5ABTA

S.enterica hisa mutant d7n, g102a, v106m, d176a
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
MIIPALNLIDGTVVRLHQGDYARQRDYGNDPLPRLQDYAAQGAGVLHLVDLTGAKDPAKRQIPLIKTLVAGVNVPVQVGGGVRTEEDVAALLKAGVARVVIASTAMKSPDVVKGWFERFGAQALVLALDVRIDEHGTKQVAVSGWQENSGVSLEQLVETYLPVGLKHVLCTDISRAGTLAGSNVSLYEEVCARYPQIAFQSSGGIGDIDDIAALRGTGVRGVIVGRALLEGKFTVKEAIQCWQNVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The Protein Structures, Functions and Dynamics of Adaptive Evolution
rcsb
molecule keywords 1-(5-PHOSPHORIBOSYL)-5-[(5-PHOSPHORIBOSYLAMINO) METHYLIDENE
molecule tags Isomerase
source organism Salmonella enterica
total genus 85
structure length 246
sequence length 246
ec nomenclature ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date 2015-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5abtA00
4IX0A 2E6FA 3DU0A 5GVJA 3GNNA 3M47A 4NZFA 1PHWA 1OFEA 4FEZA 3C2FA 1LRTA 4FX8A 5F1VA 3W1UA 3W7CA 1GEQA 2VC6A 4M7SA 1N55A 3FFSA 4WJEA 3N2XA 3M16A 1G7VA 3QQ1A 4UFHA 3HO8A 3EKLA 4EIVA 2VFHA 4FO4A 3TQVA 3ZS4A 4O57A 1H61A 1YYAA 1K02A 3HGJA 4RJEA 4Z1BA 1VLIA 2ZRWA 3CEPA 3TW7A 3DI1A 1NEYA 3NG3A 1WAUA 5J5RA 1LLWA 1FX6A 1FWNA 3TA6A 2QUTA 1DQXA 4QM1A 4GUJA 3NOEA 4GE8A 4XTIA 1VGAA 2G5WA 5J5DA 2RHGA 2TSYA 4N02A 3M6YA 3N9SA 4NJKA 1W5QA 3TXZA 3UZ5A 2VFFA 1TPH1 4UUIA 4JTSA 7TIMA 3LV5A 2WKJA 5EY5A 4PTNA 2BLEA 4RKAA 3P5ZA 4O8RA 2QCFA 1ZAHA 2FPVA 1N8FA 3W74A 4K38A 5CGQA 2P1FA 4RX0A 1W5PA 1A53A 2WPBA 3CLMA 2J6XA 3A5FA 4YLWA 1Q6OA 5C54A 3G3MA 5LHFA 3CQ0A 4GUGA 1WX0A 1QPOA 2NXHA 4HHPA 4JR5A 4UMBA 4YXGA 3C2OA 3LCHA 5FI8A 3PUEA 1KW1A 3CM4A 3GKAA 4JTHA 1SPQA 4DO6A 4MYAA 3MUXA 3C2VA 2Z1BA 4LC6A 2FQIA 5AHLA 2A6NA 1OX4B 4PL1A 2QEZA 1HO4A 1SQ7A 5AHFA 3M43A 5BRBA 4RZ4A 2GVGA 4L4LA 3BGGA 3O06A 4MZ1A 1WOAA 4O4WA 3HG4A 3FEMA 3BW2A 1ADOA 1YDNA 1J2WA 2J24A 1YPFA 3LRLA 3RK8A 6TIMA 1AW2A 1MEWA 2H8ZA 3TJLA 5F2LA 4RV8A 3G1DA 3TW6A 1GTHA 1T99A 3W1RA 1QPQA 4C1LA 4UTLA 1S5TA 4JTGA 2NUWA 2C3ZA 3G18A 2OT1A 4JTIA 3NXFA 4TX9A 3QQ0A 3WJZA 3L9CA 2WOQA 3G0UA 3P67A 4OQVA 4WD0A 3DFQA 