4F79A

The crystal structure of 6-phospho-beta-glucosidase mutant (e375q) in complex with salicin 6-phosphate
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
478
structure length
478
Chain Sequence
AMSKLPENFLWGGAVAAHQLEGGWQEGGKGISVADVMTAGRHGVAREITAGVLEGKYYPNHEAIDFYHHYKEDVKLFAEMGFKCFRTSIAWTRIFPKGDEAEPNEAGLQFYDDLFDECLKYGIEPVVTLSHFELPYHLVTEYGGFTNRKVIDFFVHFAEVCFRRYKDKVKYWMTFNEINNQANYQEDFAPFTNSGIVYKEGDDREAIMYQAAHYELVASARAVKIGHAINPNLNIGCMVAMCPIYPATCNPKDILMAQKAMQKRYYFADVHVHGFYPEHIFKYWERKAIKVDFTERDKKDLFEGTVDYIGFSYYMSFVIDAHRENNPYYDYLETEDLVKNPYVKASDWDWQIDPQGLRYALNWFTDMYHLPLFIVQNGFGAIDQVEADGMVHDDYRIDYLGAHIKEMIKAVDEDGVELMGYTPWGCIDLVSAGTGEMRKRYGFIYVDKDDEGKGTLKRSPKLSFNWYKEVIASNGDDI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus mutans
publication title GH1-family 6-P-beta-glucosidases from human microbiome lactic acid bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative phospho-beta-glucosidase
total genus 183
structure length 478
sequence length 478
ec nomenclature ec 3.2.1.86: 6-phospho-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2012-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4f79A00
3WD1A 4CCDA 4J3SA 2RGMA 3AMLA 3PZGA 2XFYA 3AZRA 1UD8A 5EFDA 1HXJA 2WHMA 4PCTA 2RGLA 4W93A 4AXNA 1XD0A 2VX6A 2VOTA 1U2YA 1JZ6A 2GDVA 2XIBA 3ARUA 3FN9A 2BHUA 1GOQA 2VCAA 1QOXA 2AOSA 3AZSA 3IAQA 2CKSA 4J3UA 1E4LA 2IXUA 5CSYA 3WN6A 1VFUA 3KZSA 3I3BA 1MXDA 1WB0A 4UQEA 1US2A 3GYCA 4R5EA 1J9YA 1B1YA 1DP0A 5I78A 3VIKA 2D0HA 1QNRA 3AIWA 2Q8XA 2ZWZA 2XGIA 1C3FA 2G3IA 3AICA 2VR5A 1R85A 3RM4A 4GO9A 5CLTA 3ARPA 3GXDA 4FF5A 4NRRA 4UFMA 1GCYA 3WEMA 1HJXA 1KXQA 2O9TA 1TVNA 3ZIZA 2VC9A 5FCZA 1MW2A 2WLYA 1E4NA 3TOPA 2WKGA 1D3CA 5ABGA 4LYRA 5HNNA 4AZGA 3QOKA 5D9OA 1KGUA 3AISA 4AZBA 1BLIA 4HU0A 