4AXNA

Hallmarks of processive and non-processive glycoside hydrolases revealed from computational and crystallographic studies of the serratia marcescens chitinases
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
DDAAIMPSIANKKILMGFWHNWAAGASDGYQQGQFANMNLTDIPTEYNVVAVAFMKGQGIPTFKPYNLSDTEFRRQVGVLNSQGRAVLISLGGADAHIELKTGDEDKLKDEIIRLVEVYGFDGLDIDLEQAAIGAANNKTVLPAALKKVKDHYAAQGKNFIISMAPEFPYLRTNGTYLDYINALEGYYDFIAPQYYNQGGDGIWVDELNAWITQNNDAMKEDFLYYLTESLVTGTRGYAKIPAAKFVIGLPSNNDAAATGYVVNKQAVYNAFSRLDAKNLSIKGLMTWSINWDNGKSKAGVAYNWEFKTRYAPLIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Serratia marcescens
publication title Hallmarks of Processivity in Glycoside Hydrolases from Crystallographic and Computational Studies of the Serratia Marcescens Chitinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE C1
total genus 115
structure length 316
sequence length 316
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4axnA00
1R7AA 2WXDM 1GOMA 2GK1B 1VFOA 5BROA 2VO5A 1J0ZA 5AYBA 3U7VA 3GBDA 5A6MA 3NYDA 2YL8A 4K68A 3AMCA 1R8LA 3W82A 4QLKA 1V3IA 3RDKA 2W66A 4WLCA 1DWJM 2C8NA 1W2PA 2CXGA 4AD5A 2W63A 1HIZA 3BCFA 2XTKA 3CUJA 4D72A 1H2JA 4PBGA 3FN9A 1K9EA 4A4AA 3AYSA 1YHTA 5FOOA 4H8VA 4P7QA 1QI5A 4JFWA 5GNYA 1WZMA 1W1VA 3GBEA 2XVPA 2GVYA 1J12A 4M24A 1BG9A 2WLYA 4W8AA 1UUQA 1JNDA 1W9XA 5A94A 1ISXA 3AHYA 2JALA 3IJ9A 3CHCA 2XSBA 4TVUA 2GJRA 5GNXA 4ZE4A 5CSYA 4UNIA 2CKRA 3KL0A 2D0HA 1E9LA 4MDOA 3WF4A 1XSKA 1OSEA 1QI4A 3RILA 1Q6DA 4AWEA 1V02A 4U3CA 2X0HA 5DO8A 5IXEA 3WUFA 3AFBA 1GJUA 3ARVA 1HKJA 1U33A 1QNQA 1SFSA 5ABFB 1W9UA 1QNRA 1HJQA 1VBRA 4HA4A 2J74A 7A3HA 2VJXA 2BY1A 1E3XA 3K46A 3SCQA 2BXYA 2XPKA 2JFEX 4W7VA 3PTKA 1EO5A 3A3HA 1UR8A 3EDEA 2JE8A 3KEHA 2ZOXA 2XSAA 1D7FA 3VNZA 1H11A 3TTSA 2EPKX 5E9AA 3PZNA 1HKKA 1JD7A 2WCSA 1HVQA 1VFFA 3UG5A 1VBUA 1UWRA 3W6MA 2WMJA 3L4TA 4H2CA 4PMDA 2WMFA 3T0DA 2DPEA 1CEOA 1EH9A 3WD2A 1R85A 1JI2A 2WKLA 1DWFM 3MO4A 4C7GA 1NP0A 3U5YA 3N13A 4PTXA 2AAAA 2EQDA 1MFUA 1EQCA 2ESCA 3VUPA 1V02E 1NWSA 1J0HA 1UR4A 1UD4A 1F4HA 2JIWA 1E0VA 1K9DA 3VIOA 5A6LA 1US2A 5D9PA 1CTNA 