4XTIA

Structure of imp dehydrogenase of ashbya gossypii with imp bound to the active site
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
407
structure length
373
Chain Sequence
YRDAATALEHLATYAEKDGLSVEQLMGGLTYNDFLVLPGKIDFPSSEVVLSSRLTKKITLNAPFVSSPMDTVTEADMAIHMALLGGIGIIHHNCTAEEQAEMVRRVKKYLASKSADTKQLLCGAAIGTIDADRQRLAMLVEAGLDVVVLDSSQGNSVFQINMIKWIKETFPDLQVIAGNVVTREQAASLIHAGADGLRIGMGSGSICITQEVMACGRPQGTAVYNVTQFANQFGVPCIADGGVQNIGHITKAIALGASTVMMGGMLAGTTESPGEYFFRKRLKTYRGMGSIDAMQKLVAQGVTGSVIDKGSIKKYIPYLYNGLQHSCQDIGVRSLVEFREKVDSGSVRFEFRTPSAQLEGGVHNLHSYEKRLF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Increased riboflavin production by manipulation of inosine 5'-monophosphate dehydrogenase in Ashbya gossypii.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Ashbya gossypii atcc 10895
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase,Inosine-5'-monophosph
total genus 117
structure length 373
sequence length 407
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2015-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4xtiA00
1VRDA 1NSJA 3LV6A 1B9BA 4N9EA 1FXQA 2YW4A 4H6KA 3BW4A 4LUIA 3DFPA 5I3FA 5HR6A 3T40A 4IX0A 3H54A 4LNYA 1H1YA 3P5ZA 1JULA 3U8GA 3QPYA 1ICSA 3HIJA 4A29A 4UTJA 3DXIA 1LTDA 1QMLA 3TMLA 5F2GA 3MMTA 4M5PA 5FF4A 3BLEA 3G8EA 4JNMA 4DELA 4WXYA 2QEZA 2ZRWA 3GNDA 4R7JA 3TQ0A 4PODA 4Y90A 5LHFA 3NXFA 1OX5A 2P0OA 3HMJG 4IMGA 3FA5A 2WO5A 2AQWA 1A53A 1QOPA 4JDBA 4Z0JA 2BSLA 2GQ9A 3NZ1A 5FEZA 2GQ8A 2J6XA 4C1LA 5DELA 1KFCA 3RLVA 1K03A 2DZWA 3SGZA 3GDRA 5I3GA 1IXNA 4I7WA 4TMCA 2JKAA 3DI1A 4JX4A 1TJPA 1G4SA 2I14A 1T99A 2F84A 4MKNA 4GNJA 3QFEA 2WNZA 3KAOA 3UWZA 4M6VA 3LB0A 2PURA 3L5LA 3TJXA 3C56A 4Z1CA 1AL7A 2ABAA 2G97A 1QR7A 3NPXA 5D03A 3SZ8A 3CWOX 1K8XA 2ZRZA 1XL9A 4O14A 4HNNA 1FDZA 5D38A 3W7OA 3QMTA 1BTMA 1UJPA 1WBHA 4BI6A 3F1QA 2H8XA 1GG1A 1FBAA 3P5YA 5IBXA 3B04A 1FCQA 4YCOA 1K8ZA 4IMFA 5AHEA 4U28A 1XDLA 2FTPA 3RNDA 2ABBA 1YDOA 4MY1A 3ABQA 4JR5A 1DORA 3UY8A 1GQNA 1LBMA 1SO6A 1DKWA 1VH7A 2ZFAA 2E5CA 3NZRA 5EBUA 3NVTA 1O5KA 4O0ZA 4JS3A 1D3HA 2C14A 4ORIA 3RU6A 5DN1A 5F2IA 3W87A 4DXVA 