4ATLA

Crystal structure of raucaffricine glucosidase in complex with glucose
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
501
structure length
470
Chain Sequence
NDATRISRSDFPADFIMGTGSSAYQIEGGARDGGRGPSIWDTFTHRRPDMIRGGTNGDVAVDSYHLYKEDVNILKNLGLDAYRFSISWSRVLPGGRLSGGVNKEGINYYNNLIDGLLANGIKPFVTLFHWDVPQALEDEYGGFLSPRIVDDFCEYAELCFWEFGDRVKHWMTLNEPWTFSVHGYATGLYAPGRGRSTGNPGTEPYWVTHHLLLAHAAAVELYKNKFQRGQEGQIGISHATQWMEPWDENSASDVEAAARALDFMLGWFMEPITSGDYPKSMKKFVGSRLPKFSPEQSKMLKGSYDFVGLNYYTASYVTNASNFSYNTDIHVTYETDRNGVPIGPQSGSDWLLIYPEGIRKILVYTKKTYNVPLIYVTENGVDDVKNTNLTLSEARKDSMRLKYLQDHIFNVRQAMNDGVNVKGYFAWSLLDNFEWGEGYGVRFGIIHIDYNDNFARYPKDSAVWLMNSFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title High Speed X-Ray Analysis of Plant Enzymes at Room Temperature
pubmed doi rcsb
molecule keywords RAUCAFFRICINE-O-BETA-D-GLUCOSIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Rauvolfia serpentina
total genus 183
structure length 470
sequence length 501
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.1.219: Vomilenine glucosyltransferase.
pdb deposition date 2012-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4atlA00
2PWDA 1H49A 2WK2A 4KGJA 1C93A 3EDKA 3VNYA 1R86A 1BGGA 1M7XA 3N1AA 2XWDA 1EOKA 5A6JA 4UOJA 1V02A 5I2UA 3KL3A 4D6DA 2WPGA 4JFTA 1FHLA 1NP2A 1HP5A 3MKKA 3VIGA 3IJ9A 3PZGA 1OB0A 2BY0A 1TFVA 3AHYA 4AZ6A 4MNLA 3HU7A 1WZAA 1E6RA 4U31A 3WD1A 1AVAA 4J3SA 1UYQA 4HMCA 3M7SA 1RD6A 4ZFMA 4CD7A 1GOWA 1UH2A 4EK7A 1V3IA 4PMXA 2VR4A 1E0WA 5D8WA 4DM1A 3CZEA 1KB3A 4AC1X 1NH6A 5DF0A 5BXSA 4Z2LA 4E8DA 5CGTA 4GO9A 3SCRA 1W3HA 5LYRA 2DPEA 1CIUA 3A47A 4W5ZA 1F4AA 4Z2GA 3WEZA 1OIFA 4IISA 1HL8A 1NARA 1UKPA 3WNKA 1Z32X 2WVSA 3HMCA 3WH6A 2D0GA 3WQ6A 3WDJA 2FGZA 2E40A 3AIRA 4PTWA 4ZENA 1BVNP 2VX5A 1JDDA 3VINA 1XSIA 1JF5A 2XIBA 5DEZA 1QHOA 1JAEA 3T2OA 3VIMA 2J62A 3W82A 1CECA 2BY1A 2GDVA 2VZUA 3I3DA 1WB0A 2DT3A 4NRRA 1JXKA 4F9JA 3TP4A 