A 4TX9A 3RMJA 4AB4A 1FCQA 4JICA 2B7NA 3P5YA 1A5BA 4JEQA 1TPDA 1SFJA 2BX7A 2X1RA 5LZLA 3EX4A 4LRSA 4O0KA 4WD0A 5LHFA 4Z1AA 5F2GA 3WJXA 4ADUA 2VENA 4P61A 3TXZA 5BRBA 1M5WA 4K37A 4EIVA 3FJ6A 1F74A 3BK0A 5K4XA 3B04A 3EX2A 4LS2A 1XL9A 2DZUA 3STEA 2CLMA 3DENA 2FB2A 4LWWA 4JTLA 4YLWA 1RVGA 4M5PA 2Z6JA 3GVGA 1HG3A 5K9XA 1Z42A 3SFKA 2OCZA 3DGRA 4HPXA 4YCPA 1MEWA 1QPNA 3FJLA 5AN7A 7TIMA 4QSHA 4BFAA 5ABTA 2E6DA 5D38A 5D33A 3O1NA 1DJNA 3TC7A 1B9BA 4DEFA 4AF0A 2VFGA 5FESA 3T7VA 5D02A 3RK8A 4I7UA 2YGYA 4O12A 4XUGA 2X2GA 1LCOA 4K6AA 5KZMA 3FYPA 1QCWA 2E68A 1KM2A 1OHLA 4UTKA 1OFAA 1QR7A 4ICNA 4Z08A 2NX3A 1TPEA 4GRSA 1H7RA 3S5NA 2VEIA 4ZQOA 2ZA3A 3IGUA 3BLIA 2G97A 3PVFA 1K8ZA 1QO5A 1EWEA 3CWOX 5IBXC 3PWAA 4RCXA 2GVGA 3TAKA 4CQAA 4TR9A 1LOLA 1JRCA 2V2DA 2EAWA 3RFAA 2ABAA 4UFIA 2YZRA 4XTDA 1A5AA 4FXSA 1I4NA 3SIZA 4A22A 4K39A 2C15A 1NAL1 1EUAA 3PULA 1KFBA 5I3JA 1KM4A 3CT7A 3E0IA 4FHAA 4NJJA 2OMAA 3KXQA 4N6EA 3IIZA 1FBAA 3PG9A 3HBLA 1MZHA 2R91A 4MYAA 3OVPA 5U7SA 4O1CA 5K2ZA 1YPFA 4FIRA 5HJLA 4XZ9A 1H61A 1T99A 2QF7A 5FI8A 1J2WA 1SZEA 4OU1A 3ABQA 5I3FA 4RXGA 1FQ0A 4TMBA 3MI3A 3NQ6A 4MFDA 1R46A 3DFSA 3FFSA 4PCFA 3MBDA 4FNPA 1OABA 3LHWA 5F2MA 1TPC1 1W0MA 3EX6A 1A5CA 1SO3A 3PB0A 3FKKA 2QCGA 2GJNA 1GVSA 2NWSA 3W86A 1A5SA 4DXVA 4IMDA 2QR6A 1DQWA 2ZRUA 3E02A 3RF9A 3QW4B 3Q37A 2O7SA 3OA3A 5DCEA 5AHNA 3NAVA 1TYGA 2VFFA 3PC0A 1F6KA 3L65A 4OGZA 1VJIA 3P67A 3P8JA 4WJEA 4NXKA 1EB3A 4JIPA 5LGZA 5AYXA 3NGJA 4LU0A 4Q33A 3LCLA 4K8EA 1KV5A 3MO7A 4ZMGA 5BNKA 3KVJA 1THFD 1LOSA 3NL3A 3WFAA 5LNRA 3SSJA 2V5BA 5HR6A 4N9EA 2WNQA 2H90A 2R8WA 2BLEA 1ZY9A 3NM3A 4ORMA 4N6FA 2X1UA 3QSTA 2FJKA 2NZLA 1H62A 3W84A 3E49A 4QAIA 3M5ZA 1Q6QA 1G4SA 2EPHA 