4MZ8A 4O15A 1GVFA 1KFBA 4JD4A 3UPWA 3G3DA 3GDTA 1S3HA 4O14A 3BV4A 3I68A 3PR2A 3S1WA 3TDFA 4JX5A 4IXHA 2PURA 3DFNA 1H62A 2V30A 2VFDA 4NJIA 3UWYA 1B4EA 2F7FA 3STFA 4LV9A 3FIGA 4PC8A 1A5CA 3B8DA 1K3UA 4UFLA 4ML9A 4GC4A 3WK0A 4G1KA 5DY3A 1EWDA 3U2OA 3PBVA 4Y9AA 3P81A 1O60A 5LNUA 1W31A 5EYWA 5D04C 3USBA 2VEKA 4ZQPA 2BZNA 4OBTA 1OYAA 3ABSA 2PC4A 4RXGA 4BK9A 3IGSA 1C29A 3L68A 5HQEA 3QC3A 2B0MA 1BWLA 2V82A 1EX5A 1B4KA 1LZOA 1P1XA 1YPIA 3EWYA 4K37A 3UNDA 3V75A 2E5CA 2R94A 3NL3A 3UD6A 2V2HA 3U8GA 5D09A 4H3DA 3OBKA 1K8YA 4B5NA 2YYUA 4FXRA 5KZMA 1TPUA 4YL2A 1XBZA 1QMLA 3NL6A 1TPEA 2R91A 1PCWA 1RV8A 5D2YA 1H7NA 4RLIA 1EPXA 3EXSA 3O05A 1FWSA 4K39A 5KZDA 1GVOA 1GYNA 1JRCA 2JGQA 3NA8A 5C5YA 3O1NA 5DY2A 1G4SA 4O53A 1IXQA 5E93A 1H7XA 2E6DA 2E1DA 1LOQA 1B57A 2E5DA 4ZQNA 1OFAA 3VE7A 3H53A 3LOTA 1GQNA 1EUNA 2ZZ4A 3KRZA 1KM0A 2CFFA 4FIRA 3RMJA 1ML1A 5IM51 4LC8A 3W7QA 1GG1A 1QNVA 4NQ1A 5AHIA 1KFCA 1OX4A 5AYZA 4K6AA 2V5BA 3W7IA 3W7OA 4CLMA 3W07A 1VYRA 4IMEA 4DF1A 4X22A 4E0CA 2NV1A 4DELA 1KTNA 1W5OA 3NL2A 5G2WA 3W71A 3UQNA 4OGZA 3SSJA 1ZFJA 3H54A 1Y0EA 2VOMA 3B4UA 1FCBA 3LHZA 2EF9A 5DBUA 3LB0A 3PF3A 4RK8A 1L6SA 2E5BA 4ICNA 1OG0A 1VYSX 5LNSA 3A5VA 5K3VA 3LI1A 2C13A 1XI3A 4FX7A 2ZZ2A 3S1VA 4JTTA 3QMRA 3W1NA 2FLIA 2PE4A 3M5YA 4POCA 3R5EA 1MEIA 3LXBA 5I3HA 3IGXA 3NQ6A 3NO5A 2DZXA 2ZRUA 1TTPA 2DU2A 1XM3A 3PS7A 1RR2A 3MYPA 3H55A 3N73A 5AC7A 2G97A 2GJLA 4YCOA 1G6CA 1VH7A 1VCGA 3ATZA 3G1VA 4EWND 2CLHA 3HF3A 4H6KA 1F05A 2CZDA 2ZZ5A 3TAKA 1CX9A 4Y96A 1XCFA 3P82A 4O28A 1SZEA 1B9BA 1QFEA 3G0XA 2AAMA 1YLVA 3LHWA 2Z2UA 4LNYA 2EHHA 3SY5A 5HJLA 3FJ6A 3DKLA 3I7RA 3SZ8A 1A50A 2CLEA 3LCLA 1KM4A 3VCRA 1OK6A 3A9IA 3DFOA 1JUEA 2ZFAA 3BLEA 1OVDA 1YTDA 2ZZ6A 1FDZA 3CIWA 5TIMA 4WZHA 1I2NA 4BWLA 1O94A 1H7PA 2J9ZA 2YX0A 1WYIA 2DJLA 1Z48A 1Q45A 2CLMA 3QFEA 1ICSA 1OFRA 1TQJA 5K7JA 4KFPA 3GR8A 1FQ0A 3GXPA 3W1LA 1H1ZA 1ZNNA 5HWMA 2YPIA 5H2ZA 3P62A 5KZEA 1HFBA 3O6CA 3LHVA 4UCGA 3IIZA 1NVMA 5F2MA 2ZBTA 4WX2A 2Y7DA 3NM1A 3WJXA 2YYTA 5D32A 2I9EA 4M5PA 3LBMA 4MVAA 3P61A 2X1RA 3NPUA 1MEHA 3N14A 