4W5ZA

High resolution crystal structure of catalytic domain of chitinase 60 from psychrophilic bacteria moritella marina.
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
323
structure length
323
Chain Sequence
GTITSQDDNVVVGYWHNWCDGRGYQGGNAPCVELKTVNPQYNVVNISFMKVYDIAEGRIPTFKLDPTIALSEAEFIAQIDTLNSQGRSVLIALGGADAHIELTRGDEDALAAEIIRLTDLYGFDGLDIDLEQAAITAKDNQFVIPAALKMVKEHYRKTGDNFMITMAPEFPYLTANGAYTPYLTELDGYYDFINPQFYNQGGDGLWIEGVGWIAQNNDALKEEFIYYIADSLINGTRNYHKIPHDKLVFGLPSNIDAAATGYIQDPQDLYKAFDRLKAQGQPLRGVMTWSVNWDMGTDAANNSYNQQFIKDYGNFIHNQLPPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Vibrio marinus
publication title High resolution crystal structure of catalytic domain of Chitinase 60 from psychrophilic bacteria Moritella marina.
rcsb
molecule keywords Chitinase 60
total genus 126
structure length 323
sequence length 323
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w5zA00
2VQTA 3AMGA 2DH3A 1AQMA 1R7AA 3GNOA 2PBGA 5E6YA 2WLZA 2J8GA 1MW2A 5IHSA 3D5HA 3B8SA 2ZUWA 4W84A 4MJ2A 1IT0A 2BXYA 1WCGA 5A69A 1B3XA 3WD3A 3AOFA 3ARZA 4AC1X 3ZM8A 1XH1A 2DSKA 1QNPA 1C8YA 3UETA 4QP0A 1K9FA 2JIEA 2DQXA 4AXNA 1V0MA 3T08A 2EPKX 1C7TA 1W1YA 2WB5A 1NWTA 5A8MA 1KQZA 2J7CA 2BY2A 1BG9A 3AS1A 4XZBA 5I23A 1DWHM 4W7UA 2O92A 2D22A 2WVSA 2WC4A 3FY1A 3OLDA 2GK1B 1LL6A 1VF8A 2WMIA 3N04A 3VPLA 1MQPA 4LPCA 1VEOA 2G3JA 3K1DA 4P7LA 3WNOA 1JD7A 1V6UA 4W5ZA 4Z2JA 2VJXA 1B0IA 3L2MA 1K9EA 2YJQA 2VURA 1E9LA 2ESCA 4U2YA 1JF5A 1UD6A 1CEOA 4CU7A 3PZQA 1NARA 3AIUA 3N1AA 3RCNA 4FMVA 1ITCA 5D9PA 2WZHA 3O2LA 3UR7A 1TFVA 1U30A 1JDCA 4W89A 3D3AA 4MADA 5IDIA 4NI3A 3UG4A 1JL8A 3RO8A 3OZOA 3ARQA 5AYBA 1XHGA 4Y7EA 3AHXA 5CGMA 3W24A 7TAAA 4F8XA 5IHRA 1MFVA 1H41A 1CDGA 5ABFA 1CXHA 5I78A 3WQ4A 2QPUA 4CKQA 1G01A 3MMDA 5A8OA 3SCNA 3W26A 3PTQA 5A8PA 2X0YA 3L4UA 5BCAA 3N15A 1O6IA 4JHOA 1LG1A 2CCRA 1V3MA 2PWGA 1VFFA 2C8NA 5I77A 