3W1T | Genus

Total Genus 103

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	103
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-3-095 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus	103
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2012-11-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w1tA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w1tA01

3W07A 1ADOA 1IIHA 4NXSA 1NF0A 3NL3A 5TIMA 3UWUA 4OGZA 2ZTJA 1OYCA 1A5CA 5AC8A 1PHWA 2X1RA 4A3UA 4NXKA 1VS1A 4BFAA 4AF0A 4WY0F 3RFAA 4IUOA 3GB6A 2QF7A 4UCGA 3PBVA 1F7BA 1MEIA 3NQ6A 4IJBA 4KWWA 4LVBA 4DBDA 2V81A 3W86A 2WSYA 3HGJA 1AW5A 3ABQA 2ZZ1A 1X1OA 2RKXA 2E77A 2CLOA 3TXVA 1BTMA 3W1TA 1PL9A 3B0VC 1I4NA 4HSOA 3CM4A 4M7TA 4BR1A 3LCHA 4O10A 3G1SA 2ZZ7A 3W1LA 2VFIA 2DZTA 4WOQA 3FIGA 5HMSA 1R2SA 1P0NA 2NXIA 4LT9A 4O4WA 4OU1A 1QPNA 1WBHA 3GVGA 4O19A 4LTSA 3DXIA 1DOSA 1V5XA 2I1OA 4MFEA 1DQXA 4WZHA 4FNSA 3TW6A 2ZTKA 1X7FA 4RLIA 3W7IA 3SECA 3PBWA 3E0IA 3MP3A 3G18A 1HUVA 3B05A 3W87A 1XBVA 1EWDA 3VI2A 1MZHA 3N2XA 4M6VA 2QR6A 5F2MA 4PCFA 5AHIA 3STFA 3WJXA 1N55A 3ZS4A 5J5RA 1KV8A 1X1ZA 1IGSA 4Q32A 1YTKA 3VFLA 1AK5A 1SO3A 4POCA 5DBTA 4N6EA 2YFNA 2ALDA 3P60A 1RQBA 5DY3A 4CLMA 5AHLA 1A5BA 1B4KA 4M5PA 3UWZA 3NXFA 3LBCA 3AO0A 1W37A 3TIMA 3LLDA 4MZ8A 3B04A 4IMCA 2WO5A 4PA8A 1GQNA 1RQHA 4S2CA 5A8GA 3O6CA 1TQJA 4XBSA 5LNSA 5G4WA 4MLJA 1AL8A 3N2MA 5K9CA 3TC7A 3A23A 2A85A 3THAA 3QMRA 2Q3OA 3N14A 2ZRVA 2B7PA 2RDWA 1SSDA 1PS9A 3VE7A 1YTDA 2V9DA 3L0NA 3NEVA 3W73A 5AOUA 2R8WA 3W7GA 1SO6A 1MEHA 2X1SA 3A21A 1H7RA 2FFCA 2J9XA 4FHAA 1AW2A 5D2WA 3NG3A 1RZMA 3G0UA 3CWOX 3H53A 3OVQA 3W7CA 1LP6A 3C8FA 4O53A 3ABOA 1KFLA 1ZALA 5FESA 4JDBA 1THFD 4N9EA 3ZWSA 1NSJA 2WOQA 4ZQNA 4N4PA 4N9DA 1M7OA 3NL5A 3UD6A 4AH7A 3MYOA 1X6UA 5E0KA 