5U7S | Genus

Total Genus 120

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	120
sequence length	348
structure length	329
Chain Sequence	HHHMALISMRQLLDHAAEHNYGVPAFNVNNLEQMRAIMLAADATNSPVIVQASAGAPFLRHLILAAIEEWPHIPVVMHQDHGTSPDVCQRSIQLGFSSVMMDGSLGADGKTPTTYDYNVDVTRQVVAMAHACGVSVEGEIGCLGSLETVLDHSQLLTSVEEAKQFVADTNVDALAIAVGTSHGAYKFTRPPTGDILAIDRIKEIHAALPNTHLVMHGSSSVPQEWLKVINEFGGNIGETYGVPVEQLVEAIKHGVRKINIDTDLRLASTGAIRRFMAENPAEFDPRKYFAKTVDSMKQICIDRYEAFGTAGNADKIRPISLEKMVDRYK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of a fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype from Acinetobacter baumannii rcsb
molecule tags	Lyase
source organism	Acinetobacter baumannii
molecule keywords	Fructose-1,6-bisphosphate aldolase
total genus	120
structure length	329
sequence length	348
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2016-12-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5u7sA00

1LM1A 3C0JA 1VYRA 2YW3A 3K30A 3GXTA 3G1VA 3QPYA 1B4KA 3JS3A 4I7UA 1RZMA 1OK6A 3NL3A 4CNPA 3LTSA 3DFPA 4AF0A 1XI3A 4KFNA 3OBKA 4LRTA 2VC6A 3GB6A 3MWAA 1KFBA 3BGJA 4A3UA 1RPXA 3MP4A 1EUNA 2YXGA 3R8RA 1TTIA 3UY8A 3UPWA 4MFDA 2Q8LA 3E49A 4DF0A 3B0VC 3U6WA 4NZJA 2JBMA 4MY1A 4WQ6A 1HUVA 5LNWA 4QNWA 3WK0A 1V7YA 3PSWA 1XBXA 5LKYA 4N9DA 1TPEA 2ZQ0A 4O1CA 3NVTA 4DPQA 3JRKA 3P81A 1K7XA 3W70A 3EKLA 4MOZA 2QCHA 3MHGA 4K7YA 3W84A 1VJIA 4FNUA 1GEQA 2EHHA 1M5WA 4GJ1A 5F1UA 3KOFA 1O95A 3QYQA 1H51A 3MMTA 2V2DA 3S1XA 5K9CA 4MYXA 1VHNA 3MO7A 2CLIA 1XBVA 3C8FA 3RFAA 5LNSA 4FO4A 4OBTA 2C6QA 1DV7A 3E96A 1OFDA 3GIYA 3V75A 1KFKA 1F5ZA 3TQVA 5TQLA 2W79A 4S1FA 3W7CA 2B7OA 3EXTA 4DEFA 4N4PA 4DO4A 1PE1A 4CNOA 1S3HA 2A7RA 2OCZA 2WOQA 3W1NA 4ADSA 3N73A 2E5BA 1G7VA 3W7JA 3GKFA 2WKJA 3AJXA 3P5YA 1QPQA 1OYCA 2ZRXA 3RK8A 3W1LA 3EEGA 1F7BA 2QCCA 4IPIA 4JTTA 2YGYA 1G4EA 1JCYA 4PODA 2A85A 3LV6A 2ZCGA 3BVJA 2WJZA 3PWAA 3MP3A 1JCLA 4Y6GA 2BZNA 3S1WA 3ABQA 5BOOA 4UFHA 4GNJA 1PHQA 2NV2A 4MYAA 1BKSA 3N19B 2I14A 4K8EA 4KWWA 3ZWSA 3QW4B 1TPFA 4A22A 3DKJA 4OE7A 4X2RA 3TR2A 1GYLA 4NZFA 4WY0A 3M1ZA 5FEXA 3NG3A 1KTNA 