1V3JA 2PWGA 5A6BA 5AY7A 3VGHA 1JZ7A 2CBIA 4CD8A 4HMEA 4Z2IA 1GVIA 2UY5A 3TTOA 2CBVA 1MW1A 2D23A 2V3FA 2ZX5A 2VZVA 4RE2A 2BY1A 1I1XA 5M3WA 1KGXA 1JI1A 1SFSA 2FHBA 4CCCA 4X0VA 4JCLA 4PTMA 3U5UA 1NM9A 1UD3A 2IXVA 2QPSA 4GI8A 1CENA 1BHGA 1Q6CA 1GOOA 3EDKA 3W0KA 2ZUVA 4CUCA 1UR8A 2NT0A 4J3TA 1UR1A 3W29A 3O9NA 2V3EA 2E0PA 1CXIA 1XC6A 2E4TA 5FIPA 1NOWA 2J7GA 2ZXBA 1B0IA 3N04A 3VKKA 1KXVA 3QHMA 3WD0A 4BA0A 1BAGA 2CHNA 3K8LA 1SMDA 1KQZA 4QFUA 4AD4A 5ECUA 3U7VA 3NIYA 5FOOA 1QHPA 3B9DA 3CZLA 2DH3A 4DWSA 2W61A 3MUAA 1CEOA 1Q6FA 1M04A 1CGUA 4OBRA 4AEFA 4W5ZA 3RMEA 1CGWA 1NQ6A 3U57A 1J01A 2E9BA 2Y5EA 1MQRA 1V6UA 1UA3A 4PTXA 4L4PA 3OLGA 1QVBA 4WF7A 3W38A 1CXHA 2YDQA 4OJYA 5HPOA 1GOKA 5D9MA 2V5CA 3WY1A 3OGRA 3W37A 3KEHA 3HN3A 4LX4A 4W8LA 2ZUWA 3VIOA 2BHZA 4M81A 1CDGA 1E0XA 1UQYA 5GQBA 4MB3A 4F66A 1OBAA 1V3HA 1NP2A 4PYSA 2Y4SA 5CJ5A 4A4AA 3L4XA 3ALFA 3BLPX 4MTVA 2W5FA 3L2LA 1C7TA 1H41A 1BF2A 4DUXA 5M17A 5F7UA 2IUZA 3WF2A 2J75A 1J0HA 1M7XA 3I3EA 1GUVA 3ZMRA 2FH8A 2VCCA 1LG2A 5A8PA 1B9ZA 2YKKA 1EGZA 3UESA 4W84A 2VCBA 3L4WA 2EPNA 1E6XM 1CXLA 3CMGA 1JL8A 3T09A 4OZOA 4FK9A 1SYTA 1E71M 1B3WA 2PWEA 1QW9A 4D71A 3SCSA 1UD5A 3BC9A 4P8UA 2W63A 2CCRA 4JKKA 2Y8KA 2WC3A 4XZWA 3BAXA 4ML4A 3WMBA 5D8ZA 4PMNA 2AMGA 4D6DA 1CGYA 4BF7A 1KR1A 3AFBA 1W1YA 1XH0A 4MPKA 3NSNA 3VGFA 3GNOA 1CZ1A 2YOCA 1UH4A 1E6PA 3WNKA 2X8RA 1EHAA 5IFPA 4Z2LA 7CGTA 1TA3B 3OIHA 4PSRA 4W85A 3WQ8A 4JFVA 1ZBCA 1AMYA 4AZ5A 5A6BD 1WZLA 1P6WA 1E70M 3VM7A 3VINA 4QP0A 1C90A 3B9AA 1GHRA 1QNOA 1VJSA 4U31A 4AIUA 2VURA 1E3XA 1LJYA 3SCVA 3ZT6A 3OZOA 1RH9A 1X6LA 3AS3A 1E1EA 2W4XA 3MV11 2WVTA 1EIBA 2WC4A 1UZ4A 2HVMA 5JBFA 4CD6A 2VX5A 2BXYA 3VDHA 2YLLA 3VU2A 4NI3A 1OGBA 3L4TA 2CXGA 4W7WA 1C8YA 1GZJA 3ZQ9A 4D6FA 1E6NA 2C7FA 1ZBWA 1HP5A 4H8HA 4XUYA 2CITA 2FHFA 