1R86A

Crystal structure of the extracellular xylanase from geobacillus stearothermophilus t-6 (xt6, monoclinic form): the e159a/e265a mutant at 1.8a resolution
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
371
structure length
371
Chain Sequence
KPHISALNAPQLDQRYKNEFTIGAAVEPYQLQNEKDVQMLKRHFNSIVAENVMKPISIQPEEGKFNFEQADRIVKFAKANGMDIRFHTLVWHSQVPQWFFLDKEGKPMVNETDPVKREQNKQLLLKRLETHIKTIVERYKDDIKYWDVVNAVVGDDGKLRNSPWYQIAGIDYIKVAFQAARKYGGDNIKLYMNDYNTEVEPKRTALYNLVKQLKEEGVPIDGIGHQSHIQIGWPSEAEIEKTINMFAALGLDNQITALDVSMYGWPPRAYPTYDAIPKQKFLDQAARYDRLFKLYEKLSDKISNVTFWGIADNHTWLDSRADVYYDANGNVVVDPNAPYAKVEKGKGKDAPFVFGPDYKVKPAYWAIIDHK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Geobacillus stearothermophilus
publication title Crystal structure of the extracellular xylanase from Geobacillus stearothermophilus T-6 (XT6, monoclinic form): The E159A/E265A mutant at 1.8A resolution
rcsb
molecule keywords Endo-1,4-beta-xylanase
total genus 147
structure length 371
sequence length 371
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1r86A00
2AMGA 1E4MM 3RM9A 4BS0A 4EKJA 1B90A 5I2UA 1WZKA 4AW7A 4CD6A 5GPRA 3BLPX 1I1XA 5E0FA 3CHDA 3SURA 4JKLA 2ESCA 3WQ8A 4MNKA 3WNNA 3VD3A 1KXVA 1J0KA 1CXEA 3WDJA 1VENA 3VD9A 2Y5EA 3GDBA 1U33A 5JBDA 2VZUA 3ZJ6A 3TOPA 3O2LA 3F4VA 4CN4A 3K8MA 2PBGA 1JXJA 3ARQA 4ZEPA 3VM7A 2WKGA 1P6WA 2WCAA 3OBAA 1NP0A 3AIEA 2WC7A 2CEQA 1JFHA 3UG3A 1LLOA 1C92A 1KCLA 3QOMA 2VC9A 4F66A 1W9UA 2CBIA 1LG2A 3ARZA 4HPGA 1MW3A 2FHBA 2DPEA 4B3KA 4Z2HA 4X9YA 1A47A 3AZSA 4CD8A 2OWXA 2E9LA 4MTVA 1FH8A 3QOKA 1SR0A 4QLLA 3WEZA 2ZUTA 1KQZA 2YL9A 1BG9A 2EQDA 3GH5A 5ABGA 2W63A 4D6HA 1DWFM 2WZIA 1ZJAA 4FLQA 1JIBA 2WVUA 3VIKA 2C0HA 2WZHA 4PMNA 1EXPA 2J4GA 1BF2A 3DYPA 1M04A 4W84A 4OZOA 2J7FA 4WKHA 3ARPA 2WWDA 1OT2A 4AZ6A 1W1PA 3AS1A 4KRUA 3A47A 3T2OA 2WMIB 4KH2A 1E6RA 3B8SA 1DWGM 2V3FA 2W92A 4TVCA 4DUVA 1JD7A 1BYDA 2EPKX 1UD8A 