4XTDA 4QIUA 5D2XA 3UYCA 3NL2A 3G1HA 1QPRA 3KVKA 3RNDA 4UNKA 5DCBA 2UV8G 5CPOA 1YXCA 1SPQA 5AHLA 5AHFA 1W8SA 3W85A 1DORA 1XCFA 4FF7A 3H54A 3S1UA 3FOKA 4O4VA 3O16A 3BO9A 5DLCA 1XL9A 4O8RA 5LGZA 4ZQRA 4YLWA 1X8FA 3DHDA 2Y7GA 1L2UA 3DXIA 3THQA 3G0UA 3CIWA 3NQAA 4HNVA 3FYOA 2DZWA 3ELFA 1R47A 3N9RA 1LP6A 3LTPA 1W5OA 1QAPA 3KFTA 5CZSA 2CW6A 3RLUA 2ZRYA 3BW4A 4UC5A 4XKYA 3O06A 4CCDA 5AYZA 1W31A 4FIQA 3LXAA 4L4LA 3S9YA 1UASA 2ZRVA 1MZHA 3DENA 1WOAA 3TSDA 4FNPA 2DZTA 3GKAA 2TRSA 3BLIA 4Z1DA 2DZUA 2Y63A 1NSJA 1SO3A 3ATZA 3P8IA 5G1YA 1LBMA 4CQ9A 3WJWA 1LORA 1B3OA 4D2JA 2Z0IA 1EIXA 4EWND 4HN4A 2BTMA 3DU0A 1FY6A 1TIMA 5D2WA 4RR4A 3HG5A 2Z2UA 2VEKA 2C0AA 4MLRA 3KVJA 2WSQA 4KWVA 1Z44A 3PB2A 4JEQA 1RQBA 2J9YA 4ZQMA 5FEWA 2J9ZA 1VLIA 2QUTA 3B4UA 4OU1A 2NX9A 3TV8A 3OVPA 4JTKA 1M6JA 2C16A 2GVJA 3UWYA 2ZZ7A 2VXNA 3IVTA 1K3UA 1SSDA 3L0GA 3DFSA 3VKJA 3W87A 4EF8A 1W5QA 3QMRA 3C52A 5D2YA 3EWZA 2YYUA 2R91A 4LV9A 4LUIA 4FX8A 3P67A 2PRHA 2X1RA 3G8RA 3HGRA 3QZEA 3A21A 1R2SA 3O6CA 2NXHA 2Q3OA 2R14A 3R89A 2ABBA 3ABRA 5LNUA 3DFNA 1GVFA 4IMCA 1MEHA 5G1TA 3C2FA 3GAKA 1W37A 3HB9A 1QFEA 3G24A 1TPC1 2VEIA 5CZ0A 5EBUA 2EPHA 2GQ9A 4FNSA 1WX0A 2J9XA 3G1DA 2QJGA 1GOXA 1YXDA 2E5CA 2JKAA 2F7FA 1WXJA 3TFCA 1HL2A 2H8ZA 2FTPA 4GBUA 1YDOA 1YDNA 4I7WA 4QSHA 3EXSA 3BW2A 5C2XA 2GVLA 1F6PA 1AW2A 3N3MA 1K7FA 4X22A 3B05A 2QJHA 3R2GA 2YCEA 1OYAA 4IJBA 4NVTA 4UTMA 1TPVA 5FEZA 1Q6OA 3QQ0A 1S5TA 2E1DA 5HR7A 1WAUA 4BWLC 2AGKA 5EPDA 3I68A 3PUOA 3HPXA 1WDWA 1RD5A 5HNRA 5CZTA 4RXGA 4R7JA 1JCNA 2J24A 4MJMA 1CI1A 3M47A 4Y8FA 1AK5A 3IIOA 5LGXA 1FCVA 3KRUA 4PH6A 2A2IA 1SO5A 3LRKA 4Z1CA 3A5FA 3PBWA 4MZ1A 1TV5A 3GX9A 4Z08A 4O15A 4UTUA 4DBEA 4MPQA 1N55A 3NPWA 4NJGA 1VCFA 3OEXA 4XUGA 3HMJG 1A50A 4O0ZA 2V2HA 1QDSA 4O0KA 5HQEA 3FKKA 4BI5A 3NQDA 3YPIA 1MO0A 4JNMA 1SQ7A 1XC4A 3QF0A 1RR2A 1CW2A 1G4PA 5K9DA 2V0TA 4Q33A 1QMLA 3GZ3A 1IIHA 4GFSA 3UD6A 5G4WA 1R46A 4LTSA 1YLVA 4BF9A 3L5MA 3HIJA 5I3KA 1UUMA 3I7RA 2ALDA 4LC6A 2VOMA 3LDVA 3L5LA 1IXQA 4ZZ9A 1H7PA 1ME7A 1WOBA 4K8HA 5J5RA 3GK0A 3W83A 1JCMP 2NWSA 5CPNA 5C54A 5AN7A 3CC1A 1VHCA 3STCA 