3LBCA 3CEPA 1LM1A 4KWVA 2ATMA 2Q8ZA 3L67A 1AL7A 4MOZA 1SUXA 4JX4A 3ATZA 4RJEA 1IXOA 1GQNA 5AC6A 1F5ZA 1L6YA 2B7QA 1ICPA 3R13A 3LERA 4Y9AA 4ZL1A 1H7NA 2CLOA 3TH6A 3TU9A 3C8FA 2TRSA 1UUMA 4Q4KA 4I7WA 4AEOA 5EYWA 4YMZA 4LVAA 4OT7A 3UD6A 4NZJA 4IMGA 4PA8A 4IMEA 5AHLA 2QCDA 1SO5A 4N4QA 1QAPA 3C0JA 3F4NA 3DFPA 1N55A 1K3UA 3TSBA 4IQLA 3TCEA 4O13A 4N02A 1FXPA 2YSWA 5AHIA 3DXIA 3MHFA 5F4WA 1TQXA 2VEPA 3Q94A 4DO4A 2QEZA 2X1SA 2ZCGA 1W31A 4H3DA 3W74A 2ZZ6A 1W5MA 2A6LA 3NPWA 1DL3A 1CI1A 3ANYA 2QCLA 4UMAA 5LKYA 3BG9A 2P1FA 4JX5A 5DY2A 3TROA 1K8YA 3W7JA 3OG3A 4PODA 3R12A 1XBXA 1G6CA 2ZA1A 4Q32A 4O19A 2TYSA 3U8GA 1FXQA 2A0NA 4RK8A 4UTIA 4O16A 3MHUA 1D3GA 1GYNA 1Q45A 4BWLA 3G0XA 1JQXA 3CQ0A 3G1YA 3G3MA 3LI0A 1LLWA 1ICQA 4JYDA 4JDBA 4IMCA 1BTMA 4O28A 4CNNA 3SGUA 2JK2A 3GX9A 4JS3A 2J9ZA 4O17A 1OFPA 2PURA 4GUGA 2YXGA 4JY9A 1SFLA 3TX9A 3GZ3A 3VI2A 2OJPA 3CM4A 3LXAA 3VCRA 3G1AA 2H8XA 3NZ1A 5F4XA 2IQTA 4A2RA 1EX5A 1I2OA 3NVTA 4NJHA 5IM51 3B0UX 3GIYA 4YCOA 3G1HA 1GPWA 1GOXA 1BWLA 3OBKA 4NQ1A 1Q6RA 1FDYA 1KFKA 1T96A 3TR2A 2YYTA 3LX9A 4J9JA 3UY8A 1DBTA 4LT9A 4NT0A 3CPRA 1JCXA 3NL5A 4NX5A 4MY1A 3R2GA 1TREA 4N4PA 5DXXA 4ADSA 4PL2A 3W7GA 1LZOA 2CLLA 4EWND 3LCGA 1EA0A 3G22A 1H7OA 3GK0A 2BTMA 2B4GA 3IIVA 3MP5A 1FWWA 2UV8G 4LV9A 1SZNA 2ZRWA 5G1TA 4AWUA 3S0CA 4AMAA 4A3UA 1JCNA 4LRTA 4FNTA 4UNKA 1EUNA 2WQPA 2DZVA 3UPBA 2VXNA 3PBUA 3U2OA 3PSWA 3QM3A 1V7YA 1BKSA 4UR8A 3LRMA 3NQFA 3S1VA 3DH7A 2WV8A 3UWUA 5GVJA 3OVQA 5C6MA 4O8RA 3W88A 1PL9A 3EKZA 4DQWA 1GG1A 2DZWA 2VFIA 1J5TA 3N2MA 2XFWA 5G2WA 3DFOA 4UFMA 4GC4A 2PRLA 3W76A 4OV9A 4DO5A 1GWJA 4NJKA 1EEPA 3UPWA 4H4IA 3KFTA 3N3MA 3UXAA 4Z1DA 1G7VA 2GPTA 1JUKA 1S5TA 3NL6A 2V5LA 1ZNNA 1ME8A 