3N2MA

Crystal structure of plasmodium falciparum orotidine 5'-monophosphate decarboxylase complexed with 5-fluoro-6-amino-ump
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
328
structure length
328
Chain Sequence
GLVPRGSMGFKVKLEKRRNAINTCLCIGLDPDEKDIENFMKNEKENNYNNIKKNLKEKYINNVSIKKDILLKAPDNIIREEKSEEFFYFFNHFCFYIINETNKYALTFKMNFAFYIPYGSVGIDVLKNVFDYLYELNIPTILDMKINDIGNTVKNYRKFIFEYLKSDSCTVNIYMGTNMLKDICYDEEKNKYYSAFVLVKTTNPDSAIFQKNLSLDNKQAYVIMAQEALNMSSYLNLEQNNEFIGFVVGANSYDEMNYIRTYFPNCYILSPGIGAQNGDLHKTLTNGYHKSYEKILINIGRAITKNPYPQKAAQMYYDQINAILKQNM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Plasmodium falciparum orotidine 5'-monophosphate decarboxylase complexed with 5-fluoro-6-amino-UMP
rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase
source organism Plasmodium falciparum 3d7
total genus 126
structure length 328
sequence length 328
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3n2mA00
5CZ0A 3TSMA 4RZ4A 2FDSA 4O0ZA 3CEUA 1OHLA 3QPZA 4Z1BA 3F4NA 5FEXA 3MI3A 1YXDA 1GPWA 3OBKA 1LDCA 1ZAHA 4NX5A 4QAIA 1QFEA 5EYWA 2NUXA 1UBSA 1I2OA 4O15A 4XKYA 1LLZA 2ZDRA 2D73A 2GOUA 3TDFA 1EIXA 4MPQA 2LLEA 5HNRA 2CLHA 3BPWA 2YW3A 2A4AA 3G1HA 2VFGA 2NUYA 4MUZA 4LV9A 5AHLA 1OX4A 2ZTJA 4I7VA 4WY0A 3STGA 3TW7A 3W2KA 2J9XA 3M7WA 2RDTA 2ZZ5A 2GVGA 5D2TA 1PV8A 3RFAA 3QFEA 4DF2A 2W0UA 4ALDA 1RZMA 5D05A 4D2JA 1LOQA 4ZQRA 4ZQNA 4MZYA 3NQDA 4NJJA 3BV4A 3EWZA 1FCVA 2Z6IA 1VC4A 5SWUA 4X22A 2E68A 2NWSA 4LW7A 1B57A 3B0UX 3QMSA 4DO6A 1H60A 2ZRWA 3CIWA 1L6WA 3KHJA 3IGUA 3O05A 2YSWA 2FPYA 1O5KA 1HO1A 4UMBA 3P5ZA 4MVAA 1H7WA 5D2VA 3TV8A 3NZ1A 1GJPA 2VFFA 3W73A 3W87A 2ALDA 4K38A 1WAUA 2QUTA 3IVUA 5G4EA 1TRDA 4M7TA 3W1XA 1T0OA 1WXJA 3DI1A 4PTNA 3U6WA 3R8RA 4AHOA 3P82A 1KFKA 3LI0A 1A50A 4J9JA 5FEZA 3THAA 2VOMA 5AYYA 1I45A 4MYXA 3MUXA 2W6RA 5AB3A 1RR2A 2DZVA 2JGQA 3SGUA 1KFBA 1Z41A 2A85A 4JY9A 1Z48A 1KLYA 3R5EA 3M5ZA 5F4XA 3OVPA 2JKPA 4UTMA 3ZR4A 5FF0A 1GYNA 3TXZA 2PC4A 3FFSA 4LRTA 5LNUA 2RFGA 3GDKA 3RK8A 4MYAA 5TQLA 1XBXA 4IMDA 4YXGA 4FX7A 3W1MA 5HR6A 3DENA 4UC5A 3LGEA 4U4MA 2V2DA 1XKYA 