4W7UA

Crystal structure of xaccel5a in the native form
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
HMLKYVGVNLSGAEFNSRKKPGTLFKDYTYPAASDFSYFAGKGMNTIRLPFLWERVQPELNGPLDQAQLGLIKKSLEAAKANKQYLILDLHNYATYSGKRIGTSDVPAGALADLWRRLALEFKDDKAVIFGLMNEPNGISAPDWANAAQGTITAIRKTGAKNLILVPGTAYTGAHSWRSTSYGVSNAKALEILKDPGNNLAFEAHQYLDKDYSGTKPVCTSDSVGQEKLQGFTSWLRENKQKGFLGEFATANNPVCDKALEGMLTYMEKNSDVWLGWTWWAAGAWWKPDYPFTVQPGKDGSDKPQMAILSKYA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
publication title Crystal structure of XacCel5A in the native form
rcsb
molecule keywords Cellulase
total genus 122
structure length 313
sequence length 313
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w7uA00
2XGBA 4M24A 1CXIA 1L8NA 3GXMA 1ZBVA 4CD7A 2EPLX 3PN8A 3SUVA 2WWCA 3AIUA 3CUIA 4UQDA 4GIAA 3B8SA 1GOMA 4AEEA 2J77A 4DM1A 1OT1A 1LWJA 1W3JA 3W26A 1V02A 3MV11 5D8ZA 1ODUA 1H0GA 4PMDA 2CCRA 1E73M 1CGVA 1Q6FA 4J3XA 3F5JA 4FK9A 3AROA 1BYDA 1M7XA 4UR9A 1HX0A 4W93A 3WFLA 2FGZA 1HVXA 1I1XA 5FKYA 2VTFA 1W3LA 1JYWA 4MNKA 4MNLA 2ZUNA 1H2JA 3UG5A 1WDSA 1W91A 1S46A 2IXVA 1LF1A 2WLYA 4PUEA 1UD2A 4WKHA 5CJ5A 3W82A 3W81A 2PBOA 2DSUA 3WELA 3AMDA 1KXQA 2WZIA 3ZJ8A 1JG9A 1DWGM 3WEMA 4CUCA 1UWIA 3WNNA 1GHRA 4Q7NA 1WAWA 5LA2A 4Z2LA 4PSRA 4UFLA 4HPGA 3U7VA 4UCFA 2X2YA 4NSBA 3EDFA 5D9NA 4C7FA 4JCLA 3ARSA 1V0MA 3WKZA 5GNZA 1JL8A 3N9KA 2DT3A 4PSPA 1JAEA 3G6LA 2WC4A 5D9PA 1HXJA 2VT0A 4HU0A 5ABGA 2EXOA 1JI2A 5A6LA 3GBDA 3S2CA 4F79A 2XWDA 3DYMA 1QW8A 2ZUSA 3CZEA 1SR0A 4J3UA 5A2BA 4AZBA 3WD3A 3MMWA 4MNJA 2YL5A 5IFPA 2VJXA 3SUWA 1UR2A 1TCMA 4W87A 3U5UA 4MADA 1LG1A 2WCAA 1GQIA 3A4AA 2BHYA 3T09A 4PMOA 1CLXA 2Y8KA 4DM2A 2X05A 1NQ6A 1UWTA 1XSKA 3UR7A 2DSWA 4LYRA 1MXDA 3WNPA 1OB0A 1CYGA 1GUVA 1V0KA 3IAQA 2Y24A 4LPCA 1HF6A 1H4PA 3JUGA 4CGTA 4PMRA 2GK1B 4P8UA 4B3KA 4HZ6A 3WH9A 5AYBA 3WF3A 3RDKA 4AZCA 1DWFM 4JCMA 4UFKA 3L2MA 3A4XA 1UWRA 2VRJA 4CD8A 3AOFA 1B90A 4M1RA 1ZL1A 1NOUA 1BG4A 1UKSA 1KGUA 3BCFA 3POCA 1E15A 3FAWA 1H3GA 4E8CA 2F2HA 3APGA 4MB4A 3AYSA 1TVNA 9CGTA 4M56A 1OT2A 1EIBA 1GJUA 