2XWDA 4BQ3A 2O9OA 1VFFA 3ZM8A 2BY2A 4KMQA 3ZJKA 1UR0A 2EXOA 1GJWA 1OT1A 1M7XA 2CNCA 4YN5A 5HDRA 1UZ4A 5F7UA 2DH2A 4U5IA 1GQJA 4AISA 2VZTA 1UKPA 3K8LA 1YQ2A 5JUVA 3W27A 1R86A 4J7RA 4ACZB 4H7VA 4AEEA 2XPKA 4MDOA 1U30A 1E6XM 3AXIA 5CZKA 3NCOA 3KEHA 1B31A 3AIRA 3WD2A 2PWEA 1KXHA 5HPOA 2Y4SA 4AD5A 3BSHA 2DQXA 4JIEA 1QI2A 1CXLA 4Q7NA 3ZSTA 1XCXA 4UQAA 4GZEA 3SCSA 3NDZA 1R8LA 1E0VA 3MMWA 2X2YA 2A3HA 2A3CA 1V02A 5CPQA 4CVUA 3ZIZA 2OYKA 4RL3A 3VX1A 4XZBA 1QNOA 2WM0A 3K4DA 4HZ6A 2CXGA 1GOMA 1Y7VA 3W29A 4TVUA 3BAKA 3IAPA 5E0CA 3SCVA 5M17A 3GNOA 2NW0A 4Z2KA 1CWYA 3NSMA 3WDHA 3DECA 4D71A 1HT6A 1XC6A 2FH8A 1LL4A 3OLDA 3KWXA 5I77A 4TXEA 1PX4A 5CGTA 3S6TA 1QPKA 2JEPA 3WQ6A 4M56A 2VX5A 4TX6A 2B31A 4M81A 3OLIA 3RJYA 3TTQA 4D6FA 4LQ1A 2GK1B 2UWFA 3AMCA 5ECUA 1BFNA 3MUAA 4D6GA 3T0DA 1ODUA 4UQ9A 2CHOA 2YA1A 3CBWA 4WSJA 3NJ3A 4UFMA 1ZS2A 4PMVA 3MKKA 5A8OA 2BY1A 1WP6A 4PUDA 2Z1SA 4D6IA 3N04A 1V6VA 4QLKA 1H49A 1EHNA 1KB3A 4CKQA 2BVTA 2GSJA 3AI0A 3MMDA 1OD0A 4L4OA 1MXDA 5EMYA 2VRKA 4DWSC 3LPPA 2VO5A 2QLYA 5EFFA 4IUGA 3QGVA 3LPGA 3OZOA 1Q6DA 1HJQA 4X0VA 4E8DA 3FXYA 5A6LA 4AEFA 4JKMA 4JZ5A 1C3FA 3N9KA 2CBUA 3NYDA 2WVSA 1DP0A 3EMCA 3ZO9A 3AIUA 1MQRA 1H11A 1UR4A 2W91A 2PC8A 3NSXA 1B3YA 4F9DA 2X1IA 1CYGA 4FF5A 3VD5A 4EANA 5D9OA 4LYPA 3AZRA 2W66A 3CHCA 3FHAA 4QAWA 4U31A 5DT5A 2J62A 1HJUA 5BWFA 2WW5A 4H2CA 4J28A 3T0AA 1SMDA 1UWTA 4UOZA 4TOQA 2Y8KA 1EA9C 2EO7A 4YPJA 3K8KA 4PCSA 1OB0A 1CGYA 4IM4A 1V6YA 3BMWA 2WPGA 2DT1A 3CUHA 4JKKA 2V3DA 2DDXA 1UKTA 5IFPA 1VEPA 4AIUA 2ZUVA 3DYOA 3GXIA 2WCSA 1EH9A 1L0PA 3MSGA 2GJXA 1E72M 3SUUA 5E6YA 2QMKA 1R7OA 3IJ7A 3ARTA 1Q4NX 4CVWA 2CBVA 1GJUA 1TE1A 2GVYA 4KGJA 1UWSA 1VRXA 2VQUA 4W7VA 2FDMA 2VT0A 2WVTA 1XH0A 1US2A 4JFVA 4DUWA 3VX0A 3HN3A 5HOSA 1F4AA 1GNXA 2ZWYA 1W3HA 1R87A 3GNPA 1KGUA 1V3MA 4UR9A 1V3HA 4CGTA 5JBEA 2MANA 3CHEA 3VMOA 2PBOA 1KR1A 1KWGA 1BVNP 3M6DA 4CCCA 2J7GA 1NWTA 3ZT5A 1OGSA 3SCPA 3HU7A 