4TTUA

N-terminally truncated dextransucrase dsr-e from leuconostoc mesenteroides nrrl b-1299 in complex with isomaltotriose
Total Genus 340
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
340
sequence length
1046
structure length
1036
Chain Sequence
KGLRQDSNGKLRYFDLTTGIQAKGQFVTIGQETYYFSKDHGDAQLLPMVTEGHYGTITTAWVYRDQNNTILKGLQNINGTLQFFDPYTGEQLKGGVAKYDDKLFYFESGKGNLVSTVAGDYQDGHYISQDGQTRYADKQNQLVKGLVTVNGALQYFDNATGNQIKNQQVIVDGKTYYFDDKGNGEYLFTNTLDMSTNAFSTKNVAFNHDSSSFDHTVDGFLTADTWYRPKSILANGTTWRDSTDKDMRPLITVWWPNKNVQVNYLNFMKANGLLTTAAQYTLHSDQDLNQAAQDVQVAIERRIASEHGTDWLQKLLFESQNNNPSFVKQQFIWNKDSEYHGGGDAWFQGGYLKYGNNPLTPTTNSDYRQPGNAFDFLLANDVDNSNPVVQAENLNWLHYLMNFGTITAGQDDANFDSIRIDAVDFIHNDTIQRTYDYLRDAYQVQQSEAKANQHISLVEAGLDAGTSTIHNDALIESNLREAATLSLTNEPGKNKPLTNMLQDVDGGTLITDHTQNSTENQATPNYSIIHAHDKGVQEKVGAAITDATGADWTNFTDEQLKAGLELFYKDQRATNKKYNSYNIPSIYALMLTNKDTVPRMYYGDMYQDDGQYMANKSIYYDALVSLMTARKSYVSGGQTMSVDNHGLLKSVRFGKDAMTANDLGTSATRTEGLGVIIGNDPKLQLNDSDKVTLDMGAAHKNQKYRAVILTTRDGLATFNSDQAPTAWTNDQGTLTFSNQEINGQDNTQIRGVANPQVSGYLAVWVPVGASDNQDARTAATTTENHDGKVLHSNAALDSNLIYEGFSNFQPKATTHDELTNVVIAKNADVFNNWGITSFEMAPQYRSSGDHTFLDSTIDNGYAFTDRYDLGFNTPTKYGTDGDLRATIQALHHANMQVMADVVDNQVYNLPGKEVVSATRAGVGNDDATGFGTQLYVTNSVGGGQYQEKYAGQYLEALKAKYPDLFEGKAYDYWYKNYANDGSNPYYTLSHGDRESIPADVAIKQWSAKYMNGTNVLGNGMGYVLKDWHNGQYFKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Leuconostoc mesenteroides
publication title Structural Insights into the Carbohydrate Binding Ability of an alpha-(12) Branching Sucrase from Glycoside Hydrolase Family 70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dextransucrase
total genus 340
structure length 1036
sequence length 1046
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2014-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02324 Glyco_hydro_70 Glycosyl hydrolase family 70
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.270.10 Mainly Beta Ribbon left handed beta-beta-3-solenoid Cholin Binding 4ttuA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4ttuA03
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 4ttuA04