3UERA 4ACZB 3GXFA 1ISWA 4AD3A 1U2YA 1CGYA 4B15A 1ZBKA 4UZUA 1W9DM 3L4TA 2JIWA 3VNZA 3BSHA 4XZWA 3T0AA 2W61A 3KWXA 5BXRA 1QBAA 1CXKA 1GUVA 4JFWA 3AS3A 3BCDA 3WH5A 5A3HA 2YIHA 3AFBA 3WNNA 1RP9A 4HA4A 5CZKA 1CWYA 1BVZA 4DWSD 5M17A 5HXMA 1WE5A 1VENA 1E3ZA 3N18A 4LQ1A 3O6AA 1D2KA 2VQUA 3PZUA 4IPNB 4PEEA 1UKSA 2PB1A 4JCMA 2WM0A 5BRQA 2GSJA 4H2CA 1CYGA 3MSGA 4Z2HA 4QFUA 2ZOXA 1CXIA 1B31A 1PIFA 1W32A 4DWSA 3K8LA 5E0CA 1R87A 3POHA 2W62A 2W91A 1C90A 2WCSA 4X0VA 1NOWA 3ZJKA 4AD0A 4Z2GA 3SUTA 3B9DA 1E6SM 2V3DA 3RM4A 1VFUA 4H8HA 1B30A 1JZ8A 4MDOA 1JIBA 2WVTA 1B3YA 4CD7A 1SR0A 3SUWA 1W2PA 2Z1SA 2W5FA 4P7QA 4PSPA 6CGTA 3ARYA 1G9HA 7A3HA 3N17A 1XCWA 1JZ4A 8CGTA 2VX7A 3MO4A 2VX5A 1ISZA 3MS8A 3MUY1 3PTMA 4Q7NA 3WDHA 1V3KA 1L0PA 1I75A 3W53A 1OIMA 4QLJA 2XVNA 1W1PA 4UFJA 2EBNA 1M04A 3WQ6A 4MNKA 3CPUA 3VDCA 1KGWA 1DWGM 3TTOA 3MV11 2WHKA 1Q4NX 3CZEA 3B9EA 4MAZA 1QI2A 4CGTA 1FP9A 2VRQA 1J0IA 3QOKA 3WBEA 4ZE4A 2BHYA 2PWEA 3WNLA 1W9PA 3NDYA 4WSKA 1LLOA 1HL8A 1JF6A 4JIEA 2XPKA 2XIIA 1US2A 3OLGA 1NWRA 5M3WA 5JIWA 2A3AA 3I3EA 4PRWA 2CXGA 1XD0A 4S3KA 1M01A 1PZ3A 4XUYA 1HP5A 2FGZA 1Q6EA 3PHAA 1NM9A 4GKLA 1TR1A 5LA2A 3SCTA 2O9RA 4D72A 4WKHA 1FFRA 4BA0A 4EKJA 3ZJ8A 2VL4A 2ZUUA 3VX1A 3OB8A 4QDMA 2XVGA 1VJSA 1JZ3A 4GI8A 4OKDA 1B2YA 2WANA 4AISA 3WFZA 2WWDA 4MB3A 1QI0A 1G1YA 1E6XM 3KEHA 4MB1A 1HP4A 5FD0A 4AZCA 5JBEA 5DEZA 1W3LA 4C7FA 1EDQA 3ARWA 4U33A 2XTKA 3FN9A 1BF2A 3CMJA 3VIHA 4GZEA 5I0DA 3GZAA 2PC8A 4M24A 3ARSA 1QOXA 2A3HA 1Z32X 3KL0A 2J25A 2VTFA 3WNKA 2ZX7A 3ZO9A 2WMGA 2YKKA 5FCZA 2YOCA 1GQIA 5ABEA 4DUXA 3GNPA 4A3YA 1KFWA 4PUDA 4M56A 3WL1A 3VVGA 1FHLA 4HP5A 3HJEA 3LMYA 1QW8A 4ATLA 4W88A 4PMRA 3BAYA 3EYPA 2PWFA 1EQPA 3SIMA 2V3FA 1HT6A 4PMDA 4TXEA 5E09A 3WMCA 3FAXA 4UFMA 1V3JA 2ZX6A 3ALGA 3AXXA 5I2UA 1E6RA 2XFRA 3MMWA 3PZVA 2V5CA 3VOCA 4DM2A 3VIGA 1VRXA 4Q22A 1JAEA 2YBUA 5ABHA 2XM1A 3BAKA 2GDVA 3HMCA 1OT1A 