4UTJ | Genus

Total Genus 126

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	126
sequence length	360
structure length	360
Chain Sequence	SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGFLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLER

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas putida
publication title	Redox-dependent substrate-cofactor interactions in the Michaelis-complex of a flavin-dependent oxidoreductase doi rcsb
molecule keywords	NADH:flavin oxidoreductase
total genus	126
structure length	360
sequence length	360
ec nomenclature
pdb deposition date	2014-07-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4utjA00

3LERA 5AHMA 3ZWSA 3TXZA 4ML9A 1T96A 1W3TA 2CLEA 1J5TA 4O0ZA 2TMDA 5D05A 3USBA 4R34A 4XQ6A 4PL1A 3W84A 3W86A 1LLZA 3WJWA 4AWSA 3UQNA 5E93A 4XTDA 1ZCOA 3GIYA 3C2EA 3NQ8A 5HUOA 3B06A 3PY2A 2ZZ5A 2C1HA 2H3BA 2QUVA 2CW6A 1K03A 2P10A 2WSYA 3UNDA 5I3GA 1TTIA 4JXCA 4G1KA 1QWGA 2Z0IA 4UFLA 4WY0B 3TSDA 3PC0A 2DZWA 3RK8A 4Y90A 2WOQA 3L5LA 1XC4A 1F6KA 1WAUA 3IIXA 4R7JA 3EXSA 3TFXA 3O63A 4MY9A 4ZZ9A 5F2GA 3NPUA 2RDWA 2Y62A 3TMQA 4LRSA 3A5FA 4RK8A 1SZFA 4AXKA 4NNCA 1HO4A 3MW7A 4RX0A 4Z1DA 3BG5A 4E2BA 1Z41A 3L0KA 1IGSA 3EX3A 3M43A 3OA3A 4OBTA 3LCGA 4NJHA 1DL3A 1LRTA 1UB3A 5F4XA 4LS0A 2YFNA 4M6QA 1FXQA 1XM3A 4N4PA 1GOXA 1M7OA 3P82A 3O15A 1FWWA 2Q8LA 2BLEA 3TAKA 5FEZA 1JQXA 5TBOA 1BWLA 3CT7A 1WOAA 4ADSA 3BLEA 2NXHA 3T4CA 2V82A 2QUTA 1O5XA 4JR5A 1RV8A 3I7SA 3UWQA 5I3FA 4DO4A 2WQPA 3O6YX 1TV7A 4X9SA 1QMLA 3G8RA 5EL1A 1HG3A 3UYCA 1MEWA 4O15A 4CLMA 1IF2A 4DELA 4MYXA 1FQ0A 4UTTA 3O6DA 1SSDA 4WZHA 4JDYA 3IEBA 5D2YA 3M16A 3BPWA 4K8HA 3PM6A 3F03K 5J5RA 3M5XA 4RZ4A 3LHVA 1K8YA 4JY9A 4AF0A 4BWLA 4NJJA 4UR8A 4AH7A 3QQ0A 3TX9A 3PSWA 2QCDA 1SZNA 3R8RA 4CCCA 5TIMA 4ICNA 2W6RA 2RH9A 4UTKA 2VEKA 3LCHA 2EAWA 1PVNA 3NL3A 3W1RA 4QIUA 1VS1A 1PHWA 5E0KA 1KBIA 3LHTA 1YADA 1F73A 2QCLA 1G7VA 4MY1A 5D09A 1JUKA 4MPQA 4N02A 4H4IA 4P2VA 4FNRA 5J5DA 1O5KA 3H53A 3NL5A 1Q6OA 4NXKA 3W1LA 1Q6RA 1QOQA 