5LXEA

F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase from rhodococcus jostii rha1
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
334
structure length
324
Chain Sequence
MVIKFGYKASAEQFGPRELVELGVLAEAHGMDSATVSDHFQPWRHEGGHAPFSLAWMTAVGERTSRLQLGTSVMTPTFRYNPAVVAQAFATMGCLYPGRIMLGVGTGEALNEIATGFAGEWPEFKERFARLREAVALMRELWLGDRVDFEGNYYKTVGASIYDVPEGGIPVYIAAGGPVVARYAGRSGDGFICTSGKGMELYTEKLMPAVAEGAEKADRDVAEIDKMIEIKISYDTDPELALENTRFWAPLSLPIEMERAADALPIEQVAKRWIVASDPDEAVAQIRPYLDAGLNHLVFHAPGHDQKRFLELFQRDLAPRLRGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Rhodococcus jostii (strain rha1)
publication title Discovery and characterization of an F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase (Rh-FGD1) from Rhodococcus jostii RHA1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase 1
total genus 121
structure length 324
sequence length 334
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.98.2: Glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme-F420).
pdb deposition date 2016-09-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00296 Bac_luciferase Luciferase-like monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.30 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Luciferase-like domain 5lxeA00
1F07A 3B4YA 1NFPA 1RHCA 3RAOA 2I7GA 1NQKA 1EZWA 5DQPA 4US5A 4UWMA 4J2PA 3FGCB 3SDOA 1FVPA 5AECA 1BSLA 3FGCA 4US5D 1M41A 1TVLA 2B81A 1BRLB 1XKJA 1LUCB 1Z69A 1BRLA 1LUCA 1YW1A 3C8NA 3B9NA 5LXEA 3B9OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5C0QA 3WF0A 1FCVA 3CB3A 2QDHA 3WUFA 4EXBA 2ZA3A 4FA3A 2VC6A 2J77A 1PZ2A 3S2JA 3VIIA 4F0LA 2CLMA 4H6RA 4QE1A 1EBHA 3CO4A 4EXAA 5D9MA 2WCGA 4AVOA 1XHGA 4EPKA 3PB0A 4PMYA 1JFXA 3BGAA 3N6QA 3AROA 4US6A 4PMZA 3M5ZA 1E6RA 4IZGA 4DUXA 2E8YA 3ZMRA 1TG7A 3WZ0E 3DHFA 1VKFA 2NZLA 4GIAA 3TTSA 3WQFA 1K9EA 2XVLA 5ABGA 3GNRA 2OG9A 3D3AA 3UA4A 4TXEA 1TMLA 1EPVA 3A4JA 4Y2WA 1V02E 3E12A 3TAKA 1XLHA 2OGJA 2EBNA 4IJBA 1X1NA 2ISSA 5TF0A 5EU9A 2VFDA 3KCJA 3NZ1A 4TR9A 4O50A 3OLEA 1TREA 1SZRA 1XH2A 3R4IA 5C7VA 1OD0A 3N4EA 1X98A 3GU1A 3T0BA 2WSQA 1K8YA 1R7AA 2YCJA 5AKQA 3ZOAA 4Z2HA 1PX4A 1RJPA 1FXPA 4MMWA 1LYXA 3ITOA 3MVIA 4GHRA 2NQJA 3O6YX 4A8LA 