1CZ1A 2DH2A 1UD2A 2DDXA 1DEDA 3BAIA 3WQ8A 2QLYA 4M82A 2WZEA 4NF7A 4GQRA 4WK9A 1OB0A 1UG6A 4OOZA 4UOQA 5TD4A 1CGTA 3G6LA 1LL7A 5I3DA 2IXVA 2QPSA 4PMYA 5D8WA 1EOKA 2UY5A 2VT0A 1EA9C 4W8BA 1JYVA 4LGXA 2QMJA 1BG4A 1CGVA 5ABGA 3GBEA 2BY3A 4R27A 1J0JA 5FL0A 4A3HA 2VMFA 1CPUA 4ZXOA 1E5NA 1ODUA 3L4YA 2JF6A 4UOZA 4L4OA 4C7GA 4W87A 1J0ZA 4E4PA 1VIWA 2WXDM 2YL5A 1TA3B 3L2LA 4AD2A 2EPNA 5CLWA 1UWUA 3M07A 2DT2A 3ZSTA 2CKSA 2EJ1A 4AD5A 5AY7A 3J7HA 4PUEA 3ARPA 2DSWA 2G3NA 3IJ7A 5CJ5A 4J3SA 1AMYA 1JG9A 2UY2A 4ZXLA 3TTQA 1VBRA 1JXJA 3VINA 4V2XA 1HX0A 4NZCA 3WDQA 1RP8A 4AIEA 3QGVA 1J9YA 2ZWZA 3THCA 5FL1A 3GH7A 1QNRA 4M8UA 5C8BB 3WH9A 3AJ7A 3K46A 4URIA 3T0DA 3AZRA 2NSXA 2A3EA 4AEFA 2VZUA 2WSPA 4HA3A 2XGIA 1E72M 2D1ZA 2F61A 7CGTA 3WF3A 4WKFA 1WDSA 2J7DA 3NSNA 2X05A 3AZTA 2XVPA 4PTWA 1W91A 2D24A 5A8NA 1MXDA 1JNDA 2GDUA 4B3LA 1HJQA 2VRKA 5A6JA 1A47A 3ALFA 3W0KA 1X6NA 4PBGA 4E8DA 2NT0A 1QHOA 1JZ5A 4GI9A 3L4ZA 5GNYA 1UWQA 4GO8A 2EEXA 1HL9A 2WMIB 3VGGA 4F9DA 3AROA 1E1FA 1V6WA 2CITA 4GIAA 2WCAA 3GBDA 5A8QA 4AZ6A 1H4PA 4AZ7A 3VU2A 4P7RA 2J7BA 4J3UA 4F66A 1WZLA 1DWFM 2OWCA 3PZTA 1U33A 3WF1A 1E6PA 3CTTA 4FLRA 3EMCA 3CH9A 2DIJA 2XIBA 3VDBA 1E43A 2J74A 2EQDA 1GONA 2YL6A 3NCOA 4J3XA 1GOKA 2CHOA 2WNWA 4GXPA 3WD2A 2BVDA 2J8FA 2XG9A 2FDMA 4BF7A 3WUFA 5C70A 1TVPA 4AD1A 3ZT6A 1I1XA 3SUUA 3AIRA 2VVNA 2VNCA 1CLXA 3T0BA 5JBDA 5ABFB 1QI3A 2W92A 4BQ3A 3W6LA 4J3WA 4D71A 3WELA 3AYSA 1JD9A 5D4YA 3RDKA 5DFAA 5KEZA 4J28A 2W4XA 2ZXDA 1UHVA 2XFFA 3CUFA 1BGAA 1UR8A 2Y8KA 5FIPA 3F5LA 1C93A 1ZU8A 2VOTA 3WUEA 3VGBA 3M46A 4U3CA 1KGXA 2WLYA 4AY1A 2FHCA 3ZIZA 4TOQA 2ZUNA 5A6KA 1ESWA 3GM8A 5A94A 3CO4A 1UH3A 4UQ9A 1L8NA 4MNLA 1PPIA 3W27A 1UQYA 4CD6A 3OGRA 2E9MA 3AI0A 1J0KA 1GQKA 1UR0A 2D0FA 5HBFA 4H8UA 1VJZA 3EBVA 2VC9A 2PF0A 2VCAA 1AQ0A 3CUGA 1NOFA 4IISA 5C71A 1EH9A 2O9OA 1E4MM 3TA9A 1UD3A 1H11A 4D6EA 1XGZA 2E4TA 5A1AA 1EGZA 1JFHA 