4KFNA

Structure-based discovery of novel amide-containing nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt) inhibitors
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
482
structure length
473
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Structure-based identification of ureas as novel nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt) inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 166
structure length 473
sequence length 482
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4kfnA02
3NQ2A 4DF0A 2YFOA 3HPZA 1IGSA 4PODA 4JTLA 4IMEA 2DZUA 4OE7A 3LCXA 3NQ8A 1UCWA 1FQ0A 4UTTC 3MW7A 4CLMA 4U28A 4GE8A 1YXYA 3W75A 2PURA 3HPXA 1JUKA 1KM3A 3MHGA 1F7BA 1H7OA 4P2VA 3VCRA 3IIPA 1WQ5A 4WXYA 3TAKA 3IGUA 3W87A 2UV8G 3NXFA 1DKWA 1LBFA 3FS2A 4LVGA 4ORMA 1OFEA 1O4UA 1Q6OA 1QWGA 3MUXA 5D2YA 2JKPA 3C0JA 5C54A 1FCQA 3TK7A 2PRMA 2Z6JA 3MJYA 3BLFA 2AQWA 4P61A 3TR2A 5J5DA 3QQ0A 3NQ6A 5HNRA 3E9AA 4WOQA 2QAFA 3L0NA 1GQNA 3W7DA 3L66A 2C14A 2A7PA 1YPIA 3ZFHA 3A21A 3PBUA 4LRSA 1B57A 1RR2A 1GJPA 1ZALA 2NXGA 2WNNA 5BMXA 4O18A 2B0MA 4JGDA 1QPOA 3EWZA 1ZNNA 4QAIA 4JN6A 4OGZA 4MLJA 4ONVA 1K03A 3FYOA 3NQ7A 3THAA 2V0TA 3RMJA 2ZA1A 4DO6A 2VFFA 1BWLA 1XKYA 3SY5A 4E2DA 1KM6A 1JCMP 1OYBA 2AGKA 2QCDA 3FLUA 4LNYA 3MHUA 3B0VC 3P61A 3DI0A 4UNLA 4WY0B 1M6JA 3TXVA 4A2RA 1MEWA 4XUGA 3N9SA 2F84A 3GYEA 4GJ1A 5ABTA 1I2NA 1B3OA 2V82A 3W2KA 3NQEA 2E5DA 3LCHA 1R46A 4JTKA 3I65A 1QAPA 3CWNA 5D33A 5EKYA 3P84A 4JTFA 1K8XA 2ZZ3A 1JCLA 2BSLA 4Z1CA 3T78A 3C2FA 3S1WA 3NL6A 1K8YA 4H3DA 3RNDA 5D2VA 1YTDA 5C6MA 5LNVA 2X1TA 4M5PA 3SGZA 1LOQA 2XN2A 3O6YX 1T96A 3N3MA 5DCEA 3PSWA 3LM7A 3M1ZA 3DZ1A 1VHNA 3G3DA 1PS9A 3W3OA 4RCXA 1NF7A 5KZMA 3C8FA 2WJZA 4X2RA 1W5MA 3CQ0A 2CZDA 3P74A 3HGOA 1KTNA 3IEBA 3QPYA 5HJLA 4UTIA 2YSWA 3OEXA 4WUIA 5LNRA 3A9IA 4O12A 1P0NA 1OFPA 5CZSA 1QO2A 3TAOA 3W7KA 4FB7A 4UXDA 1W31A 1DORA 2C18A 1NVMA 3QZEA 3I7SA 4XZ9A 3HMJG 4FHAA 5EY5A 5AFDA 4HIBA 5BNKA 1A53A 2NLIA 5FEZA 4LV9A 