1W3IA 1M5WA 3RF9A 1PCWA 1GYLA 4Q4KA 1K02A 1RV8A 3UXAA 4KFNA 2V81A 3W74A 1X8FA 3W7LA 2X1RA 5D37A 1WA3A 3MI2A 3TU9A 5EMUA 3A21A 1VZWA 4ZQRA 2XFWA 3PBWA 4LY8A 3G3MA 3UWVA 2QCEA 3DU0A 3O05A 5DXYA 3YPIA 2X1TA 4L4LA 1HUVA 2YCEA 5L9FA 3MWAA 4UTTA 4HNTA 3LBMA 4AEOA 3C61A 5ABTA 4UTHA 4O19A 3UWUA 3N9SA 4BF9A 2Q3OA 3NOEA 3UNDA 4J9JA 4NNCA 2WSYA 1M7PA 1BWKA 1MEWA 2X1SA 3QJAA 1TQJA 1SSGA 3ZS4A 4EIVA 4UCGA 3NL5A 4ZMGA 2DZUA 5EYWA 5HUPA 5U4NA 5K7JA 1CX9A 1YADA 5C2XA 1Z41A 4O1AA 3PY2A 1LLZA 2V2HA 4UTWC 2YYTA 2A5HA 3EEGA 2EF9A 1IXQA 3B06A 3BVJA 4NZJA 1G6CA 4JICA 1HTIA 2NUXA 3LRKA 3WJZA 3DFSA 4XBKA 1DOSA 2H8ZA 1S5VA 3NPWA 4QNWA 4GUFA 5AFDA 3CQ0A 3MJYA 3G1AA 5FF0A 4DBEA 4JYDA 1Z48A 1VYRA 1PVNA 2Z2UA 4S1FA 4O12A 1W5OA 1PHWA 3T7VA 1FWSA 3DH7A 3IEBA 3L68A 2ALDA 4TO8A 2Y7EA 3BW3A 1QPRA 5K9XA 1S5TA 2WKJA 3W83A 2P1FA 1W56A 2QAFA 1R47A 3Q37A 4FNUA 3JS3A 3NEVA 3TW6A 5KSWA 2E5DA 3GLCA 2YX0A 1LCOA 4FNQA 4O54A 2ZZ7A 4O57A 1GVQA 3I7QA 4XTIA 3TSDA 1NF7A 4FX8A 1KFBA 2NWSA 3MUXA 4R33A 2E6AA 5AC6A 3B8DA 5BNKA 1J4EA 4Z1DA 1UASA 1WBJA 3C2EA 2GVJA 1XM3A 4UMBA 1OF6A 1VYPX 4O1BA 4JYEA 3BG5A 4IMCA 1LLWA 3W7JA 4HIBA 3TIMA 3W2JA 4HNVA 1SW0A 1HO4A 4QM1A 4RR4A 2JGYA 3L66A 3R12A 1KTNA 2WNQA 2Y63A 4JD4A 1PV8A 2QDHA 3UY7A 3W7HA 1W5PA 3UZJA 3BO9A 1GZGA 3GDTA 1XXXA 1YDVA 1U83A 4RV8A 3LCIA 1VYSX 1WYIA 3UWWA 3GNNA 4HPXA 1VGAA 2ZZ3A 5D09A 1XBZA 2FLIA 3PB0A 1LDCA 1KM0A 3QPZA 4RZ6A 5CGQA 5HINA 5BRBA 4LU0A 3T44A 4E2DA 3R5EA 3NGJA 2X1UA 3I65A 4UNKA 3LHYA 3BLFA 2NXHA 1SFLA 4LRTA 5I3JA 2J9XA 5FEPA 3W7DA 1SO4A 2Y7GA 3W76A 4QIUA 3IGXA 2VFDA 3L5MA 1B4KA 1GYNA 4JTIA 1YXCA 3P74A 2V82A 1RVGA 2NV2A 2GUUA 3EX6A 3W22A 2VFIA 3PULA 4Q32A 3HBLA 1GVFA 2HTMA 4K6AA 1XUZA 3EWUA 4K39A 5H2ZA 2OMAA 1W31A 4UFMA 4JN6A 4NXKA 2BZNA 4M19A 4RZ5A 1ICQA 3R89A 3NM3A 5D33A 1DL3A 1FWNA 3FFSA 1YXYA 5F1VA 4R53A 3QQ0A 3LCGA 4POCA 2B7NA 4MVAA 2E1DA 3U2OA 4W9TA 4NJKA 3QW3A 2WSQA 5GVJA 5CZ0A 2RDTA 1QO5A 3LCFA 1O94A 4XTDA 1MZHA 4JDYA 1KLYA 2R94A 2DZVA 2XN0A 5CPOA 2ZA1A 1VLIA 4AWUA 4WX2A 1C8VA 1EPXA 1GEQA 4GFSA 1VCGA 3PUEA 3NM1A 3W6YA 4UIOA 1JCXA 3PSVA 1Q45A 4K8EA 2E6DA 4G1KA 4LV4A 4O15A 3Q58A 