3UPWA

Pichia stipitis oye2.6 complexed with nicotinamide
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
404
structure length
404
Chain Sequence
SSVKISPLKDSEAFQSIKVGNNTLQTKIVYPPTTRFRALEDHTPSDLQLQYYGDRSTFPGTLLITEATFVSPQASGYEGAAPGIWTDKHAKAWKVITDKVHANGSFVSTQLIFLGRVADPAVMKTRGLNPVSASATYESDAAKEAAEAVGNPVRALTTQEVKDLVYEAYTNAAQKAMDAGFDYIELHAAHGYLLDQFLQPCTNQRTDEYGGSIENRARLILELIDHLSTIVGADKIGIRISPWATFQNMKAHKDTVHPLTTFSYLVHELQQRADKGQGIAYISVVEPRVSGNVDVSEEDQAGDNEFVSKIWKGVILKAGNYSYDAPEFKTLKEDIADKRTLVGFSRYFTSNPNLVWKLRDGIDLVPYDRNTFYSDNNYGYNTFSMDSEEVDKELEIKRVPSAIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Scheffersomyces stipitis
publication title Structural and Catalytic Characterization of Pichia stipitis OYE 2.6, a Useful Biocatalyst for Asymmetric Alkene Reductions
doi rcsb
molecule keywords Old Yellow Enzyme 2.6 (OYE2.6), NADPH dehydrogenase
total genus 156
structure length 404
sequence length 404
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2011-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3upwA00
1LORA 4NJIA 4UTLA 4IUOA 4YWIA 4FNUA 3EWZA 3UD6A 2ISWA 4RJEA 4FO4A 3M16A 1QR7A 1TREA 4JTSA 1DBTA 2Y7FA 1AL7A 4LC8A 2WKJA 2V5BA 3BG9A 3G1FA 3SFKA 5F4WA 1W31A 4O28A 3W7KA 4ADTA 5I3KA 4AH7A 2JKAA 3NL2A 1YLVA 1T96A 5LNWA 1QDSA 2CLFA 3BO9A 3TQ0A 3GAKA 4N4QA 2CLEA 4DPQA 2HSAA 3G3MA 3O63A 4X9SA 5DY3A 2NZLA 5F4SA 2JKEA 2ATSA 1ZAIA 2XN1A 2Q8LA 3WJZA 4UTMA 1O95A 4NNCA 5CG7A 4O17A 3LCXA 1SZNA 2QEZA 3QQ1A 1GEQA 2NLIA 4ZQPA 5G5IA 2PCQA 2CLMA 5CPOA 4JR5A 3C52A 4M6QA 4AHQA 2C19A 1FXQA 1SO5A 5G2IA 3DAQA 1KTBA 3QMRA 4S2BA 1G4PA 1I2RA 3NZRA 3DFQA 3M6YA 3I6RA 5HULA 1FWTA 1Q3NA 3KRZA 1ZENA 2HS6A 4JX4A 5CZJA 2E5DA 3MJYA 1T99A 3ABRA 4DELA 3HGRA 2Z6IA 5EPDA 3KVMA 3F4NA 4IX0A 3B0UX 4FF7A 3HIJA 4A2RA 1G7UA 3TMLA 2QDGA 4MY8A 4XTDA 3CC1A 3HF3A 3PAJA 4UTJA 3UWZA 4MZ8A 2E6YA 3UNDA 2WQPA 3P8JA 3P62A 5AN7A 3F03K 1H7XA 1BEUA 