1I45A

Yeast triosephosphate isomerase (mutant)
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
247
structure length
246
Chain Sequence
ARTFFVGGNFKLNGSKQSIKEIVERLNTASIPENVEVVICPPATYLDYSVSLVKKPQVTVGAQNAYLKASGAFTGENSVDQIKDVGAKYVILGHSERRSYFHEDDKFIADKTKFALGQGVGVILCIGETLEEKKAGKTLDVVERQLNAVLEEVKDFTNVVVAYEPVAIGTGLAATPEDAQDIHASIRKFLASKLGDKAASELRILYGGSANGSNAVTFKDKADVDGFLVGGASLKPEFVDIINSRN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Solution-state NMR investigations of triosephosphate isomerase active site loop motion: ligand release in relation to active site loop dynamics.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
total genus 86
structure length 246
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2001-02-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1i45A00
4M6QA 1KBJA 3TMQA 3W7IA 4AF0B 4JTLA 1W8SA 4JEQA 5AC7A 1FWNA 4HSNA 4DPPA 1OFDA 5D05A 3LXBA 3NM1A 1KLZA 4O1BA 1LORA 5SWUA 1YPFA 1JCXA 3P74A 1O94A 3TC6A 4QIUA 1H7XA 4MZ1A 3WJWA 1PIIA 2ZDRA 1H50A 3LHWA 4LV4A 1R2TA 1MSSA 4JTFA 4CLMA 3GNNA 2OT0A 4UMBA 2O7QA 2QDGA 1OF8A 4UNLA 3O16A 2Y7GA 3W7OA 1WV2A 1PHWA 1LRTA 4RLIA 5AYYA 1VLIA 1LYXA 1H1ZA 4KFNA 5G2WA 3RLUA 1ICSA 3KRSA 5C6MA 3EX3A 1I2PA 3OA3A 2FQIA 4W9TA 3B8DA 1FCQA 2WJZA 2B7NA 3LERA 2I9EA 4PC8A 1XDMA 1JCJA 3SSJA 3FJLA 4E2BA 3CT7A 4O13A 3IEBA 1YXYA 3O6DA 1C8VA 1VC4A 4U28A 2Z1BA 5I3JA 2NLIA 1UASA 4ZZ9A 1K02A 2CLIA 2ZRZA 3HF3A 4FXRA 3GIYA 5LSMA 4FNPA 4MZYA 4PL2A 3NR0A 2LLEA 3SECA 3GDKA 3EWBX 2VKZG 2DORA 4MY8A 2OZ0A 3WJZA 5U4NA 2CLMA 1GG0A 4XKYB 1KM5A 5F2GA 4AWTA 4I7UA 4O0KA 3PUDA 2QAFA 5AOUA 4O4VA 2VEIA 2X1UA 1TPC1 1WX0A 2NUYA 1AW2A 3G1DA 3DHFA 2E6FA 2J9YA 3A22A 1TTPA 2WPBA 1ZHAA 3LOTA 1HO1A 2Y62A 2J6XA 1WDWA 1ZAHA 3B4UA 3TV8A 3AO0A 4IX0A 4MYXA 1KV8A 4XTIA 2QUUA 4NZFA 2ZA2A 1T99A 1LOSA 3EKZA 3ZWTA 2DP3A 5A5WA 1DV7A 1K7XA 3BW4A 5FEXA 1YDOA 2OCZA 4WX2A 1I8JA 4FNQA 4JIQA 1F74A 4LRSA 2TSYA 4JDBA 2QCGA 1YLVA 5A8GA 4HNNA 3T40A 3GB6A 1F5ZA 3NQCA 1VLWA 2JBMA 3TROA 4MVAA 3ABRA 1F05A 1K7FA 4XQ6A 4R34A 3W1NA 3HB9A 4HSOA 