3KFTA 4BR1A 4JIQA 3TDFA 4DF0A 3TSMA 5L6UA 4MLJA 3M16A 4ZQMA 1Q6RA 3N2XA 3FJLA 3NNTA 3LI1A 3L0KA 3W1QA 5HMSA 1TPH1 4XKYB 1ZFJA 2EKCA 2ZTJA 5SWUA 3LRLA 3QQ1A 3EWYA 1VPXA 3G1SA 5IM51 4UR8A 4M7SA 1JR1A 3IIPA 2NZLA 3L67A 4MPQA 2GVLA 3W1RA 4O18A 1PL9A 3UYCA 3PS7A 4IPIA 1TCDA 1X7FA 1WX0A 5E1QA 1GVOA 3EX2A 1VHNA 4CNNA 5LZLA 1Q3NA 2VEKA 1SQ7A 2QCHA 1LZOA 3TROA 2QAPA 2HSAA 2CU0A 2FPYA 3S6DA 4IQLA 3NL2A 1KM1A 3LRMA 4FNRA 4YMZA 5AN7A 1GT8A 4IMEA 3USBA 3HPZA 3STGA 4JY9A 3P81A 3W7EA 4UTLA 4QJ1A 4UFHA 4K37A 4X22A 1QCWA 2B0MA 3LX9A 1TB3A 1AW2A 1TPVA 5FI8A 2TYSA 3N3MA 1I2RA 5G2IA 3KVMA 3CIXA 3TFCA 4LVAA 2FQIA 1UB3A 4LTSA 3W2MA 3UWYA 4MZ1A 3VCRA 1V7YA 1ZAHA 1QOQA 1TPDA 4HSOA 4UNLA 1N8FA 3DHFA 4LC8A 3IGUA 4DO6A 2CLFA 4K36A 1XDMA 1W3TA 3LXAA 5I3KA 3HJZA 3L9CA 5E0KA 1TYGA 1I4NA 3N19B 1R2RA 2CLHA 4WOZA 3NPUA 3O8AA 3HGRA 1L6WA 1NAL1 4O52A 3EWWA 2R14A 4O10A 4DBDA 3CC1A 1ML1A 4ADUA 3OIXA 5F1UA 2C1HA 1YPFA 2V2CA 3W71A 1RR2A 4HNUA 4KWWA 1NF0A 2C3ZA 1WV2A 3B05A 4OGZA 2C16A 2PCQA 2AAMA 4YXGA 4OWGA 1CI1A 1T96A 5TBOA 2ZRVA 5T26A 2QCLA 3WK3A 2V0TA 3GIYA 1JCLA 4RXGA 4RXFA 2X30A 1BKSA 3LTYA 3LTPA 1GPWA 4JIPA 1WAUA 4DF2A 3UQNA 4GWEA 1SSDA 2WOQA 3S0CA 3TXZA 1TPEA 2QCDB 4AB4A 3NL3A 1QWGA 4H3DA 4A2RA 1VQTA 4BWLC 3NPVA 3M6YA 4I7VA 4IXXA 4EF8A 4UXDA 3EB2A 4LS2A 1X1OA 4WD0A 3HGJA 2NXGA 3M41A 1H5YA 5KZMA 1JCMP 3SSJA 4ZL1A 3C2OA 2XN2A 3FEMA 5EY5A 2ISWA 5A8GA 3MO7A 3DBPA 3EXSA 3THAA 4NUWA 3MW7A 3O07A 4R34A 1S3HA 3ANYA 2J24A 3STEA 5LNRA 1P4CA 4PEKA 3DFQA 1LOSA 4Q33A 3TXVA 2DZXA 4JTJA 3FIGA 3HO8A 3RFAA 1I8JA 3H55A 1O60A 3QZEA 1Y0EA 4DQWA 5AHFA 4NVTA 1JRCA 2DJLA 5FF3A 5TIMA 4O53A 4DEFA 2GVGA 4Z1BA 3T78A 1D3GA 3WJWA 1ZAIA 1QNVA 3V1PA 3Q2DA 2ZA2A 1F76A 4K38A 1OFEA 3M44A 3C3NA 2V8ZA 4JXCA 5G2WA 3C2VA 3B0UX 3O6DA 5HULA 3S5ZA 2V30A 4M7TA 5HNRA 5D2XA 2F7FA 3HGOA 4LVGA 4YCPA 3EX3A 1KV8A 3G8RA 1IIHA 3SW6A 3IIVA 1PE1A 3KXQA 2W79A 3GXNA 2VXNA 2VFEA 5HWMA 1R46A 4A2SA 3TC7A 1K3UA 3P8IA 3ABRA 1XC4A 1IIGA 5G5IA 4GUJA 5DCEA 4BI5A 2ZZ1A 3DFOA 4ZQOA 1K8YA 5FF2A 2W6RA 4ML9A 1VR6A 3L0NA 4JTEA 1QDSA 3PG9A 4FXRA 2QJIA 5C54A 4WY0F 3LI0A 3R2GA 1Q6QA 4PH6A 5HUOA 2C15A 