3K1DA 3L2MA 1HKKA 2WMJA 3AMGA 3OLEA 5HXMA 1K9TA 2ZOXA 1UH2A 4U2YA 4ZEPA 1CIUA 4TUFA 5A8QA 1A3HA 1DWAM 2XVLA 4BS0A 4DWSD 3QHNA 3AMDA 4A3HA 3WD3A 4MNMA 5IDIA 1UD6A 1GPFA 4QCFA 1BPLB 3OLIA 2PWFA 2GJRA 3RJYA 3J7HA 1G94A 1O7AA 1E5JA 1EDQA 1PX3A 2JALA 1EOKA 8A3HA 2J47A 2VL4A 1FFQA 4X9YA 4OKDA 2TAAA 3AHXA 1E72M 3N1AA 3AJ7A 1CWYA 5GNXA 3ZOAA 1UWQA 3WEOA 3CZKA 5BYWA 4P8WA 3KWXA 3AMKA 4HA1A 4P7OA 5DFAA 1EDGA 5KEZA 1HX0A 1I75A 1E4IA 4M1RA 4JL1A 4M80A 2FHCA 4AZ6A 5BXSA 2YA1A 4P8XA 3CIVA 3WQ5A 1LL7A 3CZEA 4J7RA 4PTWA 3HU7A 3IJ7A 2WMHA 2VJXA 1ISZA 2PWDA 3CLWA 1K9DA 1WDRA 3SUTA 2EBNA 3SCTA 4FLSA 3ECQA 2OSWA 4AWEA 1QNPA 2PBGA 1H11A 2WVVB 3VDBA 2XM2A 1WZKA 1W1VA 3CZGA 1VJZA 3EDDA 4GI6A 1B30A 1KR0A 1Q6GA 5E0FA 3SUSA 1ODUA 4K68A 5BCAA 3CZ8A 1PJ9A 4HU8A 4YHEA 3BH4A 1V3MA 1UD2A 1R87A 2UY2A 2WZIA 4ZXLA 3MMUA 1DWHM 4ZXOA 3ZR5A 5JIPA 3MS8A 1HKMA 1B3ZA 2X2YA 5IFTA 1BQCA 1C7SA 2B31A 2DEPA 2YDSA 1G0CA 4C7DA 2G3NA 4PMQA 1UWUA 4PRWA 1C8QA 1UYQA 4ACZB 3WF1A 1K9FA 2E8ZA 5IXEA 3K46A 1JNDA 2O9RA 3PTMA 2JIWA 1J0IA 1JF5A 3A4XA 3AYSA 3GBEA 3T2OA 4OOZA 5KZ6A 2VMFA 4B9YA 1R8LA 2WHJA 2DSVA 4FLOA 1MW0A 1NARA 3GBDA 4QLJA 1QBAA 4WKAA 2QPUA 1XGZA 2D0FA 3PTKA 2CERA 4WKFA 1QW8A 3TONA 1NWRA 3WMSA 1OIMA 2D3NA 2EPKX 3WBEA 1FFRA 2XGBA 4W7UA 1OGSA 4S3JA 3U7BA 4PTVA 1AVAA 1EQCA 4OUEA 5C70A 4D6IA 2ZUMA 2D0GA 1KGWA 3F4VA 3ZT5A 3AXXA 4B3LA 4HPHA 2XVPA 3OG2A 3DHPA 1TR1A 4ACYA 4Z2KA 2XHYA 3RDKA 4L4OA 2EXOA 4PBGA 4QCEA 1W9UA 1DEDA 1BGAA 4PCSA 1E73M 3BAWA 3WNMA 3WNNA 1UHVA 3EMZA 4HZ8A 5CLWA 3SCOA 1V0NA 2ZE0A 2CEQA 4E8CA 4XV0A 4BQ5A 3AROA 3SCPA 3THCA 2YL6A 3RO8A 4E4PA 1V0MA 3BGAA 4AIOA 3GZAA 3WMCA 5M5DA 3AS1A 5AYBA 1OGGA 2JEQA 2V3DA 5AYIA 3VM5A 4DM2A 1AQ0A 1HJWA 2J7EA 3A6OA 5JBDA 1FH9A 3POCA 1JDAA 2QV4A 1L0PA 3RM9A 3BMVA 4MB5A 2J7HA 5E6ZA 