3UXAA

Designed protein ke59 r1 7/10h
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PRYLKGALKDVVQLSLRRPSLRASRQRPIISLRERILEFNKRNITAIIAVYKRKSPSGLDVERDPIEYAKFMERYAVGLVILTEEKYFNGSYEDLRKIASSVSIPILMWDFIVKESQIDDAYNLGADTVGLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPAIVINDEEDLDIALRIGARIIIISSRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAASGISERNEIEELRKLGVNAFEIGSSLMRNPEKIKELIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title Bridging the gaps in design methodologies by evolutionary optimization of the stability and proficiency of designed Kemp eliminase KE59.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Kemp eliminase KE59 R1 7/10H
total genus 86
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.-.-.-:
pdb deposition date 2011-12-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3uxaA00
5CPLA 3DH7A 2Z2UA 2E6AA 4PH6A 1WQ5A 2NUWA 4ZZ9A 2JKPA 4A29A 3WJYA 2ATSA 3PSVA 5EKYA 3W1RA 1X7FA 2CZEA 2JKEA 3QC3A 2WSQA 1IIHA 3S42A 2VFIA 3JS3A 4YXGA 1HG3A 4NNCA 1TB3A 1MO0A 4DBDA 2DJXA 1X1OA 3LXAA 4JTKA 1JUEA 3TSDA 1I2QA 2Y7FA 4RCXA 2QR6A 1M6JA 4GUFA 3UWUA 2WSYA 3GK0A 3TE9A 5D2YA 3O63A 2YSWA 1TIMA 4EWND 3EWBX 1OK4A 2NZLA 1KFLA 1TSIA 3DFQA 1C29A 1KM2A 3TKFA 4FXSA 1XDMA 1RQEA 1ME7A 3LLDA 3RLVA 5D03A 3H53A 3DFPA 4M7TA 3QQ1A 5TQLA 3M44A 1EUNA 1TREA 5DLCA 2HTMA 1SW0A 1UUOA 3A9IA 3C52A 3B03A 3LV5A 4RX0A 1WV2A 4WXZA 2B7NA 3CIWA 1PIIA 3LGEA 1MEWA 4GXMA 4BR1A 1SO6A 3BLIA 1TRDA 3M0ZA 3CPRA 3LRKA 3SIZA 5HINA 3LCLA 3F4WA 4BWLA 4RLIA 3M47A 1W5OA 2ZFAA 2ZYFA 4LVGA 1XUZA 3DFSA 3NL5A 2Y6ZA 3W7QA 3ABRA 2YPIA 4CLMA 2Z6IA 2XN2A 1YTKA 1WOAA 1H7PA 3MO7A 3NQAA 1PS9A 2GVGA 3B4UA 1OX5A 5AFDA 4UFIA 3BVJA 4DO6A 3L0NA 5CKSA 5BNKA 4NJIA 5FF7A 2G96A 5KINA 2R94A 3M5XA 3NVTA 4JEQA 3KOFA 5C2XA 4WQ6A 1H7XA 2QUTA 1T96A 3E49A 1H60A 1KM6A 3QSRA 4O54A 3FIGA 3W7HA 1JRBA 2ZZ5A 1B4EA 4Y6GA 1QDSA 2ZTJA 3C2VA 1F76A 4DEFA 1QO5A 1JULA 4DBEA 3ZWTA 3MYOA 2GJNA 3H55A 4JTEA 1VJIA 3D0CA 4X22A 3VI2A 1PHQA 4K39A 1TMHA 2J9XA 2QCLA 2G97A 2X1SA 1H62A 3GDKA 3DHFA 3CU2A 1DJNA 