3LX9A 3H55A 4RXFA 4N9BA 4JTJA 3P5ZA 3U6WA 1M7PA 3KRUA 1F05A 3G8EA 4Y6GA 3N2XA 1GYLA 1KTBA 2IQTA 5G2HA 1F74A 4TO8A 3M5XA 3A22A 3GB6A 5CG7A 5DBUA 2Y63A 3MO7A 4GUIA 3O07A 1OX5A 3LCFA 3W74A 2NXIA 4QNWA 3QF0A 4M7SA 1ZJIA 2X1RA 3HJZA 5CZ0A 4XKYA 3SGUA 3UWVA 3LXAA 4LRTA 3UPBA 4BI7A 5HUPA 3W2UA 2TSYA 5FF3A 2Y7GA 4AHPA 4BK9A 5G5IA 1XUZA 2ATSA 2NWSA 1XBZA 2JKEA 1ZENA 1HO4A 2QCNA 3HF3A 1O94A 2J9XA 2YYUA 4ZVJA 3GDMA 1GVFA 1XBXA 2V5LA 3O63A 3MP5A 4U4MA 1SZGA 2HSAA 4QQ3A 3M44A 3U8GA 3MYPA 1L6YA 3WK3A 1C9DA 3KAOA 3P81A 2QCGA 4ZQPA 1JCNA 1JCJA 2Y7FA 3KVLA 1WA3A 3HG3A 4TIMA 1YDVA 1H50A 3GAYA 3NZRA 3FEMA 5I3KA 3S1UA 4PC8A 5LSMA 3LDVA 4MYXA 3LRLA 2A2IA 3O05A 1PVNA 3S6DA 1JCXA 2GJNA 5U4NA 1LOLA 4O14A 3RLVA 1PHWA 1SW0A 1U83A 3KRSA 3S1XA 3W6YA 3TSDA 1V7YA 1F6PA 3O16A 1JUBA 4UTJA 2ZRUA 2GOUA 1VZWA 1Y0EA 4S2BA 4RX0A 5EPDA 4O0KA 3G0UA 3O1NA 3NR0A 2W6RA 3WJYA 5BOOA 1R2RA 1RV8A 3W71A 2VOMA 1EP3A 3LCLA 2BX7A 2GQ9A 2Y89A 3ZWSA 2ZRZA 2H8XA 2DP3A 3G1VA 4Z1BA 3C6CA 4NX5A 3BW3A 1P0KA 3WJZA 3M5VA 2FFCA 3S5ZA 3N19B 3S5NA 1QO5A 1LTDA 4AMAA 3OIXA 4DEFA 1IXPA 3QSTA 1B4KA 2V2DA 2A4AA 1YLVA 3EWUA 4O1CA 1P5BA 2VEKA 3QSRA 2B7OA 3S8HA 1JVNA 4JYFA 3KFTA 1IXNA 1YPFA 3FYPA 4WY0A 2LLEA 3FJLA 4NQ1A 5K9DA 4DF1A 2A6NA 3EWBX 2VEMA 4O0ZA 5I3JA 1FCBA 4UTLA 5SWUA 3IGSA 3S1VA 1Q6RA 2X16A 3DGRA 4MZ8A 1EP2A 2PC4A 3TQVA 5KZDA 3NQGA 4MFDA 3IIOA 1OX6A 3NEVA 4R7JA 4WOZA 3DU0A 4IPIA 4NU7A 3W7EA 1N8FA 4LU0A 2EPHA 1TTQA 5CPNA 3UWZA 1G67A 2H6RA 4M7TA 3VKJA 4RXGA 1S5VA 1UBSA 2EGZA 2QCMA 3BO9A 3Q2DA 4QNEA 1QPQA 2B7NA 2CLKA 2WV8A 1WOAA 2A0NA 5TIMA 2DZWA 2G95A 3R8RA 4DF2A 4OWGA 3N9RA 2YXGA 2X1SA 4RJEA 3NL3A 4JIQA 5K9XA 3BLIA 4GWEA 3EKZA 1X1ZA 1SPQA 3W1XA 4YCPA 5A8GA 2DZTA 4N6FA 3GDKA 1LROA 1LCOA 1VR6A 1F73A 1LLWA 2JGQA 3TJXA 2QCEA 2D73A 3LV5A 3N73A 1Q3NA 2CLHA 3HO8A 3BLEA 3OG3A 3B4UA 3DKJA 3FKRA 1VYRA 3MBFA 4I7VA 1TPB1 1SZFA 5LKYA 4LTSA 4Y9AA 1UUMA 1X6UA 4PCFA 2H3BA 4AAJA 2I1OA 5A5WA 3BW2A 4KWWA 4N4QA 3L5AA 5BRBA 4UFJA 3GDTA 1LYXA 2Y6ZA 