3NL6A 3EX2A 3SFKA 2ISSA 4JTEA 2H8XA 2X16A 3Q94A 1Q45A 3W86A 5D30A 3USBA 3SGUA 2YW3A 4AHQA 3G0UA 3NQAA 1V5XA 5LKYA 4DPQA 3L21A 3NQ6A 3QSTA 4Z1DA 3IGSA 2W0UA 2J9ZA 2J88A 3E9AA 3NM3A 4KFPA 3W1QA 3IVTA 3UWQA 3IRDA 1RD5A 3UWVA 1YTKA 4OBTA 3RF9A 3M47A 4GUGA 1FWTA 3EWUA 4BI6A 1KM0A 3VNDA 1JUBA 2NV2A 4ZQRA 4JDYA 3SI9A 4DBDA 3LXCA 3PB2A 2OX1A 2EPHA 2GVJA 5F4XA 1K8ZA 1PV8A 2RH9A 1MXSA 4M6PA 4LT9A 3TJLA 5LNUA 1JQVA 1LRNA 2GJLA 3O1NA 3Q2DA 3HPZA 3WJXA 5LNVA 3EXSA 1DHPA 4FNRA 3MI6A 1QCWA 3LHUA 5HINA 2DZWA 2VC6A 4CCEA 3FYPA 4K37A 4JXCA 4JTKA 5D2XA 3SW6A 5F4WA 2XN2A 3TSDA 1QPRA 3C52A 3IIZA 5ABTA 4IJBA 1G7VA 1PS9A 1TV5A 1K3UA 4UTHA 4H4IA 1M7OA 1SO4A 5FF4A 3TIMA 1H61A 2NXHA 3W73A 1TQXA 2RFGA 3W1TA 5AHMA 1SFLA 3UWUA 5TQLA 1FWSA 3W23A 3W1MA 1BKSA 2OT1A 4N9DA 3WK1A 3N9SA 1T8XA 4MOZA 3TH6A 3W1RA 2Y7FA 1S5TA 4MKNA 3G3MA 4ADTA 1QDSA 2BWGA 4H6KA 4N02A 2VEKA 4JICA 3MBDA 3P8JA 1IGSA 3R13A 1GTEA 1RQEA 1LM1A 1OX4B 3G3DA 1SSDA 4WY0B 3HOJA 3S1VA 2G5WA 5G1YA 5AHNA 4NJJA 4MJMA 1X7FA 1EP3A 1QPOA 2ZRWA 1MEIA 4I7WA 2H8ZA 1ZENA 2Z0IA 4BK9A 1FDYA 4JIPA 3CWNA 3FEMA 1NF0A 3W6YA 3B06A 1QOPA 3N19B 5CZSA 1Q6LA 3PBYA 3M6YA 1W5QA 3H54A 1SW0A 2PRHA 1W3TA 1GWJA 4O57A 3JR2A 1P0NA 5HQEA 4BI7A 3S5NA 1DBTA 3ANYA 2C1HA 2ZYFA 1M5WA 4UTIA 3OVQA 3G1XA 4GJ1A 2QCFA 2R14A 1JCYA 5FF0A 1VH7A 4S1FA 2YFNA 1EUNA 2DJXA 4ONVA 1DL3A 4UMCA 2PC4A 3FJ6A 1YXDA 2HTMA 5FF3A 3TU9A 1G6CA 4WZHA 2X1RA 4AWUA 3NO5A 4RV8A 3NQFA 4QSHA 2NWSA 3N3MA 4M5PA 3TW6A 2BLEA 4FX8A 3M9YA 3T44A 3C3NA 5EMUA 2NUXA 3N73A 5DXYA 2CZDA 1GVRA 2GQ9A 2GVGA 3E12A 2QF7A 1WOBA 2ZZ5A 3W2UA 3TR2A 5IM51 2QCEA 2CZEA 4EOUA 3TE9A 4JYDA 4GFSA 1O5XA 1VZWA 4N4PA 4OV9A 2VFHA 2ZRYA 1VYPX 1MZHA 3I68A 1GEQA 1HO4A 1Z48A 4ICNA 1FXQA 1ME7A 1N8FA 1NFBA 2V9DA 3IV3A 4KWVA 4JD4A 4J9JA 3TSBA 4GXMA 2YFOA 4FNSA 3TNOA 5EYWA 5D03A 3I7SA 4LVAA 3THAA 1H7RA 1S5VA 1TPH1 4XUGA 1KFEA 2YYTA 1ZCOA 3DZ1A 4PTNA 3DENA 3PSWA 3PSVA 1AW5A 2ZTKA 3G0XA 4K6AA 3LCWA 4N6EA 2ZRXA 4ORMA 3L5MA 3QC3A 3W9ZA 3O6CA 4HT3A 3GDRA 2WSRA 1GZGA 1WXJA 3QRHA 4OU1A 3MP4A 5BMWA 2JKAA 1T96A 1XBZA 