3TTOA 2WMKA 3VKKA 1LF1A 1OWQA 2RGLA 7CGTA 4JHZA 5IFTA 1PZ2A 4NF7A 5IHSA 3TTYA 5A95A 1VEMA 3AS3A 2E8ZA 1LG1A 2XVLA 2V38A 2GUYA 4LXFA 2BHUA 1FHLA 5M3WA 1HL9A 5LA0A 5A8QA 2OWWA 1DTUA 1FFQA 2YA2A 5I24A 2G4FA 4W85A 3ALFA 1B3XA 2OSYA 1KGWA 3RMEA 1CECA 3WDRA 4UZSA 1GOQA 2JEQA 2J74A 4Z2JA 2ZX6A 2J79A 1NP2A 2WVVA 3GH7A 3KZSA 4M8UA 4PSRA 3BMVA 1E5NA 3OLGA 2A3BA 3O6AA 1CENA 3UESA 4BZYA 1V3LA 3U7VA 2YDRA 1C8YA 1E1FA 1UH3A 4PMZA 3W6LA 3W6MA 1JL8A 1D2KA 4PMXA 1BTCA 2CHNA 2UY5A 2YL6A 4UFLA 3QHMA 1W3KA 3MUIA 1SMAA 3CZJA 1TCMA 2Y24A 1GOOA 3A3HA 3W53A 2Y8VA 1XD0A 2ZUMA 3DC0A 4AZ7A 5I6SA 3U7BA 4PSPA 4NRRA 5IXEA 1DWJM 1BAGA 2CPUA 1QOXA 2WB5A 4LX4A 1VJZA 4D6CA 4N0RA 1KR0A 1EDTA 1QNQA 1TFVA 3SCOA 2C7FA 2J77A 4UFHA 3HJEA 3WNMA 4R5EA 1CTNA 3GM8A 5BXRA 5AYBA 3AMDA 3QHOA 4GI8A 1EDQA 1GORA 5BCAA 1CXKA 1XYFA 2BVYA 3AICA 1C8QA 3NDYA 4HMEA 1JYXA 1JG9A 4QCEA 1MFUA 4ZE5A 2Y2WA 3CZEA 3L4VA 4UFJA 1CEOA 4LYRA 1WDRA 5E09A 4PTWA 4Y7EA 3FN9A 5CLWA 1QBAA 4IPNB 3EBVA 3MV01 2VI0A 3VGBA 3VDCA 4PMQA 3GNRA 3CGTA 2VQTA 3PZGA 3WMSA 5D4YA 1E3XA 4AIEA 5HPCA 3WMCA 3L2LA 2VTFA 4ZXLA 1HJVA 4DM2A 5D8ZA 2WWCA 2WHKA 3T2QA 4W8AA 4WJXA 3WQ5A 2QF8A 3VILA 1W32A 3CHFA 2QHAA 3AHVA 3BAIA 1HL8A 2YJQA 3D3AA 3RPMA 1E70M 2BNJA 2PWGA 1KGXA 1G5AA 1J0IA 4W87A 4EK7A 3KL3A 1H09A 2FHCA 1LQ0A 4QDMA 1GZJA 1UR2A 4GZJA 2QV4A 1UR9A 5E70A 4BQ2A 4TTUA 2CIPA 2DIJA 1UKOA 3EDJA 2XYLA 4W7UA 1HNYA 4HMDA 1CLXA 1MW1A 3W82A 4MNJA 5BXSA 3N15A 5ABFB 4D1JA 4PRWA 3CLWA 2WC3A 1E3ZA 1V3KA 5JBFA 2YA0A 3OG2A 1VBRA 4QLJA 3PZOA 1V6XA 2HISA 3ARUA 1WDQA 5CGMA 1IZJA 2V3GA 8CGTA 3PZQA 1JYVA 4U2YA 1QNPA 1M01A 3PZMA 3WF4A 1OGBA 4ACYA 1JAKA 4U5KA 1CGUA 3MUZ1 1MQPA 1ISWA 2AAAA 4UQDA 4CCDA 1VB9A 2QMJA 4MAVA 3WY1A 3RM4A 1HKIA 3CMJA 4W8BA 5DO8A 2YLAA 1Z32X 3AHYA 1IT0A 4J3VA 3ZT7A 4DWSD 2CERA 1B2YA 2D2OA 3AMKA 3WBAA 2OSXA 3WD4A 4AZGA 2WSPA 1AMYA 4F79A 2ZWZA 1VF8A 3M46A 4AD4A 4W7WA 4W88A 1HVXA 2WLZA 1XH1A 3DHPA 