3OEXA 1KLZA 1S5VA 4K8EA 4CNNA 2ISSA 2G95A 4E2BA 1X1OA 1SW3A 1G6CA 2PURA 4EF8A 3E96A 3IIPA 5A8GA 3B04A 3T4CA 3FYPA 2E5CA 2GVJA 4Y6GA 4OV4A 4Y8FA 3CWNA 3IGSA 1AL8A 2JGYA 3CIWA 1AMKA 5CSRA 1KBIA 4BK9A 5F2LA 5HQEA 1EEPA 3LM7A 2F7FA 1MO0A 3EEGA 4Y90A 4DQWA 5LSMA 1BWKA 1KTCA 2YDAA 2I9EA 4IXXA 1DKWA 2WPBA 3TXZA 4KWVA 1YXYA 5FEZA 2J9XA 4UUIA 3FOKA 1PVNA 2ABAA 5CPLA 3CWOX 1ME8A 3LV5A 4HSOA 3TIMA 4ZQOA 4M19A 1KM4A 2H3BA 4Z1BA 1H60A 1KFKA 3A23A 1SU5A 3RFAA 3C2RA 1OYAA 1W8SA 4P61A 1RZMA 3L2IA 1VLIA 2V82A 4NXSA 4DBDA 3RU6A 2ZA3A 4U28A 2EGZA 1WOAA 4N9DA 1GWJA 5HNRA 5F1VA 5AYYA 4NT0A 1YDVA 1RQHA 5T26A 3TSMA 3PBWA 1QAPA 1M7OA 3NPVA 3ELFA 4LNYA 3A24A 5FF3A 1WBHA 3QMSA 3G8RA 4LS1A 4O57A 1D3GA 5CSSA 4N02A 5AB3A 1TPEA 1F2JA 2NUWA 2A2IA 3IGUA 4XWUA 3STFA 2YW4A 3EKLA 5EBUA 3S1UA 1L9WA 2ATMA 3I68A 3IIZA 2RH9A 1O5KA 5D2YA 3W74A 1AW5A 5EMUA 5A5WA 3NL5A 1QOPA 2E1DA 2DZWA 1R2TA 1TV8A 4O1BA 2R8WA 2ZRZA 1YXDA 1BKSA 3VE7A 1PHWA 1JQVA 3W73A 1JULA 1NAL1 4YCOA 3TNOA 1E51A 2DZUA 3KHJA 3W1PA 5AOUA 1S5WA 2YYTA 3W22A 4HNUA 3UZJA 1JUEA 1QWGA 1BWLA 1TRDA 4QISA 1K7XA 1RVGA 3N2MA 5CKSA 5BOOA 2V2CA 5DELA 4LS2A 3V1PA 3NNTA 4DF1A 4MVAA 3VFLA 1G67A 1Z48A 1XDLA 4OQVA 3LCGA 3IV3A 4JYDA 3TKFA 4M7SA 4JGDA 3S5OA 1AK5A 3INPA 2Y6ZA 4HHPA 4GNJA 3TW7A 1ME9A 1QPRA 3MWAA 4KFNA 5EL1A 3R12A 5DXYA 3GDLA 3HG3A 3IIVA 1O60A 1H1ZA 1PCWA 3DFOA 3NG3A 4UC5A 2ZCGA 1L6YA 4RZ5A 5LNRA 3W1RA 3UWWA 1KFJA 2GVGA 3CB8A 3FKKA 4ADSA 4LVAA 5HUPA 4L4LA 3W88A 4IJBA 1IIHA 4NX0A 3N34A 1DL3A 1P4CA 1UUMA 3WJWA 1TSIA 3BLFA 5FF7A 3STGA 2NX3A 2PC4A 3HMJG 2H8ZA 4HPJA 5AHMA 2Y70A 4AWSA 1Z44A 2EHHA 5MHBA 3PB2A 2Y7EA 3HPZA 3PR2A 5D03A 1SR9A 4UXDA 5D2XA 3LB0A 3L0KA 1H5YA 1D3HA 2X2GA 1VCGA 5DY2A 2NWRA 1TO3A 3DKJA 1NVMA 1IGSA 3BGJA 1XFBA 2ZFAA 2YW3A 3M41A 3Q58A 4O11A 3NPUA 4N9EA 1OHLA 2Q8ZA 3PF3A 3NPWA 2LLEA 3C61A 2V2DA 3VCRA 2I14A 1OFAA 4X2RA 4JDYA 3P84A 4MJZA 2CW6A 3P8IA 2ZTJA 2VELA 3W2KA 