2FHFA 1EP3A 4JZ5A 1ZALA 2A1YA 1C93A 2QHAA 4S2CA 3MP3A 3HB9A 5TIMA 3PN8A 2WHJA 1H60A 4JFUA 2G3IA 4LVAA 4ATWA 4AZGA 4YTTA 2LLEA 2QZRA 2AL1A 2EPLX 3E3HA 3QR0A 3S1WA 4R7JA 2HRWA 3DKJA 1PKNA 1TUFA 1YPIA 3R1ZA 1E4IA 4LUSB 5DN1A 4H2HA 2PWHA 3BPWA 1LRQA 1YKWA 3WDJA 3OBAA 3TTQA 4NZCA 5HATA 1BPLB 2ACSA 2OSYA 2FTYA 3FJ4A 3MUY1 4M24A 4JEJA 4EACA 4OVXA 3WYZA 4LUSA 5MKGA 4AEOA 3TNOA 4BWLC 1G4PA 1TZZA 2Z1VA 5HINA 1MRAA 1LRNA 2NV2A 2OX1A 2V9DA 5AC5A 5CGQA 4GNKB 3NQGA 3LTPA 4LY8A 1QBAA 3W0KA 3EMCA 3FK4A 3JW7A 3SGUA 5DXYA 1TV2A 1I2NA 2V6AA 1VIWA 4QDMA 4L9YA 2QF8A 3O6DA 2XGBA 4QAWA 4DZIA 3R89A 4US5A 5JUVA 2INFA 1RXOB 4IGHA 5LA0A 1BSIA 4MPKA 5T9BG 2C13A 1KLYA 5AZ0A 1U33A 2XGIA 1KXVA 3D6NA 3FJLA 1BVZA 1A5SA 3VCNA 3KVLA 5JMUA 4R5EA 4DJDD 2Q8ZA 4ASTA 2OLSA 4BK9A 2PDFA 4W93A 2WW5A 7ENLA 5A95A 1AG1O 4XWUA 4V2XA 2YXGA 4UMBA 5C71A 3VD3A 3LHWA 3WQOA 3Q37A 4CD6A 1NH6A 3QY7A 3DBPA 3PNUA 2DQXA 4DXKA 4JCLA 3H2EA 3RCYA 3A4XA 4IL2A 4XZIA 2YCIX 4QEEA 5LIWX 3BQ5A 3T55A 3KTCA 4Q4OA 1LLZA 4H7ZA 4G9PA 2Y2WA 1FXQA 1PZ1A 3ITTA 1T99A 5D02A 4QITA 3W81A 1XLEA 4F79A 1H7PA 1HFBA 4EAYA 1U22A 2B4GA 3UR2A 4NJJA 3W2MA 1RCXB 3LPFA 3HQ1A 3V5OA 3R5EA 4PCTA 3ANYA 5CZTA 1ZBVA 3BWWA 4AZ7A 4ECLA 4KFPA 4Z0JA 1OFAA 1WZAA 4M7TA 2Z29A 1OCBA 3IK4A 4IIBA 3SQMA 1Q6EA 2QJIA 3GHRA 3CC1A 2TYSA 2WO5A 1V6XA 2NW0A 5LYRA 1VPXA 1U5HA 1X8FA 1OABA 3RG6A 3KL5A 1X7IA 3BURA 3ARZA 4AYGA 1JDFA 3F1QA 1RAKA 3VNJA 4LAMA 2D2OA 1OCQA 1TPFA 4LC8A 1EP1A 1KM0A 7TIMA 2YL5A 3NQ7A 1W54A 1YRRA 1YMYA 3M41A 3TR9A 1H11A 4DO4A 3PTQA 1H51A 2X42A 4MPQA 3U4FA 4A29A 3W9ZA 1B9BA 4AX7A 1GVYA 3SZ8A 2YA0A 1YTEA 3VD4A 1TV3A 1RQEA 4HSNA 3KRSA 1QI5A 4DPQA 4JXCA 3LLXA 3NNTA 2OT1A 4IGSA 2WJDA 3UXLA 3QY8A 4KRUA 3QBUA 4QJ5B 3KOWA 1QOQA 1CIUA 2QUUA 3IJLA 3OG3A 1IT7A 3VIGA 4O18A 4R34A 1E3ZA 3WLIA 3I6TA 4DJDA 4UBPC 3B0UX 1R5YA 3MUZ1 3SUSA 5M3WA 2VC7A 4W85A 1QO5A 3L4VA 3ARTA 1JPDX 4F0RA 3N29A 1B30A 1FQ0A 1MW2A 1HJQA 2Z27A 4C6JA 3N9RA 5CG0A 2QV5A 2XM2A 4J3ZA 4F48A 5CAHA 4YCPA 1Z9AA 3KVKA 1VS1A 4XQ6A 1W8GA 3G6LA 2GSHA 2W92A 2ZADA 5DXXA 2R94A 4NZ5A 3NDOA 3PG8A 4IPLA 4O28A 2VEFA 2CBVA 4WY0B 5KINA 1D8WA 5BU9A 3MYPA 1JNEA 4HKPA 4IPNB 4P2VA 4YHEA 4FAMA 2PF8A 5CPTA 1ITQA 3PAOA 4LYRA 4QNWA 3KRUA 1CI1A 2XH2A 3B9EA 