3P62A

Wild-type pentaerythritol tetranitrate reductase containing a c-terminal 8-histidine tag
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
364
structure length
364
Chain Sequence
EKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSLHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Enterobacter cloacae
publication title Focused Directed Evolution of Pentaerythritol Tetranitrate Reductase by Using Automated Anaerobic Kinetic Screening of Site-Saturated Libraries
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pentaerythritol tetranitrate reductase
total genus 138
structure length 364
sequence length 364
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2010-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3p62A00
1GG0A 3L0GA 1VCFA 1VR6A 4NJIA 1A5SA 1KV5A 1ME7A 1SO5A 1YXYA 5FEWA 4UTLA 1CX9A 5D2TA 3L68A 3L0KA 2PRHA 5K9CA 1W37A 4K7YA 5LNSA 3UPWA 4C1LA 1EX5A 3GDTA 4UTHA 5DXXA 2ZA3A 3DGRA 4UTWA 4BI5A 1K7XA 1WYIA 4DBEA 3KOFA 2CZFA 3S1VA 3OEXA 4NT0A 1P4CA 1H50A 3TSBA 3RMJA 2C0AA 1JCNA 2CLMA 1JCXA 1WBHA 2ZRWA 4K37A 4XKYB 2E77A 1M6JA 5DCBA 1EP3A 3PB2A 2R91A 4UNKA 2E5BA 5LHEA 4GUFA 1ZFJA 4UTTC 1JRBA 1I2RA 3T55A 5C54A 3QMSA 2VKZG 3B0UX 3LRKA 3MHGA 1MXSA 1ZENA 3FJ6A 2QCLA 4IXHA 2ZA2A 5AHIA 5D02A 2TMDA 1HFBA 4DF0A 3W1PA 1YDNA 1QPQA 4DQWA 4MZYA 4NX0A 1LLZA 4O54A 4WQ6A 1O95A 1K8XA 1TPVA 1V7YA 5L9FA 1F2JA 3G1AA 5C2XA 1ML1A 3P60A 4O19A 3HBLA 3W7GA 2YXGA 4JX6A 3M5XA 1UUOA 2Q8ZA 1QO5A 3QJAA 4JS3A 4J9JA 1FDYA 3P80A 4GWEA 3STEA 4IXXA 3W1NA 4OWGA 4IMGA 4LS2A 4AMAA 4WOZA 3IIXA 1DORA 1W3TA 4JTLA 2WKJA 1OX6A 1MSSA 2WSRA 3NEVA 1FWTA 3EWWA 4LU0A 5CPMA 3EX1A 3NQGA 4ZQNA 4HN4A 3W2UA 1D9EA 1WA3A 2JGQA 3TU9A 2ISVA 3V1PA 3T4CA 2DZPA 1B57A 1VH7A 4LRSA 1OFQA 2CLKA 2VEIA 5SWUA 2F84A 3PAJA 2QCFA 4IGHA 5CZSA 3R8RA 4O4VA 4MYXA 4HPJA 1NSJA 4NQ1A 4MZ8A 1VRDA 3TAOA 3LBMA 2ZTKA 3LTSA 3R2GA 3S5ZA 2A6NA 1W31A 1KLYA 4XBSA 3N19B 2OZ0A 3C0JA 1W5PA 4G1KA 4A2SA 5KITA 1TPEA 3Q2DA 3ABQA 3GXPA 4H6KA 1K02A 2H3DA 2VEPA 1W3NA 3RLUA 3L5LA 3KRSA 3MHFA 