1GQJA 3VDAA 1AMYA 1H41A 1LL4A 5A8QA 4WKAA 3PZUA 3BMWA 2TAAA 3WF2A 1ZBWA 3UESA 4UNIA 1Q6EA 3ZJKA 1EO5A 3VIJA 4AD2A 4EAMA 2WANA 2J7CA 4XZWA 3SCSA 2VC9A 4ZXLA 2WMIB 2CBJA 4A4AA 2CETA 1B3WA 5I24A 1CIUA 1K6AA 1UH4A 4X0VA 1A3HA 4X0NA 3IK2A 1GQLA 3PZMA 1C8XA 2VMFA 5CSYA 2E8YA 2ZX9A 3VIIA 5HOSA 1V3MA 4GQQA 5E9AA 4ZE4A 3OGVA 3ZT5A 3IANA 2HISA 2W62A 4AZ7A 3T0BA 1CPUA 1JD7A 2D1ZA 1MQQA 1VB9A 2Y4SA 1VFFA 4TTGA 4Z2GA 4ACZB 4U2ZA 4AXNA 5BCAA 1JYXA 5CPQA 1E4NA 4KGLA 2FH6A 1KFWA 3AS0A 1CXFA 1C8QA 3AZSA 3SCVA 2BXZA 4Z2HA 1UWQA 2BVDA 2VUYA 3THCA 3MV01 3WUGA 3SUSA 7A3HA 5A8NA 1HKMA 1H1NA 1C8YA 2VX7A 3AIEA 1US3A 3FXYA 2F61A 5DO8A 3BAJA 1W9PA 1V03A 4GINA 4UQEA 3VDBA 5AC5A 1WZAA 1PEZA 3AIBA 3M46A 3ZT7A 7CGTA 3KWXA 5HPCA 4W7UA 2EPKX 1KR1A 1V6XA 2PWDA 3PZOA 5CPTA 1OD0A 4W5ZA 3SCNA 3WSUA 1E72M 1UWUA 1YQ2A 1CBGA 1UR9A 1VEMA 4HMDA 2FH8A 1CGXA 1C91A 1NM9A 3SCOA 3MMDA 3CUFA 2DDXA 3GNRA 2GFTA 4D71A 4D6CA 3CH9A 1E5NA 1C7TA 1QNPA 5FD0A 1O7AA 1JXJA 3LPPA 4HMCA 3K8KA 4J3TA 4AD1A 1E56A 1WZMA 3CGTA 2JIEA 2BV9A 1W1YA 5DEZA 4Y7EA 4MPKA 2W4XA 2D3NA 2JALA 1PAMA 1E43A 3WDPP 4FLOA 2BXYA 3UG3A 2J7GA 4OBSA 4LQ1A 1OIMA 3NSXA 1XCWA 2XVGA 1QBBA 4PTWA 4AD0A 2YL6A 2BHUA 3WQ8A 3QHOA 3AI0A 2ZIDA 3VGHA 1GORA 3CZGA 3CZJA 3WD4A 4QP0A 1GOKA 5ABFA 2AAAA 1V3JA 1V02E 5IHSA 2V3DA 1G5AA 3CMJA 2J4GA 4M80A 1OGBA 4QAWA 2BVYA 2DH3A 4HP5A 4W84A 1VRXA 2O9TA 1MQPA 3CUGA 2WB5A 1Q4NX 2VRKA 5A94A 3ECQA 4H04A 2EBNA 2PC8A 2J8GA 3U57A 2DQXA 3AMCA 3W0KA 4WKFA 1I1WA 1U33A 1N82A 3ALFA 1UKQA 2J25A 2G41A 1J12A 1IZKA 3W28A 5FIPA 2UY3A 5BXPA 3WMCA 1F4AA 1BLIA 2IXUA 3VKKA 5HXMA 4PUDA 2AOSA 3EYPA 1IV8A 1EQPA 2W61A 1KCLA 3POHA 3SCQA 1WNOA 4DUWA 4UFJA 1DHKA 4DWSA 2E3ZA 2BY3A 3PZVA 1VFMA 2YA1A 1F4HA 4UQ9A 1M04A 3HJEA 3MUIA 1XYFA 2J47A 4KRTA 3FHQA 4J7RA 3CUHA 4W85A 8CGTA 3MUZ1 4ZE5A 3AXXA 2OYLA 3RM9A 3WUEA 2F8QA 3VX0A 1BPLB 2XM2A 4W8BA 2C8NA 1C93A 1ZBKA 3OLGA 4P7NA 2WCGA 2XVPA 2GSJA 3WL1A 3CPUA 1E4MM 1B9ZA 1GOIA 1QI3A 1JFXA 3M7SA 1CECA 2VCCA 2WHMA 1G0CA 1VEOA 4R5EA 4CN6A 1ZB5A 4UOZA 1CGWA 4C7DA 3EMQA 1CXHA 2G3JA 2WZEA 