3QOMA 4TUFA 1MW1A 1OBAA 1XC6A 3GH5A 3L4XA 1E4IA 4BQ2A 3GH7A 3SUWA 3VX0A 1E3XA 2PF0A 1UD2A 1WCGA 4RE4A 5FOOA 3A3HA 1W2VA 1ZBWA 1W9BM 1MXDA 1UR2A 2G3MA 3AYRA 1CBGA 4JFWA 1TG7A 3AS0A 1HNYA 4M24A 3T09A 1VJSA 2D23A 2WXDM 5A94A 2OWXA 3CZKA 4MPKA 1WPCA 1JZ6A 2D2OA 4GXPA 1UH4A 1Q6DA 2EPNA 1GVIA 4J3TA 4AW7A 4CD6A 3SCUA 1C92A 1CXEA 4WSKA 5C70A 3BC9A 1PEZA 1HKIA 4MJ4A 5CZKA 3ZT5A 1UR0A 3W26A 1XSJA 2CNCA 2VX7A 1JZ4A 2ZICA 3IK2A 2VX4A 3IJ7A 1QNQA 5E6ZA 4EAMA 5C71A 1LF1A 5GQBA 4GZEA 5EMYA 3T2PA 3MV01 1G5AA 4AZGA 3WENA 2J79A 1SMAA 3WD2A 1V6YA 4LQ1A 2BVDA 4AZHA 4W7WA 4BQ5A 3N12A 4J3UA 1BGAA 3DYMA 2DIJA 1JYNA 1KQYA 4XV0A 2WHJA 4WKFA 4HU8A 3WBAA 3KL5A 3VTRA 4UFHA 1NOWA 2CETA 5LA1A 2W62A 5JBFA 3WUEA 2WC3A 1EDTA 4Q7NA 4TOQA 4W89A 3GXMA 5CJ5A 2CBJA 1O6IA 2ZX9A 2VQUA 2VUYA 2XFFA 1V6VA 3N18A 2V3EA 3VD9A 3KE0A 4BQ4A 3N15A 2VVNA 4W8AA 5EFFA 2VCCA 4LYPA 1E15A 2E0PA 2QMKA 3IANA 1LL7A 2GJPA 3GXIA 1JNDA 3EMQA 1E5JA 4M1RA 4WJXA 3M46A 2CXGA 4HOZA 3TTOA 2X05A 4TTGA 4AEFA 4B3KA 1MW2A 1EDGA 4OBSA 3D5HA 2J8GA 2VVSA 2F2HA 5BXRA 1UD4A 1VIWA 1XH2A 2UY5A 4OOUA 1ZL1A 1DWFM 2OWWA 4JKKA 2MANA 1BFNA 5KEZA 2WYSA 4AYSA 1CGYA 2VMFA 4D1IA 3MU7A 4U5KA 4TTUA 4CVWA 5ABHA 1FH9A 3PN8A 1KFWA 1GPFA 5C8BB 4PMOA 2CIPA 2NSXA 3WEMA 1QOXA 1V03A 2FH8A 4QAWA 5A3HA 1QI4A 4AXNA 5ABFB 1PJ9A 1KR1A 5I3DA 2EPOA 1FOBA 1HT6A 1V0LA 3WKZA 2VZSA 3ARWA 3AJ7A 3ARQA 1MXGA 3WD0A 3ZJ6A 3NUKA 2AMGA 2PWEA 2V38A 4Z2HA 2Y2WA 4M29A 3NDZA 3M6DA 1H11A 3HJEA 4PTVA 3VX1A 1MQQA 3DHPA 2ZUSA 4CGTA 3QHOA 1OT1A 3VMNA 5AYBA 3SCSA 3ZJ8A 3GXDA 1OM0A 3WNOA 2XGBA 2XTKA 4AD0A 4H41A 2EPMX 3WELA 4ACZB 4JCLA 3BAKA 3VOCA 3ZT6A 2X1IA 5JIPA 3VIFA 1W32A 1WNOA 3WF4A 1PX8A 1WDRA 3AOFA 1QBAA 3THCA 1JNEA 2ZUWA 1WE5A 1FH7A 2G8ZA 2WMHA 1V02E 1E70M 1ZBCA 1BG4A 3ARTA 2BVYA 2WC4A 1HL9A 3ZT7A 3UR8A 5A6MA 1VFMA 2ZE0A 2DSKA 2WHKA 1MQRA 4PN2A 3LPFA 2V3GA 1XD0A 4HA1A 4B9YA 3N17A 1UUQA 1K9TA 2PI6A 4Q22A 1B3VA 3RM9A 3II1A 1JAKA 3FNDA 4GI9A 