4IX2A

Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from vibrio cholerae, deletion mutant, complexed with imp
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
359
structure length
334
Chain Sequence
MLRIAKEALTFDDVLLVPAHSTVLPNTADLRTRLTKNIALNIPMVSASMDTVTEARLAIALAQEGGIGFIHKNMSIEQQAAQVHQVKISGGLRVGAAVGAAPGNEERVKALVEAGVDVLLIDSSHGHSEGVLQRIRETRAAYPHLEIIGGNVATAEGARALIEAGVSAVKVGIGPGSICTTRIVTGVGVPQITAIADAAGVANEYGIPVIADGGIRFSGDISKAIAAGASCVMVGSMFAGTEEAPGEVILYQGRSYKAYRGMPEGIEGRIAYKGHLKEIIHQQMGGLRSCMGLTGSATVEDLRTKAQFVRISGAGMKESHVHDVQITKEAPNYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from Vibrio cholerae, deletion mutant, complexed with IMP.
rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Vibrio cholerae o1 biovar el tor
total genus 100
structure length 334
sequence length 359
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2013-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ix2A00
1WV2A 3NPUA 3TX9A 3V75A 1OFRA 1YDVA 3MI2A 4UNKA 2WOQA 1VGAA 4IXXA 3WJWA 2Z0IA 1IXQA 1W5NA 1V7YA 3BLIA 3GYEA 4FX8A 1LOLA 1HG3A 3BG9A 2VFFA 2YYUA 4WJEA 2B7PA 4LV4A 1XDMA 3LHWA 1YDOA 4O57A 1KM0A 4RJEA 3TROA 4ORMA 2DZTA 3NO5A 2CZDA 1I8JA 2VELA 1MZHA 2X1TA 3TJXA 2YFNA 4RCXA 3HBLA 3W1AA 3KVKA 1NEYA 5G4WA 4CNOA 4MOZA 3NM3A 3EWZA 1A5SA 3HPSA 4XUGA 3F4NA 2H90A 3G1AA 3L0NA 4OV9A 2VEKA 1K7EA 1KM3A 3LCLA 5K9XA 3TR2A 2CLIA 2C14A 4JIPA 4BR1A 3HF3A 2FPYA 1EWEA 1VS1A 1VLWA 5HMSA 5BW6A 3M7WA 3KXQA 5AHFA 3O6YX 4M7TA 3EEGA 4UMBA 5CZSA 2BZNA 4UFHA 5C55A 1BTMA 2ZRWA 4O54A 3ATZA 4JYDA 4NNAA 1YADA 4K8EA 1IXNA 4JN6A 2VFHA 2NX3A 4BI6A 3MHFA 5FF0A 5AHMA 4JY9A 4Q4KA 2TPSA 1UJPA 4KFOA 4AAJA 1WXJA 1D3GA 3IVUA 4CQAA 3MI3A 4AEOA 4N02A 4YCPA 5I3IA 4ZQRA 2NZLA 4DBDA 2ZZ1A 4AWUA 5CPLA 2DZUA 4BI5A 4TR9A 2C1HA 1KFCA 1KV8A 3OVPA 4Y9AA 5FF7A 3SI9A 5BRBA 2NUYA 1ME7A 1PV8A 2ALDA 3W1RA 1X8FA 1W3TA 2B7QA 1V5XA 