4XTIA

Structure of imp dehydrogenase of ashbya gossypii with imp bound to the active site
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
407
structure length
373
Chain Sequence
YRDAATALEHLATYAEKDGLSVEQLMGGLTYNDFLVLPGKIDFPSSEVVLSSRLTKKITLNAPFVSSPMDTVTEADMAIHMALLGGIGIIHHNCTAEEQAEMVRRVKKYLASKSADTKQLLCGAAIGTIDADRQRLAMLVEAGLDVVVLDSSQGNSVFQINMIKWIKETFPDLQVIAGNVVTREQAASLIHAGADGLRIGMGSGSICITQEVMACGRPQGTAVYNVTQFANQFGVPCIADGGVQNIGHITKAIALGASTVMMGGMLAGTTESPGEYFFRKRLKTYRGMGSIDAMQKLVAQGVTGSVIDKGSIKKYIPYLYNGLQHSCQDIGVRSLVEFREKVDSGSVRFEFRTPSAQLEGGVHNLHSYEKRLF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Ashbya gossypii atcc 10895
publication title Increased riboflavin production by manipulation of inosine 5'-monophosphate dehydrogenase in Ashbya gossypii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase,Inosine-5'-monophosph
total genus 117
structure length 373
sequence length 407
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2015-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4xtiA00
3FKRA 5D2TA 4PODA 4UTTA 1MEIA 1A5BA 3M5VA 4O14A 4Q4KA 1QO2A 4UTHA 3EWUA 3BG9A 1PHWA 2EHHA 5D32A 5D2VA 3GDTA 3LRMA 2A4AA 2YSWA 4HIBA 3MJYA 3TAOA 2A6NA 4AWSA 3NR0A 1XUUA 1KFLA 1IXOA 5DXXA 5KTLA 4IMEA 1XC4A 4WJEA 3IIPA 4O16A 1LROA 4E2BA 5MHBA 1H62A 3M5YA 3GXNA 3MBFA 5T26A 3W2NA 4BK9A 4JTGA 3E49A 1GT8A 1SZFA 3I7SA 4HN4A 2Z2UA 2QUUA 1SW7A 3FJ6A 5FF2A 4HPXA 4IPJA 1Y0EA 3C2OA 3MP5A 1OFRA 3LHZA 4D2JA 1EUAA 1MXSA 3G1DA 3W75A 4XTDA 4UTLA 4NZFA 4PA8A 2RFGA 5BRBA 4RCXA 2QDGA 1SO4A 2CZDA 3G1YA 4FNUA 4EOUA 4LU0A 2C6QA 1TQJA 3O6YX 4FXRA 4O53A 3B0UX 3LXBA 1IXNA 3W2UA 4LVDA 3LCLA 1AW1A 1K3UA 3OG3A 4JIPA 3BGJA 3PBWA 4FX8A 1KM2A 4RZ5A 3L67A 3W74A 3WJXA 4IJBA 3THQA 2V2HA 3OIXA 1G7VA 3TV8A 5AHFA 2WSYA 2E1DA 4XTIA 3M1ZA 3HJZA 5AHEA 3W7NA 1HG3A 2ZRYA 4IMGA 1FUYA 1QO5A 3NQMA 3PUDA 4JTUA 1EIXA 4GRSA 3NPVA 1SZNA 3IIOA 1FCUA 