4ZFMA 2E9BA 4GKLA 4W7WA 2GJXB 2A3AA 2D0GA 1CEOA 1TA3A 5JBFA 2YOCA 3AIQA 3PTMA 5LA1A 4MB3A 1E5JA 3WH7A 3N12A 4MJ4A 1CXLA 5CLTA 4BQ4A 4M81A 3WUBA 2NW0A 3T2PA 3QHNA 4D6DA 4OOZA 4AIUA 1UR8A 1B3VA 3BH4A 2WVVA 2ZUMA 3QOKA 2FHCA 1E6QM 1JF5A 3NSNA 2YL8A 3GNOA 4RE2A 1HP5A 2O92A 1FFRA 4YN5A 4TUFA 1PBGA 3L4YA 7TAAA 2VO5A 1H5VA 4IPLA 3D5HA 2WMFA 2ZUWA 3EMZA 3DC0A 3L4ZA 1E6PA 2WXDM 1HKKA 1JI1A 4NRSA 4V28A 4U3CA 3UG4A 4EE9A 1E0WA 1HJVA 2CERA 5ECUA 3EDEA 1K9FA 1E6NA 3TOPA 1EGZA 3OG2A 2QF8A 5DT7A 1OGGA 3TTQA 5BROA 2WM0A 1TMQA 2PBGA 2WW5A 4NRRA 4D6EA 4F9JA 3VM7A 4Z2IA 5CZKA 5E0FA 3WN6A 5D8WA 2D2OA 1W2VA 4PTVA 4CU8A 3DYOA 2XJ7A 3ZJ7A 3WD0A 2G3IA 4F8XA 3OLIA 2VZUA 4WJXA 3VD4A 1FOBA 1OWQA 1W32A 3WH5A 4YPJA 3CZ8A 4ZXOA 4KMQA 1B3XA 3N17A 1ITCA 1PX8A 2A3BA 2VQTA 2VZTA 3ARTA 4UFMA 4XZBA 3VOCA 1SYTA 1EOMA 4UTFA 1ITXA 2CKSA 1EA9C 3EBVA 1KQYA 2YA0A 3RMEA 5I0DA 2VX6A 2WVUA 1QPKA 2XVLA 4L4OA 3O2LA 4LYPA 2QMKA 4K68A 5JUVA 3M07A 3T08A 3RJYA 1ISZA 4CCDA 4B9ZA 2W67A 1RD6A 2YKKA 2OWWA 3MUAA 4P8WA 3II1A 5M03A 3CTTA 1DWHM 4IUGA 5A6BA 2WKLA 1CWYA 3WEZA 1HL8A 2ZUVA 4EKJA 1GHSA 3K4DA 1WDPA 4U33A 2CYGA 3ARQA 3MUY1 1LL6A 2WMKA 3A4WA 3OZPA 5EFDA 3MSGA 1JDCA 4D1IA 3L4UA 1DWIM 1BAGA 4IPNB 4AC1X 4V2XA 3ZR6A 5KEZA 4B16A 2D24A 5E6YA 3SIMA 3EDJA 3NDZA 3AZRA 1OGSA 3W4RA 2BY0A 3AMGA 4J3WA 3KL3A 3OGRA 5A3HA 4LXFA 2PWGA 3TA9A 1E6RA 1BYAA 3WMBA 4JIEA 3AS2A 4U31A 2EPMX 1KQZA 4XV0A 4AZHA 4IISA 3BC9A 2VVSA 3MO4A 2RGLA 2X0YA 4TVDA 5EBAA 4CU6A 5GNXA 1ZS2A 4H8UA 3N04A 4V27A 3L2LA 1KWGA 1UUQA 1DP0A 2DH2A 1XV8A 3VX1A 4ZEPA 4BZYA 5IFTA 3UERA 2CPUA 2PWEA 4P7LA 3VDHA 3QOMA 3K8MA 4PMZA 3KZSA 1WDQA 1XC6A 3OB8A 2V3FA 1MW0A 4WSKA 1M53A 4CD4A 1J0KA 1CNVA 1R7OA 2ZX7A 2VNCA 2AMGA 2EJ1A 4OKDA 4AZ6A 4JFSA 1XD1A 4MNMA 1QHOA 3WQWA 5DT5A 2UY2A 3OZOA 3BSGA 1J01A 3WNMA 3GXIA 1UA7A 1ZJBA 5A95A 1VJZA 3UETA 1EHNA 2XFRA 4H41A 1GVIA 2ZUTA 3LPFA 3W6LA 3ARWA 2EO7A 2PB1A 4Q22A 1FH7A 3EDDA 2WHJA 1QI4A 3QHMA 3W6MA 1HJSA 1UR0A 4GO9A 4PRWA 1DWAM 1V6YA 3CHFA 1EDQA 4CN1A 1E40A 1AQHA 4GI6A 1L0PA 4GQRA 1PX3A 3AHXA 3AQUA 4KGJA 