4CQAA

Plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) in complex with idi-6273
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
373
structure length
371
Chain Sequence
FFLYDIFLKFCLKYIDGEICHDLFLLLGKYNILPYDTSNDSIYACTNIKHLDFINPFGVAAGFDKNGVCIDSILKLGFSFIEIGTITPRGQTGNAKPRIFRDVESRSIINSCGFNNMGCDKVTENLILFRKRQEEDKLLSKHIVGVSIGKNKDTVNIVDDLKYCINKIGRYADYIAINVSSPNTPGLRDNQEAGKLKNIILSVKEEIDNLEKNNIMNFLWFNTTKKKPLVFVKLAPDLNQEQKKEIADVLLETNIDGMIISNTTTQINDIKSFENKKGGVSGAKLKDISTKFICEMYNYTNKQIPIIASGGIFSGLDALEKIEAGASVCQLYSCLVFNGMKSAVQIKRELNHLLYQRGYYNLKEAIGRKHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
publication title In Vitro Resistance Selections for Plasmodium Falciparum Dihydroorotate Dehydrogenase Inhibitors Give Mutants with Multiple Point Mutations in the Drug-Binding Site and Altered Growth.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE
total genus 139
structure length 371
sequence length 373
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2014-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4cqaA00
4AWUA 3EWUA 2BSLA 4CNNA 3E12A 3G1SA 5HUOA 3VFLA 3O8AA 4NJKA 2VFIA 3W3OA 4IUOA 3C8FA 3UYCA 2Z6JA 1ZNNA 3IVTA 4O28A 1VQTA 2XN0A 1CW2A 5G4WA 3L65A 3DGRA 4BI7A 1KFBA 1PIIA 3HBLA 1C29A 4IPIA 1EIXA 4CCEA 4YWIA 2ZA1A 3W7PA 3E49A 3EKLA 3T78A 2B7PA 1EP3A 3MWAA 3KFTA 1OX6A 1SFJA 2OMAA 3HF3A 3VE9A 3BG5A 1QCWA 2E5CA 3P81A 4HKPA 3M47A 5AC6A 1ML1A 1V7YA 3TR2A 4HPJA 4FHAA 3PVFA 4O8RA 5K3VA 2EAWA 3TA6A 3FIGA 3SY5A 3TSBA 2PURA 4XKYB 1MEWA 1VS1A 2VEKA 3M5ZA 5DY3A 1XDLA 5U7SA 4AEOA 3OVRA 4ALDA 3MJYA 1R30A 4XWUA 3IGSA 4TU1A 3W83A 2ZYFA 2VFFA 1JCNA 3L0NA 3FKRA 3WK0A 4EF8A 4UIOA 1A5AA 3L66A 1HO1A 4UTWA 3N2XA 1G69A 3GB6A 3S6DA 4BF9A 3GR7A 2Y85A 1H7RA 1MEHA 1OYBA 3QFEA 3IIOA 4H3DA 3UWQA 1ZHAA 2RDTA 3N73A 1W3IA 4DXVA 3BV4A 5F1VA 3QZEA 1LBMA 2RDUA 2NZLA 3FYOA 5FEWA 1YPFA 4DEFA 3TROA 5F2GA 3W76A 1O94A 