1GWJA 1L6SA 2BLEA 4WD0A 2VFDA 3E0IA 5U7SA 4O28A 4IMDA 1PHQA 1SQ7A 2A2IA 1DQXA 2ZZ6A 2NZLA 5F2IA 2J9XA 3GR8A 1DBTA 4XUGA 1H5YA 4Z0JA 4JTSA 1HFBA 3N73A 1RD5A 4IQLA 4NJIA 5FEPA 4MKNA 2GJNA 4IMCA 3P82A 5K3VA 2BX7A 2I1OA 1SPQA 4DO5A 6ALDA 3S8HA 1TPDA 3KRZA 3KHJA 2QF7A 3GZ3A 2BSLA 4MYXA 1IXPA 4O0ZA 3FEMA 1ONRA 5HINA 1KBIA 2YZRA 4N9CA 3STGA 1T96A 2C19A 3H54A 3PWAA 1H61A 3UY7A 4UTIA 3A22A 1RQBA 1H1ZA 4GWEA 3W1TA 3UWWA 2J9YA 4FEZA 2ZA1A 4DF2A 1A5CA 3V75A 2C3ZA 5HWNA 3NNTA 1SO5A 1FDJA 1OFEA 3UWVA 3N14A 3KVKA 3B8DA 4HHPA 5CSRA 3R89A 5K9CA 3PY2A 4IMFA 1JUKA 2V81A 1PL9A 1B57A 4GBUA 2CW6A 3EWBX 1VC4A 4UMCA 3UWQA 2QCMA 1SR9A 1XBZA 2VFIA 3QSRA 3QZEA 1VGAA 3Q58A 1JCLA 3MYOA 3W7JA 2H3BA 5FF0A 1GTEA 2A7PA 2R8WA 1TIMA 1QDSA 1V7YA 2NX3A 2ZRVA 4WY0B 4MZYA 5HULA 1YXYA 2BZNA 5DBTA 3UYCA 4MIMA 3R2GA 4NXKA 4AF0B 4QNEA 3RNDA 3QYQA 4HNNA 5EBUA 5BNKA 3WJWA 1M6JA 4FHAA 2RHGA 3BG5A 3SFKA 1K7EA 1GVFA 3TW6A 2E09A 2QUVA 3GDLA 3NQ2A 1J2WA 4UNKA 3W1MA 4RKAA 3LRLA 5D04C 3QPYA 2CLIA 2DZPA 3IRDA 3M43A 4Z1DA 4MYAA 4YMZA 3IGXA 4EVZA 4JTEA 2YX0A 4LRTA 3HG4A 3CIXA 5GVJA 3ZWSA 1BKSA 3G8RA 2J6XA 2YYTA 1OFPA 1UASA 1FDYA 2XN2A 2JK2A 2CZ5A 3UZ5A 3PR2A 1TPEA 3NXFA 4WY0F 1KA9F 4S1FA 3KVMA 4RXFA 1F6KA 3OVQA 2HMCA 4HKPA 3NQCA 1TTJA 2DU2A 4PCFA 4U28A 2H3DA 1W5PA 4GC4A 4TO8A 4J9JA 1TPVA 1UJPA 1VJIA 3HGRA 2ATSA 2AAMA 1OX4A 3JR2A 2DP3A 1ICSA 2X1RA 4X3ZA 1KTNA 1XDLA 4GFSA 1HO1A 4JTTA 3QPZA 1TRIA 3EB2A 4QQ3A 3A9IA 1BWKA 3HIJA 3NM3A 5D02A 3EXRA 5K4XA 4QJ1A 3PC0A 3KOFA 3ATYA 3PAJA 3GIYA 5G2HA 3NQAA 3NZ1A 3BLEA 3VFLA 5HR7A 4A2SA 4C1KA 3CTLA 3GAKA 3GB6A 1FWRA 3W1QA 2RDTA 3LI1A 4JTHA 5CPMA 3W7QA 4UTWA 3UNDA 2OX1A 1XI3A 3MBDA 1VYRA 3C2FA 4UFMA 3P80A 3EX3A 1VPXA 3PF3A 1QFEA 3TSMA 1OF6A 3T78A 1OFDA 2ZZ1A 3UPBA 2Y85A 3VKJA 3RMJA 2PE4A 4CNNA 3W2MA 3S1WA 2I14A 3W7RA 4JEQA 4E38A 1R47A 4LUIA 2Y7EA 1R2SA 1TPC1 4EF9A 4GUJA 3NQ7A 3DI1A 1KFCA 1TCDA 3L2IA 2E68A 4QSHA 3FJLA 