3AI0A 4UNIA 1I75A 5IDIA 3BSHA 5A1AA 3NYDA 2QPUA 4CU6A 4W86A 2CBVA 3AS3A 4ZE4A 1TMQA 1QNOA 2BY3A 3E1F1 4D6GA 2XUCA 1W91A 2J74A 1H0GA 1MYRA 4PCSA 1JI1A 1CEOA 1VB9A 1XCWA 4PMDA 4TX8A 4R27A 3TTSA 5E9AA 3VDBA 2WANA 4L4PA 3AIWA 4AD1A 4PMRA 3RM8A 2B31A 2YOCA 5D9PA 3AIEA 1RP8A 2WCGA 4WK9A 1V0NA 1GOKA 2J77A 4UQAA 3GBDA 3CLWA 1QI5A 1KGWA 1EO7A 1ISXA 1DTUA 5FIPA 4NI3A 4AZ5A 3WDRA 1JI2A 3WH5A 2Y5EA 2J47A 1QW9A 2WSPA 4D71A 3T2QA 2VTFA 2ZWZA 4P8UA 1JXJA 4HMEA 1H3GA 4U2ZA 1CXLA 2VOTA 3N9KA 4QLLA 3VGHA 2FHFA 1IV8A 1US2A 3RIKA 1PIFA 4W84A 5GNXA 3AXHA 3RJXA 4R5EA 4URIA 4CN1A 3TTYA 4EKJA 2QPSA 2DT1A 2J7DA 1DWIM 3BCFA 3VDCA 2VZTA 2BFGA 5FKYA 5I77A 3N11A 3SCVA 2XJ7A 2XFYA 3PBGA 5DT5A 4CCEA 1H5VA 2VRKA 3OBAA 5A8PA 1ZU8A 5M5DA 1ECEA 1K9FA 5EFDA 1C7SA 2O92A 3GTNA 4A4AA 1WZLA 3PZIA 1HN1A 4EANA 4PSRA 2BNJA 4MNKA 3MUZ1 4K68A 2XG9A 4LYQA 4YHGA 4HZ8A 1J11A 8CGTA 1WZKA 4HA4A 5A8OA 2E9MA 4EE9A 3EYPA 2DSUA 3WF2A 4D6IA 2GK1B 3CUIA 1CGWA 4BF7A 2J8FA 1J0ZA 3RMEA 1VFFA 4UQDA 3CZLA 3PTMA 1ESWA 4UQ9A 1QPKA 3VD5A 3PTQA 5A6KA 3ZJKA 1WDQA 5ABFA 3AMGA 1B90A 2O9PA 2VO5A 3WF0A 3ZR6A 3CUGA 3GYCA 1GQLA 5JBEA 1SR0A 3PZTA 4H7VA 1QHPA 2XSAA 5CSUA 1HP4A 1MW3A 1R7AA 3D3AA 1TE1A 4IPLA 3ARRA 1M04A 4AD2A 3B8SA 2G3IA 4JIEA 4W85A 1V3HA 3VNZA 1C8YA 3U7BA 1NOFA 1JD9A 3RM4A 4BCEA 3EMCA 2XM1A 1FH8A 5FL1A 3A6OA 3WNPA 4A3HA 4H8UA 2DSVA 1U33A 3F4VA 4P8VA 1E4LA 4TVUA 4BS0A 4UTFA 1TR1A 4ACZA 3KWXA 3RILA 3ZSSA 1D7FA 2YLLA 5EBAA 1B9ZA 4HU0A 4ATLA 2VR5A 2BV9A 1O7AA 3VM7A 3WQ8A 4AZ7A 1K9DA 4GI8A 3ZR5A 2CERA 2ZUVA 1NQ6A 1KXQA 1DEDA 1EHAA 1CZ1A 2QHAA 3MUAA 2FHBA 3BMWA 2ZXBA 1LL6A 1HVQA 3FW6A 3VIKA 5A2BA 1G9HA 4QLKA 3ALGA 1B1YA 5A6AA 4LX4A 1XV8A 5CXPA 2JF7A 1XD1A 2IXVA 3SUTA 4AD5A 5FL0A 2EJ1A 2WMIB 1XCXA 2YJQA 3BSGA 3DHUA 3F5KA 1TZ7A 2CITA 3CMJA 1B3WA 4LPCA 1E1FA 2DGAA 1X6NA 1PAMA 3RCNA 3WL0A 2BVTA 5D8ZA 3VGDA 1W1VA 1VRXA 1JZ5A 4GPNA 2G3NA 4XUYA 1IT0A 1HIZA 4FLRA 3CTTA 4IUGA 4OZOA 2J7HA 1FA2A 