1UWIA 4B9YA 3BCFA 4D6HA 2CETA 3F5JA 2J47A 4D6CA 3KL3A 4DWSB 2WW5A 1UA3A 5HOSA 3F4VA 4NRRA 4TUFA 5D8ZA 2WBKA 4ZENA 2G3IA 1LJYA 1H0IA 4W86A 1KR1A 3RMEA 2RGMA 5LYRA 1RPKA 2C0HA 4W93A 2JALA 5IFPA 4CN1A 1I1WA 2XYLA 3WBAA 4UR9A 2AMGA 2BNJA 3CHDA 5ECUA 5E6ZA 1DHKA 1XH2A 2YA0A 3VNYA 3VGHA 3CUJA 2WKLA 2D0HA 2WC3A 4PMXA 4AYSA 2QHAA 2CBIA 4P8XA 4DWSC 2TAAA 5A2BA 4W7WA 1FFQA 4OOUA 3O9NA 4CVUA 4JCLA 1LWHA 4UOJA 1J18A 4E8CA 1GOMA 2XFYA 1CECA 2EPMX 2YL9A 4WJXA 4M1RA 2FH8A 3WEZA 1V6VA 3DHUA 3GYCA 4P8VA 3F5KA 1J01A 1G5AA 1IZJA 1HJSA 4HPHA 1E6ZA 1OGBA 2BY0A 3T2OA 3WDRA 1UR1A 3VD3A 4HOWA 1FHDA 4QCFA 1GNXA 1E55A 2JF7A 3DYMA 4XB3A 5F7UA 4ZE5A 3UG5A 1W3JA 3QHMA 1UR2A 3AXHA 3VIJA 1W3HA 5CSYA 3SCVA 1V0LA 3ZR5A 4UFIA 3WN6A 1WZKA 1A3HA 1CGWA 1PAMA 2CBUA 1QNQA 4PYSA 2QF8A 1WDPA 1CIUA 2DT1A 1BSIA 2WVUA 1EHNA 1V3LA 3PZNA 4AIOA 2OLHA 2VX4A 4BQ4A 4UCFA 2CIPA 1QI5A 1DWJM 3SUVA 3CUHA 4HU0A 1GCYA 3A4WA 4HZ6A 5CG0A 1E3XA 2QMKA 2VZTA 3CZJA 4ACZA 1V0NA 2CEQA 3S6TA 3SURA 4JFUA 4GQQA 2YBTA 1X1NA 4AZCB 5DT7A 3CMGA 1KBKA 1TE1A 1CXFA 1G94A 2WZIA 3AIWA 1B1YA 3B9AA 3AIQA 4JFVA 4OUEA 3A3HA 4ML4A 1P6WA 3BLKA 2PI6A 4AZIA 1JZ7A 1BLIA 3AXIA 4PMZA 3M6DA 1WDRA 3RILA 4GI6A 4LYQA 5CPTA 1XV8A 2E8ZA 1UA7A 3GXDA 1KCKA 4UZSA 4FLQA 1V0KA 4E2OA 3RM9A 2PWHA 3OGSA 1M03A 1W1VA 3PZ9A 4J27A 5GNZA 3AHYA 2GJPA 3WIJA 3ZT5A 1XSIA 1Y7VA 1E71M 4RE3A 1UQZA 3VKKA 3KE0A 1XYZA 3T09A 1BGGA 1VEMA 2C7FA 3VO0A 3AQUA 1HF6A 3GNRA 1HKMA 2X2YA 5A2CA 3AMKA 4AD4A 3PZGA 4Z2LA 4JL2A 2XWEA 1IZKA 4C7DA 3WDPP 2WVVA 1C92A 3EDJA 2X09A 1ODZA 4ATDA 1IV8A 1HJXA 4OZOA 5IXEA 3SCOA 4CD5A 4P7NA 4UQCA 1FA2A 1OINA 2BV9A 2E3ZA 2ZUMA 4XV0A 1AVAA 1ZJAA 6TAAA 5A95A 2YDRA 5FOOA 1K6AA 2Y5EA 2NT1A 3ZR6A 2BVTA 2GUYA 3OIHA 3AHTA 1JNEA 5E0FA 3BLPX 3PTKA 1VB9A 3LPPA 4MNMA 1TG7A 4TX6A 3VUPA 3PN8A 1EDTA 3VIKA 2WYSA 4J3VA 1DTUA 1J11A 1CGXA 5BWFA 1J10A 5FKYA 4F9JA 3KZSA 3GH4A 1GZJA 