1LLWA 2CLMA 3U2OA 1XFBA 1JQVA 4Z1CA 4R53A 4Y90A 2J9ZA 4XKYB 1TPB1 3W1PA 1MZHA 1W3IA 3IEBA 1GVRA 1KLZA 4JTFA 1YLVA 3N9SA 4ZL1A 1Q6OA 1GYLA 3G8EA 3L65A 3W1RA 3R5EA 1EA0A 3UWZA 2EGZA 3QW3A 2QJGA 3T55A 1YXCA 3N19B 3W70A 1F74A 2A7RA 1OX6A 4I7WA 1A50A 3N34A 2ZRUA 3DKJA 4JS3A 3TK7A 2Q8ZA 4LS0A 3CQ0A 1TV8A 2IQTA 1GEQA 3TC6A 4FXSA 3NPWA 4LOCA 1J4EA 1PCKA 4I7UA 4MZ8A 3LBCA 5G4WA 1HUVA 5LGXA 1EWEA 1WBHA 1H7WA 1YADA 4JTJA 3TXVA 5EYWA 3ATZA 1I2NA 2NWSA 1JULA 3IGSA 4FX6M 1G4EA 4ONVA 1FCVA 4JR5A 1IIHA 3U6WA 1F5ZA 5J5RA 3PSVA 2OZ0A 4JDYA 3M41A 5F2MA 4LNYA 3S5OA 4WX2A 4BI6A 3LLDA 1PS9A 3HPSA 1B4EA 2ATMA 3SGZA 1W3TA 1H1YA 3D0CA 2VC6A 2YYUA 3OVPA 1P0NA 2JKAA 5IBXC 2BXVA 2FPVA 3DHDA 4TMBA 4JY9A 3P7YA 2OCZA 3BK0A 3GKAA 3G1AA 4NNAA 5CPOA 3LOTA 1ZCOA 3LTSA 2V5LA 3S0CA 1ML1A 1N8FA 1QAPA 1JJKA 2ZZ2A 1PV8A 3CLMA 4HSNA 4DBEA 5EY5A 4AEOA 1UUMA 1YDNA 3BGGA 5I3KA 3DZ1A 1Z42A 1FCBA 3MYPA 4XBKA 1AL7A 5EKYA 4JDBA 4NJHA 1QR7A 5LGZA 2NV2A 4BWLA 1GQNA 1SFJA 4O4VA 4MJZA 5F1UA 3QMTA 1X1ZA 2VFFA 4FNTA 2GQAA 1H7RA 4IXXA 2GVJA 1WQ5A 3W3OA 5D03A 1CW2A 3W7LA 5DELA 4NX0A 3VE9A 2OJPA 4MPQA 3LCHA 4A29A 3RK8A 3B0VC 1FWNA 1M7OA 3W73A 4MLJA 1Q45A 4JTLA 3GVGA 2CZFA 4UUIA 5J5DA 1AG1O 4E2DA 1QNVA 3W7MA 3G1SA 5AYZA 4UMBA 3HG3A 3LB0A 3TUUA 1EB3A 4RR4A 5C54A 4UC5A 5DY3A 5K9XA 1KTCA 3U8GA 4YCOA 4Q33A 1HL2A 1ZJIA 3LTYA 5HQEA 1K03A 5LHEA 5BMXA 3W07A 3H55A 1GOXA 1VLIA 2HTMA 3NL2A 4BI5A 1LM1A 1ZNNA 2Y88A 2ISWA 5D33A 3IGUA 3MI3A 4RV8A 3L5LA 1C29A 4QNWA 4N6EA 3S1UA 1Z44A 1B4KA 4DF1A 5LHFA 3PB0A 4TR9A 4O11A 3MI2A 1D3GA 1VYPX 3VNDA 2O7QA 5F4WA 3RF9A 2VEPA 3HMJG 2C15A 4ORIA 5D37A 1TSIA 3TR2A 3C0JA 3HOJA 4NNCA 5I3IA 1W56A 1SZGA 3QW4B 1S3HA 1FWWA 2VXNA 2E6YA 2R91A 3PG8A 4FF7A 2WOQA 3HQ1A 2DZXA 4A3UA 1VH7A 5IM51 4AH7A 3W84A 1C8VA 4MY9A 2QJIA 3RLUA 4M6PA 4W9TA 4OV4A 4O1AA 3TJXA 3M44A 3QSTA 2VFHA 4UTTC 5AC8A 5BOOA 1FY6A 5F2LA 1AW5A 1ADOA 5D2YA 1Q6QA 5C2XA 4UFJA 2FFCA 