5G1YA 3TUUA 5IBXA 4JY8A 3DI0A 3OHIA 5LNUA 3W7MA 2YFNA 4LTSA 1O4UA 1YPIA 5J5DA 1G69A 3DFNA 1HUVA 1KTBA 1PIIA 5FEZA 3TV8A 2H3BA 3S42A 1MXSA 4QIUA 1P5BA 3E12A 1ME9A 5A5WA 2E5BA 3A24A 1OX4B 2RFGA 3W1PA 3KHJA 4IUOA 4JYFA 5D05A 3ZR4A 5HMSA 1YDOA 1G67A 3I65A 1JVNA 1ZCOA 3F03K 1XDMA 3PM6A 4FB7A 3UXDA 4FEZA 1HFBA 4GXMA 2YFOA 3M47A 1F76A 1KM6A 1L6SA 1H1YA 1FCUA 1WXJA 4PL1A 4CCDA 2FLIA 3MUXA 1G4EA 3H53A 3CHVA 4WOQA 1KM3A 1S5VA 4HPJA 4JR5A 3W83A 5KITA 3I6RA 3QQ1A 1P4CA 4X3ZA 2P0OA 2D73A 1I45A 1NEYA 4LC6A 3UNDA 1LRTA 3MWAA 1QOPA 4FX7A 4ZQPA 3NZRA 2RDWA 4RX0A 1H63A 2H6RA 4QM1A 3NXFA 1OFOA 4AHPA 2QCEA 4JDYA 1ZAHA 1O60A 3PUEA 3OEXA 4X2RA 2ZYFA 3GAKA 3A23A 4S2BA 1AW5A 2QKFA 3A5VA 1VYPX 4LVBA 2YDAA 3LDVA 2R14A 5D2TA 2Y61A 4R7JA 3HJZA 3GDMA 2OT0A 3BV4A 3IVUA 2O7QA 2ZRYA 2ZTKA 1IF2A 3P62A 1LP6A 3PUOA 1YXDA 3OVRA 3HGSA 3LTYA 3W07A 4WY0A 1KV8A 2AGKA 3B03A 3W2JA 3A22A 1J4EA 5KTLA 3KAOA 2DU2A 3QYQA 3GDRA 1XKYA 3LHZA 3F1QA 4OV4A 1LRNA 3P61A 2GQAA 3IRDA 3NQVA 2QCDB 3G24A 2YR1A 3HG2A 2LLEA 4XBSA 1UASA 3UWZA 3MMTA 1BWKA 1ICSA 1V5XA 2I9EA 1JRBA 1RPXA 1B57A 5L9FA 3W2KA 3I7SA 2J24A 3AO0A 3E96A 3W85A 4QITA 4K7VA 5CSSA 4EVZA 3JS3A 4A21A 1QOQA 1LORA 2YW4A 3R89A 2C16A 1WDWA 4A29A 5LSMA 2OT1A 1K7EA 1SU5A 3L66A 5KZDA 3MI6A 1TTQA 3I7QA 3TW6A 1JQVA 4L4LA 1OK6A 3NA8A 3P81A 1FUYA 4EOUA 4EF8A 4JTIA 2FPVA 4I9AA 2CFFA 4LS1A 3DU0A 2CZ5A 4LVDA 5AFDA 3WJYA 4UMBA 2H8ZA 4KFOA 4MY9A 1XUUA 5AYYA 5E1QA 2ZZ2A 1H1ZA 1WA3A 1IGSA 3ELFA 3KVLA 1CW2A 5F2LA 4UTHA 5K7JA 4IJBA 3EWBX 2DJLA 2GVLA 1NFBA 1VLIA 1C29A 3T40A 2V8ZA 1Q6OA 5K9CA 1PCKA 1FDZA 1FCBA 3C4UA 1NSJA 2YPIA 2DZPA 5D37A 5C5YA 4FNQA 1TPUA 4UTWA 3G0UA 2C1HA 1QDSA 3T4CA 2PE4A 2I14A 3NL2A 2X16A 1S3HA 