1GOIA 3AMCA 1XH0A 1GJWA 2V3GA 2RGLA 3TTSA 4BCEA 1RH9A 4AEEA 1H0GA 3ZSSA 3UR8A 1JDDA 3K8KA 4GZIA 1MW3A 4W7VA 2O9PA 5EFDA 4CU6A 3K8MA 1TZ7A 3W38A 5HPCA 1K9DA 1ZS2A 1JDAA 2WCGA 1NWSA 4TX8A 3WD1A 1QHPA 2ZXBA 1ECEA 2X8RA 2J75A 1HXJA 1Q6GA 4WIWA 4TVCA 4HTYA 3DYOA 5E70A 4QLLA 1QHZA 2VX6A 4QLKA 1WKYA 1PEZA 3ARVA 3A4AA 3OLIA 4CUCA 1B3VA 2J77A 1JFXA 5D9MA 4U3AA 3VD5A 1E0WA 2WPGA 1VAHA 4D6DA 1E15A 4D1IA 4PTMA 1WP6A 3GDBA 1C3FA 4NSBA 5A2AA 3EDEA 1JYXA 4HMCA 3WUBA 5A6LA 1DWAM 5EBAA 1OGSA 2GVYA 2HISA 1LL4A 3U57A 2PWDA 5AC4A 4IUGA 1EOMA 4ZFMA 1C8XA 1PJ9A 3QHNA 1PBGA 3T2QA 3VIFA 2MANA 2CBJA 1CXEA 5BROA 3W29A 1BQCA 1TVNA 1PX8A 3JUGA 4YN5A 1DP0A 3ARUA 3ZQ9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2VQT A;  3AMG A;  2DH3 A;  1AQM A;  1R7A A;  3GNO A;  2PBG A;  5E6Y A;  2WLZ A;  2J8G A;  1MW2 A;  5IHS A;  3D5H A;  3B8S A;  2ZUW A;  4W84 A;  4MJ2 A;  1IT0 A;  2BXY A;  1WCG A;  5A69 A;  1B3X A;  3WD3 A;  3AOF A;  3ARZ A;  4AC1 X;  3ZM8 A;  1XH1 A;  2DSK A;  1QNP A;  1C8Y A;  3UET A;  4QP0 A;  1K9F A;  2JIE A;  2DQX A;  4AXN A;  1V0M A;  3T08 A;  2EPK X;  1C7T A;  1W1Y A;  2WB5 A;  1NWT A;  5A8M A;  1KQZ A;  2J7C A;  2BY2 A;  1BG9 A;  3AS1 A;  4XZB A;  5I23 A;  1DWH M;  4W7U A;  2O92 A;  2D22 A;  2WVS A;  2WC4 A;  3FY1 A;  3OLD A;  2GK1 B;  1LL6 A;  1VF8 A;  2WMI A;  3N04 A;  3VPL A;  1MQP A;  4LPC A;  1VEO A;  2G3J A;  3K1D A;  4P7L A;  3WNO A;  1JD7 A;  1V6U A;  4W5Z A;  4Z2J A;  2VJX A;  1B0I A;  3L2M A;  1K9E A;  2YJQ A;  2VUR A;  1E9L A;  2ESC A;  4U2Y A;  1JF5 A;  1UD6 A;  1CEO A;  4CU7 A;  3PZQ A;  1NAR A;  3AIU A;  3N1A A;  3RCN A;  4FMV A;  1ITC A;  5D9P A;  2WZH A;  3O2L A;  3UR7 A;  1TFV A;  1U30 A;  1JDC A;  4W89 A;  3D3A A;  4MAD A;  5IDI A;  4NI3 A;  3UG4 A;  1JL8 A;  3RO8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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