1TV7A 2GOUA 5KMYA 3WK2A 1KW1A 4MKNA 1PV8A 5G4WA 3S8HA 1KM0A 3PUDA 2J88A 1SZEA 3DKLA 3OVQA 4DEFA 3EB2A 3NVTA 4Y8FA 4UUIA 1Q45A 3TQVA 2E6YA 2B7OA 3LHVA 5F2GA 2QCEA 2ZZ7A 3PBYA 1ADOA 2VFFA 2VFHA 5BRBA 3EX2A 1LBFA 2I14A 5EY5A 3RNDA 1QO2A 1YTDA 1H7OA 1YADA 1ALDA 3SW6A 1HTIA 3QC3A 3I7RA 4GXMA 3T78A 3QMRA 3A23A 4FX6M 3KVJA 1JQXA 4Y6GA 1OJXA 1YYAA 4FIRA 4OT7A 2FJKA 1C29A 3P61A 4ADSA 1PHQA 2ZZ4A 3O15A 4JD4A 1ONRA 3FEMA 4DPQA 3W88A 5LNWA 2DZSA 4P61A 1FCVA 1THFD 2YR1A 3G0XA 3UNDA 3ABSA 4ORMA 3M7WA 3OBKA 1TJPA 1WAUA 4UTWC 3NM1A 3TK7A 1OX4A 4OV4A 1LZOA 3DZ1A 2X1TA 4UFJA 2VEKA 4Y9AA 2A2IA 1W5NA 4AB4A 2ZDRA 4NNAA 1FY6A 3KHJA 3L0NA 5D09A 1DQWA 3SFKA 1YXCA 2QEZA 3PM6A 4IWWA 3HO8A 4GUHA 3FFSA 1IXNA 3BGGA 4O15A 1MEIA 3PS7A 2WOQA 1ME8A 3NYZA 3IIVA 1NF7A 3BGJA 2G5WA 1VYRA 3MBFA 1Y0EA 4LVFA 1PL9A 2V2HA 4MLRA 1R30A 1BWLA 4H4IA 2JBMA 4AWSA 4KWWA 4UIOA 4JTTA 4U4MA 2G95A 5LNVA 5HR6A 4WXZA 3NO5A 3W7DA 4HT3A 2NXHA 4QM1A 3W7QA 1FWSA 2G96A 1SFLA 1OHLA 1OF8A 3LXCA 3EWUA 5FEXA 1LBMA 2I1OA 1VCVA 1FXQA 2C3ZA 3FA5A 1LYXA 4RZ4A 3TMQA 3W1LA 2OCZA 1HL2A 5AYYA 4IUOA 1VHCA 1GQNA 4PH6A 5HUPA 4ML9A 5C55A 1S5TA 4UTJA 3O63A 1YTEA 1HUVA 1F5ZA 4JX4A 5G2WA 5DY2A 3VNDA 2GVJA 3DFPA 5I3KA 1EUNA 5LSMA 4K36A 5KSWA 3W1XA 5AOUA 3C2RA 4M5PA 3MBDA 3S42A 4DPPA 1TTJA 4O1DA 4O17A 1H7RA 3A5FA 1N55A 3MI6A 1H5YA 3TFCA 3W7IA 4BK9A 4MIMA 4HSNA 3TSDA 4CCDA 5HULA 5D2VA 1W5MA 3LHYA 3PULA 5HWNA 4YLWA 2V2DA 1U83A 1OFEA 3W2LA 3L9CA 5A8GA 3LCXA 3QPYA 5U4NA 1L2UA 1ME9A 2Y88A 2ZA1A 2BZNA 1KM1A 3GDKA 3G24A 4JN6A 1H7WA 2VENA 3W85A 3KXQA 4WJEA 1K3UA 1KFKA 4LWWA 2Z1BA 2EAWA 3LTYA 5LNUA 3ATZA 1HG3A 3W1QA 1VLWA 4A21A 3W1TA 1P0NA 3CEPA 1G7UA 4L4MA 3W71A 4MVAA 1D3HA 5E1QA 3GNNA 1L6YA 5F1UA 4IMCA 1Q3NA 3G18A 4UTTA 5IBXC 4H3DA 3DU0A 5E93A 1X7FA 3NQFA 3S5YA 5AFDA 3AO0A 1MO0A 1OYCA 2V2CA 2RFGA 2Z2UA 4JTHA 2YYUA 3G0SA 3H55A 3W23A 1X6UA 4LC6A 4QJ1A 2P1FA 1G4TA 1TIMA 2VELA 3LBCA 2WNZA 3SGUA 2QDHA 4UTIA 2HSAA 1LRQA 3PUEA 3W2KA 1RZMA 3VE7A 1UB3A 1RQEA 2RH9A 3N34A 1XBVA 1DL3A 1K8ZA 1FXPA 4FX8A 3W7MA 3TX9A 1AG1O 