4K8HA 5HMSA 3W7JA 2Y7GA 3KAOA 3GAYA 3ZFHA 4PEKA 3M1ZA 4ONVA 4JIQA 1QOQA 5LZLA 4CQ9A 4YLWA 1VHNA 3QEZA 3CQ0A 3DKLA 1I2PA 3S8HA 1XCFA 4O15A 1YTKA 3PUOA 1LRNA 4DO6A 4YXGA 3S5NA 8TIMA 5LGZA 5F1UA 3SSJA 2B7OA 4AAJA 5G2HA 2RDWA 2FIQA 2P0OA 3C2FA 5FEPA 2FJKA 2A7RA 5FEXA 3W83A 1R2RA 3GDMA 2NXHA 3LCIA 1XBVA 5H91A 3M47A 2BXVA 2A6LA 3NA8A 1LDCA 1F74A 1XI3A 2J6XA 1YXCA 1GOXA 1P1XA 5LNUA 3HG2A 3NXFA 1W5NA 4I9AA 5J5RA 1IXNA 5C6MA 2QF7A 2ZZ6A 3MP3A 2DU2A 2Z0IA 4N6FA 2EKCA 2RKXA 3PC0A 3E12A 4LOCA 3G1VA 1GTHA 2GQAA 4ICNA 1H62A 4O8RA 4JTKA 2G5WA 3NQFA 5G2WA 3W9ZA 4QNEA 5K2ZA 3O07A 2QCNA 1VQTA 2FQIA 3FEMA 4O52A 3UWUA 3EX1A 3W7RA 3NQCA 3L5MA 1SW7A 3ZS4A 4O1DA 1A5SA 4MUZA 4Y96A 1FCBA 1D9EA 3DFPA 2DJXA 2ZZ5A 3LCWA 4O12A 3LHWA 2ZRXA 1HO1A 5IBXC 2JK2A 1KM3A 2A5HA 4AEOA 4JN6A 3W7CA 4EOUA 2BLEA 1PS9A 5DBUA 2HMCA 5AHLA 4LRSA 4Z0JA 1EA0A 3QJAA 1FCQA 3OG3A 1TPFA 3GKAA 5SWUA 3H55A 1EWEA 2OMAA 2C1HA 3T40A 1JCXA 1FX6A 2PRHA 1UB3A 1WDWA 3M0ZA 1LP6A 2GPTA 3P5ZA 1YPIA 2DZXA 1EB3A 3LXBA 3GK0A 4I7WA 3EXSA 1GVSA 4LW7A 1B4KA 3NQMA 1NF0A 3SJ3A 3TJXA 1I8JA 3QM3A 1YYAA 3QPYA 2QCMA 1OFOA 3FS2A 2XN2A 1OFRA 2ZZ7A 1TMHA 1YDNA 5BNKA 5HR7A 4IMFA 1R46A 3G1YA 5AHFA 1UUOA 1VPXA 2OX1A 5ABTA 1OFPA 2BTMA 3Q37A 4UTWA 5E0KA 3TFCA 4LY8A 1W5PA 1LTDA 1C29A 4MFEA 1ZAJA 3W1QA 4OT7A 3PSVA 1VH7A 3M43A 3NQDA 3TA6A 1W54A 3WFAA 5LGXA 1U83A 1FWRA 2ZRVA 5D09A 1I45A 5K3VA 2NUXA 3NL3A 2NV2A 3P82A 1LCOA 5K9XA 4NJJA 3A5VA 1TPH1 1IXQA 1SQ7A 4GUFA 2G96A 4GFSA 2B7QA 5I3GA 5KSWA 3LHYA 3N19B 1N7KA 1TTPA 2V0TA 3EWWA 4K7YA 4DBEA 2ABBA 3WJXA 1QPOA 1GTEA 3BPWA 3V75A 3UQNA 3HGSA 3DU0A 4O54A 2Z1BA 2DZPA 4KFOA 1EP2A 2HTMA 1YDOA 2E09A 3NQVA 5I3HA 2Z6JA 3GNNA 1XBZA 3R2GA 4M7TA 1H50A 1IXPA 1OYBA 2TPSA 1XBXA 3P67A 1X7FA 3Q2DA 1KM5A 4E38A 4EVZA 5LHEA 4DO5A 1W56A 4LU0A 2BZNA 4FNPA 1OX4B 1JCJA 3G24A 1WYIA 1WBJA 2A21A 4ZL1A 1SSDA 4XUGA 1OX5A 4AWTA 3MMTA 1QPQA 1GPWA 5FF4A 2QJIA 4NJKA 4A21A 3LRLA 