1XUUA 3W2KA 4RJEA 3W86A 2ZZ5A 1G4TA 2QCDA 2XN1A 4JICA 2DZXA 4Q32A 3DZ1A 4FX7A 5KZEA 5F4SA 4M6QA 3L21A 3LGEA 2Y7FA 1FX6A 1QOPA 4PA8A 3NXFA 2V81A 3BW3A 4IXXA 3P7YA 3Q94A 2ZTJA 3TW7A 4G1KA 3SGZA 2RDTA 2GVGA 3KXQA 5D09A 3G1YA 1X1ZA 6ALDA 1F73A 4OGZA 3TX9A 1LTDA 3E02A 1J2WA 4K38A 4QISA 1K8YA 1KM6A 3B04A 4IXHA 3PG8A 3BG9A 3W72A 3TROA 3W3OA 4FHAA 1PIIA 3QSTA 3HG3A 2WPBA 1OX4A 3L5AA 3NAVA 4HPXA 3GNDA 4N6FA 1TTPA 3GDKA 4AMAA 3HO8A 3E9AA 2NX1A 4PTNA 4UFMA 2JK2A 4FNRA 3LHTA 1U5JA 4LVFA 3TXZA 4IQLA 3GXPA 4TR9A 2YPIA 4RZ5A 3O1NA 4AWUA 3E12A 1F74A 2ZTKA 3LRMA 1IXNA 4ORIA 2I9EA 1OFRA 3L9CA 3T44A 2W0UA 3M5XA 3W23A 1PCWA 3EKZA 1FDYA 2ZRWA 2C15A 3TIMA 3M5VA 2Y62A 5U4NA 3NPUA 1VCGA 3QFEA 5D03A 4O14A 2V8ZA 3UZ5A 5DCEA 5LZLA 3F03K 4PFMA 4OT7A 4PL1A 1H63A 3O6YX 1VLWA 4HHPA 3TQ0A 3WJYA 1XBYA 3STGA 1OK4A 3UPBA 3W1AA 1ZHAA 3UWWA 4O11A 2X30A 3OA3A 1KFLA 4UXDA 3MUXA 1QR7A 2PE4A 2Q8ZA 3NR0A 2H8XA 3TSBA 1UUOA 3WFAA 3W1QA 4N2YA 4UFJA 1RV8A 2Y89A 3B8DA 1S5WA 2WSRA 1KV5A 2O7QA 3S5OA 5EYWA 1ZJIA 5I3FA 3IGXA 2PRLA 3IVSA 3W2JA 1QWGA 3QEZA 5AOUA 2V2CA 2XN0A 4M7SA 4UTWC 4UMAA 4N4QA 3M43A 1WV2A 4DF1A 2PURA 3M9YA 1TTQA 2OX1A 2QCDB 5DCDA 1NVMA 3CHVA 2HS6A 3GDTA 6TIMA 4IOTA 1M7OA 1DBTA 1Q45A 3MP5A 2FPYA 4UIOA 5KITA 3G22A 3FKRA 4UNLA 2VFDA 4TO8A 3P84A 4A21A 1XFBA 3JR2A 5CSSA 5HULA 1UB3A 2FB3A 5TBOA 1OJXA 3NOEA 3T4CA 1ME9A 1QOQA 2X1UA 3D0CA 3LI0A 3GDRA 5L9FA 4LVDA 2XFWA 3C2RA 3S0CA 3NYZA 1PCKA 3WK2A 3DFTA 1OX4B 1RQHA 3R12A 3TW6A 2OZ0A 2PRMA 4O50A 4GXMA 3M41A 4UUIA 2VFEA 4NNAA 3LV5A 4EOUA 1A5CA 4AHOA 4RZ4A 1O4UA 3WJXA 1JUBA 4TU1A 1SO6A 3KAOA 5CG7A 2NLIA 1EP3A 2B0MA 5KZMA 4HNUA 5G2IA 2QJIA 2WNZA 5C6MA 1KFJA 3CT7A 5HWMA 1K03A 2ZZ2A 5D04C 5FESA 3F4WA 4M19A 3LXCA 1G6CA 1HFBA 2ZZ6A 4JX5A 3H53A 1YTKA 4JXCA 4U4MA 1EP2A 2FLIA 3TUUA 3QM3A 2H6RA 1NF7A 1GTHA 2DP3A 1H7RA 3G1AA 3ABSA 4OQVA 5I3IA 3PBYA 4YMZA 5ABTA 5C5YA 3NPVA 1FUYA 1G69A 1AW5A 4JDYA 3FLUA 3ANYA 2WV8A 4LS1A 4DO5A 1ZALA 1SUXA 2E6YA 4TX9A 3GR7A 3TXVA 5FF0A 1SZFA 3W75A 1JUKA 4MVAA 4QQ3A 2R8WA 5D38A 1MSSA 4LY8A 4I9AA 1RQEA 4FIRA 1XBZA 3UWZA 4I7VA 1A5AA 4MFEA 