1KBIA 3TMQA 4K39A 3MHGA 2YX0A 3S5YA 1OFRA 3O16A 3R8RA 3W7EA 4WX2A 1LBMA 2NV2A 5G2HA 1JRBA 3W7QA 3SY5A 2FTPA 4LV4A 1C9DA 1RR2A 1T0OA 3HJZA 2E6DA 3R5EA 5D33A 2V5LA 3UQNA 1W0MA 3E96A 3QW3A 1H7WA 4JTIA 1D3GA 4UFHA 4JTHA 4UTHA 5K3VA 3UWYA 3JR2A 1LBLA 3NQFA 2BWGA 4BK9A 1DV7A 4LS0A 2NWRA 4PEKA 3FJ6A 1KM4A 2BLEA 2CLEA 1UUMA 1R47A 1YDNA 5C6MA 3ZWTA 4M6PA 3LDVA 2NUYA 3BVJA 2V8ZA 3HG4A 2CFFA 1LCOA 4P61A 5I3HA 2QJGA 3G22A 5DCDA 1I2QA 2ZDRA 2ZRYA 4OV9A 1V7YA 1FWWA 4ZQMA 4W9TA 3KAOA 5I3JA 1UCWA 2GQ8A 2QCDA 5IBXA 1G7UA 5DCBA 4LU0A 4H6KA 1QOPA 2FQIA 3BW4A 3CWNA 4HHPA 4PFMA 3TAKA 3UWWA 1TYGA 3LCIA 1OYAA 1TV7A 2OCZA 4P2VA 3TKFA 1HTIA 1TJPA 1QFEA 5AFDA 4FNUA 3TA6A 3NPUA 3MP4A 2DJLA 1IXQA 5D2TA 1LROA 2GUUA 5AYYA 5BMXA 1TO3A 3HGSA 4O57A 1B57A 4UTTA 3JRKA 4HT3A 1DKWA 1H61A 1JUBA 3NAVA 1VCFA 2NXHA 3LRMA 3I7QA 2A2IA 3NQDA 1LZOA 4EOUA 1LOQA 3G1XA 1ICSA 1BEUA 4MLRA 1DBTA 1LOLA 4U28A 2D73A 1FCBA 4MUZA 4DPPA 4LRTA 6TIMA 3IIVA 4LS1A 4GC4A 2QEZA 4DXVA 2Y7FA 4GUGA 1ZAIA 3W7PA 4JTKA 4QITA 2X16A 5EYWA 2P1FA 1KW1A 3L5AA 3EWXA 3CIWA 4ZVJA 4DF2A 3QM3A 5IBXC 1Q45A 3HPXA 1K8ZA 3G3DA 1YPFA 3B06A 1W3NA 3A5FA 3STEA 4C1LA 3W85A 3G1YA 3DBPA 3KRUA 4OWGA 1Q6LA 1B9BA 1LRNA 3NQAA 4YLWA 3W2UA 3S5NA 4Y9AA 3MI6A 1VH7A 2QCDB 3FLUA 3WJSA 2EAWA 5HR6A 1T8XA 3L67A 4UTUA 1W3IA 4FXSA 1J4EA 3ZFHA 4E38A 4UTTC 3MWAA 3W70A 3EXSA 1L6YA 2X30A 5AHNA 5LNVA 2I14A 3FS2A 4DEFA 4XTDA 1SZGA 1QAPA 2NX3A 3G1DA 5DELA 5AYXA 4OHQA 1H1YA 3L66A 4N2YA 5BOOA 1W5OA 2RHGA 4MKNA 4LW7A 1RQEA 3LHVA 4G1KA 3NGJA 1KFCA 3FKKA 3A9IA 3NVTA 3W3OA 1OK4A 3LX9A 1U83A 1Z44A 3M9YA 3S0CA 3PS7A 4O4VA 3SR7A 3GAKA 1DHPA 5EL1A 3V75A 4DELA 3OVRA 1KM0A 1GZGA 2C19A 2J9YA 1N8FA 2WQPA 3MYPA 1R30A 2EGZA 3L9CA 4JTGA 3G1VA 5ABTA 3DENA 3EKLA 3HGRA 1EUNA 2DJXA 3L0GA 4YL2A 1PHQA 2CZEA 