3W74 | Genus

Total Genus 105

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	105
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-4-139 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus	105
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w74A02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w74A01

3DKLA 5HQEA 1SU5A 1L6YA 2Y62A 3W2LA 1PV8A 1IXPA 1XI3A 4GFSA 4O12A 1TPDA 3R89A 3YPIA 3WK1A 3B06A 3NL2A 4K7VA 1KM5A 2V9DA 2YXGA 4KWVA 1VH7A 1SW3A 3SFKA 5CG7A 1WX0A 2V0TA 3STFA 1Y0EA 3N9RA 2H3BA 2E6FA 2HTMA 1S3HA 3BGJA 3M41A 4LS1A 4YXGA 5LNRA 1FDJA 1JCYA 1O94A 1PVNA 1LBLA 1QR7A 1EP1A 4RZ4A 4RKAA 1T8XA 5CZSA 1D9EA 1THFD 5D30A 1KW1A 3LCGA 3SJ3A 4I7UA 2Q8ZA 4JTSA 1K8YA 3PG8A 3HJZA 3IGSA 5E0KA 1IXQA 1VS1A 2ZZ7A 1Z42A 3DHFA 2PRMA 4NJKA 2Y7GA 3IVTA 2JGYA 3LB0A 3V1PA 2BSLA 3VE7A 3VFLA 3MUXA 3EX2A 3EWYA 2YX0A 5KINA 4LC8A 3EEGA 4O19A 4FX8A 1JRCA 3QQ1A 5GVJA 1FXQA 3FKRA 2GPTA 4XUGA 2CLLA 4RZ6A 1JQVA 3N2XA 3L67A 3P7YA 1VC4A 3QPYA 4O0ZA 4UMCA 3P8IA 3GNDA 4JD4A 1OX4B 3BARA 3RF9A 1SZFA 2P10A 4MFEA 2X1UA 1KM0A 4O52A 3UY8A 3LI1A 5K4ZA 3LCIA 1W1ZA 2QCHA 3IVSA 5TIMA 4LUJA 1JVNA 4DF2A 5HR6A 1S5WA 2Q3RA 3OVRA 3NM1A 3TW7A 4K39A 5HUOA 4O1AA 3HG2A 3MYPA 4CNNA 1KFEA 1NSJA 1R2RA 2Y63A 4JIPA 3W1LA 4UFJA 3G22A 1NFBA 1YXYA 4WY0F 1NAL1 1UBSA 3E49A 3UXDA 4JX6A 2ABBA 3DU0A 1MXSA 1EWDA 4FB7A 5KMYA 4UFHA 3SGZA 3GAYA 4IPJA 2YYUA 3T55A 3NGJA 1F74A 1JUKA 5CPOA 1H7RA 3GR8A 1OFEA 3STCA 5K9CA 4ADUA 3KXQA 3FJ6A 4MVAA 2BZNA 1G69A 4HIBA 3T78A 2V82A 5LHFA 3QM3A 1DL3A 2WQPA 4PFMA 1O5XA 4O53A 4K37A 1BTMA 4PTNA 2QJGA 5AFDA 1TV7A 3MI2A 1KFBA 1Z44A 1PL9A 2CW6A 1LRNA 4MUZA 5D32A 3LV6A 5G2HA 2NX3A 1GZGA 2W0UA 2VFIA 2X16A 2V2DA 1FCVA 1TPVA 1TPB1 4BWLA 1M6JA 3G8EA 3TUUA 3NL6A 2XN1A 2YFOA 1ZENA 3QH2A 2QCMA 2PURA 2V8ZA 3U8GA 2ISSA 4NT0A 4IMEA 1FWSA 5F1UA 3ZWSA 4MZ8A 1SPQA 4R7JA 2Y7EA 5FEPA 3HO8A 4FNPA 1QOPA 1K7FA 3UD6A 2EGZA 5HJLA 5HWMA 2PRLA 1FWNA 2OCZA 