5D37A 2WO5A 1K7FA 2QUUA 1W0MA 4O1AA 5AYZA 4FIQA 3LXBA 2GPTA 2J9ZA 2DJXA 4RKAA 5LHFA 3CHVA 4NT0A 5D32A 3LHVA 3TC7A 4O4WA 4Y8FA 2ZCGA 4RK8A 3FJ6A 1GWJA 1LBMA 3ATYA 2J24A 2VFEA 4L4LA 5KZEA 1T0OA 2X2GA 1EA0A 4HNTA 3G1AA 3K30A 1OK6A 1ICQA 1OFAA 4JTEA 2QUVA 1ZAHA 4O10A 4OV9A 1LORA 2GUUA 2ZFAA 3TKFA 4UTTA 1VCFA 1ME9A 4ALDA 4LVDA 2PCQA 1H63A 3PUEA 3W76A 2Y61A 1EUAA 2G96A 4MZYA 4A29A 6ALDA 1MEHA 1OFQA 1OABA 4LOCA 1BEUA 4DQWA 1DBTA 1TCDA 5TBOA 3NNTA 3G0XA 1VGAA 3HPSA 5F4WA 2E1DA 3EEGA 4AWTA 1VCGA 1H62A 1WV2A 1N55A 5KSWA 1QR7A 4N4PA 4UCGA 3S5YA 4ADSA 4PA8A 4HKPA 5K4ZA 1W56A 1SSGA 4E0CA 4GC4A 1RZMA 4WD0A 1ZFJA 5F2MA 1W37A 4NJJA 4MY1A 1L9WA 1A5BA 1YXDA 3W1UA 1A5SA 1GEQA 5E93A 1H7XA 3AJXA 2OCZA 4A21A 2WQPA 3GZ3A 3BW4A 1VRDA 4JTHA 5LNUA 2DORA 1KFCA 1TYGA 1PCKA 2V30A 1B9BA 3DBPA 1BKSA 8TIMA 5DN1A 4HNNA 1GPWA 4FX7A 3L0KA 2WSRA 3PBVA 1KM5A 3NPUA 2A6LA 3W7MA 3C2RA 1IIGA 1ZHAA 2BTMA 1OFRA 1OK4A 1BWKA 1TJPA 4XKYB 3LGEA 3UWUA 3H54A 1XI3A 4UNKA 3CTLA 3ELFA 2C0AA 3HQ1A 2JK2A 3GR7A 3GXPA 5CZTA 1XL9A 4XBKA 3NAVA 4AH7A 4UFHA 2A21A 3W7IA 1OX4A 1SFJA 3NL5A 1RVGA 2NUXA 1QFEA 5IM51 1H7RA 1OFDA 1UB3A 2J6XA 3P8JA 2VEIA 4RZ5A 4GBUA 1WDWA 3NOEA 4MJMA 3P67A 4CNPA 3A5VA 3LHTA 1SR9A 3N34A 3SR7A 3W7LA 1FDJA 4UTUA 4IX0A 4MUZA 2OT1A 2FLIA 3MP3A 3PUDA 1I2OA 1JR1A 1A50A 3M7WA 3PAJA 1YTKA 1HFBA 2ZZ4A 3IIVA 5AYYA 3EX1A 3RU6A 2TRSA 1MZHA 3I7QA 3O6CA 2RDTA 4CQ8A 2H8ZA 2FB3A 3P82A 2Z0IA 3HG2A 2ZA3A 4LVBA 4LVFA 2RKXA 4ML9A 2CLEA 4DELA 1HTIA 1Q6LA 4POCA 1OFBA 1AMKA 4C1LA 3UPWA 3TJLA 1RD5A 2O7SA 2X30A 1KM1A 4O1DA 3MHFA 3N2MA 3PY2A 5K4XA 3QPZA 3NQAA 4UTWC 4NZFA 5U7SA 5IBXC 4DPPA 2F7FA 4LUIA 3TC6A 1L6SA 2CW6A 3PF3A 1HUVA 3WK1A 5HWNA 3W22A 4AWSA 2E5CA 3BGGA 5AHEA 4FF7A 2ZZ7A 3SIZA 2CFFA 5HUOA 3G18A 3TIMA 4UR8A 2Y70A 1VYPX 2NV2A 4GUGA 1W5OA 2J9YA 3TSMA 1JRBA 2DZXA 3LCIA 3W85A 2ZZ6A 3OBKA 5K2ZA 3SSJA 3F03K 2YW4A 1NAL1 5D30A 4TR9A 5J5RA 4IMGA 3C2EA 4WJEA 3I6RA 1CW2A 3JRKA 4XWUA 2W0UA 4JY9A 5I3GA 3LBCA 1LM1A 4AB4A 5F2IA 3LHYA 