3GXDA 2QMJA 3RIKA 3AS2A 1MXDA 2X09A 3MV01 5GPRA 1V3LA 2FHFA 1CLVA 1XD0A 4V27A 3WL1A 2UY2A 2CBIA 1GOQA 5CPSA 3MV11 1E6PA 4J3UA 1OWQA 2DIEA 4PMNA 2HVMA 4AD0A 2ZXAA 1G01A 1HN1A 3EDJA 4AIUA 1OD0A 4JIEA 1E0WA 3UETA 1B31A 1H09A 3BSGA 4L4PA 3WD1A 2XWEA 3AZTA 4MB1A 3ARPA 2B31A 1IZKA 1UKQA 2EXOA 3W37A 1H5VA 1DWAM 4HPGA 1KBKA 2WBGA 4AW7A 3PZMA 4UZUA 3SIMA 2IXUA 3RM9A 1UWSA 3WMSA 1MYRA 4DM2A 4Q7NA 2WVUA 1JI1A 1LQ0A 3AHZA 4M8UA 2XJ7A 5E70A 5LA0A 3D3AA 3ZT7A 4W5UA 3AXXA 3ZMRA 1BLIA 4W7WA 3GNRA 3AMLA 4MTVA 3WQ6A 4PMQA 2GUYA 2FH6A 4E4PA 2YJQA 4WKHA 1V6WA 2Z1KA 4GO9A 2NSXA 4AZ5A 3CBWA 2DQXA 3VIIA 2XYLA 3SEPA 2W67A 2Y8KA 1UA3A 2J79A 1CPUA 2GJXA 4W7UA 5CQ1A 3BAWA 4AD2A 1FP9A 4J3VA 2WMKA 4CD4A 5ECUA 2WLZA 2BVYA 1CXFA 3PHAA 4W89A 1DWGM 1LG2A 1JAEA 1CGUA 1W32A 4JKLA 3GYCA 4PMOA 1CIUA 3L4XA 4AIEA 1ZB5A 2YL6A 3L2MA 2D1ZA 3ZT6A 3A6OA 4HMCA 1QBBA 4PMRA 2O9OA 1S46A 3GXFA 4JFSA 4TUFA 3DYMA 2XGIA 1UG6A 2VRJA 1KBBA 1JF5A 3ARTA 1WO2A 1GQIA 3TTOA 1JD9A 1ZBVA 3VM7A 1E56A 2VCAA 1UWTA 2J77A 4ZXLA 2FDMA 2WBKA 2WAGA 3ZM8A 4HZ7A 4FLSA 2EJ1A 5LA2A 1HXJA 1CWYA 1AQHA 4H8UA 4P8XA 2G3NA 4V2XA 3T0AA 1OCQA 4J28A 3AICA 1BG4A 1PX8A 1CNVA 3LPOA 2VZVA 1JZ5A 3AHXA 6CGTA 1K6AA 4F79A 1C8YA 3QHOA 4JKMA 2VR4A 2OLHA 1AQMA 3LPGA 3N1AA 3VGBA 1IZJA 3CH9A 1U30A 4J3SA 4TVCA 5DFAA 1CGXA 1NP2A 1ZBCA 2ZX5A 3IAQA 3GDBA 3RO8A 2PWEA 4P8UA 2E0PA 4D6EA 4X9YA 1OIFA 1ZL1A 4HA1A 2QPUA 2CETA 4MB3A 6A3HA 2VZUA 3CUGA 2CPUA 1V03A 2Z1SA 4IPNB 5A6AA 4DWSA 4OUEA 5M5DA 3ARRA 3OB8A 2NT0A 1KR1A 2CBVA 4WSJA 4YHGA 2F61A 1VENA 4UZSA 4CD7A 3UG3A 3BH4A 1VEMA 4D6CA 2V3FA 1TVNA 3AROA 4BS0A 1EIBA 4E8CA 2WW5A 5A6SA 4CCDA 3VGFA 1SMAA 3HMCA 5A95A 4CCEA 4QCFA 3N15A 1X6LA 1V3MA 3UESA 5DF0A 3CZGA 8CGTA 3O2LA 4UFLA 3PZTA 5I3DA 1NOUA 1RH9A 5JUVA 2IXVA 2WHKA 3B8SA 4JL1A 3VMPA 5I2UA 4GZIA 2GJPA 3RM4A 3ZJ8A 3CZJA 4J7RA 5IHSA 1I75A 3M46A 1G0CA 3OGVA 1KWGA 3CUIA 1XSJA 3WH8A 3WUBA 1J0KA 3WFZA 1M53A 2ZXBA 4Z2KA 3BMVA 1VIWA 4UQBA 5IFTA 2VMFA 2VOTA 1MQQA 3CTTA 2DGAA 2YLAA 1W9PA 4MNMA 5C71A 5EFFA 3NUKA 4WSKA 4P7RA 3WNLA 3IJ7A 3VTRA 2YL9A 1LL6A 4Q22A 1UR2A 1ODZA 1CENA 3A4AA 3VGGA 1TA3A 