2J8FA 2ZWYA 5I78A 1W9VA 2C0HA 4TVCA 3I3DA 1BG9A 5C8BB 5DF0A 1J0YA 4ML4A 4U5KA 3AHYA 4ATDA 4KH2A 1UD5A 1CGTA 1J18A 1E70M 1CLVA 1QNQA 4B3LA 4NI3A 3ZM8A 1CGYA 3OLEA 3W29A 1LLOA 5EB8A 4D72A 4H8HA 2O9PA 2DSKA 5DFAA 1W3HA 3WDHA 1V0NA 1B0IA 1E6XM 2NT0A 3WQ6A 3VIHA 4URIA 4JL1A 1EOKA 2V5CA 3K46A 5BRQA 3ARUA 4AIEA 1C7SA 2X8RA 3GXFA 2YLAA 1Z32X 2YDRA 1XH2A 1M03A 3L4WA 1MXGA 3OIHA 4TOQA 3M6DA 1VEPA 4QLJA 2WSKA 3IJ9A 2JF7A 4AZ5A 2HVMA 5CSUA 3W25A 5JIWA 1HJQA 2G4FA 1J0JA 1H09A 1EQCA 1EO7A 3CMGA 4JKLA 1MW3A 3GXDA 4UZSA 4FMVA 3VILA 1J9YA 3WH6A 4AY1A 1KGXA 1W2PA 4MAZA 2ZE0A 5CGMA 2BHZA 4M82A 4HOWA 3LPGA 3W37A 4A3YA 4AW7A 1YHTA 2J7BA 2BNJA 2WHLA 3B9EA 1KBBA 1UZ4A 1QI5A 1FH8A 4CCCA 1SMAA 4TXEA 1XD0A 5ABEA 2PI6A 4PCTA 5M17A 3AFBA 2FHBA 1LJYA 5M5DA 1UD6A 2CKRA 1WPCA 3QR3A 5A1AA 2YBTA 3LPOA 3VD5A 4BQ5A 1E3XA 1PJ9A 2W63A 4DWSC 5A69A 1GQKA 1X1NA 2WYSA 2X0HA 3VGDA 1IT0A 4PMNA 3VDCA 3L4XA 2WVSA 2PF0A 2YBUA 1MW2A 1NARA 2DPEA 4PTMA 1BGGA 1JZ3A 5E0CA 2BFGA 3IAPA 4ACZA 1GCYA 1V3HA 5ABFB 1PZ2A 3WY1A 1ZBCA 4HOZA 2XIIA 1FA2A 4LX4A 3AYRA 4UQAA 3ZSTA 3TTYA 2Y8VA 4XUYA 6A3HA 2J62A 3BAKA 1XRVA 1I75A 4JZ5A 2VCAA 3ZIZA 1O6IA 4XX6A 1U30A 3VMNA 2BS9A 3J7HA 2A3CA 3MKKA 5HDRA 1GOWA 4JHOA 2ZXAA 4FLSA 3OLDA 2E9MA 2EPOA 2V5DA 4TTUA 4E2OA 3AXIA 2XHYA 3RJXA 1R8LA 3HMCA 3WBAA 1HNYA 1BSIA 2VQUA 4FLRA 3WL0A 3UCQA 1UQZA 1J0ZA 1UH3A 4D6FA 1VBUA 5BXRA 2X1IA 1Y7VA 3VIPA 1NWTA 2UY5A 4BA0A 4RE3A 1RH9A 4P8VA 4DWSB 5A6KA 2D22A 1TUXA 4J28A 1V6VA 2XGIA 2OWCA 1UYQA 4JAWA 2WSPA 4LGXA 3VIOA 2J79A 2XFYA 2B31A 4CD6A 1JYNA 2ZX8A 1EDTA 3RM4A 1BVZA 2QLYA 1FHDA 4ATLA 3ZT6A 2FDMA 5BXSA 3NCOA 1GOOA 3WQ5A 2V3GA 2YJQA 3VMOA 4QDMA 3A47A 1MFUA 5JBDA 1W3KA 3K4AA 1VAHA 1W1TA 1W9DM 1BGAA 3ALGA 1E71M 2ZX5A 1QNSA 3WDJA 1VIWA 1UR4A 4RE4A 1CDGA 4MB5A 5D4YA 3K8LA 1JGIA 4U3AA 3ZSSA 1WB0A 1TA3B 2OWXA 4E4PA 4HZ7A 4B15A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2XGB A;  4M24 A;  1CXI A;  1L8N A;  3GXM A;  1ZBV A;  4CD7 A;  2EPL X;  3PN8 A;  3SUV A;  2WWC A;  3AIU A;  3CUI A;  4UQD A;  4GIA A;  3B8S A;  1GOM