5AC6A 3NZRA 3S5ZA 2O7SA 4AVFA 4QISA 4UIOA 3IGUA 1WV2A 4ADSA 1KLYA 3GKFA 2NUYA 1SSGA 1VS1A 5FEXA 2ZQ0A 2EAWA 2Z6IA 2Y85A 1EIXA 3QEZA 5BOOA 1YDVA 3C3NA 3AJXA 1R2TA 5K9CA 2AQWA 4XTDA 3DFSA 2NV2A 2QCDB 4Q32A 2YDAA 2Y6ZA 3P60A 3BO9A 1G69A 5FF0A 2QKFA 3PUDA 1RQHA 3HGRA 2ATMA 4ZQOA 2ABBA 1AL8A 3I7QA 3LTPA 4NNBA 1FWTA 2OMAA 3DBPA 3EX2A 4GUHA 3M44A 2NWSA 3F4NA 1NF0A 4A2RA 3NEVA 3E02A 1JJKA 4AXKA 4GRSA 1SW7A 2GVJA 1SW3A 4O0KA 3A23A 1T8XA 3SJ3A 4MUZA 4FXSA 4LVGA 3VI2A 3P7YA 4O16A 4XZ9A 3RF9A 3MO7A 1OFBA 1H7RA 4UC5A 2X30A 3QF0A 1DHPA 4N6EA 5FESA 2QJIA 1RQEA 3I65A 5U4NA 4AHOA 3UWWA 3HPSA 3C0JA 5DBTA 3QW4B 2C6QA 3MJYA 1LORA 1O5XA 2ZRZA 3SFKA 1PE1A 5HWJA 5SWUA 3FKRA 2E77A 2ZZ3A 3PM6A 3NQDA 4O1DA 3HGSA 1SO6A 4JTJA 1LLZA 3GLCA 1WQ5A 1ALDA 1Q6LA 5F4SA 4DEFA 2JKPA 3PWAA 2CW6A 1BEUA 1EP2A 1L9WA 5DLCA 4LRSA 2R14A 3E96A 4FF7A 4JNMA 2ZYFA 5D38A 5L9FA 1JCMP 1X1ZA 4ONVA 2E6AA 1JR1A 4LVAA 3GX9A 2X1SA 1I8JA 1Z44A 2FB3A 3W3OA 4FNQA 3BG5A 2A0NA 2ZZ7A 1THFD 3LHTA 4ORIA 4IOTA 3G22A 5K4XA 3W9ZA 2J9YA 2VEPA 3N9RA 2WO5A 2PCQA 3L5MA 1CI1A 3W7EA 2BX7A 2C18A 1FDYA 4UMAA 2CWNA 4DO4A 1GVSA 4S2BA 2P10A 2RKXA 1F6KA 3EWBX 4Q4KA 3C2RA 1IXPA 2DZUA 2H3DA 4JTFA 1UJPA 2FB2A 1LDCA 1OHLA 4A21A 2Q8ZA 1TIMA 2NZLA 5EPDA 5CSSA 1TTIA 1JQXA 3PY2A 5G1YA 1EA0A 2A7PA 4XBKA 3TQKA 4R34A 5DCDA 4CNPA 4FB7A 3BG9A 5D30A 1F7BA 3OA3A 2PRMA 2ZA3A 1GJPA 5HR7A 3L65A 1LROA 1X6UA 3PG9A 2OJPA 5K4ZA 2E6YA 1DQWA 1TO3A 3KX6A 5FF3A 3SW6A 1LOLA 4IJBA 4O50A 3T7VA 3CT7A 2O7QA 3PBYA 3LLDA 3BVJA 3CWNA 1W5NA 2H3BA 4UTMA 1ZAJA 1TPVA 2ALDA 4UNKA 5HINA 1XDLA 4O17A 3ATYA 5LHEA 1DOSA 3GDRA 4LRTA 1KTCA 3R13A 5D02A 3NQFA 4K8HA 2C16A 3W87A 3SGZA 1AW5A 3QW3A 1ICPA 2A6LA 3E12A 4P2VA 1YXCA 4RR4A 4MFEA 4S2CA 5D2WA 3TIMA 1QDSA 1R30A 2C1HA 5K9DA 1B3OA 3TX9A 2WV8A 1XKYA 3GB6A 4O12A 3TC6A 1QWGA 4OU1A 5EA9A 1GWJA 1UBSA 2DZSA 5HUOA 3E0IA 1UB3A 2A1YA 3G1FA 4Y90A 3WFAA 1FY6A 4AF0B 1SFLA 4WOQA 2WNZA 2GQAA 1VPXA 4QSHA 4NVTA 4L4MA 4I9AA 3G24A 1QAPA 1V5XA 4JY8A 4K7YA 4HSOA 2H6RA 5D2VA 2QCHA 3C2EA 3N34A 4DQWA 1YTKA 1GT8A 4N9DA 2HS6A 4N9CA 