2YA1A 1JZ6A 2FGZA 3WH5A 2XIIA 2YDRA 1NOWA 3MUY1 5CLTA 5BXRA 1WCGA 4IISA 3FHQA 3AZSA 2BXZA 4BQ3A 2GJXB 3OGRA 1CBGA 4CKQA 4P7OA 3W53A 3T08A 1JYNA 2VR5A 1HP4A 1E70M 2VVNA 3G6MA 1M03A 1VJSA 1J18A 4DWSD 1ITXA 4PEEA 3AIRA 4ATDA 1C91A 4QAWA 4F66A 1FH8A 3VD3A 3APGA 3D5HA 3WY1A 2XVGA 2GSJA 2VURA 2FHCA 5I5RA 1UKTA 1B30A 4PSRA 4LYQA 3OGSA 3CHEA 2WC7A 4FLQA 1NWUA 4B3KA 2CEQA 3SUUA 2XGBA 1JXJA 1J9YA 5EBAA 5A8QA 1NOFA 5A3HA 3EBVA 3WDRA 5BCAA 2FH8A 3DYPA 1D2KA 3SCUA 1HKMA 4D6IA 1X6NA 2QHAA 3VX0A 2W91A 2VC9A 3VX1A 3VDBA 3MMDA 3DECA 5I6SA 4UR9A 2WWCA 2XVKA 1JGIA 2D0FA 4UCFA 4Z2HA 2CERA 3CZLA 2BV9A 3LPFA 1BGGA 3OG2A 3RCNA 1KQZA 1CXHA 2YIHA 2PWHA 2XVLA 5DT5A 4W86A 3MUAA 2J75A 3BSHA 3MUIA 4R27A 1E6QM 3SCWA 1L0PA 1CXEA 5EMYA 1V6XA 3FY1A 4HTYA 3NDZA 2CKSA 4S3JA 1W3JA 2ZWYA 4CU7A 2EEXA 3VGEA 1FHLA 3FW6A 5E0CA 3CO4A 3PTMA 3N17A 5JBDA 1UH3A 1UWQA 4XV0A 4B16A 1R87A 3VD7A 2VX7A 1JYWA 3WEMA 1JIBA 3CMJA 2W62A 1UQZA 3I3DA 4DWSB 4CU6A 1JZ8A 2YLLA 4PMVA 3AOFA 3SCOA 2WYSA 1RD6A 5ABHA 2BY0A 1H41A 3T2OA 2E8ZA 1Z32X 1JDAA 4TX6A 4B9YA 5I79A 2A3BA 2QF8A 4ATWA 2X05A 3AS1A 2O92A 3IJ8A 3VGHA 1UZ1A 2V3DA 5JIPA 3FHAA 5KZ6A 5FD0A 1PIFA 2WB5A 1GJWA 1LL7A 1PBGA 2QPSA 1GNXA 1LF1A 1QHOA 1W1PA 5D8ZA 4MADA 1TCMA 2UWFA 4NF7A 2O9RA 3TTYA 1SMDA 1E6NA 4JKKA 1JXKA 1NARA 2C0HA 4OOUA 1OIMA 2BHZA 3VNYA 3SUWA 4ML4A 1BVZA 1W1YA 1HJWA 1C7TA 1JDDA 3RJYA 1E0XA 2DSWA 1BF2A 1UOKA 2VCCA 1HJXA 3AZRA 1V08A 4FK9A 4WKAA 4D71A 1TA3B 3WIJA 3FAWA 2OSXA 3WDJA 2YA2A 1BYAA 3ARQA 3AIBA 2PWFA 3WF1A 5HNNA 2OWWA 3MSDA 1EHAA 3UERA 5CXPA 4UQ9A 4AD4A 5IHRA 5M17A 3VIPA 1ESWA 2WSPA 2WPGA 1V3HA 3EMZA 2CITA 3WFLA 2BVDA 1UYQA 2QMKA 4LQ1A 3AIEA 4BQ4A 3ZR6A 6TAAA 3B9EA 1WNOA 1VRXA 3ARZA 1R7OA 4BZYA 1ISVA 3WQ5A 5EFDA 3S6TA 3PZOA 4NRRA 2VZSA 1UD3A 1EDTA 4GI6A 3WEZA 1V6YA 1GORA 1LLOA 4Z2JA 2PI6A 1KWKA 3ARXA 1CGTA 3HJEA 5BXTA 5CG0A 1UWIA 4JFVA 2OSWA 3THCA 4C7DA 1SR0A 3BCDA 1TZ7A 1OD8A 1GCYA 2VVSA 4M56A 4URIA 3WEOA 3EMCA 4PMUA 1N82A 4FMVA 1QI0A 3N18A 2XVNA 4QP0A 4L4OA 3WNPA 2XFRA 4MDPA 4H41A 3ALFA 1BFNA 3F5LA 5FCZA 3IANA 3WMBA 2RGLA 3SCTA 2DT1A 5CSUA 1W9DM 1HJSA 3OLIA 3OZOA 