5J5RA 3DENA 1H63A 4N4QA 5AHNA 2E5CA 4N6EA 3UYCA 2ZRXA 3QH2A 2HMCA 3PR2A 4KKXA 4O12A 2DZUA 3UZ5A 2R94A 3QRHA 4D2JA 5CZTA 1TQJA 3R5EA 1C9DA 5I3FA 5KINA 1OFOA 3IGSA 1CI1A 1RR2A 1WOAA 3NXFA 4CQ8A 1KFCA 3Q94A 2J9YA 4MJMA 2EF9A 4UMBA 4ZL1A 1ICPA 3EKLA 3OIXA 1JUKA 1OFAA 5FF3A 4POCA 3MO7A 1TV5A 4K7VA 2X2GA 4N9DA 5F4SA 3HG5A 3NPWA 3O06A 3KVLA 3GDMA 3W70A 3TCEA 3IVSA 1LCOA 1LTDA 4I7VA 3SIZA 4JEQA 5C6MA 2NLIA 3NL5A 2H8ZA 2QCHA 4YWIA 4WXYA 3WFAA 3DKJA 3FS2A 1UUMA 4TU1A 3W7LA 2NUXA 2X1UA 3Q37A 4DO5A 3O6CA 2V0TA 2DJXA 2GJNA 2GVLA 4AEOA 4LT9A 1F6KA 4GBUA 2E1DA 2X1RA 4Y96A 1ICSA 2JGYA 3NL2A 2ISSA 1SO6A 2V5LA 3O16A 4PFMA 1F76A 2XN2A 2YPIA 1QOPA 1PE1A 4BF9A 3CIXA 2ISWA 3LERA 4DBDA 4I7UA 4MYAA 1E51A 1IXOA 4Q33A 3MYOA 1GTEA 3M9YA 1TQXA 3W84A 2B7QA 1G4SA 2WQPA 3USBA 3GXNA 5HMSA 1B4KA 1KFEA 3DHFA 1BEUA 2VXNA 3KVMA 3W7JA 2FTPA 1KTCA 1QNVA 2AQWA 2C14A 4WY0F 5EMUA 5BMXA 1OYAA 5FESA 1SO4A 4ZQOA 2ABAA 3P8IA 2BTMA 5HWJA 5LKYA 4JGDA 1N8FA 3FOKA 3W9ZA 1ZNNA 5U7SA 3W07A 3DFOA 4PTNA 1ZAIA 1T99A 5G1TA 2A85A 4X2RA 3B0PA 1IIHA 1KM4A 1HO1A 4O1CA 2ZRUA 3M5YA 5A5WA 3TNOA 4QAIA 5KTLA 1SW7A 3CC1A 3UWUA 2CLHA 1MZHA 3EWZA 4AHPA 5FF2A 2W6RA 4UCGA 2H6RA 4M6QA 3CHVA 3QSTA 1ZJIA 2P10A 3C56A 4FXSA 1FDJA 4EVZA 3HG2A 4MY9A 2FLIA 3G3DA 3A22A 3C2VA 3LCFA 4HIBA 1TRDA 2BXVA 3W86A 4IMDA 5D37A 5DBTA 1O5KA 1H7PA 3I68A 3ZFHA 2ZYFA 1G4PA 1N7KA 3TA6A 3TROA 4ZMGA 3EWYA 5HINA 4PL1A 2J9XA 1QPNA 3HGRA 1EPXA 2CLIA 3WJWA 4QIUA 3TXVA 3W7CA 2RHGA 3H53A 2GJLA 2DORA 3LXAA 1GVFA 3OG3A 3IIPA 1I2NA 3P67A 3NNTA 5CZ0A 1I2PA 5F1VA 4O1AA 1TMHA 2RDUA 1JJKA 1SQ7A 1FBAA 3N2XA 3RF9A 3W22A 3DAQA 4O13A 2P0OA 4NUWA 2OJPA 1JR1A 2QCMA 3C2OA 1J5TA 1XXXA 2JK2A 1TRIA 1C8VA 2Z0IA 5D2YA 4K39A 2NV1A 3W87A 3EX6A 2ZBTA 1OX4B 3S1UA 4KFOA 3FKRA 4IX2A 3SZ8A 1S3HA 4Y90A 2A4AA 1T8XA 4FX7A 3L5AA 4JDYA 3TJXA 4JDBA 4UFMA 3RK8A 4FO4A 3HIJA 5TIMA 5I3JA 1TO3A 1QOQA 4X22A 2HS8A 1TPFA 1YXDA 1GEQA 2BSLA 4LVBA 4XZ9A 1YDVA 1XFBA 4LV9A 4R34A 3KX6A 3INPA 2B0MA 1FCUA 1I2OA 5G4EA 3W74A 3UZJA 2Y63A 1FWNA 5AHEA 4WY0A 7TIMA 4CNPA 5BW6A 