3W7HA 2QKFA 3DAQA 1OJXA 3G0UA 2A7PA 5AHFA 3R12A 1MSSA 2EF9A 1IXQA 3W70A 1G4TA 1X6UA 3NR0A 2J27A 4O1BA 4XZ9A 3TC7A 1EPXA 3T55A 2H90A 3KVLA 4AHQA 1H5YA 4YCOA 2HMCA 1WV2A 1UCWA 2ZZ1A 1OX5A 3PB2A 3W7MA 1F05A 3FIGA 1GTHA 4BI5A 5D04C 5EA9A 3W1AA 4UTMA 3P8JA 3HB9A 4DEFA 1TPC1 2QCDB 3BW2A 3U8GA 3GB6A 2E5BA 2ZZ3A 1J2WA 3CU2A 5KZDA 3S1VA 3W7QA 2LLEA 5LHEA 1OFRA 3G24A 2TRSA 4Q33A 4FNQA 1OK4A 4O4WA 4UTWA 5AN7A 3S6DA 5HINA 3QF0A 4EF9A 1A5BA 4PEKA 5G5IA 3NNTA 1W3IA 1XUZA 4WD0A 1MZHA 1HFBA 1O94A 1OFDA 3LTPA 1QR7A 5D2XA 3W2JA 1XXXA 3PBUA 1WBJA 2RDUA 4Y96A 3RNDA 3S1XA 1F5ZA 2J9XA 1TPEA 2Y63A 1K7FA 1KM4A 3OG3A 1TB3A 3IIZA 1K8ZA 4HSNA 4NU7A 2YR1A 3C0JA 4LOCA 1LOQA 3BV4A 1CX9A 4YWIA 3BLIA 5KZEA 3VFLA 3TXVA 2FPVA 3LHYA 5I3HA 2QCNA 1KM6A 5C55A 1DHPA 2CLOA 4CNOA 3CHVA 3LRLA 3HGJA 4O1DA 3W6YA 2C18A 3SGZA 3ANYA 3PBWA 1TRDA 4U28A 4UFIA 3IGUA 2ZRXA 1KA9F 5LNRA 4JTHA 3L66A 1LP6A 4ZL1A 5CG7A 3FJ6A 2ZTJA 1F6PA 3GNDA 2VKZG 2Y7DA 3TFCA 1BTMA 4O1AA 3CIWA 5FEPA 5HR6A 1VHCA 4DQWA 4HNVA 3N73A 1OABA 2RKXA 3KFTA 4AHPA 4GNJA 5IBXA 1WX0A 4GJ1A 3G1DA 4N4QA 2Y61A 3P5ZA 3S5YA 2V2CA 5AOUA 1Z42A 3KVKA 5FEXA 4KWWA 2NUYA 2VFGA 2WO5A 2CZDA 5K4XA 2J9ZA 2E09A 1KTNA 2C6QA 3HPZA 1JUEA 4NJIA 3G1XA 2W79A 4QSHA 3UPBA 3FA5A 4P61A 1QFEA 5D32A 4IOTA 1G6CA 3LI1A 1L6WA 1XL9A 2Y85A 3QMTA 2VFDA 2O7QA 5DBUA 3CB8A 1VH7A 2QR6A 3R2GA 2HSAA 1JCXA 3N2MA 3O07A 4NT0A 3LHWA 3Q94A 3MJYA 1I2NA 4Z0JA 1XBVA 1R46A 4MOZA 5G1YA 1AG1O 3LTSA 2O7SA 2X1TA 1N7KA 1S5TA 4TR9A 3G1HA 1QOPA 2YX0A 2WKJA 2BSLA 3L65A 4BWLC 3P7YA 4I9AA 3TQKA 4K39A 5FESA 4HSOA 2Y7EA 3LBCA 2TPSA 5D2TA 3IV3A 2XN1A 1VYRA 4O4VA 3UXDA 1HL2A 1KW1A 4LY8A 1B57A 5KTLA 3LCLA 3NQEA 3ZR4A 2YYUA 4AAJA 1X1OA 1ML1A 5KSWA 3A23A 4MZYA 5AC6A 3DXIA 1AMKA 2ZA2A 2TSYA 4IPIA 3RF9A 3DU0A 1QO2A 1PV8A 1KM0A 2DZPA 2ZYFA 3BG3A 4HKPA 4Y6GA 2Q3RA 3W9ZA 5I3KA 3DKJA 1PL9A 4K38A 4TU1A 1L6SA 2WNZA 3C2FA 1SW3A 3HGRA 4O53A 3NL6A 5FF2A 4MZ8A 5AYYA 4I7UA 3ZWTA 4RV8A 3QEZA 1OK6A 4UXDA 1H7XA 2BWGA 2C16A 3MWAA 3B0PA 2X16A 1JUBA 3KVMA 1G7UA 5GVJA 4QQ3A 