5FF4A 3S5NA 4HNTA 2Q3OA 3MI6A 4LT9A 1YDOA 1KM3A 3QPYA 3NQEA 3DENA 1QPRA 3W1TA 1DV7A 1FBAA 1I2PA 3PAJA 3QSTA 3TE9A 3DI0A 3W2LA 5FEWA 4O4VA 3RFAA 5EL1A 2A7NA 3NM3A 4BI7A 4HNUA 1ZAIA 1RQBA 3W1QA 3TFCA 4NUWA 2Z0IA 3IIOA 3A21A 4X3ZA 3NAVA 5IBXC 4IX2A 1BWKA 3KAOA 3EEGA 3B0VC 1TSIA 4M6VA 2WJZA 2V8ZA 5LGXA 1FCQA 3L66A 3QJAA 1W8SA 3UWQA 3KVMA 1OFDA 3HG3A 4CCDA 3B05A 2GQ9A 4DPPA 3K30A 3EX4A 3ZWTA 1TPB1 4GFSA 2HSAA 4A2SA 4JIQA 1ICQA 4Z1DA 3KHJA 3NQVA 4JTLA 3JR2A 4M19A 3P5YA 2Y7FA 5EKYA 3WJWA 3SIZA 5C6MA 4IUOA 1F76A 2NWRA 1KFEA 2JKEA 1XL9A 1M7OA 2V2CA 1XDMA 3W7MA 3W7DA 5D05A 5FF7A 3TQ0A 4TR9A 3UXAA 4CQ8A 3QH2A 5LGZA 3AO0A 5DN1A 2QJHA 3QZEA 4XWUA 1WBJA 1X8FA 4MZYA 4BF9A 1KM2A 2QDGA 3HBLA 3VE9A 1XXXA 4LVBA 5D37A 1SZNA 3LCGA 3CTLA 3TR2A 2QCNA 3TCEA 2WQPA 3L0KA 1JRBA 1OYCA 3LCWA 5AB3A 4JTKA 3W2UA 4FIQA 1PS9A 4QIUA 2TRSA 1ZHAA 1OK4A 1H60A 4EVZA 1VCFA 1KFJA 1QCWA 5AHNA 4MLJA 1NFBA 1R46A 1OFQA 4DO5A 1PL9A 1G7UA 3L5AA 1EP1A 2Z6JA 1TYGA 3KRUA 1ONRA 3W85A 1U83A 3GIYA 3IVUA 4O19A 2NXGA 1UUMA 3OVRA 4U28A 3GXNA 2VEIA 1F74A 4I7UA 4O0ZA 5LNRA 3LXAA 4AWSA 2FFCA 2I1OA 2TYSA 3G1HA 1XUZA 3KFTA 4O18A 2QCGA 3T4CA 5BW6A 3FA5A 1ME7A 1W56A 3DHFA 3M7WA 1TPFA 1VR6A 3WK1A 3F4WA 3S0CA 2Y7EA 4RXFA 1SU5A 4AWTA 3W1MA 1KBIA 1K7FA 3EWUA 4AF0A 2Y61A 2WNQA 1LCOA 4PA8A 2VFIA 4N2YA 4UTKA 4UTTA 5AHMA 2BXVA 2NX1A 1PCKA 2C0AA 4UTUA 1XC4A 3TC7A 1UCWA 1X1OA 5HMSA 1WOBA 4CQAA 1KFLA 4OWGA 4CNNA 3G1XA 2ATSA 3NL5A 1R2SA 3S9YA 4PODA 5K2ZA 3T44A 4WY0B 3GK0A 2JKAA 3W2MA 4IMGA 1DVJA 2V2DA 1JCJA 4OHQA 1FWWA 3O15A 3GDMA 3CPRA 5LSMA 3FOKA 4HNNA 4O1CA 4MKNA 5H91A 2J9XA 3OVPA 1D3HA 4JEQA 2RH9A 1TJRA 3LX9A 3NPWA 4M7TA 2FPTA 1Q3NA 4P61A 1QO5A 1GPWA 2EPHA 5CPMA 3MP4A 4MJMA 3IIPA 1W37A 4FNPA 4WXZA 2D73A 5CPLA 1GTEA 1R47A 3W7PA 4JN6A 1F2JA 3NPXA 4IPIA 3IIXA 2A4AA 1JCLA 3HQ1A 4LUJA 1DL3A 5BNKA 2JGYA 4Z0SA 1P5BA 1Q6QA 1AL7A 2DZVA 4N4PA 3S1UA 1R2RA 3L0NA 3DAQA 3DHDA 4FHAA 2CZ5A 2XFWA 4UTWA 3S1XA 4ALDA 1GVRA 3WK3A 1H63A 1OJXA 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 3MMT A;  3EWX A;  3PB2 A;  2RFG