4E2DA 4DO5A 4I9AA 3USBA 1XC4A 3GVGA 3MYPA 3BPWA 4XUGA 3G1AA 5FI8A 4MJMA 3R12A 3PBWA 4JGDA 4LVDA 5D30A 4MZ8A 1VHCA 3M6YA 4XWUA 2ZRUA 3KRZA 1H5YA 3OBKA 1KFCA 5G2IA 4UMCA 1K03A 1O5KA 3CWNA 3TQVA 1KW1A 4FF7A 2NLIA 4DF0A 3WK1A 2NX9A 4WXYA 3HPZA 4DPPA 3G1FA 5DBUA 4O10A 4O8RA 2IQTA 1JCNA 5CPNA 1VGAA 3UPWA 4IWWA 2XN0A 4N9EA 1W3TA 3T4CA 4MLJA 3QW4B 4UIOA 5F2MA 1VC4A 4JDBA 1VR6A 3G3DA 4JTIA 4NX0A 4Z0SA 4YCOA 2C16A 3KX6A 4IMCA 4QQ3A 3MW7A 1UJPA 4LVAA 3N2XA 1YADA 2CZDA 3TSBA 3W1UA 3GAYA 4HPJA 3BW2A 1YTEA 2TPSA 3MP4A 4RZ6A 4MZYA 1PCKA 4RKAA 2P0OA 1O60A 2CU0A 3TDFA 4ORIA 2VEKA 3KRSA 3G1VA 2Y88A 1I2NA 4C1KA 4CCEA 4QM1A 3NM1A 5GVJA 2RKXA 3O15A 3G8EA 1X8FA 1QPNA 2BLEA 1ML1A 3LLFA 3HMJG 3G18A 5G2WA 4H6KA 4LS1A 2ISWA 3TNOA 4ORMA 4Z1AA 2V30A 3WK2A 5LHEA 3LCHA 4QITA 2QCHA 2QUUA 3GR7A 2QJIA 4OU1A 1H51A 3I65A 4ZQRA 1ONRA 2ZRXA 3QH2A 1CW2A 3SECA 3GAKA 4M6VA 5SWUA 3LTSA 2WNNA 1R2SA 4I7UA 3W73A 3A21A 5CZSA 1F74A 5C55A 4IMDA 4JTSA 2BTMA 1UASA 2DZTA 4ZQPA 1BWLA 1W0MA 3LCFA 1FCVA 4EF9A 3HG3A 4XTIA 4HHPA 4MFDA 3TQKA 1L6YA 5K9DA 1K8YA 2E1DA 3M7WA 1YXDA 2O7QA 1TTJA 3UWQA 1LLWA 1YDNA 2VEMA 1A53A 5AN7A 1GG0A 1SZGA 3W7EA 2YYTA 1VHNA 3OVQA 4JNMA 4JYDA 1MSSA 3ABQA 1G4SA 5BOOA 4JS3A 2ZRZA 3UNDA 2DZWA 3W7KA 1AW5A 2YFOA 3EWUA 4NJKA 4K7YA 3C4UA 1K02A 1KM3A 3BLFA 4UUIA 3S5YA 3IEBA 2C13A 2BXVA 5LHFA 1G4EA 2HS8A 2GJLA 1FUYA 2GOUA 3TFXA 4AHOA 2ZA3A 1R47A 1DJQA 2JKAA 3BG5A 2C19A 4FX8A 1BTMA 1JRCA 5E0KA 4JX6A 1PV8A 1BEUA 2GQ9A 1ICPA 4AXKA 3QJAA 4FIQA 1D9EA 3FEMA 1KV5A 4RV8A 2ZZ2A 5DBTA 3HB9A 4A22A 2XFWA 2CFFA 1SFLA 2Q3RA 2O7SA 3LV6A 1ZHAA 4KWVA 2WQPA 1WX0A 1I2RA 4O28A 4WOQA 2I14A 1QAPA 2Y7DA 2YFNA 1JCJA 2VFGA 4Z08A 2TMDA 2Y7GA 4DPQA 2OT0A 3NG3A 4E38A 3TIMA 2JGQA 3ZWSA 3STGA 2V8ZA 2WKJA 4UTJA 4R33A 3W86A 4ZQOA 2X1TA 1TPWA 1GZGA 1MEIA 1O95A 1LTDA 3M5YA 4QJ1A 4AF0A 4JTFA 2AQWA 4S2CA 2Q8LA 4UTTC 3ANYA 4HNNA 4B5NA 3W7NA 2OJPA 3NEVA 2QCMA 2WNZA 3HGOA 3WK3A 3R5EA 1H61A 1ZCOA 4MLRA 4Z1CA 1OHLA 1FWSA 1UUMA 4PODA 5IBXC 2NXHA 4AAJA 1X1ZA 2E5CA 1G4TA 1Q3NA 4Y96A 4FO4A 1DQXA 5HWNA 4CNNA 5AC6A 3DI0A 2HMCA 