3W88A 3TE9A 2ZBTA 1ICPA 1W0MA 3UPBA 3G1VA 2A1YA 3W1XA 2I9EA 3N14A 4FNPA 3KFTA 2YZRA 4NU7A 3CHVA 2QCCA 1MEWA 3QJAA 3N73A 2CLLA 1JULA 2OT1A 4KFPA 5F1UA 3DZ1A 3TKFA 3PBUA 4UTJA 1NVMA 3HG2A 4MY1A 2RH9A 1K03A 4TU1A 4K8HA 3CPRA 3N19B 4NT0A 4WD0A 5FI8A 3BLFA 4RX0A 2J9XA 3C6CA 1TPWA 2H6RA 1DQWA 3W7IA 1NF7A 3N3MA 3S1VA 2Y89A 5KZEA 2GJLA 4RZ5A 4N6FA 5EPDA 3TU9A 3GNDA 3TSDA 1LCOA 4FO4A 1GYLA 4OV4A 2ZA1A 1QOPA 2E5BA 3G18A 2VFIA 3OG3A 4MZ8A 3HJZA 3P62A 3P80A 4UTWC 2E09A 2O7QA 3UYCA 5J5DA 2ZRUA 2DJLA 4HT3A 3UWYA 3EX6A 6ALDA 3QMRA 4X2RA 3M0ZA 4FNQA 3L67A 1JQXA 3W7OA 1OX4A 4ZQNA 1GT8A 4NJGA 4LUIA 1RD5A 3C56A 2CLMA 3G0XA 1Y0EA 3PWAA 3TUUA 1GJPA 2BSLA 1TPVA 4LY8A 3T55A 3UQNA 1TQJA 3NZ1A 4LRTA 1TO3A 1LRTA 2P0OA 1SO5A 1SW3A 1RVGA 3LCHA 3L66A 1HUVA 4IQLA 3QRHA 2HMCA 4YCOA 1D3HA 4BWLA 4OWGA 1WX0A 4R33A 4HPXA 3PBWA 3LXCA 3LOTA 1JUKA 1YLVA 3B05A 3ANYA 1Z41A 1YPFA 2OCZA 3R12A 1ZJIA 4WY0A 1ZNNA 3FS2A 3EWUA 3DFQA 5TBOA 3VKJA 4UR7A 3W76A 4LW7A 3GDLA 4KWWA 1ZALA 4O12A 1GVRA 4MYXA 2ZQ0A 2TYSA 3IIVA 2A6NA 1DORA 4GUJA 3DU0A 2FTPA 5CZ0A 2CZFA 1QFEA 1QAPA 5AN7A 5D38A 1OFOA 3M5ZA 4RK8A 3O15A 3IGXA 4ZQCA 3LI0A 5HUOA 5AB3A 1XBXA 3O05A 4N2YA 2C6QA 1GG0A 4MJMA 3P60A 3GR8A 3BG3A 3TNOA 3RNDA 4CCEA 2ZTJA 5K4XA 1GPWA 1O95A 2DORA 5DELA 4Z0SA 5G2IA 4O50A 5D37A 5LHFA 3MI6A 5AHIA 1CW2A 4PL2A 3HGRA 1TYGA 3DFPA 1XUUA 4PL1A 1PL9A 2NXGA 2CWNA 2B0MA 3IVSA 1G4EA 3PSVA 5F4XA 2FDSA 2VEIA 1LM1A 1XM3A 3L9CA 5HUPA 3MO7A 1DBTA 3DXIA 1XCFA 4O13A 1S5WA 3G1YA 4FEZA 4IPIA 1QWGA 3IVTA 3R5EA 4AWTA 4JD4A 3BPWA 4WQ6A 3OEXA 2OT0A 3PB2A 3P81A 3DI1A 3SIZA 4UNLA 1I2OA 2DZSA 1R2SA 3INPA 1U83A 3L65A 2E6DA 1A50A 1MSSA 2AAMA 4IX0A 3T40A 3QPZA 3GR7A 1TJRA 2V8ZA 1H62A 3S5YA 1TRDA 3W2LA 3M44A 3RLVA 2QCFA 4O16A 2E5CA 3S5OA 1C8VA 1GWJA 2C16A 5DY3A 4XZ9A 4AWSA 1P0KA 2RDWA 5CPNA 3W73A 2Y7DA 2GQAA 3UZ5A 4HNVA 2Y70A 3R13A 3M1ZA 5K7JA 1FXQA 2FLIA 3CU2A 