3WIJA 1W1TA 2BHYA 2WZEA 4PMYA 4H2CA 2CESA 1ITXA 5I23A 2CYGA 5A2AA 3VD7A 1W2VA 2WMIA 2UY4A 5A6SA 4MNJA 4W8AA 3T08A 2FGZA 1KBBA 2XSAA 3ARSA 4AD1A 1W9VA 1G01A 1UWSA 3LPOA 2GK1A 4Y7EA 2EPOA 2YA2A 3VDAA 2ZIDA 4UNIA 3CUJA 3M46A 1UKOA 3PHAA 4B15A 1UA7A 3T2QA 1V08A 1HVQA 1J0KA 5HOSA 3ZSTA 2V3GA 4MB4A 1DWJM 2W67A 2EQDA 5IHRA 2WZHA 3PZUA 3W53A 4ATLA 1WKYA 4HMDA 3VVGA 1ZJBA 3LMYA 4KGLA 2WPGA 3AHTA 2QMJA 1HNYA 3RILA 1JYVA 4PMOA 1PEZA 3CBWA 2C0HA 3FY1A 3CUFA 5I6SA 1MFUA 1DHKA 1GONA 1TFVA 1XYZA 3M07A 3ZR6A 3AIUA 1DWFM 2ZICA 3WUBA 2DPEA 1F4HA 2JEPA 3WSUA 1HKIA 3WDRA 2BS9A 1GVYA 3WUFA 3FHAA 3D3AA 1PX4A 2GUYA 2XWEA 1Q6EA 5DO8A 2NSXA 1X6NA 3T2PA 3VIIA 5JIWA 3THDA 3AHYA 1VIWA 1TVPA 1C91A 2YBUA 5CGMA 1V6WA 1UOKA 1MW3A 2A3EA 4WJXA 5CSUA 4IM4A 4JAWA 3VMNA 3IK2A 2WYSA 4KMQA 1HJVA 1E6ZA 4HOXA 4XB3A 1QNQA 5I5RA 5EB8A 1CECA 5A6AA 4HPGA 1JZ8A 4V2XA 2F61A 3AXIA 5I77A 4R27A 3ARWA 1XRVA 4U3CA 4TXEA 3WDJA 2D2OA 4AY1A 2XVGA 4DM1A 5LA0A 4D6HA 4ZFMA 4ZE4A 2VUYA 3PZVA 1CLVA 3FAWA 1WDQA 3VGBA 1B3VA 4UQBA 4YPJA 6CGTA 2WWDA 1UD4A 4CN4A 2G41A 1H0IA 3O6AA 3UR8A 5FKYA 3CO4A 1RD6A 3ARYA 2HISA 2BFGA 4GZEA 1TE1A 1V6VA 1FH8A 2XTKA 2ESCA 1PIGA 1FA2A 3EDFA 4LYPA 2XVKA 5A6KA 2WXDM 3LPPA 2A3HA 4PMVA 5DEZA 2VVSA 4AYSA 1HJSA 3VMOA 2OWXA 4WKHA 1XCXA 2ZXAA 2CNCA 1CBGA 3CUIA 4B3KA 5I2UA 3LPGA 2BVDA 2VR4A 1J0JA 1W3HA 1EO5A 4EKJA 2BY3A 3W82A 1J0YA 2XFRA 3NSXA 1JZ3A 5LYRA 3KL0A 2X0HA 2VX4A 4ZENA 2WVVA 3EMCA 4M29A 4MAZA 3KL3A 4P7QA 4OIFA 1VF8A 2QLYA 3N11A 5CPTA 1H4PA 2ZWYA 1GQIA 4C7FA 4UFLA 1EA9C 4MDPA 4U2ZA 4M56A 1JYNA 1R7AA 1XD1A 1V6YA 4AZCB 4UOQA 6A3HA 5D9NA 2X1IA 2PI6A 3RPMA 2WMFA 4NZCA 1GOMA 4ACZA 5E0CA 1MYRA 1GQLA 3FNDA 1UQZA 5A8OA 2OYKA 1OT1A 2WANA 3VNZA 1BFNA 2XYLA 1JYXA 3BMWA 2VVNA 1XCWA 4FLQA 3SUUA 4JFUA 5HDRA 4AD3A 1J10A 5A3HA 1KXHA 