1Q45A 5D05A 2RH9A 3T44A 5MHBA 3STFA 4JS3A 1KFJA 1UUOA 4YLWA 1FWSA 3GDLA 4LC6A 4O1DA 1I4NA 3PBWA 1RPXA 1FDZA 3KAOA 1XDMA 2FDSA 2O7QA 3LRMA 5DLCA 1IXPA 2ZZ7A 1K03A 1BTMA 3TNOA 1N55A 2ZTKA 3ELFA 3HGRA 4KWVA 3M6YA 3SGUA 4IX0A 1LBLA 2I14A 5DXYA 1WQ5A 4JN6A 3TSMA 3O05A 2YPIA 1SR9A 2YYUA 4FNTA 4XKYA 3EX3A 1T0OA 2WSRA 4HT3A 2Y61A 1W5NA 5FF4A 4O4WA 1TB3A 1H7OA 1FDYA 1MEIA 5D02A 2BZNA 3RU6A 3W1AA 3KRSA 3T55A 1YPIA 4ZMGA 1VCVA 1LOQA 1J4EA 1JRBA 3SI9A 4RXGA 3TXZA 1R47A 1GTHA 4JTLA 1DL3A 4NJGA 3TU9A 1H7PA 3NA8A 3UPWA 2X1UA 4FX6M 3QW3A 3NNTA 5AHEA 4DBDA 1NF7A 4UTHA 2DZPA 3NQFA 3W7OA 2ALDA 1SO3A 2ATSA 3RFAA 1X7FA 1H7NA 2H8ZA 1F73A 4XTDA 3OVPA 1EP2A 1XFBA 3UQNA 3W7DA 4LU0A 3LI1A 1G7VA 1PV8A 4LS0A 1TPDA 3GVGA 3TQ0A 6ALDA 2QUVA 1GQNA 1G4SA 1SO6A 3W07A 3IGXA 5G1TA 2Q3OA 3EXRA 1TPC1 2V81A 3TAKA 2WNZA 4DO5A 1H62A 2R91A 4FNUA 3LI0A 3S1VA 3E02A 3K30A 1W0MA 5A5WA 1IGSA 3KVMA 4JDBA 3KX6A 5AHIA 1FY6A 1LOSA 2X2GA 3KVKA 1JUBA 2CZ5A 3RLUA 3P67A 1TYGA 3KVJA 3M0ZA 1LYXA 3MBFA 4NUWA 3WK1A 1ALDA 3NQ7A 5HQEA 3LV6A 1K7XA 2I1OA 4XBSA 4UTJA 3C3NA 4IGHA 5I3JA 1WDWA 2W0UA 2VFEA 3UWZA 3LXBA 4JTTA 5LNWA 3DHDA 3LGEA 3IEBA 2NWSA 2P1FA 1KBJA 4DBEA 1Q6RA 5IBXC 4M7TA 2NUXA 1W56A 2BTMA 4S1FA 3ZFHA 1D3GA 1RV8A 2CLEA 5FI8A 1W5OA 3PB2A 3R2GA 5BNKA 3BW2A 1UB3A 5I3KA 3OIXA 3TKFA 3DFNA 3A9IA 1IIGA 1V5XA 4FNQA 3CIWA 3R8RA 3LHUA 2QAFA 2ZRYA 1KM3A 1OJXA 1JUKA 2VENA 4YCOA 1RD5A 1P1XA 1PE1A 2HMCA 4OV9A 5KMYA 2QJIA 3I65A 3GNNA 1KM0A 3P84A 3UD6A 2A0NA 4JIPA 4K6AA 3A22A 2R14A 2FB3A 3SGZA 5EKYA 1UUMA 1XL9A 4MY1A 2CZDA 1NAL1 2EPHA 2ZDRA 1KA9F 3KRUA 3TUUA 3GKFA 2E6FA 3EX1A 1JRCA 5D2XA 5BOOA 1FXQA 3BLIA 1F7BA 4BFAA 4YXGA 4S2CA 1N7KA 3L9CA 3C2VA 1H51A 4LS1A 3MYOA 3NPWA 1JQXA 3BLFA 1XUUA 4RV8A 3W71A 4LW7A 1H1ZA 5LGXA 4O12A 4AB4A 1YADA 2YW3A 2IQTA 4YMZA 1U5JA 5AYYA 4O53A 1GEQA 2AQWA 1KM1A 5J5RA 1PCKA 4WOQA 4PL2A 3WJWA 3CT7A 3M5XA 2CLLA 4Z1DA 3U2OA 5DBTA 3EWXA 