1Z41A 4O17A 5K2ZA 2FB3A 4LS2A 5C2XA 4HNVA 4Z1AA 2OJPA 2NX9A 5FEZA 3TAKA 1W37A 3FIGA 1DJNA 2ISWA 3LHZA 5DXXA 2QCLA 1L6WA 3B03A 3W7GA 2ZZ2A 5CZ0A 5F2IA 3SZ8A 3ELFA 1X1OA 3FA5A 3PAJA 3STEA 4O19A 2B4GA 3BG3A 4OHQA 3A23A 3QJAA 1AL7A 1OX6A 4N9EA 3KVMA 1GVFA 4LTSA 3OG3A 1OK4A 3PUEA 2A7RA 3FKRA 1B4KA 4HN4A 2WKJA 3ZS4A 4O14A 3VKJA 3W7PA 2TRSA 5HJLA 4BWLA 3TQ0A 1T0OA 4C1LA 4DF2A 4PFMA 3LTSA 4RXGA 3THQA 4LRTA 5CSRA 2E68A 3I6RA 3ABQA 1FCUA 1EP2A 2ZRUA 3QMRA 4LVGA 3M41A 3EWYA 1GYNA 1U5JA 3M43A 4ZQNA 5TIMA 1PCWA 4LY8A 3T4CA 1SO5A 3G1YA 4KFOA 2YXGA 1M6JA 1OABA 3QQ0A 1OK6A 1DORA 3W2LA 2YZRA 5K4ZA 1OFBA 2F84A 5LHFA 3PC0A 4B5NA 3BO9A 4R7JA 1AW1A 3MYOA 4M7SA 1LRQA 2NX1A 3INPA 5FESA 1GJPA 1VRDA 1X1ZA 2C13A 3P8IA 2E5BA 1ZAIA 2E1DA 2CLHA 3IGXA 4LVDA 3R89A 5L6UA 5CGQA 3NL3A 3P5ZA 4JNMA 5L9FA 5FEPA 2NUWA 1SW3A 3OIXA 1LBLA 4BR1A 5AFDA 1R46A 1UBSA 3NYZA 2X1SA 1F7BA 3EXTA 3U6WA 2DZTA 3QSRA 3W3OA 4DBEA 2C19A 4RK8A 2ZQ0A 1P5BA 3UZ5A 5DBUA 3LRLA 1F2JA 2A21A 4AVFA 3C2VA 3MI3A 1OYBA 1TV7A 1FWWA 2R8WA 3O63A 3LCXA 3N14A 1GG1A 4RR4A 4UUIA 3MYPA 1QR7A 2FPTA 1JRBA 3CWOX 3CIXA 3B0VC 4ORIA 3M5XA 3M16A 3QFEA 1WYIA 1XKYA 3KRZA 3UQNA 3TFCA 3HGJA 4N9CA 1ZALA 3GK0A 1XFBA 5AHEA 4LV9A 3W7NA 5I3GA 4YL2A 3BARA 2YPIA 2QUVA 3PR2A 3ZFHA 3HMJG 1A53A 5H2ZA 5LGZA 2DZPA 1LP6A 5DCDA 2ALDA 2C6QA 1H7WA 5EL1A 1M7PA 3JRKA 1E51A 3VCRA 3W1LA 2QCHA 4O53A 4Q4KA 1I2RA 1X6UA 1TTQA 3W71A 3QW4B 5BRBA 1IIGA 1Q6QA 3Q58A 5D2TA 5D2VA 5C54A 1B9BA 3G8EA 3NNTA 5D02A 4MFDA 4NNBA 4O50A 3W7LA 3P61A 3BV4A 1IXQA 2NXGA 4GUFA 3DXIA 3KVJA 2WNNA 3GKFA 3TXVA 3FS2A 3L0KA 4GWEA 4PL1A 3GXTA 1L2UA 1H51A 1B4EA 1VHNA 3F03K 3LLDA 4JY8A 4Q32A 4P61A 3DKLA 3BPWA 3LRMA 3MP5A 5AYXA 2WO5A 5I3FA 4IXHA 5EPDA 3GXPA 3WK0A 3RMJA 3T55A 1OJXA 5AC8A 3MHGA 1NF7A 1EUAA 4X9SA 1TCDA 4TU1A 1TQJA 3C61A 1KM4A 3PG8A 2I14A 1W1ZA 4IGHA 4WOZA 1GQNA 1DJQA 4FHAA 1KFLA 1QFEA 2I1OA 5KMYA 4O1DA 3CU2A 3KAOA 1YYAA 1KTNA 2QKFA 4H3DA 4NJGA 4TX9A 1W3NA 4DF0A 2VXNA 3O07A 1LDCA 5DY3A 3PWAA 2CLEA 1GPWA 1A5BA 4HPJA 4JTJA 3LX9A 3OVRA 2GQAA 3BLEA 1YDVA 1TJRA 1V7YA 