1XV8A 1QI3A 4MJ2A 3AXHA 2A3BA 3T0DA 4BQ3A 4WIWA 4W7VA 5ABHA 2VZTA 2GJXA 1WDSA 4GI9A 1ODZA 2XIIA 5EFFA 2VZUA 3G6MA 2EEXA 2CIPA 1LWHA 3SCQA 1CPUA 1LLOA 3MSDA 4AD0A 1CTNA 5A1AA 3IJ9A 1FHLA 2J74A 1ISYA 1GJUA 1QI4A 2WBKA 3W27A 4AMCA 1YHTA 1TCMA 1YQ2A 2W62A 3DHUA 3QOMA 5ABFA 2BY0A 1QBBA 3VOCA 1ZJAA 5BRPA 3NUKA 1CNVA 1JXKA 1HL8A 1K6AA 1BYAA 5A6MA 1B3YA 2Z1KA 3WD4A 3CTTA 1MQQA 1VB9A 3CPUA 3PTQA 2WSPA 3TA9A 3N9KA 1QNSA 3VX0A 2EPLX 3BCDA 4URIA 7A3HA 1V0KA 1KWKA 3SCRA 4PMDA 4V28A 5GNYA 3VUPA 2OSYA 2CBUA 5BROA 4HP5A 3OBAA 1C92A 4IISA 1PZ3A 2F2HA 3NDZA 3AMCA 1KQYA 1C93A 1WZMA 2OWCA 1CXEA 3WH6A 4JFWA 3UG4A 1KBKA 2GSJA 3NJ3A 4EK7A 2BNJA 3PN8A 1XH1A 3GXMA 4QDMA 1E6RA 4AIEA 1JIBA 3M7SA 4CN1A 1WNOA 4HTYA 1W3KA 3WQVA 4CU6A 3PZ9A 5JBEA 1EH9A 5E9AA 1QHZA 4CU7A 3VD9A 4UTFA 3AS0A 2DIEA 2J7FA 1HVXA 3BAJA 1OINA 2CETA 2DIJA 2W92A 3VIGA 3CH9A 2J8FA 3AHVA 1NOFA 1UR0A 4F8XA 3F5LA 1DWGM 1Z32X 3VPLA 1JD7A 4ATWA 2OWWA 1ZBKA 4PN2A 3MMWA 3SUVA 2J7CA 3WQWA 5JUVA 3GDBA 1R7OA 3W6LA 3OGVA 2ZUSA 4F9DA 4DWSB 2J7DA 4UFHA 3WUEA 5HPCA 4LYQA 1H1NA 2ZXDA 1VFFA 4OOUA 1W1PA 4NF7A 1W2PA 3UG3A 4NSBA 2Y2WA 1H09A 1PX8A 3VIMA 1XSIA 2WM0A 1HKJA 1HN1A 1B3XA 3K4DA 4IPLA 1A47A 3WKZA 4UQAA 4A3YA 3PZOA 1E0VA 2EJ1A 3VDCA 3AZTA 4IPNB 3T0AA 3W25A 4MB1A 4EAMA 4UQCA 5CZKA 5LA1A 1OM0A 1XSKA 1V02A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3WD1 A;  4CCD A;  4J3S A;  2RGM A;  3AML A;  3PZG A;  2XFY A;  3AZR A;  1UD8 A;  5EFD A;  1HXJ A;  2WHM A;  4PCT A;  2RGL A;  4W93 A;  4AXN A;  1XD0 A;  2VX6 A;  2VOT A;  1U2Y A;  1JZ6 A;  2GDV A;  2XIB A;  3ARU A;  3FN9 A;  2BHU A;  1GOQ A;  2VCA A;  1QOX A;  2AOS A;  3AZS A;  3IAQ A;  2CKS A;  4J3U A;  1E4L A;  2IXU A;  5CSY A;  3WN6 A;  1VFU A;  3KZS A;  3I3B A;  1MXD A;  1WB0 A;  4UQE A;  1US2 A;  