3NSNA 3GBEA 3AJ7A 1XH1A 1JI1A 2CBIA 4DWSB 5JIPA 4W8LA 3MSDA 1ODZA 1SFSA 4HMEA 3SCPA 2D1ZA 3WQ5A 3GM8A 2QJ6A 2D23A 1QI2A 3TTOA 1JZ8A 3VOCA 2DSWA 5BXPA 1GW1A 3CUFA 5F7UA 1FHDA 1S46A 1C7TA 4OBRA 1NARA 5CG0A 2VNCA 4EAMA 1EHNA 1ZL1A 1DWGM 4PCSA 3WQ4A 3I3EA 3ZR6A 1HJUA 1OCQA 2YIHA 1HXJA 4AZ7A 1H11A 1UZ4A 2A3BA 1CXLA 1W91A 3IJ7A 1XSIA 1G0CA 3CMGA 4P7OA 5KEZA 5JBEA 1JD7A 1CXIA 3A6OA 3NSMA 2OWCA 1QNRA 2C8NA 3FHQA 1UKTA 4JKKA 3RO8A 1UKOA 4HOZA 1M03A 2ZUMA 4JKMA 3AMCA 2WVTA 2GK1B 3POHA 1FH9A 4AZIA 4TVDA 2BXYA 4DUWA 1JAEA 4OJYA 4DUVA 3EDDA 2WPGA 2VZTA 3VMOA 1E15A 4HA3A 4GKLA 1H2JA 4U33A 4Z2IA 1LF1A 1U2YA 5D9OA 4HZ8A 4XX6A 1J10A 1UHVA 3HU7A 5A8NA 1E56A 3CZ8A 1TUXA 3KL3A 4PMXA 1UKPA 1LQ0A 1JYWA 1NWRA 2E0PA 3WD0A 1L0PA 1AQ0A 4QAWA 1R85A 4CN6A 1B90A 1ECEA 4JCLA 4ML4A 4ZE4A 3PTMA 2YOCA 3AHYA 2J8GA 1JFHA 4AD5A 4AISA 4DUXA 4CVWA 5CZKA 2PF0A 5I5RA 1JGIA 1XV8A 1W1TA 1E6XM 2E9LA 3OBAA 4NF7A 4XB3A 1EOKA 4UR9A 3VDCA 1W3HA 3RCNA 2JF7A 3ZT5A 1CXEA 4ZE5A 2VI0A 2OYKA 4WJXA 1OGSA 1DEDA 3SUUA 3OLIA 2Y5EA 4PUEA 4Z2LA 3KWXA 1V03A 5ABFA 4HZ6A 3NYDA 3UCQA 1E4MM 4H8VA 1X6LA 2AOSA 3VGBA 1J0HA 3VGDA 1MW2A 4ATDA 1QBAA 3WDJA 4IM4A 3ZMRA 1MWOA 5A6SA 2GJRA 4NRSA 5D9NA 2J7HA 1B3YA 4HU0A 3D5HA 4L4PA 3SUTA 3DYOA 1UQZA 2DT3A 3MUAA 3AMDA 1NP0A 2XHYA 2XPKA 2F8QA 2WLZA 1GQLA 1GVIA 5BWFA 4CN1A 4UQDA 5BROA 3WL1A 1F4AA 5ABEA 1VEMA 1JDAA 1CXFA 1U33A 4A3HA 2G4FA 4W87A 5BXSA 1W2PA 3AXXA 2V05A 1LL4A 1BG9A 1CENA 1W2VA 1OM0A 5A6KA 3ARVA 2D24A 3CUIA 3GDBA 4C7GA 2QF8A 1U30A 2WVVA 2WSPA 3OG2A 4JHOA 3UR7A 1US3A 3AS0A 1MFUA 1KFWA 2XM2A 3SCVA 2WANA 3K1DA 4UFIA 3MV11 1FH8A 2YL6A 2O9RA 2VQUA 2NT1A 1GONA 1X6NA 4P8UA 1KXVA 1HCXA 4TUFA 4B16A 5FCZA 3AZTA 1V6YA 3G6MA 1W3LA 4PTVA 3L4UA 2W5FA 3WQ6A 1H0IA 4IPNB 1IZJA 3WEMA 9CGTA 5ABGA 1AQMA 4D6FA 1KR1A 5I77A 1FA2A 3O9NA 4ATWA 1NOUA 2IUZA 4QCFA 2DT1A 3ARQA 2PWFA 2JIWA 5CGMA 2A3EA 3OB8A 3WMBA 4IUGA 3NDYA 5EMYA 1UWUA 4TXEA 1CGWA 1RD6A 4UCFA 4AD0A 1ZBKA 3KZSA 5FL1A 2G41A 1GOIA 3A4XA 1GOWA 4PMYA 5E09A 3WUFA 4AIEA 3DHUA 4TVCA 1E71M 3CIVA 4AZ5A 2XVGA 3WFZA 3GH5A 4J3SA 7A3HA 3LMYA 1EQCA 5CPTA 2IXVA 4OOZA 1G5AA 