1FCQA 3KFTA 4YXGA 2A1YA 3OIXA 1UJPA 5DLCA 2QJIA 5EKYA 1H7XA 4BWLA 3WJYA 1MO0A 3TFXA 3HO8A 1GVFA 3A24A 2BXVA 1HG3A 4HIBA 2VFGA 1H51A 3TU9A 3BLEA 5DBUA 4YCOA 2YDAA 3DHDA 3NQ7A 1YTEA 4R33A 3W7OA 5KZDA 3RNDA 1H60A 4NX0A 3C2RA 1L2UA 1RVGA 3T40A 3CC1A 3VCRA 3C2EA 4MJZA 5IM51 4QM1A 3DI0A 3HOJA 2YZRA 3EXTA 1OFPA 3UNDA 4ZQPA 1KFEA 1YYAA 2XFWA 4NUWA 1PVNA 3QW4B 3ATZA 1AMKA 1X8FA 2Q3RA 2PRMA 2ISSA 3HF3A 4NZJA 1EUAA 2CW6A 1DL3A 1H5YA 2BX7A 2H3BA 5KTLA 2Z2UA 1YDOA 4JIQA 1OHLA 2WV8A 1EA0A 2NUWA 2Z6JA 3WK0A 3EX2A 4UFKA 1O94A 2CLMA 1LRQA 2YW3A 3M5YA 5AYZA 3TUUA 2GJNA 3QQ1A 3W75A 4OV4A 3C3NA 3W7JA 4MYXA 4M19A 5G2IA 3QMSA 5F4WA 1C29A 5CKSA 4I7UA 4ZMGA 2QCCA 2NZLA 4CCDA 4B5NA 3CT7A 5K4XA 4I7WA 2H8ZA 5G5IA 2AGKA 5LSMA 2JK2A 4RX0A 1EEPA 1BKSA 4JTTA 2QCFA 3LCLA 4EF9A 2NX1A 2YR1A 2YXGA 4NNCA 5I3IA 1K8YA 1EP3A 2NUXA 2B7NA 1WAUA 3NYZA 2A21A 4WXZA 2YW4A 3LB0A 3GYEA 1QNVA 4ICNA 1P5BA 4N9BA 3M47A 1JRCA 1OFQA 4NX5A 3LXBA 2DZSA 2X1UA 3CB8A 3GDKA 5CPNA 2TYSA 1MEWA 4Z1DA 1OJXA 3KVJA 1L6SA 2CLIA 1FXPA 1FBAA 4QQ3A 3LHUA 3HB9A 3Q58A 4JR5A 4GUHA 4K7VA 3P8IA 3PBYA 2CLFA 5DXYA 5AB3A 3NL6A 3KOFA 4AVFA 3MHFA 3GDMA 4GUFA 4QNWA 1CW2A 3BV4A 4HPXA 4M6QA 5TQLA 2JKEA 3M5XA 2QCEA 1TREA 2RFGA 1FQ0A 5C55A 3W22A 1KLYA 3EB2A 4LNYA 3M5ZA 4UTLA 4AEOA 3MBDA 2ZCGA 4YCPA 2H6RA 5AN7A 1DORA 4MIMA 4MZ1A 3LHWA 3PM6A 4Q33A 2NXGA 1SO4A 4HNUA 1LBFA 4E2DA 1VC4A 1NFBA 4HN4A 3C56A 4JN6A 2XN0A 3VNDA 2QCMA 1ZENA 1YADA 4IX0A 4RXFA 5F2LA 5D2XA 3WK3A 3YPIA 3LHYA 3INPA 4GNJA 1SO5A 4RKAA 3QEZA 3L68A 4L4LA 2TSYA 4PC8A 5F2GA 3DFQA 2Y7EA 3CPRA 4XBKA 1K3UA 2GVJA 1DVJA 3GKAA 2E1DA 1WOBA 5AC7A 1BWLA 2FPTA 1F76A 3KX6A 3GNNA 5FI8A 3GDRA 3DFOA 1KM3A 4MVAA 2HTMA 2BTMA 1XC4A 2XN2A 3W74A 1FY6A 1H7OA 5LHEA 1OABA 4Y8FA 4FX8A 1GVQA 4LVAA 1KTBA 5K2ZA 4UC5A 4R7JA 