4CNNA 4B5NA 2AQWA 3STEA 7TIMA 3S6DA 3NPXA 4GUIA 3TAKA 4AWSA 1DOSA 3HGJA 5AFDA 5D2VA 1SZNA 3G1SA 5D05A 3G3MA 3S5YA 4A29A 4O10A 3HG4A 4JY8A 3PR2A 4WXYA 4O16A 4Z1AA 5HWJA 3MBFA 3VFLA 4Y90A 4KFPA 4LV4A 5HINA 2AAMA 4NX0A 4WJEA 3IIXA 1B9BA 4AB4A 4XZ9A 4AF0B 2VENA 4O53A 4YL2A 2NV1A 1W5PA 3MBDA 1G67A 3NQ2A 3WJSA 2VFGA 3L0KA 4KKXA 1WYIA 3TH6A 2B7PA 2VELA 1W1ZA 1NAL1 1JR1A 3RF9A 3W74A 3N14A 1DJNA 2Y85A 3UXAA 3SZ8A 3P8JA 4JR5A 5CZJA 4UMBA 2QAPA 3Q37A 2FPVA 4RV8A 3F1QA 3TK7A 4N02A 2OT1A 2B7NA 2JKEA 5D30A 4O1DA 2C18A 4N9EA 4IGHA 4IMEA 1KM1A 2QKFA 3S1VA 3OHIA 3EX4A 1L6WA 2CFFA 1OFBA 5K4ZA 2QCLA 3G0SA 1WBHA 1QPNA 4ADUA 4NX5A 3P62A 1W5NA 4LS2A 5DELA 1LZOA 3SW6A 5LSMA 1TJRA 1ZCOA 4UTTA 3NL5A 1TRIA 4O19A 1OFAA 4UR7A 4RXFA 2ZZ3A 2A7PA 1GT8A 3FA5A 3TC7A 5HMSA 3W6YA 1VYPX 3T55A 2G96A 3I7QA 3LCXA 1DHPA 3W9ZA 2A21A 1Q6RA 5FEPA 1EX5A 2EAWA 1FXPA 3UY7A 3OVRA 1LOQA 1TPUA 4PC8A 4O54A 3LRLA 3PBUA 3DKLA 4JTHA 1TPWA 3ATYA 3NQEA 3SIZA 4UR8A 1NF0A 1GVQA 3NQ8A 3LHUA 2ZRZA 1NEYA 2QCMA 2V9DA 3LTYA 2QCGA 1U83A 3DFOA 3W1XA 2RFGA 4XTIA 2ATMA 2DJXA 5IBXC 4UTKA 2QCNA 4DQWA 1VYSX 4ONVA 1JQVA 1ZAHA 1ZFJA 1O5KA 5AC6A 3TDFA 3LHWA 2G5WA 2C3ZA 2WNNA 4MZ8A 1QCWA 2WO5A 2DZSA 5L6UA 2JGYA 2OT0A 3LCWA 1SW3A 3A23A 4WY0F 3QRHA 5E93A 3TJXA 2Q3RA 2LLEA 3T40A 1FWWA 1VGAA 4WY0B 1LDCA 5I3GA 4GE8A 3PUEA 1ME8A 3SI9A 3W7NA 1EA0A 2ZDRA 3N2MA 4GC4A 2NUWA 5KINA 3NGJA 3V1PA 3W88A 3LHVA 3LBMA 3GDLA 4RKAA 1TQJA 3SGUA 3EWYA 3KRZA 3S5ZA 3H55A 4JS3A 4GUJA 4L4MA 3LLFA 2ISVA 1J5TA 4AH7A 1YYAA 5DY2A 2E6AA 3PBVA 2TSYA 2Y7EA 3W07A 4O4WA 4LRSA 3EB2A 3CLMA 4NT0A 4JTGA 3W2MA 1T8XA 3M5ZA 2YW4A 3NQ7A 1LRQA 4N9BA 2ZA3A 5AC7A 2ZA2A 3HGOA 2CZEA 3CEPA 5BMXA 1JRCA 5CPMA 2NUYA 1TCDA 3LXBA 1PV8A 2ISWA 1V5XA 4XWUA 2VEPA 4YXGA 1H7XA 4HIBA 4XKYB 2JKPA 1LROA 1SU5A 4O18A 4ZQOA 3L66A 4JTIA 1I2NA 1Z48A 4PCFA 1K8ZA 5SWUA 4E38A 2GOUA 4O12A 2GJNA 2CLHA 3CU2A 1H61A 3EX3A 4O1AA 1DKWA 1I2OA 2ABAA 1P4CA 1EUAA 1LLZA 3FEMA 1ADOA 1LCOA 4YCOA 2V30A 1TMHA 3PG9A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5U7SA

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