5CLWA 1PBGA 3AHTA 3OLDA 4NSBA 1HX0A 1UYQA 4GI8A 1GQJA 3W28A 3BAYA 2WMGA 3WBEA 1LL7A 3SCSA 5IFTA 1UWIA 3GZAA 3CH9A 4AZCB 1ZBCA 2VZSA 4PMZA 5HOSA 3VM5A 1PIFA 2CBJA 3A3HA 3MUIA 2EPOA 1J18A 4MNMA 1GPFA 2PB1A 3N9KA 3WY1A 4HMDA 1V3KA 1BVZA 2JE8A 3THCA 3VNYA 3VTRA 5E70A 4N0RA 4CCEA 1Q6EA 4CD7A 1EDQA 5I78A 4AZ6A 1V6XA 3MV01 1C8XA 5DT7A 1JYXA 2WBKA 3MO4A 1JXJA 2ZUWA 3VD4A 4CU8A 1WZLA 1EQPA 4OOUA 4E8CA 5M03A 2Y8VA 4YN5A 1YHTA 2X0HA 3WUGA 3N04A 1ISZA 2CEQA 2DSZA 1UA3A 3WH8A 3POCA 2J7BA 3CUJA 1CGXA 2WHLA 3SUSA 3WN6A 2XFFA 1MQPA 1WKYA 1SYTA 3KLLA 3B9DA 2VL4A 4AD4A 4BQ2A 2WXDM 4CD5A 5GNYA 3QOMA 3VMPA 1I75A 4MB1A 2VZUA 3CLWA 4U3CA 3F5JA 1P6WA 3D3AA 2F61A 4WKFA 2EPMX 1OIFA 3ZQ9A 4KGJA 4AZBA 1FFQA 3VGHA 2HVMA 1HT6A 3QR3A 5FL0A 4M24A 5IFPA 1XH2A 5DMYA 2UY3A 2DIJA 2DSVA 3VGFA 4B9YA 2BNJA 1W9VA 4OKDA 2CHOA 5D9PA 1GZJA 1ZS2A 1QOXA 4GXPA 2DSUA 1XGZA 4FLSA 3WFLA 1D3CA 5I79A 5GNZA 1ISYA 1CPUA 3K4AA 4CN4A 2WMIB 1HJXA 4UQCA 4WKAA 1TG7A 3THDA 4A4AA 4D72A 1MXGA 2ZXQA 3NJ3A 3AHVA 3VIFA 3VVGA 1VIWA 3BH4A 3CHFA 3UG4A 1J0ZA 1LG2A 4UOQA 2BY1A 4ZEPA 2D3NA 1UD6A 1UA7A 1TZ7A 1WB0A 2BHYA 1B9ZA 4NBZA 3ARRA 3CGTA 1WDPA 3PZGA 2UY5A 3PZQA 3CHEA 3GH7A 4CCCA 1TCMA 1KBKA 1OINA 2XWDA 4PCTA 4J27A 1MYRA 3PTKA 3W38A 3ARWA 2G3MA 1GHRA 3U57A 4OIFA 4EANA 2WW5A 1HJSA 2CBUA 2GJXB 3DYMA 1JD9A 3WF0A 1E6ZA 1UD2A 1WDQA 5I6SA 1GNXA 3WD3A 1QPKA 4P8XA 4X0VA 2YKKA 2PWGA 2VT0A 5LA1A 1QNSA 2CITA 1WNOA 4KWUA 5AYIA 1ITXA 4H8HA 2YL8A 5A8OA 3GYCA 3W6LA 4GI9A 3VMNA 1W3JA 5A6JA 3WD2A 1HKKA 1VENA 4XZWA 2CKSA 4WK9A 2VX5A 3K46A 1J0JA 3OZPA 2J7CA 1BYBA 2UWFA 4PYSA 3SEPA 4LQ1A 2GDUA 3W27A 3W4RA 3EMCA 5KZ6A 1E6PA 1W9BM 2DT2A 1QNQA 1HL8A 2WHJA 1K9DA 1UUQA 3VIIA 1ESWA 2CETA 2GVYA 3VO0A 1QW8A 4AD2A 3UESA 2O9TA 3KEHA 3F5KA 2VURA 2FGLA 2JF6A 2X8PA 2BV9A 4FMVA 1N82A 1VB9A 2VR4A 2XGBA 3AYSA 1LG1A 1RP9A 2WWDA 3AS3A 2YDRA 3PZNA 3T0AA 3AIVA 1H8GA 4F66A 3EYPA 1NQ6A 1UH4A 1MW1A 4TTGA 3ALGA 1CLVA 4D6DA 3L4XA 3GXFA 1W3KA 4HMCA 4ZXLA 2DT0A 5C8BB 1ZB5A 4M29A 3RM9A 1LWJA 1JYVA 3GXIA 1FHLA 3BAKA 3ZIZA 2D2OA 2BXZA 3WELA 2ZUVA 1PZ3A 2CERA 4NC0A 2V3FA 4JIEA 3AIBA 1UWSA 3W82A 3QGVA 1TA3B 3VILA 5D4YA 