3PWAA 5LSMA 3UD6A 3W2UA 3PF3A 3L21A 4FNPA 3QYQA 1WBJA 4MUZA 3G1HA 1ADOA 3W1NA 2VOMA 3TX9A 3W1TA 2NUXA 2J9ZA 1THFD 4HN4A 4Z1DA 4BFAA 5LNRA 4QAIA 1Z42A 4LTSA 3L67A 1D3GA 4L4LA 4YCPA 3GNDA 2H3BA 3P80A 2FLIA 5AYZA 3TJXA 2I1OA 3PC0A 1GPWA 1VRDA 2CLFA 3NQEA 5ABTA 1GVQA 5FF3A 1LZOA 5G5IA 4N9BA 1A5AA 3GXNA 4MOZA 3BW4A 4DELA 4FNSA 1G4PA 1Q6RA 1W5PA 3DAQA 3T55A 1GT8A 3W72A 1MEHA 1KTBA 1OX6A 3GIYA 4JYFA 3M1ZA 1F05A 3LXBA 3B0VC 3LHUA 3W22A 1FWWA 3C61A 4E2BA 4HSOA 3AO0A 3A5VA 3LBMA 3W7CA 3G3MA 5LNVA 5E93A 4X3ZA 3S1VA 4N2YA 3W1LA 1TPB1 3T78A 2YX0A 5HULA 2B0MA 4UTLA 4IGHA 1EUAA 3THQA 4QNWA 3W07A 3ZS4A 4UNKA 3RFAA 2NV1A 3CLMA 4AH7A 1FCQA 1LRNA 4IMFA 5AYXA 3EXRA 4IX0A 4FHAA 1LBMA 3W2NA 4UNLA 2Y61A 5DCEA 5DN1A 2PURA 3M41A 3P61A 4ICNA 1QCWA 3IRDA 3W7OA 4QISA 2W0UA 1TPDA 3TQ0A 3L0GA 4H4IA 4UXDA 5D04C 3YPIA 1JCLA 2JGYA 1KLZA 4MY1A 4JIPA 1N8FA 1HL2A 3UWZA 1H50A 2A21A 4NNBA 2QCGA 2P10A 3LI0A 1W5NA 3GDLA 2WPBA 3HQ1A 3LBCA 1YXYA 1Z41A 2CLLA 1I4NA 4Q33A 4HT3A 2B7OA 2VKZG 4GC4A 2GQAA 1LDCA 1H7WA 3M5ZA 1W3NA 1C8VA 3EX6A 2UV8G 3O07A 4WZHA 4ADUA 4N4QA 3PG9A 3B8DA 4NZJA 7TIMA 4P61A 1EPXA 1KM0A 4ZQNA 4PCFA 5G1TA 1RR2A 1DKWA 1NAL1 3LHVA 2QDHA 5U7SA 5F1UA 3NA8A 3FKKA 2TRSA 4DXVA 2VXNA 3NQFA 1G7VA 1Q6QA 3CTLA 3OHIA 1D3HA 4O17A 5K9CA 3QMSA 4LUJA 1CI1A 5D09A 2XN1A 1SU5A 1DVJA 1YTDA 1KLYA 4UTWA 2BWGA 4KFPA 4FX6M 1SW3A 3NQ7A 5CSSA 3QMRA 3NXFA 3PBUA 2G5WA 3DI1A 3M5VA 1FDYA 1V5XA 1ME8A 3OVPA 4UTTA 3LXCA 1YDOA 2EGZA 5F2LA 3M43A 1RPXA 1F7BA 5AHLA 3S5NA 4JY8A 5D05A 3G1SA 2H90A 5IBXA 4LNYA 3MJYA 5L9FA 3TSMA 1MZHA 1NEYA 1L9WA 4LV4A 5EMUA 1SR9A 1T0OA 2QCDB 3P5YA 3G22A 4LRTA 1GYNA 4ZL1A 1JJKA 3EKLA 1ZY9A 3O06A 2AAMA 1FX6A 3BG9A 5A5WA 3W7PA 3PAJA 4IOTA 4K6AA 3N9RA 5D37A 1EEPA 3NO5A 1IXNA 3JRKA 4POCA 4OV9A 3MI2A 1YYAA 2A2IA 1AL7A 1JUKA 5CGQA 4N02A 2VFEA 2E5BA 2QCFA 4NXKA 4GUJA 2QCEA 4N6EA 3KXQA 2QF7A 3NL2A 4O50A 2FTPA 3HG4A 4O11A 3QQ0A 1KTNA 3FYPA 1LOQA 1VLWA 3GXTA 3I68A 5K7JA 2J9YA 2ZRWA 1I8JA 3GB6A 2G95A 2RH9A 5AC8A 3S5ZA 3UWYA 3MBFA 4FNUA 2YGYA 5DCBA 3LI1A 1OX4B 3H54A 3HPXA 4IPIA 4OQVA 3L0KA 