2QUVA 2FB2A 3DI0A 1L6WA 3QMTA 4BI6A 3TQKA 3QPZA 1DJQA 3E02A 2FQIA 2ABBA 2G97A 2ZTJA 2VFEA 1ZAJA 3S9YA 2CWNA 3W83A 3BVJA 4JTSA 4PL2A 1GT8A 1MEWA 5IBXA 4A3UA 4JIQA 3GX9A 4CCCA 2QCDB 4DO6A 5K9DA 4EF9A 2R14A 1TPB1 1UJPA 1KM5A 3FYOA 3NGJA 4S2BA 2Q8LA 2WNQA 3CM4A 3THQA 1B3OA 3T7VA 4NJKA 2PURA 1G7VA 1IGSA 1T0OA 4NJJA 2WSYA 5AN7A 1QWGA 4MY8A 4AHQA 1BTMA 1NF0A 2CZEA 5K4XA 5G5IA 2GQAA 2QCGA 3N3MA 3MP4A 2XFWA 3LHZA 1M7OA 3BARA 3F4NA 4NNCA 1CW2A 4NX5A 5K3VA 1QDSA 3IV3A 2EPHA 4WOQA 2V9DA 1EIXA 3NPXA 2XN1A 3GDRA 3IVUA 4OBTA 2QUUA 4Z1BA 1I45A 2ZZ5A 4Z1CA 3UXDA 4JTJA 3BW2A 1W0MA 4KFNA 1KM2A 1R2TA 5EPDA 3P81A 4TIMA 3AJXA 1GG1A 4RV8A 3QZEA 3G1YA 1WV2A 4PODA 1OABA 3G0UA 4IQLA 2NXIA 3MJYA 1NAL1 1UCWA 4Z0JA 3M5ZA 3O6DA 1XKYA 1O94A 3UPBA 5HNRA 3LHTA 1SW3A 2YCEA 4IMFA 5FEPA 4QNEA 1KM6A 4RCXA 1JCYA 2Y7DA 4R33A 5AHLA 3LV6A 3W7OA 4DELA 4ZQMA 3LCLA 2FPTA 5DXYA 4UC5A 5FF4A 2IQTA 1B9BA 4E0CA 4CQAA 3ABOA 3IVTA 3PVFA 1XI3A 2W79A 3JRKA 2EHHA 3HOJA 1K03A 2Z6IA 3C2FA 1IF2A 1AK5A 1H7NA 2O7QA 3S5OA 4FB7A 1VHNA 1TPDA 5AYXA 4LY8A 4NXSA 4UFKA 4QISA 3KAOA 2PC4A 4JTFA 1JCJA 3UD6A 1F74A 4O16A 3WK0A 1Z41A 3C52A 3LRMA 1SZNA 1Q6RA 1FQ0A 2X30A 1RD5A 1KTNA 4RJEA 3CT7A 1XDMA 1LM1A 2QCDA 2BLEA 3BG9A 1P5BA 3G22A 4Q4KA 3TKFA 1XC4A 4FXRA 5TQLA 5CKSA 5HUOA 3P5ZA 1FX6A 3U8GA 2Q3RA 2V5BA 3NOEA 3NDOA 1PIIA 4UFHA 1W5QA 2Y89A 5BOOA 4LVDA 3QW3A 5LNRA 1K8YA 3B03A 1QR7A 5I3IA 4AWUA 2YDAA 3W76A 1H1YA 1AW1A 3HPZA 3SJ3A 3M5VA 2B7NA 1BKSA 1H1ZA 3HF3A 4EOUA 1XBYA 3N9RA 1K7EA 4AAJA 3CQ0A 1WX0A 3RLVA 3TC6A 2CLEA 2VOMA 5CG7A 3CLMA 3QYQA 1XM3A 3GYEA 1ZALA 3E96A 3R89A 1GYLA 2BX7A 4Z0SA 3W2JA 3NA8A 1XUZA 1EEPA 4TX9A 4BR1A 3ZWTA 5H2ZA 2Y85A 5CSSA 1KFBA 5IM51 1TB3A 2ATSA 2NWSA 3G1DA 2Y7FA 3RU6A 3W7HA 1GVSA 5D2XA 3GLCA 3W7PA 1SR9A 2WNNA 3HGSA 3EX4A 3W6YA 2EKCA 3M43A 3S6DA 5D33A 4N2YA 5EL1A 1LOLA 3G3MA 1YPIA 3WJXA 2YGYA 4CNNA 1RV8A 2Z6JA 3IIOA 3PBVA 1VPXA 3MP5A 2C19A 3C8FA 4MFEA 1F05A 3NZRA 1UBSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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