4U5IA 4W5UA 3A4XA 2J7EA 3A4AA 2RGMA 4ATDA 3MMDA 4MAVA 3WUGA 2DIEA 1L8NA 2UWFA 4PRWA 5JIWA 3ARSA 4P7RA 2CESA 4QLJA 2PWHA 7TAAA 2EPKX 4D6FA 2VRQA 2GVYA 4L4OA 1WZMA 4HOXA 3VILA 3DYPA 1EXPA 1TVNA 3TONA 3ZSTA 2XPKA 1VFUA 1LG2A 1GVYA 3GNOA 1VBRA 1UHVA 1WP6A 3O2LA 4C7FA 1GZJA 1I1WA 5I5RA 1BSIA 5D4YA 4HP5A 2G3JA 1KXVA 3CGTA 1E4NA 1H09A 2WZIA 3HN3A 3WFLA 2ZUNA 5I24A 3AMLA 3F5LA 4QDMA 3VKKA 4AIEA 1FP8A 1C3FA 1CXFA 3WMBA 1SFSA 2WCSA 3PZUA 4B15A 3K4AA 1OCQA 4JKMA 1XH0A 1UZ1A 2ZX7A 2DH3A 1OWQA 4AZIA 3L2LA 1QHZA 3F5JA 3ZMRA 1E40A 1DWJM 3ARXA 5I78A 1PBGA 3AHZA 3WDIA 3W25A 1CGXA 2ZX8A 3TTQA 3BXWA 2WKLA 1I1XA 3NJ3A 2WWCA 4CU7A 1WKYA 2OLHA 3MSGA 1EQPA 1FFQA 1UKTA 2GK1A 3T0DA 2W92A 1M53A 1QI0A 1MFVA 5CPQA 4PTXA 5GNYA 3AIVA 4ZEPA 2WVTA 3UG4A 3UEQA 1HJQA 5KZ6A 4H8VA 3CIVA 2J25A 3VIJA 4MB4A 1W3LA 1VFOA 1E1EA 1XGZA 3NSMA 1H2JA 1OINA 3CZ8A 4UZSA 1AQ0A 2Y24A 3WQWA 4P7NA 1GOQA 2ZUMA 3B9AA 4UFIA 1Q6CA 2CCRA 3CUHA 3BAIA 4X9YA 3NSNA 3W29A 1J0IA 1CDGA 1EHNA 1Q6FA 5IHRA 5TD4A 1BG9A 5HDRA 1PZ2A 1FP9A 2WB5A 2WZHA 2J78A 1OT2A 5HPCA 5DFAA 5E0CA 3RJYA 4JL1A 3AXIA 1LG1A 1KCKA 3WQ4A 2NW0A 3AMDA 2ZXAA 4CN4A 3MMUA 3VIHA 4CCDA 3CHCA 2VNCA 1YQ2A 2DQXA 3WNLA 2YDRA 2WBGA 2WW5A 3OZOA 4LXFA 1HX0A 3ZOAA 3POHA 4NSBA 2XVPA 2A3CA 2VZVA 1UWSA 2FHCA 1M01A 1XH1A 3GXFA 4N42A 2Y8VA 2BHZA 2WC7A 1G94A 1MQPA 1ISWA 2UY4A 2ZIDA 4QFUA 2W5FA 3B9EA 3WQ5A 4UQEA 1QNPA 3UG5A 4M56A 4UOZA 1Q4NX 4WKAA 2WMIA 1SMDA 2F8QA 2D3LA 4H04A 3CZJA 3OG2A 3AMKA 1D3CA 2CYGA 3N13A 4U3CA 1EH9A 4GKLA 3FAWA 4D1JA 4DWSB 1E6QM 1MWOA 1UA3A 4PMUA 1H1NA 1J0HA 4WSJA 1UWTA 5BWFA 1HJXA 1E73M 2QF8A 1B30A 1CNVA 1JF6A 3MUIA 2G4FA 4JCMA 3PZVA 1VBUA 4AD3A 2Q8XA 5EB8A 3WMCA 3ZIZA 5BRQA 1VF8A 4AZBA 4CD4A 2WLZA 3N04A 2WMGA 1GOOA 1W9PA 3GZAA 3VD3A 1HJWA 4MB3A 2DSZA 2PWGA 3VGBA 3AIBA 3WMSA 2ZOXA 1JZ8A 1PX3A 4TX6A 1XYZA 3L4VA 3ARPA 3VGFA 4TVDA 1K9EA 4GI6A 2PBGA 1W1YA 1JFHA 4KRUA 1EGZA 3VM5A 2DDXA 1V3LA 4BA0A 3IJ8A 3W53A 5M17A 