3W86A 4ZQRA 2QAFA 3LOTA 4BFAA 1X8FA 2NXIA 3JR2A 3VI2A 1CX9A 1AMKA 4GUGA 4FHAA 3T44A 3TJXA 5LNSA 3FEMA 1JULA 2EPHA 2ATMA 3L21A 5DY2A 1AL8A 3W1MA 5CSRA 3TE9A 4HNVA 5CZJA 3F4NA 2NUYA 4FNTA 1EX5A 3IGXA 4C1KA 4OU1A 2Y6ZA 3O8AA 4FX6M 3W7RA 1SSGA 1EP2A 1YADA 2E6DA 3N34A 1G7VA 4M7TA 4N9EA 1EUNA 1MO0A 4UNLA 1A5SA 1GT8A 2C14A 3N14A 2GUUA 3UXAA 1LROA 4LV9A 3UYCA 1RQEA 3HPZA 4JTLA 2NV1A 2GVGA 5F2GA 3DBPA 4TMCA 3P82A 5J5RA 3W7DA 3BK0A 3EXTA 4LRSA 1TRIA 1VQTA 2DZWA 1G4SA 1W8SA 2H8ZA 2J9XA 2ZA1A 3NXFA 4HNTA 3M16A 3KX6A 3MI6A 5HUPA 3EXSA 3PM6A 4IQLA 2CU0A 3QC3A 4FO4A 2QKFA 2P1FA 2NUXA 3W85A 4POCA 3NQDA 5AHEA 1J4EA 2EHHA 2ABAA 1FDYA 4A3UA 3FYPA 3TV8A 4M6VA 1X7FA 2QJHA 3LX9A 2O7QA 5LNVA 3NA8A 2CLOA 2CLKA 4CNPA 3LRKA 4N4QA 3W2UA 3W7HA 2FFCA 1OFBA 3IVUA 1UCWA 1NVMA 3TC6A 2XN0A 5DN1A 1R2SA 5I3FA 3QEZA 3FIGA 1I2QA 1OFDA 1DHPA 1JCJA 1K7EA 3P61A 4NX5A 2JKEA 1WBHA 1N7KA 3UZJA 2WNZA 3M7WA 4GUFA 2A2IA 4HKPA 2CZDA 3H53A 1D3HA 4A2SA 3WJXA 1H7XA 5LHEA 2CZ5A 4HN4A 5DCEA 3Q58A 1VYSX 1VYPX 2J88A 3UQNA 1OYCA 2FQIA 3CIXA 1QPRA 5EA9A 3GDTA 4Y96A 1ICQA 4Q33A 4X22A 3L5LA 1RQBA 5AOUA 2JK2A 1TCDA 4CQ8A 3GDKA 1YTKA 5E1QA 1KFLA 1IF2A 4WY0A 3PBUA 4C1LA 4OHQA 1JQXA 2NUWA 3FOKA 3HIJA 2AAMA 3MBFA 1TTQA 3W87A 1DQWA 5F4SA 3WFAA 1AG1O 3NL5A 5DCDA 4CQ9A 5AHMA 1SFLA 4TO8A 3EKZA 4MZ1A 3O6CA 3NQGA 4O4WA 1W54A 3DFPA 1IXOA 2EAWA 2Q8LA 1FXPA 1ZCOA 3THQA 3NPWA 2QUTA 4FIRA 3QPZA 1WAUA 3M5XA 1LDCA 1LOLA 4WX2A 2ISWA 1QAPA 4B5NA 3B03A 4IOTA 2OZ0A 2TSYA 3P62A 4AF0A 2ZQ0A 4M6PA 3C3NA 1A5BA 5EBUA 3U2OA 3PF3A 4H6KA 2E77A 4BI5A 1LYXA 1OVDA 4HSOA 3HG3A 4O18A 2NXGA 1P4CA 3CB8A 2ZRYA 1WA3A 3DFQA 5G4WA 3HF3A 1KA9F 4LS2A 2WSYA 3MHFA 3W73A 1KFJA 4QNWA 5K9DA 5LNWA 3LTYA 4NJHA 3B8DA 1I2RA 4UFKA 3VKJA 3LHTA 3Q94A 1PIIA 2I1OA 1PCWA 3CM4A 3W7NA 3HMJG 4R34A 1SUXA 4MLJA 2OT0A 3NOEA 5LNUA 1IXNA 1ME7A 1V5XA 1TPC1 3S9YA 3O6DA 1HO4A 4O1BA 4ZZ9A 2ISVA 1JR1A 4AF0B 4DF0A 3ANYA 2A0NA 3W7OA 3W7MA 3GDLA 1HTIA 