3SUTA 1NQ6A 3EDDA 3OLDA 3WELA 1A47A 3AHVA 1V3KA 5FIPA 4UOJA 1GW1A 4CD5A 4OKDA 5A6BA 3EMQA 1ZU8A 3PZUA 2VT0A 3L4YA 1O6IA 3ZJKA 3AIUA 1JYXA 3S2CA 2PF0A 2Y24A 2D0GA 1M01A 1CXKA 3TP4A 3WDPP 1E6SM 3BAYA 3PZVA 1B3WA 4JFTA 4KRTA 1U2YA 3W26A 2VZTA 5LYRA 1JYVA 1XHGA 3PZ9A 4JHZA 3K4DA 1EDQA 1EQPA 1BSIA 2ZUWA 1B1YA 2WCAA 1KB3A 4FF5A 1TMQA 4W84A 1PAMA 5C8BB 3AIWA 1R86A 7TAAA 2J78A 4TOQA 4Z2LA 1B2YA 3W0KA 4AC1X 4OBRA 1UKOA 1BQCA 4PUDA 4E2OA 1GQJA 4ZXOA 3SCVA 2A3EA 1V0KA 4W8LA 4OJYA 1RP8A 3BAJA 5AC4A 4GZEA 3WDQA 2C7FA 4XZWA 4UOQA 4TXEA 1LWJA 2VRKA 3T0BA 3K4AA 1KXQA 2D2OA 1UD5A 2XWDA 5BXPA 1CXLA 2ZX6A 1DWHM 1CGWA 3TA9A 3PBGA 3QR3A 1E5JA 1JDCA 1W91A 3VGDA 4HU0A 4HMEA 4CD6A 2ZX9A 3VDAA 2VX6A 1QI2A 2WMGA 3GXMA 4DUXA 2ZUVA 4M1RA 1JZ4A 3A47A 4BQ5A 3ECQA 2WZIA 2E3ZA 3VIGA 4CUCA 5A6BD 3IAPA 1QW9A 3N11A 4DUWA 3RJXA 4W5ZA 4AZHA 4PMXA 2CESA 4D6DA 3TONA 1HKIA 2V3EA 1C3FA 3SCNA 5M3WA 3CZKA 4AEEA 3AMGA 4P7LA 1DEDA 3KZSA 3L4ZA 1XH0A 2X8RA 4MNLA 3ZO9A 2G4FA 1C7SA 4AZCA 4M81A 4AY1A 1E5NA 1OBAA 4E8DA 5HBFA 1EOMA 3VIHA 1F4AA 3MKKA 5FL1A 4MB4A 1NWTA 1E73M 3U57A 2WHMA 2V38A 4X0NA 4H7VA 3SUSA 4ACYA 2JF6A 3W4RA 4GKLA 1XCXA 4PYSA 1W9BM 5D8WA 2J47A 2ZUTA 2EPOA 5A8NA 3NSNA 3PZIA 2DT2A 1OT1A 1GOWA 1WP6A 1WPCA 3VDHA 3II1A 1TG7A 2F8QA 1SYTA 1E4NA 3M6DA 1ISYA 3L4WA 4LYPA 2WZEA 4PTMA 2J7EA 1FP8A 2DT3A 3RM8A 5GNZA 1WDSA 1BTCA 1CLXA 1HJVA 4HOXA 5JBFA 1D3CA 5I23A 3CUHA 3NDYA 1GOIA 1HT6A 4ACZA 2OWCA 1HVXA 2J25A 4OZOA 4QFUA 1BYBA 4M82A 5AY7A 3WF0A 3M07A 2WHLA 1UA7A 2YKKA 1WDRA 1QHPA 3DHPA 3QOMA 3GM8A 3VVGA 1QI3A 4D1IA 4ZE5A 1B3XA 1KCLA 4CCCA 3FXYA 1Y7VA 2Y4SA 5HXMA 1E6RA 3VOCA 5CGMA 4M80A 4YHEA 2J7BA 2ZX8A 1ITCA 2G41A 2UY3A 3WKZA 1V0MA 4UFMA 5C70A 1G9HA 3WH7A 4GI9A 4IM4A 5JIWA 1MWOA 2J7DA 4F9DA 3K8KA 1Q6EA 4HU8A 4UFJA 2OYKA 3AXHA 4HOZA 1NM9A 1UD2A 1MXGA 3M7SA 2NW0A 1UR9A 4IUGA 4U33A 2WSKA 4RE4A 4WKFA 3GH5A 2WMIB 1V0NA 3WD0A 4PRWA 2G3IA 1XGZA 4GINA 4A3YA 1UHVA 4W93A 1W3KA 1W3HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1R7A A;  2WXD M;  1GOM A;  2GK1 B;  1VFO A;  5BRO A;  2VO5 A;  1J0Z A;  5AYB A;  3U7V A;  3GBD A;  5A6M