5IFTA 2XVLA 2XVKA 3VMPA 1GQIA 3OLDA 4CU8A 2EEXA 2WVVB 3DC0A 4NRSA 1E55A 1UOKA 1CXKA 2VC9A 3BAWA 2VX6A 4V28A 2QMJA 1B2YA 1UWQA 1B3XA 1CXHA 2JF6A 2JIWA 3WEOA 1J9YA 1C8XA 2FH6A 4GINA 1UWRA 4D72A 3ZM8A 3ZQ9A 3L4UA 3FN9A 2CKRA 3EDDA 1J18A 1QNSA 2VT0A 1BYAA 1RPKA 3BLPX 3K1DA 3VGEA 2CBIA 3SUUA 3O6AA 3T0BA 4B9ZA 5A95A 1UD5A 3G6MA 1JZ3A 3VO0A 4PMYA 4GZIA 2JALA 1H0IA 4CD8A 2YDSA 2X0HA 2Z1SA 4GQRA 4FK9A 3ZJ7A 1QI3A 2J7CA 3CBWA 1ITXA 4AEEA 3AXXA 4J27A 1DWAM 4HTYA 2VZOA 4MDOA 2XM2A 3WNMA 4ZXLA 3L4WA 1BVZA 1OSEA 1XRVA 4MDPA 4Z2IA 2VURA 2BY2A 2O9TA 2WWDA 3BMVA 2WAGA 4U33A 1JYVA 1EA9C 1UD3A 4HMDA 1JIBA 2OYKA 4OUEA 3WNNA 1Y7VA 4HA3A 3UESA 3BGAA 1LQ0A 3A4WA 1L0PA 3RDKA 1NWSA 3SUVA 2WHMA 5CSYA 1DHKA 4AIUA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2PWD A;  1H49 A;  2WK2 A;  4KGJ A;  1C93 A;  3EDK A;  3VNY A;  1R86 A;  1BGG A;  1M7X A;  3N1A A;  2XWD A;  1EOK A;  5A6J A;  4UOJ A;  1V02 A;  5I2U A;  3KL3 A;  4D6D A;  2WPG A;  4JFT A;  1FHL A;  1NP2 A;  1HP5 A;  3MKK A;  3VIG A;  3IJ9 A;  3PZG A;  1OB0 A;  2BY0 A;  1TFV A;  3AHY A;  4AZ6 A;  4MNL A;  3HU7 A;  1WZA A;  1E6R A;  4U31 A;  3WD1 A;  1AVA A;  4J3S A;  1UYQ A;  4HMC A;  3M7S A;  1RD6 A;  4ZFM A;  4CD7 A;  1GOW A;  1UH2 A;  4EK7 A;  1V3I A;  4PMX A;  2VR4 A;  1E0W A;  5D8W A;  4DM1 A;  3CZE A;  1KB3 A;  4AC1 X;  1NH6 A;  5DF0 A;  5BXS A;  4Z2L A;  4E8D A;  5CGT A;  4GO9 A;  3SCR A;  1W3H A;  5LYR A;  2DPE A;  1CIU A;  3A47 A;  4W5Z A;  1F4A A;  4Z2G A;  3WEZ A;  1OIF A;  4IIS A;  1HL8 A;  1NAR A;  1UKP A;  3WNK A;  1Z32 X;  2WVS A;  3HMC A;  3WH6 A;  2D0G A;  3WQ6 A;  3WDJ A;  2FGZ A;  2E40 A;  3AIR A;  4PTW A;  4ZEN A;  1BVN P;  2VX5 A;  1JDD A;  3VIN A;  1XSI A;  1JF5 A;  2XIB A;  5DEZ A;  1QHO A;  1JAE A;  3T2O A;  3VIM A;  2J62 A;  3W82 A;  1CEC A;  2BY1 A;  2GDV A;  2VZU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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