1UBSA 2YW3A 3MJYA 3GFYA 4WY0A 2RAGA 1DWGM 4WK9A 3GBEA 1XUZA 4FNRA 1UKTA 2C1HA 3EX4A 3A5VA 3N3MA 3OVGA 4L6DA 1YE4A 4HPHA 3G1SA 2OR2A 1OK6A 2PDQA 1TPH1 1H62A 1RHCA 3GVVA 4S3FA 3E0FA 2HNEA 1M03A 4JFTA 3IVSA 1H5VA 1UHVA 4QDPA 3W00A 2WVVB 3UD6A 1DXIA 1ZRQA 3QHMA 5HUPA 4JTKA 2NLYA 3WH6A 4GI4A 4MKVA 1TV4A 3FFSA 4PEKA 5CPNA 4WUIA 1XLMA 4OECA 5EL1A 3TEVA 2VZTA 3TR2A 2Q02A 2FJKA 7ODCA 2EGZA 1XBXA 5EBUA 1ZBWA 3KP0A 2G4FA 1J6PA 2WVVA 3ABZA 3AAMA 1RA5A 4XV0A 5I78A 5CEWA 4C7GA 2WANA 3TJXA 1WUFA 4LTSA 4ZL1A 3C61A 3BLEA 2R14A 4AAJA 3F4VA 2R8WA 1YNYA 1MDLA 4GKTA 3IIOA 4FLOA 4V33A 2ZDSA 4MWAC 3QJAA 2X7WA 2E1DA 4JIPA 5K2ZA 2VCBA 1U1HA 4FX7A 4PB5A 2WBGA 2VX5A 3B9NA 5HNNA 1G01A 4TMBA 3KOFA 2E6FA 3SN4A 5HQLA 3WNMA 3HQNA 2HVMA 3O16A 1NQ6A 1R47A 5DY2A 3AHYA 1V5XA 4JIEA 1ICQA 3OJGA 3H7UA 1UQZA 1WOBA 1H4PA 1PB0A 5D04C 1DWAM 3FLUA 2NQLA 2XTKA 2NXHA 4NNAA 3T09A 4G7FA 4LC6A 4QLJA 4IIFA 1XI3A 4WSKA 1IQ8A 5FJJA 3CASA 1DHPA 3SRFA 2CWXA 2OZTA 2OYKA 1A53A 1I75A 3BV7A 4HCLA 4PFHA 4LVBA 2W66A 1QPKA 3WF1A 4ES4A 3VE7A 1VH7A 3SCSA 3WG6A 1FHDA 5IOBA 3OHIA 2DW7A 1PE1A 1BQCA 4CQBA 5BXRA 1O68A 1W56A 1J5TA 2PE4A 8A3HA 4Y9OA 3O6CA 1QK0A 1YPFA 3MKCA 5I3IA 1W2VA 1ZJBA 2XVNA 1QOXA 3NL2A 3UY7A 5LZLA 3WNPA 3OQ8A 1DYSA 1HGYA 1BKSA 2HTMA 3G1VA 1CGXA 4LYPA 3ZR4A 3VILA 5E70A 4Z2JA 1LRTA 3T0TA 3UT0A 1UD4A 4Z2IA 1PYFA 8XIMA 1XRSA 3TFCA 1U1JA 3DIPA 1O66A 2Z24A 4WDTA 1UPMB 2F84A 3HM7A 4KEMA 4M1RA 2G37A 4J40A 3ZS4A 4XD5A 1GVIA 3G3MA 2BGSA 3NXLA 1SJDA 2ZVIA 1JXJA 1WCGA 2VFGA 2FMOA 2WC4A 4AHOA 3G3DA 3O15A 2QDDA 4HNUA 1U1UA 3OGSA 5B7ZA 2XVGA 5HQEA 1K7XA 5DRCA 4R3UA 4M80A 3W72A 5CSRA 3ABXA 4QM1A 5ABEA 2PA6A 3TE9A 4AH7A 1LUCB 2HWGA 4CD7A 4UTWA 3R43A 1OHLA 1WZLA 4TUFA 3AMKA 4S3AA 1BHGA 3K5XA 3VGEA 1XLDA 4M7SA 1K4GA 3HPFA 1H0GA 3I6RA 3HTWA 1HNYA 3L23A 2EPHA 4LYQA 4GY7A 4F0MA 3EX3A 5E1QA 3R79A 4M81A 2VR2A 5BWFA 1M7JA 2VVNA 1E1EA 3UXKA 1LUCA 3UBPC 3TU9A 2DZUA 1F6YA 4RW3A 2CU0A 3GO2A 3RO8A 3B9DA 2H3BA 1XIMA 4OOZA 1KTNA 2BODX 2YBUA 3G18A 4E8DA 5DMMA 3S5ZA 4DZ5A 1VEPA 1MEHA 2ZXDA 2Z4GA 4NU7A 5LXXA 1TR1A 3DDMA 4I7UA 3LG3A 1UA7A 4H9VA 3DGBA 3BAXA 2BGQA 4Q4QA 3W26A 7CGTA 5C55A 1ZAJA 3KUMA 4PB3A 1H0IA 2J78A 3WNNA 4HA1A 1R3WA 2R6OA 3ITCA 1XQLA 3T0CA 2X8RA 4K1WA 1RA0A 4NZFA 