3TH6A 3PSWA 4K6AA 4DXVA 3C3NA 3NA8A 2B7NA 3I7SA 3LLDA 1AL7A 2ZFAA 5KINA 4E0CA 4O52A 1H5YA 2C13A 4LC6A 4LS1A 2OJPA 4HKPA 2HS6A 1AW5A 5KMYA 4MZYA 4UR8A 4JTEA 4Q32A 1LTDA 4LVAA 1JUBA 2WQPA 2QEZA 1SW7A 3NG3A 3W07A 1LLZA 5AC6A 5CG7A 3HG5A 4FNTA 4NNCA 4S2CA 5D03A 5FF3A 4O15A 5DCEA 3GXNA 2F84A 4E2DA 3F4WA 2VFEA 2H3DA 1SFJA 1K8XA 4HNTA 1SZFA 1VLIA 2NXHA 2A7PA 3L5MA 1JRCA 1G67A 1OABA 2YCEA 3H53A 3B03A 1VCFA 3N2XA 3NDOA 4NXKA 5AYZA 5EKYA 2TSYA 4MZ1A 2V0TA 3JRKA 1KV5A 3MP3A 2A4AA 1N55A 4XWUA 5DCDA 4ZZ9A 3B4UA 4EF8A 1BWLA 2AGKA 1W56A 3C52A 3HPXA 4AHOA 1OFBA 3VNDA 1SZGA 2JGYA 4K39A 5AFDA 1OYBA 1YTEA 4BFAA 3G0UA 2C19A 4LS0A 2GPTA 3LCXA 2GVGA 1QO5A 1S5TA 4TMCA 4OQVA 1IF2A 2G96A 1S3HA 2QR6A 3LRMA 4I7UA 3FLUA 4GWEA 4UTLA 4HIBA 4FXSA 1W37A 5D2XA 1KA9F 4EVZA 5FEXA 3DI0A 2PRLA 2EF9A 3W87A 2ZCGA 4FXRA 4N9CA 4S1FA 6TIMA 1M7OA 1XL9A 3B8DA 1SQ7A 2NXIA 4MJZA 3BW4A 3W7MA 4DPQA 4DBEA 3NXFA 5F2MA 2BX7A 3V1PA 4MLRA 1AW2A 1L9WA 3STEA 5K2ZA 4OE7A 3B04A 4WY0F 4N6EA 4JTJA 1H1YA 4I7VA 4I9AA 5EBUA 5HINA 3BVJA 3NQMA 2JBMA 1ZENA 4PODA 4KFNA 4Z0JA 1UASA 3CEPA 1F05A 3NQAA 4UFKA 3QEZA 3KRSA 2QJIA 4MY8A 1SW0A 2A7RA 4OU1A 4JX4A 1J4EA 3LCGA 1QDSA 3B06A 3MWAA 4O10A 3IIPA 3S5ZA 2ZRYA 3LCWA 1UB3A 1VQTA 4JNMA 4MFEA 4KKXA 3HB9A 4N4PA 3RF9A 3UWZA 5HWMA 1ONRA 1QPNA 1VJIA 1W3NA 3MMTA 1F74A 4GNJA 4W9TA 3NPWA 4FNRA 1T96A 2VFGA 1PHQA 2V81A 1B57A 3LRLA 5CPOA 3PR2A 3QF0A 1C29A 3L21A 3UD6A 5I3FA 3NM1A 3C2OA 3W1MA 4XKYB 5AYXA 3LXAA 2NV2A 3QW3A 4AF0B 1DOSA 5EL1A 3SFKA 5I3GA 1WQ5A 3D0CA 5GVJA 5T26A 1EP2A 3EX3A 4LTSA 4JTFA 4X3ZA 4YWIA 2E6YA 2V30A 3QPYA 2QCHA 1AL8A 3ATYA 3RMJA 1H7RA 2GJNA 1WBHA 1R47A 2ZA2A 5DBTA 2PCQA 1KFBA 4K7YA 1HTIA 1XUZA 3PULA 1SFLA 1FX6A 3NL5A 1SO3A 1RZMA 3EKLA 4MLJA 2JKAA 4QAIA 5IM51 3FKKA 4PEKA 3TV8A 2QF7A 3UZJA 1W1ZA 5LNUA 4UTIA 4UTWA 1OFAA 3C8FA 4O1AA 1L6WA 1LP6A 4MFDA 4JDBA 3G0SA 3W3OA 4WX2A 2E6FA 2JKPA 