A;  3B0U X;  1TJP A;  3BGJ A;  3M0Z A;  3MHG A;  4UTJ A;  4NX0 A;  3KVJ A;  5KIN A;  1PII A;  4JTE A;  2YFO A;  4BI6 A;  3W7J A;  3Q2D A;  5FF2 A;  4PCF A;  1CW2 A;  3ABQ A;  3THQ A;  4KWV A;  3EB2 A;  4JGD A;  4LU0 A;  2CZF A;  1LBL A;  3EWW A;  2BWG A;  2HMC A;  4Z1A A;  5EMU A;  2F84 A;  4MJZ A;  3Q58 A;  2PRL A;  4GXM A;  1FXP A;  5LZL A;  3NZ1 A;  3ZFH A;  2Y89 A;  2ZRV A;  3YPI A;  4FX6 M;  3W76 A;  1I4N A;  4UTI A;  1BTM A;  1LM1 A;  4I7V A;  5EBU A;  3PB0 A;  4CNO A;  4RZ5 A;  2E68 A;  4Q33 A;  4ZMG A;  4TMB A;  2QAF A;  3QM3 A;  3UZJ A;  4QNE A;  5E1Q A;  3QSR A;  3TU9 A;  2GVL A;  4NJH A;  4O13 A;  4IPJ A;  3W7N A;  1EEP A;  4XQ6 A;  3V1P A;  2OT0 A;  2NX9 A;  1NAL 1;  5I3F A;  4BI5 A;  1OFP A;  5BMW A;  3HPX A;  3ANY A;  4A3U A;  3P80 A;  4C1K A;  3NPV A;  4LWW A;  4E2D A;  5F4W A;  1I2O A;  1MSS A;  2EKC A;  5G5I A;  2ISW A;  4HKP A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1WPC A;  4H00 A;  3DU0 A;  2O92 A;  4DBW A;  4NZF A;  1OFE A;  1QNS A;  4FEZ A;  1LRT A;  4PUK A;  5F1V A;  1GEQ A;  2CXE A;  1T7L A;  5FJU A;  3FGC A;  4XK2 A;  1G7V A;  1MMF A;  3B8U A;  4UFH A;  3EKL A;  1UYQ A;  2YA1 A;  1QNQ A;  3K5X A;  1YYA A;  3WBE A;  4D8A A;  3WLT A;  4RJE A;  2G8Z A;  3GFY A;  4B5S A;  3TLQ A;  1VLI A;  3TW7 A;  3DI1 A;  2Y5S A;  3T05 A;  2R82 A;  4G7E B;  2QJN A;  4DI8 A;  4D6F A;  1OCB A;  4L1W A;  1TJ0 A;  3TA6 A;  1DQX A;  4QM1 A;  2Z1W A;  1C91 A;  5J5D A;  1VGA A;  1TG7 A;  2BMB A;  4NJK A;  5H8M A;  2F6X A;  3ID7 A;  3WN6 A;  4UUI A;  1E3Z A;  4JTS A;  3FVM A;  3LV5 A;  3WBY A;  2Q09 A;  5EY5 A;  1A0E A;  1XIF A;  3PZ9 A;  4RKA A;  2YDR A;  1XLD A;  3ZT5 A;  5DEZ A;  3AU6 A;  4KIE A;  3WH6 A;  3N4F A;  3ECQ A;  4QLK A;  4URI A;  4AEF A;  2PZN A;  1IQ8 A;  2P1F A;  4RX0 A;  2UY3 A;  1W5P A;  5FKY A;  1LL7 A;  2J6X A;  4EXA A;  3A5F A;  1O7A A;  2XVP A;  3RHG A;  2NXH A;  4HHP A;  1U1U A;  2X2Y A;  2WK2 A;  4UMB A;  1W1T A;  3C2O A;  1BGG A;  2PUZ A;  3GKA A; 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