4KWWA 3CEUA 1EIXA 4K36A 1A5CA 4JYEA 3W3OA 1TRIA 3HG5A 3EWZA 3NPVA 1QO2A 2A0NA 2CZFA 2WNQA 1G67A 3NNTA 1VYSX 3FLUA 1AW2A 3W70A 4TU1A 3LHZA 3B04A 2Z0IA 3NZ1A 3NQDA 5HMSA 3P67A 3IVSA 3KHJA 4JX5A 4AVFA 4QSHA 4BI5A 2E6FA 1EA0A 5AHMA 1QPRA 1Y0EA 1RQBA 5CSRA 1XDLA 1W8SA 2FPVA 2V2DA 3KVKA 4O53A 1RZMA 3W88A 3G1DA 4X9SA 2A7NA 1XUUA 2C6QA 4ZQCA 2ZBTA 3Q37A 1EP2A 4DF1A 1RV8A 3K30A 3W7LA 4I7WA 1K7FA 1KTCA 3W74A 4NX5A 1QOQA 3VNDA 1OYCA 3UXDA 1PL9A 3O6YX 2A6NA 2A7PA 3P8IA 4NQ1A 3F4NA 3QW3A 5FESA 3FJ6A 3M16A 3TAKA 1TTIA 4CCCA 2VFHA 3JR2A 1R46A 4CNOA 4NJJA 1GYLA 5LGXA 3Q2DA 4XBKA 3PR2A 3UWVA 4UFJA 2H8ZA 1B3OA 3C3NA 2Y7EA 1PCWA 1YDVA 3C56A 1G7UA 1H1YA 3QFEA 1XCFA 3LCXA 3HJZA 3EXTA 5FF4A 1ME9A 2YW3A 1YPIA 3GXPA 3WFAA 3G0XA 3SI9A 3SGZA 3TCEA 4WY0A 2HSAA 2V81A 3IGUA 2V5LA 1FDZA 3B0UX 1I2OA 4GRSA 2Z6JA 4CQ8A 4JY9A 4ADTA 1JR1A 1F6PA 1XBVA 4NU7A 1JVNA 4J9JA 3FYOA 2VELA 2ZRVA 1S5VA 4MYAA 4HPXA 4JTUA 3F03K 1DV7A 2V0TA 3N14A 3QMTA 3KAOA 4MJZA 3L9CA 4KFNA 2J24A 3NQGA 3NDOA 1A5SA 4PA8A 3M9YA 2GPTA 2RDWA 5I3KA 3DU0A 4Z0JA 1M7OA 2R14A 3N9SA 4W9TA 2CWNA 4XQ6A 5G1YA 2YW4A 1TPC1 1XBYA 3MBDA 1FBAA 2WOQA 4PL2A 1EP1A 1KFBA 1KFKA 4S2BA 5AHIA 4NXSA 5AHNA 1DHPA 1FDJA 2A5HA 2C18A 5H2ZA 3CHVA 4GNJA 2V82A 1VYRA 1I45A 3PUOA 4RZ5A 1HUVA 4LU0A 3SSJA 4A2RA 4FB7A 2GVLA 2OMAA 3W7DA 4O1BA 4HNVA 4C1LA 1IXOA 2QCNA 3S5OA 4N4PA 5K3VA 1F2JA 1NVMA 2PC4A 5D38A 3PBYA 3W75A 2NX1A 2QJHA 1K8ZA 3VE9A 4K38A 3GZ3A 3HBLA 2YYUA 3R13A 5AYYA 3U6WA 1TJRA 4XBSA 4H3DA 1DORA 1MXSA 2Y62A 4WY0F 3W71A 4PEKA 3WJZA 2GQ8A 3C2FA 1GVOA 1WBHA 4UTKA 5I3GA 1SZEA 1GOXA 3W1MA 1HO1A 5BRBA 2CLKA 1LROA 2QDGA 2V2HA 3NQVA 5FF0A 4EVZA 2Y63A 3THAA 3W85A 1TPUA 2CLEA 4TX9A 3OEXA 3STFA 1NFBA 3DZ1A 2ABAA 2PRHA 2C1HA 4RXFA 5A8GA 5CZTA 4K8EA 1GVFA 3UYCA 3BK0A 2RHGA 4ML9A 2EPHA 4JTJA 3T7VA 3L66A 3R89A 1W54A 4FEZA 4LC8A 2OT1A 3STEA 4XKYA 3QM3A 1TQXA 2NXIA 3UY7A 4MZ1A 5EPDA 4R7JA 2C0AA 1KFEA 2QUVA 2ABBA 3VFLA 3PG8A 3LHYA 3OA3A 1F6KA 3ABSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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