2DZTA 3LHVA 1FWWA 3NQMA 4EWND 1W5MA 1G67A 1AMKA 3CWNA 4O11A 2YW3A 3C8FA 3LCLA 3QMRA 1O95A 3G1XA 2C6QA 5DXXA 3E02A 3W1PA 2CLKA 3QMSA 4JGDA 2E77A 2J27A 4O0KA 5DY2A 3VE7A 1A5AA 1VJIA 2I1OA 2Z0IA 3QRHA 2A1YA 1XFBA 2Y85A 3GDMA 3ZWSA 3EX1A 4UC5A 3M5ZA 3S9YA 2WNNA 3CM4A 1K7FA 2A0NA 2Z1BA 1QPQA 3MHUA 1X1ZA 1H61A 3O16A 1OK4A 1OYCA 1SZFA 3G1DA 4E0CA 1LYXA 4JTLA 4LW7A 1JUKA 1FWRA 3TSBA 3NAVA 1W5QA 1NFBA 1TPWA 2CZDA 3R8RA 1JQXA 3NQAA 4TMBA 3CTLA 5FEWA 3NG3A 1RQBA 3G0SA 3LTSA 3THQA 2CLMA 2PC4A 2RHGA 4N4PA 3U6WA 4D2JA 1QFEA 4WZHA 2QCCA 1EB3A 3QW4B 3N9RA 1AW5A 4WQ6A 3S1VA 1ZY9A 3W9ZA 2Q8ZA 4E38A 1OK6A 2RDWA 3PSWA 4ONVA 1I2PA 2FIQA 3OEXA 3WJXA 4N4QA 3GDKA 3LCXA 4CCCA 2EAWA 1G4EA 4RJEA 4K7YA 4AWTA 3ELFA 1F7BA 3S1UA 1RZMA 4NJHA 1H7RA 2YYUA 3TKFA 2TRSA 3LXBA 4N9CA 3F4WA 3TAOA 1W0MA 1LBFA 4FX7A 3MYOA 2ATMA 4BFAA 1F05A 4ZQCA 2V9DA 4NJIA 4H4IA 2OJPA 1H51A 1JCJA 5D2VA 3CB8A 2YFNA 2I9EA 4LT9A 3MYPA 2Y89A 1L2UA 3EXRA 5BMXA 1F6PA 3W3OA 1T8XA 2JBMA 2WSRA 1YPIA 4XZ9A 3LHWA 3A5FA 6ALDA 4N02A 3RK8A 4QAIA 5AC8A 5KTLA 1AG1O 3O6YX 4S2CA 5CSRA 1O5XA 1WQ5A 1PS9A 3N2MA 3MI3A 5F2MA 3LLFA 2FFCA 5LHEA 2BWGA 2GJNA 3V75A 5LNVA 2R91A 1TQXA 5AHNA 2OT1A 5AYXA 3IRDA 3W2KA 2BXVA 1YTDA 1FWTA 2X2GA 4UFKA 4XWUA 4IMDA 4MLRA 2TPSA 3TCEA 4O17A 3NQDA 1G7VA 1J5TA 4ADSA 2QF7A 1OFPA 5CZTA 4MJMA 2JGQA 3W1AA 5DLCA 1DQXA 4HPJA 1ZHAA 3W07A 2C13A 2Y7FA 1SR9A 3C2FA 5U7SA 2O7QA 3FJ6A 3E9AA 4GUIA 1ZNNA 1ONRA 1HFBA 1ZALA 1YDNA 3KOFA 4FX6M 3ZR4A 3NQ7A 3FYOA 1OX4A 2B7OA 1F2JA 1OFBA 3GAKA 3W70A 2NUWA 1H7NA 1VLWA 2Y70A 4RX0A 4UTWA 3OVPA 1OFDA 4S2BA 2E09A 1IXPA 1JRBA 3M1ZA 4IX2A 3W1LA 4PL1A 3NDOA 3QEZA 4RLIA 3TUUA 2DZSA 2JK2A 3DENA 3IGSA 4L4MA 1H7PA 3GB6A 3GKAA 1EWDA 1AL8A 1FY6A 3W7GA 1EUNA 3QSTA 1JUEA 1UBSA 4MUZA 3A5VA 4O1DA 1OX4B 2QUVA 4ALDA 1NVMA 4AHOA 2FPTA 3NQ2A 1L6SA 4MZYA 1SO3A 3DZ1A 4MFDA 3SR7A 3PM6A 1IGSA 4UTIA 4CQ9A 1RQHA 1YTEA 3UPBA 2VELA 3GK0A 1TV5A 1TMHA 4IOTA 1FQ0A 2QKFA 3SECA 1A5SA 3LLDA 3W1XA 4KFPA 3KHJA 5KITA 5HJLA 4MJZA 1L9WA 1MEHA 1G4PA 1EWEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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