4HOWA 1HVQA 2ZX7A 1B30A 1V0LA 5FOOA 4H41A 4XV0A 6CGTA 3AROA 1X6NA 1VFOA 1KBKA 1TMQA 1WZLA 3F5KA 2DT3A 4AZIA 3VDBA 1EHAA 5FL1A 3WUBA 4GO9A 5CSUA 4FMVA 1E9LA 1NQ6A 1VFMA 5BXTA 4XZWA 2G8ZA 4Q22A 4PTXA 1V3JA 4CCEA 2ZUNA 1PX8A 3W4RA 1AQHA 2CITA 2XSAA 3CPUA 3WF0A 2X0YA 2C8NA 1NARA 1TZ7A 3B9EA 3WEOA 1H41A 1MVYA 1JXKA 2UY4A 3WFZA 1WDPA 3BAYA 5A8NA 1JF5A 3NUKA 5IDIA 1EOMA 4UQEA 2XFFA 3EDEA 1PAMA 4R27A 3VU2A 3UETA 3U5YA 1RD6A 2WKLA 3MS8A 2ZUSA 1R7AA 3WD0A 3PZ9A 1O6IA 4V2XA 1H2JA 2YKKA 1BYAA 2XG9A 4J3SA 1JI1A 4DWSB 5HBFA 4XX6A 2OSWA 1IV8A 4M29A 3VMPA 2BFGA 5A3HA 1KXTA 2AOSA 2ZICA 3CTTA 3WN6A 1HP4A 1C90A 2UY2A 4FLRA 2PWHA 1QHZA 1W9BM 4WLCA 1FP8A 1WZMA 3IJ9A 3UCQA 3CZKA 1WO2A 5CPTA 1BYCA 3WF1A 2DT2A 3VGEA 2VZSA 4N42A 2XWEA 3EDKA 2J47A 4JHOA 4PTMA 1PEZA 1UWIA 1WZAA 4M82A 2DH3A 3AXHA 3WDIA 3FAWA 1Q6CA 5A8MA 4BF7A 1DEDA 4TX8A 1W1YA 4AZCB 3PZTA 2EPOA 2O9PA 3QHNA 3PBGA 3PN8A 2ZXAA 1VIWA 5A6JA 5AC4A 3BCFA 3IANA 1QNRA 3GZAA 4C7GA 3MU7A 1EGZA 2WMFA 5D9NA 3VINA 1KXQA 3FHQA 4L4PA 4IPLA 3OLEA 1UD6A 1JZ2A 1E4NA 1K9EA 5JIWA 1B9ZA 3VO0A 2X05A 2IXUA 1G01A 3OGSA 2QPUA 5GNZA 3LPFA 1Q6FA 5I79A 2E0PA 2WXDM 4U2ZA 3VIMA 1H5VA 2XGIA 4UOQA 3IK2A 3CUJA 4GZIA 3VIIA 3TA9A 5E6ZA 1C93A 1Q6EA 5E9AA 2WHMA 4JCLA 4XUYA 3SCRA 4LPCA 1QI4A 2G3MA 1V6UA 4CD4A 1B3ZA 4A4AA 3M07A 1TR1A 4P7RA 4GI9A 2DSVA 4YHEA 3WNOA 2WMIA 3AZTA 3W26A 2CCRA 5M03A 3AHTA 3L4WA 1VJSA 3ARXA 3WH5A 2V5DA 1B3WA 2FHFA 1UYQA 4TUFA 3WBEA 1BGGA 1TA3B 5A6AA 4CU7A 2J7HA 3THDA 2OWCA 4CU6A 2XHYA 4AXNA 1H3GA 2WZEA 3VM5A 1XCWA 4WKAA 2OYLA 1M03A 2BVDA 4OBSA 1JNEA 8A3HA 3BSGA 3AMLA 3NIYA 1K9TA 4W86A 1VAHA 3N12A 4ACZA 3VGHA 2XJ7A 2ZE0A 1SYTA 2Q8XA 2YL5A 4PMOA 1E4LA 1VBUA 2VCBA 2XFRA 3EDFA 2DSKA 2J8FA 1OIMA 4W5ZA 5A6KA 5DMYA 4UTFA 2E40A 1H1NA 1MWOA 3VIPA 1OINA 1J12A 1TVPA 1OBAA 3AMGA 1UG6A 4PEEA 3BC9A 4FK9A 2W67A 3IAQA 2VZOA 5A6SA 3OA5A 2XTKA 1H0GA 2DSWA 4M1RA 1PZ3A 4OBRA 3WDQA 1DWIM 4QFUA 3ZMRA 