1TTJA 2ZZ6A 3OVQA 4JY8A 1BKSA 2X30A 2CW6A 3KVMA 1OX5A 2R8WA 3I65A 2AQWA 5LNWA 3KRZA 2WSYA 1OK6A 1B4KA 3EXRA 3QMSA 4BK9A 2VC6A 4QIUA 4NUWA 1A5AA 1T0OA 4ALDA 2RDTA 3KVJA 1KM5A 2XN0A 4XQ6A 1ME8A 2QKFA 1OF6A 1TPB1 3A22A 3SGZA 3AJXA 4ZVJA 4O17A 1W31A 1KFKA 2J6XA 3FOKA 4M5PA 2YX0A 3SW6A 2BXVA 4O28A 1G7VA 3LERA 3W7GA 1XI3A 2ZDRA 2QCEA 1F7BA 1MXSA 1JQVA 3UWWA 3A5FA 4JX5A 2NV1A 3PAJA 2PC4A 3WJSA 4EOUA 1TPH1 2W0UA 5LNRA 3LHVA 1GVOA 3CIWA 1VRDA 4L4MA 1TTIA 5AOUA 1TV8A 3EWWA 5BMXA 4ZQPA 4TX9A 1SSDA 4AHQA 2H8XA 4C1KA 3VE7A 1OYAA 2DZWA 4R7JA 1JRBA 2NX1A 1QPOA 2DU2A 1H7NA 1I45A 4C1LA 3C2VA 3LCFA 1R46A 1X1ZA 4AMAA 1G4SA 3N2MA 4Z08A 1GTHA 3GVGA 1J5TA 1P0NA 1G69A 3DHFA 3DKJA 1SU5A 3EX4A 4TMBA 2VFDA 3DGRA 3GB6A 1KW1A 4LC8A 3IGSA 2VEMA 1XBVA 1ME9A 3TQ0A 3NL3A 3CIXA 2V2CA 3M6YA 1H51A 3UPWA 4JIQA 1K02A 3LHZA 3TXVA 3G1DA 2E77A 1DHPA 1F2JA 3HGOA 4HN4A 3N9SA 1MO0A 1VC4A 1N8FA 4IXHA 4LT9A 2CLHA 3A5VA 5AHEA 2GQ9A 1AG1O 5A8GA 5HWNA 5D2YA 1T99A 4HNUA 5FEPA 3GDTA 3W7NA 3P8JA 4MPQA 3GXTA 3GNNA 1KTCA 1TTPA 4QM1A 5KSWA 3W7KA 3NAVA 3R8RA 4L4LA 3CWOX 3QFEA 1TPDA 3PBYA 4YLWA 4ZQMA 1H7XA 2YSWA 4UXDA 1VHCA 1Q6OA 4EF9A 2D73A 2Y6ZA 5J5RA 1FCUA 3DENA 4N9BA 5HWJA 3GXPA 2QCNA 4DF1A 2V82A 2Q8LA 1HL2A 4ICNA 1NAL1 1CX9A 2LLEA 2ZYFA 3E0IA 2X1RA 3M16A 1CI1A 2C18A 1DJNA 3MJYA 3K30A 1EX5A 1NSJA 1XDLA 3Q2DA 5F4SA 2W79A 4UFIA 2G97A 4RKAA 3R89A 4OHQA 2QCGA 3THQA 1R2TA 1EUNA 3QM3A 4E38A 5HULA 4OT7A 1YTKA 4M6QA 1VZWA 3NQ7A 4RR4A 3P5ZA 3WJXA 3HG3A 4IJBA 4NX0A 1UBSA 3C61A 5SWUA 3JS3A 2QCDB 1H1ZA 5F2IA 3RFAA 4LVFA 3GIYA 1SO4A 4DO5A 5H2ZA 3ABSA 4QJ1A 1GTEA 4AB4A 4XBKA 1C9DA 5IBXA 1XBZA 1K8YA 2Y61A 4O53A 5MHBA 3O8AA 1M6JA 3W2NA 3HG4A 3M9YA 4EWND 3UWUA 4JGDA 3A24A 1KM1A 3LCIA 4N9DA 1KBJA 2P10A 4UTMA 2FPVA 2J24A 3ZR4A 1LOSA 1FDZA 3CTLA 1RQBA 3F1QA 3M47A 2QUTA 2CZ5A 3NQ8A 4JTKA 3W7JA 4DO4A 1H7PA 4KWVA 1EB3A 1XBYA 3HPZA 4JTTA 1Q3NA 