3PZUA 3GNRA 3VD5A 1WDSA 3WNMA 3AYRA 4JFVA 1DWHM 2OSXA 3WDHA 3RMEA 2GSJA 3EDJA 3BAXA 4E2OA 5AYBA 2X1IA 1V02E 1AQHA 2HISA 2ZUNA 3SCTA 1W1YA 4H04A 4U5KA 1PX3A 3NSXA 4V2XA 1M01A 1JYNA 8CGTA 5CLTA 5HDRA 3OGVA 4PRWA 2WMKA 4W5UA 3ZSSA 1V3JA 5CSYA 4KRUA 3KE0A 2OWXA 1Q6CA 2YL5A 1BHGA 1UH3A 2D3LA 5ECUA 4JFWA 3VIGA 1PIGA 4OUEA 1XH0A 1ISXA 5A94A 5M3WA 1BGAA 1UKSA 2J7FA 3W0KA 1H3GA 1US2A 3ECQA 3WDIA 4WLCA 3LPPA 1VFOA 4PMOA 4HZ7A 3WDQA 4Z2HA 1PJ9A 2BVDA 1J9YA 2RGMA 1R7OA 3DECA 2VCCA 1C90A 2PWHA 3RILA 3AZSA 3E1F1 1IZKA 3VIHA 3QHOA 5DF0A 1I1XA 1TMQA 1B31A 2XFRA 3I3BA 2QLYA 3KL0A 1C8YA 5CJ5A 4V28A 1XD0A 3WMSA 5CGTA 1H09A 3AHZA 2DIEA 3U7BA 1KCKA 1H1NA 2MANA 2W62A 5CPSA 4CU7A 1CGUA 4PUDA 1HJVA 1UH2A 2VZVA 5M17A 1BYAA 1O7AA 3TTQA 4UFKA 3RIKA 1UWQA 3ZJ6A 2DGAA 1LWHA 1PZ2A 3VX1A 4NRRA 4UQ9A 1H41A 2VCBA 4IPLA 1E6QM 1V3LA 3VIJA 2W4XA 2ZUTA 3W29A 3AOFA 4B9ZA 4F79A 1DHKA 2CNCA 3ARPA 3OGRA 3CO4A 1C7SA 1CGYA 2X2YA 1R8LA 3GNPA 3TONA 4MTVA 2G8ZA 2XFYA 3AQUA 1Q6DA 1ZJAA 5ABHA 4U5IA 4Z2GA 1KCLA 1WZMA 1XSJA 3AMKA 4WKHA 1E40A 2O9PA 4L4OA 4FK9A 2NW0A 1JZ3A 2X09A 4QLLA 2WHKA 2ZXBA 5EB8A 1WE5A 4CD6A 4E4PA 1VAHA 2YLLA 1FP9A 4D6JA 1BTCA 2J47A 3TTSA 4JFTA 2ZX5A 2DPEA 1MFVA 3WENA 4MB3A 3IK2A 4M81A 4HA1A 1KB3A 4JKLA 2WLYA 2J4GA 2YA2A 2GK1A 1WO2A 4AC1X 2PBOA 1OWQA 1XC6A 2WHMA 4MAVA 3WDPP 4P7QA 4PMUA 2X8OA 2D0GA 4FLOA 1WZAA 4H8UA 3M07A 4AZHA 3UETA 1QI4A 4BQ5A 5AC4A 1JZ5A 1VRXA 4JHZA 1V0NA 3AIRA 2WZHA 4ACZB 3T2QA 1JNEA 2NT0A 1E1FA 3II1A 4JFSA 3WDRA 5A2BA 4F9DA 4Q22A 4PTXA 1OGGA 5A95A 4XZBA 3VDHA 2ZX7A 1VEOA 2WNWA 3GXMA 1C3FA 1GCYA 4TTUA 6CGTA 1RPKA 5E0FA 1B2YA 1XCWA 3VD3A 1W1VA 3W26A 1B30A 2ZOXA 4MB4A 2QMKA 4D6GA 4AD3A 2CKRA 1ZBVA 4D6HA 4Z2JA 5E6ZA 2XTKA 2VUYA 4URIA 2W91A 2OSYA 2RGLA 4PMRA 3HMCA 4R27A 1CGVA 3SUVA 2ZXDA 2PC8A 3N11A 1CLXA 2XIBA 1EDGA 3JUGA 3WNNA 2CXGA 2WVSA 5EBAA 1BG4A 2WSKA 2EO7A 4AYGA 3VKKA 1VEPA 4FF5A 1JDDA 2YLAA 2WC7A 2WC4A 3CUGA 3WQWA 2OYLA 4CU6A 2E8ZA 1V0KA 1NP2A 4W88A 2ZUSA 3M6DA 4NI3A 1NM9A 1JFXA 1G9HA 1XCXA 4JFUA 1UQYA 4JAWA 2XIIA 1HL9A 3N12A 2Q8XA 1K9FA 4LPCA 2CPUA 3G6LA 1KWKA 1VBRA 4PBGA 3IAPA 3WNKA 3F5LA 3FN9A 5DFAA 2J62A 