3T7VA 1KTNA 2A2IA 2WQPA 5LHEA 4O4VA 1XBXA 2DJXA 2QCCA 4GWEA 2G96A 4UTMA 3C2OA 3F1QA 4N9EA 1PCWA 3CC1A 2B0MA 1T96A 1UASA 1BKSA 3LLFA 3NPUA 2X1SA 1DQXA 5SWUA 4FIRA 1WBJA 5E93A 4X9SA 3C6CA 2NLIA 1MO0A 3LHZA 3VI2A 2RHGA 1XKYA 3LTYA 3QJAA 1YXYA 3B0UX 4E2BA 1QOPA 1I2QA 1Z44A 4BWLC 4N4PA 3UXDA 1VYRA 3BGJA 5HUPA 4TR9A 4O10A 3RNDA 5D2WA 1SU5A 4IJBA 3NL2A 3FS2A 4OE7A 3STEA 1TPUA 5F2LA 5CKSA 4PCFA 1YTKA 3F4WA 1J5TA 2H8XA 4K7YA 4UFHA 4JX6A 3B04A 2WSYA 3TFCA 1NEYA 5CZJA 4A3UA 3UXAA 1OG0A 1YTDA 3GK0A 4CQAA 1W8SA 2OJPA 4LVFA 4DPQA 4LUJA 2F7FA 1C9DA 3HB9A 3C4UA 3Q2DA 3DKJA 5CSSA 5FEPA 2FLIA 2JBMA 3KOFA 3L5AA 4RR4A 5LNSA 3U8GA 3PM6A 3W22A 5C6MA 2B7NA 3W7QA 2P0OA 1DVJA 4PTNA 4FNSA 4K8HA 1GVOA 4BWLA 3FKKA 4GRSA 2ZCGA 3P5ZA 2GUUA 2BX7A 3C2EA 3NO5A 4TMCA 2QAPA 4MJMA 3BW4A 3A21A 1X1OA 3W23A 1B57A 1GVFA 4O52A 3THQA 4AF0B 1FWWA 1QO2A 1L6SA 1FCBA 5E0KA 1TPVA 1TTIA 4NJJA 3LCHA 5CPLA 4JDYA 2C3ZA 1M5WA 5AHFA 3TQKA 5CZSA 2VEMA 2D73A 3W7LA 3PBYA 5D2TA 4A22A 2NXHA 4WXZA 4EWND 4W9TA 3MHUA 3THAA 1W31A 2VFDA 3MP5A 2YFOA 1KFKA 1LRNA 3USBA 4JTIA 2J9ZA 3GDTA 3NAVA 3B4UA 4EOUA 3LBMA 1MXSA 5D37A 3P7YA 1T99A 2P10A 3MHFA 3IRDA 3UY8A 4IMEA 3NYZA 3TJLA 4GJ1A 3SECA 3CPRA 3TW7A 4ICNA 2X1TA 1XM3A 4LOCA 3QSTA 1G4TA 2PCQA 3IVUA 1K7EA 1X8FA 2NXIA 4LRTA 1ZAJA 4MPQA 1R2TA 4FXSA 2ABAA 4MLRA 1X1ZA 3I7RA 3O06A 3DBPA 4X3ZA 3ABOA 3DFOA 2E6DA 3RF9A 4MVAA 3TV8A 3WJZA 3LBCA 3N34A 2C6QA 4M5PA 5G5IA 1ICQA 4HNNA 1O5XA 5K7JA 1GWJA 1W5PA 3PSVA 4K8EA 4UTTC 4IXXA 4UFJA 2HSAA 4RZ6A 2QKFA 3BW3A 3W2KA 4JTFA 1SW7A 1A53A 4AF0A 1QOQA 4ML9A 4QITA 4CCDA 1QPQA 3EX6A 1TQJA 5CGQA 1UBSA 3PB0A 3E0IA 5LHFA 2Z0IA 3GZ3A 4WY0B 3SFKA 2V8ZA 1I8JA 1RR2A 1SZFA 1CI1A 4YL2A 5LKYA 3PBVA 1TV8A 3TMQA 1LLZA 2QEZA 2XN2A 3INPA 4FNPA 2YZRA 5KTLA 1OABA 3MP4A 3PF3A 3LHYA 5AN7A 1GG1A 2DP3A 2NX9A 1Z48A 3LOTA 3LTPA 3S1UA 3PUDA 1HG3A 2FPVA 2DZTA 3AJXA 3IIPA 4MY8A 4DF2A 3W84A 1VZWA 5DCDA 3G1DA 