1YPFA 3W2NA 1EPXA 4LTSA 1K8ZA 5AYXA 3CEPA 1W0MA 3PC0A 3LXBA 1TPVA 1AW2A 2G95A 3LOTA 2E6DA 1PVNA 1ALDA 4JTSA 2C16A 1TPB1 4GUGA 4AH7A 1MSSA 1QOPA 3C2OA 3LTPA 4MFDA 3VKJA 2EAWA 3MWAA 1SU5A 3HGRA 4FNRA 3UXAA 2UV8G 1OFOA 2H3DA 3P7YA 4MY9A 3LXCA 4FEZA 4K7YA 3S1XA 3GKAA 2H6RA 1TYGA 3EEGA 3GZ3A 4KKXA 4UMAA 3PULA 1TPH1 3BO9A 3EWWA 5G5IA 3NQEA 1UJPA 2ZTKA 4ICNA 5HUOA 1VHCA 5K4ZA 3EX3A 2PE4A 4FF7A 5G2IA 2G96A 4UTWC 3TMLA 2X16A 1I8JA 4R33A 2GPTA 4B5NA 1GT8A 3GYEA 3LCWA 1DV7A 3MP3A 4GUFA 4CCDA 3CPRA 3G18A 1TTIA 5H91A 4AVFA 1VR6A 1SUXA 3G3DA 1GYLA 3S0CA 5HUPA 2HMCA 4PFMA 3S1VA 3T7VA 5U4NA 1VYRA 3QJAA 1SW3A 1FXPA 1KV8A 1DQWA 3F1QA 1G4SA 1VLIA 2Q3OA 5CZTA 3TU9A 5L9FA 3NPXA 4CLMA 1D9EA 3KX6A 3UWYA 1R2RA 2P1FA 3KOFA 2VENA 3E12A 3HQ1A 3N9SA 3W1RA 2I1OA 3TA6A 3W2MA 2NXHA 3E9AA 1XUZA 4EF9A 3W1PA 4MZ8A 1H63A 4O57A 3GX9A 1KTBA 3HOJA 2X1SA 2ZRXA 3LBMA 4JYDA 1SZFA 1TMHA 3CWOX 1YDVA 3R13A 3FYPA 2B7NA 5LNRA 1YPIA 4IMGA 1LBLA 3UD6A 1LZOA 3GK0A 3W07A 5LGXA 1N55A 2V5LA 3B03A 3G1DA 4JTHA 4CCCA 4TMCA 6ALDA 4M19A 1O94A 3DKLA 3FKKA 4Q4KA 1QAPA 1KM6A 1KTCA 1X6UA 4JYFA 3KRZA 2EF9A 2OT0A 4MKNA 3EX2A 1KFJA 2ZA2A 1OYCA 4GJ1A 3M44A 2CLFA 2Q8LA 3EXRA 4ZZ9A 4LS0A 1DJQA 4LOCA 2CU0A 4H6KA 1NSJA 1ZAJA 3C2FA 2FJKA 5D2XA 4S2CA 1TTQA 1F76A 3MMTA 4O4WA 2Y7DA 1P4CA 3NQAA 4UTTA 1M7OA 1LORA 4FO4A 4P61A 3OA3A 2WNQA 4O19A 1SSGA 4NNBA 1XUUA 2HSAA 5LSMA 1PIIA 4G1KA 1W5PA 1FX6A 4ZMGA 4DEFA 3A23A 1T96A 1VCVA 2C18A 3NQ7A 1OABA 3JRKA 3W71A 2RDUA 5FEWA 1KM0A 3B04A 1TJRA 3TAOA 4OHQA 4PCFA 1GVOA 1I2RA 4FX6M 3G1VA 3N2MA 4H4IA 3W1UA 4NX0A 2KZHA 1JR1A 4K8EA 3P81A 1I2PA 4O11A 1K3UA 4I7UA 2CLKA 4JIQA 3LTYA 4ONVA 3H54A 1DQXA 2CWNA 1UB3A 2VFDA 4RCXA 1EP2A 1JQVA 4QJ1A 2PRLA 1OF8A 3BK0A 5LKYA 2BWGA 4MFEA 3TXVA 3W2UA 2G5WA 3ABQA 5IM51 3NO5A 2QJIA 3NDOA 1TO3A 1DHPA 2YYTA 1QOQA 4BWLA 5DY3A 1QO2A 4UFJA 4NNAA 4WD0A 2F84A 1TPWA 1IF2A 1AMKA 4GE8A 1OG0A 4LVDA 2ATMA 3NQMA 4JNMA 1O95A 5D02A 3DGRA 3LV5A 3W7GA 1KBJA 3THQA 5I3IA 1VYPX 2A1YA 2QCCA 5HULA 1JCLA 3G1FA 4HIBA 2B4GA 1JCXA 5A5WA 2ZYFA 4O1AA 3TNOA 1VH7A 2QEZA 2X30A 1H7NA 4ADSA 1QPQA 2H8XA 