1SW7A 3W7DA 3DAQA 1VYRA 2J27A 2H3DA 2J6XA 1OFEA 4K36A 3QC3A 4NT0A 5LNRA 1XDLA 2B0MA 2R14A 3LERA 5AHMA 4IMGA 2A7PA 3P74A 3PUDA 4AF0B 4FIRA 3UPBA 4GRSA 2GQAA 3UYCA 3UPWA 3B8DA 3TK7A 4RZ6A 1F5ZA 4JTJA 3PULA 2ZZ2A 2NX9A 3F4WA 1VHCA 2A0NA 2OT1A 1XDMA 2OMAA 1R2RA 3LCXA 4XTIA 4AMAA 3BW3A 4X9SA 3TC6A 3A5VA 2PC4A 1G6CA 3BLFA 1F6PA 1K7EA 3G1HA 5EBUA 5U7SA 2GQ9A 2W79A 3L2IA 5FEWA 1CI1A 2AQWA 2E5DA 2FPYA 2QDHA 2WPBA 3PG9A 2UV8G 3QYQA 2FJKA 2JGYA 3E02A 1A53A 1NVMA 4MJMA 1A50A 1WQ5A 2B7OA 4LOCA 3D0CA 3S1WA 4TMBA 5FF0A 5DCEA 1I2OA 2ISWA 1FDZA 3NQ8A 5I3KA 3LM7A 4LWWA 3KVKA 1F05A 4RXGA 2QCLA 3MHUA 4MOZA 1K8XA 3P8JA 5FF3A 1TRIA 3NZ1A 3TAOA 5EY5A 4O14A 4BF9A 4ADSA 1W1ZA 3DGRA 4K6AA 1Y0EA 4FNQA 3NA8A 1OFAA 3LTSA 3CTLA 5HINA 4K37A 4FF7A 1WOAA 2DP3A 1F2JA 4ADUA 5HWNA 2WNNA 1IXPA 1IIGA 3S5ZA 2XN1A 2VC6A 3M6YA 4LY8A 4RJEA 1TPC1 2CWNA 3DKLA 1FWSA 4PL2A 1W3TA 3P5ZA 3P5YA 5E93A 2W6RA 3PVFA 2Y85A 5E1QA 3MUXA 4QISA 4OBTA 3HPZA 4K8HA 2QAFA 3A22A 1UASA 2QJHA 2R91A 3NQ2A 3SW6A 3P84A 3M1ZA 5D03A 1IXNA 4Y96A 1ICQA 5F4XA 3S1XA 1RD5A 3W9ZA 2C6QA 4DBEA 3GK0A 3W2KA 5C5YA 4X2RA 3UY7A 3C2FA 3QSTA 4UTWA 4NJJA 1TPVA 4FXRA 4PH6A 1RPXA 3NDOA 1YXDA 4AXKA 5L9FA 3CEPA 1J2WA 1YXCA 3LXCA 2Y70A 1Z41A 3STGA 4WQ6A 3HBLA 5CZ0A 4FO4A 4S2BA 4CQ9A 3W7KA 2CLHA 1OX6A 2GVGA 2EPHA 4UMAA 3P7YA 5G1TA 5A5WA 1SZFA 1TPEA 1G4SA 4A2RA 1GOXA 2QUVA 1JCYA 3O63A 1VQTA 3E49A 3CHVA 4NJHA 3N3MA 4IQLA 1R46A 1Z48A 3PUEA 3NPVA 4MFDA 5T26A 4MY1A 3TROA 1Q6QA 3TR2A 3NQGA 3B0PA 4DO6A 2TRSA 1XUZA 1GTHA 4RCXA 5FF7A 1S3HA 1JQVA 5HJLA 3KVLA 4IGHA 1KV5A 2HS8A 3BW2A 1XCFA 3IGSA 4YMZA 2ZRXA 5MHBA 3QF0A 2HMCA 2YYTA 2NLIA 4Z0JA 1P1XA 1IXOA 1XBXA 3ABSA 4UTWC 3W1QA 2C15A 3PB2A 1XM3A 3W1AA 1TPB1 4UXDA 3I65A 2LLEA 5KITA 2RDTA 1FWNA 4E0CA 2PRLA 1TTJA 3W2JA 3L21A 1VLIA 