3HQ1A 5E93A 2Q3OA 3LGEA 1A53A 2A7RA 4BF9A 3PBYA 1H50A 4Y6GA 3NQEA 4MZYA 2CLEA 3M1ZA 3LCHA 1K8XA 4JXCA 3W7IA 5D30A 2RH9A 3CEUA 2JBMA 5E0KA 3B05A 2E5DA 2BWGA 1O5KA 4PC8A 4ONVA 1R47A 1UUOA 2XN0A 1AK5A 3W1QA 2G5WA 2NX1A 2RKXA 3PSVA 3MP4A 4NNCA 3DFTA 4JYEA 3GNNA 3G1SA 3R5EA 1VZWA 3EXTA 1TPB1 3GR8A 5DELA 1TCDA 2A21A 5EA9A 2Y70A 4K8HA 5TBOA 3TIMA 5HULA 2GVJA 2ISWA 2NUXA 1PV8A 1TTIA 3HF3A 3VFLA 3K30A 4O1BA 3C2VA 5D2XA 4UTTC 4M6PA 3S1XA 1VLWA 1TJRA 1GT8A 3PB2A 4GUIA 1YXYA 1SW3A 2DZSA 3NQCA 3UZJA 1D9EA 2NXGA 4K38A 2P10A 4BR1A 3QRHA 3HGOA 3M0ZA 3NQ2A 1WYIA 1OFBA 4Y96A 3LV5A 2QJHA 1KFLA 3IVTA 1P0KA 3GDTA 3O6CA 1PCWA 4U4MA 3P80A 3VE9A 4RKAA 3O15A 4ZVJA 1QMLA 3M9YA 1RZMA 4FX6M 1QPRA 6ALDA 4C1KA 1QWGA 3A9IA 4KFNA 4JTFA 5A8GA 4XWUA 3L5AA 1H51A 3NG3A 1W3TA 1DKWA 3SI9A 3HG5A 3N9SA 3NDOA 4RZ6A 3W23A 2QCHA 2Y7GA 3BVJA 4O11A 4HSNA 3MYPA 1Z48A 1R2SA 1EP3A 5KMYA 2CU0A 3T44A 3QPYA 5CPMA 3LRKA 2EKCA 5LHEA 2WO5A 4UIOA 3DBPA 3LHTA 5L6UA 2FPTA 1KFEA 2JKEA 4TMCA 3WJZA 3BLFA 1L6WA 1DV7A 1TV7A 1OYAA 4OHQA 3H54A 1W5QA 3TSDA 4WZHA 4UUIA 5D09A 5LNWA 4AHOA 2FPYA 3GKFA 3NQ7A 3NQGA 4GBUA 3TC6A 5K4ZA 1KM1A 1WAUA 4GUFA 1K7FA 3IEBA 1TTPA 4LS0A 4O10A 3MHGA 2A4AA 4M7SA 3UYCA 1RQBA 3TE9A 2E1DA 3LB0A 5HINA 4BI6A 1EPXA 5F1VA 1IXNA 3WK2A 2YCEA 1ZFJA 4UTJA 1P1XA 2DP3A 3CU2A 1H5YA 1KBJA 1VC4A 1FWRA 3WK0A 4XTIA 4O54A 3GAYA 2DJXA 4DPPA 2YYUA 3W7RA 5CG7A 3QEZA 2J9YA 3W7LA 2DZXA 2B7PA 4MZ8A 3JRKA 3KRSA 1OF6A 1GVRA 1I2NA 1VHCA 4YXGA 3QJAA 3C6CA 3BO9A 3CC1A 4CCEA 5F2IA 1ALDA 5KINA 3QH2A 4JGDA 2ZRZA 1PS9A 2AAMA 1LBMA 3O06A 1R2RA 3W7EA 4O53A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3W86A

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