1OFDA 2QCMA 3W72A 1Z48A 3EKZA 5LSMA 5DLCA 3DFOA 3HO8A 3WFAA 3E49A 1FDJA 3GK0A 1F76A 3T4CA 1KFJA 3I68A 5AHNA 1YDNA 1SPQA 4UFMA 4NQ1A 4E2BA 4WOQA 4POCA 5G1YA 4IPJA 3CM4A 1FWTA 1HFBA 4FX7A 1IGSA 4GRSA 1VCVA 1KBIA 1P1XA 3UY7A 3TQVA 4GUFA 1TB3A 1GOXA 1JCLA 1OYCA 4Z1AA 5CZJA 1H60A 3FFSA 1LLWA 1JJKA 2YW4A 4A21A 4P61A 5DXYA 5FEWA 1GEQA 3M5YA 2Q3OA 2FJKA 3TC7A 1F5ZA 3Q37A 2WNZA 3G1XA 3E12A 1MEIA 2YR1A 1F6PA 2X2GA 4LVGA 2VENA 1OFQA 1OFEA 1GQNA 3SZ8A 5L9FA 2GVLA 4DELA 1TTQA 4PFMA 4CNPA 1Q45A 4PA8A 2OMAA 5EYWA 3T44A 2EHHA 3WK2A 4G1KA 1X6UA 4AXKA 4NXSA 5KITA 3FIGA 1PE1A 1K7FA 3I7QA 3W7QA 2CLFA 1LRQA 2XN1A 3CB8A 3L2IA 4JYFA 1THFD 3IIZA 4O19A 3PUOA 5TIMA 3UXAA 4GUGA 3KOFA 2V5BA 3G8RA 2P1FA 5DY2A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4GD0 A;  3V75 A;  4LCQ A;  2CLP A;  1VEN A;  1Q7Z A;  4NIL A;  5CG0 A;  4PCT A;  3EDF A;  1W5N A;  4Z2K A;  1FWB C;  2QT3 A;  4H01 A;  2J8T A;  1VPY A;  5E6Z A;  3T8Q A;  3TRO A;  4ORM A;  4UR9 A;  2DZT A;  3NO5 A;  2CZD A;  2GSH A;  2VEL A;  3TJX A;  4ZOB A;  3CAV A;  3KVK A;  1V3M A;  3KS6 A;  2J79 A;  1GOO A;  1XLI A;  3VIG A;  4E6M A;  3LD5 A;  3FX4 A;  2GZX A;  3M0Y A;  1M7J A;  3HPS A;  2XVG A;  2H90 A;  4IIC A;  4C6L A;  3LCL A;  1KM3 A;  1UIO A;  2C14 A;  4JIP A;  5KZ6 A;  5HPO A;  1EDT A;  2XIQ A;  1EWE A;  4ERA A;  3CV1 A;  5AHF A;  1JAE A;  4PCN A;  2Z1K A;  1A0E A;  3TTO A;  4G5D A;  1AH3 A;  2PAJ A;  1UMY A;  1E4I A;  3I3D A;  4IIH A;  5C55 A;  1OD0 A;  4O54 A;  1IXN A;  3GFZ A;  4JN6 A;  2VFH A;  2NX3 A;  5JXQ A;  1PIF A;  2XSB A;  2GVY A;  3MHF A;  2Z26 A;  3AU6 A;  1BYD A;  1OGG A;  2TPS A;  1E6N A;  2WWC A;  2OQY A;  4H8V A;  3MKC A;  4YTQ A;  4HYW A;  3MI3 A;  3LPO A;  4J3Z A;  4M8U A;  4F2U A;  3ZLF A;  4IL0 A;  4BI5 A;  2BFG A;  2BY0 A;  3OVP A;  4Y9A A;  5BRB A;  1ELS A; 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