3DU0A 3S5NA 4C1LA 3PM6A 3UWVA 3HG2A 1LOLA 5I3FA 5BW6A 1HUVA 4WZHA 3SECA 4Z0JA 1KBIA 3GNDA 4WOZA 3W7JA 3W76A 2ZQ0A 4HNVA 2ZZ7A 3V1PA 5D09A 4FNQA 3RF9A 1P1XA 4AWUA 2DU2A 2C13A 3CU2A 3HGJA 2FPTA 4U28A 1WOBA 2G97A 2R91A 2Y88A 3PF3A 1G4PA 2PURA 3M47A 1F5ZA 1IIHA 3TROA 3BW2A 1DL3A 4DBEA 4NXSA 4QITA 1JJKA 2QCNA 5F4WA 3RLUA 1Q6OA 1M5WA 1I2NA 3S6DA 4BI7A 3BLIA 3MO7A 4HPJA 5EY5A 3ZWTA 3G8EA 1QDSA 3OVRA 2QF7A 3W83A 1JUKA 1VGAA 2JKEA 3HBLA 3NL6A 5KZMA 4WXZA 3R12A 3GDRA 4JR5A 2BXVA 2F7FA 2TYSA 4UR7A 3UYCA 4XBSA 4Y8FA 4IUOA 2Y6ZA 1LROA 2C1HA 4O13A 3TUUA 5TBOA 2V81A 2WKJA 4JX6A 3SSJA 2EPHA 4AHQA 1W5MA 3HG4A 3UPBA 3TC6A 3BW3A 4JTUA 2WV8A 3DAQA 3TQ0A 1GG0A 2ZZ2A 3HPZA 2WPBA 3NOEA 2VELA 3L67A 2VKZG 2YDAA 1LLWA 2A7NA 5GVJA 1F6PA 1JRCA 1DOSA 4KFOA 5BOOA 3L5LA 1V7YA 4JDBA 4YWIA 1VS1A 4UTKA 2NV2A 4N9EA 5K7JA 1OFPA 1OFDA 3T40A 3RNDA 1A5BA 3QQ1A 1SFLA 3NQGA 2V2HA 3FJLA 3W7OA 2DZTA 1XCFA 3QYQA 4LS1A 3S5YA 3W6YA 3C6CA 2QJHA 4WX2A 3S8HA 1Q6RA 2J9YA 4DPQA 1RVGA 3W84A 3G3MA 1ZHAA 5AYZA 3L66A 5L6UA 2NLIA 3HPSA 3TJLA 2CLOA 5F1VA 1TV5A 3ABSA 1XI3A 4JTGA 3BVJA 2QAPA 4JGDA 2RH9A 3EWUA 3U2OA 1LRQA 4NU7A 4O8RA 1OYAA 1KFCA 4HN4A 3TQKA 3B4UA 2ZFAA 2DZWA 3P80A 3QW3A 2NUWA 4ORMA 1VRDA 3UWZA 3M1ZA 3KRSA 1ZY9A 5EBUA 4JIPA 2ZA1A 5KTLA 3LCLA 2C15A 1EP1A 4JTFA 3TX9A 3KVKA 4JDYA 5C55A 4H3DA 3N9RA 2GVLA 3W7EA 3LTSA 2PCQA 4UFLA 4UFIA 2O7SA 4EIVA 4MLRA 1VQTA 4GWEA 5LHEA 1NVMA 5AHMA 4NUWA 7TIMA 3DFQA 1VJIA 4BFAA 4LV4A 1KM3A 4UTWA 1BWKA 4JN6A 4CCEA 4IX0A 1VCFA 3L68A 3O16A 5F1UA 4HPXA 4S2BA 4W9TA 1KFLA 2A21A 2B0MA 4HNUA 3Q94A 5EL1A 1FQ0A 5AHFA 3S1UA 4RJEA 1AL7A 2ZRUA 3BGGA 1GOXA 4O1BA 5LZLA 3O1NA 4YCPA 4MLJA 3W7QA 1A5AA 3QSRA 4UUIA 4OU1A 3PY2A 1TB3A 4BI5A 5FI8A 3STFA 8TIMA 4ORIA 3TW6A 3LM7A 3GXTA 1JUBA 2J27A 3GR7A 1PCKA 3ABOA 1LTDA 1L6YA 1MXSA 3A21A 4JXCA 3LRMA 3FS2A 3UY7A 2E6YA 3BW4A 3NM1A 4L4MA 3IIOA 2GQ9A 1SO3A 3E0IA 2RHGA 4RK8A 4K39A 5E0KA 3PVFA 4FXRA 2YGYA 3T4CA 4A2RA 3HF3A 4OWGA 1SZEA 1TV7A 2CZDA 4O52A 4XZ9A 5HWNA 3I7RA 3V75A 1OFEA 3M43A 2C19A 1GZGA 3N14A 3IGSA 5I3JA 3QMRA 4AHPA 3TJXA 3DHFA 2EHHA 4O1CA 4E38A 