1LLZA 4MVAA 4IGHA 4MY8A 2YW4A 1QPRA 2FIQA 1FDZA 2CU0A 3OVRA 4AWUA 1JRBA 1GVOA 3W23A 3YPIA 4QISA 3GKFA 1KM6A 3TCEA 4A21A 5CG7A 3GR7A 3C6CA 2ZZ7A 2V0TA 5FEZA 3WK0A 2HSAA 4CCEA 2B4GA 1O4UA 2ISVA 1VCFA 2ZZ4A 2V9DA 1NFBA 2X2GA 1TJPA 1E51A 3EWYA 1J5TA 3LCGA 4JGDA 3AO0A 1P5BA 3EWZA 3G18A 2QR6A 1X7FA 4AVFA 3PB2A 1DHPA 7TIMA 1T8XA 4O18A 3P61A 1HO4A 3CEPA 4M6QA 3SGUA 4IPIA 4JXCA 4WQ6A 2VFGA 3WJSA 1F73A 1YDOA 2E6DA 4ADTA 2WJZA 4O57A 3GXTA 4LWWA 1JQXA 3TU9A 3UD6A 2ZFAA 3B0PA 4MOZA 5CPLA 1B9BA 2W0UA 3M16A 3CIWA 2TRSA 2DJXA 2YDAA 2FPTA 3DFOA 3KFTA 3S9YA 1SZEA 4FNRA 3Q2DA 4UTUA 2ZTJA 2I9EA 4K36A 3UWYA 2E6AA 1N55A 5AC7A 1QOQA 2CFFA 1MEWA 2JKPA 3USBA 2H8ZA 4KWWA 4N6FA 2B7QA 4IXHA 1GTHA 4DBDA 3LCFA 1W5QA 1Q6RA 1KTBA 3ABRA 3MI6A 3CEUA 4FIQA 4K6AA 1JCYA 3T4CA 3TDFA 2VOMA 3O6CA 3G3MA 4UFKA 1H50A 4IX2A 2E6FA 2H90A 2NUYA 3P74A 2B0MA 1OFBA 4RLIA 2WPBA 3MHGA 2JBMA 4O15A 1YXDA 3PULA 1VCVA 5AHMA 1OYBA 4Q32A 3NDOA 3NZRA 5KITA 3PUEA 1IXQA 3GLCA 2X30A 3W6YA 3IIZA 4O1BA 3HPXA 2QCHA 1CI1A 4FNQA 1LOQA 5AFDA 1S5WA 3BLIA 1KV5A 3L9CA 3GX9A 1RZMA 3NG3A 1S5VA 3TFXA 2V82A 3NQ6A 4PL1A 1H51A 4TX9A 3NEVA 2C13A 1Z48A 2G95A 3F4WA 2Z0IA 1OFOA 3OA3A 1BWLA 1VCGA 1L6WA 2YGYA 1TPUA 1TO3A 3VI2A 5D2XA 1WX0A 1EP2A 1ICPA 1O94A 2QCNA 5KZEA 1W1ZA 4OT7A 3TMQA 3I65A 5KSWA 3EKLA 3P84A 4K7YA 4OQVA 3W7EA 4PC8A 1DORA 4FO4A 4LY8A 3O6DA 3O8AA 5A5WA 5K7JA 1VS1A 4M5PA 5BW6A 2QUTA 3MHUA 1I45A 4LS2A 3M47A 5I3HA 5LNWA 2QCDA 3C2RA 2PRHA 3TIMA 1RPXA 4O8RA 4DPQA 4X2RA 1L9WA 3KRUA 1TPWA 3W76A 3O06A 1XBYA 2QCGA 3NOEA 3M5XA 5CGQA 4XZ9A 3IV3A 4ZVJA 1W3NA 3TC7A 5LSMA 2F7FA 1NSJA 4YL2A 2J24A 2VENA 1TTIA 3TMLA 3NQGA 4FNPA 4POCA 1GJPA 2A21A 2Y7FA 2Q3RA 2FJKA 3TQ0A 4LW7A 4DEFA 4OBTA 3S1XA 2VELA 1OX4B 3N3MA 1SW3A 5K4ZA 3WK3A 1O95A 3HGJA 4KFPA 1W5MA 1F76A 2WV8A 5HR6A 5AYYA 2NLIA 5CZTA 3W1AA 1AMKA 4IUOA 2E77A 2PRMA 3G1HA 1P0KA 5E0KA 3TKFA 1OABA 4QITA 3INPA 1JCMP 1TRDA 3G1XA 1W5NA 