3N3MA 2V9DA 1TPH1 1FXPA 2CFFA 2EHHA 3L0KA 4UTTA 5CPNA 4I7VA 4J9JA 3NEVA 2ZRVA 1A5SA 1RQHA 3QRHA 4WQ6A 3CEPA 2E09A 1TRIA 3W1UA 4JICA 3QEZA 3LHTA 3Q58A 1ICSA 1H1YA 2B7QA 3UZ5A 3PSWA 4JYDA 4UXDA 3KVLA 1NFBA 4R33A 4CLMA 5LSMA 3W1XA 1JCLA 3GKAA 1EX5A 1A50A 2HS8A 4TX9A 4WUIA 5AYZA 4AH7A 2ZRZA 1LORA 2BXVA 4Q32A 4OHQA 3CWNA 4B5NA 1G4PA 1EB3A 3YPIA 4N9BA 2A7RA 4NX5A 4I7WA 2GQAA 1ZALA 3BLEA 3E96A 5H91A 3EX2A 4A2SA 3FJ6A 1JJKA 5EY5A 5AB3A 3DFTA 4LC8A 3LCIA 5LNUA 4NX0A 2GVJA 4LVGA 4RZ5A 5LZLA 3EXTA 4LTSA 1L9WA 4UR7A 4ZQPA 1FDJA 3EWZA 4S2BA 1W37A 3HPSA 3NG3A 4WY0A 3GYEA 4HIBA 3SW6A 5KITA 2GQ9A 2G97A 2ZZ1A 2FJKA 4ADSA 5CPOA 1LLWA 3PULA 2QCNA 2Q3RA 3OA3A 4JGDA 2AGKA 1TTQA 3NQ2A 2C16A 3W88A 4GFSA 1TO3A 2FPYA 5EA9A 3LX9A 3IIXA 4PL1A 2Y7EA 3PUOA 3PUEA 1A5CA 2VELA 3NPXA 3HGSA 2YYTA 1AL8A 2CLMA 3NL5A 1U83A 4FXRA 4Z08A 5C54A 2ZQ0A 5G2WA 4UTKA 4JTGA 3MMTA 3ZWSA 1GT8A 4GUIA 1QMLA 3TC6A 3EEGA 3WK2A 1ZFJA 1K8YA 4NXKA 3G0UA 1BEUA 4IWWA 5DY2A 3QSRA 1QAPA 3CQ0A 5DCEA 2BWGA 1YDNA 3T40A 4LWWA 4HNTA 1K8ZA 3NM3A 4JTSA 4MYAA 3VKJA 1P0KA 2ZZ2A 4N4QA 4LVAA 3A5FA 1Q6OA 2Z2UA 4LNYA 1GPWA 4FNRA 5FF2A 5F4SA 4ONVA 3ZWTA 1JCMP 3P5YA 2PC4A 4N2YA 3Q37A 5U4NA 3N14A 3VE7A 1NF0A 3R5EA 3QMTA 1L6YA 3PG9A 2JGYA 3DKLA 1FWNA 3B8DA 2B7OA 4FEZA 1HO4A 4L4LA 4R7JA 4ADTA 3NQGA 1WYIA 2V30A 4FX8A 4Y8FA 3NR0A 1PVNA 2DZXA 3CLMA 2V2DA 2G95A 1FWRA 3EKZA 4AWTA 5LGZA 4RK8A 1H5YA 2OZ0A 3ZS4A 4MUZA 3R12A 3L5LA 4EF9A 2GJNA 2WOQA 1VPXA 5EPDA 4A29A 5CG7A 3OG3A 3I7SA 1VCGA 1UJPA 4RLIA 1L6WA 3HPXA 3WJXA 4GC4A 2VFHA 2E68A 2VKZG 1KTCA 3TSDA 3C52A 3HMJG 4MZYA 4NNAA 2B4GA 1QR7A 4PFMA 2ZA3A 1VC4A 2ISVA 1FQ0A 1H61A 4MFDA 1EP1A 4O1AA 4Y6GA 3MHGA 3C61A 4MLJA 4ZL1A 3B03A 2PE4A 3P8JA 1H7WA 1G4EA 1TQXA 3LRLA 4DF1A 4UR8A 4UNLA 2AAMA 3W7RA 4QISA 4A21A 2YSWA 2WPBA 2EGZA 3TE9A 2QCFA 3A5VA 3GDKA 4G1KA 2DZSA 2J88A 7TIMA 3CWOX 5EMUA 3NPVA 3MYPA 3PS7A 3UWYA 5C55A 5HINA 5AC8A 1FWTA 