4ALDA 2G96A 5I3FA 3TQ0A 4K38A 1KTCA 1WA3A 1D3HA 1HO1A 5DY2A 3MP5A 1IF2A 5G2WA 5K7JA 3QRHA 1YDVA 3TJLA 1EWEA 1EX5A 1ML1A 2NWSA 3U8GA 1SR9A 4UFIA 1HL2A 3PWAA 3IIOA 4GBUA 4LC8A 3IVSA 5D2YA 2WNQA 3EX6A 4IXXA 1H1ZA 5KINA 4JXCA 5LNUA 3IGXA 3H54A 1LRTA 3LI0A 3SFKA 1LOSA 4JYDA 4JX6A 3NR0A 1VR6A 1A5SA 4O15A 4XUGA 1ZCOA 1CX9A 3TNOA 2X1TA 4O0KA 2VEMA 5AC6A 1SU5A 3QPZA 1KM2A 3G1FA 4N02A 1JCLA 3GX9A 3UWQA 2Y89A 3EWUA 4MPQA 1XI3A 3TH6A 3KHJA 4HNNA 3EX4A 4AWTA 1JCNA 4PTNA 1ZAHA 2JKPA 3O05A 3W7RA 3TMLA 1GEQA 3IVUA 4UUIA 5LKYA 3U2OA 3FA5A 4NVTA 3M0ZA 5LGZA 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2CZDA 2B4GA 4O1DA 1Q6OA 2DZPA 7TIMA 1QO2A 1A5AA 4KKXA 1N7KA 3GDTA 4A22A 3HPSA 5CPLA 5FEPA 2BSLA 3RLVA 4NZFA 4ZZ9A 4N9CA 4GE8A 1EIXA 2R94A 5H2ZA 4RV8A 3DZ1A 1ICPA 3PSVA 4XZ9A 2ATMA 5KZMA 3MMTA 3GDLA 3S9YA 4RR4A 5D04C 2V30A 3GLCA 3U6WA 2VEIA 1B3OA 4Z1AA 3SIZA 2PE4A 1I2RA 5SWUA 1TV8A 3O1NA 4LVGA 3F1QA 4GUJA 4A21A 3R89A 3CQ0A 1TPFA 1PV8A 1TMHA 4I7VA 1OK6A 1LM1A 1XBYA 3W1UA 4O16A 1OF6A 3R13A 2RH9A 4NU7A 1JQXA 1QDSA 3DU0A 4DQWA 2QAPA 3MI2A 2VFFA 3W7NA 4GUIA 1GWJA 3LRKA 4AHQA 4EWND 3RK8A 3LCGA 3QSRA 4QNEA 2Z6IA 4GFSA 4JYEA 3G0XA 1GJPA 3TV8A 3HG3A 1W5NA 3NQMA 4JTSA 4DPQA 4LUJA 5DN1A 1WV2A 4UTJA 4J9JA 2A7RA 2ZFAA 3BGJA 3NPXA 1Q6RA 4Z08A 1TTPA 3THQA 3S1UA 2VFEA 4TMCA 3NL2A 3FKRA 1NEYA 4I9AA 2E09A 4MY9A 5D37A 3CU2A 3TW7A 3W7LA 3L5LA 3W71A 3W7HA 3TQVA 3NPWA 5K9XA 5L6UA 3GIYA 4IMEA 3PY2A 1M5WA 2H8XA 3TCEA 2RDUA 3EWZA 1LLZA 1TIMA 4IWWA 4UFJA 1HFBA 3GAYA 3B0UX 1SZEA 3IIXA 1GVSA 1DJNA 3UXAA 1H63A 4RZ4A 4X3ZA 1JR1A 1F6KA 3DFNA 2WKJA 5F1VA 1XXXA 3GXPA 3EXRA 3IVTA 3TDFA 1I45A 2V5BA 3QZEA 2E68A 4X22A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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