1I4NA 4PEKA 2CZEA 5FI8A 2V2HA 3M43A 3UNDA 3M5YA 4M6PA 4LT9A 5GVJA 5AC6A 3G1SA 2ZRXA 3QMRA 1KFKA 3DXIA 1OG0A 4ADUA 1TPWA 2FPYA 1OVDA 3SZ8A 2QJGA 4AHQA 1GOXA 5F1UA 3H53A 1TPVA 3A23A 3INPA 4FO4A 4QSHA 5KTLA 3E02A 2R14A 4KFNA 1R2TA 5F4XA 1I2QA 2WPBA 2E6YA 4IPJA 3I7RA 5FEWA 3NG3A 4KFPA 3EX4A 5D2XA 4MKNA 4Q32A 3RFAA 1W8SA 3ABRA 1L2UA 3CC1A 4JNMA 1GTHA 3G1DA 4HSOA 1VJIA 2XFWA 1C8VA 1SW7A 1EP1A 4IMFA 1GT8A 1KFJA 4PL1A 4E38A 5D38A 3UZ5A 3DENA 1KBJA 1SW3A 4K7YA 5BW6A 3W1NA 3W1LA 1MEIA 4GFSA 3G3MA 4EF9A 5FF4A 1B4EA 4NJHA 1KFBA 1K02A 2NX9A 1FWSA 4Z1DA 4K38A 2R94A 5C5YA 4ZQOA 3QQ1A 2ABAA 1TIMA 1FWNA 1W5NA 3UQNA 1KFLA 4IXHA 4UR7A 3GAKA 1ADOA 3ZWTA 1IXOA 4YCOA 1FCUA 1T8XA 2VFHA 1TPDA 3GLCA 4JTTA 2CLFA 3B05A 3T55A 5L6UA 4FXRA 4YXGA 5I3FA 4CCEA 1F2JA 2E6FA 4NX0A 1G4EA 2BLEA 5D02A 5MHBA 1H7NA 1W5PA 3NPXA 3Q94A 5KMYA 2OMAA 1O60A 4O57A 1KLYA 2ZZ5A 3KVMA 3G1HA 1H1YA 2H90A 2VFGA 3TNOA 5DBTA 3STFA 2TMDA 4UMAA 1G69A 2Q3RA 4HNVA 2BZNA 5I3IA 1KV5A 1LLZA 4NUWA 1MXSA 3W72A 2CLMA 4S2CA 2O7QA 1VLIA 2GQAA 1JULA 1KBIA 4XBSA 5AYXA 3OA3A 2B4GA 3QW3A 4AF0B 4LW7A 4OBTA 3GXNA 1TB3A 1W54A 5DXYA 4JYEA 3LOTA 4K36A 1P1XA 2VEPA 5CPMA 4I7WA 3B04A 3UWWA 1L6WA 4K6AA 1TV7A 2FPVA 4GXMA 4JTIA 3QJAA 2QDGA 1PCWA 1Q45A 3ANYA 3R2GA 3V75A 4MLRA 1TQXA 5LNSA 3HGSA 4Q4KA 3F1QA 3B0UX 1XBVA 2NX1A 5HULA 3PBWA 2QCHA 1SZEA 3STEA 1XDMA 2QKFA 1AK5A 3W83A 3NVTA 4HN4A 1WX0A 1UASA 3AO0A 3UD6A 3W1QA 2YZRA 3QRHA 3PR2A 4UTMA 3HG4A 3M5ZA 2JKAA 1NEYA 1FXPA 1VQTA 3BK0A 5H2ZA 2C15A 3F4NA 3P8IA 3LTYA 1XUUA 2Z2UA 5CPLA 3HGJA 2RH9A 2VC6A 3B03A 5F2GA 3ABOA 4X22A 3IVTA 1QCWA 1S3HA 3SI9A 1M7OA 3D0CA 2V5BA 1TTJA 1GVOA 2ZZ2A 4Y90A 3BG9A 1QMLA 2QCCA 1OF8A 3ABQA 4KKXA 1OX4B 3NPVA 4BWLA 4MPQA 3S0CA 3DKLA 4DPQA 5HR7A 1G4SA 3DHDA 3G1XA 4EOUA 2V9DA 5E0KA 1XM3A 2YW3A 2ZA2A 4FNQA 4JTSA 1DV7A 3W1RA 2YGYA 3KVJA 4GUHA 3PSVA 2A1YA 1KM4A 3TFXA 2Y88A 4LS2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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