2F6KA 4B5WA 4NUWA 4HT3A 5C2CA 1KTCA 3WF4A 1N82A 1FWIC 1E5JA 2V5KA 1YEYA 3SCOA 1HO4A 1PUDA 5LNSA 4IMAA 2QCLA 3RK8A 2IS7A 3VIPA 2HS8A 5H8UA 2KAUC 2X1UA 1KFKA 4JX6A 1C7SA 4KT2A 3W6MA 4GYPA 3APGA 3F5JA 3PUDA 3K4DA 2HISA 4PCPA 3GG1A 4AD2A 1XLLA 1X1OA 4Y90A 4GI9A 1J2BA 4GZJA 3STGA 3B0VC 1FWEC 3BGGA 4MF4A 4H01A 1VFOA 3URNA 4AZBA 2L5HA 3RM8A 5FESA 4PUDA 1UZHA 1ADOA 4HK6A 1V3KA 4W8LA 5HR7A 3TWAA 2C15A 3GIQA 3V1PA 6XIMA 1JCTA 2J9ZA 1UH4A 1PWMA 3DFHA 1V3IA 3G6MA 3UERA 1KCZA 1K9FA 4GO8A 2V5JA 1JL8A 1O1ZA 1KFEA 2HVNA 3DERA 4F0HA 3P8IA 4G2DA 1GEHA 3UXAA 2DIJA 3WLJA 1VRDA 4KETA 2R1KA 1HKMA 3NL3A 1WDRA 3BAWA 3PPGA 1I9CB 3VKAA 3LOTA 1XYFA 3PPCA 2AKMA 4MB5A 3VIOA 4Q8OA 2YIHA 3CGTA 4YIWA 4AZHA 1E0TA 4XBKA 4EF9A 1W5PA 5AECA 2YDRA 4HMCA 2VR5A 1W17A 3RLHA 4CVWA 4PCNA 1WAWA 1TB3A 5FJIA 1ISXA 4QP0A 1AZ1A 5HQMA 2E6AA 4XTIA 3RIKA 2A3CA 4E2DA 3OVQA 2BP1A 2J8GA 2Y6ZA 4UFMA 3L65A 3HURA 4F66A 1EEXA 4L7ZA 4UB9A 1HL2A 1OCJA 3OOQA 3WDIA 1JPMA 4S3EA 2Z6IA 5AC6A 1EXBA 1A5NC 4XISA 3CAKA 3WL1A 1OGSA 4INFA 2O92A 4WSHA 4XBSA 3TK7A 1ONEA 1A50A 3WLNA 3O8AA 4RDWA 2XFFA 1FFRA 3C3NA 2YDSA 3F4DA 5LGZA 3AHVA 3ZR5A 1V6WA 2V5DA 3DG7A 2P8BA 4CUCA 3UJSA 4UFHA 4MY1A 3WNKA 4D72A 5M5DA 2V81A 3A3HA 3DFSA 3UYIA 3P62A 3ZIZA 4AZCB 4DEFA 2ZICA 1I8JA 2BOGX 5AHFA 1M7XA 5D9OA 2PWDA 3M0LA 3SFWA 6REQB 3DC8A 3CQJA 5LHEA 5BMWA 5IFPA 4GQBA 3PUEA 1XFBA 3QY6A 4NAFB 3THQA 5EPDA 1KW1A 1DWIM 4XB3A 1G9HA 3ATZA 4AZCA 3P5YA 1BF6A 3NSXA 5H2ZA 2PBOA 1B31A 1VEMA 5CSYA 5KETA 6REQA 3RJXA 3BAYA 4JIHA 1NOWA 2V2DA 4NAFA 1T0OA 1M04A 2QDGA 3CO8A 2VJXA 4R7OA 2H3DA 3N25A 5CPQA 4FI4A 2PBGA 3BJTA 1RVGA 2DVUA 2WKJA 2QS8A 2V3GA 3DUGA 2VGBA 3GG0A 1E4LA 4L4PA 3N2CA 3W1LA 4AISA 2B81A 3RX3A 3LGDA 4XO6A 2E7FA 4H6EA 5JQ9A 1TJ1A 1CNVA 1JNDA 4AWEA 4UTUA 1NQKA 4GPNA 3CB8A 2WVSA 4JFVA 2V2CA 4JICA 1UMLA 4RNIA 2JBMA 3NG3A 3TZFA 1US2A 4HTBA 4L6HA 3WJYA 2XIIA 4LX4A 3AIRA 1A0CA 1TPWA 2FH8A 4RZ4A 3M0ZA 4OV4A 2OO6A 3SY5A 4ZE4A 4EANA 3N2XA 1L6FA 1UKOA 3R2GA 3KS5A 1EEPA 1EDGA 3A5FA 3W71A 2CZVA 2G0WA 4S38A 3W86A 4D9PA 3EAUA 1W8SA 2BZNA 2Y7FA 1UWQA 1J6OA 2PODA 4IFKA 1G1YA 4KERA 4X61A 3B97A 4LS1A 3WFAA 1GQKA 5CH9A 4HOWA 1EIXA 2A2IA 3ELFA 3EDEA 3MU7A 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