2ZZ1A 3RU6A 1B4EA 1EPXA 3PS7A 1F2JA 3FLUA 3E02A 1N8FA 3PG9A 1PE1A 1X1ZA 4CLMA 1RR2A 4AAJA 3EWUA 4K6AA 3QRHA 1P0KA 1R2TA 3G1AA 3W07A 3LHVA 3EX6A 2QEZA 4MKNA 2NV2A 5CGQA 5FEZA 1TRDA 4LT9A 5AYXA 5AHNA 3EWWA 4N2YA 1MEWA 1O60A 2XFWA 4NJIA 3GYEA 2CLFA 1ZAHA 1H7OA 1I2NA 4UTKA 3HQ1A 4AEOA 4DQWA 3TQKA 3G0XA 4AB4A 4HNUA 3KRZA 2WKJA 1SO4A 3B04A 3W1RA 1RV8A 1J5TA 3TC7A 1Z41A 4TMBA 1AW1A 2VFHA 4O50A 1ADOA 1GG1A 3N2MA 4XTIA 3TU9A 3NQEA 5U4NA 3T7VA 4UTTA 1GTHA 3GXTA 4QSHA 1XBVA 3ZR4A 1LLWA 2GOUA 1GPWA 4PA8A 8TIMA 5A8GA 3W74A 4HNNA 2GQ9A 3TQVA 1OFOA 3W70A 2P0OA 1UB3A 1LM1A 1YXCA 5KZEA 2YGYA 1ME9A 4BK9A 5LKYA 1CI1A 1VHCA 1M7OA 4IGHA 1EP3A 3B0VC 3ZWTA 5D2TA 3C2FA 3CWOX 5SWUA 2I9EA 5F2IA 4XKYA 1AK5A 1LZOA 1C8VA 5DLCA 3O63A 4GUHA 2HSAA 5TQLA 3W7IA 3DFTA 3UWZA 5CSSA 2E6AA 3JRKA 4IMDA 3NZRA 2QAPA 3TKFA 1TQXA 3H55A 1GJPA 3DZ1A 4UC5A 1KBJA 1VRDA 4O28A 4WXYA 2QCFA 1SO5A 3GXPA 2FIQA 4CCCA 4IXXA 3NL3A 3L5AA 4JX5A 5G2WA 5HWNA 3L0KA 4UXDA 4IMCA 4L4LA 4O57A 5LGXA 1XUZA 3Q2DA 3W1UA 3QZEA 3NQAA 1OFAA 4TR9A 1KM6A 2NLIA 2GVLA 3LHUA 3NQCA 4HT3A 2C19A 4WZHA 4Z1CA 3W1AA 2A5HA 3GAKA 1W31A 4XKYB 2LLEA 4MLRA 1WOAA 4KFPA 2QDGA 3F4WA 4TIMA 3TFXA 1F05A 3S5OA 2GJLA 4AHQA 4I7VA 3W1NA 5DBUA 1ICPA 4JTGA 1Q6LA 5I3JA 3NAVA 4Y6GA 3VNDA 3C61A 1DORA 2QF7A 1AW2A 5CPMA 4E2DA 5KITA 3I68A 2V5LA 1MSSA 3OA3A 4A21A 1K8XA 2CZFA 4O17A 5K2ZA 4O54A 3P8JA 2TPSA 3JS3A 3W72A 1KTNA 2G97A 3N19B 3PUOA 2Y61A 4GE8A 4IMGA 4S2BA 3G8RA 3PSVA 2DJXA 2Y85A 4ONVA 4MJZA 2A6LA 4ML9A 4O14A 3W7JA 1UUMA 4RZ5A 5I3IA 1WOBA 2OT1A 3SW6A 2BWGA 5AHLA 5AYYA 5DBTA 1GTEA 3HPSA 3OVQA 3FA5A 1P1XA 1T0OA 1EWEA 3NQ6A 1X1OA 3W1PA 2VEMA 5D2WA 4YLWA 3QJAA 4N02A 3SIZA 1YTDA 2VFDA 1TPEA 4RXGA 2H6RA 3P5YA 2ZTJA 3P74A 4JTFA 4RLIA 1YXDA 2B7PA 1G67A 3E96A 4MY9A 5L9FA 5F4WA 3UWWA 5HULA 1KM3A 4LTSA 5D09A 4EIVA 2CWNA 3UWVA 1RPXA 4E2BA 2YFNA 3INPA 5HMSA 5KTLA 2NX1A 1L2UA 2I14A 3TSDA 2YR1A 5KZMA 3LCHA 3GIYA 3W1XA 4NNAA 4UMBA 3TH6A 