3LHZA 2EF9A 2WOQA 3QC3A 5D38A 1Q6LA 4JTFA 3RNDA 1YTDA 1YADA 3HO8A 4IMGA 1JJKA 5K7JA 3A21A 3NQ2A 3O15A 1ICPA 3FFSA 2EAWA 3GDKA 3UPWA 3TDFA 3W85A 1P0KA 4NNBA 4H4IA 4QIUA 1W5OA 5KZDA 2R91A 4I7VA 2B4GA 3ATYA 3GXNA 2TYSA 3BW3A 4AWUA 3AJXA 3LXCA 3PBVA 4GJ1A 3S1WA 3G0SA 3RLVA 3NQGA 2ZZ4A 1JUBA 1L2UA 4PL1A 4PCFA 5F4XA 3KFTA 2FPTA 2JBMA 3O1NA 2QUTA 1AW1A 4FEZA 1J5TA 3B0PA 4ORIA 3LRKA 4UFHA 3TSDA 3N14A 4NU7A 3A9IA 3EX6A 4K6AA 4MZ1A 4LUIA 5AHIA 4RKAA 1HFBA 4ORMA 3WK2A 3DFSA 4WX2A 4Z1AA 2E6AA 4M6PA 2QUUA 3I7SA 3HQ1A 5C54A 4JXCA 4A2SA 3ATZA 2X1RA 5KINA 3NPXA 1QO2A 2YSWA 4Z0SA 4GUIA 3S1XA 2QJGA 4QNWA 4FNRA 1A5BA 3M44A 2QJHA 4KFPA 3ANYA 3PVFA 2FLIA 1B9BA 3IGXA 4BI6A 2ZTKA 3LTPA 2J24A 3EXTA 3TH6A 4OV9A 1WXJA 5F2GA 1WAUA 4CNPA 4LWWA 3S42A 1EP1A 4QAIA 1LBMA 5KZEA 4BI7A 1RV8A 3QW3A 3FYOA 3UY8A 4PL2A 2V81A 4MKNA 3GB6A 5GVJA 4K39A 3PULA 2NX9A 2E6DA 3CPRA 1EPXA 1I2OA 1WX0A 3JRKA 2NXIA 3SGUA 3W7MA 4CLMA 1VZWA 3TR2A 1X6UA 3P60A 4UNKA 3STCA 3M5XA 4PODA 1H1YA 1SW0A 1XM3A 1I2QA 3GIYA 4WXYA 1VCVA 3S5ZA 4G1KA 4ZZ9A 1FDZA 3C0JA 4GWEA 2TRSA 4N2YA 3QW4B 4QJ1A 3WK3A 2QCDB 2Y62A 2JKPA 1SPQA 4AXKA 4TMCA 4ADUA 4PC8A 1WV2A 4RK8A 4LV4A 1OG0A 2EPHA 3YPIA 4JIPA 4MFDA 3P5YA 1F5ZA 5DLCA 2WNZA 3VNDA 1H7RA 3TJLA 4CCCA 3O6CA 4HNNA 2ZZ2A 4R7JA 4MOZA 4K7VA 1MEIA 4FNSA 2DORA 1JRBA 3W1MA 5I3FA 3TCEA 3W70A 1JUKA 2J27A 2C15A 1DVJA 5AC8A 3DBPA 1GVOA 4O0KA 1SO4A 4LUJA 4HKPA 2CLKA 1TPDA 2C6QA 3KRUA 3SW6A 1P5BA 3PBUA 5HWJA 2GUUA 4MY9A 3USBA 4OWGA 2UV8G 4AF0B 1G7VA 1GYLA 3M5ZA 4LTSA 3KX6A 3T7VA 3VKJA 4JEQA 3ABOA 1A50A 1GQNA 5AHEA 5D33A 3W7QA 1TYGA 3CU2A 4RR4A 2QCFA 1EP3A 3MI2A 3STEA 5FEWA 3VE9A 1Q6OA 1FBAA 1VCFA 4JTIA 6TIMA 2V2HA 3O8AA 3RLUA 5KTLA 1CX9A 1O5XA 4WOZA 4XTIA 3G0XA 3C56A 3QRHA 4M6VA 1TTJA 3DHFA 2W79A 4N6EA 2WSRA 1K8ZA 2VFEA 1NSJA 2FPYA 3G1HA 1J4EA 3G1AA 1XDMA 1SZEA 3HGJA 4X22A 4N4PA 3M9YA 3W2UA 2X1UA 2CU0A 4JY8A 3FA5A 5CPMA 3NQAA 2ZA1A 3CHVA 