A;  3NYD A;  2YL8 A;  4K68 A;  3AMC A;  1R8L A;  3W82 A;  4QLK A;  1V3I A;  3RDK A;  2W66 A;  4WLC A;  1DWJ M;  2C8N A;  1W2P A;  2CXG A;  4AD5 A;  2W63 A;  1HIZ A;  3BCF A;  2XTK A;  3CUJ A;  4D72 A;  1H2J A;  4PBG A;  3FN9 A;  1K9E A;  4A4A A;  3AYS A;  1YHT A;  5FOO A;  4H8V A;  4P7Q A;  1QI5 A;  4JFW A;  5GNY A;  1WZM A;  1W1V A;  3GBE A;  2XVP A;  2GVY A;  1J12 A;  4M24 A;  1BG9 A;  2WLY A;  4W8A A;  1UUQ A;  1JND A;  1W9X A;  5A94 A;  1ISX A;  3AHY A;  2JAL A;  3IJ9 A;  3CHC A;  2XSB A;  4TVU A;  2GJR A;  5GNX A;  4ZE4 A;  5CSY A;  4UNI A;  2CKR A;  3KL0 A;  2D0H A;  1E9L A;  4MDO A;  3WF4 A;  1XSK A;  1OSE A;  1QI4 A;  3RIL A;  1Q6D A;  4AWE A;  1V02 A;  4U3C A;  2X0H A;  5DO8 A;  5IXE A;  3WUF A;  3AFB A;  1GJU A;  3ARV A;  1HKJ A;  1U33 A;  1QNQ A;  1SFS A;  5ABF B;  1W9U A;  1QNR A;  1HJQ A;  1VBR A;  4HA4 A;  2J74 A;  7A3H A;  2VJX A;  2BY1 A;  1E3X A;  3K46 A;  3SCQ A;  2BXY A;  2XPK A;  2JFE X;  4W7V A;  3PTK A;  1EO5 A;  3A3H A;  1UR8 A;  3EDE A;  2JE8 A;  3KEH A;  2ZOX A;  2XSA A;  1D7F A;  3VNZ A;  1H11 A;  3TTS A;  2EPK X;  5E9A A;  3PZN A;  1HKK A;  1JD7 A;  2WCS A;  1HVQ A;  1VFF A;  3UG5 A;  1VBU A;  1UWR A;  3W6M A;  2WMJ A;  3L4T A;  4H2C A;  4PMD A;  2WMF A;  3T0D A;  2DPE A;  1CEO A;  1EH9 A;  3WD2 A;  1R85 A;  1JI2 A;  2WKL A;  1DWF M;  3MO4 A;  4C7G A;  1NP0 A;  3U5Y A;  3N13 A;  4PTX A;  2AAA A;  2EQD A;  1MFU A;  1EQC A;  2ESC A;  3VUP A;  1V02 E;  1NWS A;  1J0H A;  1UR4 A;  1UD4 A;  1F4H A;  2JIW A;  1E0V A;  1K9D A;  3VIO A;  5A6L A;  1US2 A;  5D9P A;  1CTN A;  3GXD A;  2QMJ A;  3RIK A;  3AS2 A;  1MXD A;  2X09 A;  3MV0 1;  5GPR A;  1V3L A;  2FHF A;  1CLV A;  1XD0 A;  4V27 A;  3WL1 A;  2UY2 A;  2CBI A;  1GOQ A;  5CPS A;  3MV1 1;  1E6P A;  4J3U A;  1OWQ A;  2DIE A;  4PMN A;  2HVM A;  4AD0 A;  2ZXA A;  1G01 A;  1HN1 A;  3EDJ A;  4AIU A;  1OD0 A;  4JIE A;  1E0W A;  3UET A;  1B31 A;  1H09 A;  3BSG A;  4L4P A;  3WD1 A;  2XWE A;  3AZT A;  4MB1 A;  3ARP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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