4M19A 1AMKA 1K03A 1IIHA 4FNUA 2W6RA 3LHYA 3NQMA 5KZDA 1UUOA 2AGKA 3LV5A 4Y8FA 2ZZ7A 2QCCA 3HQ1A 1ICQA 4LUIA 1GOXA 4K7YA 4O54A 4XZ9A 3GDMA 3W7JA 5LGXA 3G1AA 4XTDA 4O1CA 1H62A 4A21A 1UJPA 5D38A 4PEKA 2Z2UA 3W2MA 5AYZA 4DXVA 3W22A 3TQVA 4LOCA 5LZLA 1R47A 5HULA 3TXZA 3EWZA 3RFAA 4MY1A 2HSAA 3S5YA 2C0AA 3VI2A 2QAPA 2O7SA 4N2YA 2X2GA 3MHUA 4IPJA 3FFSA 2YYUA 3DH7A 1DVJA 2PRMA 4GRSA 3U8GA 3GVGA 2NXIA 1D9EA 1JCMP 3DFTA 4LC6A 4QAIA 5T26A 3S42A 3E96A 5CPMA 2NV1A 2Z6IA 4KWWA 4DO6A 3P62A 1Z42A 3S5ZA 3WJSA 3OBKA 1YTDA 2JGQA 4PCFA 1XL9A 3FOKA 2A0NA 4BF9A 3CHVA 1YDNA 3PF3A 1P1XA 3QZEA 4OWGA 2W79A 3O15A 4UTLA 3S0CA 2JGYA 4LC8A 1EA0A 3DI0A 2JKPA 2H6RA 2WSQA 3P81A 1ML1A 1RPXA 1SZEA 3UNDA 4Z0JA 3LGEA 1JUEA 3QEZA 3WFAA 4E2DA 3M5YA 1GVQA 4MZ8A 3IIPA 1S5WA 4RZ6A 4UMAA 4ADSA 3LCLA 3UPWA 2J27A 2V81A 4IMCA 1PL9A 3O06A 1K7EA 3STCA 3PG9A 2G95A 4KKXA 4LUJA 4MJZA 4JTTA 1BWKA 1XM3A 4AH7A 4BWLC 3EX6A 5AN7A 2A7NA 3A24A 3KXQA 4R53A 4LVBA 1TJPA 1VQTA 2H3DA 3TA6A 5AHIA 1NEYA 2CFFA 4CQ9A 5HR6A 2CLLA 3AJXA 3SIZA 4X22A 2ABBA 4EWND 1UUMA 1WA3A 4UTUA 5DLCA 3W72A 3G1FA 1H7PA 4MLRA 3LXAA 3UXDA 4DO5A 4NXKA 3CTLA 5DY2A 3GAKA 4ZQCA 1UCWA 5D37A 5CPOA 4MIMA 3V75A 3FKKA 4K7VA 5F2LA 5D2YA 1J4EA 1QMLA 4FF7A 3R12A 3D0CA 5G4WA 4AMAA 1A5AA 4LW7A 5HUOA 4MPQA 1F73A 2E6DA 4E0CA 2CLKA 4ZQOA 4ML9A 4YCOA 5K9CA 3SR7A 5F4SA 2FPYA 1TREA 2VOMA 3NDOA 5K7JA 4GUJA 1TPWA 3LCFA 2BSLA 1I2NA 2G97A 3S9YA 1KFBA 1JQXA 4NX5A 3WK3A 4AHPA 3W85A 4YWIA 2YCEA 4AB4A 1KTBA 1X8FA 4WY0F 4HIBA 3W1UA 5DCEA 1TYGA 1VGAA 5F1VA 5FI8A 2DJLA 3TKFA 4LU0A 1THFD 5F2MA 4WD0A 2CZFA 1D3HA 3CLMA 1HG3A 4O12A 2Q8LA 2QEZA 5KSWA 1TPEA 3UY8A 1OFEA 2EHHA 3NPUA 5I3HA 2QCDA 1G4PA 1TB3A 1SO6A 2GUUA 2GPTA 1FDJA 4JTUA 3C2FA 4Z1CA 2WOQA 1OG0A 3MWAA 4UR7A 5K9DA 2HS6A 3C4UA 3C8FA 1W5PA 3MMTA 3CC1A 3MW7A 1FDZA 3OEXA 3PUOA 1J2WA 2AAMA 2VELA 2QUTA 4AXKA 3RU6A 1ME9A 3GDLA 3NL5A 4XWUA 4K36A 4BI5A 3IIXA 4NUWA 4LS0A 1OF6A 1TPFA 3MI2A 3IVSA 1VCVA 3W7QA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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