2WV8A 5KINA 3M1ZA 2OT1A 4OQVA 5HJLA 3NOEA 1B4KA 4N6FA 2Z6IA 1WOAA 3LLDA 4HN4A 5IBXA 1F76A 5HWNA 3W2JA 5HNRA 1Q6QA 1EUAA 3WFAA 3IV3A 2QUTA 3ABSA 2Y88A 5DELA 2C15A 3FOKA 2C1HA 2YGYA 3QQ0A 2RFGA 1YXDA 5CPMA 2PRHA 3W1RA 3W85A 5HWMA 2ZZ3A 1I2OA 1Z42A 1ME7A 1JULA 2W79A 3E9AA 2A7PA 2H3DA 3N2MA 1I2RA 4Y9AA 3TDFA 3G22A 2CLFA 3ATYA 3G1HA 1PHWA 5BMXA 3QMSA 1ZY9A 4IMDA 1R46A 3DZ1A 4EVZA 4ZQCA 4UFLA 3FA5A 3G1FA 4ZQRA 3W6YA 2NV1A 1FCVA 1TSIA 4UTIA 3W70A 4K38A 3DHFA 4BI5A 2O7SA 5IM51 4AMAA 5D09A 3QM3A 3GR8A 5KZDA 2VFGA 2QJGA 4WY0F 3TH6A 3JRKA 4O19A 3TQVA 3M9YA 1TJRA 5FESA 4PEKA 3W1TA 2CLIA 3DU0A 3R13A 3NZ1A 3DFSA 4Q33A 4QIUA 3G1VA 4RZ4A 2DZVA 4AAJA 5C2XA 4CNPA 1QPNA 2ZRUA 1WA3A 2CLKA 3H55A 4JX4A 5K4XA 1S5VA 2JGQA 4ZQOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4O8A A;  2BSL A;  4CNN A;  5DF0 A;  3O8A A;  2VJX A;  3WQW A;  1A3W A;  3SRK A;  2J7G A;  3IVT A;  3KZS A;  2TAA A;  2PTY A;  4ZGY A;  2XN0 A;  4HA3 A;  5G4W A;  1E6Z A;  3UW6 A;  5I07 A;  4NZ4 A;  4GYF A;  1EIX A;  4KIR A;  1J0I A;  4XKM A;  3MKV A;  4TTU A;  2E3Z A;  3T78 A;  3MWA A;  2XVG A;  2G3F A;  1HKJ A;  4NRS A;  1FTX A;  1SFJ A;  3MUY 1;  3VE9 A;  4HKP A;  4YYC A;  3M47 A;  1XR2 A;  2Z2B A;  3VA8 A;  3DYM A;  1MNZ A;  4HPJ A;  4FHA A;  1I75 A;  1KCZ A;  3IJD A;  3FIG A;  3TSB A;  2CCR A;  2PUR A;  5CGT A;  4XKY B;  2EJ1 A;  1MEW A;  1VS1 A;  1DIE A;  2VEK A;  3R10 A;  4M8U A;  4PSR A;  4ZST A;  4AEO A;  4F8X A;  4ALD A;  4TU1 A;  1HKI A;  4BF5 A;  2EBN A;  4OBR A;  2WHK A;  3SCQ A;  4A4A A;  1JCN A;  5CQ1 A;  4EF8 A;  1W3J A;  1A5A A;  2Z1S A;  3L66 A;  3CYV A;  3Q4D A;  1Q4N X;  3U7V A;  4IIS A;  2Y85 A;  2QVH A;  3KBS A;  3UWQ A;  2RDT A;  3N73 A;  5A2B A;  4DXV A;  3MCM A;  1LBM A;  2RDU A;  2WMK A;  3VC6 A;  3T44 A;  4E2O A;  4NRR A;  1KFJ A;  4PRT A;  1T5A A;  1Y65 A;  2C79 A; 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