A;  4AEE A;  2J77 A;  4DM1 A;  1OT1 A;  1LWJ A;  1W3J A;  3W26 A;  1V02 A;  3MV1 1;  5D8Z A;  1ODU A;  1H0G A;  4PMD A;  2CCR A;  1E73 M;  1CGV A;  1Q6F A;  4J3X A;  3F5J A;  4FK9 A;  3ARO A;  1BYD A;  1M7X A;  4UR9 A;  1HX0 A;  4W93 A;  3WFL A;  2FGZ A;  1HVX A;  1I1X A;  5FKY A;  2VTF A;  1W3L A;  1JYW A;  4MNK A;  4MNL A;  2ZUN A;  1H2J A;  3UG5 A;  1WDS A;  1W91 A;  1S46 A;  2IXV A;  1LF1 A;  2WLY A;  4PUE A;  1UD2 A;  4WKH A;  5CJ5 A;  3W82 A;  3W81 A;  2PBO A;  2DSU A;  3WEL A;  3AMD A;  1KXQ A;  2WZI A;  3ZJ8 A;  1JG9 A;  1DWG M;  3WEM A;  4CUC A;  1UWI A;  3WNN A;  1GHR A;  4Q7N A;  1WAW A;  5LA2 A;  4Z2L A;  4PSR A;  4UFL A;  4HPG A;  3U7V A;  4UCF A;  2X2Y A;  4NSB A;  3EDF A;  5D9N A;  4C7F A;  4JCL A;  3ARS A;  1V0M A;  3WKZ A;  5GNZ A;  1JL8 A;  3N9K A;  2DT3 A;  4PSP A;  1JAE A;  3G6L A;  2WC4 A;  5D9P A;  1HXJ A;  2VT0 A;  4HU0 A;  5ABG A;  2EXO A;  1JI2 A;  5A6L A;  3GBD A;  3S2C A;  4F79 A;  2XWD A;  3DYM A;  1QW8 A;  2ZUS A;  3CZE A;  1SR0 A;  4J3U A;  5A2B A;  4AZB A;  3WD3 A;  3MMW A;  4MNJ A;  2YL5 A;  5IFP A;  2VJX A;  3SUW A;  1UR2 A;  1TCM A;  4W87 A;  3U5U A;  4MAD A;  1LG1 A;  2WCA A;  1GQI A;  3A4A A;  2BHY A;  3T09 A;  4PMO A;  1CLX A;  2Y8K A;  4DM2 A;  2X05 A;  1NQ6 A;  1UWT A;  1XSK A;  3UR7 A;  2DSW A;  4LYR A;  1MXD A;  3WNP A;  1OB0 A;  1CYG A;  1GUV A;  1V0K A;  3IAQ A;  2Y24 A;  4LPC A;  1HF6 A;  1H4P A;  3JUG A;  4CGT A;  4PMR A;  2GK1 B;  4P8U A;  4B3K A;  4HZ6 A;  3WH9 A;  5AYB A;  3WF3 A;  3RDK A;  4AZC A;  1DWF M;  4JCM A;  4UFK A;  3L2M A;  3A4X A;  1UWR A;  2VRJ A;  4CD8 A;  3AOF A;  1B90 A;  4M1R A;  1ZL1 A;  1NOU A;  1BG4 A;  1UKS A;  1KGU A;  3BCF A;  3POC A;  1E15 A;  3FAW A;  1H3G A;  4E8C A;  2F2H A;  3APG A;  4MB4 A;  3AYS A;  1TVN A;  9CGT A;  4M56 A;  1OT2 A;  1EIB A;  1GJU A;  1GQJ A;  3VDA A;  1AMY A;  1H41 A;  1LL4 A;  5A8Q A;  4WKA A;  3PZU A;  3BMW A;  2TAA A;  3WF2 A;  1ZBW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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