1M53A 1E43A 3AIVA 3WD1A 1EOKA 2XVNA 5ABHA 3G6LA 4MNLA 5I3DA 1GONA 4AIOA 1MFVA 3A4AA 4Z2IA 5GQBA 2E3ZA 2WCGA 2ZXDA 2EJ1A 4MJ4A 1GQLA 5BXPA 4ML4A 5A69A 2PWFA 1I75A 2J78A 1GCYA 2WHJA 2WSKA 3CUGA 3TONA 2GJRA 3L4XA 3LPOA 1AQ0A 2GK1A 1NOFA 1XRVA 1JF6A 4B16A 1G0CA 1CBGA 1FA2A 5EBAA 5A2BA 5GNXA 4HPHA 5D9PA 2FH6A 3KL0A 4W5UA 3ARYA 1W3JA 2JIWA 1GOWA 2CESA 1JZ4A 2WYSA 1UWRA 3EMQA 4BA0A 3VVGA 3T09A 5BRPA 3WMBA 4ZE4A 1ZJBA 3SUTA 3TP4A 1UKSA 2VRQA 4NSBA 4C7DA 3HMCA 3L4ZA 3FAXA 2OYMA 1AQMA 4AD2A 2IUZA 1V0KA 3WQWA 1JZ3A 2VR4A 3CIVA 3K4AA 3WDPP 5LA2A 1GQIA 4B9YA 5CLTA 3DHUA 1S46A 1HX0A 3O9NA 3UR7A 1FHDA 3PTQA 2YDQA 1XSJA 1BQCA 2D3LA 4NZCA 1JAEA 4P7QA 5A6MA 5A94A 2NT1A 1OIFA 5BRQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2AMG A;  1E4M M;  3RM9 A;  4BS0 A;  4EKJ A;  1B90 A;  5I2U A;  1WZK A;  4AW7 A;  4CD6 A;  5GPR A;  3BLP X;  1I1X A;  5E0F A;  3CHD A;  3SUR A;  4JKL A;  2ESC A;  3WQ8 A;  4MNK A;  3WNN A;  3VD3 A;  1KXV A;  1J0K A;  1CXE A;  3WDJ A;  1VEN A;  3VD9 A;  2Y5E A;  3GDB A;  1U33 A;  5JBD A;  2VZU A;  3ZJ6 A;  3TOP A;  3O2L A;  3F4V A;  4CN4 A;  3K8M A;  2PBG A;  1JXJ A;  3ARQ A;  4ZEP A;  3VM7 A;  2WKG A;  1P6W A;  2WCA A;  3OBA A;  1NP0 A;  3AIE A;  2WC7 A;  2CEQ A;  1JFH A;  3UG3 A;  1LLO A;  1C92 A;  1KCL A;  3QOM A;  2VC9 A;  4F66 A;  1W9U A;  2CBI A;  1LG2 A;  3ARZ A;  4HPG A;  1MW3 A;  2FHB A;  2DPE A;  4B3K A;  4Z2H A;  4X9Y A;  1A47 A;  3AZS A;  4CD8 A;  2OWX A;  2E9L A;  4MTV A;  1FH8 A;  3QOK A;  1SR0 A;  4QLL A;  3WEZ A;  2ZUT A;  1KQZ A;  2YL9 A;  1BG9 A;  2EQD A;  3GH5 A;  5ABG A;  2W63 A;  4D6H A;  1DWF M;  2WZI A;  1ZJA A;  4FLQ A;  1JIB A;  2WVU A;  3VIK A;  2C0H A;  2WZH A;  4PMN A;  1EXP A;  2J4G A;  1BF2 A;  3DYP A;  1M04 A;  4W84 A;  4OZO A;  2J7F A;  4WKH A;  3ARP A;  2WWD A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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