3L0KA 4CNPA 3GYEA 3SIZA 3W7PA 3C2EA 3KVLA 2A0NA 1VLWA 1TYGA 3NAVA 1AW2A 3LHWA 3AJXA 1LBFA 1LDCA 1WOAA 1KM0A 3G0UA 4N02A 3W71A 2DJLA 1T0OA 2W6RA 4S2CA 3F1QA 5F4SA 2Z1BA 2NWRA 5G5IA 3K30A 1GVQA 1I4NA 3FS2A 1ZALA 3IVSA 5E1QA 4AHOA 4ZQOA 4GJ1A 1DL3A 3UXDA 4JYDA 4Z1AA 2FTPA 5L6UA 2OMAA 1OHLA 1AL8A 1M7PA 3TH6A 2Y7DA 3O16A 4UMAA 1NVMA 3FIGA 3C56A 3UPWA 2WNZA 3TAKA 3PG9A 1VR6A 3HB9A 5LNSA 5G1TA 2QEZA 3L5MA 4O10A 2FB2A 1LRTA 4CQ9A 4S2BA 2NXGA 1I2QA 1L2UA 3MWAA 3JS3A 3BG3A 4UFLA 3O07A 5FF3A 4C1LA 5D2WA 4MLRA 4UTWC 5KZMA 2Y62A 4Y8FA 1W0MA 4LC6A 2E5DA 3NQVA 5EPDA 5FESA 4AXKA 3DENA 1QPQA 1PCWA 3RLVA 1YPFA 4ZQCA 3M9YA 2GJLA 2GQ9A 4DO4A 3O63A 2RH9A 3UY8A 1O5XA 4DELA 4RJEA 1UB3A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4YVX A;  1A5O C;  5D2T A;  1FWA C;  2UZ9 A;  2QLY A;  4K3Z A;  4UTT A;  1MEI A;  3E0F A;  4Q4K A;  1DE6 A;  3UJ2 A;  4ZBC A;  3LSC A;  1KXT A;  1EJW C;  1PHW A;  1R38 A;  4UBP C;  2D2G A;  4RW3 A;  2A4A A;  1Q2R A;  3WX7 A;  2A6N A;  5EMM A;  4JTA A;  5DO8 A;  2Q09 A;  3DG3 A;  5DXX A;  4O16 A;  3CUG A;  2WAN A;  4E2B A;  5MHB A;  3M5Y A;  5T26 A;  4V27 A;  1SZF A;  1SFT A;  3PPC A;  1Q6E A;  2VYO A;  3MUZ 1;  4PE8 A;  4IPJ A;  1OFR A;  4PEE A;  3G1D A;  2YJQ A;  3S47 A;  3VO0 A;  2A79 A;  4KRZ A;  4LF2 A;  4LUS A;  4PA8 A;  3AS3 A;  4QBX A;  4H01 A;  3GIP A;  4ES4 A;  1ZB5 A;  2QDG A;  2CZD A;  2PDP A;  4FNU A;  4LU0 A;  4RZB A;  4ZTY A;  3O6Y X;  3FAW A;  3B0U X;  3V1H A;  3LXB A;  1IXN A;  4LVD A;  1AW1 A;  2GDU A;  3OG3 A;  3BGJ A;  4FX8 A;  2AAA A;  3W74 A;  2E0P A;  1MNS A;  3NJ3 A;  5DFA A;  1G7V A;  3TV8 A;  3EA2 A;  1P0E A;  2E1D A;  4XTI A;  2UBP C;  3M1Z A;  4JFW A;  2C71 A;  3LLX A;  1HG3 A;  5B80 A;  1PUD A;  1QO5 A;  3CUZ A;  3PUD A;  4L56 A;  3CV2 A;  3M0K A;  1QWK A;  1GWJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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