3EWZA 1VLIA 4O13A 4UMAA 3EWBX 4NVTA 3UD6A 8TIMA 2WPBA 3MP3A 3NAVA 2VEPA 3DH7A 4O28A 4GFSA 4I7VA 2ZRZA 4JGDA 3DFTA 4UFJA 3NQCA 3GAKA 4TX9A 1V7YA 3W7EA 2Y89A 3FJLA 4CNPA 1DJQA 4HIBA 1TJPA 3CC1A 1HO1A 3P84A 2PRMA 1JVNA 3QSTA 4Q32A 5BRBA 3CM4A 3IRDA 4PL2A 3NDOA 3G1VA 3GKAA 4OWGA 1TTJA 1K7EA 1LYXA 3TK7A 2BTMA 3C6CA 5F2MA 3HBLA 3EXRA 1TPVA 4UIOA 4UUIA 3LI0A 3DZ1A 3HO8A 1GVRA 2JKEA 2DZSA 3TSMA 1KV8A 3W1PA 3TAOA 4ZQRA 1SFLA 3W7DA 1ALDA 5F1VA 3UZ5A 3I7QA 5EPDA 3GR8A 5KINA 5HWMA 2CLKA 2QF7A 4JTLA 3HGSA 4LC8A 3IGSA 4IUOA 3NA8A 3W74A 1AK5A 2H8XA 4AB4A 1W31A 2QJHA 5LGXA 3W1XA 3SZ8A 3KX6A 1QPOA 1H7RA 4OQVA 2EHHA 3NGJA 5E1QA 3B0UX 1YLVA 3JR2A 1WXJA 5IBXC 1FWSA 4RKAA 1TQJA 1VC4A 1RR2A 2YSWA 1VRDA 1YDNA 2B7PA 5KITA 2DZXA 4O14A 4Z08A 1H50A 3R89A 1H1YA 5DELA 4HNNA 1O4UA 2C0AA 1VCGA 2NV1A 3L21A 3LV5A 5DXYA 3QM3A 4JYFA 1KFEA 1QDSA 5CSRA 3E0IA 3WFAA 3GR7A 4WXZA 1GJPA 4RXGA 5D03A 1Q6LA 2X1SA 3NPXA 3GXTA 3BW3A 3SSJA 5LKYA 1XDMA 3M9YA 2G97A 3LCFA 4WJEA 1EP1A 1GWJA 4TMCA 4PTNA 3T44A 1F2JA 1W3NA 5G1TA 4LVAA 1TRIA 4K8EA 5K4ZA 3W75A 3QYQA 1Q3NA 4EOUA 3OVRA 3N14A 1PE1A 2E6FA 1LORA 1F74A 1THFD 1U5JA 3F4NA 4OV9A 5FF3A 1FDJA 1SFJA 4LU0A 4O18A 2YW4A 1IXNA 2QJIA 3KOFA 5G2IA 4X3ZA 5AYZA 3TR2A 3C56A 3M44A 3TSBA 3MP5A 4FNSA 3P8IA 5G4WA 3GX9A 2C3ZA 3WJXA 5D2WA 1TPWA 1R30A 1X7FA 3N9RA 4UC5A 3MYPA 3QW3A 4XBKA 1RQBA 2GPTA 4O10A 4Y9AA 1EUNA 1M7PA 2V5LA 2DJLA 3G3MA 4A29A 4W9TA 3M41A 4N9BA 3TKFA 3P74A 2R91A 2R14A 4E2DA 4Z1BA 5FEWA 1PCWA 2A6NA 3EXTA 5H91A 4ADTA 2IQTA 5I3IA 3DGRA 3STEA 1XFBA 5BOOA 3MHGA 1KFLA 3Q37A 3HPSA 3LXCA 1NF7A 4QAIA 2X2GA 3SIZA 3PG8A 2Y70A 2ZBTA 2ZZ2A 1P0NA 3PSVA 3UPWA 3P62A 5EKYA 4O1CA 4UTIA 4AVFA 4HNTA 4B5NA 1GVSA 1R2TA 3MYOA 1SO3A 3GKFA 1MEIA 4M5PA 2ZRYA 4FNUA 5SWUA 1TIMA 4XTIA 3TQ0A 1ICPA 1BKSA 2VENA 4K7YA 2RHGA 1EP2A 3NPVA 2PE4A 3DKLA 1IIGA 3WK2A 3HG3A 2Y7FA 3CWOX 2NX3A 3W7OA 1TPFA 1GTEA 2V2HA 3U2OA 4OE7A 2QCFA 2VEIA 5D30A 2GVGA 1D9EA 5K2ZA 2NX9A 1FCQA 3QH2A 4RZ6A 4LS2A 3SY5A 5CPOA 1LBLA 4CQ8A 3G22A 1EA0A 5BMXA 1NAL1 1B9BA 