3QHMA 2J74A 4WSJA 3WEZA 3BCFA 5A8PA 1WP6A 1BSIA 2WB5A 4UOJA 2B31A 1QVBA 4J3XA 1E4NA 4V27A 1Q6FA 2E40A 1G94A 2VX4A 2AAAA 3MUZ1 4P7LA 4AIUA 3KLKA 1V0MA 2WZIA 4FLQA 4MJ2A 1KQYA 3PZIA 1HNYA 2GJPA 2CYGA 5I23A 2YDSA 1W9XA 3QOKA 4HP5A 4Y7EA 1J01A 1WCGA 3WD4A 1GQIA 4ZFMA 4FLRA 1ZU8A 1D7FA 4LX4A 3MMDA 2X8RA 4P7NA 4BQ4A 4AEFA 2YJQA 2VRQA 2EEXA 4J3TA 4MJ4A 1B3VA 1C93A 1AVAA 1ITCA 5BYWA 4AW7A 2YA1A 1ODUA 1VJSA 2J7EA 1R7AA 2W67A 2A3CA 7TAAA 2BVTA 3VD9A 3WH6A 1E5JA 3ARZA 1GVYA 3CZGA 5DO8A 3T09A 2Y8KA 1QNOA 4M56A 1VF8A 2V38A 1OT2A 3AIQA 5IXEA 1XSKA 2XM1A 1GHSA 1KWGA 4E8DA 6A3HA 2BY0A 3CBWA 2FGZA 3FXYA 3VNZA 3A4AA 1FH7A 1BGGA 4AWEA 1JF5A 4ZXOA 4QFUA 1JG9A 1WPCA 4D71A 1QHPA 1RP8A 3A47A 5CSUA 4M80A 5D8ZA 3UERA 2J7GA 3PTQA 1NWUA 4LGXA 3FHAA 2VX6A 2C0HA 3CZJA 1GOQA 3BLPX 2D20A 3K4DA 1KQZA 4GI6A 2VRJA 1BPLB 1XHGA 3TTYA 4ACYA 2XGIA 2GDVA 1FOBA 1UG6A 2CESA 2WCSA 1MQQA 2OLHA 4ZENA 3AIWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3NSN A;  3GBE A;  3AJ7 A;  1XH1 A;  1JI1 A;  2CBI A;  4DWS B;  5JIP A;  4W8L A;  3MSD A;  1ODZ A;  1SFS A;  4HME A;  3SCP A;  2D1Z A;  3WQ5 A;  3GM8 A;  2QJ6 A;  2D23 A;  1QI2 A;  3TTO A;  1JZ8 A;  3VOC A;  2DSW A;  5BXP A;  1GW1 A;  3CUF A;  5F7U A;  1FHD A;  1S46 A;  1C7T A;  4OBR A;  1NAR A;  5CG0 A;  2VNC A;  4EAM A;  1EHN A;  1ZL1 A;  1DWG M;  4PCS A;  3WQ4 A;  3I3E A;  3ZR6 A;  1HJU A;  1OCQ A;  2YIH A;  1HXJ A;  4AZ7 A;  1H11 A;  1UZ4 A;  2A3B A;  1CXL A;  1W91 A;  3IJ7 A;  1XSI A;  1G0C A;  3CMG A;  4P7O A;  5KEZ A;  5JBE A;  1JD7 A;  1CXI A;  3A6O A;  3NSM A;  2OWC A;  1QNR A;  2C8N A;  3FHQ A;  1UKT A;  4JKK A;  3RO8 A;  1UKO A;  4HOZ A;  1M03 A;  2ZUM A;  4JKM A;  3AMC A;  2WVT A;  2GK1 B;  3POH A;  1FH9 A;  4AZI A;  4TVD A;  2BXY A;  4DUW A;  1JAE A;  4OJY A;  4DUV A;  3EDD A;  2WPG A;  2VZT A;  3VMO A;  1E15 A;  4HA3 A;  4GKL A;  1H2J A;  4U33 A;  4Z2I A;  1LF1 A;  1U2Y A;  5D9O A;  4HZ8 A;  4XX6 A;  1J10 A;  1UHV A;  3HU7 A;  5A8N A;  1E56 A;  3CZ8 A;  1TUX A;  3KL3 A;  4PMX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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