2ALDA 1VRDA 1XC4A 3G0UA 3WJSA 2CZFA 4PA8A 1F7BA 3LX9A 3TK7A 1KFBA 4XZ9A 4O1CA 2YPIA 1BTMA 5I3JA 1ONRA 3C4UA 2F84A 3OVQA 4P2VA 2NUYA 3N9SA 1C8VA 1U5JA 1P0NA 3W72A 2RHGA 1PE1A 4IXHA 1OX4A 4O14A 3ABSA 5K4XA 3QYQA 3DENA 4NZFA 2Q3OA 3FIGA 4O53A 1L6WA 2FFCA 4DXVA 1ZCOA 3TX9A 3HPSA 4QITA 4NJHA 2J9ZA 2H8XA 3SR7A 5K9CA 3W7NA 3EWXA 4IQLA 5HINA 4PFMA 2B0MA 4UFMA 2JGQA 3UY7A 2GOUA 1ZFJA 2FDSA 1W3IA 2WJZA 3I7QA 4OGZA 4UTTC 3HOJA 3T78A 3H54A 2X1TA 1Q45A 3C2OA 3W7HA 2VFIA 1UJPA 2B7NA 1H7PA 2YZRA 2WO5A 1OFDA 3TAOA 4O13A 4QQ3A 2I1OA 4EWND 3RMJA 3MHFA 4FHAA 4QSHA 3LERA 3SY5A 3C8FA 4UNLA 1K7EA 1J2WA 1NF7A 1Z41A 3W2LA 4UTUA 1FDJA 3TMQA 1F76A 1R30A 1TTQA 3CLMA 3PM6A 5IBXA 3IEBA 3W87A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2XZ9 A;  3IUD A;  3D46 A;  1U1J A;  1FH9 A;  1PIG A;  3EWC A;  4AVN A;  2WKJ A;  4ECL A;  4H7Z A;  4MNJ A;  4AYG A;  4O28 A;  5I3K A;  3NL2 A;  1T96 A;  4AZ7 A;  2I56 A;  5LNW A;  1CXE A;  1U33 A;  3ARS A;  3OYX A;  4LFY A;  5TAO A;  1E3X A;  3GYC A;  4DPQ A;  4KCU A;  2VYO A;  3RN6 A;  4RPP A;  4X9S A;  2JKE A;  2XN1 A;  2Q8L A;  3WF0 A;  3WEO A;  1O95 A;  4JOM A;  1SZN A;  3VGG A;  3QQ1 A;  4EK7 A;  2NLI A;  3PBG A;  3ZZ1 A;  4BQ3 A;  1BQC A;  1JPD X;  1VFS A;  3WH7 A;  4JR5 A;  4AHQ A;  4Q7I A;  3K5X A;  2PGE A;  3EDK A;  1SO5 A;  1E9L A;  5G2I A;  5CSU A;  3BLL A;  1E6P A;  3QMR A;  3TOP A;  3AWN A;  4S2B A;  3NZR A;  1XLI A;  3K1D A;  4HK5 A;  3I6R A;  2YCL A;  4PB4 A;  4IIG A;  1ZJA A;  1PO9 A;  1T99 A;  3GC4 A;  7REQ B;  3EOS A;  3SUS A;  3ITG A;  1UC5 A;  3KTS A;  1RLD A;  1MDR A;  2ZWZ A;  4O1E A;  4FF7 A;  3M0I A;  1P6C A;  3WDJ A;  4MY8 A;  3HF3 A;  3PAJ A;  4WLC A;  4W7U A;  4MZ8 A;  1HX0 A;  2PC8 A;  2OZ8 A;  4NRS A;  4AZB A;  4GK8 A;  3B0X A;  3P62 A;  4UQC A;  1PTD A;  1KLZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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