2WJZA 3NQGA 3VE7A 3G0SA 1WA3A 4ZMGA 1YYAA 2QCMA 2HTMA 5LHFA 4XKYA 3L0NA 3LRKA 3HIJA 5LNWA 3GDTA 3DFQA 4YL2A 2H8ZA 3KXQA 4H6KA 2A7RA 3LOTA 4S2BA 3STFA 2C15A 4N6FA 4DBEA 3O06A 2YPIA 3TE9A 5ABTA 3QJAA 3F1QA 5L9FA 1GYLA 1G69A 1P4CA 2ATMA 3NZ1A 2CLIA 2V2DA 3I6RA 1XDLA 5LNSA 1DOSA 1IXPA 4U4MA 4GBUA 3UZJA 1OX6A 1QCWA 3W85A 2AQWA 2PC4A 2J24A 5FI8A 1WYIA 4JYEA 1A53A 5FF7A 1DJNA 1F7BA 4KFPA 3TJXA 3G1SA 1OYBA 3ABRA 4IWWA 1FWTA 1HTIA 1OVDA 5DXXA 5BNKA 4LTSA 2P1FA 4XKYB 2NLIA 4QITA 3WK1A 5CZ0A 2E6YA 1EWEA 3HPXA 3RLUA 4MLJA 4FX7A 4AF0B 3O8AA 2E68A 3NO5A 2ZRVA 2UV8G 1CW2A 1TTPA 2G95A 5G2WA 4MUZA 2I1OA 3THQA 1FDZA 4JICA 3IVUA 3M0ZA 4S2CA 1FWNA 2VOMA 3C2RA 1W5MA 1PHQA 2ZFAA 2QDGA 4GUFA 4RR4A 5EYWA 2NUXA 3B4UA 1I45A 1FX6A 2ISVA 4JDBA 4K7VA 3MUXA 2ABAA 3PB0A 4O0KA 1GZGA 4LRTA 1OYCA 4GRSA 1YXCA 3KRZA 5DCDA 3MI2A 4ZQCA 3E02A 3EWXA 3N9SA 4GE8A 2B4GA 3IVSA 4S1FA 4JEQA 1GQNA 4A2RA 3W2LA 5LZLA 1EWDA 1R2RA 4IXHA 5DY3A 4PH6A 1G67A 1VYSX 2YYTA 2NWSA 3V1PA 1S5WA 4NZJA 1Z48A 1F76A 1OFOA 2PRHA 3PUEA 2VEMA 7TIMA 5DN1A 1I4NA 1P5BA 3W1TA 4ZQOA 4LUJA 4LUIA 3NM3A 3L2IA 4DF1A 4O52A 1RQEA 1K8XA 1QAPA 3EX1A 1TYGA 3N3MA 2VELA 1VPXA 1W56A 3O16A 4L4MA 4RLIA 3NQMA 3TMLA 2E5DA 3NPWA 2CLHA 5D02A 1NSJA 1OYAA 3FFSA 1SW0A 5D37A 4DF2A 1G4EA 4NXSA 3DFNA 4PODA 4Z1AA 3PAJA 5CSSA 2J6XA 3WK0A 4TMBA 4AWTA 3LHUA 2NV2A 3TU9A 1UUOA 4O54A 1LZOA 1LRNA 5K9XA 1CI1A 3OHIA 3T78A 1TPUA 5DBTA 1TMHA 2A2IA 4M7TA 3ZFHA 3LTYA 4Y8FA 2ZCGA 4UFKA 3LCIA 1L2UA 1G4SA 1W5OA 1DORA 3UWWA 1O95A 5AHIA 3W7GA 3B0VC 3NQFA 2C14A 3TW6A 2E6AA 3QQ1A 3WJZA 3LRMA 1KFBA 4CQ9A 3S1WA 4UTTC 3ELFA 4A22A 5HQEA 1EIXA 1ME7A 3CPRA 3G18A 5KZMA 1VHNA 1KFJA 1HUVA 1B3OA 3TUUA 1TSIA 2PCQA 4JX6A 1A5SA 3L68A 4MLRA 1R2SA 3M47A 4LT9A 3BW4A 1I2OA 4MIMA 1JRCA 1SO5A 4NX0A 4ZQPA 3FOKA 5HNRA 1ONRA 4NJKA 2NXIA 2B7QA 3G1YA 2CLFA 1TPH1 5A8GA 3W1QA 1PIIA 3O1NA 3ATYA 4FXSA 2FPYA 3DHDA 3TNOA 2FDSA 2NZLA 2QCHA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4UTJA

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