2XN1A 2DP3A 1XBZA 5C54A 4O10A 1ICQA 1FUYA 1R46A 3EX6A 3TE9A 4TX9A 1M6JA 2FFCA 1F05A 2QCDB 2Q3RA 1OF6A 1YDOA 3O6DA 5KINA 2ZCGA 3CT7A 2R8WA 3PBWA 1GEQA 4OT7A 3NQCA 2GJLA 3NPWA 3GAKA 3QH2A 3TFXA 4DPPA 5D30A 1XXXA 1XC4A 5FEPA 2YXGA 3CM4A 4NNCA 3MHUA 1TPFA 4MJMA 5CKSA 3UZ5A 3PB0A 5A8GA 2BSLA 5KMYA 4QM1A 1ONRA 2P10A 1CX9A 1U83A 3TC7A 3SJ3A 2Z1BA 3E02A 2XFWA 4NJGA 3W86A 4K36A 1K8YA 1EWDA 1TPC1 4N02A 3QSTA 3ANYA 1Q6LA 2A7PA 4QSHA 3M41A 3C0JA 5AN7A 3SIZA 4AXKA 4NJIA 1H7RA 2V0TA 2FPVA 2OX1A 3I7SA 4PEKA 4KFPA 1P0KA 5D03A 3TKFA 1H51A 1VLWA 3Q58A 5KZEA 1G4EA 1LCOA 3HO8A 3A9IA 3W1LA 4LVGA 1LBFA 3NQVA 1VPXA 3G24A 1P0NA 3NAVA 2ZA3A 3RU6A 2TRSA 4GFSA 2QCMA 2O7QA 5CPNA 1MZHA 2E6FA 5I3HA 3TH6A 5AC7A 3L65A 4JTEA 1WA3A 4BI6A 5CPLA 4CNNA 2Y7EA 1O60A 3STCA 4GUHA 3FOKA 2QUVA 3NVTA 3MYOA 1FCBA 2VFIA 4LVFA 1OJXA 4P2VA 2ISVA 4YMZA 3NM3A 4R34A 5KSWA 3P67A 5D37A 3LHUA 4LUJA 3O07A 1W5NA 1TV8A 1FCQA 4MJZA 4Z08A 1KV5A 3M0ZA 3RLVA 1TPEA 1W3TA 2HS8A 2WNZA 1FWTA 4LVBA 2CZ5A 4WJEA 2A6LA 3BG5A 4R53A 1TJPA 1HO4A 3DFSA 3SGZA 1EEPA 4XTDA 3NG3A 3B0VC 3W7KA 4IWWA 4N4QA 1W37A 5F2GA 2Z6JA 3EXSA 4PC8A 4DO5A 2A2IA 5KITA 1B4KA 3W72A 4NZFA 3W7DA 3FIGA 1YXYA 3P60A 3HIJA 3LX9A 2FLIA 3QQ0A 3RMJA 3L5MA 4UTLA 1IXOA 2FIQA 4Y9AA 4DXVA 4UFMA 1KLZA 4ZQPA 1S3HA 2WSYA 5BNKA 1LRTA 3LHTA 3HG5A 1KW1A 3KAOA 1EWEA 1YTKA 3LV6A 3EWYA 1G6CA 4ML9A 4O14A 4N4PA 3MHGA 4CNPA 4Y96A 2QAFA 3NQ8A 3W3OA 1TQXA 1ZNNA 3D0CA 1SZNA 4RZ5A 3KVMA 1K7XA 4CNOA 3PSVA 3TSDA 3PSWA 1H62A 2CZEA 3LCHA 4LRSA 4RXGA 2A0NA 4O54A 2NX3A 3B06A 4UTUA 1WBJA 2ZZ3A 4Z1AA 3W7HA 5IBXC 2A6NA 3AO0A 4Y90A 4ZQMA 1SO6A 3DBPA 3OHIA 5E1QA 1KM2A 2V30A 4XKYB 5DBUA 5T26A 2I9EA 1OVDA 1EB3A 1GVRA 1O5XA 5C2XA 4A2SA 4Z1DA 1TREA 2VFEA 4AF0B 3OIXA 1YXCA 1X7FA 2I14A 4NVTA 3WJZA 2WO5A 2NX9A 3A22A 4UFHA 3VCRA 1OX4B 3DKJA 3PS7A 1SO5A 3LDVA 1UUOA 4MY8A 2V82A 3LCIA 4M6PA 2ATSA 1K7EA 5FESA 4JTJA 2X1TA 3UWQA 5DBTA 1XDLA 2ABAA 4WQ6A 3L21A 1LM1A 4UMCA 5G4WA 4LNYA 4MOZA 1LOSA 4O16A 5K4XA 1RQBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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