3GYC A;  4R5E A;  1J9Y A;  1B1Y A;  1DP0 A;  5I78 A;  3VIK A;  2D0H A;  1QNR A;  3AIW A;  2Q8X A;  2ZWZ A;  2XGI A;  1C3F A;  2G3I A;  3AIC A;  2VR5 A;  1R85 A;  3RM4 A;  4GO9 A;  5CLT A;  3ARP A;  3GXD A;  4FF5 A;  4NRR A;  4UFM A;  1GCY A;  3WEM A;  1HJX A;  1KXQ A;  2O9T A;  1TVN A;  3ZIZ A;  2VC9 A;  5FCZ A;  1MW2 A;  2WLY A;  1E4N A;  3TOP A;  2WKG A;  1D3C A;  5ABG A;  4LYR A;  5HNN A;  4AZG A;  3QOK A;  5D9O A;  1KGU A;  3AIS A;  4AZB A;  1BLI A;  4HU0 A;  1V3J A;  2PWG A;  5A6B A;  5AY7 A;  3VGH A;  1JZ7 A;  2CBI A;  4CD8 A;  4HME A;  4Z2I A;  1GVI A;  2UY5 A;  3TTO A;  2CBV A;  1MW1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3WD1 A;  4CCD A;  4J3S A;  2RGM A;  3AML A;  3PZG A;  2XFY A;  3AZR A;  1UD8 A;  5EFD A;  1HXJ A;  2WHM A;  4PCT A;  2RGL A;  4W93 A;  4AXN A;  1XD0 A;  2VX6 A;  2VOT A;  1U2Y A;  1JZ6 A;  2GDV A;  2XIB A;  3ARU A;  3FN9 A;  2BHU A;  1GOQ A;  2VCA A;  1QOX A;  2AOS A;  3AZS A;  3IAQ A;  2CKS A;  4J3U A;  1E4L A;  2IXU A;  5CSY A;  3WN6 A;  1VFU A;  3KZS A;  3I3B A;  1MXD A;  1WB0 A;  4UQE A;  1US2 A;  3GYC A;  4R5E A;  1J9Y A;  1B1Y A;  1DP0 A;  5I78 A;  3VIK A;  2D0H A;  1QNR A;  3AIW A;  2Q8X A;  2ZWZ A;  2XGI A;  1C3F A;  2G3I A;  3AIC A;  2VR5 A;  1R85 A;  3RM4 A;  4GO9 A;  5CLT A;  3ARP A;  3GXD A;  4FF5 A;  4NRR A;  4UFM A;  1GCY A;  3WEM A;  1HJX A;  1KXQ A;  2O9T A;  1TVN A;  3ZIZ A;  2VC9 A;  5FCZ A;  1MW2 A;  2WLY A;  1E4N A;  3TOP A;  2WKG A;  1D3C A;  5ABG A;  4LYR A;  5HNN A;  4AZG A;  3QOK A;  5D9O A;  1KGU A;  3AIS A;  4AZB A;  1BLI A;  4HU0 A;  1V3J A;  2PWG A;  5A6B A;  5AY7 A;  3VGH A;  1JZ7 A;  2CBI A;  4CD8 A;  4HME A;  4Z2I A;  1GVI A;  2UY5 A;  3TTO A;  2CBV A;  1MW1 A; 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