3CQ0A 3LLFA 2OMAA 3MBDA 1SSDA 4IX2A 3HGSA 1KTCA 4PL1A 2X1SA 1QO2A 1H1ZA 1G4EA 4ADSA 4JXCA 2DZXA 3IIPA 3NM3A 2PCQA 2JKAA 3BGGA 3LDVA 2AGKA 2JKPA 3IEBA 1XDMA 3MW7A 2WNQA 2JBMA 2E68A 3PVFA 4RXFA 3PB2A 1RD5A 5FEWA 3QSRA 5K9XA 1W5NA 3DHDA 2RFGA 2V81A 3I6RA 2Y88A 4G1KA 3ELFA 5TBOA 5K4XA 3E9AA 1OABA 4UR8A 4TX9A 5IBXC 5FF4A 3W3OA 4UTMA 2WSQA 3NVTA 1FDZA 4XQ6A 2Y70A 1GWJA 4XBSA 3WJZA 4BWLC 1PHWA 1HFBA 3LCFA 3BG5A 1FY6A 5BNKA 5D2XA 3S1VA 4WXZA 2UV8G 4NNCA 4P61A 4P2VA 3NG3A 3LRMA 3GDRA 3BVJA 4DPPA 3MWAA 1VHNA 1VJIA 4JYFA 3A24A 4PH6A 1FCQA 4O4VA 1OHLA 3EX3A 3NQ8A 3OHIA 4UCGA 3DI0A 2VFFA 4DF1A 5CZTA 4AH7A 3SSJA 5G1TA 1XC4A 3FS2A 4NU7A 2CLMA 2WJZA 4GWEA 3S0CA 1LBFA 5L6UA 3GLCA 1IIGA 4O10A 2FB2A 2VC6A 1TJRA 3T4CA 5EKYA 1EA0A 2Z1BA 1NF7A 2H3DA 3W7PA 2VOMA 3EX4A 3SI9A 3BV4A 3P81A 2AQWA 4MY8A 3EWBX 3W83A 1V7YA 3TX9A 3KRUA 1TV5A 4UTWC 1JCMP 2RDWA 3R13A 1GVOA 1XXXA 3W84A 1QMLA 1YPFA 3CWNA 5AC6A 4R53A 2GQAA 5H91A 3DGRA 4CNOA 3LI0A 3PY2A 3N3MA 1ME8A 2C18A 4S1FA 1XBXA 3STGA 3BLIA 3M9YA 3A5VA 1OYBA 3MO7A 3M5ZA 1QPOA 4FNQA 2R14A 4WOZA 4O1CA 1ZALA 1QPNA 3L5MA 1JRBA 1W5PA 2ATSA 3DH7A 1B3OA 3WJWA 5F1VA 2A85A 1JCLA 1OX6A 3F03K 3E12A 1QWGA 2A7NA 1ALDA 3RFAA 1I8JA 3NEVA 3GK0A 4LVDA 4EVZA 2W6RA 4UTUA 4O13A 1EB3A 3W71A 4JTIA 4UR7A 4JICA 2R94A 3LHWA 4OE7A 4IMFA 2X1TA 1KLZA 1W3NA 5DXXA 1JUBA 4LW7A 3NPUA 5AC7A 2DZVA 1SZGA 3UPWA 1WDWA 4DEFA 4QJ1A 4N4PA 3GKAA 4XTDA 1C9DA 3BLEA 3CT7A 1AW5A 3S6DA 3G0UA 5DCBA 3CC1A 3NZ1A 1H51A 1W3TA 1B9BA 4WOQA 3O05A 1H61A 3KVLA 4Y8FA 5AB3A 3MJYA 1JCXA 4ZL1A 4BR1A 1ICSA 1TIMA 1T99A 3TSBA 3G1XA 4L4MA 5D02A 1WQ5A 3P5ZA 4ZMGA 1G4TA 2VXNA 3ABOA 3WK0A 5DY3A 4ZVJA 1TREA 1F73A 2ZYFA 4WJEA 2DZSA 2A4AA 5F2LA 1H50A 2PE4A 2CZEA 1AL7A 1H5YA 2VFGA 1L6WA 3O06A 4NXKA 4Y90A 5CZ0A 3SY5A 4GC4A 3QW3A 1OFPA 1TPUA 4GJ1A 4LVAA 3TR2A 2QCCA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3W74A

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